Scarecrow样胁迫相关的多肽和在植物中的使用方法

专利名称：：Scarecrow样胁迫相关的多肽和在植物中的使用方法相关申请的交叉参考本申请要求2004年10月20日提交的美国临时专利申请序号60/620,601的优先权，将该申请的全部内容引入本文作为参考。
背景技术：
：发明领域本申请一般涉及核酸序列，其编码与植物中生长和/或非生物胁迫应答和/或非生物胁迫耐受性有关的多肽。具体地，本发明涉及编码在受限的水可用性的条件下增加植物生长并且对植物赋予干旱、寒冷和/或盐耐受性的多肽的核酸。
背景技术：
：非生物环境胁迫，如干旱胁迫、盐度胁迫、热胁迫和冷胁迫是植物生长和生产力的主要限制因素。这些胁迫导致主要作物如大豆、稻、玉米(玉蜀黍)、棉花和小麦的作物损失和作物产量损失代表重要的经济和政治因素并且造成许多不发达国家中的粮食短缺。植物通常在它们的生命周期中暴露于降低的环境水含量的条件下。多数植物已经进化出保护它们自身对抗这些干燥条件的策略。然而，如果干旱条件的严重性太大和持续时间太长，那么对多数作物植物的发育、生长和产量的影响是深远的。持续暴露于干旱条件导致植物代谢的主要改变，其最终导致细胞死亡和随后的产量损失。开发胁迫耐受性植物是具有解决或者介导至少部分这些问题的潜力的策略。然而，用来开发显示出对这些类型的胁迫的抗性(耐受性)的新的植物品系的传统植物育种策略相对较慢并且需要将特定抗性品系与所希望的品系杂交。胁迫耐受性的有限的种质来源和远缘植物物种之间杂交的不相容性代表了常规育种中遇到的重要问题。此外，在模式干旱和/或盐耐受性植物中导致干旱、寒冷和盐耐受性的细胞过程在本质上是复杂的并且涉及细胞适应的多种机制和许多代谢途径。胁迫应答的这种多组分性质不仅使得耐受性育种大多不成功，而且还限制了使用生物技术方法基因工程化胁迫耐受性植物的能力。来自不同胁迫，如干旱、盐度和寒冷胁迫的通常损害多数是由于脱水(Smirnoff，1998，Curr.Opin.Biotech.9214-219)。通过耐受性植物中离子和溶质的显著积累可以清楚地区分干旱(水胁迫)耐受或者敏感植物，所述积累导致植物中的渗透调节(BohnertH.J和Jensen.R.G.，1996，TIBTECH1489-97)。由于(1)离子通过土壤到根的运输减少；和/或(2)根对离子的摄入改变，干旱和高盐条件可以与矿质营养一致。在拟南芥(Arabidopsis)中鉴定了SCARECROW(SCR)基因并且其在植物胚胎和某些根和茎组织的根祖先组织中特异表达。SCR基因编码新的推定的转录因子并且是拟南芥根中不对称细胞分裂所需的。SCR表达水平的调节可以用于有利地修饰转基因植物的根和气生结构和改善这种植物的农学性质。SCR基因的突变导致根中辐射型缺陷和失去基本组织层。Pysh和同事鉴定了与拟南芥SCR氨基酸序列相似的许多拟南芥已表达序列标志(EST)并且将它们称作Scarecrow样基因(SCL)(Pysh等人，1999，PlantJ.18111-119)。SCL基因包含新的基因家族，基于三种基因的基因座名称赤霉酸不敏感的(GAI)基因座、GA1(RGA)基因座的抑制物和scarecrow(SCR)基因座，将所述基因家族称作GRAS基因家族。已经报导GRAS/SCL基因产物局限于高等植物并且是参与多种发育过程的植物特异的蛋白质。GRAS/SCL家族成员具有易变的N-末端和高度保守的C-末端，其含有5个可识别的基序亮氨酸七残基重复序列I(LHRI)、VHIID基序、亮氨酸七残基重复序列II(LHRII)、PFYRE基序和SAW基序。GRAS/SCL蛋白质发挥转录因子的功能但是它们的作用不限于不对称细胞分裂。例如，已经表明PAT1蛋白质参与拟南芥(Arabidopsisthaliana)的植物光敏素A信号转导(Bolle等人，GenesDev.，2000，141269-1278)，马铃薯基因Lateral抑制基因(Ls)发挥形成侧枝的功能。GRAS家族的两个成员GAI和GRA基因在赤霉酸(GA)信号转导途径中起重要作用。在GAI基因座具有突变的拟南芥植物不应答外源应用的GA并且具有减小的身材(Koorneef等人，1985，Physiol.Plant.6533-39)。稻的SLR1已经被鉴定为GAI直向同源物并且已经表明其涉及玉米、稻、大麦、葡萄和小麦中的GA信号传递途径(Hynes等人，2003，TransgenicResearch12707-714)。与野生型植物相比，烟草和稻中拟南芥GAI的过表达产生了矮小表型(Hynes等人，2003，TransgenicResearch12707-714)。在所有地球上的光合生物中，在二氧化碳(CO2)吸收和水损失之间存在基本的理学受限的平衡(Taiz和Zeiger，1991，PlantPhysiology，Benjamin/CummingsPublishingCo.，p.94)。CO2需要在水溶液中被CO2固定化酶如Rubisco(核酮糖1，5-二磷酸羧化酶/加氧酶)和PEPC(磷酸烯醇丙酮酸羧化酶)作用。由于CO2扩散需要湿润的细胞表面，当湿度低于100％时，将不可避免地发生蒸发(Taiz和Zeiger，1991，p.257)。植物有许多生理学机制来减小水分损失(例如，蜡质表皮、气孔闭合、叶毛、下沉的气孔窝)。由于这些屏障不区分水和CO2流，所以这些水保持措施将也增加对CO2摄取的抗性(Kramer，1983，WaterRelationsofPlants，AcademicPressp.305)。在光能自养植物中光合CO2吸收绝对是植物生长和生物量积累所需的。水利用效率(WUE)是经常用于估计耗水量和CO2吸收/生长之间的平衡的一个参数(Kramer，1983，WaterRelationsofPlants，AcademicPressp.405)。已经以多种方式定义和测量的WUE。一种方法是计算完整植物干重与植物在其整个生命中消耗的水的重量的比率(Chu等人，1992，Oecologia89580)。另一变量是当测量生物量积累和水利用时使用较短的时间间隔(Mian等人，1998，CropSci.38390)。另一种方法是利用从植物的受限部分的测量，例如，测量仅气生生长和水利用(Nienhuis等人1994AmerJBot81943)。还已经将WUE定义为CO2摄入与从叶或者叶的部分的水蒸汽损失的比率，通常在非常短的时间段内测量(例如，数秒/分钟)(Kramer，1983，p.406)。使用C3光合作用，用同位素比率质谱仪测量的植物组织中固定的13C/12C的比率也已经用于估计植物中的WUE(Martin等人，1999，CropSci.1775)。WUE的增加提供关于生长和水消耗的相对提高的效率的信息，但是该信息单独不能指出这两种过程之一改变还是两种都已经改变。在选择用于改进植物的性状中，由于水利用的减少而生长没有改变引起的WUE的增加将在灌溉农业系统中尤其有价值，在所述灌溉农业系统中，水输入成本很高。主要由生长的增加而没有对应的水利用上涨导致WUE的增加将可以应用于所有农业系统。在许多水供应不是限制性的农业系统中，生长的增加，即使该增加是以增加的水利用为代价(即WUE没有改变)，也可以增加产量。因此，需要增加WUE和生物量积累的新方法来提高农业生产力。由于WUE结合了与初级代谢和水利用有关的许多生理过程，所以它通常是高度多基因的性状，具有受到环境相互作用的影响的大基因型(Richards等人，2002，CropSci.42111)。由于这些和其他原因，在传统育种程序中很少的选择WUE改变的尝试取得了成功。尽管已经表征了涉及植物生长和/或植物中的胁迫应答的一些基因，但是在水受限的条件下赋予胁迫耐受性和/或增加的生长的植物基因的表征和克隆仍然很不完全和不完整。例如，一些研究已经表明在一些植物中干旱和盐胁迫可能是由于累加的基因作用，相比其他研究指出，在渗透胁迫条件下，植物的营养组织中特定基因在转录水平上被激活。尽管通常认为胁迫诱导的蛋白质在胁迫耐受性中具有作用，但是仍然缺少直接证据，并且许多胁迫应答基因的功能是未知的。因此，需要鉴定在胁迫耐受性植物和/或有效水利用的植物中表达的额外基因，其能够对宿主植物和其他植物物种赋予在水限制条件下的胁迫抗性和/或增加的生长。新近产生的胁迫耐受性植物和/或在水利用中有效的植物将具有许多优点，如通过例如减少植物物种的水需求扩大可以栽培的作物植物的范围。植物和作物生长和产量通常受到水可用性的限制。在受限的水可用性的条件下增加植物生长可以在所有主要全球市场中增加作物产量。发明概述本发明部分满足了鉴定新的独特多肽和核酸的需求，所述多肽和核酸在修饰表达时能够在水受限的条件下增加植物生长和/或赋予植物的胁迫耐受性。本发明描述了一类新的Scarecrow样胁迫相关的多肽(SLSRPs)和SLSRP编码核酸，其对于植物生长和调节植物对环境胁迫的应答是重要的。更具体地，修饰植物中这些SLSRP编码核酸的表达导致在水受限的条件下植物的增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性。因此，本发明包括包含SLSRP编码核酸的分离的植物细胞，其中植物细胞中核酸序列的表达导致与野生型变种的植物细胞相比，在水受限的条件下植物的增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性。优选地，SLSRP来自展叶剑叶藓(Physcomitrellapatens)或者大豆(Glycinemax)。即，本文描述了展叶剑叶藓Scarecrow样基因PpSCL1(SEQIDNO1和2)、PpSCL2(SEQIDNO3和4)、PpSCL3(SEQIDNO5和6)，和大豆Scarecrow样基因GmSCL1(SEQIDNO7和8)。在一些实施方案中，本发明提供了SLSRP和编码核酸，其是在剑叶藓属(Physcomitrella)或大豆属(Glycine)中发现的SLSRP和编码核酸。在另一优选实施方案中，所述核酸和多肽来自展叶剑叶藓植物或者大豆植物。在一个实施方案中，本发明提供了表达SLSRP的植物，其证明了在水受限的条件下生长的增加。在另一实施方案中，植物生长的增加是由于与植物的野生型变种相比，植物的水利用效率(WUE)的增加。在另一实施方案中，本发明提供过表达SLSRP的植物，其与野生型变种的植物相比，表现出增加的植物干重(DW)。在再一个实施方案中，本发明提供了过表达SLSRP的植物，其与野生型植物相比，表现出对环境胁迫的增强的耐受性。本发明提供的环境胁迫可以是盐度、干旱、温度、金属、化学品、病原体和氧化胁迫，或者它们的组合。在优选实施方案中，环境胁迫可以选自干旱、高盐和低温的一种或多种。本发明还提供了通过SLSRP编码核酸转化的转基因植物产生的种子，其中种子包含SLSRP编码核酸，其中植物对于与野生型变种的植物相比在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性方面是不分离的。在优选实施方案中，本发明提供了用PpSCL1、PpSCL2、PpSCL3或GmSCL1编码核酸转化的转基因植物产生的种子，其中植物对于与野生型变种的植物相比在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性方面是不分离的。本发明还提供了通过下述转基因植物、植物部分或者种子的任一种产生的农产品。本发明还提供了如下述的分离的SLSRP。本发明还提供了分离的SLSRP编码核酸，其中SLSRP核酸编码如下述的SLSRP。本发明还提供了包含如下述的SLSRP编码核酸的分离的重组表达载体，其中载体在宿主细胞中的表达导致与野生型变种的宿主细胞相比，在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性。本发明还提供了含有所述载体的宿主细胞和含有所述宿主细胞的植物。本发明还提供了用SLSRP编码核酸产生转基因植物的方法，其中植物中所述核酸的表达导致与野生型变种的植物相比，在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性，该方法包括(a)用包含SLSRP编码核酸的表达载体转化植物细胞，和(b)从植物细胞产生转基因植物，其与野生型变种的植物相比，具有在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性。在优选实施方案中，SLSRP和SLSRP编码核酸如下述。本发明还提供了鉴定新的SLSRP的方法，其包括(a)如下述产生对SLSRP或者其片段的特异抗体应答；(b)用该抗体筛选推定的SLSRP物质，其中抗体与该物质的特异结合表明存在潜在的新的SLSRP；和(c)从所结合的物质鉴定与已知的SLSRP相比新的SLSRP。备选地，与如下述核酸探针的杂交可以用于鉴定新的SLSRP编码核酸。本发明还提供了修饰植物的生长或胁迫耐受性的方法，其包括修饰植物中SLSRP编码核酸的表达，其中SLSRP如下述。本发明提供可以使得生长和/或胁迫耐受性增加或者减小的方法。优选地，通过修饰SLSRP编码核酸的表达，植物中的生长和/或胁迫耐受性增加。附图简述图1显示了所公开的PpSCL1(SEQIDNO2)氨基酸序列与GRAS家族的6个已知成员的序列的系统树。用VectorNTI的AlignX产生该图。图2显示了所公开的PpSCL1、PpSCL2、PpSCL3和GmSCL1(SEQIDNO2、4、6和8)氨基酸序列与GRAS家族的4个已知成员的序列的系统树。用VectorNTI的AlignX产生该图。图3显示了所公开的PpSCL1、PpSCL2、PpSCL3和GmSCL1(SEQIDNO2、4、6和8)氨基酸序列与GRAS家族的6个已知成员的序列的详细比对。用VectorNTI的AlignX产生比对。黑色底纹上的白色字体是来自给定位置上相似残基区组的共有残基。灰色底纹上的黑色字体是一个位置上的共有或相似的残基，在至少50％的序列中是共有残基。将给定位置上的非相似残基标识为白色底纹上的黑色字体。图4显示了PpSCL1(EST386)的核苷酸序列(SEQIDNO1)。图5显示了PpSCL1的推导的氨基酸序列(SEQIDNO2)。图6显示了PpSCL2(EST166)的核苷酸序列(SEQIDNO3)。图7显示了PpSCL2的推导的氨基酸序列(SEQIDNO4)。图8显示了PpSCL3(EST512)的核苷酸序列(SEQIDNO5)。图9显示了PpSCL3的推导的氨基酸序列(SEQIDNO6)。图10显示了来自大豆的GmSCL1(GM59556757)的核苷酸序列(SEQIDNO7)。图11显示了来自大豆的GmSCL1的推导的氨基酸序列(SEQIDNO8)。发明详述通过参考下面的本发明的优选实施方案和本发明包括的实施例的详细描述，可以更容易理解本发明。然而，在公开和描述本发明化合物、组合物和方法之前，将理解本发明不限于特定核酸、特定多肽、特定细胞类型、特定宿主细胞、特定条件或者特定方法，等等，因为这些当然可以改变并且其中的许多修改和变型将是本领域技术人员显而易见的。还理解本文使用的术语仅仅用于描述特定实施方案的目的并且不意在限定。具体地，如“Scarecrow样胁迫相关的多肽”(Scarecrow-LikeStress-RelatedPolypeptides)或“SLSRPs”的氨基酸序列的名称绝不限制那些序列的功能性。本发明描述了新类别的SLSRP和SLSRP编码核酸，其对于在水受限的条件下增加植物生长和/或调节植物对环境胁迫的应答是重要的。更具体地，修饰植物中SLSRP编码核酸的表达导致植物在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性。SLSRP类别的代表性成员是PpSCL1(SEQIDNO1和2)、PpSCL2(SEQIDNO3和4)、PpSCL3(SEQIDNO5和6)、和GmSCL1(SEQIDNO7和8)。因此，本发明包括SLSRP多核苷酸和多肽和它们用于增加植物在水受限的条件下的生长和/或增强植物环境胁迫的耐受性的用途。在一个实施方案中，SLSRP来自植物，优选剑叶藓或者大豆植物，更优选展叶剑叶藓或者大豆植物。在另一优选的实施方案中，SLSRP和PpSCL1如SEQIDNO1和2中定义；PpSCL2如SEQIDNO3和4中定义；PpSCL3如SEQIDNO5和6中定义；或者GmSCL1如SEQIDNO7和8中定义。所公开的SLSRP多肽序列(SEQIDNO2、4、6和8)与GRAS家族的已知成员的序列具有显著序列同源性。例如，PpSCL1序列与Q7X9T5(麝香百合(L.Longiflorum)SCL)蛋白质序列具有42％序列同一性和30％序列相似性，与Q8S2B3(稻)蛋白质序列具有42％同一性和30％相似性，与T02531(拟南芥scarecrow基因调节物)蛋白质序列具有42％同一性和30％相似性，与Q94HJ4(稻推定的scarecrow基因调节物)蛋白质序列具有39％同一性和27％相似性，与Q9LNX6(拟南芥)蛋白质序列具有21％同一性和15％相似性，与T02736(拟南芥scarecrow基因调节物)蛋白质序列具有24％同一性和16％相似性。PpSCL2序列与NP190990(拟南芥scarecrow转录因子，推定的)蛋白质序列具有26％序列同一性和39％序列相似性，与T51244(拟南芥scarecrow蛋白质)蛋白质序列具有26％同一性和39％相似性，与Q6L5Z0(稻(Oryzasativa)scarecrow)蛋白质序列具有24％同一性和38％相似性，与Q9FUZ7(玉米(Zeamays)scarecrow)蛋白质序列具有24％同一性和38％相似性，与Q9AVK4(豌豆(Pisumsativum)scarecrow)蛋白质序列具有20％同一性和31％相似性。PpSCL3序列与NP_199626(拟南芥植物光敏素A信号转导1)蛋白质序列具有40％序列同一性和49％序列相似性，与Q8GYN7(拟南芥推定的scarecrow基因调节物)蛋白质序列具有37％同一性和45％相似性，与NP_175475(拟南芥scarecrow样转录因子5)蛋白质序列具有42％同一性和54％相似性，与E966542(拟南芥scarecrow样蛋白质)蛋白质序列具有40％同一性和51％相似性，与Q7EXH0(拟南芥推定的scarecrow蛋白)蛋白质序列具有41％同一性和54％相似性。GmSCL1序列与NP_200064(拟南芥scarecrow样转录因子8)蛋白质序列具有45％序列同一性和58％序列相似性，与BAD27826(稻赤霉素不敏感的蛋白OsGAI)蛋白质序列具有32％同一性和47％相似性，与NP_915059.1(稻scarecrow样蛋白质)蛋白质序列具有28％同一性和40％相似性，与AF036300_1(拟南芥scarecrow样1)蛋白质序列具有19％同一性和27％相似性。本发明提供了通过SLSRP编码核酸转化的转基因植物细胞，其中植物细胞中所述核酸的表达导致与野生型变种的植物细胞相比，在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性。本发明还提供了含有本文描述的植物细胞的转基因植物部分和转基因植物。本文使用的术语“植物”将指完整植物、植物细胞和植物部分，包括种子。植物部分包括但不限于，茎干、根、胚珠、雄蕊、叶、胚、分生组织区、愈伤组织、配子体、孢子体、花粉、小孢子等等。在一个实施方案中，转基因植物是雄性不育的。还提供了通过SLSRP编码核酸转化的转基因植物产生的植物种子，其中种子含有SLSRP编码核酸，并且其中植物对于与野生型变种的植物相比，在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性是不分离的。本发明还提供了表达SLSRP的转基因植物产生的种子，其中种子含有SLSRP，并且植物与野生型变种的植物相比，在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性是不分离的。本发明还提供了下述转基因植物、植物部分和植物种子的任一种产生的农产品。农产品包括但不限于，植物提取物、蛋白质、氨基酸、糖类、脂肪、油、聚合物、维生素等等。本文使用的术语“变种”指一个物种内共有恒定特征的一组植物，所述特征将它们与该物种内的典型形式和其他可能的变种分开。尽管具有至少一种不同的性状，但是变种的特征还在于该变种内个体之间的一定变异，主要是基于连续世代的后代中性状的孟德尔分离。认为变种对于特定性状是“不分离的”条件是它对于该性状在一定程度上是遗传上纯合的，即当不分离的变种自花传粉时，没有观察到后代中该性状的显著量的独立分离。在本发明中，从导入植物变种的一种或多种DNA序列的转基因表达产生性状。还如本文使用的，术语“野生型变种”指作为对照植物用于比较目的分析的一组植物，其中野生型变种植物与测试植物(用SLSRP转化的植物或者其中已经修饰了SLSRP编码核酸的表达的植物)同一，只是野生型变种植物没有用SLSRP编码核酸转化和/或还没有修饰野生型变种植物中SLSRP编码核酸的表达。本发明描述了展叶剑叶藓和大豆SLSRP可用于在水受限的条件下增加植物的生长和/或对环境胁迫的耐受性。本文使用的术语多肽指通过肽键结合的至少四个氨基酸的链。该链可以是线性的、分枝的、环状的或者其组合。因此，本发明提供了选自PpSCL1、PpSCL2、PpSCL3、GmSCL1和其同源物的分离的SLSRP。在优选实施方案中，SLSRP选自如SEQIDNO2中定义的PpSCL1、如SEQIDNO4中定义的PpSCL2、如SEQIDNO6中定义的PpSCL3、如SEQIDNO8中定义的GmSCL1、和其同源物和直向同源物。在下文定义氨基酸序列的同源物和直向同源物。优选通过重组DNA技术产生本发明的SLSRP。例如，将编码多肽的核酸分子克隆到表达载体(如下文描述)中，将表达载体导入宿主细胞(如下文描述)并在宿主细胞中表达SLSRP。然后可以使用标准多肽纯化技术通过合适的纯化方案从细胞分离SLSRP。对于本发明，术语“重组多核苷酸”指已经通过遗传工程改变、重排或者修饰的多核苷酸。实例包括任何克隆的多核苷酸和连接或结合到异源序列的多核苷酸。术语“重组的”不是指由于天然发生的事件，如自发突变产生的多核苷酸的改变。作为重组表达的备选方案，可以使用标准肽合成技术，化学合成SLSRP或者其肽。此外，例如，使用抗SLSRP抗体从细胞(例如，展叶剑叶藓和大豆细胞)分离天然SLSRP，可以利用SLSRP或者其片段通过标准技术产生SLSRP抗体。本文使用的术语“环境胁迫”指与盐度、干旱、温度、金属、化学品、病原体或者氧化胁迫或者其组合有关的亚最优的条件。在优选实施方案中，环境胁迫可以选自盐度、干旱、或者温度或者其组合的一种或多种，并且具体地可以选自高盐度、低水含量或者低温的一种或多种。还如本文所用的，术语“水利用效率”指植物产生的有机物质的量除以植物在产生该有机物质中使用的水的量，即植物的干重相对于植物的水利用。如本文使用的术语“干重”指植物中除了水以外的所有物质，并且包括例如，糖类、蛋白质、油和矿质营养物。还理解，如说明书和权利要求书中所用的，“一个”指一个或多个，取决于它使用的上下文。从而例如，对“一个细胞”的引用指可以利用至少一个细胞。还如本文所用的，术语“核酸”和“多核苷酸”指线性或分枝的、单链或双链的RNA或者DNA，或者其杂交体。该术语还包括RNA/DNA杂交体。这些术语还包括位于该基因的编码区的3’和5’末端的非翻译序列编码区的5’末端上游序列的至少约1000个核苷酸和该基因的编码区的3’末端下游序列的至少约200个核苷酸。较不常见的碱基，如肌苷、5-甲基胞嘧啶、6-甲基腺嘌呤、次黄嘌呤等等也可以用于反义、dsRNA和核酶配对。例如，已经表明含有尿苷和胞苷的C-5丙炔类似物的多核苷酸以高亲和力结合RNA并且将是基因表达的有效反义抑制剂。可以进行其他修饰，如对RNA的磷酸二酯主链或者核糖基中2’-羟基的修饰。反义多核苷酸和核酶可以完全由核糖核苷酸组成或者可以含有混合的核糖核苷酸和脱氧核糖核苷酸。可以通过任何手段产生本发明的多核苷酸，所述手段包括基因组制备、cDNA制备、体外合成、RT-PCR和体外或体内转录。“分离的”核酸分子是基本上与该核酸的天然来源中存在的其他核酸分子(即，编码其他多肽的序列)分离的核酸分子。优选地，“分离的”核酸没有一些序列，所述序列天然位于该核酸侧翼的天然发生的复制子中(即，位于该核酸的5’和3’末端的序列)。例如，认为克隆的核酸是分离的。在多种实施方案中，分离的SLSRP核酸分子可以含有少于约5kb、4kb、3kb、2kb、1kb、0.5kb或0.1kb的核苷酸序列，该核苷酸序列天然位于所述核酸所来源的细胞(例如，展叶剑叶藓和大豆细胞)的基因组DNA中的核酸分子侧翼。如果已经通过人工干预改变了核酸，或者将其置于不是其天然位置的基因座或位置或者如果通过农杆菌感染将其导入细胞，那么也认为该核酸是分离的。此外，“分离的”核酸分子，如cDNA分子，可以没有与其天然结合的某种其他细胞物质，或者当通过重组技术产生时没有培养基，或者当化学合成时没有化学前体或者其他化学药品。从“分离的核酸”的定义特别排除作为体外核酸制备物或者作为转染的/转化的宿主细胞制备物存在的天然发生的染色体(如染色体分散(spreads))、人工染色体文库、基因组文库、cDNA文库，其中宿主细胞是体外异质性制备物或者作为单个菌落的异质性群体平板接种。还特别排除上面的文库，其中所指定的核酸构成载体分子中核酸插入片段的数目的5％以下。还特别排除完整细胞基因组DNA或者完整细胞RNA制备物(包括机械剪接或者酶促消化的完整细胞制备物)。甚至还特别排除作为体外制备物或者作为通过电泳分离的异质性混合物的完整细胞制备物，其中本发明的核酸没有与电泳介质中的异源核酸进一步分离(例如，通过从琼脂糖凝胶或者尼龙印迹中的异质性带群体切除单条带进一步分离)。使用标准分子生物学技术和本文提供的序列信息，可以分离本发明的核酸分子，例如，具有SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5、SEQIDNO7的核苷酸序列的核酸分子或者其部分。例如，使用SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5的全部或者部分可以从展叶剑叶藓文库分离展叶剑叶藓SLSRPcDNA。此外，使用基于该序列设计的寡核苷酸引物通过聚合酶链式反应可以分离包含SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的序列的全部或者部分的核酸分子。例如，可以从植物细胞分离mRNA(例如，通过Chirgwin等人，1979，Biochemistry185294-5299的硫氰酸胍提取步骤)，并且可以使用逆转录酶(例如，可以从Gibco/BRL，Bethesda，MD得到的MoloneyMLV逆转录酶，或者可以从SeikagakuAmerica，Inc.，St.Petersburg，FL得到的AMV逆转录酶)制备cDNA。可以基于SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中显示的核苷酸序列设计用于聚合酶链式反应扩增的合成的寡核苷酸引物。使用cDNA，或者备选地，使用基因组DNA作为模板，和合适的寡核苷酸引物，根据标准PCR扩增技术可以扩增本发明的核酸分子。这样扩增的核酸分子可以克隆到合适的载体并且通过DNA序列分析表征。此外，通过标准合成技术，例如，使用自动化DNA合成仪，可以制备对应于SLSRP核苷酸序列的寡核苷酸。在优选实施方案中，本发明的分离的核酸分子包含SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中显示的核苷酸序列。cDNA可以包含编码SLSRP的序列(即，“编码区”)，以及5’非翻译序列和3’非翻译序列。将理解SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7仅包含SLSRP核苷酸序列的编码区。备选地，本发明的核酸分子可以包含从基因组DNA分离的完整基因组片段。本发明还包括SLSRP编码核酸，其编码如本文描述的SLSRP。优选编码如SEQIDNO2中定义的PpSCL1、如SEQIDNO4中定义的PpSCL2、如SEQIDNO6中定义的PpSCL3或如SEQIDNO8中定义的GmSCL1的SLSRP编码核酸。此外，本发明的核酸分子可以包含SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中显示的序列的编码区的一部分，例如，用作探针或者引物的片段或者编码SLSRP的生物学活性部分的片段。从展叶剑叶藓和大豆克隆SLSRP基因确定的核苷酸序列允许产生探针和引物，设计所述探针和引物用于鉴定和/或克隆其他细胞类型和生物中的SLSRP同源物，以及来自其他藓类和相关物种的SLSRP同源物。编码区的部分可以编码SLSRP的生物活性片段。本文使用的术语SLSRP的“生物活性部分”意在包括SLSRP的部分，例如，结构域/基序，其参与植物的生长和/或植物中胁迫耐受性的调节。胁迫耐受性优选为干旱耐受性、冷冻耐受性或者盐耐受性。对于本发明，术语包含SLSRP表达盒(或者表达载体)的转基因植物的“增加的生长”指与非转基因的或者仅转基因载体对照植物相比，水利用效率(WUE)和/或植物干重(DW)增加至少10％、15％、20％、25％或30％、优选至少40％、45％、50％、55％或60％、更优选至少65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％或以上。胁迫耐受性的调节指与非转基因对照植物的胁迫耐受性相比，包含SLSRP表达盒(或者表达载体)的转基因植物的胁迫耐受性增加或减少至少10％、15％、20％、25％或30％、优选至少40％、45％、50％、55％或60％、更优选至少65％、70％、75％、80％、85％、90％、95％或以上。至少在下面的实施例7中提供了定量植物生长和胁迫耐受性的方法。在优选实施方案中，SLSRP的生物活性部分增加了在水受限的条件下的植物生长和/或增加了植物对环境胁迫的耐受性。SLSRP的生物活性部分包括包含来自SLSRP的氨基酸序列，例如，SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6、SEQIDNO8的氨基酸序列，或者与SLSRP同一的多肽的氨基酸序列的肽，其包括比全长SLSRP或者与SLSRP同一的全长多肽更少的氨基酸，并且显示出SLSRP的至少一种活性。通常，生物活性部分(例如，长为5、10、15、20、30、35、36、37、38、39、40、50、100或者更多氨基酸的肽)包含具有SLSRP的至少一种活性的结构域或者基序。此外，通过重组技术可以制备其中缺失了多肽的其他区域的其他生物活性部分，并评价本文描述的一种或多种活性。优选地，SLSRP的生物活性部分包括具有生物活性的一种或多种所选的序列基序或者其部分，如LHRI、LHRII、VHIID、PFYRE和SAW基序。LHRI和II基序是亮氨酸七残基重复序列，并且VHIID基序含有在GRAS家族的所有成员中容易识别的VHIID序列。在VHIID基序内，P-N-H-D-Q-L残基绝对保守。脯氨酸和天冬酰胺之间的间隔在所有GRAS成员中都相同，如组氨酸、天冬氨酸、谷氨酰胺和亮氨酸残基之间的间隔一样。VHIID基序在其C末端被称作LRITG的保守序列结合。PFYRE基序在其序列水平上并不也是保守的(仅P是绝对保守的)。在PFYRE基序内，序列很大程度上是共线性的，并且该区域的部分在GRAS家族的所有成员中显示出高度序列相似性。SAW基序的特征是三对绝对保守的残基R-E、W-G和W-W。W-W对几乎在C-末端，与W-G对一样显示出间隔的绝对保守；然而，W-G和W-W对之间的间隔不保守。在一个实施方案中，本发明提供了具有scarecrow样结构域的SLSRP，其包含三个最保守的基序VHIID基序、PFYRE基序和SAW基序。在另一实施方案中，保守的scarecrow样结构域包含下面四个保守区域的至少一个。本发明包括植物中天然发生的SLSRP和SLSRP编码核酸的同源物和类似物。“同源物”在本文中定义为分别具有相似或者“同一”的核苷酸或者氨基酸序列的两种核酸或者多肽。同源物包括如下文定义的SLSRP的等位变体、直向同源物、种内同源物(paralog)、激动剂和拮抗剂。术语“同源物”还包括由于遗传密码简并性而与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中显示的核苷酸序列之一(和其部分)不同的核酸分子，其从而与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中显示的核苷酸序列编码相同的SLSRP。如本文使用的，“天然发生的”SLSRP指自然中发生的氨基酸序列。优选地，天然发生的SLSRP包含SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的氨基酸序列。SLSRP的激动剂可以基本上保留SLSRP的相同或者部分生物活性。SLSRP的拮抗剂可以抑制天然发生形式的SLSRP的一种或多种活性。对应于SLSRPcDNA的天然等位变体和类似物、直向同源物和种内同源物的核酸分子可以基于它们与本文描述的展叶剑叶藓或者大豆SLSRP核酸的同一性，使用SLSRPcDNA或者其部分作为杂交探针，根据标准杂交技术在严格杂交条件下分离。在备选实施方案中，通过筛选SLSRP的突变体，例如，截短突变体的组合文库的SLSRP激动剂或者拮抗剂活性来鉴定SLSRP的同源物。在一个实施方案中，在核酸水平上通过组合诱变产生SLSRP变体的多样化(variegated)文库，并且其由多样化基因文库编码。例如，通过将合成的寡核苷酸的混合物酶促连接到基因序列中，使得简并组的潜在SLSRP序列可以作为个体多肽表达，或者备选地，作为含有所述组的SLSRP序列的一组更大的融合多肽(例如，用于噬菌体展示)，可以产生SLSRP变体的多样化文库。多种方法可以用于从简并寡核苷酸序列产生潜在SLSRP同源物的文库。可以在自动化DNA合成仪中进行简并基因序列的化学合成，并且然后将合成的基因连接到合适的表达载体中。基因的简并组的使用允许在一种混合物中提供编码所希望组的潜在SLSRP序列的所有序列。用于合成简并寡核苷酸的方法是本领域已知的(见，例如，Narang，1983，Tetrahedron393；Itakura等人，1984，Annu.Rev.Biochem.53323；Itakura等人，1984，Science1981056；Ike等人，1983，NucleicAcidRes.11477)。此外，SLSRP编码区的片段的文库可以用于产生SLSRP片段的多样化群体用于筛选和随后选择SLSRP的同源物。在一个实施方案中，可以如下产生编码序列片段的文库在其中每个分子发生仅约一次切口的条件下用核酸酶处理SLSRP编码序列的双链PCR片段，变性双链DNA，复性DNA以形成双链DNA，其可以包括来自不同的带切口的产物的有义/反义对，通过用S1核酸酶处理从再形成的双链体除去单链部分，并将所得片段文库连接到表达载体中。通过该方法，可以得到表达文库，其编码不同大小的SLSRP的N-末端、C-末端和内部片段。本领域已知一些技术用于筛选通过点突变或者截短制备的组合文库的基因产物，和筛选cDNA文库的具有所选性质的基因产物。此类技术适于快速筛选通过组合诱变GAS/SCL同源物产生的基因文库。最广泛使用的用于筛选大基因文库的技术(适于高通量分析)包括将基因文库克隆到可复制的表达载体中，用所得载体文库转化合适的细胞，并在一定条件下表达组合基因，在所述条件下，所希望的活性的检测方便载体的分离，所述载体编码检测其产物的基因。循环总体诱变(Recursiveensemblemutagenesis(REM))是增强文库中功能突变体的频率的一种技术，可以与筛选测定法组合使用来鉴定SLSRP同源物(Arkin和Yourvan，1992，PNAS897811-7815；Delgrave等人，1993，PolypeptideEngineering6(3)327-331)。在另一实施方案中，使用本领域公知的方法，可以用基于细胞的测定法分析多样化SLSRP文库。本发明还提供了鉴定新的SLSRP的方法，其包括(a)产生针对SLSRP或者其片段的特异抗体应答，如本文所述；(b)用所述抗体筛选推定的SLSRP物质，其中抗体对所述物质的特异结合表明存在潜在的新的SLSRP；和(c)与已知的SLSRP相比，分析结合的物质以确定其新颖性。如上所述，本发明包括SLSRP和其同源物。为了确定两种氨基酸序列(例如，SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6、SEQIDNO8的序列，和其突变形式)的百分数序列同一性，为了最佳比较目的比对序列(例如，在一种多肽的序列中引入缺口以与另一多肽或者核酸最佳比对)。然后比较对应的氨基酸位置上的氨基酸残基。当一种序列(例如，SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的序列)被另一种序列(例如，SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的序列的突变形式)的对应位置上相同的氨基酸残基占据时，那么这两种分子在该位置同一。在两种核酸序列之间可以进行相同类型的比较。两种序列之间的百分数序列同一性是序列共有的同一位置数目的函数(即，百分数序列同一性＝同一位置的数目/位置总数×100)。优选地，本发明中包括的分离的氨基酸同源物与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8中所示的完整氨基酸序列具有至少约50-60％，优选至少约60-70％，更优选至少约70-75％、75-80％、80-85％、85-90％或90-95％，最优选至少约96％、97％、98％、99％或者更高的同一性。在再一个实施方案中，本发明中包括的分离的氨基酸同源物与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中所示的核酸序列编码的完整氨基酸序列具有至少约50-60％，优选至少约60-70％，更优选至少约70-75％、75-80％、80-85％、85-90％或90-95％，最优选至少约96％、97％、98％、99％或者更高的同一性。在其他实施方案中，SLSRP氨基酸同源物在SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的至少15个连续氨基酸残基，更优选至少25个连续氨基酸残基，最优选至少35个连续氨基酸残基上具有序列同一性。在另一优选实施方案中，本发明的分离的核酸同源物包含与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中所示的核苷酸序列或者与包含其至少60个连续核苷酸的部分具有至少40-60％，优选至少约60-70％，更优选至少约70-75％、75-80％、80-85％、85-90％或90-95％，甚至更优选至少约95％、96％、97％、98％、99％或者更高的同一性的核苷酸序列。用于核酸的序列比较的优选长度为至少75个核苷酸，更优选至少100个核苷酸，最优选编码区的全长。甚至更优选地，核酸同源物编码与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8在编码如上述的5个可识别的基序的C-末端上具有同源性的蛋白质。还优选本发明的分离的核酸同源物编码SLSRP或者其部分，其与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的氨基酸具有至少70％同一性并且作为植物中环境胁迫应答的调节剂。在更优选的实施方案中，修饰植物中核酸同源物的表达增加了植物生长和植物对环境胁迫的耐受性。对于本发明，使用VectorNTI9.0(PC)软件包(InforMax，7600WisconsinAve.，Bethesda，MD20814)确定两种核酸或者多肽序列之间的百分数序列同一性。15的缺口打开罚分和6.66的缺口延伸罚分用于确定两种核酸的百分数同一性。10的缺口打开罚分和0.1的缺口延伸罚分用于确定两种多肽的百分数同一性。所有其他参数设置为默认设置。对于多重比对(ClustalW算法)，缺口打开罚分为10，缺口延伸罚分为0.05，使用blosum62矩阵。将理解为了确定序列同一性，当比较DNA序列与RNA序列时，胸苷核苷酸等同于尿嘧啶核苷酸。在另一方面，本发明提供了分离的核酸，其包含在严格条件下与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的多核苷酸杂交的多核苷酸。更具体地，本发明的分离的核酸分子长为至少15个核苷酸并且在严格条件下与包含SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的核苷酸序列的核酸分子杂交。在其他实施方案中，核酸长为至少30、50、100、250或者更多核苷酸。优选地，本发明的分离的核酸同源物包含核苷酸序列，该核苷酸序列在高严格条件下与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中所示的核苷酸序列杂交并且在植物中作为胁迫耐受性的调节子。在另一优选实施方案中，植物中该分离的核酸同源物的过表达增加了植物的生长和对环境胁迫的耐受性。如本文中关于DNA与DNA印迹的杂交所使用的，术语“严格条件”指60℃在10XDenhart溶液中、6XSSC、0.5％SDS和100μg/ml变性鲑精DNA存在下过夜杂交。将印迹在62℃在3XSSC/0.1％SDS中，接着在1XSSC/0.1％SDS中，最后在0.1XSSC/0.1％SDS中顺序地洗涤，每次30分钟。在另一实施方案中，“严格条件”指在6XSSC溶液中65℃下杂交。还如本文使用的，“高严格条件”指在10XDenharts溶液、6XSSC、0.5％SDS和100μg/ml变性鲑精DNA中65℃下过夜杂交。将印迹在3XSSC/0.1％SDS中，接着在1XSSC/0.1％SDS，最后在0.1XSSC/0.1％SDS中65℃下顺序洗涤，每次30分钟。核酸杂交的方法在Meinkoth和Wahl，1984，Anal.Biochem.138267-284；CurrentProtocolsinMolecularBiology，Chapter2，Ausubel等人Eds.，GreenePublishingandWiley-Interscience，NewYork，1995；和Tijssen，1993，LaboratoryTechniquesinBiochemistryandMolecularBiologyHybridizationwithNucleicAcidProbes，PartI，Chapter2，Elsevier，NewYork，1993中描述。优选地，在严格或者高度严格条件下与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的序列杂交的本发明的分离的核酸分子对应于天然发生的核酸分子。如本文使用的，“天然发生的”核酸分子指具有天然发生的核苷酸序列的RNA或者DNA分子(例如，编码天然多肽)。在一个实施方案中，核酸编码天然发生的展叶剑叶藓SLSRP。使用上述方法，和本领域技术人员已知的其他方法，本领域技术人员可以分离包含SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8中所示的氨基酸序列的SLSRP的同源物。这些同源物的一个子集是等位变体。如本文使用的“等位变体”指核苷酸序列，其含有导致SLSRP的氨基酸序列改变并且存在于天然群体(例如植物物种或者变种)内的多态性。此类天然等位基因变异可以通常导致SLSRP核酸的1-5％变异。通过许多不同植物中目的核酸序列的测序可以鉴定等位变体，通过使用杂交探针鉴定那些植物中相同的SLSRP遗传基因座可以容易地进行鉴定。SLSRP中由于天然等位基因变异的结果并且不改变SLSRP的功能活性的任何和所有此类核酸变异和所得氨基酸多态性或者变异都意在本发明的范围内。此外，编码来自相同或者其他物种的SLSRP的核酸分子，如SLSRP类似物、直向同源物、和种内同源物意在本发明的范围内。如本文使用的术语“类似物”指具有相同或者相似的功能但是在不相关的生物种分别进化的两种核酸。如本文使用的术语“直向同源物”指来自不同物种但是从共同的祖先基因通过物种形成进化的两种核酸。通常，直向同源物编码具有相同或者相似功能的多肽。如本文使用的术语“种内同源物”指通过基因组内的复制相关的两种核酸。种内同源物通常具有不同的功能，但是这些功能可以是相关的(Tatusov等人，1997，Science278(5338)631-637)。天然发生的SLSRP的类似物、直向同源物和种内同源物可以通过翻译后修饰、通过氨基酸序列差异或者通过两者与天然发生的SLSRP不同。翻译后修饰包括多肽的体内和体外化学衍生，例如，乙酰化、羧基化、磷酸化或者糖基化，并且此类修饰可以在多肽合成或者加工期间或者用分离的修饰酶处理后发生。具体地，本发明的直向同源物将通常显示出与天然发生的SLSRP氨基酸序列的全部或者部分的至少80-85％，更优选85-90％或90-95％，最优选95％、96％、97％、98％或者甚至99％同一性，或者100％的序列同一性，并且显示出类似于SLSRP的功能。优选地，SLSRP直向同源物增加植物的生长和胁迫耐受性。除了群体中可能存在的SLSRP序列的天然发生的变体外，技术人员将还明白通过突变可以向SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的核苷酸序列中导入改变，从而导致所编码的SLSRP的氨基酸序列的改变，而不改变SLSRP的功能活性。例如，可以在SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的序列中产生核苷酸替代，其导致在“非必需”氨基酸残基上的氨基酸替代。“非必需”氨基酸残基是可以从SLSRP之一的野生型序列改变而不改变所述SLSRP的活性的残基，而“必需”氨基酸残基是SLSRP活性所需的。然而，其他氨基酸残基(例如，在具有SLSRP活性的结构域中不保守或者仅仅半保守的那些残基)可以不是活性必需的并且从而可能顺从改变而不改变SLSRP活性。因此，本发明的另一方面涉及编码SLSRP的核酸分子，其含有氨基酸残基的改变，所述氨基酸残基不是SLSRP活性必需的。此类SLSRP与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8中所含的序列在氨基酸序列上不同，然而保留至少一种本文描述的SLSRP活性。在一个实施方案中，所分离的核酸分子包含编码多肽的核苷酸序列，其中多肽包含与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的氨基酸序列具有至少约50％同一性的氨基酸序列。优选地，所述核酸分子编码的多肽与SEQIDNO2的序列具有至少约50-60％同一性，更优选与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的序列具有至少约60-70％同一性，甚至更优选与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的序列具有至少约70-75％、75-80％、80-85％、85-90％、或90-95％同一性，最优选与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的序列具有至少约96％、97％、98％或99％同一性。本发明的优选的SLSRP同源物优选参与植物的生长和胁迫耐受性应答，或者更具体地，参与涉及植物生长和胁迫应答耐受性的多肽的转录，和/或作为转录因子。编码与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的多肽序列具有序列同一性的分离的核酸分子可以通过向SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的核苷酸序列中引入一个或多个核苷酸替代、添加或者缺失来产生，从而向所编码的多肽中引入一个或多个氨基酸替代、添加或者缺失。通过标准技术，如位点定向诱变和PCR介导的诱变，可以向SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的序列之一导入突变。优选地，在一个或多个预测的非必需氨基酸残基进行保守氨基酸替代。“保守氨基酸替代”是其中将氨基酸残基用具有相似侧链的氨基酸残基替换的一种替代。已经在本领域中定义了具有相似侧链的氨基酸残基家族。这些家族包括具有碱性侧链(例如，赖氨酸、精氨酸、组氨酸)、酸性侧链(例如，天冬氨酸、谷氨酸)、不带电侧链(例如，谷氨酸、天冬酰胺、谷氨酰胺、丝氨酸、苏氨酸、酪氨酸、半胱氨酸)、非极性侧链(例如，丙氨酸、缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、脯氨酸、苯丙氨酸、甲硫氨酸、色氨酸)、β分枝侧链(例如，苏氨酸、缬氨酸、异亮氨酸)、和芳族侧链(例如，酪氨酸、苯丙氨酸、色氨酸、组氨酸)的氨基酸。从而，SLSRP中预测的非必需氨基酸残基优选用来自相同侧链家族的另一氨基酸残基替换。备选地，在另一实施方案中，可以沿着SLSRP编码序列的全部或者部分导入突变，如通过饱和诱变导入，并且可以对所得突变体筛选本文描述的SLSRP活性以鉴定保留SLSRP活性的突变体。SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的序列的诱变后，可以重组表达所编码的多肽并且可以如实施例7中描述的通过分析表达所述多肽的植物的生长和胁迫耐受性来测定该多肽的活性。额外地，可以产生优化的SLSRP核酸。优选地，优化的SLSRP核酸编码SLSRP，其结合磷酸基团和/或调节植物对环境胁迫的耐受性，更优选地当在植物中过表达时增加植物的生长和对环境胁迫的耐受性。如本文所用的“优化的”指遗传工程化以增加其在给定植物或者动物中的表达的核酸。为了对植物提供优化的SLSRP核酸，可以修饰基因的DNA序列以1)包含高水平表达的植物基因首选的密码子；2)包含核苷酸碱基组成中A+T含量为植物中大量发现的A+T含量；3)形成植物起始序列；或者4)除去导致RNA的去稳定化、不合适的多腺苷酸化、降解和终止，或者形成二级结构发夹或者RNA剪接点的序列。通过利用一般植物或者具体植物中密码子选择的分布频率可以实现植物中SLSRP核酸的表达增加。优化植物中核酸表达的方法可以见EPA0359472；EPA0385962；PCT申请号WO91/16432；美国专利号5,380,831；美国专利号5,436,391；Perlack等人，1991，Proc.Natl.Acad.Sci.USA883324-3328；和Murray等人，1989，NucleicAcidsRes.17477-49。可以优化SLSRP核酸使得密码子选择的分布频率与高水平表达的植物基因的分布频率的偏差优选不超过25％，更优选不超过约10％。此外，考虑简并的第三个碱基的G+C的百分比含量(单子叶植物似乎在该位置倾向于G+C，而双子叶植物则否)。还认识到XCG(其中X为A、T、C或者G)核苷酸是双子叶植物中最不优选的密码子，而在单子叶和双子叶植物中避免XTA密码子。本发明的优化的的SLSRP核酸还优选具有密切接近所选宿主植物的CG和TA双避免指数(doubletavoidanceindices)。更优选地，这些指数与宿主的指数偏离不超过约10-15％。除了编码上述SLSRP的核酸分子外，本发明的另一方面涉及与其反义的分离的核酸分子。认为反义多核苷酸通过特异结合靶多核苷酸并且干扰靶多核苷酸的转录、剪接、转运、翻译和/或稳定性而抑制靶多核苷酸的基因表达。现有技术描述了将反义多核苷酸靶定染色体DNA、初级RNA转录物或者加工的mRNA的方法。优选地，靶区域包括剪接位点、翻译起始密码子、翻译终止密码子和可读框内的其他序列。对于本发明，术语“反义”指核酸，其包含与基因、初级转录物或者加工的mRNA的全部或者部分足够互补的多核苷酸，从而干扰内源基因的表达。“互补”多核苷酸是能够根据标准Watson-Crick互补性原则进行碱基配对的多核苷酸。特别地，嘌呤将与嘧啶碱基配对形成与胞嘧啶配对的鸟嘌呤组合(G:C)和与胸腺嘧啶配对的腺嘌呤组合(A:T)(对于DNA的情况)，或者与尿嘧啶配对的腺嘌呤组合(A:U)(对于RNA的情况)。可以理解两种多核苷酸可以相互杂交，即使它们相互不完全互补，条件是每个多核苷酸具有与另一个实质互补的至少一个区域。术语“反义核酸”包括单链RNA以及双链DNA表达盒，其可以转录以产生反义RNA。“活性”反义核酸是能够与初级转录物或者mRNA选择性杂交的反义RNA分子，所述初级转录物或者mRNA编码与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的多肽具有至少80％序列同一性的多肽。反义核酸可以与整个SLSRP编码链或者仅与其部分互补。在一个实施方案中，反义核酸分子是编码SLSRP的核苷酸序列的编码链的“编码区”反义的。术语“编码区”指核苷酸序列的区域，其包含翻译成氨基酸残基的密码子。在另一实施方案中，反义核酸分子是编码SLSRP的核苷酸序列的编码链的“非编码区”反义的。术语“非编码区”指编码区侧翼的5’和3’序列，其不翻译成氨基酸(即，也称作5’和3’非翻译区)。反义核酸分子可以与SLSRPmRNA的整个编码区互补，但是更优选是仅与SLSRPmRNA的编码或者非编码区的部分反义的寡核苷酸。例如，反义寡核苷酸可以与SLSRPmRNA的翻译起始位点周围的区域互补。反义寡核苷酸可以长为例如约5、10、15、20、25、30、35、40、45或50个核苷酸。通常，本发明的反义分子包含与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7或者编码SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的多肽的多核苷酸的至少14个连续核苷酸具有60-100％序列同一性的RNA。优选地，序列同一性将为至少70％，更优选至少75％、80％、85％、90％、95％或98％，最优选99％。通常将本发明的反义核酸分子施用于细胞或者在原位产生，从而它们杂交或者结合到编码SLSRP的细胞mRNA和/或基因组DNA，以例如通过抑制转录和/或翻译而抑制所述多肽的表达。杂交可以是通过常规核苷酸互补形成稳定的双链体，或者例如，对于结合DNA双链体的反义核酸分子的情况，通过双螺旋的大沟中的特异相互作用。可以修饰反义分子使得它特异结合在所选细胞表面上表达的受体或者抗原，例如，通过将反义核酸分子连接到结合细胞表面受体或者抗原的肽或者抗体。使用本文描述的载体，还可以将反义核酸分子递送到细胞。为了实现反义分子的有效细胞内浓度，优选这样的载体构建体，其中反义核酸分子被置于强的原核、病毒或者真核(包括植物)启动子的控制下。作为反义多核苷酸的备选方案，可以用核酶、有义多核苷酸或者双链RNA(dsRNA)减小SLSRP多肽的表达。如本文使用的术语“核酶”指具有核糖核酸酶活性的催化性基于RNA的酶，其能够切割与其具有互补区域的单链核酸，如mRNA。核酶(例如，Haselhoff和Gerlach，1988，Nature334585-591中描述的锤头核酶)可以用于催化性切割SLSRPmRNA转录物，从而抑制SLSRPmRNA的翻译。可以基于如所公开的SLSRPcDNA的核苷酸序列(即，SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7)或者基于将根据本发明中教导的方法分离的异源序列设计对编码SLSRP的核酸具有特异性的核酶。例如，可以构建四膜虫(Tetrahymena)L-19IVSRNA的衍生物，其中活性位点的核苷酸序列与编码SLSRP的mRNA中将切割的核苷酸序列互补。见，例如，Cech等人的美国专利号4,987,071和5,116,742。备选地，可以用SLSRPmRNA从RNA分子库选择具有特定核糖核酸酶活性的催化性RNA。见，例如，Bartel和Szostak，1993，Science2611411-1418。在优选实施方案中，核酶将含有与靶RNA的一部分具有100％互补性的至少7、8、9、10、12、14、16、18或20个核苷酸或者更优选7或者8个核苷酸的部分。制备核酶的方法是本领域技术人员已知的。见例如，美国专利号6,025,167；5,773,260；和5,496,698。如本文使用的术语“dsRNA”指包含两条链的RNA的RNA杂交体。dsRNA的结构可以是线性或者环状的。在优选实施方案中，dsRNA对于编码SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的多肽或者与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的多肽具有至少80％序列同一性的多肽的多核苷酸是特异的。杂交的RNA可以实质上或者完全互补。“实质上互补”指当使用如上述的BLAST程序最优比对两个杂交的RNA时，杂交部分为至少95％互补。优选地，dsRNA长为至少100个碱基对。通常，杂交的RNA将具有相同长度，没有5’或者3’突出端并且没有缺口。然而，具有多达100个核苷酸的5’或者3’突出端的dsRNA可以用于本发明的方法中。dsRNA可以包含核糖核苷酸、核糖核苷酸类似物，如2’-O-甲基核糖基残基，或者其组合。见，例如，美国专利号4,130,641和4,024,222。在美国专利4,283,393中描述了dsRNA多核糖肌苷酸多核糖胞苷酸。制备和使用dsRNA的方法是本领域已知的。一种方法包括在体内或者在单一体外反应混合物中同时转录两条互补的DNA链。见，例如，美国专利号5,795,715。在一个实施方案中，可以通过标准转化步骤直接将dsRNA导入植物或者植物细胞中。备选地，可以通过导入两个互补的RNA在植物细胞中表达dsRNA。其他抑制内源基因表达的方法，如三螺旋形成(Moser等人，1987，Science238645-650和Cooney等人，1988，Science241456-459)和共抑制(Napoli等人，1990，ThePlantCell2279-289)是本领域已知的。部分和全长cDNA已经用于共抑制内源植物基因。见例如，美国专利号4,801,340、5,034,323、5,231,020和5,283,184；VanderKroll等人，1990，ThePlantCell2291-299；Smith等人，1990，Mol.Gen.Genetics224477-481；和Napoli等人，1990，ThePlantCell2279-289。对于有义抑制，认为导入有义多核苷酸阻断了对应的靶基因的转录。有义多核苷酸将与靶植物基因或者RNA具有至少65％序列同一性。优选地，百分数同一性为至少80％、90％、95％或者以上。所导入的有义多核苷酸相对于靶基因或者转录物不必是全长的。优选地，有义多核苷酸将与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的至少100个连续多核苷酸具有至少65％序列同一性。同一性区域可以包含内含子和/或外显子和非翻译区。所导入的有义多核苷酸可以暂时存在于植物细胞中，或者可以稳定整合到植物基因组或者染色体外复制子中。备选地，通过靶定与SLSRP核苷酸序列的调节区(例如，SLSRP启动子和/或增强子)互补的核苷酸序列以形成阻止靶细胞中SLSRP基因的转录的三螺旋结构，可以抑制SLSRP基因表达。一般见，Helene，1991，AnticancerDrugDes.6(6)569-84；Helene等人，1992，Ann.N.Y.Acad.Sci.66027-36；和Maher，1992，Bioassays14(12)807-15。除了上述SLSRP核酸和多肽，本发明包括附着到部分的这些核酸和多肽。这些部分包括，但不限于，检测部分、杂交部分、纯化部分、递送部分、反应部分、结合部分，等等。一组典型的具有附着的部分的核酸是探针和引物。探针和引物通常包含基本上分离的寡核苷酸。该寡核苷酸通常包含核苷酸序列区，其在严格条件下与SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中给出的序列的有义链或者SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中给出的序列的反义序列或者其天然发生的突变体的至少约12个，优选约25个，更优选约40、50或者75个连续核苷酸杂交。基于SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7的核苷酸序列的引物可以用于PCR反应中克隆SLSRP同源物。基于SLSRP核苷酸序列的探针可以用于检测编码相同或者基本上同一的多肽的转录物或者基因组序列。在优选实施方案中，探针还包含附着的标记物，例如，标记物可以是放射性同位素、荧光化合物、酶或者酶辅因子。此类探针可以用作基因组标记检测试剂盒的部分用于鉴定表达SLSRP的细胞，例如，通过测量细胞样品中SLSRP编码核酸的水平，例如，检测SLSRPmRNA水平或者确定基因组SLSRP基因是否已经突变或者缺失。具体地，用于确定基因的转录水平(指示可以用于翻译成基因产物的mRNA的量)的有用方法是进行RNA印迹(参考文献见例如，Ausubel等人，1988，CurrentProtocolsinMolecularBiology，WileyNewYork)。来自RNA印迹的信息至少部分表明了所转化的基因的转录程度。可以通过本领域公知的一些方法，如Bormann等人，1992，Mol.Microbiol.6317-326中描述的方法，从细胞、组织或者器官制备总细胞RNA。为了评估从该mRNA翻译的多肽的存在或者相对量，可以使用标准技术，如蛋白质印迹。这些技术是本领域普通技术人员公知的。(见例如，Ausubel等人，1988，CurrentProtocolsinMolecularBiology，WileyNewYork)。本发明还提供了包含如上述的SLSRP核酸的分离的重组表达载体，其中该载体在细胞中的表达导致与野生型变种的宿主细胞相比增加的生长和对环境胁迫的耐受性。如本文使用的术语“载体”指能够转运其连接的另一核酸的核酸分子。一种类型的载体是“质粒”，其指环状双链DNA环，其中可以连接额外的DNA区段。另一类型的载体是病毒载体，其中可以将额外的DNA区段连接到病毒基因组。某些载体能够在它们所导入的宿主细胞中自主复制(例如，具有细菌复制起点的细菌载体和附加型哺乳动物载体)。其他载体(例如，非附加型哺乳动物载体)当导入宿主细胞时整合到宿主细胞的基因组，从而随着宿主基因组一起复制。此外，某些载体能够指导它们有效连接的基因的表达。此类载体在本文中称作“表达载体”。通常，在重组DNA技术中利用的表达载体通常为质粒的形式。在本说明书中，“质粒”和“载体”可以互换使用，因为质粒是最常用形式的载体。然而，本发明意在包括其他形式的表达载体，如病毒载体(例如，复制缺陷反转录病毒、腺病毒和腺伴随病毒)，它们具有等同功能。本发明的重组表达载体包含本发明的核酸，其为适合在宿主细胞中表达该核酸的形式，这表示重组表达载体包括基于用于表达的宿主细胞选择的一种或多种调节序列，其有效连接到待表达的核酸序列。如关于重组表达载体使用的，“有效连接的”意在指目的核苷酸序列以允许表达该核苷酸序列的方式连接到调节序列(例如，在体外转录/翻译系统中或者当载体导入宿主细胞时在宿主细胞中)。术语“调节序列”意在包括启动子、增强子和其他表达控制元件(例如，多腺苷酸化信号)。此类调节序列例如在Goeddel，1990，GeneExpressionTechnologyMethodsinEnzymology185，AcademicPress，SanDiego，CAandGruberandCrosby，inMethodsinPlantMolecularBiologyandBiotechnology，eds.Glick和Thompson，Chapter7，89-108，CRCPressBocaRaton，Florida中描述，包括其中引用的参考文献。调节序列包括指导所述核苷酸序列在许多类型的宿主细胞中组成型表达的调节序列和指导核苷酸序列仅在一些宿主细胞或者在某些条件下表达的调节序列。本领域技术人将理解表达载体的设计可以取决于诸如待转化的宿主细胞的序列、所希望的多肽的表达水平等等因素。可以将本发明的表达载体导入宿主细胞，从而产生本文描述的核酸编码的多肽或者肽，包括融合多肽或者肽(例如，SLSRP、SLSRP的突变形式、融合多肽等等)。可以设计本发明的重组表达载体以在原核或者真核细胞中表达SLSRP。例如，可以在细菌细胞，如谷氨酸棒杆菌(C.glutamicum)、昆虫细胞(使用杆状病毒表达载体)、酵母和其他真菌细胞(见Romanos等人，1992，Foreigngeneexpressioninyeastareview，Yeast8423-488；VandenHondel等人，1991，Heterologousgeneexpressioninfilamentousfungi，inMoreGeneManipulationsinFungi，BennetandLasure，eds.，p.396-428AcademicPressSanDiego；andVandenHondelandPunt，1991，Genetransfersystemsandvectordevelopmentforfilamentousfungi，inAppliedMolecularGeneticsofFungi，Peberdy等人，eds.，p.1-28，CambridgeUniversityPressCambridge)、藻类(Falciatore等人，1999，MarineBiotechnology1(3)239-251)、如下类型的纤毛虫Holotrichia、缘毛亚纲(Peritrichia)、旋毛亚纲(Spirotrichia)、吸管亚纲(Suctoria)、四膜虫(Tetrahymena)、草履虫(Paramecium)、豆形虫(Colpidium)、瞬目虫(Glaucoma)、匙口虫(Platyophrya)、Potomacus、Pseudocohnilembus、游仆虫(Euplotes)、Engelmaniella和Stylonychia，尤其是尾棘虫(Stylonychialemnae)中使用载体，使用PCT申请号WO98/01572中描述的转化方法，和在多细胞植物细胞中(见Schmidt和Willmitzer，1988，HighefficiencyAgrobacteriumtumefaciens-mediatedtransformationofArabidopsisthalianaleafandcotyledonexplants，PlantCellRep.583-586；PlantMolecularBiologyandBiotechnology，CPress，BocaRaton，Florida，chapter6/7，S.71-119，1993；White等人，1993，TechniquesforGeneTransfer，inTransgenicPlants，Vol.1，Engineering和Utilization，eds.KungundR.Wu，128-43，AcademicPress；Potrykus，1991，Annu.Rev.PlantPhysiol.PlantMolec.Biol.42205-225和其中引用的参考文献)，或者在哺乳动物细胞中表达SLSRP基因。合适的宿主细胞在Goeddel，1990，GeneExpressionTechnologyMethodsinEnzymology185，AcademicPressSanDiego，CA中详细讨论。备选地，重组表达载体可例如使用T7-启动子调节序列和T7-聚合酶体外转录和翻译。原核生物中多肽的表达通常用载体进行，该载体含有指导融合或者非融合多肽的表达的组成型或者诱导型启动子。融合载体向其中编码的多肽加入许多氨基酸，通常加到重组多肽的氨基末端，但是也加到C-末端或者融合在多肽中合适的区域内。此类融合载体通常用于三个目的1)增加重组多肽的表达；2)增加重组多肽的溶解度；和3)通过作为亲和纯化中的配体帮助纯化重组多肽。通常，在融合表达载体中，在融合部分和重组多肽的接点导入蛋白酶解切割位点以使得能够在纯化融合多肽后分离重组多肽与融合部分。此类酶和它们的同种识别序列包括因子Xa、凝血酶和肠激酶。典型的融合表达载体包括pGEX(PharmaciaBiotechInc；SmithandJohnson，1988，Gene6731-40)、pMAL(NewEnglandBiolabs，Beverly，MA)，和pRIT5(Pharmacia，Piscataway，NJ)，其分别将谷胱甘肽S转移酶(GST)、麦芽糖E结合多肽、或者多肽A融合到靶重组多肽。在一个实施方案中，将SLSRP的编码序列克隆到pGEX表达载体中以产生编码融合多肽的载体，该融合多肽从N-末端到C-末端包含GST-凝血酶切割位点-X多肽。使用谷胱甘肽-琼脂糖树脂，通过亲和层析可以纯化融合多肽。通过用凝血酶切割融合多肽可以回收不与GST融合的重组SLSRP。合适的可诱导的非融合大肠杆菌表达载体的实例包括pTrc(Amann等人，1988，Gene69301-315)和pET11d(Studier等人，1990，GeneExpressionTechnologyMethodsinEnzymology18560-89，AcademicPress，SanDiego，CA)。从pTrc载体的靶基因表达依赖于从杂合的trp-lac融合启动子的宿主RNA聚合酶转录。从pET11d载体的靶基因表达依赖于共表达的病毒RNA聚合酶(T7gn1)介导的从T7gn10-lac融合启动子的转录。该病毒聚合酶由宿主菌株BL21(DE3)或者HMS174(DE3)从固有的λ原噬菌体提供，所述原噬菌体含有处于lacUV5启动子的转录控制下的T7gn1基因。最大化重组多肽表达的一种策略是在蛋白酶解切割重组多肽的能力受损的宿主细菌中表达该多肽(Gottesman，1990，GeneExpressionTechnologyMethodsinEnzymology185119-28，AcademicPress，SanDiego，CA)。另一种策略是改变将插入表达载体的核酸的序列，从而每个氨基酸的个体密码子是在为表达所选的细菌如谷氨酸棒杆菌中优先利用的密码子(Wada等人，1992，NucleicAcidsRes.202111-2118)。可以通过标准DNA合成技术进行本发明的核酸序列的此类改变。在另一实施方案中，SLSRP表达载体是酵母表达载体。用于在酵母酿酒酵母(S.cerevisiae)中表达的载体的实例包括pYepSec1(Baldari，等人，1987，EMBOJ.6229-234)、pMFa(Kurjan和Herskowitz，1982，Cell30933-943)、pJRY88(Schultz等人，1987，Gene54113-123)，和pYES2(InvitrogenCorporation，SanDiego，CA)。用于构建适合在其他真菌，如丝状真菌中使用的载体的载体和方法包括在VandenHondel和Punt，1991，“Genetransfersystemsandvectordevelopmentforfilamentousfungi，”inAppliedMolecularGeneticsofFungi，Peberdy，等人，eds.，p.1-28，CambridgeUniversityPressCambridge中详述的那些。在本发明的优选实施方案中，SLSRP在植物和植物细胞，如单细胞植物细胞(例如，藻类)(见Falciatore等人，1999，MarineBiotechnology1(3)239-251和其中引用的参考文献)和来自高等植物(例如，种子植物，如农作物植物)的植物细胞中表达。可以通过任何方法将SLSRP“导入”植物细胞，所述方法包括转染、转化或者转导、电穿孔、微粒轰击、农杆菌感染等等。本领域技术人员已知的一种转化方法是将开花植物浸入农杆菌溶液中，其中农杆菌含有SLSRP核酸，然后培育所转化的配子。用于转化或者转染宿主细胞(包括植物细胞)的其他合适的方法可以见Sambrook，等人，1989，MolecularCloningALaboratoryManual.latested.，ColdSpringHarborLaboratory，ColdSpringHarborLaboratoryPress，ColdSpringHarbor，NY和其他实验室手册，如MethodsinMolecularBiology，1995，Vol.44，Agrobacteriumprotocols，edGartlandandDavey，HumanaPress，Totowa，NewJersey。由于生物和非生物胁迫耐受性是希望遗传到多种植物，像玉米、小麦、黑麦、燕麦、黑小麦(triticale)、稻、大麦、大豆、花生、棉花、油菜籽(rapeseed)、油菜(canola)、木薯、胡椒、向日葵、万寿菊、茄科植物，像马铃薯、烟草、茄子、番茄、蚕豆物种、豌豆、苜蓿、灌木植物(咖啡、可可、茶)、柳属的种、树(油棕榈树、椰子)、多年生草及饲料作物的一般性状，所以这些作物植物也是如本发明的另一实施方案的遗传工程的优选的靶植物。饲料作物包括但不限于，虉草、雀麦、披碱草(WildryeGrass)、早熟禾(Bluegrass)、鸭茅、苜蓿、Salfoin、角果百脉根(BirdsfootTrefoil)、杂种车轴草、红车轴草、和草木樨(SweetClover)。在本发明的一个实施方案中，通过农杆菌介导的基因转移实现SLSRP向植物的转染。用例如GV3101(pMP90)(Koncz和Schell，1986，Mol.Gen.Genet.204383-396)或LBA4404(Clontech)根癌农杆菌(Agrobacteriumtumefaciens)菌株可以进行农杆菌介导的植物转化。通过标准转化和再生技术可以进行转化(Deblaere等人，1994，Nucl.Acids.Res.134777-4788；Gelvin等人，1995，PlantMolecularBiologyManual，2ndEd.-DordrechtKluwerAcademicPubl.，-inSect.，RingbucZentraleSignaturBT11-PISBN0-7923-2731-4；Glick等人，1993，MethodsinPlantMolecularBiologyandBiotechnology，BocaRatonCRCPress，360S.，ISBN0-8493-5164-2)。例如，通过子叶或者下胚轴转化可以转化油菜(Moloney等人，1989，PlantCellReport8238-242；DeBlock等人，1989，PlantPhysiol.91694-701)。用于农杆菌和植物选择的抗生素的使用可以取决于用于转化的双元载体和农杆菌菌株。通常用卡那霉素作为选择性植物标记进行油菜选择。可以用例如，Mlynarova等人，1994，PlantCellReport13282-285描述的技术进行农杆菌介导的基因向亚麻的转移。此外，使用例如欧洲专利号0424047、美国专利号5,322,783、欧洲专利号0397687、美国专利号5,376,543或美国专利号5,169,770中描述的技术进行大豆的转化。通过微粒轰击、聚乙二醇介导的DNA摄入或者通过碳化硅纤维技术实现玉米的转化。(见例如，Freeling和Walbot，1993，“Themaizehandbook”SpringerVerlagNY，ISBN3-540-97826-7)。玉米转化的特定实例见美国专利号5,990,387。小麦转化的特定实例见PCT申请号WO93/07256。根据本发明，所导入的SLSRP如果整合到非染色体自主复制子或者整合到植物基因组中，那么可以在植物细胞中稳定保持。备选地，所导入的SLSRP可以存在于染色体外非复制的载体中并且可以瞬时表达或者是暂时活性的。在一个实施方案中，可以产生同源重组微生物，其中SLSRP整合到染色体，制备载体，其含有已经导入缺失、添加或者替代的SLSRP的至少一部分，从而改变例如，功能性破坏SLSRP基因。优选地，SLSRP是展叶剑叶藓和大豆SLSRP基因，但是它们可以是来自相关植物或者甚至来自哺乳动物、酵母或者昆虫来源的同源物。在一个实施方案中，设计载体使得当同源重组时，内源SLSRP基因被功能性破坏(即，不再编码功能多肽；也称作敲除载体)。备选地，可以设计载体使得当同源重组时，内源SLSRP基因被突变或者改变，但是仍然编码功能多肽(例如，可以改变上游调节区从而改变内源SLSRP的表达)。为了通过同源重组产生点突变，可以在称作chimeraplasty的技术中使用DNA-RNA杂交体(Cole-Strauss等人，1999，NucleicAcidsResearch27(5)1323-1330和Kmiec，1999，GeneTherapyAmericanScientist87(3)240-247)。展叶剑叶藓中同源重组步骤也是本领域公知的并且预期用于本文。而在同源重组载体中，SLSRP基因的改变的部分在其5’和3’末端侧翼是SLSRP基因的额外的核酸分子以允许在微生物或植物中，载体携带的外源SLSRP基因和内源SLSRP基因之间发生同源重组。额外的侧翼SLSRP核酸分子具有足够长度以与内源基因进行成功的同源重组。通常，在载体中包括侧翼DNA的几百碱基对到几千碱基(都在5’和3’末端)(见例如，Thomas和Capecchi，1987，Cell51503关于同源重组载体的描述或者Strepp等人，1998，PNAS，95(8)4368-4373关于展叶剑叶藓和大豆中基于cDNA的重组的描述)。将载体导入微生物或者植物细胞(例如，通过聚乙二醇介导的DNA)，并且使用本领域已知的技术选择其中所导入的SLSRP基因已经与内源SLSRP基因同源重组的细胞。在另一实施方案中，可以产生重组微生物，其含有允许所导入的基因的受调节的表达的所选系统。例如，在载体中包括SLSRP基因，将其置于lac操纵子的控制下允许仅在IPTG的存在下表达SLSRP基因。此类调节系统是本领域公知的。当存在于染色体外非复制载体中或者整合到染色体的载体中时，SLSRP多核苷酸优选位于植物表达盒中。植物表达盒优选含有能够驱动植物细胞中基因表达的有效连接的调节序列，从而每个序列完成其功能，例如，通过多腺苷酸化信号终止转录。优选的多腺苷酸化信号来自根癌农杆菌t-DNA，如已知为Ti-质粒pTiACH5的章鱼碱合酶的基因3(Gielen等人，1984，EMBOJ.3835)或者其功能等同物，以及在植物中功能活性的所有其他终止子都是合适的。由于植物基因表达通常不限于转录水平，因此，植物表达盒优选含有其他有效连接的序列，如翻译增强子，如含有来自烟草花叶病毒的5’-非翻译前导序列的超驱动序列，其按照RNA比率增强多肽(Gallie等人，1987，Nucl.AcidsResearch158693-8711)。植物表达载体的实例包括在Becker等人，1992，Newplantbinaryvectorswithselectablemarkerslocatedproximaltotheleftborder，PlantMol.Biol.201195-1197；和Bevan，1984，Nucl.Acid.Res.128711-8721；VectorsforGeneTransferinHigherPlants；inTransgenicPlants，Vol.1，EngineeringandUtilization，eds.Kung和Wu，1993，AcademicPress，S.15-38中详述的那些。植物基因表达应该有效连接到合适的启动子，其赋予以时间、细胞特异的或组织特异的方式进行基因表达。用于本发明的表达盒的启动子包括能够在植物细胞中启动转录的任何启动子。此类启动子包括，但不限于，可以从植物、植物病毒和含有在植物中表达的基因的细菌，如农杆菌和根瘤菌(Rhizobium)得到的启动子。启动子可以是组成型的、诱导型的、发育阶段优选的、细胞类型优选的、组织优选的或者器官优选的。组成型启动子在多数条件下有活性。组成型启动子的实例包括CaMV19S和35S启动子(Odell等人，1985，Nature313810-812)、sXCaMV35S启动子(Kay等人，1987，Science2361299-1302)、Sep1启动子、稻肌动蛋白启动子(McElroy等人，1990，PlantCell2163-171)、拟南芥肌动蛋白启动子、泛蛋白启动子(Christensen等人，1989，PlantMolec.Biol.18675-689)、pEmu(Last等人，1991，Theor.Appl.Genet.81581-588)、玄参花叶病毒35S启动子、Smas启动子(Velten等人，1984，EMBOJ32723-2730)、GRP1-8启动子、肉桂醇脱氢酶启动子(美国专利号5,683,439)、来自农杆菌的T-DNA的启动子，如甘露碱合酶、胭脂氨酸合酶和章鱼碱合酶、核酮糖二磷酸羧化酶的小亚基(ssuRUBISCO)启动子，等等。诱导型启动子在某些环境条件，如存在或不存在营养物或者代谢物、热或者冷、光、病原体攻击、缺氧条件等等下优先活化。例如通过热休克诱导来自芸苔的hsp80启动子；通过光诱导PPDK启动子；通过病原体感染可诱导来自烟草、拟南芥和玉米的PR-1启动子；通过缺氧和冷胁迫诱导Adh1启动子。通过诱导型启动子还可以促进植物基因表达(综述见Gatz，1997，Annu.Rev.PlantPhysiol.PlantMol.Biol.4889-108)。如果希望以时间特异的方式发生基因表达，那么化学可诱导的启动子特别合适。此类启动子的实例是水杨酸可诱导的启动子(PCT申请号WO95/19443)、四环素可诱导的启动子(Gatz等人，1992，PlantJ.2397-404)，和乙醇可诱导的启动子(PCT申请号WO93/21334)。在本发明的一个优选实施方案中，诱导型启动子是胁迫诱导型启动子。对于本发明，胁迫诱导型启动子在一种或多种下面的胁迫下优先具有活性与盐度、干旱、温度、金属、化学品、病原体和氧化胁迫有关的亚最优条件。胁迫诱导型启动子包括，但不限于，Cor78(Chak等人，2000，Planta210875-883；Hovath等人，1993，PlantPhysiol.1031047-1053)、Cor15a(Artus等人，1996，PNAS93(23)13404-09)、Rci2A(Medina等人，2001，PlantPhysiol.1251655-66；Nylander等人，2001，PlantMol.Biol.45341-52；Navarre和Goffeau，2000，EMBOJ.192515-24；Capel等人，1997，PlantPhysiol.115569-76)、Rd22(Xiong等人，2001，PlantCell132063-83；Abe等人，1997，PlantCell91859-68；Iwasaki等人，1995，Mol.Gen.Genet.247391-8)、cDet6(Lang和Palve，1992，PlantMol.Biol.20951-62)、ADH1(Hoeren等人，1998，Genetics149479-90)、KAT1(Nakamura等人，1995，PlantPhysiol.109371-4)、KST1(Müller-Rber等人，1995，EMBO142409-16)、Rha1(Terryn等人，1993，PlantCell51761-9；Terryn等人，1992，FEBSLett.299(3)287-90)、ARSK1(Atkinson等人，1997，GenBankAccession#L22302，和PCT申请号WO97/20057)、PtxA(Plesch等人，GenBankAccession#X67427)、SbHRGP3(Ahn等人，1996，PlantCell81477-90)、GH3(Liu等人，1994，PlantCell6645-57)、病原体可诱导的PRP1-基因启动子(Ward等人，1993，Plant.Mol.Biol.22361-366)、来自番茄的热可诱导的hsp80启动子(美国专利号5187267)、来自马铃薯的冷可诱导的α-淀粉酶启动子(PCT申请号WO96/12814)，或者创伤可诱导的pinII-启动子(欧洲专利号375091)。关于干旱、寒冷、盐可诱导的启动子的其他实例，如RD29A启动子，见Yamaguchi-Shinozalei等人，1993，Mol.Gen.Genet.236331-340。发育阶段优选的启动子在某些发育阶段优先表达。组织和器官优选的启动子包括在某些组织或者器官，如叶、根、种子或者木质部中优先表达的启动子。组织优选的和器官优选的启动子的实例包括，但不限于果实优选的、胚珠优选的、雄性组织优选的、种子优选的、珠被优选的、块茎优选的、茎优选的、果皮优选的、和叶优选的、气孔优选的、花粉优选的、花药优选的、花瓣优选的、萼片优选的、花梗优选的、长角果优选的、茎干优选的、根优选的启动子，等等。种子优选的启动子在种子发育和/或萌发期间优先表达。例如，种子优选的启动子可以是胚胎优选的、胚乳优选的、和种皮优选的。见Thompson等人，1989，BioEssays10108。种子优选的启动子的实例包括，但不限于，纤维素合酶(celA)、Cim1、γ-玉米醇溶蛋白、球蛋白-1、玉米19kD玉米醇溶蛋白(cZ19B1)，等等。其他合适的组织优选的或者器官优选的启动子包括来自油菜籽的油菜籽蛋白基因启动子(美国专利号5,608,152)、来自蚕豆(Viciafaba)的USP启动子(Baeumlein等人，1991，Mol.Gen.Genet.225(3)459-67)、来自拟南芥的油质蛋白启动子(PCT申请号WO98/45461)、来自菜豆(Phaseolusvulgaris)的菜豆蛋白启动子(美国专利号5,504,200)、来自芸苔的Bce4启动子(PCT申请号WO91/13980)，或者豆球蛋白B4启动子(LeB4；Baeumlein等人，1992，PlantJournal，2(2)233-9)，以及赋予在单子叶植物像玉米、大麦、小麦、黑麦、稻等等中种子特异表达的启动子。将提到的合适的启动子是来自大麦的lpt2或lpt1基因启动子(PCT申请号WO95/15389和PCT申请号WO95/23230)或者在PCT申请号WO99/16890中描述的那些(来自大麦的大麦醇溶蛋白、稻谷蛋白基因、稻水稻素基因、稻谷醇溶蛋白基因、小麦醇溶蛋白基因、小麦谷蛋白基因、燕麦谷蛋白基因、高粱kasirin基因，和黑麦裸麦醇溶蛋白基因的启动子)。用于本发明的表达盒中的其他启动子包括，但不限于，主要叶绿素a/b结合蛋白启动子、组蛋白启动子、Ap3启动子、β-conglycin启动子、油菜籽蛋白启动子、大豆凝集素启动子、玉米15kD玉米醇溶蛋白启动子、22kD玉米醇溶蛋白启动子、27kD玉米醇溶蛋白启动子、γ-玉米醇溶蛋白启动子、waxy、shrunken1、shrunken2和bronze启动子、Zm13启动子(美国专利号5,086,169)、玉米多聚半乳糖醛酸酶启动子(PG)(美国专利号5,412,085和5,545,546)，和SGB6启动子(美国专利号5,470,359)，以及合成的或者其他天然启动子。通过使用来自异源的DNA结合结构域和应答元件(例如，来自非植物来源的DNA结合结构域)可以得到控制植物中异源基因表达的额外的灵活性。这种异源DNA结合结构域的一个实例是LexADNA结合结构域(Brent和Ptashne，1985，Cell43729-736)。本发明还提供了重组表达载体，其包含以反义方向克隆到该表达载体的本发明的SLSRPDNA分子。即，DNA分子以允许SLSRPmRNA反义的RNA分子的表达(通过DNA分子的转录)的方式有效连接到调节序列。可以选择有效连接到以反义方向克隆的核酸分子的调节序列，其指导反义RNA分子在多种细胞类型中持续表达。例如，可以选择指导反义RNA的组成型、组织特异性或者细胞类型特异性表达的病毒启动子和/或增强子，或者调节序列。反义表达载体可以是重组质粒、噬菌粒或者减毒病毒的形式，其中在高效调节区的控制下产生反义核酸。可以通过载体所导入的细胞类型确定调节区的活性。关于使用反义基因调节基因表达的讨论，见Weintraub，H.等人，1986，AntisenseRNAasamoleculartoolforgeneticanalysis，Reviews-TrendsinGenetics，Vol.1(1)，和Mol等人，1990，FEBSLetters268427-430。本发明的另一方面涉及本发明的重组表达载体所导入的宿主细胞。术语“宿主细胞”和“重组宿主细胞”在本文中互换使用。可以理解此类术语不仅指具体受试细胞，而且它们也应用于这种细胞的后代或者潜在后代。因为由于突变或者环境影响，在连续世代中可以发生某些修饰，这些后代实际上可能与亲本细胞不同，但是仍然包括在本文使用的该术语的范围内。宿主细胞可以是任何原核或者真核细胞。例如，SLSRP可以在细菌细胞，如谷氨酸棒杆菌、昆虫细胞、真菌细胞或者哺乳动物细胞(如中国仓鼠卵巢细胞(CHO)或者COS细胞)、藻类、纤毛虫、植物细胞、真菌或者其他微生物，像谷氨酸棒杆菌中表达。其他合适的宿主细胞是本领域技术人员已知的。本文描述的核酸分子、多肽、多肽同源物、融合多肽、引物、载体和宿主细胞可以用于一种或多种下面的方法中鉴定展叶剑叶藓或者大豆和相关生物；与展叶剑叶藓或者大豆有关的生物的基因组作图；鉴定和定位展叶剑叶藓或者大豆目的序列；进化研究；确定功能所需的SLSRP区；调节SLSRP活性；调节一种或多种细胞功能的代谢；调节一种或多种化合物的跨膜运输；调节胁迫抗性；和调节SLSRP核酸的表达。在这些方法的一个实施方案中，SLSRP发挥活性植物转录因子的功能。藓类展叶剑叶藓或大豆代表一类藓类。它与其他藓类如能够在无光的条件下生长的角齿藓台湾变种(Ceratodonpurpureus)有关。藓类像角齿藓(Ceratodon)和剑叶藓在DNA序列和多肽水平上具有高度的序列同一性，允许使用从其他藓类或者生物得到的探针对DNA分子进行异源筛选，从而使得能够得到适于异源筛选或者功能注解和预测第三个物种中的基因功能的共有序列。因此，鉴定此类功能的能力具有重要相关性，例如，预测酶的底物特异性。此外，这些核酸分子可以作为藓类基因组或者相关生物的基因组作图的参照点。本发明的SLSRP核酸分子具有多种用途。最重要地，本发明的核酸和氨基酸序列可以用于转化植物，从而增加生长和诱导对胁迫如干旱、高盐度和寒冷的耐受性。本发明因此提供了用SLSRP核酸转化的转基因植物，其中核酸序列在植物中的表达导致与野生型变种的植物相比，该转基因植物的增加的生长和对环境胁迫的耐受性。转基因植物可以是单子叶植物或者双子叶植物。本发明还提供了转基因植物，其可以选自例如玉米、小麦、黑麦、燕麦、黑小麦、稻、大麦、大豆、花生、棉花、油菜籽、油菜、木薯、胡椒、向日葵、万寿菊、茄科植物、马铃薯、烟草、茄子、番茄、蚕豆物种、豌豆、苜蓿、咖啡、可可、茶、柳属的种、油棕榈树、椰子、多年生草及饲料作物。具体地，本发明描述了使用PpSCL1、PpSCL2、PpSCL3和GmSCL1的表达工程化植物，所述植物具有增加的生长和干旱耐受性、盐耐受性和/或寒冷耐受性。对拟南芥阐明了本文描述的该策略，但是它的应用不局限于这些植物。因此，本发明提供了含有SLSRP，如SEQIDNO2中定义的PpSCL1、如SEQIDNO4中定义的PpSCL2、如SEQIDNO6中定义的PpSCL3、或者如SEQIDNO8中定义的GmSCL1的转基因植物，其中该植物具有增加的生长和对选自干旱、增加的盐度或者降低或者升高的温度的一种或多种的环境胁迫的增强的耐受性。在优选实施方案中，环境胁迫是干旱或者降低的温度。因此，本发明提供了用SLSRP编码核酸产生转基因植物的方法，其中所述核酸在植物中的表达导致与野生型变种的植物相比增加的生长和对环境胁迫的增强的耐受性，所述方法包括(a)向植物细胞导入包含SLSRP核酸的表达载体，和(b)从植物细胞产生转基因植物，该转基因植物与野生型变种的植物相比具有增加的生长和对环境胁迫的增强的耐受性。植物细胞包括，但不限于，原生质体、产生配子的细胞和再生成完整植物的细胞。如本文使用的术语“转基因的”指含有至少一种重组多核苷酸的全部或者部分的任何植物、植物细胞、愈伤组织、植物组织或者植物部分。在许多情况中，重组多核苷酸的全部或者部分稳定整合到染色体或者稳定的染色体外元件，从而它传递到连续世代。在优选实施方案中，SLSRP核酸编码包含SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8的多肽的蛋白质。本发明还提供了调节植物的生长和对环境胁迫的耐受性的方法，其包括修饰植物中SLSRP编码核酸的表达。如分别通过增加或者减少SLSRP的表达可以实现增加或者减少植物的生长和对环境胁迫的耐受性。优选地，通过增加SLSRP的表达增加植物的生长和对环境胁迫的耐受性。通过本领域技术人员已知的任一方法可以修饰SLSRP的表达。可以使用增加SLSRP的表达的方法，其中植物是转基因的或不是转基因的。对于植物是转基因的情况，可以用含有上述SLSRP编码核酸的任一种的载体转化植物，或者可以例如用指导植物中天然SLSRP表达的启动子转化植物。本发明提供的这种启动子可以是组织优选的、发育调节的、胁迫诱导型的或者其组合。备选地，非转基因植物可以具有通过诱导天然启动子修饰的天然SLSRP表达。靶植物中如SEQIDNO1中定义的PpSCL1、如SEQIDNO3中定义的PpSCL2、如SEQIDNO5中定义的PpSCL3、或者如SEQIDNO7中定义的GmSCL1的表达可以通过但不限于如下实例之一实现(a)组成型启动子，(b)胁迫诱导型启动子，(c)化学品诱导的启动子，和(d)用例如锌指衍生的转录因子工程化的启动子过表达(Greisman和Pabo，1997，Science275657)。在优选实施方案中，用如Greisman和Pabo，1997，Science275657中描述的并由SangamoBiosciences，Inc生产的锌指衍生的转录因子(ZFPs)调节SLSRP的转录。这些ZFPs包含DNA识别结构域和功能结构域，其导致靶核酸如SLSRP核酸的活化或者抑制。因此，可以产生活化和抑制性ZFPs，其特异识别上述SLSRP启动子并且用以增加或减少植物中的SLSRP表达，从而调节植物的胁迫耐受性。本发明还包括靶植物中如SEQIDNO1中定义的PpSCL1、如SEQIDNO3中定义的PpSCL2、如SEQIDNO5中定义的PpSCL3、或者如SEQIDNO7中定义的GmSCL1的同源物以及该同源物的启动子的鉴定。本发明还提供了与野生型变种的宿主细胞相比，增加宿主细胞内目的基因的表达的方法，其中目的基因应答SLSRP而转录，所述方法包括(a)用包含SLSRP编码核酸的表达载体转化宿主细胞，和(b)在宿主细胞中表达SLSRP，从而与野生型变种的宿主细胞相比，增加应答SLSRP所转录的基因的表达。除了向转基因植物中导入SLSRP核酸序列外，这些序列还可以用于鉴定生物为展叶剑叶藓、大豆或者其近亲。而且，它们还可以用于鉴定微生物的混合物群体中展叶剑叶藓、大豆或者其近亲的存在。本发明提供了展叶剑叶藓和大豆基因的核酸序列；通过用跨越展叶剑叶藓或大豆基因的该生物独特的区域的探针在严格调节下探测微生物的唯一或者混合群体的培养物的所提取的基因组DNA，可以确定该生物是否存在。此外，本发明的核酸和多肽分子可以用作基因组的特异区域的标记。这不仅可以用于基因组的作图，而且用于展叶剑叶藓或大豆多肽的功能研究。例如，为了鉴定特定展叶剑叶藓DNA结合多肽所结合的基因组区域，可以消化展叶剑叶藓基因组，并用DNA结合多肽温育片段。结合所述多肽的那些片段可以用本发明的核酸分子额外探测，本发明的核酸分子优选具有容易检测的标记。这种核酸分子与基因组片段的结合使得可以将片段定位到展叶剑叶藓的基因组图谱，并且当用不同的酶进行多次时，方便了快速确定该多肽结合的核酸序列。此外，本发明的核酸分子可以与相关物种的序列足够同一，使得这些核酸分子可以作为构建相关藓类中的基因组图谱的标记。本发明的SLSRP核酸分子还可用于进化和多肽结构研究。本发明的分子参与的转录和信号转导过程被多种原核和真核细胞利用；通过比较本发明的核酸分子与编码来自其他生物的相似蛋白质的那些核酸分子的序列，可以评估生物的进化亲缘关系。类似地，这种比较允许评估序列的哪些区域是保守的，哪些不保守，哪些可以帮助确定多肽的转录因子功能必需的那些区域。该类型的确定对于多肽工程化研究是有价值的并且可以给出哪种多肽可以耐受诱变而不丧失功能的指征。操作本发明的SLSRP核酸分子可以导致产生具有与野生型SLSRP不同功能的SLSRP。这些多肽可以在效率或活性上提高，可以在细胞中具有比通常更多的数目，或者可以具有降低的效率或活性。本发明的SLSRP的改变可以借助多种机理来直接影响胁迫应答和/或胁迫耐受性。对于表达SLSRP的植物，增强的耐受性可以导致植物组织和器官内提高的盐和/或溶质分配。通过将经修饰的微生物或者植物在较不合适的调节下生长，然后分析植物的生长特征和/或代谢，可以评估植物、谷氨酸棒杆菌、真菌、藻类或者纤毛虫的遗传修饰对植物生长和/或胁迫耐受性的影响。此类分析技术是本领域技术人员已知的，并且包括干重、湿重、多肽合成、糖类合成、脂类合成、蒸发蒸腾速率、总的植物和/或作物产量、开发、繁殖、结籽、根生长、呼吸率、光合作用速率等等(ApplicationsofHPLCinBiochemistryinLaboratoryTechniquesinBiochemistryandMolecularBiology，vol.17；Rehm等人，1993Biotechnology，vol.3，ChapterIIIProductrecoveryandpurification，page469-714，VCHWeinheim等人，1988，Bioseparationsdownstreamprocessingforbiotechnology，JohnWileyandSons；Kennedy和Cabral，1992，Recoveryprocessesforbiologicalmaterials，JohnWileyandSons；Shaeiwitz和Henry，1988，Biochemicalseparations，inUlmann’sEncyclopediaofIndustrialChemistry，vol.B3，Chapter11，page1-27，VCHWeinheim；和Dechow，1989，Separationandpurificationtechniquesinbiotechnology，NoyesPublications)。例如，使用标准方案，可以构建包含本文公开的核酸或者其片段的酵母表达载体并将其转化到酿酒酵母中。然后测定所得转基因细胞对干旱、盐和温度胁迫的耐受性的失败或者改变。类似地，使用标准方案，可以构建包含本文公开的核酸或者其片段的植物表达载体并将其转化到合适的植物细胞，如拟南芥、大豆、油菜、玉米、小麦、Medicagotruncatula等等中。然后测定所得转基因细胞和/或植物的提高生长和/或对干旱、盐和温度胁迫的耐受性的失败或者改变。本发明的一种或多种SLSRP基因的工程化还可以导致具有改变的活性的SLSRP，其间接影响藻类、植物、纤毛虫或者真菌或者其他微生物像谷氨酸棒杆菌的生长和/或胁迫应答和/或胁迫耐受性。例如，代谢的正常生物化学过程导致产生多种产物(例如，过氧化氢和其他活性氧类别)，其可以积极干扰这些相同的代谢过程。此外，本文公开的序列或者其片段可以用于在多种生物，如细菌、哺乳动物细胞、酵母细胞和植物细胞的基因组中产生敲除突变(Girke，T.，1998，ThePlantJournal1539-48)。然后可以评估所得敲除细胞耐受多种胁迫条件的能力或容量、它们对多种胁迫条件的应答，和对突变的表型和/或基因型的影响。对于其他基因失活方法，见美国专利号6,004,804和Puttaraju等人，1999，NatureBiotechnology17246-252。上述导致增加的生长和胁迫抗性的SLSRP的诱变策略不意在限制；这些策略的变通方案将是本领域技术人员显而易见的。使用此类策略，并结合本文公开的机理，本发明的核酸和多肽分子可以用于产生表达突变的SLSRP核酸和多肽分子的藻类、纤毛虫、植物、真菌或者其他微生物像谷氨酸棒杆菌，从而提高了胁迫耐受性。本发明还提供了特异结合如本文描述的核酸编码的SLSRP或者其部分的抗体。可以通过多种公知的方法制备抗体(见，例如，Harlow和Lane，1988，“Antibodies；ALaboratoryManual，”ColdSpringHarborLaboratory，ColdSpringHarbor，NY.)。短语“选择性结合”和“特异结合”多肽指结合反应，其确定多肽或者其他生物产品的异源群体中所述多肽的存在。从而，在所指出的免疫测定条件下，结合特定多肽的特定抗体不以显著量结合样品中存在的其他多肽。在此类条件下抗体的选择性结合可以需要由于对特定多肽的特异性所选的抗体。可以用多种免疫测定法形式筛选选择性结合特定多肽的抗体。例如，通常用固相ELISA免疫测定法来选择与多肽选择性免疫反应的抗体。见Harlow和Lane，1988，“Antibodies，ALaboratoryManual”ColdSpringHarborPublications，NY关于可以用于确定选择性结合的免疫测定形式和条件的描述。在一些情况中，希望从多种宿主制备单克隆抗体。制备此类单克隆抗体的技术的描述可以见Stites等人，等人，“BasicandClinicalImmunology，”(LangeMedicalPublications，LosAltos，Calif.，FourthEdition)，和其中的参考文献，和Harlow和Lane，1988，“Antibodies，ALaboratoryManual”ColdSpringHarborPublications，NY。在本申请全文中，参考了许多出版物。所有这些出版物和那些出版物中引用的那些参考文献的公开都完整引入本申请中作为参考以便更完整地描述本发明所述领域的现状。将理解前面的涉及本发明的优选实施方案并且可以在其中做出许多改变而不背离本发明的范围。本发明还通过下面的实施例阐明，其绝不以任何方式理解为限制本发明的范围。相反，通常理解可以存在多种其他实施方案、修饰和等同方案，在阅读了本说明书后，本领域技术人员可以联想到它们并且它们不背离本发明的精神和/或所附权利要求的范围。实施例实施例1展叶剑叶藓培养物的生长对于该研究，使用来自UniversityofHamburg的遗传学研究组的保藏中心的物种展叶剑叶藓(Hedw.)B.S.G.的植物。它们来自GransdenWood，Huntingdonshire(英国)的H.L.K.Whitehouse收集的菌株16/14，其由Engel从孢子传代培养(1968，Am.J.Bot.55438-446)。通过孢子和配子体的再生进行植物的繁殖。原丝体从单倍体孢子发育为富含叶绿体的原丝体和低叶绿素的茎原丝，在约12天后从原丝体形成芽。这些芽生长产生具有精子器和茎卵器的配子托。受精后，得到具有短的刚毛和孢子荚膜的二倍体孢子体，其中减数孢子成熟。在气候室中25℃的大气温度和55微摩尔m2s-1的光强度(白光；PhilipsTL65W/25荧光管)和16/8小时的光/黑暗改变下进行培养。使用根据Reski和Abel(1985，Planta165354-358)的Knop培养基在液体培养中修饰该苔藓或者使用1％oxoid琼脂(Unipath，Basingstoke，England)将苔藓培养在Knop固体培养基上。在充气的液体培养物中培养用于RNA和DNA分离的原丝体。将原丝体每9天研细并转移到新鲜培养基。实施例2从植物分离总DNA关于总DNA的分离的细节涉及用1克鲜重的植物材料详细研究。所用的材料包括下面的缓冲液CTAB缓冲液2％(w/v)N-十六烷基-N，N，N-三甲基溴化铵(CTAB)；100mMTrisHClpH8.0；1.4MNaCl；20mMEDTA；N-十二烷基肌氨酸缓冲液10％(w/v)N-十二烷基肌氨酸；100mMTrisHClpH8.0；和20mMEDTA。在研钵中液氮下研磨植物材料得到细粉末并转移到2mlEppendorf容器中。然后用一层1ml的分解缓冲液(1mlCTAB缓冲液，100μlN-十二烷基肌氨酸缓冲液，20μlβ-巯基乙醇，和10μl蛋白酶K溶液，10mg/ml)覆盖冷冻的植物材料并在60℃连续摇动下温育1小时。将所得匀浆物分配到两个Eppendorf容器(2ml)中并通过用相同体积的氯仿/异戊醇(24∶1)摇动萃取两次。对于相分离，在每种情况下室温下以8000xg离心15分钟。然后用冰预冷的异丙醇在-70℃下沉淀DNA30分钟。在4℃和10,000g下沉降所沉淀的DNA30分钟并重悬浮在180μlTE缓冲液中(Sambrook等人，1989，ColdSpringHarborLaboratoryPressISBN0-87969-309-6)。为了进一步沉淀，将DNA用NaCl(1.2M终浓度)处理并在-70℃用两倍体积的无水乙醇再次沉淀30分钟。用70％乙醇的洗涤步骤后，干燥DNA并随后用50μlH2O+RNA酶(50mg/ml终浓度)吸收。将DNA在4℃下过夜溶解，并随后在37℃下进行RNA酶消化1小时。将DNA在4℃保存。实施例3从展叶剑叶藓分离总RNA和聚腺苷酸化RNA和cDNA文库构建为了研究转录物，分离总RNA和聚腺苷酸化RNA。按照GTC方法(Reski等人，1994，Mol.Gen.Genet.，244352-359)从野生型9天龄的原丝体得到总RNA。用DynaBeadsR(Dynal，Oslo，Norway)按照生产商的方案分离聚腺苷酸化RNA。测定RNA或者聚腺苷酸化RNA的浓度后，通过加入1/10体积的3M乙酸钠pH4.6和2体积的乙醇沉淀RNA并在-70℃保存。对于cDNA文库构建，用鼠白血病病毒逆转录酶(Roche，Mannheim，德国)和寡聚d(T)引物实现第一链合成，通过在12℃(2小时)、16℃(1小时)和在22℃(1小时)与DNA聚合酶I、Klenow酶温育和RNA酶H消化合成第二链。通过在65℃(10分钟)终止反应并随后转移到冰上。通过T4-DNA-聚合酶(Roche，Mannheim)在37℃(30分钟)下填平双链DNA分子。通过苯酚/氯仿萃取和SephadexG50旋转柱除去核苷酸。通过T4-DNA-连接酶(Roche，12℃，过夜)连接EcoRI接头(Pharmacia，Freiburg，德国)到cDNA末端并与多核苷酸激酶(Roche，37℃，30分钟)温育磷酸化。将混合物在低熔点琼脂糖凝胶上分离。从凝胶洗脱大于300个碱基对的DNA分子，苯酚萃取，并在Elutip-D-柱(Schleicher和Schuell，Dassel，德国)上离心，使用GigapackGoldKit(Stratagene，Amsterdam，荷兰)用生产商的材料和按照使用说明书连接到载体臂并包装成λZAPII噬菌体或者λZAP-表达噬菌体。实施例4展叶剑叶藓EST的测序和功能注解如实施例3中描述的cDNA文库用于根据标准方法，尤其通过链终止方法，使用ABIPRISMBigDyeTerminatorCycleSequencingReadyReactionKit(Perkin-Elmer，Weiterstadt，德国)进行DNA测序。通过体内大量切除、再转化和随后在琼脂板上接种DH10B(材料和方案细节来自Stratagene，Amsterdam，荷兰)从cDNA文库进行制备性质粒回收后进行随机测序。用QiageneDNA制备机器人(Qiagen，Hilden)按照生产商的方案从在含有氨苄青霉素的LB培养基上过夜生长的大肠杆菌(E.coli)培养物制备质粒DNA(见Sambrook等人，1989，ColdSpringHarborLaboratoryPressISBN0-87969-309-6)。使用具有下面的核苷酸序列的测序引物5′-CAGGAAACAGCTATGACC-3′SEQIDNO95′-CTAAAGGGAACAAAAGCTG-3′SEQIDNO105′-TGTAAAACGACGGCCAGT-3′SEQIDNO11用Bio-Max(Munich，德国)商业提供的软件包EST-MAX处理和注解序列。该程序整合了对于蛋白质序列的功能和结构表征重要的几乎所有生物信息学方法。参考文献见网站pedant.mips.biochem.mpg.de。整合到EST-MAX的最重要的算法是FASTA(Verysensitivesequencedatabasesearcheswithestimatesofstatisticalsignificance；Pearson，1990，RapidandsensitivesequencecomparisonwithFASTPandFASTA，MethodsEnzymol.18363-98)；BLAST(Verysensitivesequencedatabasesearcheswithestimatesofstatisticalsignificance；Altschul等人，Basiclocalalignmentsearchtool，JournalofMolecularBiology215403-10)；PREDATOR(High-accuracysecondarystructurepredictionfromsingleandmultiplesequences；Frishman和Argos，1997，75％accuracyinproteinsecondarystructureprediction.Proteins27329-335)；CLUSTALW(Multiplesequencealignment；Thompson等人，1994，CLUSTALW(improvingthesensitivityofprogressivemultiplesequencealignmentthroughsequenceweighting，position-specificgappenaltiesandweightmatrixchoice，NucleicAcidsResearch224673-4680)；TMAP(Transmembraneregionpredictionfrommultiplealignedsequences；Persson和Argos，1994，Predictionoftransmembranesegmentsinproteinsutilizingmultiplesequencealignments.J.Mol.Biol.237182-192)；ALOM2(Transmembraneregionpredictionfromsinglesequences；Klein等人，PredictionofproteinfunctionfromsequencepropertiesAdiscriminateanalysisofadatabase.Biochim.Biophys.Acta787221-226(1984).Version2byDr.K.Nakai)；PROSEARCH(DetectionofPROSITEproteinsequencepatterns；Kolakowski等人，1992，ProSearchfastsearchingofproteinsequenceswithregularexpressionpatternsrelatedtoproteinstructureandfunction.Biotechniques13，919-921)；BLIMPS(Similaritysearchesagainstadatabaseofungappedblocks，WallaceandHenikoff，1992)；PATMAT(asearchingandextractionprogramforsequence，patternandblockqueriesanddatabases，CABIOS8249-254.WrittenbyBillAlford)。实施例5鉴定对应于PpSCL1、PpSCL2和PpSCL3的展叶剑叶藓ORF使用程序EST-MAX通过BLAST分析在展叶剑叶藓EST测序程序中鉴定了展叶剑叶藓部分cDNA(EST)。PpSCL1、PpSCL2和PpSCL3的全长核苷酸序列分别在SEQIDNO1、SEQIDNO3和SEQIDNO5中定义。PpSCL1(SEQIDNO2)、PpSCL2(SEQIDNO4)和PpSCL3(SEQIDNO6)的预测的氨基酸序列与如表1、2和3中显示的scarecrow样基因产物共有显著的序列同一性和相似性。表1PpSCL1(EST386)和其他同源蛋白质的氨基酸同一性和相似性程度(使用GCGGap程序缺口罚分10；缺口延伸罚分0.1；得分矩阵blosum62)表2PpSCL2(EST166)和其他同源蛋白质的氨基酸同一性和相似性程度(使用GCGGap程序缺口罚分10；缺口延伸罚分0.1；得分矩阵blosum62)表3PpSCL3(EST512)和其他同源蛋白质的氨基酸同一性和相似性程度(使用GCGGap程序缺口罚分10；缺口延伸罚分0.1；得分矩阵blosum62)实施例6编码PpSCL1、PpSCL2和PpSCL3的全长展叶剑叶藓cDNA的克隆为了从展叶剑叶藓分离编码全长PpSCL1(SEQIDNO1)、PpSCL2(SEQIDNO3)和PpSCL3(SEQIDNO5)的克隆，用SMARTRACEcDNA扩增试剂盒(ClontechLaboratories)按照生产商的使用说明书产生cDNA文库。如实施例3中描述的分离的总RNA用作模板。在RNA分离前如下处理培养物盐胁迫用补充1-MNaCl的培养基处理2、6、12、24、48小时；冷胁迫4℃下处理与盐相同的时间点；干旱胁迫将培养物在干燥滤纸上培育与盐相同的时间点。5’RACE方案如实施例4描述的从数据库检索鉴定的EST序列用于设计RACE的寡核苷酸(oligos)(见表6)。用Advantage2PCR试剂盒(ClontechLaboratories)和SMARTRACEcDNA扩增试剂盒(ClontechLaboratories)，使用BiometraT3循环变温器按照生产商的使用说明，通过进行cDNA末端的快速扩增聚合酶链式反应(RACEPCR)得到这些基因的延长的序列。从RACE反应得到的序列对应于全长编码区并且用于设计各自基因的全长克隆的寡核苷酸(见下面的全长扩增)。表4用于扩增全长克隆的方案和引物全长扩增用基因特异引物和最初的EST作为模板通过进行聚合酶链式反应(PCR)得到对应于PpSCL1(SEQIDNO1)、PpSCL2(SEQIDNO3)或PpSCL3(SEQIDNO5)的全长克隆。反应条件是使用PWODNA聚合酶(Roche)的标准条件。根据标准条件和生产商的方案进行PCR(Sambrook等人，1989，MolecularCloning，ALaboratoryManual.2ndEdition，ColdSpringHarborLaboratoryPress，ColdSpringHarbor，NY，BiometraT3Thermocycler)。反应的参数为94℃下5分钟，接着是5个循环的94℃1分钟，50℃1分钟，和72℃4分钟。接着是25个循环的94℃1分钟，65℃1分钟，和72℃4分钟。这些参数产生了PpSCL1的4.0kb片段、PpSCL2的2.8kb片段和PpSCL3的2.3kb片段。用QIAquickGelExtractionKit(Qiagen)从琼脂糖凝胶提取扩增的片段并按照生产商的使用说明连接到TOPOpCR2.1载体中(Invitrogen)。用标准条件将重组载体转化到Top10细胞(Invitrogen)中(Sambrook等人，1989，MolecularCloning，ALaboratoryManual.2ndEdition，ColdSpringHarborLaboratoryPress，ColdSpringHarbor，NY)。在含有100μg/ml羧苄青霉素、0.8mgX-gal(5-溴-4-氯-3-吲哚基-β-D-半乳糖苷)，和0.8mgIPTG(异丙基硫代-β-D-半乳糖苷)的LB琼脂上37℃下过夜生长来选择转化的细胞。选择白色菌落并用于接种含有100μg/ml氨苄青霉素的3ml液体LB并在37℃下过夜生长。用QIAprepSpinMiniprepKit(Qiagen)按照生产商的使用说明提取质粒DNA。根据标准分子生物学技术(Sambrook等人，1989，MolecularCloning，ALaboratoryManual，2ndEdition，ColdSpringHarborLaboratoryPress，ColdSpringHarbor，NY)进行随后克隆的分析和限制酶切作图。用Biomax和VectorNTI分析PpSCL1(SEQIDNO1)、PpSCL2(SEQIDNO3)或PpSCL3(SEQIDNO5)的全长核苷酸序列。PpSCL1(SEQIDNO2)、PpSCL2(SEQIDNO4)和PpSCL3(SEQIDNO6)的氨基酸序列与GRS家族的转录因子具有同源性。例如，PpSCL1氨基酸序列(SEQIDNO2)与GRAS家族的转录因子有同源性(http://www.sanger.ac.uk/cgi-bin/Pfam/getacc？PF03514)。在PpSCL1(SEQIDNO2)中发现了GRAS基因家族中三个最保守的基序VHIID、PFYRE和SAW基序。来自12种古细菌(Archaea)、145种细菌和84种真核生物的序列的ERGO中PpSCL1(SEQIDNO2)的blast检索(http://ergo.zh.basf-ag.de8080/ERGO/)在拟南芥、玉米和番茄中鉴定了相似序列(0.00001的最小严格性)。将PpSCL1(SEQIDNO2)、PpSCL2(SEQIDNO4)和PpSCL3(SEQIDNO6)蛋白质序列对公共NCBI数据库的blast检索从SwissProt(＜e-40)鉴定了表1、2和3中所示的GRAS/SCR序列。图1、2和3显示了PpSCL1、PpSCL2、PpSCL3和GmSCL1氨基酸序列(SEQIDNO2、4、6和8)与GRAS家族的6种已知成员的序列的相对同源性和详细比对。组织收获、RNA分离和cDNA文库构建在多种条件和处理下培养大豆植物，并在不同的发育阶段收获不同组织。以一种策略方式进行植物生长和收获，所述方式使得在至少一个或多个所得文库中收获所有可表达的基因的概率最高。如实施例3中描述的从每个收集的样品分离mRNA，并构建cDNA文库。在文库产生过程中没有使用扩增步骤以便使样品内基因的冗余性最小和保留表达信息。所有文库都从寡聚dT柱上纯化的mRNA3’产生。随机挑选cDNA文库向大肠杆菌转化得到的菌落并置于微量滴定板中。探针杂交从大肠杆菌菌落分离质粒DNA并在膜上点样。将288种33P放射性标记的7-mer寡核苷酸集合与这些膜顺序杂交。为了增加通量，处理一式两份的膜。每次杂交后，在感光成像扫描期间捕获印迹图像以便为每种寡核苷酸产生杂交谱。该原始数据图像通过LIMS自动转移到计算机。通过成像暗盒的条形码、滤光器和暗盒内的定向保持绝对同一性。然后将滤光器用相对温和的条件处理以剥离结合的探针和返回到杂交室中用于另一轮的杂交。重复杂交和成像循环直到完成288种寡聚体的集合。完成杂交后，对每个斑点(代表cDNA插入片段)产生图谱，其关于288种33P放射标记的7-mer寡核苷酸的哪一种结合到该特定点(cDNA插入片段)和结合程度怎样。该图谱定义为从该克隆产生的签名。将每个克隆的签名与从相同生物产生的所有其他签名比较以鉴定相关签名的簇。该方法在测序前将来自生物的所有克隆“分选”成簇。基于具有相同或者相似的杂交签名将克隆分选成不同的簇。簇将指出个体基因或者基因家族的表达。该分析的副产物是特定文库中每种基因的丰度的表达谱。从5’末端的单程测序用于通过序列数据库中的相似性和基序检索预测具体克隆的功能。将PpSCL1(SEQIDNO1)、PpSCL2(SEQIDNO3)或PpSCL3(SEQIDNO5)的全长DNA序列对专有的重叠群BPS作物数据库以E-10的E值进行blast(Altschul，Stephen等人，GappedBLASTandPSI_BLASTanewgenerationofproteindatabasesearchprogram，NucleicAcidsRes.253389-3402)。为推定的所有全长序列分析所有重叠群命中，并对代表推定的全长重叠群的最长的克隆完整测序。从大豆中鉴定了一种序列GmSCL1(SEQIDNO7)。GmSCL1的推导的氨基酸序列(SEQIDNO8)与最近的已知现有技术的同源性在表7中指出。图1、2和3显示了PpSCL1(SEQIDNO2)、PpSCL2(SEQIDNO4)、PpSCL3(SEQIDNO6)和GmSCL1(SEQIDNO8)氨基酸序列与GRAS家族的其他已知成员序列的相对同源性和详细比对。表5GmSCL1和相似蛋白质的氨基酸同一性和相似性程度(使用逐对比较缺口罚分10；缺口延伸罚分0.1；得分矩阵blosum62)表6GmSCL1、PpSCL1、PpSCL2和PpSCL3的氨基酸序列(SEQIDNO2、4、6和8)之间的百分数同一性表7GmSCL1、PpSCL1、PpSCL2和PpSCL3的氨基酸序列(SEQIDNO2、4、6和8)之间的百分数相似性实施例7通过过表达PpSCL1、PpSCL2、PpSCL3和GmSCL1基因工程化拟南芥植物PpSCL1、PpSCL2、PpSCL3或GmSCL1重组载体的克隆根据生产商的使用说明通过用限制酶进行双消化(见表6)从重组PCR2.1TOPO载体亚克隆含有PpSCL1、PpSCL2或PpSCL3的片段。随后用QIAquickGelExtractionKit(Qiagen)根据生产商的使用说明从琼脂糖凝胶切除片段并连接到含有选择性标记基因、组成型启动子和终止子的双元载体中。农杆菌转化根据标准条件(Hoefgen和Willmitzer，1990)将重组载体转化到根癌农杆菌C58C1和PMP90中。植物转化培养农杆菌生态型C24植物并根据标准条件转化(Bechtold，1993，Acad.Sci.Paris.3161194-1199；Bent等人，1994，Science2651856-1860)。转化植物的筛选对T1植物筛选选择性标记基因赋予的对选择试剂的抗性，并收集T1种子。根据标准方案(Xiong等人，1999，PlantMolecularBiologyReporter17159-170)对T1种子消毒。将种子平板接种在Murashige和Skoog培养基(MS)(Sigma-Aldrich)上，该培养基用KOH调节到pH5.7并且含有0.6％琼脂并补加1％蔗糖、0.5g/L2-[N-吗啉代]乙磺酸(MES)(Sigma-Aldrich)、50-150μg/ml选择试剂、500μg/ml羧苄青霉素(Sigma-Aldrich)和2μg/ml苯菌灵(benomyl)(Sigma-Aldrich)。将平板上的种子在4℃下春化4天。种子在22℃的气温和40微摩尔m2s-1光强(白光；PhilipsTL65W/25荧光管)和16小时白天和8小时黑夜的日长周期下在气候室中萌发。14天后选择转化的幼苗并转移到用KOH调节到pH5.7的MS培养基的0.6％琼脂板，其补加0.6％琼脂、1％蔗糖、0.5g/LMES(Sigma-Aldrich)，和2μg/ml苯菌灵(Sigma-Aldrich)并且允许恢复5到7天。在水受限的条件下的生长筛选对T1植物筛选选择性标记基因赋予的对选择试剂的抗性，并收集种子。在平板上对T2和T3种子筛选选择性标记基因赋予的对选择试剂的抗性，并将阳性植物移植到土壤中并在生长室中生长3周。在整个该时间内保持土壤湿度在土壤的最大持水量的约50％。测量该时间内植物的总水量损失(蒸腾)。3周后，收集完整的地上植物材料，在65℃干燥2天并称重。结果在表8、9、10和11中显示。地上植物干重与植物水的比例为水利用效率(WUE)。下面的表8显示了PpSCL1(SEQIDNO1和2)过表达植物、野生型对照和仅仅转基因载体对照的平均WUE、WUE的标准误、植物干重(DW)和DW的标准误。数据来自每个基因型约50株植物、每10个独立的转基因株系约5株植物，和4个独立的实验。表8通过给出来自仅载体和PpSCL1(SEQIDNO2)过表达植物的野生型对照的百分数差异，在下面的表9中概述了上面的数据。数据表明PpSCL1(SEQIDNO2)植物与对照相比在DW和WUE中显著增加。PpSCL1-过表达植物与对照相比表现出干重增加约23-33％，和与对照相比水利用效率增加约10-12％。表9表10给出了过表达PpSCL1(SEQIDNO2)和PpSCL2(SEQIDNO4)的转基因植物的独立转化事件(株系)的WUE和DW。给出了从方差分析得到的株系与野生型对照相比较的最小平方平均值和标准误。还给出了PpSCL1(EST386)和PpSCL2(EST166)过表达植物的WUE和DW的从野生型对照植物的百分数提高。表10表11代表PpSCL3(SEQIDNO6)的独立转化事件(株系)的WUE。列出了株系与转基因对照相比的平均值和标准误。此外，给出了比较所有转基因对照株系与所有PpSCL3(SEQIDNO6)过表达株系的方差分析，显示了最小平方平均值、标准误和显著性值(p)。还给出了与转基因对照相比，PpSCL3(SEQIDNO6)的组合分析中平均值的提高，作为百分比刺激。表11实施例8通过过表达SLSRP基因工程化胁迫耐受性玉米植物在补充合适的抗生素的YP培养基中生长在同一质粒上含有所述基因和玉米ahas基因的农杆菌细胞1-3天。收集菌环量的农杆菌细胞并悬浮在2mlM-LS-002培养基(LS-inf)中并将含有农杆菌细胞的管在摇床上以1,200转/分钟(rpm)保持1-3小时。授粉后7-12天收获玉米芯[基因型J553x(HIIIAxA188)]。将玉米芯在20％Clorox溶液中消毒15分钟，然后用无菌水充分冲洗。将0.8-2.0mm大小的不成熟胚解剖到含有LS-inf溶液中的农杆菌细胞的管中。通过将管在层流超净台上在室温下水平保持30分钟进行农杆菌感染。将农杆菌感染混合物倒在含有共培养培养基(M-LS-011)的平板上。吸出液体农杆菌溶液后，将胚接种在共培养培养基上，schutellum边朝上，并在黑暗中22℃下培养2-4天。将胚转移到没有选择的M-MS-101培养基。7-10天后，将胚转移到含有0.75uMimazethapyr的M-LS-401培养基并生长4周以选择转化的愈伤组织细胞。将抗性愈伤组织转移到补加0.75μMimazethapyr的M-LS-504培养基并在26℃光下生长2到3周启动植物再生。然后将再生的枝条转移到含有M-MS-607培养基(0.5μMimazethapyr)的生根盒中。将具有根的小植株转移到盆栽混合物并在生长室中生长一周，然后移植到更大的盆中并在温室中保持直到成熟。序列表<110>巴斯福植物科学有限公司<120>SCARECROW样胁迫相关的多肽和在植物中的使用方法<130>PF2063015073<150>US60/620,601<151>2004-10-20<160>20<170>PatentIn版本3.3<210>1<211>2685<212>DNA<213>展叶剑叶藓(Physcomitrellapatens)<220><221>CDS<222>(152)..(2476)<223>Scarecrow-样基因PpSCL1(EST386)<400>1atcccgggagacaagctaagcaagtaagcaagagctgaattagggaaaagaagaccataa60gctcaatgcaagagcgtacctttatttgtaagcacagggaaaegctaaaggtcgagtata120ttccgaaccctttcacgtggtaattacggcaatggctggaagtaagcatgag172MetAlaGlySerLysHisGlu15agatcgggggattcccctgtaggaacaggagaggtgtctccacttgct220ArgSerGlyAspSerProValGlyThrGlyGluValSerProLeuAla101520gcacaacttcagcaagcatggcttcaaacgcagatgcccaaagctcag268AlaGlnLeuGlnGlnAlaTrpLeuGlnThrGlnMetProLysAlaGln253035aagcggagttttacctcggttgcaaatgcgcagaaccaacttcctcgg316LysArgSerPheThrSerValAlaAsnAlaGlnAsnGlnLeuProArg40455055ttgtcaccgccaggtcctgggtctgagatgtccgcatcctcgaaacca364LeuSerProProGlyProGlySerGluMetSerAlaSerSerLysPro606570ccatcatcctctgtactgaagtccttgtcgactctttttcccgagctt412ProSerSerSerValLeuLysSerLeuSerThrLeuPheProGluLeu758085gcaaacgttcaagagaagaaggaggcaaagatctcttctgtttttgaa460AlaAsnValGlnGluLysLysGluAlaLysIleSerSerValPheGlu9095100gaaggagagcaaccaattccaattcacccagaattacgccagaagaaa508GluGlyGluGlnProIleProIleHisProGluLeuArgGlnLysLys105110115gctgaatgcttagaggtgatgtttggtcaagacgttgttgagcagacg556AlaGluCysLeuGluValMetPheGlyGlnAspValValGluGlnThr120125130135caagctcaggggctcagggactacgaccgtcatgcatctacagaacgg604GlnAlaGlnGlyLeuArgAspTyrAspArgHisAlaSerThrGluArg140145150tcattgtctgatagtctgattcagcaatctgacgactcgttggatttc652SerLeuSerAspSerLeuIleGlnGlnSerAspAspSerLeuAspPhe155160165tctgaccttgggccgctttctgtttccaatagtttctcgagacctagt700SerAspLeuGlyProLeuSerValSerAsnSerPheSerArgProSer170175180gcacagcctggacgaggaacttttgaggacgatctttcctacatctgt748AlaGlnProGlyArgGlyThrPheGluAspAspLeuSerTyrIleCys185190195agcgcttacggtagtagaccttcggcatcagaatatgagacttcggcg796SerAlaTyrGlySerArgProSerAlaSerGluTyrGluThrSerAla200205210215gaggtggaacaagagaaaacgccactgtttgaatatcttacagacata844GluValGluGlnGluLysThrProLeuPheGluTyrLeuThrAspIle220225230ctcatggatgaaaacgtagaggaaaagaaatgcatgttcattgaaatg892LeuMetAspGluAsnValGluGluLysLysCysMetPheIleGluMet235240245agcgcttatcaggccatggcgaaagaacttggagaccttatctcatac940SerAlaTyrGlnAlaMetAlaLysGluLeuGlyAspLeuIleSerTyr250255260gatcctcctcctatgccaatacctgaaactagaagatcggatcctcac988AspProProProMetProIleProGluThrArgArgSerAspProHis265270275tttgaagaagatgtcagattcgtcgacagctggattgatgagattcta1036PheGluGluAspValArgPheValAspSerTrpIleAspGluIleLeu280285290295agtggtcctcttcctgcggatcgtacggatagccctggtgcagaagct1084SerGlyProLeuProAlaAspArgThrAspSerProGlyAlaGluAla300305310aagcttgacatcaaacacggaagcagtcctgaagaactctactctcac1132LysLeuAspIleLysHisGlySerSerProGluGluLeuTyrSerHis315320325acagacgcagatcgtggcagctctgtctggaatgatacggcgtctgat1180ThrAspAlaAspArgGlySerSerValTrpAsnAspThrAlaSerAsp330335340acagcatcatacctacatccagactccaccttatctcccgtggacttt1228ThrAlaSerTyrLeuHisProAspSerThrLeuSerProValAspPhe345350355gggaactcccatgctcttgaaaatggtagtggaggcagtttacaagtt1276GlyAsnSerHisAlaLeuGluAsnGlySerGlyGlySerLeuGlnVal360365370375ggtactcgtcacctaagtagcatatcttcgtcaaatggcaatggggtt1324GlyThrArgHisLeuSerSerIleSerSerSerAsnGlyAsnGlyVal380385390catgcaccgccggtggacttgactgatctcctcatcagatgcgcgcaa1372HisAlaProProValAspLeuThrAspLeuLeuIleArgCysAlaGln395400405gcagtggaacaagcggactatcggcatgccaatgagttgattcacgaa1420AlaValGluGlnAlaAspTyrArgHisAlaAsnGluLeuIleHisGlu410415420ctgcgtcatcactcgtccgcgtatggaaatgggtcccagcgcatggcc1468LeuArgHisHisSerSerAlaTyrGlyAsnGlySerGlnArgMetAla425430435cattacttcatggaagctctggttgctaaaatatctggaactggcgga1516HisTyrPheMetGluAlaLeuValAlaLysIleSerGlyThrGlyGly440445450455cagctttactcagctctatccaactaccgtccttccgaggcccaaatg1564GlnLeuTyrSerAlaLeuSerAsnTyrArgProSerGluAlaGlnMet460465470ctgagggcgcaaatgttgttctgcgagcattgtcctttcattcaagtg1612LeuArgAlaGlnMetLeuPheCysGluHisCysProPheIleGlnVal475480485ccacatatttatgctaatcatgcaattatggtggccttcaagggtgcc1660ProHisIleTyrAlaAsnHisAlaIleMetValAlaPheLysGlyAla490495500ccacgagttcatattattgactacggcatcctttatggaattcagtgg1708ProArgValHisIleIleAspTyrGlyIleLeuTyrGlyIleGlnTrp505510515ctgtgccttattcatcagctttcacaacgtcctgagggaccaccacac1756LeuCysLeuIleHisGlnLeuSerGlnArgProGluGlyProProHis520525530535cttcgtattacaggcatcgataggcctcaaccaggattcaggccctca1804LeuArgIleThrGlyIleAspArgProGlnProGlyPheArgProSer540545550gcgagaattcaagatactgggcggcgtctggctaagcttgcgaagcaa1852AlaArgIleGlnAspThrGlyArgArgLeuAlaLysLeuAlaLysGln555560565atgggagtgccgtttgagtttcatgcaatagctgagaaatgggaggca1900MetGlyValProPheGluPheHisAlaIleAlaGluLysTrpGluAla570575580attacccctgctcatctcttactgcgagatgatgaagtcctcgcagtg1948IleThrProAlaHisLeuLeuLeuArgAspAspGluValLeuAlaVal585590595aattctatgttcaggttccgtcatttattggatgagtccgtcacagcc1996AsnSerMetPheArgPheArgHisLeuLeuAspGluSerValThrAla600605610615gcaagccctcgcaatcttgtgctgagcagaataagaagcttgaatcca2044AlaSerProArgAsnLeuValLeuSerArgIleArgSerLeuAsnPro620625630aagatcttcgtccaaggagtcctcaacgctggctacaacgcacccttt2092LysIlePheValGlnGlyValLeuAsnAlaGlyTyrAsnAlaProPhe635640645tttatgtcccgcttccgagaggcactggcttacttctcaacaatattc2140PheMetSerArgPheArgGluAlaLeuAlaTyrPheSerThrIlePhe650655660gactctatggagtgttcgtttcctgcagagcacccggacaggcaaatc2188AspSerMetGluCysSerPheProAlaGluHisProAspArgGlnIle665670675atagatcacgagattgtaggcagagagattttgaacgtggtggcttgt2236IleAspHisGluIleValGlyArgGluIleLeuAsnValValAlaCys680685690695gaaggcccggagagggtggagcgctcggaaacgtacagacagtggcag2284GluGlyProGluArgValGluArgSerGluThrTyrArgGlnTrpGln700705710gcacggaccatgcgagctggcttccagcagaagcccaactctccgaac2332AlaArgThrMetArgAlaGlyPheGlnGlnLysProAsnSerProAsn715720725gtcatggctaagattaggatggcaatgaggtcatatcacagagactac2380ValMetAlaLysIleArgMetAlaMetArgSerTyrHisArgAspTyr730735740ggtattggggaagacggtgcctggttcttgctcggatggaaggagcgc2428GlyIleGlyGluAspGlyAlaTrpPheLeuLeuGlyTrpLysGluArg745750755atcacacatgccatgactgtctgggagcctctccccgacagcccttga2476IleThrHisAlaMetThrValTrpGluProLeuProAspSerPro760765770ttgtcgccacatatttccttgtggtcacttctctgcactaggaagtaatcacagtaccat2536gttccttctcattgggcaagtagagtgataattgtgttgtgattagatagatggccctga2596acaacgccttatctcattaatcttgagcaatgccttacaaactgctgtgctcaccttcgc2656ctgcagctctgtactatatccgagctcgc2685<210>2<211>774<212>PRT<213>展叶剑叶藓<400>2MetAlaGlySerLysHisGluArgSerGlyAspSerProValGlyThr151015GlyGluValSerProLeuAlaAlaGlnLeuGlnGlnAlaTrpLeuGln202530ThrGlnMetProLysAlaGlnLysArgSerPheThrSerValAlaAsn354045AlaGlnAsnGlnLeuProArgLeuSerProProGlyProGlySerGlu505560MetSerAlaSerSerLysProProSerSerSerValLeuLysSerLeu65707580SerThrLeuPheProGluLeuAlaAsnValGlnGluLysLysGluAla859095LysIleSerSerValPheGluGluGlyGluGlnProIleProIleHis100105110ProGluLeuArgGlnLysLysAlaGluCysLeuGluValMetPheGly115120125GlnAspValValGluGlnThrGlnAlaGlnGlyLeuArgAspTyrAsp130135140ArgHisAlaSerThrGluArgSerLeuSerAspSerLeuIleGlnGln145150155160SerAspAspSerLeuAspPheSerAspLeuGlyProLeuSerValSer165170175AsnSerPheSerArgProSerAlaGlnProGlyArgGlyThrPheGlu180185190AspAspLeuSerTyrIleCysSerAlaTyrGlySerArgProSerAla195200205SerGluTyrGluThrSerAlaGluValGluGlnGluLysThrProLeu210215220PheGluTyrLeuThrAspIleLeuMetAspGluAsnValGluGluLys225230235240LysCysMetPheIleGluMetSerAlaTyrGlnAlaMetAlaLysGlu245250255LeuGlyAspLeuIleSerTyrAspProProProMetProIleProGlu260265270ThrArgArgSerAspProHisPheGluGluAspValArgPheValAsp275280285SerTrpIleAspGluIleLeuSerGlyProLeuProAlaAspArgThr290295300AspSerProGlyAlaGluAlaLysLeuAspIleLysHisGlySerSer305310315320ProGluGluLeuTyrSerHisThrAspAlaAspArgGlySerSerVal325330335TrpAsnAspThrAlaSerAspThrAlaSerTyrLeuHisProAspSer340345350ThrLeuSerProValAspPheGlyAsnSerHisAlaLeuGluAsnGly355360365SerGlyGlySerLeuGlnValGlyThrArgHisLeuSerSerIleSer370375380SerSerAsnGlyAsnGlyValHisAlaProProValAspLeuThrAsp385390395400LeuLeuIleArgCysAlaGlnAlaValGluGlnAlaAspTyrArgHis405410415AlaAsnGluLeuIleHisGluLeuArgHisHisSerSerAlaTyrGly420425430AsnGlySerGlnArgMetAlaHisTyrPheMetGluAlaLeuValAla435440445LysIleSerGlyThrGlyGlyGlnLeuTyrSerAlaLeuSerAsnTyr450455460ArgProSerGluAlaGlnMetLeuArgAlaGlnMetLeuPheCysGlu465470475480HisCysProPheIleGlnValProHisIleTyrAlaAsnHisAlaIle485490495MetValAlaPheLysGlyAlaProArgValHisIleIleAspTyrGly500505510IleLeuTyrGlyIleGlnTrpLeuCysLeuIleHisGlnLeuSerGln515520525ArgProGluGlyProProHisLeuArgIleThrGlyIleAspArgPro530535540GlnProGlyPheArgProSerAlaArgIleGlnAspThrGlyArgArg545550555560LeuAlaLysLeuAlaLysGlnMetGlyValProPheGluPheHisAla565570575IleAlaGluLysTrpGluAlaIleThrProAlaHisLeuLeuLeuArg580585590AspAspGluValLeuAlaValAsnSerMetPheArgPheArgHisLeu595600605LeuAspGluSerValThrAlaAlaSerProArgAsnLeuValLeuSer6l0615620ArgIleArgSerLeuAsnProLysIlePheValGlnGlyValLeuAsn625630635640AlaGlyTyrAsnAlaProPhePheMetSerArgPheArgGluAlaLeu645650655AlaTyrPheSerThrIlePheAspSerMetGluCysSerPheProAla660665670GluHisProAspArgGlnIleIleAspHisGluIleValGlyArgGlu675680685IleLeuAsnValValAlaCysGluGlyProGluArgValGluArgSer690695700GluThrTyrArgGlnTrpGlnAlaArgThrMetArgAlaGlyPheGln705710715720GlnLysProAsnSerProAsnValMetAlaLysIleArgMetAlaMet725730735ArgSerTyrHisArgAspTyrGlyIleGlyGluAspGlyAlaTrpPhe740745750LeuLeuGlyTrpLysGluArgIleThrHisAlaMetThrValTrpGlu755760765ProLeuProAspSerPro770<210>3<211>2773<212>DNA<213>展叶剑叶藓<220><221>CDS<222>(569)..(2500)<223>Scarecrow-样基因PpSCL2(EST166)<400>3gcgatatcggcggtgatctccgtttctggctctcgcaaacccctcttgttgcacttcatt60gctttagaaccaagtatcttaaatgctctcagaatttctcatcatgttcaattgtagact120tatatgaggtgtcttttagactgcattctttcagacgcagtgctagtgctgctttggtaa180tgaagggcttgcacgttgcttattttctgctagagcttaatctcgtctctctgaaatttt240cttgatgcttcactagcgactcgcggagtccatacgaggggttcgtagctcttggacttg300cttaattggactttttcgacgacggttgtgaaattagtctttaagtgcagcttttggagg360gtctcatctgcgggctatctgccgcacgcaacttagtgtttacaaatcctgcttcccagt420tgatcattcacagctggacttggtaacagggggaaaggattttgaagtttgtttgagcac480atgtctgggtttgtgaaaatttacatttgggaagctcgcaactttgccatttgaggaaga540tctctctgtctgttcaatctctgcaacaatggctgccactcacgtcgttagc592MetAlaAlaThrHisValValSerl5aagaagaggtcgcccactatcttctctgaggtcgccacagccacctgc640LysLysArgSerProThrIlePheSerGluValAlaThrAlaThrCys101520aagcgatggaaatccgaagcggcctggcaccacgtggaagaaatggcc688LysArgTrpLysSerGluAlaAlaTrpHisHisValGluGluMetAla25303540ccggagccaccacccatccaggacttcgacctcaaggtgaaaacttcg736ProGluProProProIleGlnAspPheAspLeuLysValLysThrSer455055tgcttgaagatggtgcagccagaacccacgtccgtgctggacttgcaa784CysLeuLysMetValGlnProGluProThrSerValLeuAspLeuGln606570gccagcccaggtcggtcttgttcgtcgtcgaccagcctgagctccggg832AlaSerProGlyArgSerCysSerSerSerThrSerLeuSerSerGly758085accgattctccccactccatctccactgactctccaaatttctccacc880ThrAspSerProHisSerIleSerThrAspSerProAsnPheSerThr9095100actgtgcagcaagttgagccggttgacatcgccagctgggtcgactgt928ThrValGlnGlnValGluProValAspIleAlaSerTrpValAspCys105110115120atggccctgcccgaatttgaagactgcgaccgccatttggaggaagtt976MetAlaLeuProGluPheGluAspCysAspArgHisLeuGluGluVal125130135cttaagtccgacatcgacttcgccagcacagatctggacttcggcttc1024LeuLysSerAspIleAspPheAlaSerThrAspLeuAspPheGlyPhe140145150gagcttacgagcttggaccattgtagcgttgtgaccgagcatggctac1072GluLeuThrSerLeuAspHisCysSerValValThrGluHisGlyTyr155160165tctgtgagtctcttatccgagtttctcggggatcctgatgagaatctt1120SerValSerLeuLeuSerGluPheLeuGlyAspProAspGluAsnLeu170175180cttcttccagagagctttcacgacgcaaagaggctgcaagagttagac1168LeuLeuProGluSerPheHisAspAlaLysArgLeuGlnGluLeuAsp185190195200gactcgctctcgtcaatgttgagtgaggttcgatcgagcggttcagac1216AspSerLeuSerSerMetLeuSerGluValArgSerSerGlySerAsp205210215tcggggagtagcgtaccgacaacagtcgagcttgcgaggctcgtcgaa1264SerGlySerSerValProThrThrValGluLeuAlaArgLeuValGlu220225230tcactgccttgctctgacttgcgaagacacggaggtgttgacacgaaa1312SerLeuProCysSerAspLeuArgArgHisGlyGlyValAspThrLys235240245caccaccaccaccatagccgatctgagagctgggggtcgacgagcaaa1360HisHisHisHisHisSerArgSerGluSerTrpGlySerThrSerLys250255260ctgcaaaccttgcagcatccggaggacagcggattgcagctggttcat1408LeuGlnThrLeuGlnHisProGluAspSerGlyLeuGlnLeuValHis265270275280atgttgttagcgtgcgctgaagcgattgaaaagtctgacttcaacaaa1456MetLeuLeuAlaCysAlaGluAlaIleGluLysSerAspPheAsnLys285290295gcaaagcctatcttagaccagttactccgatcctccgacccatatggt1504AlaLysProIleLeuAspGlnLeuLeuArgSerSerAspProTyrGly300305310gaccccatgcaacgaatcgccctttacttcggtgaagccctcactgat1552AspProMetGlnArgIleAlaLeuTyrPheGlyGluAlaLeuThrAsp315320325catcttgccggggttgtcagccccagtgaaactcacttgctttcggat1600HisLeuAlaGlyValValSerProSerGluThrHisLeuLeuSerAsp330335340tccaagctcgcgtaccaagccttctacaaagtgcttcctttcgcgaaa1648SerLysLeuAlaTyrGlnAlaPheTyrLysValLeuProPheAlaLys345350355360ttttcacatgttacggcgaaccaaaccatttacgaggcggttgtgagg1696PheSerHisValThrAlaAsnGlnThrIleTyrGluAlaValValArg365370375agtcagaacgttcatgtggttgatttggacatccaactagggctgcag1744SerGlnAsnValHisValValAspLeuAspIleGlnLeuGlyLeuGln380385390tggccgtgcttcatacagtccttggccatgcgaccagggggtgctcct1792TrpProCysPheIleGlnSerLeuAlaMetArgProGlyGlyAlaPro395400405catctcagaatttcggccatcggaacgaatgccgagaatttgcagaca1840HisLeuArgIleSerAlaIleGlyThrAsnAlaGluAsnLeuGlnThr410415420accaagcgacggctgtccgaatttgccgaagctctcaaggtgcccttc1888ThrLysArgArgLeuSerGluPheAlaGluAlaLeuLysValProPhe425430435440gagttcactccagtgctctcgagcttggagaatctcaccgcggcgatg1936GluPheThrProValLeuSerSerLeuGluAsnLeuThrAlaAlaMet445450455ttggacattcggtcagaggaggatttggccatcaattgctcccaagtg1984LeuAspIleArgSerGluGluAspLeuAlaIleAsnCysSerGlnVal460465470ttgcatacgctttccggagaagaagctgttttagataaattgctcagc2032LeuHisThrLeuSerGlyGluGluAlaValLeuAspLysLeuLeuSer475480485atgttccacaacctgaaaccgaatgtggtgacactgttggaggccgag2080MetPheHisAsnLeuLysProAsnValValThrLeuLeuGluAlaGlu490495500gccaatcataatggcgcctcgttcattgcgaggtttgtcgaagcgctg2128AlaAsnHisAsnGlyAlaSerPheIleAlaArgPheValGluAlaLeu505510515520cactattactgcgccctgtttgattccttggagggagctctaggtcgc2176HisTyrTyrCysAlaLeuPheAspSerLeuGluGlyAlaLeuGlyArg525530535gacagtgcggatagataccatattgagagtacagcactcgctgctgag2224AspSerAlaAspArgTyrHisIleGluSerThrAlaLeuAlaAlaGlu540545550atcaaggagattgttgctttcaagggaaataggcggcgtgtgagacat2272IleLysGluIleValAlaPheLysGlyAsnArgArgArgValArgHis555560565gtgcggtcggagacatggcggggcttgtttgcgaaagcaggatttctg2320ValArgSerGluThrTrpArgGlyLeuPheAlaLysAlaGlyPheLeu570575580tccatggctttcagttcgtatactgtgcagcaagcgcagatgttgctg2368SerMetAlaPheSerSerTyrThrValGlnGlnAlaGlnMetLeuLeu585590595600gaagttttgacatcgaagcctatgcagcaagcaaacgctacaatgcct2416GluValLeuThrSerLysProMetGlnGlnAlaAsnAlaThrMetPro605610615tacaaactgtcgcaggaatcgacatccctgattttagggcggcaagaa2464TyrLysLeuSerGlnGluSerThrSerLeuIleLeuGlyArgGlnGlu620625630actcccgtgattggcgtatctgcttggacttgctagtggctaatca2510ThrProValIleGlyValSerAlaTrpThrCys635640aataccaatcggagctagaacaattaggttagaaattgtccataattgtaccagtatatg2570tgattgtagatttagaaaatgcgcctattgtagatttagaaaatgaatgaggactgcggt2630ggaaactctgaggcggtgataattgccggtgatgagtaggcacatagcatgcgcaatctt2690caatcgacatgttaacgtaatgaagtatcaatgtacataagttgatgtaacagtgccaga2750caatctggactatacgatatcgc2773<210>4<211>643<212>PRT<213>展叶剑叶藓<400>4MetAlaAlaThrHisValValSerLysLysArgSerProThrIlePhe151015SerGluValAlaThrAlaThrCysLysArgTrpLysSerGluAlaAla202530TrpHisHisValGluGluMetAlaProGluProProProIleGlnAsp354045PheAspLeuLysValLysThrSerCysLeuLysMetValGlnProGlu505560ProThrSerValLeuAspLeuGlnAlaSerProGlyArgSerCysSer65707580SerSerThrSerLeuSerSerGlyThrAspSerProHisSerIleSer859095ThrAspSerProAsnPheSerThrThrValGlnGlnValGluProVal100105110AspIleAlaSerTrpValAspCysMetAlaLeuProGluPheGluAsp115120125CysAspArgHisLeuGluGluValLeuLysSerAspIleAspPheAla130135140SerThrAspLeuAspPheGlyPheGluLeuThrSerLeuAspHisCys145150155160SerValValThrGluHisGlyTyrSerValSerLeuLeuSerGluPhe165170175LeuGlyAspProAspGluAsnLeuLeuLeuProGluSerPheHisAsp180185190AlaLysArgLeuGlnGluLeuAspAspSerLeuSerSerMetLeuSer195200205GluValArgSerSerGlySerAspSerGlySerSerValProThrThr210215220ValGluLeuAlaArgLeuValGluSerLeuProCysSerAspLeuArg225230235240ArgHisGlyGlyValAspThrLysHisHisHisHisHisSerArgSer245250255GluSerTrpGlySerThrSerLysLeuGlnThrLeuGlnHisProGlu260265270AspSerGlyLeuGlnLeuValHisMetLeuLeuAlaCysAlaGluAla275280285IleGluLysSerAspPheAsnLysAlaLysProIleLeuAspGlnLeu290295300LeuArgSerSerAspProTyrGlyAspProMetGlnArgIleAlaLeu305310315320TyrPheGlyGluAlaLeuThrAspHisLeuAlaGlyValValSerPro325330335SerGluThrHisLeuLeuSerAspSerLysLeuAlaTyrGlnAlaPhe340345350TyrLysValLeuProPheAlaLysPheSerHisValThrAlaAsnGln355360365ThrIleTyrGluAlaValValArgSerGlnAsnValHisValValAsp370375380LeuAspIleGlnLeuGlyLeuGlnTrpProCysPheIleGlnSerLeu385390395400AlaMetArgProGlyGlyAlaProHisLeuArgIleSerAlaIleGly405410415ThrAsnAlaGluAsnLeuGlnThrThrLysArgArgLeuSerGluPhe420425430AlaGluAlaLeuLysValProPheGluPheThrProValLeuSerSer435440445LeuGluAsnLeuThrAlaAlaMetLeuAspIleArgSerGluGluAsp450455460LeuAlaIleAsnCysSerGlnValLeuHisThrLeuSerGlyGluGlu465470475480AlaValLeuAspLysLeuLeuSerMetPheHisAsnLeuLysProAsn485490495ValValThrLeuLeuGluAlaGluAlaAsnHisAsnGlyAlaSerPhe500505510IleAlaArgPheValGluAlaLeuHisTyrTyrCysAlaLeuPheAsp515520525SerLeuGluGlyAlaLeuGlyArgAspSerAlaAspArgTyrHisIle530535540GluSerThrAlaLeuAlaAlaGluIleLysGluIleValAlaPheLys545550555560GlyAsnArgArgArgValArgHisValArgSerGluThrTrpArgGly565570575LeuPheAlaLysAlaGlyPheLeuSerMetAlaPheSerSerTyrThr580585590ValGlnGlnAlaGlnMetLeuLeuGluValLeuThrSerLysProMet595600605GlnGlnAlaAsnAlaThrMetProTyrLysLeuSerGlnGluSerThr610615620SerLeuIleLeuGlyArgGlnGluThrProValIleGlyValSerAla625630635640TrpThrCys<210>5<211>2281<212>DNA<213>展叶剑叶藓<220><221>CDS<222>(218)..(2191)<223>Scarecrow-样基因PpSCL3(EST512)<400>5atcccgggaagaagagcgtgaacgtgggagagactgagacatcgtccccgcggttctaca60cttgcaggaggtcacatgagagattgcacgtggatcacactgcacagtttcaagattcgg120gcgaagccattttcttgacgaccagcttgtgcaagggagaaataaacgtagtacaagctc180tgttcctggaacctccttgagttcagtttccgcgagtatgagtgtgcagtatcga235MetSerValGlnTyrArg15ccggagctgggtactatggttctaacacctggatatccaccaggcaaa283ProGluLeuGlyThrMetValLeuThrProGlyTyrProProGlyLys101520gaaagagagtatttgtcagacactgctaatagtcaacagacacccagc331GluArgGluTyrLeuSerAspThrAlaAsnSerGlnGlnThrProSer253035tattatggtgcgcagaagtcttatgcggatggtcaaaggcagagtgca379TyrTyrGlyAlaGlnLysSerTyrAlaAspGlyGlnArgGlnSerAla404550tatggtatgaaaaacaaaagtcacagttcgcctgtatctcccctatct427TyrGlyMetLysAsnLysSerHisSerSerProValSerProLeuSer55606570ccgcaagattcatctcaggccgcttcggataatggacaaaggatgtct475ProGlnAspSerSerGlnAlaAlaSerAspAsnGlyGlnArgMetSer758085gcaggctggagctctgcatcttatcagagcgaatcctcctctcatagt523AlaGlyTrpSerSerAlaSerTyrGlnSerGluSerSerSerHisSer9095100gatggttctttagagggtcctggaaaactggaagaggcagactattat571AspGlySerLeuGluGlyProGlyLysLeuGluGluAlaAspTyrTyr105110115ggacgccaacatcgtcatggtgagcagttaactgggtcagtagcatat619GlyArgGlnHisArgHisGlyGluGlnLeuThrGlySerValAlaTyr120125130cataatacgccgtcttctgttttgagacccatgggatatccagctgaa667HisAsnThrProSerSerValLeuArgProMetGlyTyrProAlaGlu135140145150actgctcaggcttatcaaatgcctaactatcagcaggccgtacgatat715ThrAlaGlnAlaTyrGlnMetProAsnTyrGlnGlnAlaValArgTyr155160165ataccagaggagcaatatgcccagtctcagagcaattatgcgcagagg763IleProGluGluGlnTyrAlaGlnSerGlnSerAsnTyrAlaGlnArg170175180aacccagaaatggcacatatgctgcaagttctggagagcgcgcttttg811AsnProGluMetAlaHisMetLeuGlnValLeuGluSerAlaLeuLeu185190195gatgacgacgatggtgcagatttgccaggatctcttgggaatggacat859AspAspAspAspGlyAlaAspLeuProGlySerLeuGlyAsnGlyHis200205210gatcctgcatcagaagggaactgggcagacacgattgaggagtttatg907AspProAlaSerGluGlyAsnTrpAlaAspThrIleGluGluPheMet215220225230gctgccgatgcctcgccagctgattcatccactgtaacgtcagctacc955AlaAlaAspAlaSerProAlaAspSerSerThrValThrSerAlaThr235240245actccacctgaatatgggaagcagtgtcgcaacgggagtacaaacaac1003ThrProProGluTyrGlyLysGlnCysArgAsnGlySerThrAsnAsn250255260tatactggagccgccactgctagagtggaagaaccacctcctcaaaaa1051TyrThrGlyAlaAlaThrAlaArgValGluGluProProProGlnLys265270275ttggttgtgggaacaaggagtagatcagaacagctgcttgtagcttgc1099LeuValValGlyThrArgSerArgSerGluGlnLeuLeuValAlaCys280285290gctgaagctctctcaaataatgatatgccgttagcgaacgtactaatc1147AlaGluAlaLeuSerAsnAsnAspMetProLeuAlaAsnValLeuIle295300305310gctcaactcaatcaagtggtttccatatatggtgatccaatgcagcgt1195AlaGlnLeuAsnGlnValValSerIleTyrGlyAspProMetGlnArg315320325ttggctgcttatatggtcgagggtcttgtggctcgggtcgctgcctca1243LeuAlaAlaTyrMetValGluGlyLeuValAlaArgValAlaAlaSer330335340ggaaaaggcatttatagatcactgaagtgtaaagatcctccgaccaga1291GlyLysGlyIleTyrArgSerLeuLysCysLysAspProProThrArg345350355gacctactttcagcaatgcagattctgtacgaagtctgtccatacttt1339AspLeuLeuSerAlaMetGlnIleLeuTyrGluValCysProTyrPhe360365370aaatttgggtacatggcagctaatggatccatcgctgaagcttttcaa1387LysPheGlyTyrMetAlaAlaAsnGlySerIleAlaGluAlaPheGln375380385390aatgaatctcgggttcatatcatcgactttcaaatagctcaaggcaca1435AsnGluSerArgValHisIleIleAspPheGlnIleAlaGlnGlyThr395400405caatggacaactcttattcaagccttggctgctcgaccagggggtcca1483GlnTrpThrThrLeuIleGlnAlaLeuAlaAlaArgProGlyGlyPro410415420cctcacttgcgaatcactggtatcgatgatcctatgcctggaccgaat1531ProHisLeuArgIleThrGlyIleAspAspProMetProGlyProAsn425430435tcgaatgcaggtgttgagatggttgggaagcggcttgctaaactagcg1579SerAsnAlaGlyValGluMetValGlyLysArgLeuAlaLysLeuAla440445450gaagctgttggagttcccttcgacttccatcctgtagcgaagaaaggg1627GluAlaValGlyValProPheAspPheHisProValAlaLysLysGly455460465470ccagaggtagaagcatggatgctggagcggcagccgggggaagctctt1675ProGluValGluAlaTrpMetLeuGluArgGlnProGlyGluAlaLeu475480485gcagtcaatttcgccctacatctccaccatatgcctgacgagagtgtc1723AlaValAsnPheAlaLeuHisLeuHisHisMetProAspGluSerVal490495500tgcacaagcaatcctcgggatcgtatactgcatatggtcaaagccctc1771CysThrSerAsnProArgAspArgIleLeuHisMetValLysAlaLeu505510515aaccccaaagttgtgacccttgtcgagcaggagtctaatactaacact1819AsnProLysValValThrLeuValGluGlnGluSerAsnThrAsnThr520525530gctccattctttccacgctttttggaagctatgaattactacgctgca1867AlaProPhePheProArgPheLeuGluAlaMetAsnTyrTyrAlaAla535540545550atatttgagtctctggacattaccttggcccgtgagagcaaggagcgt1915IlePheGluSerLeuAspIleThrLeuAlaArgGluSerLysGluArg555560565gtgaatgttgagcaacaatgtttagctcgcgatatcgtcaacatcatt1963ValAsnValGluGlnGlnCysLeuAlaArgAspIleValAsnIleIle570575580gcttgtgaaggtattgatagagttgaaaggcatgagatgatggggaaa2011AlaCysGluGlyIleAspArgValGluArgHisGluMetMetGlyLys585590595tggcgcgcgcgcctgactatggctggttttcgtccgtatcctttaagc2059TrpArgAlaArgLeuThrMetAlaGlyPheArgProTyrProLeuSer600605610caaacagtgaacaacacaataaagacattgctggagtcatatagtgat2107GlnThrValAsnAsnThrIleLysThrLeuLeuGluSerTyrSerAsp615620625630aagtatagacttaaagacgagggcggagcactttatctgggctggaag2155LysTyrArgLeuLysAspGluGlyGlyAlaLeuTyrLeuGlyTrpLys635640645aatcggtccctcattgtttcctctgcatggcagtagacctcgtctg2201AsnArgSerLeuIleValSerSerAlaTrpGln650655ttctcactgtatatattcttatagtgtggttcagcctcgagttatctgaggacctgtctc2261atttggtaaggcagtactgc2281<210>6<211>657<212>PRT<213>展叶剑叶藓<400>6MetSerValGlnTyrArgProGluLeuGlyThrMetValLeuThrPro151015GlyTyrProProGlyLysGluArgGluTyrLeuSerAspThrAlaAsn202530SerGlnGlnThrProSerTyrTyrGlyAlaGlnLysSerTyrAlaAsp354045GlyGlnArgGlnSerAlaTyrGlyMetLysAsnLysSerHisSerSer505560ProValSerProLeuSerProGlnAspSerSerGlnAlaAlaSerAsp65707580AsnGlyGlnArgMetSerAlaGlyTrpSerSerAlaSerTyrGlnSer859095GluSerSerSerHisSerAspGlySerLeuGluGlyProGlyLysLeu100105110GluGluAlaAspTyrTyrGlyArgGlnHisArgHisGlyGluGlnLeu115120125ThrGlySerValAlaTyrHisAsnThrProSerSerValLeuArgPro130135140MetGlyTyrProAlaGluThrAlaGlnAlaTyrGlnMetProAsnTyr145150155160GlnGlnAlaValArgTyrIleProGluGluGlnTyrAlaGlnSerGln165170175SerAsnTyrAlaGlnArgAsnProGluMetAlaHisMetLeuGlnVal180185190LeuGluSerAlaLeuLeuAspAspAspAspGlyAlaAspLeuProGly195200205SerLeuGlyAsnGlyHisAspProAlaSerGluGlyAsnTrpAlaAsp210215220ThrIleGluGluPheMetAlaAlaAspAlaSerProAlaAspSerSer225230235240ThrValThrSerAlaThrThrProProGluTyrGlyLysGlnCysArg245250255AsnGlySerThrAsnAsnTyrThrGlyAlaAlaThrAlaArgValGlu260265270GluProProProGlnLysLeuValValGlyThrArgSerArgSerGlu275280285GlnLeuLeuValAlaCysAlaGluAlaLeuSerAsnAsnAspMetPro290295300LeuAlaAsnValLeuIleAlaGlnLeuAsnGlnValValSerIleTyr305310315320GlyAspProMetGlnArgLeuAlaAlaTyrMetValGluGlyLeuVal325330335AlaArgValAlaAlaSerGlyLysGlyIleTyrArgSerLeuLysCys340345350LysAspProProThrArgAspLeuLeuSerAlaMetGlnIleLeuTyr355360365GluValCysProTyrPheLysPheGlyTyrMetAlaAlaAsnGlySer370375380IleAlaGluAlaPheGlnAsnGluSerArgValHisIleIleAspPhe385390395400GlnIleAlaGlnGlyThrGlnTrpThrThrLeuIleGlnAlaLeuAla405410415AlaArgProGlyGlyProProHisLeuArgIleThrGlyIleAspAsp420425430ProMetProGlyProAsnSerAsnAlaGlyValGluMetValGlyLys435440445ArgLeuAlaLysLeuAlaGluAlaValGlyValProPheAspPheHis450455460ProValAlaLysLysGlyProGluValGluAlaTrpMetLeuGluArg465470475480GlnProGlyGluAlaLeuAlaValAsnPheAlaLeuHisLeuHisHis485490495MetProAspGluSerValCysThrSerAsnProArgAspArgIleLeu500505510HisMetValLysAlaLeuAsnProLysValValThrLeuValGluGln515520525GluSerAsnThrAsnThrAlaProPhePheProArgPheLeuGluAla530535540MetAsnTyrTyrAlaAlaIlePheGluSerLeuAspIleThrLeuAla545550555560ArgGluSerLysGluArgValAsnValGluGlnGlnCysLeuAlaArg565570575AspIleValAsnIleIleAlaCysGluGlyIleAspArgValGluArg580585590HisGluMetMetGlyLysTrpArgAlaArgLeuThrMetAlaGlyPhe595600605ArgProTyrProLeuSerGlnThrValAsnAsnThrIleLysThrLeu610615620LeuGluSerTyrSerAspLysTyrArgLeuLysAspGluGlyGlyAla625630635640LeuTyrLeuGlyTrpLysAsnArgSerLeuIleValSerSerAlaTrp645650655Gln<210>7<211>2610<212>DNA<213>大豆(Glycinemax)<220><221>CDS<222>(124)..(2079)<223>Scarecrow-样基因GmSCL1(GM59556757)<400>7actaaaacacccatactctctctttctctttcattctttgatgcctttctacaaaaacac60aaccttttaactgttatttttttttttttcgtttgctccttattttcttcgccgaatcct120agaatgtcatcgccggggttccctggcggcggtagtgcgtctgagttt168MetSerSerProGlyPheProGlyGlyGlySerAlaSerGluPhe151015ttcgctggagcgggtgttttcggcggcagatccattccgggggccacc216PheAlaGlyAlaGlyValPheGlyGlyArgSerIleProGlyAlaThr202530atgaacaaccccaacgccgccgcttccgccaccatcaacaacctccac264MetAsnAsnProAsnAlaAlaAlaSerAlaThrIleAsnAsnLeuHis354045cctctctaccgaacccaacaacaacagaaccttcccgcaatgtttcta312ProLeuTyrArgThrGlnGlnGlnGlnAsnLeuProAlaMetPheLeu505560gatccttcctcgcagatcgcccaacgccaaacaccaaccttcatcggt360AspProSerSerGlnIleAlaGlnArgGlnThrProThrPheIleGly657075aagcgcaccctaaccgaattccaagcctacaaccaaaccaacaacaac408LysArgThrLeuThrGluPheGlnAlaTyrAsnGlnThrAsnAsnAsn80859095cccaaccacgtcctctcgaacctcctgcttcgttccgttaagccccgg456ProAsnHisValLeuSerAsnLeuLeuLeuArgSerValLysProArg100105110accagtttataccacacctctatggactttcctgttcccgaattgcaa504ThrSerLeuTyrHisThrSerMetAspPheProValProGluLeuGln115120125aaccaaaacctttattccaaccaaacgcagcgttttggtgttccgtta552AsnGlnAsnLeuTyrSerAsnGlnThrGlnArgPheGlyValProLeu130135140cttcaccagcttcgtcctcagcccattaatctccccaacaacgggccc600LeuHisGlnLeuArgProGlnProIleAsnLeuProAsnAsnGlyPro145150155gtgcccatgacaggcccaaatttcggttaccggaactcgaatttgggc648ValProMetThrGlyProAsnPheGlyTyrArgAsnSerAsnLeuGly160165170175ttaccacagaaccagaaccgggttcgtgtttctctccctgtttctgtt696LeuProGlnAsnGlnAsnArgValArgValSerLeuProValSerVal180185190ccggttcaggttcactcatctgaaccggaaaagaagatcatggaccac744ProValGlnValHisSerSerGluProGluLysLysIleMetAspHis195200205aggcttctggaattggagaagcagcttctggaagataacgacgacgaa792ArgLeuLeuGluLeuGluLysGlnLeuLeuGluAspAsnAspAspGlu210215220ggagaagctgatgctgcgtctgtgataaccacgagcgagtggtccgag840GlyGluAlaAspAlaAlaSerValIleThrThrSerGluTrpSerGlu225230235acttatcagaatttaatcagtcccagtccggttcagaaaccggttttg888ThrTyrGlnAsnLeuIleSerProSerProValGlnLysProValLeu240245250255acgacgacgtcgccgacttcttccacgacgtcgtccacgtcatcttct936ThrThrThrSerProThrSerSerThrThrSerSerThrSerSerSer260265270tcctccgtggcttcgcctgcttccggatgctccaagcaaacgctcatg984SerSerValAlaSerProAlaSerGlyCysSerLysGlnThrLeuMet275280285gaagccgcatctgcaattgttgaaggtaaacacgatgttgcggcggag1032GluAlaAlaSerAlaIleValGluGlyLysHisAspValAlaAlaGlu290295300atcctgaaccggttgaacggtgtgaaccggagtgataggttgacggat1080IleLeuAsnArgLeuAsnGlyValAsnArgSerAspArgLeuThrAsp305310315tgcatggtttcggcgttgaaatcgaggatgaatccggtggagtatcct1128CysMetValSerAlaLeuLysSerArgMetAsnProValGluTyrPro320325330335ccgccggtggcggagcttttcaggaaggagcacgccgattcgactcag1176ProProValAlaGluLeuPheArgLysGluHisAlaAspSerThrGln340345350atgctcttggagaactcggtgtgcttcacggtagggttcatggcggcg1224MetLeuLeuGluAsnSerValCysPheThrValGlyPheMetAlaAla355360365aatctcgcgattctggaagccgcatttgaggagaaaacggagacgagc1272AsnLeuAlaIleLeuGluAlaAlaPheGluGluLysThrGluThrSer370375380aggttctgcgtggtggattttgagattggacaagggaagcagtatttg1320ArgPheCysValValAspPheGluIleGlyGlnGlyLysGlnTyrLeu385390395cacctcctcaacgcgctctcggcgcgtggacagaacgtggcggtgaag1368HisLeuLeuAsnAlaLeuSerAlaArgGlyGlnAsnValAlaValLys400405410415atcgcagccgtagcagaaaaaggaggtgaggagagagtgcgggctgtg1416IleAlaAlaValAlaGluLysGlyGlyGluGluArgValArgAlaVal420425430ggagacatgctgagattactcgcggagaggctgaggatccggttcgag1464GlyAspMetLeuArgLeuLeuAlaGluArgLeuArgIleArgPheGlu435440445ttcaaaatcgtcgcgactcagaaaatcgccgagttgactcgtgagtcg1512PheLysIleValAlaThrGlnLysIleAlaGluLeuThrArgGluSer450455460ctgggatgcgatgcggacgatgttctcatggtgaacttcgcgttcaag1560LeuGlyCysAspAlaAspAspValLeuMetValAsnPheAlaPheLys465470475ctgaacaagattccggacgagagcgtctccccggaaaaccctcgggac1608LeuAsnLysIleProAspGluSerValSerProGluAsnProArgAsp480485490495gagcttcttcggcgcgtgaagagactcgcgccgcgcgtggtgacggtt1656GluLeuLeuArgArgValLysArgLeuAlaProArgValValThrVal500505510gtggagcaggagataaacgggaacacggcgccgtttttggcgcgcgtg1704ValGluGlnGluIleAsnGlyAsnThrAlaProPheLeuAlaArgVal515520525gcggaaacgctgtcgtattacggcgcgttgttggagtccattgaggcc1752AlaGluThrLeuSerTyrTyrGlyAlaLeuLeuGluSerIleGluAla530535540accacggtggggaaagataacagcattaacaactcagaccgagtcaga1800ThrThrValGlyLysAspAsnSerIleAsnAsnSerAspArgValArg545550555ctcgaggagggactgagtcgaaaattgcataactcggtggcgtgcgaa1848LeuGluGluGlyLeuSerArgLysLeuHisAsnSerValAlaCysGlu560565570575ggaagagatcgcgtggaacggtgcgaagtgtttggaaaatggcgcgcg1896GlyArgAspArgValGluArgCysGluValPheGlyLysTrpArgAla580585590cgtatgagcatggcggggtttgagttaaaaccactgagtcaaagcatg1944ArgMetSerMetAlaGlyPheGluLeuLysProLeuSerGlnSerMet595600605gtcgagtcaattaaagcgcgactcatctctgccaacaaccgagtcaac1992ValGluSerIleLysAlaArgLeuIleSerAlaAsnAsnArgValAsn610615620tcgggactcaccgtaaaagaagagaacggagggatttgctttggttgg2040SerGlyLeuThrValLysGluGluAsnGlyGlyIleCysPheGlyTrp625630635atgggaagaacactcacagtcgcatctgcttggcgttaacttggctcat2089MetGlyArgThrLeuThrValAlaSerAlaTrpArg640645650ttatttttctttcttttttctttttattttggttcggaatattattatatataatatcac2149attgttactatattttaacgtcatctagagataatggaaaggcaaagagaatagatttgg2209taaattattattattataaatatagtatgataaaagggtgaaaagaaaatctcaaggaaa2269gcccctcctcttggttctaccgaactaaaactaataaagaagtgtttggattccgagaag2329actcatgttacatttattgattcttctatgtattagttgttgatatgctttttttatttt2389atttttattttttggtttatcatcttcacttgggtgtgtgaaaggagttggttgctgttt2449ggtagatagctgacttgtgtgtgatacaatggattggtttgccctcgcattaccgacaaa2509cgagggctccacttataggatgcatttttgggggtttagttggacttggaacttccctgt2569tatccaaaaaaaaaaaaaaaaaagagagagaccgacacgca2610<210>8<211>651<212>PRT<213>大豆<400>8MetSerSerProGlyPheProGlyGlyGlySerAlaSerGluPhePhe151015AlaGlyAlaGlyValPheGlyGlyArgSerIleProGlyAlaThrMet202530AsnAsnProAsnAlaAlaAlaSerAlaThrIleAsnAsnLeuHisPro354045LeuTyrArgThrGlnGlnGlnGlnAsnLeuProAlaMetPheLeuAsp505560ProSerSerGlnIleAlaGlnArgGlnThrProThrPheIleGlyLys65707580ArgThrLeuThrGluPheGlnAlaTyrAsnGlnThrAsnAsnAsnPro859095AsnHisValLeuSerAsnLeuLeuLeuArgSerValLysProArgThr100105110SerLeuTyrHisThrSerMetAspPheProValProGluLeuGlnAsn115120125GlnAsnLeuTyrSerAsnGlnThrGlnArgPheGlyValProLeuLeu130135140HisGlnLeuArgProGlnProIleAsnLeuProAsnAsnGlyProVal145150155160ProMetThrGlyProAsnPheGlyTyrArgAsnSerAsnLeuGlyLeu165170175ProGlnAsnGlnAsnArgValArgValSerLeuProValSerValPro180185190ValGlnValHisSerSerGluProGluLysLysIleMetAspHisArg195200205LeuLeuGluLeuGluLysGlnLeuLeuGluAspAsnAspAspGluGly210215220GluAlaAspAlaAlaSerValIleThrThrSerGluTrpSerGluThr225230235240TyrGlnAsnLeuIleSerProSerProValGlnLysProValLeuThr245250255ThrThrSerProThrSerSerThrThrSerSerThrSerSerSerSer260265270SerValAlaSerProAlaSerGlyCysSerLysGlnThrLeuMetGlu275280285AlaAlaSerAlaIleValGluGlyLysHisAspValAlaAlaGluIle290295300LeuAsnArgLeuAsnGlyValAsnArgSerAspArgLeuThrAspCys305310315320MetValSerAlaLeuLysSerArgMetAsnProValGluTyrProPro325330335ProValAlaGluLeuPheArgLysGluHisAlaAspSerThrGlnMet340345350LeuLeuGluAsnSerValCysPheThrValGlyPheMetAlaAlaAsn355360365LeuAlaIleLeuGluAlaAlaPheGluGluLysThrGluThrSerArg370375380PheCysValValAspPheGluIleGlyGlnGlyLysGlnTyrLeuHis385390395400LeuLeuAsnAlaLeuSerAlaArgGlyGlnAsnValAlaValLysIle405410415AlaAlaValAlaGluLysGlyGlyGluGluArgValArgAlaValGly420425430AspMetLeuArgLeuLeuAlaGluArgLeuArgIleArgPheGluPhe435440445LysIleValAlaThrGlnLysIleAlaGluLeuThrArgGluSerLeu450455460GlyCysAspAlaAspAspValLeuMetValAsnPheAlaPheLysLeu465470475480AsnLysIleProAspGluSerValSerProGluAsnProArgAspGlu485490495LeuLeuArgArgValLysArgLeuAlaProArgValValThrValVal500505510GluGlnGluIleAsnGlyAsnThrAlaProPheLeuAlaArgValAla515520525GluThrLeuSerTyrTyrGlyAlaLeuLeuGluSerIleGluAlaThr530535540ThrValGlyLysAspAsnSerIleAsnAsnSerAspArgValArgLeu545550555560GluGluGlyLeuSerArgLysLeuHisAsnSerValAlaCysGluGly565570575ArgAspArgValGluArgCysGluValPheGlyLysTrpArgAlaArg580585590MetSerMetAlaGlyPheGluLeuLysProLeuSerGlnSerMetVal595600605GluSerIleLysAlaArgLeuIleSerAlaAsnAsnArgValAsnSer610615620GlyLeuThrValLysGluGluAsnGlyGlyIleCysPheGlyTrpMet625630635640GlyArgThrLeuThrValAlaSerAlaTrpArg645650<210>9<211>18<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(18)<223>测序引物<400>9caggaaacagctatgacc18<210>10<211>19<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(19)<223>测序引物<400>10ctaaagggaacaaaagctg19<210>11<211>18<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(18)<223>测序引物<400>11tgtaaaacgacggccagt18<210>12<211>25<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(25)<223>PpSCL-1(EST386)的5’RACEPCR引物<400>12gagggaaagctgtggcgagctaaaa25<210>13<211>32<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(32)<223>PpSCL-1(EST386)的RT-PCT引物RC896<400>13atcccgggagacaagctaagcaagtaagcaag32<210>14<211>34<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(34)<223>PpSCL-1(EST386)的RT-PCR引物RC897<400>14gcgagctcggatatagtacagagctgcaggcgaa34<210>15<211>25<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(25)<223>PpSCL2(EST166)的5’RacePCR引物<400>15gtcggaggatcggagtaactggtct25<210>16<211>34<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(34)<223>PpSCL2(EST166)的RT-PCR引物RC618<400>16gcgatatcggcggtgatctecgtttcctggctct34<210>17<211>34<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(34)<223>PpSCL2(EST166)的RT-PCR引物RC619<400>17gcgatatcgtatagtccagattgtctggcactgt34<210>18<211>25<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(25)<223>PpSCL3(EST512)的5’RacePCR引物<400>18gtgaaccccctggtcgagcagccaa25<210>19<211>28<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(28)<223>PpSCL3(EST512)的RT-PCR引物RC705<400>19cccgggaagaagagcgtgaacgtgggat28<210>20<211>32<212>DNA<213>人工的<220><221>misc_feature<222>(1)..(32)<223>PpSCL3(EST512)的RT-PCR引物RC706<400>20agtactgccttaccaaatgagacaggtcctca3权利要求1.用编码多肽的核酸转化的转基因植物，其中该核酸包含选自如下的多核苷酸序列a.编码如SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8中定义的多肽的多核苷酸序列；b.如SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中定义的多核苷酸序列；c.编码与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8中定义的全长多肽具有至少60％序列同一性的多肽的多核苷酸序列；和d.在严格条件下与选自上面a)或者b)的全长多核苷酸序列和上面a)或者b)的多核苷酸序列的全长互补序列的至少一种序列杂交的多核苷酸序列，其中严格条件包括在6X氯化钠/柠檬酸钠(SSC)溶液中65℃下杂交；其中植物中所述多核苷酸的表达导致该植物与野生型变种的植物相比对干旱胁迫的耐受性增强。2.权利要求1的转基因植物，其中植物中所述多核苷酸的表达导致该植物在水受限的条件下增加的生长。3.权利要求2的转基因植物，其中在水受限的条件下增加的生长是由于植物的水利用效率(WUE)增加。4.权利要求3的转基因植物，其中增加的WUE是由于植物的增加的干重。5.权利要求1的转基因植物，其中该植物是单子叶植物。6.权利要求1的转基因植物，其中该植物是双子叶植物。7.权利要求1的转基因植物，其中该植物选自玉米、小麦、黑麦、燕麦、黑小麦、稻、大麦、大豆、花生、棉花、油菜籽、油菜、木薯、胡椒、向日葵、万寿菊、茄科植物、马铃薯、烟草、茄子、番茄、蚕豆物种、豌豆、苜蓿、咖啡、可可、茶、柳属的种、油棕榈树、椰子、多年生草、冰草、虉草、雀麦、披碱草、早熟禾、鸭茅、苜蓿、Salfoin、角果百脉根、杂种车轴草、红车轴草、和草木樨(SweetClover)。8.权利要求1的转基因植物，其中该植物是完整植物、植物细胞、植物部分或者植物种子。9.权利要求2的转基因植物，其中该植物是完整植物、植物细胞、植物部分或者植物种子。10.权利要求3的转基因植物，其中该植物是完整植物、植物细胞、植物部分或者植物种子。11.权利要求4的转基因植物，其中该植物是完整植物、植物细胞、植物部分或者植物种子。12.分离的编码多肽的核酸，其中该核酸包含选自如下的多核苷酸序列a.编码如SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8中定义的多肽的多核苷酸序列；b.如SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中定义的多核苷酸序列；c.编码与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8中定义的全长多肽具有至少60％序列同一性的多肽的多核苷酸序列；和d.在严格条件下与选自上面a)或者b)的全长多核苷酸序列和上面a)或者b)的多核苷酸序列的全长互补序列的至少一种序列杂交的多核苷酸序列，其中严格条件包括在6X氯化钠/柠檬酸钠(SSC)溶液中65℃下杂交；其中所述多肽当在植物中表达时赋予所述植物对干旱胁迫的增强的耐受性。13.重组载体，其包含权利要求12的分离的核酸。14.根据权利要求13的重组载体，其是还包含一种或多种调节序列的表达载体。15.产生包含编码多肽的核酸的转基因植物的方法，其中该方法包括步骤用包含所述核酸的表达载体转化植物细胞并从该植物细胞产生表达所述多肽的转基因植物；其中与野生型变种的植物相比，转基因植物中所述多肽的过表达导致该植物对干旱胁胁迫的耐受性增强，并且其中所述核酸包含选自如下的多核苷酸序列a.编码如SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8中定义的多肽的多核苷酸序列；b.如SEQIDNO1、SEQIDNO3、SEQIDNO5或SEQIDNO7中定义的多核苷酸序列；c.编码与SEQIDNO2、SEQIDNO4、SEQIDNO6或SEQIDNO8中定义的全长多肽具有至少60％序列同一性的多肽的多核苷酸序列；和d.在严格条件下与选自上面a)或者b)的全长多核苷酸序列和上面a)或者b)的多核苷酸序列的全长互补序列的至少一种序列杂交的多核苷酸序列，其中严格条件包括在6X氯化钠/柠檬酸钠(SSC)溶液中65℃下杂交。16.在农业场所种植植物的方法，其中该方法包括得到根据权利要求1的转基因植物，并在农业场所种植所述植物。17.从权利要求1的转基因植物制备的动物饲料、粮食、化妆品或者药物。全文摘要用SLSRP编码核酸转化的转基因植物，其中植物中所述核酸序列的表达导致与野生型变种的植物相比，在水受限的条件下增加的生长和/或对环境胁迫的增强的耐受性。还提供了通过该转基因植物产生的农产品，包括种子。还提供了分离的SLSRP、分离的SLSRP编码核酸和含有所述核酸的载体和宿主细胞。文档编号C12N15/82GK101040048SQ200580035086公开日2007年9月19日申请日期2005年10月19日优先权日2004年10月20日发明者D·艾伦,O·达科斯塔埃席尔瓦,L·米尔斯,N·范蒂伦申请人:巴斯福植物科学有限公司