调节植物细胞多醣的组合物和方法

专利名称：：调节植物细胞多醣的组合物和方法
技术领域：
：本发明大体来说涉及植物多醣合成基因和通过所述基因编码的多肽的领域，与所述多核苷酸和多肽序列用于控制植物表型的用途。本发明特定地提供从桉属(Eucalyptus)与松属(Pinus)分离的细胞周期多核苷酸和多肽序列和与其相关的序列。
背景技术：
：植物细胞壁主要由纤维素、胶质和半纤维素组成。纤维素由极其坚固且抵抗酶和机械退化的晶体β-1，4-葡聚糖微纤维组成。纤维素含量对植物纤维和木质产品的结构特性以及动物与人类食物的营养数量、可消化性和可口性具有深远影响。此外，纤维素是重要工业植物纤维诸如棉花、亚麻、大麻、黄麻与林业种类诸如桉亚属(Eucalyptusssp)和松亚属(Pinusssp)的主要结构组份。纤维素也经常用于多种工业应用中。一些生物可降解塑料与可消化药物胶囊以及医药填充剂和食品纤维添加剂可由植物多醣制成。另外，某些塑料诸如醋酸纤维素和合成纺织品诸如嫘萦源自纤维素。多醣对食物质量具有深远影响。细胞壁促成胡萝卜的脆性，而软化果实诸如桃子和西红柿要求细胞壁退化。在玉米中，家畜饲养(但不是人类消费)需要经增加的直链淀粉，且经增加的细胞壁强度降低可消化性。在纤维农作物诸如木材中，纤维素是有关的主要聚合物。结构性木材质量的基本量度-木质密度-基本上是纤维素含量的量度。在纸浆工业中，根据纤维素产率测量效率，并因此需要较高的纤维素含量。改变多醣合成基因表达的能力是极其强有力的，因为多醣合成影响植物表型以及生长速率。已应用多醣合成控制用于(尤其)改变木质特性和尤其是木材与木浆特性。举例来说，可以通过改变多醣合成基因表达来奏效的木浆改善包括经增加或降低的木质素和纤维素含量。操纵植物中的多醣合成也可以设计具有以下特性的较佳木材经增加的尺寸稳定性、经增加的抗张强度、经增加的剪切强度、经增加的压缩强度、经降低的反应性木质、经增加的刚性、经增加或降低的硬度、经降低的螺旋性、经降低的收缩性和相对于重量、密度与比重的所需特性。A.多醣基因与蛋白纤维素合成部分上是通过纤维素合成酶催化的。纤维素合成酶是转化进行性β-糖基转移酶大家族中的成员。纤维素合成酶(Ces)基因编码纤维素合成酶，并部分负责调节纤维素生物合成。CesA，一种纤维素合成酶，隶属于纤维素合成酶超级家族，其特征在于4个保守域U1至U4。U1至U3都各具有保守的天冬氨酸盐以及N′锌手指形域。U4域具有公认的基质结合点Q-x-x-R-W。Saxena等人，JBacteriol.1771419(1995)。CesA蛋白经预测是八个具有大约1100个氨基酸的横跨膜域蛋白。CesA蛋白充当将经活化的葡萄糖聚合成纤维素聚合物的大型膜结合错合物的部分。如果不是所有证据均支持“纤维素合成酶基因编码整合到纤维素生物合成途径的糖基转移酶”的假说，那么在高等植物中Ces的基质是UDP葡萄糖(UDPG)且最多(参见Holland等人，PlantPhysiol.，1231313(2000))。计算机分析(InSilicoAnalysis)识别-纤维素合成酶类似蛋白(Csl)，植物中的据信为进行性多醣β糖类转移酶的蛋白大家族。参见，例如Goubet等人，PlantPhysiol.131547(1993)。纤维素合成酶类似蛋白具有如同纤维素合成酶的保守U1至U4域，但缺少N′锌手指形域。Doblin等人，PlantCellPhysiol.431407(2002)。据信纤维素合成酶类似酶控制非纤维素植物多醣的产生。B.多醣合成中的表达分布与微阵列分析多醣合成的多基因控制在判定负责表型判定的基因中出现困难。识别促成植物中表型的基因和基因表达差异的一个主要障碍是可共同研究多于少数基因表达的困难。识别并理解促成植入表型的基因表达与基因间相互关系的另一困难是植物证明的对环境因素的高度敏感性。近来已有使用基因组范围表达分布的进展。详细来说，DNA微阵列的使用适用于在单一实验中研究大量基因的表达。已使用表达分布来进行对发展和环境刺激的植物基因响应的几项研究。举例来说，采用微阵列分析来研究草莓果实成熟期间的基因表达，Aharoni等人，PlantPhysiol.1291019-1031(2002)，Arabodopsis中的伤口响应，Cheong等人，PlantPhysiol.129661-7(2002)，Arabodopsis中的病原体响应，Schenk等人，Proc.Nat′lAcad.Sci.9711655-60(2000)和大豆中的植物生长素响应，Thibaud-Nisse等人，PlantPhysiol132118。Whetten等人，PlantMol.Biol.47275-91(2001)揭示使用cDNA探针的火炬松(PinustaedaL)中的细胞壁生物合成基因的表达分布。Whetten等人研究在差异性不成熟与成熟第二木质部之间差异表达的基因。另外，为测定某种环境刺激对基因表达的影响，将压缩木质中的基因表达与正常木质相比较。所研究的2300个要素中的156个显示差异表达。上文的Whetten在285处。不成熟木质与成熟木质的比较显示188个要素为差异表达。同样上文的Whetten在286处。尽管表达分布且尤其是DNA微阵列为基因组范围表达分析提供便利手段，但其使用已限制于可利用完整基因组序列或大型cDNA基因库的有机体。参见Hertzberg等人，Proc.Nat′lAcad.Sci.9814732-7(2001a)；Hertzberg等人，PlantJ.，25585(2001b)。举例来说，上文的Whetten声称“这个令人感兴趣的问题的更完整分析有待于更大组松树与白杨EST的完成”。Whetten等人在286。此外，由于基因中的序列类似性，包含cDNA或EST探针的微阵列可能无法辨别同一家族中的基因。即当用作微阵列探针时，cDNA或EST可结合至同一家族中的多个基因。操纵基因表达以产生具有更合意的表型的植物的方法将通过更好地理解各种类型植物组织在植物发育的不同阶段和在以不同环境提示刺激后的多醣合成基因表达来促进。控制植物架构和农艺学重要特征的能力将通过更好理解地多醣合成基因表达如何影响植物组织形成和植物生长与多醣合成如何联系来改善。在大量基因中，植物发育期间可改变的基因的表达仅一部分可能影响植物发育的任一给定阶段期间的表型改变。
发明内容因此，需要适用于测定多醣合成基因表达中可导致所需表型的改变的手段和方法。也需要适用于所述方法的多核苷酸。进一步需要可使多醣合成基因表达中的改变与表型相关联的方法。进一步需要识别多醣合成基因和基因产物的方法，所述多醣合成基因和基因产物影响植物表型，且其可被操纵以获得所需表型。在一方面，本发明提供经分离的多核苷酸，所述多核苷酸包含选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列。在另一方面，本发明提供以经分离的多核苷酸转型的植物细胞，所述经分离的多核苷酸包含选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列。在另一方面，本发明提供包含多核苷酸的转基因植物，所述多核苷酸包含选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列。在另一方面，本发明提供包含至少一个多核苷酸的DNA构造，所述多核苷酸具有SEQIDNO1-29的任一个和其保守变体的序列。在一方面，本发明提供一种制造经转型的植物的方法，所述方法包含以DNA构造将植物细胞转型、在促进植物生长的条件下培养所述经转型的植物细胞。在另一方面，本发明提供经分离的多核苷酸，所述经分离的多核苷酸包含将多肽的催化性或基质结合域编码的序列，所述多肽选自SEQIDNO30-58的任一个，其中所述多核苷酸编码具有选自SEQIDNO30-58的任一个的所述多肽的活性的多肽。在另一方面，本发明提供一种制造经转型的植物的方法，所述方法包含以包含至少一个具有SEQIDNO1-29的任一个的序列的多核苷酸的DNA构造将植物细胞转型和在促进植物生长的条件下培养所述经转型的植物细胞。在另一方面，本发明提供从转基因树获得的木质，所述转基因树已以本发明的DNA构造转型。在另一方面，本发明提供从转基因树获得的木浆，所述转基因树已以本发明的DNA构造转型。在另一方面，本发明提供一种制造木质的方法，所述方法包含以包含具有选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列的多核苷酸的DNA构造将植物转型；在促进植物生长的条件下培养所述经转型的植物；和从所述植物获得木质。本发明也提供一种制造木浆的方法，所述方法包含以包含具有选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列的多核苷酸的DNA构造将植物转型、在促进植物生长的条件下培养所述经转型的植物和从所述植物获得木浆。本发明的另一方面提供经分离的多肽，所述经分离的多肽包含通过本发明的经分离的多核苷酸编码的氨基酸序列。在另一方面，本发明提供经分离的多肽，所述多肽包含选自由SEQIDNO30-58组成的群组的氨基酸序列。在另一方面，本发明提供一种改变植物的植物表型的方法，所述方法包含改变植物中通过SEQIDNO1-29的任一个编码的多肽的表达。在一方面，本发明提供多核苷酸，所述多核苷酸包含选自由SEQIDNO59-83组成的群组的核酸序列。在另一方面，本发明提供将两个不同样品中的基因表达相关联的方法，所述方法包含探测编码产物的一个或一个以上基因在第一样品中的表达水平，所述产物通过选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列编码；探测一个或一个以上基因第二样品中的表达水平；将一个或一个以上基因在第一样品中的表达水平与一个或一个以上基因在第二样品中的表达水平相比较；和将第一样品与第二样品之间的一个或一个以上基因表达水平的差异相关联。在另一方面，本发明提供一种将植物表型拥有物与植物中的一个或一个以上基因的基因表达水平相关联的方法，所述方法包含探测拥有表型的第一植物中的编码产物的一个或一个以上基因的表达水平，所述产物通过选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列编码；探测缺少表型的第二植物中的一个或一个以上基因的表达水平；将第一植物中的一个或一个以上基因的表达水平与第二植物中的一个或一个以上基因的表达水平相比较；和将第一植物与第二植物之间的一个或一个以上基因表达水平的差异与表型的拥有物相关联。在另一方面，本发明提供将基因表达与形成反应性木质的倾向相关联的方法，所述方法包含探测显示正常木质表型的木质部的第一植物细胞中的编码产物的一个或一个以上基因的表达水平，所述产物通过选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列编码；探测显示反应性木质表型的木质部的第二植物细胞中的一个或一个以上基因的表达水平；将第一植物细胞中的一个或一个以上基因的表达水平与第二植物细胞中的一个或一个以上基因的表达水平相比较；和将第一与第二样品之间的一个或一个以上基因表达水平的差异与形成反应性木质的倾向相关联。在一方面，本发明提供用于探测一个或一个以上基因的表达的组合，所述组合包含两个或两个以上寡核苷酸，其中每一寡核苷酸都能够杂交到选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列。在另一方面，本发明提供用于探测一个或一个以上基因的表达的组合，所述组合包含两个或两个以上寡核苷酸，其中每一寡核苷酸都能够杂交到基因产物，所述基因产物通过选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列编码。在另一方面，本发明提供一种在固体载体上包含本发明支撑件的组合的微阵列，其中所述两个或两个以上寡核苷酸的每一者在所述固体载体支撑件上占据一个独特位置。在另一方面，本发明提供一种用于探测样品中的一个或一个以上基因的方法，所述方法包含使所述样品与两种或两种上寡核苷酸接触，其中每一寡核苷酸在标准杂交条件下都能够杂交到包含选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列的基因；和探测杂交到一个或一个以上寡核苷酸的一个或一个以上有关基因。在一方面，本发明提供一种用于探测通过样品中的一个或一个以上基因编码的一个或一个以上核酸序列的方法，所述方法包含使所述样品与两个或两个以上寡核苷酸接触，其中每一寡核苷酸在标准杂交条件下都能够杂交到通过包含选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列的基因编码的核酸序列；和探测杂交到一个或一个以上寡核苷酸的一个或一个以上核酸序列。在一方面，本发明提供一种用于探测基因表达的套组，所述套组包含微阵列与用于核苷酸杂交反应的一个或一个以上缓冲液或试剂。从下文的详细描述，本发明的其它特征、目标和优势将显而易见。然而应了解，虽然指示本发明的优选实施例，但详细描述都仅以说明方式而不是限制的方式给出。从详细描述，在本发明的精神和范围内的各种变化和修改对于所属领域的技术人员将显而易见。图1.SEQIDNO30的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图2.SEQIDNO31的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图3.SEQIDNO32的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图4.SEQIDNO33的氨基酸序列。划线部分是保守家族2糖基转移酶域。图5.SEQIDNO34的氨基酸序列。划线部分是保守糖基转移酶家族2的家族域。图6.SEQIDNO35的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图7.SEQIDNO36的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图8.SEQIDNO37的氨基酸序列。划线部分是保守家族2糖基转移酶域。图9.SEQIDNO38的氨基酸序列。划线部分是保守核苷酸-二磷酸-糖转移酶域。图10.SEQIDNO39的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图11.SEQIDNO40的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图12.SEQIDNO41的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图13.SEQIDNO42的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图14.SEQIDNO43的氨基酸序列。划线部分是保守糖基转移酶家族2域。图15.SEQIDNO44的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图16.SEQIDNO45的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图17.SEQIDNO46的氨基酸序列。划线部分是保守糖苷水解酶家族2域。图18.SEQIDNO47的氨基酸序列。划线部分是保守糖基转移酶家族2域。图19.SEQIDNO48的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图20.SEQIDNO49的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域图21.SEQIDNO50的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图22.SEQIDNO51的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图23.SEQIDNO52的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图24.SEQIDNO53的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图25.SEQIDNO54的氨基酸序列。划线部分是保守糖基转移酶家族2域。图26.SEQIDNO55的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图27.SEQIDNO56的氨基酸序列。划线部分是保守糖基转移酶家族2域图28.SEQIDNO57的氨基酸序列。划线部分是保守纤维素合成酶域。图29.SEQIDNO58的氨基酸序列。划线部分是保守糖基转移酶家族2域。图30.pWVR8的载体图。图31.pART27的载体图。图32示范性微阵列采样参数。具体实施例方式发明者已发现适用于改变植物表型特性的新颖的经分离的多醣合成基因和多核苷酸。发明者也已发现识别促成植物表型的多基因因素和操纵基因表达以影响植物表型的方法。源自商业重要的林业属植物(松树和桉树)的这些基因在植物多醣合成中涉及且至少部分上负责商业木质中重要的表型特征的表达，诸如刚性、强度、密度、纤维尺寸、粗糙度、纤维素与木质素含量和提取物含量。总体来说，基因和多核苷酸编码可为纤维素合成酶、纤维素合成酶类似蛋白、糖基转移酶或具有相同功能的多肽的蛋白，且本发明进一步包括所述蛋白和多肽。本发明用于选择多醣合成基因序列以针对操纵的方法将允许更好地设计和控制具有更高设计表型的转基因植物。控制商业重要的林业种类中的植物架构和农艺学重要特点的能力将通过从所述方法获得的信息来改善。除非另外指示，否则所有技术与科学术语在本文中都是以符合一般技术用法的方式来使用。通常，此描述的命名法与所描述的实验室程序(包括细胞培养、分子遗传学和核酸化学与杂交)在所属领域中分别熟知和通用。将标准技术用于重组核酸方法、寡核苷酸合成、细胞培养、组织培养、转型、转染、转导、分析化学、有机合成化学、化学合成、化学分析与医药调配与传递。通常，根据制造商的说明书来执行酶反应与纯化和/或分离步骤。缺少对相反面的指示，所考虑的技术与程序根据所揭示的传统方法来执行，例如，在Sambrook等人的MolecularCloningALaboratoryManual，第二版(ColdSpringHarborLaboratoryPress，1989)和在JohnWiley&Sons的CurrentProtocolsinMolecularBiology(1989)中所揭示的方法。下文更详细地讨论与本发明相关的特定科学方法。然而，这个讨论仅作为实例提供，且其并不限制可进行本发明的方法的方式。A.植物多醣合成基因与蛋白1.多醣合成基因、多核苷酸与多肽序列本发明一方面涉及新颖多醣合成基因和以这些基因编码的多肽。本发明提供新颖的植物多醣合成基因与多核苷酸和新颖的多醣合成蛋白与多肽。根据本发明的一实施例，新颖的多醣合成基因与松属或桉属种类的野生型植物中所表达的基因相同。本发明的特定示范性新颖植物多醣合成基因序列陈述于包含辐射松(Pinusradiata)序列的表1与包含巨桉(Eucalyptusgrandis)序列的表2中。相应的基因产物，即寡核苷酸和多肽，也列于表3、表4与表5中。本发明的序列具有多醣合成活性，且可编码多醣合成中呈活性的蛋白，诸如上文讨论的纤维素合成酶和纤维素合成酶类似家族的蛋白。如下文的更详细讨论，操纵多醣合成基因与多核苷酸的表达或操纵经编码的蛋白与多肽的活性可导致具有与相同种类的野生型植物的表型不同的所需表型的转基因植物。在整个此描述中，参考多醣合成基因产物。如本文所使用的“多醣合成基因产物”是通过多醣合成基因编码的产物，且包括诸如RNA的核苷酸产物与诸如蛋白和多肽的氨基酸产物。本发明的特定多醣合成基因的实例包括SEQIDNO1-29。本发明的特定多醣合成基因产物的实例包括通过SEQIDNO1-29的任一个编码的产物。本文也参考多醣合成蛋白与多醣合成多肽。本发明的特定多醣合成蛋白和多肽的实例包括通过SEQIDNO1-29的任一个编码的多肽，或包含SEQIDNO30-58的任一个的氨基酸序列的多肽。本发明的一方面是针对这些多醣合成基因与多醣合成基因产物的子集(即SEQID1-2、7-14、16-18、20-21、24-25和27-30、其个别保守变体(如下文所定义的术语))和借此编码的核苷酸和氨基酸产物。本发明也包括为本文所揭示的核苷酸序列的互补、反向序列或反向互补的序列。本发明也包括本文所揭示的序列的保守变体。如本文所使用的术语“变体”是指一个或一个以上核苷酸碱基对或氨基酸残基与变体的参考序列不同的核苷酸或氨基酸序列。因此，在一方面，本发明包括保守变体多核苷酸。如本文所使用的术语“保守变体多核苷酸”是指在严谨条件下杂交到寡核苷酸探针、在对照条件下结合到参考基因的多核苷酸，所述保守变体是所述多核苷酸的变体。因此，例如在严谨性条件下SEQIDNO1的保守变体杂交到寡核苷酸探针、在对照条件下结合到SEQIDNO1。举例来说，当序列在6×SSC、0.5％SDS、5×Denhardt溶液和100μg非特异性载体DNA的杂交溶液中形成双链错合物时，认为所述序列杂交。参见Ausubel等人，第2.9节，增刊27(1994)。“中度严谨性”被定义为在60℃温度、在6×SSC、0.5％SDS、5×Denhardt溶液和100μg非特异性载体DNA的杂交溶液中。同样在Ausubel等人中。“高度严谨性”杂交条件是(例如)68℃、在6×SSC、0.5％SDS、5×Denhardt溶液和100μg非特异性载体DNA的杂交溶液中。同样在Ausubel等人中。在中度严谨性杂交反应后，在室温下于2×SSC加0.05％SDS的溶液中将核苷酸冲洗5次，随后以0.1×SSC加0.1％SDS在60℃下冲洗1小时。本发明的一方面提供展示与其个别参考序列的至少约75％的序列一致性的保守性变体多核苷酸。“序列一致性”具有技术所认知的意义，且可使用已公开的技术来计算。参见COMPUTATIONALMOLECULARBIOLOGY，Lesk编辑(OxfordUniversityPress，1988)；BIOCOMPUTINGINFORMATICSANDGENOMEPROJECTS，Smith编辑(AcademicPress，1993)；COMPUTERANALYSISOFSEQUENCEDATA，第I部分，Griffin与Griffin编辑(HumanaPress，1994)；SEQUENCEANALYSISINMOLECULARBIOLOGY，VonHeinje编辑，AcademicPress，1987；SEQUENCEANALYSISPRIMER，Gribskov与Devereux编辑(MacmillanStocktonPress，1991)；Gish等人，J.Mol.Biol.215403(1990)；Gish与States，NatureGenet.3266(1993)；Madden等人，Meth.Enzymol.266131(1996)；Altschul等人，NucleicAcidsRes.253389(1997)；和Zhang与Madden，GenomeRes.7649-656(1997)和Carillo与Lipton，SIAMJ.AppliedMath.481073(1988)。通常用于测定两种序列之间的一致性或类似性的方法包括(但不限于)GUIDETOHUGECOMPUTERS，Bishop编辑(AcademicPress，1994)和上文的Carillo与Lipton中所揭示的那些方法。在计算机程序中编成测定一致性与类似性的方法。测定两种序列之间的一致性与类似性的优选计算机程序方法包括(但不限于)GCG程序包(Devereux等人，NucleicAcidsResearch12387(1984))、BLASTP、BLASTN、FASTA(Atschul等人，J.Mol.Biol.215403(1990))和FASTDB(Brutlag等人，Comp.App.Biosci.6237(1990))。本发明包括与1-29的任一个具有以下序列一致性的保守变体多核苷酸，所述序列一致性大于或等于99％、98％、97％、96％、95％、94％、93％、92％、91％、90％、89％、88％、87％、86％、85％、84％、83％、82％、81％、80％、79％、78％、77％、76％、75％、74％、73％、72％、71％、70％、69％、68％、67％、66％、65％、64％、63％、62％、61％或60％。在所述变体中，变体与参考序列之间的差异可发生于参考核苷酸序列的5′或3′端位置，或发生于那些端位置之间的任意处，个别地散布于参考序列中的核苷酸中，或在参考序列内的一个或一个以上连续组中。由于删除与/或插入总计小于总序列长度的30％，本发明所涵盖和包涵在其内的额外保守变体多核苷酸包括多核苷酸，所述多核苷酸包含不同于SEQIDNO1-29的多核苷酸序列或其互补、反向互补或反向序列的序列。在一实施例中，删除与/或插入总计小于总长度的20％或小于10％。本发明也包括保守变体多核苷酸，除在其主要结构(序列)与SEQIDNO共有高度类似性之外，其具有下列特征的至少一者(i)其含有编码多肽的开放式阅读框架或部分开放式阅读框架，所述多肽在多核苷酸合成中具有与通过参考多核苷酸编码的多肽大体相同的功能特性，或(ii)其具有共同的核苷酸域或经编码的蛋白域。本发明包括SEQIDNO1-29的保守变体，所述保守变体编码具有通过参考多核苷酸编码的蛋白的酶或生物活性或结合特性的蛋白。所述保守变体是功能性变体，因为其具有通过参考多核苷酸编码的蛋白的酶或结合活性。根据本发明，多核苷酸变体可包括“改组基因(shuffledgene)”，例如那些在(例如)美国专利第6,500,639、6,500,617、6,436,675、6,379,964、6,352,859、6,335,198、6,326,204和6,287,862号中描述的基因。本发明的核苷酸序列变体也可为如在美国专利第6,132,970号中揭示的经修饰的多核苷酸，所述专利以引用的方式并入本文中。根据一实施例，本发明提供编码多醣合成蛋白，诸如纤维素合成酶和纤维素合成酶类似蛋白的多核苷酸。SEQIDNO1-29提供所述多核苷酸的实例。根据另一实施例，本发明的多核苷酸编码通过SEQIDNO1-29的任一个编码的多肽或包含SEQIDNO30-58的任一个的多肽的催化性或蛋白结合域。本发明的多醣合成蛋白的催化性和蛋白结合域在所属领域中已知。这些蛋白的保守序列在图1-29中作为划线文本显示。本发明也包涵作为保守变体的多核苷酸，所述多核苷酸不同于上文所讨论的序列，但由于基因码的简并性，其编码与通过本发明的多核苷酸编码的多肽相同的多肽。本发明也包括作为保守变体的多核苷酸，所述多核苷酸包含由于不影响所编码的多肽序列的氨基酸序列或导致所编码的多肽序列中的保守取代的的取代而不同于上文所讨论的多核苷酸序列的序列。本发明也包括通过多核苷酸编码的经分离的多肽，所述多核苷酸包含SEQIDNO1-29的任一个或上文所讨论的其保守变体的任一个。本发明也包括包含SEQIDNO30-58的多肽和这些多肽的保守变体。根据本发明，变体多肽或蛋白是指通过增加、删除或取代一个或一个以上氨基酸来改变的氨基酸序列。本发明包括保守变体多肽。如本文中所使用的术语“保守变体多肽”是指与蛋白具有类似结构、化学或生物特性的多肽的保守变体。测定哪些氨基酸残基可取代、插入或删除的指导可使用所属领域中熟知的计算机程序来找到，诸如VectorNTISuite(InforMax，MD)软件。在本发明的一实施例中，保守变体多肽展示与其个别参考序列至少约75％的序列一致性。保守变体蛋白包括多肽的“同源异构体”或“类似物”。多肽同源异构体和其类似物是指具有相同物理与生理学特性和相同生物功能的蛋白，但其氨基酸序列相差一个或一个以上氨基酸，或其序列包括非天然氨基酸。包含由于总计小于总序列长度的10％的氨基酸取代、插入与/或删除而不同于SEQIDNO30-58的多肽序列的序列的多肽涵盖和包涵于本发明内。本发明一方面提供多醣合成中的保守变体多肽功能，如通过一个或一个以上适当检定(诸如下文所描述的那些适当检定)来测定。本发明包括为纤维素合成酶或纤维素合成酶类似蛋白的变体多肽，诸如那些可将活性葡萄糖转化为纤维素聚合物的多肽与那些编码具有糖基转移酶生物活性的肽的基因。如上文所讨论，本发明包括变体多核苷酸，所述变体多核苷酸编码充当多醣合成蛋白的多肽。多醣合成蛋白的活性与物理特性可使用所属领域中已知的任何方法来检验。下列检定方法实例并非详尽的，且可包括用于在检验活性和区分多醣合成蛋白变体的蛋白特征中提供些指导。可如(例如)Blanton等人，Planta180324(1990)和Blanton，Development119703(1993)中所描述评估纤维素合成酶活性。可如(例如)Stults等人，Anal.Biochem.Biophys.174151(1988)；Stults等人，Arch.Biochem.Biophys.28020-26.(1990)；Stults和Macher，Arch.Biochem.Biophys.303125(1993)；4)Crawley等人，Anal.Biochem.185112(1990)和Yan等人，Anal.Biochem.223111(1994)中所描述检验糖基转移酶活性。2.使用多醣合成基因、多核苷酸和多肽序列的方法本发明提供使用多醣合成基因和其保守变体的方法。本发明包括用于改变纤维素合成酶和纤维素合成酶类似基因的表达的方法与构造，和/或用于以下目的的基因产物，所述目的包括(但不限于)(i)研究在多醣合成期间的功能与对植物表型的最终影响，和(ii)影响植物表型变化。举例来说，本发明包括通过改变一个或一个以上多醣合成基因的表达来修饰木质质量、纤维发育、细胞壁多醣含量、果实成熟和植物生长与产量的方法和手段。本发明包含改变多醣合成基因的任一个和其上文所讨论的变体的表达的方法。因此，例如本发明包含改变桉属或松属种类的野生型植物的基因组中所存在的多醣合成基因的表达。在一实施例中，多醣合成基因包含选自SEQIDNO1-29序列或如上文所讨论的其保守变体的核苷酸序列。根据本发明可用于改变基因表达的技术包括(但不限于)(i)过量表达基因产物；(ii)破坏基因转录，诸如破坏基因的mRNA转录；(iii)破坏通过基因编码的多肽的作用，或(iv)破坏基因自身。基因产物的过量表达、反义RNA、核糖酶的使用和双链RNA干扰(dsRNAi)的使用是发现基因功能性作用和产生具有不同于相同种类野生型植物的表型的植物的重要技术。目标基因的过量表达通常通过将基因或cDNA克隆为表达载体和将所述载体引入受体细胞来完成。或者，过量表达可通过将外源启动子引入细胞中以驱动位于基因组中的基因的表达来完成。接着可通过将经转型以过量表达基因的植物与未经转型为过量表达基因的植物相比较来评估给定基因的过量表达对细胞功能、生化与/或生理学特性的影响。反义RNA、核糖酶和dsRNAi技术通常针对基因的RNA(通常为mRNA)转录。反义RNA技术涉及在细胞中表达或将RNA分子(或RNA衍生物)引入所述细胞中，所述RNA分子(或RNA衍生物)与细胞中的特定mRNA中所发现的序列互补或反义。通过与mRNA相关联，反义RNA可抑制经编码的基因产物的翻译。使用反义技术来降低或抑制特定植物基因表达已描述于(例如)欧洲专利公开案第271988号；Smith等人，Nature，334724-726(1988)；Smith等人，PlantMol.Biol.，14369-379(1990)中。核糖酶是具有催化性域和与特定mRNA互补的序列的RNA。核糖酶通过与mRNA相关联(通过核糖酶的互补域)和接着使用催化性域裂解(降解)信息来发挥作用。RNA干扰(RNAi)涉及转录后基因沉默(PTGS)调节过程，其中在不改变目标基因自身的重新转录速率的情况下，特定mRNA的稳态含量通过经转录、通常经充分处理的mRNA的特定序列降解来降低。RNAi技术已在(例如)Elibashir等人，MethodsEnzymol.26199(2002)；McManus和Sharp，NatureRev.Genetics3737(2002)；PCT申请案WO01/75164；Martinez等人，Cell110563(2002)；上文的Elbashir等人；Lagos-Quintana等人，Curr.Biol.12735(2002)；Tuschl等人，NatureBiotechnol.20446(2002)；Tuschl，Chembiochem.2239(2001)；Harborth等人，J.CellSci.1144557(2001)；等人，EMBOJ.206877(2001)；Lagos-Quintana等人，Science.2948538(2001)；Hutvagner等人，同上834；Elbashir等人，Nature.411494(2001)中讨论。本发明提供DNA构造，其包含SEQIDNO1-29或其保守变体的至少一种多核苷酸，诸如上文所讨论的保守变体。所属领域中已知的任一方法可用于产生本发明的DNA构造。参见例如上文的Sambrook等人。本发明包括视情况包含启动子的DNA构造。可使用所属领域中已知的任何合适启动子。启动子是结合RNA聚合酶与/或其它转录调节要素的核酸，优选为DNA。如任一启动子一样，本发明的启动子促进或控制DNA或RNA的转录，以从可可操作性地连接至启动子的核酸分子产生mRNA分子。RNA可编码蛋白或多肽，或可编码反义RNA分子或适用于RNAi中的分子。适用于本发明的启动子包括组成型启动子、诱导型启动子、暂时调节型启动子与组织优选型启动子。有用的组成型植物启动子的实例包括花椰菜花叶病毒(CaMV)35S启动子，其在多数植物组织中均赋予组成型、高水平表达(Odel等人，Nature313810(1985))；胭脂碱合成酶启动子(An等人，PlantPhysiol.88547(1988))；和章鱼碱合成酶启动子(Fromm等人，PlantCell1977(1989))。应注意，虽然CaMV35S启动子通常被称作组成型启动子，但可见一些组织优选性。不管在本发明中使用期间可展示的任何组织优选性，本发明涵盖CaMV35S的使用。响应环境、激素或化学信号，诱导型启动子调节基因表达。激素诱导型启动子的实例包括植物生长素诱导型启动子(Baumann等人，PlantCell11323-334(1999))、细胞分裂素诱导型启动子(Guevara-Garcia，PlantMol.Bio.38743-753(1998))和赤霉素响应型启动子(Shi等人，PlantMol.Biol.381053-1060(1998))。另外，响应热、光、伤口、病原体抗性和诸如茉莉酸甲酯或水杨酸甲酯的化学物质的启动子可用于本发明的DNA构造和方法中。组织优选型启动子允许本发明的多核苷酸在某植物组织中优选表达。组织优选型启动子也适用于引导反义RNA或siRNA在某些植物组织中的表达，其可适用于抑制或完全阻塞如上文所讨论的目标基因的表达。如本文中所使用的维管植物组织是指木质部、韧皮部或维管形成层组织。其它优选组织包括顶端分生组织、根、种子和花朵。在一方面，本发明的组织优选型启动子是“木质部优选型”、“形成层优选型”或“韧皮部优选型”，并优选地分别引导可可操作性地连接的核酸序列在木质部、形成层或韧皮部中的表达。在另一方面，本发明的DNA构造包含对木质部、形成层或韧皮部呈组织特异性的启动子，其中所述启动子仅在木质部、形成层或韧皮部中具有活性。维管优选启动子在木质部、韧皮部或形成层组织的任一个中或在所述三种组织类型中的至少两种中优选地具有活性。维管特异性启动子在木质部、韧皮部或形成层的任一个中或在所述三种中的至少两种中特定地具有活性。换句话说，启动子仅在植物木质部、形成层或韧皮部组织中具有活性。然而，请注意，由于植物中的溶质运输，在表达发生后可在植物中的其它地方发现特定地或优选地在组织中表达的产物。另外，特定多醣合成基因的启动子在发育第二维管结构时可仅于形成层中表达。在形成层内，特定多醣合成基因启动子可排他性地在干部或根部中表达。此外，多醣合成启动子可仅在春天(用于早期木质形成)表达或仅在夏天表达。启动子可操作性地联接至多核苷酸。如本文中所使用的可操作性连接是指将编码结构性基因的多核苷酸连接到启动子，以使得启动子控制所述结构性基因的转录。如果所需多核苷酸包含编码蛋白产物的序列，那么编码区可操作性地连接到调节要素，诸如连接到启动子和终止子，带来相关信使RNA转录物和/或通过所需多核苷酸编码的蛋白产物的表达。在这种情况下，多核苷酸在5′到3′定向上可操作性地连接到启动子，且视情况连接到终止子序列。或者，本发明提供DNA构造，其包含“反义”定向的多核苷酸，所述多核苷酸的转录产生可形成影响植物细胞中的内源性多醣合成基因的表达的第二结构的核酸。在另一变化中，DNA构造可包含在转录后产生双链RNA产物的多核苷酸，所述转录起始与多核苷酸相关的多醣合成基因的RNA干扰。本发明的多核苷酸可定位于t-DNA内，以使得t-DNA的左侧和右侧边界序列与所述多核苷酸相接，或在多核苷酸的两侧。应了解本发明包括DNA构造，其包含上文所讨论的任何多核苷酸的一个或一个以上。因此，例如构造可包含t-DNA，所述t-DNA包含一个、两个、三个、四个、五个、六个、七个、八个、九个、十个或更多个多核苷酸。本发明也包括包含启动子的DNA构造，所述启动子包括一个或一个以上调节要素。或者，本发明包括包含与启动子分离的调节要素的DNA构造。调节要素赋予启动子区许多重要特征。某些要素结合增强可操作性连接的核酸转录速率的转录因子。其它要素结合抑制转录活性的抑制子。转录因子对启动子活性的影响可测定启动子活性高低，即启动子是“强”还是“弱”。本发明的DNA构造可包括用作适用于识别和选择经转型的植物细胞或植物的可选择标记的核苷酸序列。所述标记的实例包括(但不限于)新霉素磷酸转移酶(nptll)基因(Potrykus等人，Mol.Gen.Genet.199183-188(1985))，其赋予卡那霉素抗性。细胞表达nptll基因可使用适当的抗生素(诸如卡那霉素或G418)来选择。其它通用的可选择标记包括突变型EPSP合成酶基因(Hinchee等人，Bio/Technology6915-922(1988))，其赋予草甘膦抗性；和突变型乙酰乳酸合成酶基因(ALS)，其赋予咪唑啉酮或磺酰脲抗性(欧洲专利申请案第154,204号)。本发明也包括包含上文所讨论的DNA构造的载体。所述载体可包括特定宿主细胞的复制(复制子)起点。各种原核复制子已为所属领域的技术人员所已知，且用于引导自主复制和维持原核宿主细胞中的重组分子。举例来说，pMON530是基于土壤杆菌(Agrobacterium)的植物转型载体，对于用于双子叶植物转型来说，pMON530是质体载体(Rogers等人，″Improvedvectorsforplanttransformationexpressioncassettevectorsandnewselectablemarkers.，″在R.Wu和L.Grossman编辑的METHODSINENZYMOLOGY.中，第253至277页。SanDiegoAcademicPress)。其它有用的质体是pMON530、pMON505的衍生物，其通过将pMON316的2.3kbStul-Hindlll片段转移入pMON526中来制备。质体pMON526是pMON505的简单衍生物，其中通过以Xmal消化、以Klenow聚合酶处理和连接来移除Smal部位。虽然质体pMON530保留pMON505和CaMV35S-NOS表达盒的所有特性，但其在启动子与多腺苷酸信号之间含有Smal的独特裂解部位。二元载体pMON505是pMON200的衍生物(上文的Rogers等人)，其中Ti质体同源区LIH以小型RK2质体pTJS75的3.8kbHindlll到Smal区段替代(Schmidhauser和Helinski.(1985)J.Bacteriol.164-155)。这个区段含有用于使用三亲本配对程序结合入土壤杆菌中的RK2复制起点oriV和转移起点-oriT。Horsch和Klee.，Proc.Natl.Acad.Sci.U.S.A.，834428(1986)。质体pMON505保留pMON200的所有重要特征，包括用于插入所需DNA片段的合成多连接子、植物细胞中用于卡那霉素抗性的嵌合NOS/NPTII′/NOS基因、用于在大肠杆菌与根癌土壤杆菌中选择的壮观霉素/链霉素抗性决定子、用于易于转化株划线和子代中遗传的完整胭脂碱合成酶基因和用于在大肠杆菌中易于制造大量载体的pBR322复制起点。质体pMON505含有源自pTiT37胭脂碱类型T-DNA的右端的单一T-DNA边界物。南方转渍分析(Southernblotanalyse)证明质体pMON505和其携带的任一DNA整合入植物基因组中，即整个质体是插入植物基因组的T-DNA。经整合的DNA的一末端位于右边界序列与胭脂碱合成酶基因之间，且另一末端位于边界序列与pBR322序列之间。尤其有用的Ti质体盒载体是pMON17227。这个载体描述于WO92/04449中，且含有编码赋予草甘膦抗性的酶的基因(命名为CP4)，其是包括马铃薯和西红柿的许多植物的优良选择标记基因。所述基因融合到阿布属EPSPS叶绿体输送肽(CTP2)，且其表达通过选择启动子来驱动。在一实施例中，本发明利用如图30所示的pWVR8载体或如Gleave，PlantMol.Biol.，201203-27(1992)中所描述和图31中所示的pART27。本发明也提供以本发明的DNA构造转型的宿主细胞。如本文中所使用的宿主细胞是指本发明的多核苷酸在其中表达的细胞。因此，宿主细胞可为个别细胞、细胞培养物或为有机体一部分的细胞。宿主细胞也可为胚胎、胚乳、精子或卵细胞或受精卵的一部分。在一实施例中，宿主细胞是植物细胞。本发明进一步提供包含本发明的DNA构造的转基因植物。本发明包括为被子植物或裸子植物的转基因植物。本发明的DNA构造可用于转型多种植物，单子叶植物(例如草、玉米、玉米、燕麦、小麦与大麦)、双子叶植物(例如阿布属、烟草、豆类、紫花苜蓿、橡树、桉树、枫树)和裸子植物((例如，苏格兰松；参见Aronen，FinnishForestRes.Papers，第595卷，1996)、白云杉(Ellis等人，Biotechnology1184-89，1993)和落叶松(Huang等人，InVitroCell27201-207，1991))。所述植物也包括草坪、小麦、玉米、水稻、糖用甜菜、马铃薯、西红柿、莴苣、胡萝卜、草莓、木薯、甘薯、天竺葵、大豆与各种类型的木质植物。木质植物包括树，诸如棕榈橡树、松树、枫树、冷杉、苹果树、无花果树、李子树和阿拉伯胶树。木质植物也包括玫瑰和葡糖藤。在一实施例中，本发明的DNA构造用于转型木质植物，即树干存活多年且每年通过增加木质组织来增加直径的树木或灌木。本发明包括转型植物的方法，所述植物包括商业林业工业中重要的桉树和松树种类，诸如选自由巨桉与其杂交类和火炬松(Pinustaeda)组成的群组的植物，以及经转型的植物和从其获得的木质和木浆。合适植物的其它实例包括那些选自由以下各植物组成的群组的植物北美短叶松(Pinusbanksiana)、塞埔路斯松(Pinusbrutia)、加勒比松(Pinuscaribaea)、砂地松(Pinusclausa)、扭叶松(Pinuscontorta)、大果松(Pinuscoulteri)、萌芽松(Pinusechinata)、Pinuseldarica、湿地松(Pinusellioti)、黑材松(Pinusjeffreyi)、糖松(Pinuslambertiana)、马尾松(Pinusmassoniana)、西部白松(Pinusmonticola)、欧洲黑松(Pinusnigra)、长叶松(Pinuspalustris)、海岸松(Pinuspinaster)、美国黄松(Pinusponderosa)、辐射松(Pinusradiata)、多脂松(Pinusresinosa)、刚松(Pinusrigida)、沼松(Pinusserotina)、北美乔松(Pinusstrobus)、欧洲赤松(Pinussylvestris)、火炬松(Pinustaeda)、矮松(Pinusvirginiana)、太平洋银冷杉(Abiesamabilis)、胶冷杉(Abiesbalsamea)、科罗拉多冷杉(Abiesconcolor)、北美冷杉(Abiesgrandis)、高山冷杉(Abieslasiocarpa)、加州红冷杉(Abiesmagnifica)、壮丽冷杉(Abiesprocera)、美国扁柏(Chamaecyparislawsoniona)、黄扁柏(Chamaecyparisnootkatensis)、美国尖叶扁柏(Chamaecyparisthyoides)、东方红柏(Juniperusvirginiana)、欧洲落叶松(Larixdecidua)、美洲落叶松(Larixlaricina)、日本落叶松(Larixleptolepis)、西部落叶松(Larixoccidentalis)、西伯利亚落叶松(Larixsiberica)、翠柏(Libocedrusdecurrens)、挪威云杉(Piceaabies)、白香云杉(Piceaengelmanni)、白云杉(Piceaglauca)、黑云杉(Piceamariana)、北美云杉(Piceapungens)、红云杉(Picearubens)、西加云杉(Piceasitchensis)、北美黄杉(Pseudotsugamenziesii)、巨杉(Sequoiagigantea)、北美红杉(Sequoiasempervirens)、落羽杉(Taxodiumdistichum)、加拿大铁杉(Tsugacanadensis)、西部铁杉(Tsugaheterophylla)、高山铁杉(Tsugamertensiana)、北美香柏(Thujaoccidentalis)与北美乔柏(Thujaplicata)、白桉(Eucalyptusalba)、Eucalyptusbancroftii、葡萄桉(Eucalyptusbotryoides)、苹果按(Eucalyptusbridgesiana)、美叶桉(Eucalyptuscalophylla)、赤桉(Eucalyptuscamaldulensis)、柠檬桉(Eucalyptuscitriodora)、Eucalyptuscladocalyx、聚果桉(Eucalyptuscoccifera)、Eucalyptuscurtisii、山桉(Eucalyptusdalrympleana)、粗皮桉(Eucalyptusdeglupta)、Eucalyptusdelagatensis、异色桉(Eucalyptusdiversicolor)、邓恩桉(Eucalyptusdunnii)、红花桉(Eucalyptusficifolia)、蓝桉(Eucalyptusglobulus)、Eucalyptusgomphocephala、古尼桉(Eucalyptusgunnii)、香果桉(Eucalyptushenryi)、银顶纤皮桉(Eucalyptuslaevopinea)、毛皮桉(Eucalyptusmacarthurii)、Eucalyptusmacrorhyncha、斑皮桉(Eucalyptusmaculata)、红柳桉(Eucalyptusmarginata)、Eucalyptusmegacarpa、蜜味桉(Eucalyptusmelliodora)、Eucalyptusnicholii、亮果桉(Eucalyptusnitens)、Eucalyptusnova-angelica、斜叶桉(Eucalyptusobliqua)、Eucalyptusoccidentalis、Eucalyptusobtuslflora、Eucalyptusoreades、少花桉(Eucalyptuspauciflora)、多苞叶桉(Eucalyptuspolybractea)、王桉(Eucalyptusregnans)、树脂桉(Eucalyptusresinifera)、大叶桉(Eucalyptusrobusta)、野桉(Eucalyptusrudis)、柳桉(Eucalyptussaligna)、Eucalyptussideroxylon、Eucalyptusstuartiana、细叶桉(Eucalyptustereticornis)、毛叶桉(Eucalyptustorelliana)、果桉(Eucalyptusurnigera)、尾叶桉(Eucalyptusurophylla)、多枝桉(Eucalyptusviminalis)、Eucalyptusviridis、鞣桉(Eucalyptuswandoo)和Eucalyptusyoumanni。如本文中所使用的术语“植物”也希望包括植物的果实、种子、花朵、球果等等。本发明的经转型植物可为直接转染子，其意谓DNA构造诸如通过土壤杆菌直接引入植物中，或所述植物可为经转染的植物的子代。第二或随后代植物可通过有性生殖(即受精)来产生。此外，植物可为配子体(单倍体阶段)或孢子体(双倍体阶段)。如本文中所使用的术语“植物组织”包括植物的任一部分，包括植物细胞。植物细胞包括悬浮培养物、愈伤、胚胎、分生组织区、愈伤组织、叶、根、芽、配子体、孢子体、花粉、种子与小孢子。植物组织可在液体或固体培养物中生长，或在土壤或在盆、温室或田地里的合适媒介中生长。如本文中所使用的“植物组织”也指无论有性产生还是无性产生的植物、种子、子代或繁殖体的克隆体与任一这些的后代，诸如插枝或种子。根据本发明的一方面，已以本发明的DNA构造转型的转基因植物具有不同于未以DNA构造转型的植物的表型。如本文中所使用的“表型”是指植物的可区分特征或特点，其可根据本发明通过将本发明的一个或一个以上DNA构造整合入植物的至少一个植物细胞的基因组来改变。DNA构造通过修饰经转型的植物细胞或作为一个整体的植物的许多基因、分子、生化、生理学、形态学或农艺学特点或特性中的任一个或一个以上，可使经转型植物的表型具有变化。举例来说，已显示在植物生长中涉及纤维素合成酶类似蛋白。(Favery等人，GenesDev.1579(2001))。因此，可通过改变一个或一个以上多醣合成基因的表达来改变植物中多醣含量，进而调节植物细胞生长。植物细胞生长通过松弛植物细胞壁与由于植物细胞的膨胀压力而造成的扩张来实现。植物细胞壁松弛与细胞膨胀压力间的关系使得较松弛细胞壁要求用以扩张的较少膨胀压力，而较坚硬细胞壁则要求用以扩张的较多膨胀压力。以这种方式，本发明的多核苷酸可用于调节多醣合成水平，并且因此介导植物生长。类似地，在干旱或压力条件下，植物细胞的膨胀压力与多醣合成水平均下降。Ray，Curr.TopicsinPlantBiochem.&Phys1118-41(1992)。因此，低膨胀压力与细胞壁强度之间的相互影响阻止或减缓生长。因此，通过改变多醣基因表达而增加多醣合成将允许植物细胞壁松弛，并且允许在导致膨胀压力下降的条件下生长，例如干旱条件。此外，压力响应启动子的使用将允许本发明多醣合成酶的经调节表达(参见美国专利号美国5,891,859；美国专利号5,929,305；美国专利号5,965,705；美国专利号5,892,009)。在一实施例中，经本发明的DNA构造转型的植物可产生的表型包括(但不限于)以下各表型的任一个或一个以上干旱耐受性增加、除草剂抗性、高度减小或增大、分枝减少或增多、冷冻或霜耐受性增强、生命力改善、色彩增强、健康与营养特征增强、储藏改善、产率提高、盐耐受性增强、木质腐烂抗性增强、真菌疾病抗性增强、虫害吸引力改变、疾病耐受性增大、昆虫耐受性增大、水压耐受性增大、质地改善、发芽率增大、微量营养素摄入量增大、新颖树脂产生和新颖蛋白或多肽产生。在另一实施例中，当与相同种类的未经所述DNA构造转型的植物相比时，所述植物展示选自由以下各特点组成的群组的一个或一个以上特点形成反应性木质倾向、不成熟期降低、不成熟期增加、自我脱落分枝、生殖发育加速或生殖发育延迟。在另一实施例中，在植物对照例中不同的表型包括下列的一个或一个以上木质素质量、木质素结构、木质组成、木质外观、木质密度、木质强度、木质刚性、纤维素聚合性、纤维尺寸、内腔大小、花冠比例、导管分子比例、其它植物组份、植物细胞分裂、植物细胞发育、单位面积的细胞数量、细胞大小、细胞形状、细胞壁组成、木质形成速率、木质审美外观、干缺陷形成、平均微纤维角度、S2细胞壁层宽度、生长速率、根的根形成速率与分枝植物发育的比、叶面积指数和叶形状。可通过合适方法评估表型。可基于其通用形态学评估植物。转基因植物可用裸眼观测、称重及测量其高度。可通过分离植物组织的个别层，即韧皮部与形成层检验植物，其进一步划分为分生组织细胞、早期扩张、晚期扩张、第二壁形成和晚期细胞成熟。参见，例如上文的Hertzberg。也可以使用显微镜分析或化学分析评估植物。显微镜分析包括检查细胞类型、发育阶段、组织与细胞摄入的色素。纤维形态(诸如纤维壁厚度和木浆纤维的微纤维角度)可使用(例如)显微镜透射椭圆偏光法观测。参见Ye与Sundstrom，TappiJ.，80181(1997)。湿木质与未砍伐的树的木质强度、密度和颗粒倾角可通过结合多变量分析测量可见与近红外光谱数据来测定。参见美国专利申请公开案第2002/0107644和2002/0113212号。内腔大小可使用扫描电显微镜测量。如Marita等人，.J.Chem.Soc，PerkinTrans.I2939(2001)中所描述，可使用核磁共振谱观测木质素结构和化学性质。木质素、纤维素、糖类和其它植物提取物的生化特点可通过已知的任何标准分析法评估，包括分光光度测量法、荧光光谱法、HPLC、质谱法和组织染色法。如本文中所使用的“转型”是指将核酸插入植物细胞的基因组的过程。所述插入包涵稳态引入细胞并转送到子代。转型也指核酸瞬间插入，其中所得转化株瞬间表达核酸。使用所属领域中已知的各种方法，转型可在自然或人工条件下发生(参见例如Glick和Thompson编辑，METHODSINPLANTMOLECULARBIOLOGY，CRCPress，BocaRaton，Fla.(1993))。可通过将核酸序列插入原核或真核宿主细胞的任何已知方法达成所述转型，包括土壤杆菌调节转型法(参见例如Horsch等人，Science，2271229-31(1985))、病毒感染、晶须、电穿孔(参见例如Rhodes等人，Science240(4849)204-207(1988))、显微注射、聚乙二醇处理(参见例如Lyznik等人，PlantMol.Biol.13151-161(1989))、热电击、脂肪生成和粒子轰击(参见例如Klein等人，PlantPhysiol.91440-444(1989)和Boynton等人，Science240(4858)1534-1538(1988))。转型也可使用如(例如)Svab等人，Proc.NatlAcad.Sci.878526-30(1990)中所描述的叶绿体转型方法来完成。植物转型方法描述于(例如)美国专利第5,159,135(棉花)、5,981,840(玉米)、5,914,451(大豆)和WO00/12715(桉树)号中，所述专利以全文引用的方式并入本文中。其它植物转型方法和技术于在Birch，R.G.，Ann.Rev.PlantPhysiol.PlantMol.Biol.48297(1997)和Forester等人，Exp.Agric.3315-33(1997)中评论，并且以全文引用的方式并入本文中。所属领域中已熟知转型树种的方法。根据本发明的一实施例，桉树移植植物的基因型依赖性转型和转基因子代的产生可通过使用土壤杆菌的转型来完成。移植树可(虽然不需)在转型前于预培养基上收获和培养。尽管预培养基并非必要，但这个培养基的使用可增加转型效率和植物再生。预培养基是转型前在其上可以土壤杆菌培养移植植物的营养基。可使用任何预培养基和培养时间段。预培养基含有土壤杆菌诱导子，诸如乙酰丁香酮。预培养基视情况含有植物生长操纵子，包括植物生长素和细胞分裂素。预培养基可通过使用合适盐媒介来制备，包括(但不限于)Woody植物媒介(WPM)盐(Lloyd和McCown，CombinedProceedingsoftheInternationalPlantPropagatorsSociety，30421-427，1980)、Murashige和Skoog媒介(SigmaAldrich，St.Louis，MO)或Lepoivre媒介。预培养基可含有土壤杆菌诱导子，诸如(例如)乙酰丁香酮。预培养基视情况可含有植物生长素和细胞分裂素，或既含有植物生长素也含有细胞分裂素。下文显示示范性植物预培养基。在这个转型方法中，可将移植植物在黑暗中、于预培养基上预培养4天。经诱导的土壤杆菌培养物可通过所属领域中已知的技术制备。将所述经诱导的培养物应用于移植植物。移植植物可通过将土壤杆菌培养物应用到移植、真空渗入、花浸蘸法等来转型。在转型后，经土壤杆菌培养物处理的移植植物可与土壤杆菌在光照或黑暗条件下共培养2到10天。在一实施例中，所述移植植物以土壤杆菌在光照或黑暗条件下共培养4天。在共培养后，可将移植植物转移到具有400mg/L提门叮的再生媒介中。在转移到选择性媒介之前，移植植物可在再生媒介上培养。在一实施例中，将移植植物在再生媒介上培养4天。可使用任何合适的选择性媒介。在一实施例中，选择性媒介是经提门叮和除草剂选择性试剂补充的再生媒介。下表提供示范性再生媒介。1升媒介中的组份KNO31NH4H2PO40.25MgSO47H2O0.25CaCl2.2H2O0.10FeSO4.7H2O0.0139Na2EDTA.2H2O0.01865MES(Duchefa，m1501)600.0MS微量盐(1/2浓度)MnSO4.H2O0.00845ZnSO4.7H2O0.0043CuSO4.5H2O0.0000125CoCl2.6H2O0.0000125KI0.000415H3BO30.0031Na2MoO4.2H2O0.000125玉米素NAA(萘乙酸)葡萄糖/蔗糖20.0肌醇0.100烟碱酸0.010硫胺0.010泛酸钙0.001维生素B60.001生物素0.00001抗坏血酸维生素C0.050L-谷氨酰胺0.1精氨酸0.0258氨基乙酸0.00199赖氨酸0.0508甲硫氨酸0.0132苯基丙氨酸0.0257丝氨酸0.00904苏氨酸0.00852色氨酸0.0122酪氨酸0.0127水晶凝胶3.0经过选择而存活的幼苗块保持在含有除草剂和提门叮的再生媒介上。可将幼苗块转移直到幼苗激增并且开始伸长。在一实施例中，幼苗块每3周转移一次。使用任何报导基因，诸如(例如)GFP、荧光素酶或GUS。在一实施例中，可执行GUS染色以监测土壤杆菌感染频率，及确保经选择的幼苗不是野生体或嵌合体。可将再生幼苗的叶和干组织染色，用以在幼苗发育后立即表达报导基因。举例来说，为测定GUS活性，移植植物可在包含100mM磷酸盐缓冲液(pH值7.0)、0.05％的二甲基亚砜、0.05％的曲拉通X-100、10mM的EDTA、0.5mM的亚铁氰化钾和1.5mg/ml的5-溴-4-氯-3-碘-D-葡萄糖苷酸(X-gluc)的基质中培育。接着使移植植物经受10分钟真空，然后在37℃培养隔夜，再对GUS变异区计数。根据另一实施例，松树的转型可使用美国专利申请公开案第2002/0100083号中描述的方法来完成。本发明另一方面提供从经本发明的DNA构造转型的植物获得木质与/或制造木浆的方法。上文提供制造转基因植物的方法，且其在所属领域中已知。经转型的植物可在任何合适的条件下培养或生长。举例来说，松树可按照美国专利申请公开案第2002/0100083号中所描述的培养并生长。桉树可按照(例如)Rydelius等人在MechanizationinShortRotation，IntensiveCultureForestryConference，Mobile，AL，1994提出的“GrowingEucalyptusforPulpandEnergy”来培养和生长。木材和木浆可通过所属领域中已知的任何方法从所述植物获得。如上文所注，根据本发明获得的木材或木浆可证明经改善的特点，其包括(但不限于)下列的任一个或一个以上木质素组成、木质素结构、木质组成、纤维素聚合性、纤维素尺寸、纤维与其它植物组分的比例、植物细胞分裂、植物细胞发育、单位面积细胞的数量、细胞大小、细胞形状、细胞壁组成、木质形成速率、木材审美外观、干缺陷形成、生长速率、根的根形成速率与分枝植物发育速率的比、叶面积指数，并且叶形包括木质素含量增加或降低、木质素对化学处理可达性增加、木质素反应性提高、纤维素含量增加或降低、空间稳定性增加、拉伸强度增加、剪切强度增加、压缩强度增加、电击抗性增加、刚性增加、硬度增加或降低、螺旋性降低、收缩性降低与重量、密度和比重的差异。B.多醣合成基因的表达图谱本发明也提供执行多醣合成基因表达图谱的方法和手段。表达图谱在测定基因是经转录基因还是经翻译基因，比较特定基因在不同组织中的转录水平、基因型分类、评估DNA复制数目、测定后裔一致性、测量mRNA衰退速率、识别蛋白结合位置、测定基因产物的子细胞位置、将基因表达与表型或其它现象相关联、并测定操纵特定基因对其它基因的影响中是有益的。表达图谱对于识别复杂、多基因情况下的基因表达尤其有益。由于这个原因，表达图谱在将多醣合成基因表达关联至植物表型和植物组织的形成中有益，并在将其相互关系关联至多醣生物合成中有益。仅小部分植物多醣合成基因在给定时间给定组织样品中表达，并且所有的表达基因均可能不影响植物表型。为识别能够影响有关表型的基因，本发明提供用于测定(例如)植物发育中给定点的多醣合成基因表达图谱，和用于测定给定组织样品中多醣合成基因表达图谱的方法和手段。本发明也提供用于识别表达可被操纵以改变植物表型的多醣合成基因的方法和手段。在支援这些方法中，本发明也提供区分相同家族的不同基因的表达的方法和手段，例如区别纤维素合成酶或纤维素合成酶类似蛋白的方法和手段。如本文中所使用的“基因表达”是指DNA序列至RNA序列的转录过程，接着RNA翻译成可或不可经历翻译后处理的蛋白，。因此，植物表型与多醣合成基因表达之间的关系可通过定量或定性地探测RNA或蛋白含量的变化来观测。如本文中所使用的术语“生物活性”包括(但不限于)蛋白基因产物活性，所述蛋白基因产物活性包括酶活性，诸如糖基转移酶活性。本发明提供在这些表达图谱方法中有益的寡核苷酸。在一组给定条件下，每一寡核苷酸都能够杂交到多醣合成基因或基因产物。本发明的一方面提供复数种寡核苷酸，其中在一组给定条件下，每一寡核苷酸都能够杂交到不同多醣合成基因产物。本发明的寡核苷酸实例包括SEQIDNO59-83。在标准条件下，每一SEQIDNO59-83的寡核苷酸杂交到SEQIDNO1-29中的一种的不同基因产物。本发明的寡核苷酸在以上文所描述的方法中的任一个测定一个或一个以上多醣合成基因表达时有益。1.细胞、组织、核酸与蛋白样品本发明的方法中所使用的样品可从植物组织中获得。合适的植物组织包括(但不限于)体细胞胚、花粉、叶、干、愈伤、匍匐枝、微型薯、幼苗、木质部、malestrolbili、花粉球花、维管组织、顶端分生组织、维管形成层、木质部、根、花朵和种子。根据本发明，“植物组织”按照本文中先前所描述来使用。植物组织可从上文描述的任意植物类型或种类获得。根据本发明的一方面，样品可从不同发育阶段的植物组织获得，从一年中不同时间的植物组织获得(例如春天对夏天)，从经受不同环境条件(例如光和温度变化)的植物组织获得和/或从不同植物组织和细胞类型获得。根据一实施例，植物组织在成熟的多个阶段中和一年中不同季节时获得。在另一实施例中，植物组织从显示不同表型的植物中获得。举例来说，植物组织可从干分裂细胞、分化型木质部、早期发育木质细胞、分化型早期木质细胞和分化型晚期木质细胞收集。作为另一实例，可将在从具有发育木质的植物获得的样品中的基因表达与从不具有发育木质的植物获得的样品中的基因表达相比较。作为另一实例，可将从显示反应性木质表型的植物获得的样品中的基因表达与从不具备反应性木质的植物获得的样品中的基因表达相比较。分化木质部包括从反应性木质获得的样品。反应性木质包括压缩木质、边木和正常垂直木质部。已知从松树和桉树获得用于表达图谱的样品的方法。参见例如Allona等人，Proc.Nat′lAcad.Sci.959693-8(1998)和Whetton等人，PlantMol.Biol.47275-91，和Kirst等人，Int′lUnionofForestryResearchOrganizationsBiennialConference，S6.8(2003年6月，Umea，Sweden)。在本发明的一实施例中，将一种类型植物组织中的基因表达与不同类型组织中的基因表达相比较，或与不同发育阶段的相同类型组织中的基因表达相比较。也可比较在一年中多个时间(不同季节)采集的一种类型组织基因中的基因表达。举例来说，可将不成熟的第二木质部中的基因表达与成熟期第二木质部中的基因表达相比较。类似地，可将形成层中的基因表达与木质部中的基因表达相比较。另外，可将顶端分生组织中的基因表达与形成层的基因表达相比较。在本发明的另一实施例中，从具有特定表型的植物获得样品，并且将所述样品中的基因表达与从相同种类但不具有所述表型的植物获得的样品中的基因表达相比较。举例来说，可从显示快速生长的植物获得样品，并且基因表达可与从显示正常或慢速生长的植物获得的样品中的基因表达相比较。从这种比较识别的不同表达基因可与生长速率相关联，且因此对于操纵生长速率有益。在另一实施例中，从克隆繁殖植物获得样品。在一实施例中，克隆繁殖植物是松属或桉属种类。来自相同基因型的个别无性系分株可在一年中的不同时间砍伐。因此，对于任何基因型都有至少两个遗传一致的树木被砍伐，一个在季节初期而另一个在季节晚期。这些树木的每一个都可划分为不成熟期(顶部)到成熟期(底部)样品。另外，组织样品可以至少5层剥皮分为(例如)韧皮部到木质部。可评估每一这些样品的表型和基因表达。参见图32。其中细胞组份可能干扰分析技术，诸如杂交探测、酶探测、配体结合探测或生物活性探测，可能需要从这些细胞组份分离基因产物。可通过所属领域中已知的任何方法将包括核酸和氨基酸基因产物的基因产物从细胞片段或溶解产物分离。根据本发明使用的核酸可通过任何可利用的方法或工艺来制备，或通过在所属领域中已知的其它工艺来制备。例如在Tijssen，LaboratoryTechniquesinBiochemistryandMolecularBiology，HybridizationWithNucleicAcidProbes，第3章(Elsevierpress，1993)，Berger和Kimmel，MethodsEnzymol.中详细说明了用于分离核酸的传统技术。已知用于制备核酸样品和使自松树和桉树的多核苷酸定序的技术。参见例如上文的Allona等人和上文的Whetton等人。合适的核酸样品可含有从多醣合成基因转录获得的任何类型的核酸，即RNA或其子序列，或从多醣合成基因转录的mRNA用作其模板的核酸。合适的核酸包括从转录物反向转录的cDNA、从所述cDNA转录的RNA、从所述cDNA放大的DNA和从所述经放大的DNA转录的RNA。对这些产物或所获得产物的探测表明样品中转录物的存在和/或丰度。因此，合适样品包括(但不限于)一个或多个基因的转录物、从转录物反向转录的cDNA、从cRNA转录的cDNA、从所述基因放大的DNA和从经放大的DNA转录的RNA。如本文中所使用，“转录物”的种类包括(但不限于)预mRNA初生转录物、转录过程中间体和成熟mRNA和其降解产物。不需监测所有类型的转录以实践本发明。举例来说，本发明的表达分布方法可通过仅探测一种类型的转录来进行，例如通过仅探测成熟mRNA含量。在本发明的一方面中，制备染色体DNA或cDNA基因库(包含例如荧光标记的从总细胞mRNA合成的cDNA)以根据所属领域中公认的方法用于杂交方法中。参见上文的Sambrook等人。在本发明的另一方面中，使用(例如)信息放大套组(MessageAmpki)(Ambion)放大mRNA。在另一方面，以可探测的标记来标记mRNA。举例来说，可使用诸如CyDye(AmershamBiosciences)的荧光发色团标记mRNA。在一些应用中，在用于杂交技术之前，可能需要抑制或破坏经常存在于均质物或溶解产物中的核糖核酸酶(RNase)。抑制或破坏核酸酶的方法已为人们所熟知。在本发明的一实施例中，在存在离液剂时，将细胞或组织均质化以抑制核酸酶。在另一实施例中，通过加热处理，接着通过蛋白酶处理来抑制或破坏RNase。可通过所属领域中的任何已知方法来获得蛋白样品。在本发明的所述技术中有益的蛋白样品包括原细胞溶解产物和原组织均质物。或者，可纯化蛋白样品。所属领域中已熟知的各种蛋白纯化方法可在Marshak等人，STRATEGIESFORPROTEINPURIFICATIONANDCHARACTERIZATIONALABORATORYCOURSEMANUAL(ColdSpringHarborPress，1996)中找到。a.寡核苷酸探针在本发明采用的核酸杂交技术中有益的寡核苷酸探针是通过一或多种类型的化学键，通常通过经由形成氢键互补碱基对配对，能够结合至互补核酸序列的核酸。探针可包括天然碱基对(例如，A、G、U、C或T)或经修饰的碱基对(7-脱氮鸟苷、肌苷等等)。此外，所述探针中的核苷酸碱基对可通过联接而非磷酸二酯酶键结合，只要其不干扰杂交。因此，探针可为肽核酸，其中组成碱基对是通过肽键而非磷酸二酯酶键联接结合。寡核苷酸探针可通过所属领域中任何已知方法制备。在本发明中有益的探针是能够杂交到多醣合成基因的核苷酸产物，例如杂交到SEQIDNO1-29之一的探针。在本发明中有益的探针可使用在SEQIDNO1-29中揭示的核苷酸序列产生。本发明包括具有任一SEQIDNO1-29的相应邻近序列的至少2、10、15、20、30、35、40、45、50、55、60、65、70、75、80、85或100个核苷酸片段的寡核苷酸探针。本发明包括长度小于2、1、0.5、0.1或0.05的寡核苷酸。在一实施例中，寡核苷酸在长度上是60核苷酸。可使用所属领域中任何已知方法设计寡核苷酸探针。参见例如Li和Stormo，Bioinformatics171067-76(2001)。可使用软件实现寡核苷酸探针设计。示范性软件包括ArrayDesigner、GeneScan和ProbeSelect。与所定义核酸序列互补的探针可使用限定酶从较长核苷酸来化学合成产生，或可使用例如聚合酶链反应(PCR)技术获得。已熟知PCR方法，并且其描述于例如Innis等人编辑，PCRPROTOCOLSAGUIDETOMETHODSANDAPPLICATIONS，ACADEMICPRESS，INC.，SanDiego，CA(1990)中。探针可用例如放射性、经结合生物素或荧光标记来标记。理想地，标记样品中的核酸序列，不标记探针。通过上文的方法产生的寡核苷酸探针可用于溶液或基于固体支撑件的方法。本发明包括杂交到编码区或杂交到多醣合成基因的3′未翻译区(3UTR)的产物的寡核苷酸探针。在一实施例中，寡核苷酸探针杂交到任一SEQIDNO1-29的3′UTR。3′UTR通常是基因的独特区，甚至在同一家族的各成员之间。因此，能够杂交到3′UTR的产物的探针可有益于区分基因的编码区可能高度一致的家族内的个别基因的表达。这就允许设计寡核苷酸探针以用作每一个都能够独特地结合到单一基因的复数个寡核苷酸中的成员。在另一实施例中，寡核苷酸探针包含任一SEQIDNO59-83。在另一实施例中，寡核苷酸探针包含任一SEQIDNO1-29。b.寡核苷酸阵列方法本发明的一实施例采用两个或两个以上寡核苷酸探针相结合以探测一个或一个以上多醣合成基因表达水平，例如探测SEQIDNO1-29的基因的表达水平。在这个实施例的一方面，探测两个或两个以上不同基因的表达水平。所述两个或两个以上基因可来自上文讨论的相同或不同多醣合成基因家族。所述两个或两个以上寡核苷酸的每一个均可杂交到一个不同所述基因。本发明的一实施例采用两个或两个以上寡核苷酸探针，其中每一个均特异地杂交到自SEQIDNO1-29提供的基因的转录获得的多核苷酸。另一实施例采用两个或两个以上寡核苷酸探针，其中至少一个包含SEQIDNO59-83的核酸序列。另一实施例采用两个或两个以上寡核苷酸探针，其中至少一个由SEQIDNO59-83组成。寡核苷酸探针可包含从大约5至大约60，或从大约5至大约500个核苷酸碱基对，例如从大约60至大约100个核苷酸碱基对，包括从大约15至大约60个核苷酸碱基对。本发明的一实施例使用基于固体支撑件的寡核苷酸杂交方法以探测基因表达。适于实践本发明的基于固体支撑件的方法已广泛得知，并且在例如PCT申请案WO95/11755；Huber等人，Anal.Biochem.29924(2001)；Meiyanto等人，Biotechniques.31406(2001)；Relogio等人，NucleicAcidsRes.30e51(2002)中描述。寡核苷酸可结合的任何固体表面可共价地或非共价地使用。这些固体支撑件包括过滤器、聚氯乙烯盘、基于硅或玻璃的晶片等等。一实施例使用寡核苷酸阵列，即微阵列，其可用于同时观测许多基因或基因产物的表达。寡核苷酸阵列包含在固体支撑件上提供的两个或两个以上寡核苷酸探针，其中每一探针在所述固体支撑件上占据一个独特位置。可预测定每一探针的位置，因此在给定位置探测到可探测信号是表明至已知身份的寡核苷酸探针的杂交。每一预测定位置可含有探针的多个分子，但预定位置的每一分子具有一致序列。这些预测定位置被称作特征。在一个固体支撑件上可有例如从2、10、100、1,000、2,000或5,000或更多这些特征。在一实施例中，每一寡核苷酸在阵列上至少2次，至少3次，至少4次，至少5次，至少6次，或至少10次位于一个独特位置。用于探测基因表达的寡核苷酸探针阵列可根据(例如)在Lockhart等人，Nat′lBiotech.141675(1996)，McGall等人，Proc.Nat′lAcad.Sci.USA9313555(1996)与Hughes等人，NatureBiotechnol.19342(2001)中描述的传统技术制造并使用。大量寡核苷酸阵列设计适于实践本发明。在一实施例中，一个或一个以上寡核苷酸包括每一个都杂交到特异组织类型中表达的不同基因的复数个寡核苷酸。举例来说，组织可为正发育木质。在一实施例中，自植物获得的核酸样品可放大，并且视情况地以可探测标签标记。可使用的任何核酸放大方法和为这个目的的任何可探测标签。举例来说，放大反应可使用(例如)Ambion信息放大执行，其产生“反义”RNA或“aRNA”(核酸序列与从样品组织提取的RNA互补)。RNA可视情况地使用CyDye荧光标签标记。在放大步骤时，aaUTP被并入所得aRNA。在非酶反应中，将CyDye荧光标签偶合至aaUTPs。放大与标记步骤后，经标记的放大反义RNA沉淀，并以适当缓冲溶液冲洗，并接着探测纯度。举例来说，纯度可使用NanoDrop分光光度计探测。接着将核酸样品与已附加至固体基板(“微阵列”载玻片)的寡核苷酸阵列接触，寡核苷酸样品探针能够杂交到可能存在于样品中的有关核酸。在有关核酸与阵列上存在的寡核苷酸探针间可发生杂交的条件下执行接触步骤。接着冲洗阵列以移除非特异性结合核酸，并且探测来自仍保持杂交到固体基板上寡核苷酸探针的经标记分子的信号。探测步骤可使用任何适于所使用标签类型的方法而完成。举例来说，探测步骤可使用激光扫描仪与探测器完成。举例来说，可使用Axon扫描仪，其视情况地使用GenePixPro软件以分析微阵列载玻片上信号的位置。可通过所属领域中已知的任何合适方法分析来自一个或一个以上微阵列载玻片的数据。在本发明的方法中使用的寡核苷酸探针包括微阵列技术，其可使用PCR产生。选择在产生所述择探针中使用的PCR引子，举例来说，基于SEQIDNO1-29的序列选择，以导致多醣合成基因独特片段(即，在标准杂交条件下仅杂交到任一SEQIDNO1-29的一个多核苷酸的片段)的放大。计算机程序在设计具有所需特异性与最佳杂交特性的引子中有益。举例来说，上文的Li和Stormo在1075处讨论了使用ProbeSelect选择探针的方法，ProbeSelect基于整个基因序列以及同时其它以待用探针探查的基因序列选择最佳寡核苷酸探针。在一实施例中，也使用寡核苷酸控制探针。示范性控制探针可至少分为3类，在本文中称作(1)正规化控制探针；(2)表达水平控制探针和(3)负控制探针。在微阵列方法中，可在阵列上将一个或一个以上这些控制探针与发明的多醣合成基因相关的寡核苷酸一起提供。正规化控制探针校正染色偏移、组织偏移、灰尘、载玻片不规则、畸形载玻片点等等。正规化控制探针是与加入待筛选样品的经标记的参考寡核苷酸或其它核酸序列互补的寡核苷酸或其它核酸探针。在杂交后，从正规化控制探针获得的信号提供对杂交条件、标记强度、读取效率变化的控制和对其它可引起完整杂交信号在阵列间变化的因素的变化的控制。在一实施例中，从所述方法中使用的所有其它探针读取的信号(例如荧光强度或放射性)通过来自控制探针的信号划分，进而使测量正规化。实际上任何探针可用作正规化控制探针。然而杂交效率随着碱基对组成与探针长度而变化。选择优选正规化探针以反映所使用的其它探针的平均长度，但其也可选择涵盖长度范围。另外，可选择正规化控制探针以反映所使用的其它探针的平均碱基对组成。在一实施例中，只使用一个或少数几个正规化探针，且其以使得其杂交良好(即不形成次级结构)且不会匹配任何测试探针的方式来选择。在一实施例中，正规化控制探针是哺乳动物基因。表达水平控制探针特异地与存在于生物样品中的组成表达基因杂交。实际上任何组成表达基因向表达水平控制探针提供合适靶位。通常，表达水平控制探针具有与组成表达“看家基因”子序列互补的序列，所述组成表达“看家基因”包括(但不限于)某些光合基因。“负控制”探针并不与任何测试寡核苷酸(即发明的多醣合成基因相关的寡核苷酸)、正规化控制探针、或表达控制探针互补。在一实施例中，负控制探针是并不与样品中任何其它序列互补的不容动物基因。术语“背景”和“背景信号强度”是指自非特异性结合或经标记目标核酸(即存在于生物样品中的mRNA)与寡核苷酸阵列的组份间的其它相互作用所得的杂交信号。背景信号也可通过阵列组份自身的内在荧光产生。可计算整个阵列的单一背景信号，或可计算每一目标核酸的不同背景信号。在一实施例中，将背景信号计算为所使用寡核苷酸探针的最低5％至10％的平均杂交信号强度，或其中计算每一目标基因的不同背景信号，每一基因的不同背景信号为探针的最低5％至10％。其中对应于特定多醣合成基因的寡核苷酸探针杂交充分，并且因此似乎特异地结合到目标序列，其不应用于背景信号计算中。或者可将背景信号计算为通过杂交到不与样品中发现的任何序列互补的探针所产生的平均杂交信号强度(例如针对反义核酸或针对样品中未发现的基因的探针)。在微阵列方法中，可将背景信号计算为通过根本缺少任何寡核苷酸探针的阵列区所产生的平均信号强度。c.基于PCR的方法在另一实施例中，使用基于PCR的方法探测基因表达。这些方法包括反向转录酶调节的聚合酶链反应(RT-PCR)包括实时与终点定量反向转录酶调节的聚合酶链反应(Q-RTPCR)。这些方法在所属领域中已熟知。举例来说，可使用从(例如)AppliedBioSystemsandStratagene(应用生物系统与策略基因公司)商业获得的套组和方法进行定量PCR方法。也请参见Kochanowski，QuantitativePCRProtocols(HumanaPress，1999)；上文的Innis等人；Vandesompele等人，GenomeBiol.3RESEARCH0034(2002)；Stein，CellMol.LifeSci.591235(2002)。也可在溶液中使用Q-RTPCR观测基因表达。Q-RTPCR依赖在放大PCR产物时产生的荧光信号比例的探测。见上文的Innis等人。与传统PCR方法相类似，这个技术采用杂交到有关DNA区的侧面相反链和区的PCR寡核苷酸引子，通常是15到30个碱基对长的引子。此外，设计探针(例如TaqMan，应用生物系统)使其杂交到在PCR技术中惯常使用的前与反向引子之间的目标序列。在5′端以报导子荧光团，例如6-羧基萤光素(6-FAM)与如6羧基四甲基罗丹明的淬灭荧光团(TAMRA)标记探针。只要探针完整，荧光能量便会发生转移，其导致报导子荧光团的荧光发射被淬灭荧光团吸收。然而，由于Taq聚合酶扩展引子，因此Taq的内在5′到3′核酸酶活性降解探针，释放报导子荧光团。放大周期间所探测到的荧光信号增加与每一周期中产生的产物量成比例。向前与反向放大引子和内部杂交探针经设计以特异地并独特地与自目标基因的转录获得的一个核苷酸杂交。在一实施例中，引子与探针序列的选择标准包括关于核苷酸含量与尺寸的限制以满足TaqMan的要求。SYBRGreen可用作上文所讨论的Taqman类型阵列的少探针Q-RTPCR替代方法。ABIPrism7900SequenceDetectionSystemUserGuideAppliedBiosystems，第1到8章，应用A到F.(2002)。在PCR放大期间，以设备测量荧光发射强度的变化。所述测量实时完成，即当反应中放大产物积累时完成测量。可使用其它方法测量从探针消解所得的荧光变化。举例来说，可基于分子翻滚法辨别大与小分子间的荧光偏振。d.蛋白探测方法可使用所属领域中已知的任何方法观测蛋白，包括免疫学探测、酶探测与蛋白探测/类蛋白体技术。可根据几种蛋白方法执行翻译状态的测量。举例来说，蛋白-“蛋白体”-的整个基因组监测可通过构造微阵列进行，所述微阵列中的结合位置包含具有任一SEQIDNO30到48的氨基酸序列的复数个蛋白的固定、优选地单克隆、特定抗体，或以SEQIDNO1-29或其保守变体的基因编码的复数种蛋白的固定、优选地单克隆、特定抗体。见Wildt等人，NatureBiotechnol.18989(2000)。已熟知制造多克隆与单克隆抗体的方法，如在(例如)Harlow与Lane，AntibodiesALaboratoryManual(ColdSpringHarborPress，1988)中所描述。或者，可通过二维胶体电泳技术系统分离蛋白。所属领域中已熟知二维胶体电泳技术系统，并且其通常包括沿第一维等电聚焦，接着沿第二维进行SDS-PAGE电泳技术分析。见例如Hames等人，GelElectrophoresisofProteinsAPracticalApproach(IRLPress，1990)。所得电子影像分析图可通过多种技术分析，包括质谱技术、西方转渍分析(westernblotting)和使用多克隆和单克隆抗体的免疫转渍分析(immunoblotanalysis)和内部与N端子微定序分析。3.将基因表达与表型和组织发育相关联如上文所讨论，本发明提供将基因表达与植物表型相关联的方法和手段。基因表达可在具有有关表型的植物中研究，并与不具所述表型的植物或具有不同表型的植物相比较。这个表型包括(但不限于)干旱耐受性增加、除草剂抗性、高度减小或增大、分枝减少或增多、抗冷冻与霜耐受性增强、生命力改善、色彩增强、健康与营养特征增强、储藏改善、产量提高、盐耐受性增强、木质腐烂抗性增强、真菌病症抗性增加、虫害吸引力改变、疾病耐受性增大、昆虫耐受性增大、水压耐受性增大、质地改善、发芽率增大、微量营养素摄入量增大、新颖树脂产生、纤维素含量增大、木质素含量降低和新颖蛋白或肽产生。在另一实施例中，表型包括下文特征的一个或一个以上形成反应性木质倾向、不成熟期降低、不成熟期增加、自我剪切分枝、生殖发育加速、或生殖发育延缓。在另一实施例中，植物比较中不同的表型包括下文的一个或一个以上木质素质量、木质素结构、木质组成、木质外观、木质密度、木质强度、木质刚性、纤维素聚合性、纤维尺寸、内腔大小、花冠比例、导管分子比例、其它植物组份、植物细胞分裂、植物细胞发育、单位面积的细胞数量、细胞大小、细胞形状、细胞壁组成、木质形成速率、木质审美外观、干缺陷形成、平均微纤维角度、S2细胞壁层宽度、生长速率、根的根部形成速率与分枝植物生长的比、叶面积指数与叶形状。可通过上文讨论的任何合适方法评估表型，例如上文的Hertzberg；上文的Ye和Sundstrom；美国专利申请公开案号2002/0107644与2002/0113212；上文的Marita等人。对于所属领域的技术人员显而易见的是，在不偏离本发明的精神和范围的情况下，可对本发明的方法和组合物做出多种改进和变化。因此，本发明用于涵盖本发明的改进和变化，只要所述改进与变化在所附权利要求范围和其等效物的范围内。下文给出实例解释本发明。然而，应了解不应将本发明限制于这些实例中所描述的特定条件或细节中。在整个所述说明书中，公开可利用文献，包括美国专利的任何专利和所有参考文献都特定地以全部引用的方式并入本文中。实例实例1实例1证明如何将巨桉与辐射松中的纤维素合成酶和纤维素合成酶类似基因分离和表征。从植物组织提取总RNA(使用Chang等人，PlantMol.Biol.Rep.11113-116(1993)中的方法)。从韧皮部(P)、形成层(C)、扩展木质部(X1)和经分化与木质素化的木质部(X2)获得植物组织样品。使用Poly(A)QuikmRNA分离套组(Stratagene，LaJolla，CA)或DynalBeadsOligo(dT)25(Dynal，Skogen，Norway)从总RNA制备物分离mRNA。根据使用制造商的方法，通过反向转录酶合成，接着通过使用ZAP表达cDNA合成套组(Stratagene)将所得cDNA克隆体插入LambdaZAP，由经纯化的mRNA构造cDNA表达基因库。使用GigapackII封装提取(Stratagene)，使用依赖所述基因库的5μL接合反应中的等分试样封装所得cDNAs。使用XLl-BlueMRF′细胞和具有ExAssist辅助性噬菌体(Stratagene)的XLOLR细胞(Stratagene)完成所述基因库的大量切离。以NZY肉汤(GibcoBRL，Gaithersburg，MD)将经切离的噬菌粒稀释，并将其涂在含有X-gal(5-溴-4-录-3-吲哚-β-半乳糖苷)和异丙基-β-D硫代半乳糖苷(IPTG)的LB-卡那霉素琼脂板上。在经涂布和选择用于DNA小量制备的克隆体中，99％含有适于定序的插入物。在NZY肉汤中以卡那霉素培养阳性克隆体，并且借助碱性溶菌法和聚乙二醇沉淀纯化cDNA。使用1％的琼脂糖凝胶筛选染色体污染的定序模板。根据制造商的方法，使用Turbo催化800仪制备染色引子序列(PerkinElmer/AppliedBiosystemsDivision，FosterCity，CA)。使用PerkinElmer/AppliedBiosystemsDivisionPrism377377定序仪获得阳性克隆体的DNA序列。cDNA首先从5′端定序，且在某些状况下，也从3′端定序。对于某些克隆体来说，使用核酸外切酶III删除分析获得内部序列，在pBK-CMV中产生不同大小的子克隆体库，或通过使用经设计识别有关基因区的基因特异性引子直接定序而获得某些克隆的内部序列。所测定的cDNA序列在SEQIDNO1-29中提供。经预测的多肽序列是SEQIDNO30到58。为在辐射松和巨桉数据库中识别纤维素合成酶(Ces)与纤维素合成酶类似(Csl)候选物，将cDNA序列与阿布属纤维素合成酶超级家族相比较。Richmon和Somerville，PlantPhysiol.124495(2000)。下一步，使用公共域序列(通过SWISS-PROT/TrEMBL蛋白识别号)相对于松树和桉树数据库搜索(非冗余片段重叠群，期望值＜1.0e-2)。松树获得80次匹配，桉树获得82次匹配。对于这些匹配来说，26个松树和15个桉树是潜在全长(即含有起始Met)或接近全长序列。接着获得所有162个匹配树木的片段重叠群一致DNA与蛋白序列，并且识别复制序列。着对蛋白序列进行多重比较。使用剩余的29个松树与桉树序列与阿布属成员，与2个胼胝质合成酶和2个纤维素酶建立蛋白比较。从所述蛋白比较，建立系统树状图。这个系统树状图以ces家族或csl家族序列命中为基。通过引子行走分析这些序列以提供全长序列(分析从片段重叠群挑选的最佳HT全长序列)。还提取了玉米、棉花、水稻与白杨的公共域纤维素合成酶序列，并且对照松树和桉树数据库进行比对。还将已完成引子行走的松树与桉树序列对照其自身的序列进行比对，并获取最前面的500个匹配。完成这个步骤，以使所述序列可用于进一步搜索，并且通过使用阿布属超级家族确保未错失松树与桉树数据库中的任何数据。这个搜索产生了在以前的搜索中未发现的4个其它序列。然后，也发送这些序列以获得经引子行走的全长序列。引子行走后，移除少数附加复制子，然后识别30个松树与桉树经引子行走的纤维素合成酶超级家族成员。通过与ClustalX的比较、相应的系统树状图与MEME/MAST分析证实这些序列的分类CES或CSL。实例2为在cDNA基因库中识别部分cDNA序列的附加序列5′或3′，使用SMARTRACEcDNA放大套组(ClontechLaboratories.PaloAlto.Calif.)执行cDNA端(RACE)的5′与3′快速放大。通常，所述方法必须首先分离聚合(A)mRNA，执行第一与第二链cDNA合成以产生双链cDNA，钝化cDNA末端，并接着连接SMARTRACE。cDNA的调节子形成经调节子连接的dscDNA基因库。设计基因特异性引子以与调节子特异性引子一起用于5′与3′RACE反应。使用5′与3′RACE反应，获得5′与3′RACE片段，并将其定序、克隆。可重复所述过程直到识别出全长基因的5′与3′末端。通过使用基因5′与3′末端特异性引子(以末端对末端PCR而特异)的PCR，可产生全长cDNA。举例来说，为放大自第一链cDNA的基因的缺失5′区，将引子设计成从模板序列相反链及从模板序列的约100到200bp之间区的5′→3′。成功的放大应在模板5′末端与PCR产物之间产生约100bp的DNA序列重合。使用Concert试剂方法(Invitrogen，Carlsbad，CA)与标准分离和提取过程从4种松树组织提取RNA，即子叶、木质部、韧皮部与结构性根。接着使用10U/μl脱氧核糖核酸酶I(RocheDiagnostics，Basel，Switzerland)将所得RNA以脱氧核糖核酸酶处理。使用100μgRNA、9μl10x脱氧核糖核酸酶缓冲溶液(Invitrogen，Carlsbad，CA)、10μlRoche脱氧核糖核酸酶I与90μl不含核糖核酸酶的水。接着在室温下将RNA培养15分钟，并添加1/10体积的25mMEDTA。根据制造商的方法，使用核糖核酸酶微套组(Qiagen，Venlo，Dutch)纯化RNA。为合成cDNA，根据制造商的方法，使用从木质部、韧皮部、子叶与根提取的RNA，接着使用SMARTRACEcDNA放大套组(ClontechLaboratoriesInc，PaloAlto，CA)。对于RACEPCR，结合来自4种组织类型的Cdna。通过结合等体积的来自木质部、韧皮部、根与子叶组织的cDNA产生快速PCR通用试剂(mastermixforPCR)。在96孔PCR载玻片上进行PCR反应，其具有1μl来自引子稀释载玻片(10mM)的引子对应孔位置。将49μl快速PCR通用试剂整分放入具有引子的PCR载玻片上。以下列参数在GeneAmp9700(应用生物系统公司，Foster，CA)上开始热循环94℃(5秒)，72℃(3分钟)，循环5次；94℃(5秒)，70℃(10秒)，72℃(3分钟)，循环5次；94℃(5秒)，68℃(10秒)，72℃(3分钟)，循环25次。按下述标准过程在琼脂糖凝胶上分离cDNA。剪切胶体片段，并遵循制造商指示，通过使用96孔胶体洗提套组从胶体将其洗提。遵循下文说明将PCR产物隔夜连接放入96孔板的pGEMTeasy(Promega，Madison，Wl)将60-80ngDNA、5il2X快速连接缓冲液、0.5μlpGEMT简易载体、0.1μlDNA连接酶用水填充到10μl并隔夜培养。遵循标准过程将每一克隆转型进入大肠杆菌，并从按照下文标准方法选取的12克隆中提取DNA。在1％的琼脂糖凝胶上校验DNA提取与DNA质量。通过限制性消化，使用限制性核酸内切酶EcoRI与胶体电影技术，遵循标准实验室过程，测定校正尺寸插入物的出现。具有有义UDP葡萄糖结合域序列可操作性地连接到组成型启动子的桉树原种克隆的转型具有增加的生长表型，如以纤维素合成、初级细胞壁合成、木质密度与拉伸强度所证明。从储备桉树植物收获移植叶，并将移植植物在预处理媒介上培养。与培养基包含植物生长素、细胞分裂素与土壤杆菌诱导子，例如乙酰丁香酮，刺激沿移植组织剪切边缘的细胞分裂。四天预培养后，以含有质体的土壤杆菌种类GV2260培养移植植物，所述质体的一部分UDP葡萄糖结合域可操作性地连接到泛激素启动子。在转入到Euc再生媒介中之前，将移植植物共培养3天。在Euc再生媒介上培养4天后，将移植植物转移到含有除草剂的选择性媒介上。在选择除草剂抗性转化株后，检验转化株的GUS表达。当确认GUS表达时，收获幼苗并将其转移到生根媒介中。生根媒介含有以MeadWestvacoNuchar活性炭补充的5g/l的BTM-1盐，并且生根发育通常发生在2到4周后。当初级根系统发育时，将经转型的植物转移到土壤中。可操作性地连接到泛激素启动子的携带任一SEQIDNO1-29的转基因桉树植物显示生长加速。实例3实例3说明RNA提取与纯化过程，其对从松针、木质部、形成层与韧皮部获得的RNA特定地有益。从松针、木质部、形成层或韧皮部获得组织。在液氮中冷冻所述组织，并将其置于地面上。使用Concert植物RNA试剂提取总RNA(Invitrogen)。将所得RNA样品放入苯酚氯仿中提取，并以脱氧核糖核酸酶处理。接着，在65℃将所述RNA培育2分钟，然后在4℃离心30分钟。离心后，将RNA放入苯酚中提取至少10分钟，以移除污染物。进一步使用RNeasy柱(Qiagen)清洁RNA。经纯化的RNA使用RiboGreen试剂(分子探针)定量，并以胶体电泳技术评估纯度。接着使用MessageAmp(Ambion)放大RNA。将氨烯丙基-UTP与从由UTP以4∶1的比例加入经纯化RNA的活体外转录。当转录时，氨烯丙基-UTP被并入新的RNA链中。接着所述氨烯丙基基团与Cy标记反应以使用Amersham过程将比色标记附加到所得经放大RNA，所述Amersham过程为与RNA一起使用而改进。未并入的标记以乙醇沉积移除。经标记的RNA分光光度定量(NanoDrop分光光度计)。如在Hughes等人，NatureBiotechnol.19342(2001)中所描述，通过加热到95℃将经标记的RNA分段。实例4实例4说明如何测定对辐射松木质发育重要的纤维素合成酶或纤维素合成酶类似基因，并且说明如何设计并合成在微阵列上使用的独特地结合到那些基因的寡核苷酸。辐射松种松树在自然光条件下生长。如在例如Sterky等人，Proc.Nat′lAcad.Sci.9513330(1998)中所描述制备组织样品。特定地，从高度为5m的木质数目收集组织样品。木质树木的组织样品通过经由树干的形成层区切线部分制备。将树干水平地划分为从不成熟木质(上部)到成熟木质(底部)变化的部分。以发育阶段分离的树干部分进一步通过剥皮为韧皮部部分、分化韧皮部、形成层、分化木质部、发育木质部和成熟木质部，分为5层。也从辐射松种的树苗制备包括叶，芽、幼苗与根的组织样品。如在实例1或在上文的Sterky等人中所描述，分离RNA并产生EST。将从含有发育木质的样品获取的EST核酸序列与已知在多醣合成中包括的基因的核酸序列相比较。也将来自不含发育木质的样品的EST序列与已知在植物细胞周期中包括的基因的序列相比较。使用BLAST(NCBI)执行计算机杂交分析。下面的表6与表7说明巨桉(表6)和辐射松(表7)中纤维素合成酶与纤维素合成酶类似蛋白的计算机杂交数据。表6.巨桉的计算机杂交数据表7辐射松的计算机杂交数据选择来自已知纤维素合成酶与纤维素合成酶类似蛋白基因中的序列用于进一步研究，所述纤维素合成酶类似蛋白基因在计算机中显示杂交到由含有发育木质的样品制造EST，但其并不杂交到由未含有发育木质的样品制造EST。使用分子生物学领域中的技术人员已熟知的技术从cDNA基因库选择cDNA克隆体，所述cDNA克隆体含有杂交到显示木质优选表达的基因的序列。使用所述序列信息设计寡核苷酸，因此每一寡核苷酸仅对于基因库中的一个cDNA序列特异。表5中提供寡核苷酸序列。使用上文的Li与Stormo的方法或使用软件例如ArrayDesigner、GeneScan与ProbeSelect设计60mer长度的寡核苷酸探针。接着根据Hughes等人，NatureBiotechnol.19324(2002)或Kane等人，NucleicAcidsRes.284552(2000)中所描述的合成寡核苷酸，并使用氨基连接子将其固定到经活化的玻璃载玻片(Sigma-Genosis，Woodland，TX)。已知载玻片上每一寡核苷酸的位置。实例5实例5说明如何使用实例4中所描述的从辐射松cDNA序列获得的微阵列选择来从多种松树种的组织RNA(在这个情况下是辐射松与火炬松(P.taeda)树)，用于不成熟木质和成熟木质中与木质发育相关联的基因表达模式的分析，所述不成熟木质和成熟木质形成树木区。从种植园生长点选择大约16年生开放授粉树木，在美国选择火炬松，在新西兰选择辐射松。在春季与夏季砍伐树木以比较与这些不同木质形成发育阶段相关联的基因表达。从距基部大于1到2米的末端区域将个别砍伐的树木与树干区移除，并在活树冠下1到2米内将个别砍伐的树木与树干区移除。从树干基部末端移除的部分含有成熟木质。从活树冠下移除的部分含有不成熟木质。在春季收集的样品被称作早期木质或春季木质，而在夏季收集的样品被认为是晚期木质或夏季木质。Larson等人，Gen.Tech.Rep.FPL-GTR-129.Madison，WlU.S.DepartmentofAgriculture，ForestService，ForestProductsLaboratory，，第42页。从树干部分分离组织，因此韧皮部、形成层、发育木质部与成熟木质部被移除。这些组织仅从当年生长环收集。当在每一种情况下移除组织时，将材料迅速浸入液氮中以保存核酸与其它组份。从所述部分剥掉树皮，并从树皮的内表面通过以刀锋切削将韧皮部移除。从剥皮部分的外表面通过轻轻切削表面将形成层分离。通过顺序执行剩余组织的更多有力切削分离发育木质部与木质素化木质部。将组织从液氮移入容器中以在-70℃长期储存，直到执行RNA提取和随后的分析。实例6实例6说明替代那些在实例3中使用的用于RNA提取和纯化的过程，其对于从木质植物多种组织获得的RNA尤其有益，而且实例6说明使用实例4中所描述的阵列用于杂交与数据分析的过程。根据Chang等人，PlantMol.Biol.Rep.11113中描述的方法分离RNA。根据制造商建议使用DNaseI(Invitrogen，Carlsbad，CA)移除DNA。使用Agilent2100生物分析仪(AgilentTechnologies，USA)测定RNA样品的整体性。使用已知方法将每一组织的10μg总RNA反向转录于cDNA中。在辐射松韧皮部组织的情况下，难以提取足够量的总RNA用于标准标记过程。提取总RNA并如前所描述将其处理，并且使用来自NuGENTM的OvationTM纳米样品RNA放大系统将100ng总RNA放大。或者可使用类似放大套组，例如那些Ambion制造的套组。将经放大的RNA反向转录于cDNA，并按照上文所描述将其标记。按照美国专利申请(上文的)“用于微阵列分析的cDNA标记与杂交的方法和套组”中描述的方法在42℃下执行杂交与严谨性冲洗。使用扫描阵列4000微阵列分析系统(ScanArray4000MicroarrayAnalysisSystem)(GSILumonics，Ottawa，ON，Canada)扫描阵列(载玻片)。使用QUANTARRAY软件(GSILumonics，Ottawa，ON，Canada)产生原始的未正规化的强度值。使用完全平衡、不完全区组实验设计(Kerr和Churchill，Gen.Res.123123，2001)以审计允许从分析数据的最大统计推测的阵列实验。使用SAS微阵列方法软件包分析基因表达数据(SASInstitute，Gary，NC，USA)。接着使用JMp检验所得数据(SASInstitute，Gary，NC，USA)。为这个实验所做的分析是具有混合模型特异性的ANOVA(方差分析)方法(Wolfinger等人，J.Comp.Biol.8625-637)。应用2个线性混合模型步骤。第一个，正规化模型，其应用于载玻片水平上的全面正规化。第二个，基因模型，其应用于在每一个基因上进行精确统计推测。模型(1)和模型(2)中说明2个模型。log2(Yikls)＝θij+Dk+Sl+DSkl+ωikls(1)Rijkls(g)=μij(g)+Dk(g)+Sl(g)+DSkl(g)+SSls(g)+ϵijkls(g)----(2)]]>Yijkls表示第I载玻片上第s点的强度，第I载玻片具有第j处理应用于第i细胞系的第k染色。θij、Dk、Sl与DSki第I细胞系中平均第J处理影响、第K染色影响、第I载玻片随机影响与第I载玻片上第K染色的随机交互影响，Wijkls是随机误差项，除θij、Dk、Sl，与Dski对第g基因的特异性外，Wijkls表示与θij、Dk、Sl，与Dski类似的作用。Rijkls(g)表示来自模型(1)的第g基因的残差。除θij、Dk、Sl，与Dski对第g基因的特异性外，D(g)k，S(g)l，和DSkl(g)表示与θij、Dk、Sl和DSki的类似作用，SSls(g)表示第g基因的受到载玻片随机影响的点。εijkls(g)表示随机误差项。认为所有随机项均正态分布，并且在每一模型中相互独立。根据上文所描述的分析，其中一些已在表4中展示的某些cDNA，被发现分化表达。木质发育中这些特异性基因的包括是通过基因的上调或下调与木质发育特定阶段的关联推测到的。当确立基因表达与木质发育中相关性的联系时，考虑特定季节，横贯一个区(韧皮部、形成层、发育木质部、成熟木质部)中木质发育的空间连续性与树干位置和季节与树干的关系。实例7实例7证明如何将多醣基因表达与诸如密度、刚性、强度、分枝间的距离和螺旋纹理的农艺学重要木质表型相关联。在已知亲本树木的子代中选择较好生长特点于重要真菌疾病抗性的成熟克隆繁殖松树。将树皮从切线部分移除，在胸高处检查第五年轮中平均木质密度、木质刚性与强度和螺旋纹理。所述树木的特征也在于其高度、主要述木分枝间的平均距离、树冠大小与分枝。为获得隔离主要基因的幼苗家族，所述主要基因影响密度、刚性、强度、分枝间的距离、螺旋纹理与可连接到任一影响这些特点的基因的其它特点，在其显示彼此间关于密度、刚性、分枝间距离与螺旋纹理标准的最大范围变化的标准下，选择缺少共同亲本的树木用于特定交叉。因此，来自显示高密度、低主要分枝间平均距离和高螺旋纹理的树木的花粉用于对来自可选择树木中的不相关优势木的球果授粉，所述可选择树木显示最低密度、最高主要分枝间平均距离与最低螺旋纹理。有必要注明“优势木”经交叉，因此例如将来自显示高密度的优势木的花粉用于对来自其它显示高密度的优势木的发育球果授粉，并且来自显示低主要分枝间平均距离的树木的花粉将用于对来自其它显示低主要分枝间平均距离的优势木的发育球果授粉。从这些经控制授粉的树木收集种子，并使其生长，因此每一种子将保持亲本特性，并且每一种子可用于植物繁殖，因此每一基因型以多个无性分株表示。使用微繁殖、篱植、肌束插枝完成植物繁殖。当每一基因型的植物繁殖体长到用于建立野外种植足够大的尺寸时，每一基因型的一些无性分株存储。在复制设计中探测所述基因型，并使其在日间温度与降雨测量并记录的野外条件下生长。在多种年龄测量树木以测定密度、刚性、强度、分枝间距离、螺旋纹理与可连接到任一影响这些特点的基因的其它可观测特点。收获样品用于表征纤维素含量、木质素含量、纤维素微纤维角度、密度、强度、刚性、管胞形态、年轮宽度和类似特征。如在实例6中所描述也研究样品的基因表达。每一基因型的无性分株与同一基因型不同年龄的无性分株相比较以确立这些特点的年龄年龄关系。实例8实例8证明如何响应环境条件例如光与季节来改变植物表型，且证明如何使用微阵列与多醣合成基因表达相关联。详细来说，研究与木质密度相关联的基因表达的改变。3种不同克隆繁殖的巨桉树杂交体基因型在具有气象站测量日温与降雨的地点生长。在春季与随后而来的夏季期间，3种不同基因型的遗传一致无性分株首先以北到南方向标记摄影，接着将其砍伐，使用充分分辨率的摄影术以展示植物不成熟与成熟部分的树皮特点。树木的年龄通过种植记录测定，并且通过年轮计数证实。在每一颗这些树中，成熟木质被定义为胸高以下最外环，且不成熟木质被定义为胸高以上最内环。因此，每一颗树按照如下划分NM北部成熟SM南部成熟NT北部过渡ST南部过渡NJ北部不成熟SJ南部不成熟从植物树干以及不成熟和成熟形式叶收获组织。同时制备样品用于表型与基因表达分析，包括植物形态学与生物化学特点。记录获得每一部分的点的树木高度和直径，并获取树木基部的土壤样品用于化学化验。称重经制备用于基因表达分析的样品，并将其放入液氮中用于随后在微阵列试验中使用的RNA样品的制备。将组织表示为如下P韧皮部C形成层X1扩展木质部X2分化与木质素化木质部将树干每一部分的切线与半径区中的薄层按照Ruzin，PlantMicrotechniqueandMicroscopy，OxfordUniversityPress，Inc.，NewYork，NY(1999)中所描述的固定，用于木质发育阶段的解剖研究与证实。在木质不同发育阶段研究微纤维角度，例如在巨按木质的不成熟、过渡与成熟阶段研究。所研究的其它特点是每一部分中纤维与导管分子和花冠组织的比例。此外，研究这些样品在不成熟与成熟木质间和春季木质与夏季木质间变化的特点，例如纤维素形态、内腔大小、S2(最厚)细胞壁层宽度。进一步检查第五环中密度的测量与使用木质阵列领域中的技术人员熟知的技术的弹性系数的测量。参见例如，Wang等人，Non-destructiveEvaluationsofTrees，ExperimentalTechniques，第28到30页(2000)。对于生物化学分析，使用植物生物化学领域中的技术人员熟知的单一琼脂、氨基酸、脂、其它提取物、木质素和纤维素量的生物化学化验，冷干并分析50g每一所收获样品。见，例如Pettersen与Schwandt，J.WoodChem.&Technol.11495(1991)。在本实例中，为比较而选择的表型是高密度木质、平均密度木质与低密度木质。按照实例3中所描述，由在春季与夏季收获的树木制备核酸样品。按照上文描述执行杂交的基因表达图谱与数据分析。当多醣合成基因表达与其它综合木质特点例如强度、刚性和螺旋形性关联时，使用类似技术与克隆繁殖单体可研究多醣合成基因表达。实例9实例9证明纤维素合成酶如何连接到组织优选启动子，并且在松树中表达，导致具有木质密度增加的植物。以实例7中描述的方法识别多醣合成基因，所述多醣合成基因在早期春季更高度表达。将具有可操作性地连接到启动子的密度相关多肽的DNA构造放于合适二元载体中，并使用本文所描述的方法将其转型为松树。如在本文中所描述转型松树植物，并且将所述转基因松树植物用于确立林业种植。相对于未以密度相关DNA构造转型的控制松树植物，在转基因松树植物中，甚至在春季木质(早期木质)中即可观测到密度增加。实例10使用分子生物学领域的技术人员已熟知的技术，在从紫花苜蓿分离的基因组DNA中分析实例9中分离的纤维素合成酶序列。这就使得紫花苜蓿中直系同源性的识别成为可能，接着将紫花苜蓿的序列用于建立RNAi剔除构造。然后将这个构造转型入紫花苜蓿。参见例如Austin等人，Euphytica85，381(1995)。所述再生转基因植物显示低纤维含量与木质部中射线细胞含量的增加。与相同种类野生型紫花苜蓿相比，所述特性改善可消化性，所述可消化性的改善导致喂食这种紫花苜蓿的牛快速生长。实例11实例11证明如何将基因表达分析用于在具有所需表型的成熟植物中发现存在于其中的基因变体。这个变体的出现或缺失可用于预测成熟植物表型，允许在子叶期筛选植物。尽管这个实例采用桉属，但本文使用的方法也有益于松树和其它树种的培养计划。公认密度相关基因序列用于从桉属分离的探针基因组DNA，如在前实例中所描述桉属的密度可发生变化。研究不同木质表型的非转基因产生桉属杂交体。一个杂交体显示高木质密度，并且另一杂交体显示低木质密度。在编码区的3′部分发现分子标记，其将高密度基因变体从低密度基因变体区分开来。这个分子标记使得当树木仍处于子叶期时，树木育种人便能够探测非转基因桉属杂交体的可能密度谱图，然而当缺少所述标记时，树木育种人必须等到树木成长多年，直到收获时的密度能够可靠预测之前，才能探测非转基因桉属杂交体的可能密度谱图。这就使得最佳树木在子叶期即可选择性的出圃，而不是进行昂贵精选并导致在疏伐阶段腐蚀。这个分子标记在培育阶段测定何者亲本将产生高密度异型杂交子代中进一步有益。在基因的编码区部分3′发现的分子标记也有益，所述分子标记并不对应于在较高或较低木质密度非转基因桉属杂交体树木中常见的变体。我们发现这些标记对于桉属的指纹不同表型有益，对于用在培育计划与种植园中的一致性追踪有益。实例12这个实例描述用于识别基因表达差异的微阵列，所述基因表达差异促成商业木质中重要的表型特点，即木质外观、刚性、强度、密度、纤维尺寸、粗糙度、纤维素与木质素含量、可提取含量与类似物质含量。为从发育木质部、形成层、韧皮部、叶、芽、根和其它组织收集和分离RNA，从不同地点和在一年的多个时间砍伐产生商业重要木质产品的木质树种，在本发明状况下是松属和按属。也从相同种的子叶分离RNA。将所有片段重叠群与由RNA制造的EST相比较，所述RNA从含有发育木质的样品中分离，并将所有片段重叠群与由多种组织的RNA制造的EST的序列相比较，所述多种组织并不含有发育木质。测定主要含有EST的片段重叠群以对应发育木质中特定表达的可能的新颖基因，与由从不含有发育木质的样品分离的RNA制造的EST相比，片段重叠群的EST在计算机中显示更倾向于杂交到由从含有发育木质的样品中分离的RNA制造的EST。接着将这些片段重叠群用于BLAST搜索公共域序列。下个步骤中选择那些在计算机中以高度严谨性杂交到未知基因或杂交到被注解为仅具有“假定蛋白”的基因的片段重叠群。这些片段重叠群被公认是显示木质优选表达的新颖基因。使用分子生物学领域中的技术人员已熟知的技术从cDNA基因库选择最长cDNA克隆体，所述cDNA克隆体含有杂交到显示木质优选表达的公认新颖基因的序列。将所述cDNA定序，并在可能之处获得全长基因编码序列与未翻译侧翼序列。从显示木质优选表达的公认新颖基因的每一个序列选择45到80核苷酸(或寡核苷酸)段，因此每一寡核苷酸探针在高度严谨性条件下仅杂交到在由RNA制造的EST中表示的一个序列，所述RNA从相同种的树木或子叶分离。接着化学合成低聚物，并如实例4中所描述将其放置于微阵列载玻片上。每一低聚物对应于显示木质优选表达的公认新颖基因的特定序列，而且并不对应其它基因，所述其它基因的序列在由从相同种的树木或幼苗分离的RNA制造的EST中表示。按照实例4进行样品制备和杂交。这个实例中使用的技术比使用cDNA探针的微阵列的使用更有效，因为表示特定基因表达的显著证据的信号的出现，而非许多基因中任一个的出现，由于保守功能域或共同进化史，所述许多基因含有与cDNA的类似性。因此，可能区分同源基因，例如那些同一家族，但在表型测定中可能具有不同功能的基因。这个用实例6的方法获得的杂交数据使得用户能够识别何者公认新颖基因真正具有与已知基因协调的表达模式、与特定发育职能一致的表达模式和/或暗示基因具有以有用方式驱动表达的启动子的表达模式。可使用用这个方法获得的杂交数据，例如识别在发育春季木质(早期木质)中显示具有最低纤维素微纤维角度的管胞特定表达模式的公认新颖基因。也可按照实例8分离这个基因的启动子，并且可可操作性地将其连接到如照实例9中所展示的基因，以与晚期木质(夏季木质)相关联。使用实例9的方法产生含有这种构造的转基因松树植物，并且接着展示这些植物的早期木质以显示几个晚期木质特点，例如较高微纤维角度、较高密度、较小平均内腔等等。实例13实例13证明使用功能性地连接到多醣合成基因的木质部特异启动子以用于增加植物生物量。如在实例6中所描述，经由不同次级维管结构层的阵列分析识别木质部特异多醣合成转录。使用(例如)BD克隆技术基因组行走套组(BDClontechGenomeWalkerkit)，从松树染色体组DNA克隆候选启动子，所述候选启动子连接到对应于这些转录的基因，并在转基因烟草中经由形成层的特异/优选报导子探测测试所述候选启动子。过量表达次级木质部细胞分裂中包括的多醣合成基因的木质部特异启动子用于增加木质生物量。构造串接木质部特异性启动子以驱动多醣合成基因ORF。提高候选多醣合成基因的转录水平可导致木质部生物量表型的增加。***尽管参考示范性实施例描述了本发明，但所属领域的技术人员应了解在不偏离本发明范围的情况下，可做出多种变化，而且其元素可被对等元素取代。此外，在不偏离本发明的基本范围的情况下，可做出许多改进以使特定情况或物质适于本发明的教导。因此，希望本发明不限制于涵盖用于进行本发明的最佳模式来揭示特定实施例。本文中所引用的所有参考文献和公开案以全文引用的方式并入本文中。序列表表1巨桉多醣合成基因表2辐射松多醣合成基因表3巨桉多醣合成肽表4辐射松多醣合成肽表5寡核苷酸序列权利要求1.一种经分离的多核苷酸，其包含选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列。2.根据权利要求1所述的多核苷酸，其中所述核酸序列是选自由SEQIDNO1-2、7-14、16-18、20-21、24-25与27-30和其保守变体组成的群组。3.根据权利要求1所述的经分离的多核苷酸，其中所述多核苷酸具有与桉属或松属种类的野生型植物中表达的基因中所包含的序列相一致的序列。4.根据权利要求1所述的经分离的多核苷酸，其中所述变体与SEQIDNO1-29的任一个具有大于或等于99％、98％、97％、96％、95％、94％、93％、92％、91％、90％、89％、88％、87％、86％、85％、84％、83％、82％、81％、80％、79％、78％、77％、76％、75％、74％、73％、72％、71％、70％、69％、68％、67％、66％、65％、64％、63％、62％、61％或60％的序列一致性。5.根据权利要求4所述的经分离的多核苷酸，其中变体编码与SEQIDNO1-29的任一个具有大于或等于60％、70％、80％、85％、90％或95％的序列一致性。6.根据权利要求5所述的经分离的多核苷酸，其中所述变体编码具有氨基酸序列的蛋白，所述氨基酸序列与SEQIDNO30-58的任一个具有大于或等于60％、70％、80％、85％、90％或95％的序列一致性，且其中通过所述多核苷酸编码的所述蛋白拥有通过SEQIDNO1-29的所述任一个编码的所述蛋白的活性。7.一种植物细胞，其以权利要求1所述的经分离的多核苷酸轉型。8.一种转基因植物，其包含权利要求1所述的经分离的多核苷酸。9.一种DNA构造，其包含至少一个多核苷酸，所述多核苷酸具有SEQIDNO1-29的任一个和其保守变体的序列。10.根据权利要求9所述的DNA构造，其进一步包含一个启动子，其中所述启动子与所述多核苷酸可操作地连接。11.根据权利要求10所述的DNA构造，其中所述启动子是选自由组成型启动子、强启动子、可诱导型启动子、可调节型启动子、暂时调节型启动子和组织优选型启动子组成的群组。12.根据权利要求9所述的DNA构造，其中所述多核苷酸编码RNA转录物。13.根据权利要求12所述的DNA构造，其中所述多核苷酸相对于所述启动子处于同义或反义定向。14.根据权利要求12所述的DNA构造，其中所述RNA转录物诱导多核苷酸的RNA干扰，所述多核苷酸具有选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列。15.一种植物细胞，其以权利要求14所述的DNA构造转型。16.一种转基因植物，其包含权利要求15所述的植物细胞。17.一种制造经转型的植物的方法，其包含以权利要求14所述的DNA构造转型一植物细胞；在促进植物生长的条件下，培养所述经转型的植物细胞。18.一种植物细胞，其以权利要求9所述的DNA构造转型。19.一种转基因植物，其包含权利要求18所述的植物细胞。20.根据权利要求19所述的转基因植物，其中所述植物的表型不同于相同种类的未经所述DNA构造转型的植物的表型。21.根据权利要求20所述的转基因植物，其中在所述转基因植物中不同的表型是选自由以下各表型组成的群组木质素质量、木质素结构、木质组成、木质外观、木质密度、木质强度、木质刚性、纤维素聚合性、纤维尺寸、内腔大小、花冠比例、导管分子比例、植物细胞分裂、植物细胞发育、单位面积的细胞数量、细胞大小、细胞形状、细胞壁组成、木质形成速率、木质审美外观、干缺陷形成、平均微纤维角度、S2细胞壁层宽度、生长速率、根的根形成速率与分枝植物发育的比、叶面积指数和叶形状。22.根据权利要求19所述的转基因植物，其中所述植物是木质植物。23.根据权利要求22所述的转基因植物，其中所述植物是树。24.根据权利要求23所述的转基因植物，其中所述植物是桉属或松属种类。25.根据权利要求19所述的转基因植物，其中与相同种类的未经所述DNA构造转型的植物相比，所述植物呈现选自由以下各特点组成的群组的一个或一个以上特点干旱耐受性增加、除草剂抗性、高度减小或增大、分枝减少或增多、冷冻或霜耐受性增强、生命力改善、色彩增强、健康与营养特征增强、储藏改善、产率提高、盐耐受性增强、木质腐烂抗性增强、真菌疾病抗性增强、虫害吸引力改变、疾病耐受性增大、昆虫耐受性增大、水压耐受性增大、质地改善、发芽率增大、微量营养素摄入量增大、新颖树脂产生、纤维素含量增大、木质素含量降低和新颖蛋白或多肽产生。26.根据权利要求19所述的转基因植物，其中与相同种类的未经所述DNA构造转型的植物相比，所述植物呈现选自由以下各特点组成的群组的一个或一个以上特点不成熟期降低、不成熟期增加、形成反应性木质倾向、自我脱落分枝、生殖发育加速或生殖发育延迟。27.一种经分离的多核苷酸，其包含编码选自SEQIDNO30-58的任一个的多肽的催化性或基质结合域的序列，其中所述多核苷酸编码一多肽，所述多肽具有选自SEQIDNO30-58的任一个的所述多肽的活性。28.一种制造经转型的植物的方法，其包含以DNA构造转型植物细胞，所述DNA构造包含至少一个具有SEQIDNO1-29的任一个的序列的多核苷酸，和在促进植物生长的条件下，培养所述经转型的植物细胞。29.根据权利要求28所述的方法，其中所述DNA构造进一步包含一启动子，其中所述多核苷酸与所述启动子可操作地连接。30.根据权利要求28所述的方法，其中所述至少一个多核苷酸编码选自由纤维素合成酶和纤维素合成酶类似蛋白组成的群组的蛋白。31.根据权利要求28所述的方法，其中所述植物细胞位于植物移植组织中。32.根据权利要求28所述的方法，其中所述转基因植物呈现不同于相同种类的未经所述DNA构造转型的植物的表型。33.根据权利要求28所述方法，其中在所述转基因植物中不同的表型是选自由以下各表型组成的群组木质素质量、木质素结构、木质组成、木质外观、木质密度、木质强度、木质刚性、纤维素聚合性、纤维尺寸、内腔大小、花冠比例、导管分子比例、植物细胞分裂、植物细胞发育、单位面积的细胞数量、细胞大小、细胞形状、细胞壁组成、木质形成速率、木质审美外观、干缺陷形成、平均微纤维角度、S2细胞壁层宽度、生长速率、根的根形成速率与分枝植物发育的比、叶面积指数和叶形状。34.根据权利要求28所述的方法，其中与相同种类的未经所述DNA构造转型的植物相比，所述转基因植物呈现选自由以下各特点组成的群组的一个或一个以上特点干旱耐受性增加、除草剂抗性、高度减小或增大、分枝减少或增多、冷冻或霜耐受性增强、生命力改善、色彩增强、健康与营养特征增强、储藏改善、产率提高、盐耐受性增强、木质腐烂抗性增强、真菌疾病抗性增强、虫害吸引力改变、疾病耐受性增大、昆虫耐受性增大、水压耐受性增大、质地改善、发芽率增大、微量营养素摄入量增大、新颖树脂产生、纤维素含量增大、木质素含量降低和新颖蛋白或多肽产生。35.一种从转基因树获得的木质，所述转基因树经根据权利要求9所述的DNA构造转型。36.一种转基因树获得的木浆，所述转基因树已以权利要求9所述的DNA构造转型。37.根据权利要求36所述的木浆，其中所述DNA构造包含编码多肽的核苷酸序列，所述多肽包含SEQIDNO30-58的任一个的氨基酸序列。38.一种制造木质的方法，其包含以DNA构造转型一植物，所述DNA构造包含具有选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列的多核苷酸；在促进植物生长的条件下，培养所述经转型的植物；和从所述植物获得木质。39.一种制造木浆的方法，其包含以DNA构造转型一植物，所述DNA构造包含具有选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列的多核苷酸；在促进植物生长的条件下，培养所述经转型的植物；和从所述植物获得木浆。40.一种经分离的多肽，其包含通过权利要求1所述的经分离的多核苷酸编码的氨基酸序列。41.一种经分离的多肽，其包含选自由SEQIDNO30-58组成的群组的氨基酸序列。42.一种改变植物的植物表型的方法，其包含改变通过SEQIDNO1-29的任一个编码的多肽在所述植物中的表达。43.根据权利要求42所述的方法，其中所述表达经上调、下调、沉默或发育调节。44.根据权利要求42所述的方法，其中所述植物是木质植物。45.根据权利要求42所述的方法，其中所述植物表型是选自由以下各表型组成的群组木质素质量、木质素结构、木质组成、木质外观、木质密度、木质强度、木质刚性、纤维素聚合性、纤维尺寸、内腔大小、花冠比例、导管分子比例、植物细胞分裂、植物细胞发育、单位面积的细胞数量、细胞大小、细胞形状、细胞壁组成、木质形成速率、木质审美外观、干缺陷形成、平均微纤维角度、S2细胞壁层宽度、生长速率、根的根形成速率与分枝植物发育的比、叶面积指数和叶形状。46.根据权利要求41所述的方法，其中与相同种类的未经所述DNA构造转型的植物相比，所述植物呈现选自由以下各特点组成的群组的一个或一个以上特点干旱耐受性增加、除草剂抗性、高度减小或增大、分枝减少或增多、冷冻或霜耐受性增强、生命力改善、色彩增强、健康与营养特征增强、储藏改善、产率提高、盐耐受性增强、木质腐烂抗性增强、真菌疾病抗性增强、虫害吸引力改变、疾病耐受性增大、昆虫耐受性增大、水压耐受性增大、质地改善、发芽率增大、微量营养素摄入量增大、新颖树脂产生、纤维素含量增大、木质素含量降低和新颖蛋白或多肽产生。47.一种多核苷酸，其包含选自由SEQIDNO59-83组成的群组的核酸序列。48.根据权利要求47所述的多核苷酸，其中所述多核苷酸由少于约100个核苷酸碱基组成。49.一种使两个不同样品中的基因表达相关联的方法，其包含探测编码产物的一个或一个以上基因在第一样品中的表达水平，所述产物通过选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列编码；探测所述一个或一个以上基因在第二样品中的表达水平；将所述一个或一个以上基因在所述第一样品中的所述表达水平与所述一个或一个以上基因在所述第二样品中的所述表达水平相比较；和使所述第一样品与第二样品之间的所述一个或一个以上基因的表达水平差异相关联。50.根据权利要求49所述的方法，其中所述第一样品与所述第二样品各自来自不同类型的植物组织。51.根据权利要求49所述的方法，其中所述第一样品为正常木质且所述第二样品为反应性木质。52.根据权利要求49所述的方法，其中所述第一样品与所述第二样品来自相同组织，且其中所述第一样品与所述第二样品各自在一年中的不同季节期间收获。53.根据权利要求49所述的方法，其中所述第一样品与所述第二样品是从处于不同发育阶段的植物获得。54.一种使植物表型拥有物与一个或多个基因在所述植物中的基因表达水平相关联的方法，其包含探测编码产物的一个或一个以上基因在拥有一表型的第一植物中的表达水平，所述产物通过选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列编码；探测所述一个或一个以上基因在缺少所述表型的第二植物中的表达水平；将所述一个或一个以上基因在所述第一植物中的所述表达水平与所述一个或一个以上基因在所述第二植物中的所述表达水平相比较；和使所述一个或一个以上基因在所述第一与第二植物之间的表达水平差异与所述表型拥有物相关联。55.一种使基因表达与形成反应性木质的倾向相关联的方法，其包含探测编码产物的一个或一个以上基因在显示正常木质表型的木质部中的第一植物细胞中的表达水平，所述产物通过选自由SEQIDNO1-29和其保守变体组成的群组的核酸序列编码；探测所述一个或一个以上基因在显示反应性木质表型的木质部中的第二植物细胞中的表达水平；将所述一个或一个以上基因在所述第一植物细胞中的所述表达水平与所述一个或一个以上基因在所述第二植物细胞中的所述表达水平相比较；和使所述一个或一个以上基因在所述第一与第二样品之间的表达水平差异与形成反应性木质的所述倾向相关联。56.根据权利要求54所述的方法，其中所述第一与第二植物或植物细胞是选自桉属和松属种类的相同种类。57.根据权利要求54所述的方法，其中所述第一与第二植物或植物细胞是选自巨桉和辐射松的种类。58.根据权利要求54所述的方法，其中使用一个或一个以上多核苷酸来实施所述探测步骤，所述多核苷酸在标准的杂交条件下能够杂交到选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列。59.根据权利要求54所述的方法，其中使用一个或一个以上多核苷酸来实施所述探测步骤，所述多核苷酸在标准的杂交条件下能够杂交到通过选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列编码的基因产物。60.根据权利要求54所述的方法，其中通过杂交到经标记的核酸来实施所述探测步骤。61.根据权利要求57所述的方法，其中以可探测的标记来标记所述一个或一个以上多核苷酸。62.根据权利要求58所述的方法，其中所述一个或一个以上多核苷酸的至少一个杂交到所述一个或一个以上基因之一的3′未翻译区。63.根据权利要求59所述的方法，其中所述一个或一个以上多核苷酸的至少一个杂交到所述一个或一个以上基因的一个基因的所述3′未翻译区。64.根据权利要求58所述的方法，其中所述一个或一个以上多核苷酸包含选自由SEQIDNO59-83组成的群组的核酸序列。65.根据权利要求59所述的方法，其中所述一个或一个以上多核苷酸包含选自由SEQIDNO59-83组成的群组的核酸序列。66.根据权利要求58所述的方法，其中所述一个或一个以上多核苷酸是选自由DNA和RNA组成的群组。67.根据权利要求59所述的方法，其中所述一个或一个以上多核苷酸是选自由DNA和RNA组成的群组。68.根据权利要求54所述的方法，其在所述探测步骤之前进一步包含放大所述第一和第二植物或植物细胞中的所述一个或一个以上基因的步骤。69.根据权利要求54所述的方法，其在所述检定探测之前进一步包含在所述第一与第二植物或植物细胞中以可探测的标记来标记所述一个或一个以上基因的步骤。70.一种用于探测一个或一个以上基因的表达的组合，其包含两个或两个以上寡核苷酸，其中每一寡核苷酸都能够杂交到选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列。71.一种用于探测一个或一个以上基因的表达的组合，其包含两个或两个以上寡核苷酸，其中每一寡核苷酸都能够杂交到通过选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列编码的基因产物。72.根据权利要求70所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一者都杂交到选自由SEQIDNO1-29组成的群组的所述核酸序列的一个不同核酸序列。73.根据权利要求71所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一者都杂交到通过选自由SEQIDNO1-29组成的群组的所述核酸序列的一个不同核酸序列编码的核苷酸序列。74.根据权利要求71所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的至少一个杂交到选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列的3′未翻译区。75.根据权利要求71所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的至少一个杂交到与选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列的3′未翻译区互补的核酸序列。76.根据权利要求70所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都由少于约100个核苷酸碱基组成。77.根据权利要求70所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的至少一个包含选自由SEQIDNO59-83组成的群组的核酸序列。78.根据权利要求71所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的至少一个包含是选自由SEQIDNO59-83组成的群组的核酸序列。79.根据权利要求70所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都杂交到编码选自由纤维素合成酶与纤维素合成酶类似蛋白组成的群组的蛋白的基因。80.根据权利要求71所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都杂交到通过编码选自由纤维素合成酶和纤维素合成酶类似蛋白组成的群组的蛋白的基因编码的核酸序列。81.根据权利要求79所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都杂交到编码所述蛋白的一个不同蛋白的基因。82.根据权利要求80所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸的每一个都杂交到通过编码所述蛋白的一个不同蛋白的基因编码的核酸序列。83.根据权利要求79所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸的每一个都杂交到一个不同基因。84.根据权利要求80所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸的每一个都杂交到通过不同基因编码的核酸序列。85.根据权利要求70所述的组合，其包含所述两个或两个以上寡核苷酸的约2个到约5000个。86.根据权利要求70所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都以可探测的标记来标记。87.一种微阵列，其包含在固体支撑件上提供的权利要求70所述的组合，其中所述两个或两个以上寡核苷酸的每一者在所述固体支撑件上占据一个独特位置。88.一种用于探测一样品中一个或一个以上基因的方法，其包含使所述样品与两个或两个以上寡核苷酸接触，其中每一寡核苷酸在标准的杂交条件下都能够杂交到包含选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列的基因；和探测杂交到所述一个或一个以上寡核苷酸的所述一个或一个以上有关基因。89.一种用于探测一样品中通过一个或一个以上基因编码的一个或一个以上核酸序列的方法，其包含使所述样品与两个或两个以上寡核苷酸接触，其中每一寡核苷酸在标准的杂交条件下都能够杂交到通过包含选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列的基因编码的核酸序列；和探测杂交到所述一个或一个以上寡核苷酸的所述一个或一个以上核酸序列。90.根据权利要求88所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都杂交到包含选自由SEQIDNO1-29组成的群组的所述核酸序列的一个不同核酸序列的基因。91.根据权利要求89所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都杂交到通过包含选自由SEQIDNO1-29组成的群组的所述核酸序列的一个不同核酸序列的基因编码的核酸序列。92.根据权利要求88所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的至少一个杂交到包含选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列的基因的3′未翻译区。93.根据权利要求89所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的至少一个杂交到与包含选自由SEQIDNO1-29组成的群组的核酸序列的基因的3′未翻译区互补的核酸序列。94.根据权利要求88所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都由少于约100个核苷酸碱基组成。95.根据权利要求88所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的至少一个包含选自由SEQIDNO59-83组成的群组的核酸序列。96.根据权利要求89所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的至少一个包含是选自由SEQIDNO59-83组成的群组的核酸序列。97.根据权利要求88所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都杂交到编码选自由纤维素合成酶和纤维素合成酶类似蛋白组成的群组的蛋白的基因。98.根据权利要求89所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都杂交到通过编码选自由纤维素合成酶和纤维素合成酶类似蛋白组成的群组的蛋白的基因编码的核酸序列。99.根据权利要求97所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都杂交到编码所述蛋白的一个不同蛋白的基因。100.根据权利要求98所述的方法，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个都杂交到通过编码所述蛋白的一个不同蛋白的基因编码的核酸序列。101.根据权利要求88所述的方法，其中在一固体支撑件上提供所述两个或两个以上寡核苷酸，其中所述两个或两个以上寡核苷酸中的每一个在所述固体支撑件上都占据一个独特位置。102.根据权利要求101所述的方法，其中所述固体支撑件包含所述两个或两个以上寡核苷酸的约2个到约5000个。103.根据权利要求88所述的方法，其在所述接触步骤之前进一步包含放大所述样品中的所述一个或一个以上基因或核酸序列的步骤。104.根据权利要求88所述的方法，其在所述接触步骤之前进一步包含在所述样品中以可探测的标记来标记所述一个或一个以上基因或核酸序列的步骤。105.一种用于探测基因表达的套组，其包含权利要求87所述的微阵列和用于核苷酸杂交反应的一个或一个以上缓冲液或试剂。全文摘要本发明提供新颖植物多醣合成基因和通过所述基因编码的多肽。这些基因和多核苷酸序列适用于调节多醣合成和植物表型。另外，这些基因适用于植物多醣合成基因的表达分布。文档编号A01H1/00GK1871352SQ200480021499公开日2006年11月29日申请日期2004年6月7日优先权日2003年6月6日发明者伦纳德·N·布洛克斯贝格,玛丽·B·康内特－波尔切杜,萨拉·简·埃默森,迈克尔·J·弗罗斯特,理查德·卢埃林·辛迪·弗罗斯特,默里·罗伯特·格里戈尔,伊尔卡·哈乌卡拉,科伦·M·希金斯,罗伯特·J·科德奇基,史蒂文·特洛伊·伦德,安德烈亚斯·马古辛申请人:阿博根有限公司