检测核酸链和物质间结合或相互作用的检测方法

文档序号:565034阅读:362来源:国知局
专利名称:检测核酸链和物质间结合或相互作用的检测方法
技术领域
本发明涉及才企测4亥酸链(4企测用4亥酸链,detecting nucleic acid )
更具体地说,本发明涉及能够检测特定物质或者物质间的结合或相 互作用的检测核酸链,并且还涉及物质之间的结合或相互作用的检 测方法。
皆景技术
检测蛋白质、有机小分子、核酸、多聚复合物(多聚配合物)、 细胞、细胞组织、金属离子、微生物、病毒等的技术在各种领域的 研究、开发等中担负非常重要的角色。如今,检测技术的开发在各 种领域,例如,诸如特定疾病的i貪断、药物开发、食品等的卫生控 制、以及环境污染的净化和恢复中正在进4亍。
在它们之中,允许在底物(基外反,substrate)的表面(界面) 等上发生物质间的相互作用或反应,并通过物理方法、光学方法等 检测它的技术,近年来尤其得到发展。这些技术已作为重要的技术, 在诸如疾病的诊断、化合物(例如药物)的筛选、法医学、遗传信息的综合分析、生物物质(biosubstance)的功能分析、蛋白质组 (proteome)分析、以及活体内相互作用的分析的领域中得到越来 越多的应用。
作为4企测技术,JP-A-08-333398公开了 一种使用特异性地识別 尿中皮质醇(一种激素)的多克隆抗体或单克隆抗体的免疫测定方 法;JP-A-2007-000009公开了 一种用于通过使用对双链核酸特异的 降解酶而简易且准确地;险测靶核酸分子的方法;JP-A-2006-133098 公开了 一种蛋白质的检测方法,该方法通过在分离介质中插入有源 电极(活性电极),通过其使蛋白质样品进行电泳,以氧化该蛋白 质的官能团,并测量所产生的电流来冲企测蛋白质的有无; JP-A-2002-296274公开了 一种用于检测宫颈涂片标本中瘤细胞及其 前体的方法,该方法通过用抗体或核酸探:4十同时染色并4企测至少两 种不同的分子标记物(该分子标记物表示基因表达中的疾病相关的 变化)而进行才佥测;以及JP-A-2006-262775 ^Hf了一种樣t生物细胞 的才企测方法,其特征在于通过使发光增感剂(luminescence sensitizer )与微生物细胞样品接触来增加待被;微生物细胞发射的荧 光强度。
这里,对与本发明有关的"适体"进4于描述。术语"适体"意 指具有允许核酸分子或肽特异性地结合于特定物质,例如蛋白质、 有机小分子、核酸、多聚复合物、细胞、细胞组织、金属离子、微 生物、病毒等的功能的核酸分子或肽。"适体"可不受限制地与任 何对象(object)结合,并允许以高亲和性(亲和力)和高特异性 结合于对象。其易于大量合成,并且其作用机制简单。因此,其可 广泛地应用于诸如结构蛋白组学、輩巴分析、靶确认(target validation )、以及药净勿开发的4页i或中。
由于上述原因,近年来正在进行各种适体的l支术开发。例如, JP-A-2006-320289 ^>开了 一种RNA适体,其特异性地结合于来自异常朊病毒蛋白质(mSAF)的原纤维(fibril),并可用于朊病毒病 的诊断、治疗或预防;以及JP-A-2007-082543公开了一种抑制大肠 杆菌释放因子的RNA适体。

发明内容
上述的物质4企测方法都具有优点和缺点。例如,它们中的每一 个都涉及一个或多个问题,因为它不适于小分子的冲企测,如果^f品 为痕量时它不能4企测,和/或它要求特殊的步骤以避免物质的失活。 因此,仍有进一步开发的空间。
因此,本发明的目的是提供一种新型的检测核酸链,其又可提 供一种至今未知的物质4企测方法。
目的而进行了广泛的研究。结果,本发明的发明人从根本上改变了 传统方法中已实践的测量揮:针或耙(目标物,target)本身的变化的 》见念,并已找到一种新方法,该方法能够通过设计制造一种不同于 适体或耙的物质,在适体与靶的结合上发生变化,并测量那种变化 来才企测革巴。
因而,在本发明的第一个方面中,提供了一种^^测核酸链,该 冲企测核酸链包括具有能够起适体作用的第一石成基序列区的第一核 酸链,以及具有第二碱基序列区的第二核酸链,该第二石咸基序列区 与第一碱基序列区互补并与第一碱基序列区形成互补链,其中,检 测核酸链i殳计成使得当预定的物质与第一石咸基序列区相互作用时, 第一碱基序列区和第二碱基序列区形成的互补链解离(离解, dissociate)为单链。对于用于4企测第一石咸基序列区和第二石咸基序列区形成的互补 链解离为单链的方法不作特别限制。然而,作为实例,可以设计为 使得检测核酸链包括探针。
在探针具有提供表明第 一碱基序列区和第二碱基序列区形成
的互补链解离为单链的^r测信号的功能的情况下,对于探针的位 置、功能等没有特别限制。例如,探针可以是保持在检测核酸链的 第二核酸链上并能够产生检测信号的物质。具体的实例可包括电介 质和荧光物质。
4罙4十也可由两种或两种以上物质构成。示例性的纟笨针可以为一 种包括标记在第二核酸链上的荧光物质,和标记在第一核酸链上并 能在第一碱基序列区和第二碱基序列区形成的互补链存在时猝灭 荧光物质的猝灭剂的探针。
在本发明的第二个方面中,还提供了一种通过至少使用上述的 才全测核酸链而用于4企测在能够起适体作用的第一》咸基序列区与预 定物质间的相互作用的方法。
在上述方法中,第一核酸链可在其一端固定于固相表面上。
对于第一石咸基序列区与预定物质之间的结合或相互作用的检 测方法没有特别限制。然而,例如,第一石成基序列区与予贞定物质之 间的结合或相互作用可以通过测量由保持在第二核酸链上的电介 质可获得的介电常数的变化并检测互补链解离为单链而检测。
第 一碱基序列区与预定物质之间的结合或相互作用还可以通 过测量冲企测核酸链的重量变化并冲企测互#卜链解离为单链而才佥测。此外,第一石咸基序列区与预定物质之间的结合或相互作用还可以通过测量来自插入剂(其结合或吸附于在^r测核酸链中第一石咸基 序列区与第二碱基序列区形成的互补链上并能够发射荧光)的荧光 强度的降低并检测互补链解离为单链而检测。现在,将对关于本发明的特定4支术术语进行描述。如本文中所 4吏用的术语"适体"意指核酸分子或肽,其具有允许该核酸分子或 肽特异性地结合于诸如蛋白质、有机小分子、核酸、多聚复合物、 细胞、细胞组织、金属离子、微生物、病毒等特定物质的功能。如本文中所^吏用的术语"揮:针"包4舌所有其每一个均可以:探测(acquire)用于4企测预定物质的4企测信号的物质。实例可以包括电 介质、具有期望重量的J朱(bead)、荧光物质、;故射性物质、插入剂 等。如本文中所使用的术语"猝灭剂"意指一种物质,其为激发能 吸4欠剂(excitation energy absorber)并具有承卩制4卩近的荧光4勿质发 射荧光的功能。如本文中所-使用的术语"插入剂"意指一种结合于双《连核酸中 的互补链部位(位点,site)以发射荧光等的物质。实例可包括「 "POPO-l"(商标名,分子4笨针(Molecular Probes ) />司的产品)、 "TOTO-3"(商标名,Invitrogen公司的产品)、"SYBRTM GREEN I" (Invitrogen 司的产品)、"PICOGREEN "(分子4笨针 (Molecular Probes )公司的产品)、以及Hoechst 33258。根据本发明的检测核酸链的应用,使得可以不考虑预定物质的 尺寸、数量、种类等而对预定物质进行简单并准确的4企测。而且, 根据本发明的检测核酸链可将预定物质的活性降低最小化,并因此不需要进行用于抑制活性降低的任何附加的步骤。此外,根据本发 明的检测核酸链可以以高精度检测物质间的结合或相互作用。化'的分析、预定物质与适体结合后的功能分析或物质的筛选,并预期其可对i者如疾病的i貪断、化合物(例如,药物)的筛选、法医学、遗 传信息的综合分析、生物物质的功能分析、蛋白质组分析、活体内 相互作用的分析、食品等的卫生控制、以及环境污染的净化与恢复 的所有领域作出贡献。


图1A和图1B为根据本发明第一方面的第一实施例的4企测核 酸链和根据本发明第二方面的第 一实施例的用该才企测核酸链来检 测物质的方法的示意图;图2A-图2C是根据本发明第一方面的第二实施例的检测核酸 链和才艮据本发明第二方面的第二实施例的用该;险测核酸链来4企测物质的方法的示意图;图3A和图3B是根据本发明第一方面的第三实施例的才企测核 酸链和才艮据本发明第二方面的第三实施例的用该才企测核酸4连来检 测物质的方法的示意图;图4A和图4B是才艮据本发明第一方面的第四实施例的4企测核 酸链和才艮据本发明第二方面的第四实施例的用该才全测核酸链来检 测物质的方法的示意图;图5A和图5B是才艮据本发明第二方面的第五实施例的用于枱r 测预定物质间相互作用的方法的示意图;图6A和图6B是根据本发明第二方面的第六实施例的用于检 测予贞定物质间沖目互4乍用的方法的示意图;以及图7A 图7C是根据本发明第二方面的第七实施例的,如用于 适体的功能分析、预定物质在其与适体结合后的功能分析或物质的具体实施方式
在下文中,将参照附图对本发明的优选实施例进行描述。然而, 应当注意,在下文中将描述的实施例仅以举例方式示出了本发明的 代表性实施例,并且本发明的范围不应狭窄地解释为下述实例。首先,将参照图1A和图1B,对根据本发明第一方面的第一实 施例的4企测核酸链Nl,以及根据本发明第二方面的第一实施例的 用检测核酸链Nl来4全测预定物质4的方法进行描述。粗略地描述,根据本发明第一方面的第一实施例的检测核酸链 Nl至少i殳置有第一4亥酸链11和第二核酸链21。第一核酸链11具有起适体作用的石咸基序列区A,作为第一石威 基序列区。在图1A和图1B中,第一核酸链11在其一端固定于固 相表面S(例如多朱等;这在下文中同样适用)上,虽然其并不限于 这样的固定形式。如随后将参照图4A和图4B所描述的,其可以是 一种自由形式(游离形式)。关于将第一核酸链ll在其一端固定于 固相表面S上,对用于其固定的方法没有特别限制,并且已知的方 法均可使用。示例性的是抗生物素蛋白-生物素结合和偶联反应(例 如,重氮偶联反应)。第二核S史链21具有与石威基序列区A互补的碱基序列区B,作 为第二碱基序列区。在图1A和图1B中,示出了与整个石威基序列区 A互补的碱基序列区,作为碱基序列区B的一个实例。然而,石咸基 序列区B并不限于这样的碱基序列区,且如图2A~图2C中所示, 碱基序列区B可与长于碱基序列区A的碱基序列区互补。此夕卜,碱 基序列区B可以与如图3A和图3B中所描述的碱基序列区A的至 少一部分互#卜。在图1A和图1B中,第二核酸链21在其相反端用探针,即电 介质31进行修饰。然而,无须预先用揭:针对第二核酸链21进行修 饰。例如,可在才全测前不久施加{务饰、标记(labeling)等。虽然优 选能够探测物理或化学检测信号的物质,但是对探针的类型没有特 别限制。除电介质31以外,可以使用所有已知的4笨针,例如具有 已知重量的珠、荧光物质、放射性物质以及插入剂。这是根据本发明第一方面的第一实施例的检测核酸链Nl,其 中以上描述的第 一核酸链11和第二核酸链21以双链形式存在。在图1A和图1B中,数字4指代特异性地结合至石威基序列区A 的预定物质。在预定物质是与碱基序列区A (其起适体作用)特异 性地结合或相互作用的物质的情况下,对可^皮4企测的预定物质4没 有特别限制。实例可包括蛋白质、有机小分子、核酸、多聚复合物、 细月包、细月包组织、金属离子、樣i生物、病毒等。在反应或相互作用的位置,准备检测核酸链Nl用于反应或相 互作用(参见图1A)。当预定物质4充满(填充,charge)那里时, 碱基序列区A和预定物质4彼此结合,以便当预定物质4与碱基序 列区A之间的结合性比预定物质4与碱基序列B之间的结合性更具 优势时,导致第二核酸链21的解离(如图1B中所示)。结合性的强度可以通过改变碱基序列区A或B的长度和/或GC含量进行调 整。由于第二核酸链21其上携带用于其修饰(modification)的电 介质31,因此当第二核酸链21解离时,固相表面上的介电常数显 著变化。因此,预定物质4可通过用表面等离子体共振传感器 (surface plasmon resonance sensor, SPR4专感器)等须'J量介电常凄t的变^:而4企测。当第二核酸链21上携带的用于其修饰的探针是具有期望重量的珠时,预定物质4还可以通过按照石英晶体孩么量天平法(QCM 法)等测量重量变化而4企测。与通常使用的探针核酸不同,将根据本发明第一方面的第一实 施例的4企测核酸链N1^殳计为,使得仅形成双链的第一核酸链11中 的碱基序列区A与预定物质4结合或相互作用,而形成双链的其他 核酸《连,即,第二核酸链21,同时解离。因此,无须在预定物质4 上进行标记等。此外,预定物质4的4企测可通过测量解离的第二核 酸链21的变化,而非测量预定物质4本身的变化来实施。从而, 即使当预定物质4是小分子或为痕量时,也可以以高灵敏度4企测预 定物质4。接下来,将参照图2A~图2C,对才艮据本发明第一方面的第二 实施例的检测核酸链N2和根据本发明第二方面的第二实施例的用 该才企测核酸链N2 4企测预定物质4A的方法进4于描述。才艮据本发明第一方面的第二实施例的检测核酸链N2是以这样 的形式,即作为第二核酸链22中的第二碱基序列区的碱基序列区D 与作为第一碱基序列区的碱基序列区互补地形成双链,碱基序列区 D长于第一核酸链12中的碱基序列区C。此外,作为示例性探针的荧光物质32标记于第二核酸链22的一端。对荧光物质32的类 型没有特别限制。然而,例如,可使用任何已知的荧光物质,例如 诸如Cy3或Cy5的焚光染料或诸如荧光素酶或GEP的荧光蛋白。与图1A和图1B中所示的第一实施例相类似,在反应或相互 作用的位置准备4企测核酸链N2用于反应或相互作用(参见图2A )。 当预定物质4A充满那里时,碱基序列区C和预定物质4A彼此结 合乂人而导致第二核酸链22的解离(如图2B所示)。预定物质4A可通过对反应或相互作用的位置进4亍洗涤,然后 确定是否经予贞定》皮长的荧光-敫发光(fluorescence excitation light)而 发射出荧光来检测。具体地描述,当存在与碱基序列区C结合或相 互作用的预定物质4A时,第二核酸链解离^f吏得如图2C中所示,第 二核酸链22通过随后的洗涤-故除去,并且即4吏当照射预定波长的 荧光激发光时也不发射荧光。当不存在与碱基序列区C结合或相互 作用的预定物质4A时,第二核酸链22不发生解离,且4企测核酸链 N2保持双链形式。由于检测核酸链N2不会经洗涤而被除去,因此 当照射预定波长的荧光激发光时发射出荧光。接下来参照图3A和图3B,在下文中将对根据本发明第一方面 的第三实施例的#企测核酸链N3和才艮据本发明第二方面的第三实施 例的用该4企测核酸链N3 4企测预定物质4B的方法进4于描述。才艮据本发明第一方面的第三实施例的4企测核酸链N3以这样的 形式,即作为第二核酸链23中的第二碱基序列区的碱基序列区F 与作为第一核酸链13中的第一碱基序列区的碱基序列区E的一部 分互补地形成双链。使用作为探针的是由荧光物质331和能够猝灭 该荧光物质331的猝灭剂332所构成的探针。它被这样设计,即荧 光物质331净皮标记至第二核酸链23的一端,而猝灭剂332 #:标记 至第 一核酸链13的 一端,使得只要形成双链即可捽灭荧光物质331 。与图1A和图IB以及图2A-图2C中所示的实施例相类似, 在反应或相互作用的位置中准备检测核酸链N3用于反应或相互作 用,其中荧光物质331处于猝灭状态(参见图3A)。当预定物质4B 充满那里时,石咸基序列区E和预定物质4B彼此结合以使第二核酸 链23解离(如图3B所示)。第一核酸链13与第二核酸链23;f皮此解离后,荧光物质331和 猝灭剂332彼此分开,使得荧光物质331即将发射荧光。因此,对 经预定波长的荧光激发光而产生的荧光放射进行测量,使得可以检 测予贞定物质4B。如第三实施例中的猝灭剂的使用可产生以下优点,即不再需要 如在图2A~图2C所示的第二实施例中所进行的洗涤步骤。以下将参照图4A和图4B,对根据本发明第一方面的第四实施 例的冲企测核酸链N4和才艮据本发明第二方面的第四实施例的用该冲企 测核酸链N4来检测预定物质4C的方法进行描述。根据第四实施例的才佥测核酸链N4不固定在任何固相表面上, 而是以自由(游离)状态存在。作为示例性的探针,使用插入剂34 并将其结合或吸附在石威基序列区G (作为第一核酸链14中的第一 石成基序列区)与石咸基序列区H (作为第二核酸链24中的第二石咸基 序列区)形成的互4卜链上。与图1A和图1B、图2A~图2C以及图3A和图3B中户斤示的 实施例相类似,在反应或相互作用的位置中准备4企测核酸《连N4用 于反应或相互作用(参见图4A)。当预定物质4C充满那里时,石咸 基序列区G与预定物质4C 4皮此结合从而导致第二核酸链24的解 离(如图4B中所示)。第一核酸链14与第二核酸链24彼此解离后,插入剂34也解 离。因此,在预定波长的荧光激发光等的照射下,测量荧光放射的 减少侦J寻可以;险测预定物质4C。图5A和图5B示出了4艮据本发明第二方面的第五实施例的用 于才企测予贞定物质4a、 4b之间的相互〗乍用的方法。在该第五实施例 中,将使用图1A和图1B中所示的冲企测核酸链N1作为检测核酸链 进行描述。然而,第五实施例并不限于使用4企测核酸链N1。例如, 也可才艮据需要,使用上述才艮据第 一至第四实施例的4企测核酸链中的 任意一种。图5A和图5B中以标号4a示出的预定物质,只要其4安原才羊存 在就不能结合至石威基序列区A。然而,当它与其他j子贞定物质4b相 互作用时,其性能改变, -使得其可结合至石咸基序列区A。在反应或相互作用的位置中,准备检测核酸链Nl与预定物质 4a用于反应或相互作用(参见图5A)。当预定物质4b充满那里时, 预定物质4a与预定物质4b之间发生相互作用。然后,如此相互作 用的预定物质4a、 4b结合至碱基序列区A从而导致第二核酸链21 的解离。由于第二核酸链21于其上携带电介质31用于其修饰,因此当 第二核酸链21解离时,固相表面上的介电常数显著改变。因此, 预定物质4a和予贞定物质4b之间的相互作用可通过例如〗吏用表面等 离子体传感器(SPR传感器)等测量介电常数的变化而检测。图6A和图6B为根据本发明第二方面的第六实施例的用于检 测预定物质4与结合抑制物质5之间的相互作用的方法的示意图。 在该第六实施例中,还将使用图1A和图1B中所示的4全测核酸链 Nl作为4企测核酸链而进4于描述。然而,第六实施例并不限于4吏用检测核酸链Nl。例如,也可根据需要使用上述根据第一至第四实 施例的检测核酸链中的任意一种。在图6A中,结合抑制物质5抑制预定物质4与碱基序列区A 之间的结合。当结合抑制物质5从预定物质4解离,或结合抑制物 质5的功能在特定作用下丧失时,预定物质4结合至碱基序列区A 乂人而导致第二核酸链21的解离。由于第二核酸链21于其上携带电介质31用于其修饰,因此当 第二核酸链21解离时,固相表面上的介电常数显著改变。因此, 结合抑制物质5从预定物质4上解离或结合抑制物质5的功能障碍 (functional failure)可以通过例4口^f吏用表面等离子体传感器(SPR 传感器)等测量介电常凄史的变化而4全测。根据第六实施例的方法可用于诸如结合抑制物质5的功能抑制 剂的筛选。当预定物质4以以下状态存在,即,通过结合抑制物质 5抑制预定物质4结合于检测核酸链Nl,尤其是石咸基序列区A (如 图6A中所示),然后供入一种未示出的能够作为用于结合抑制物质 5的功能抑制剂的物质以抑制结合抑制物质5的功能时,该预定物 质结合至石咸基序列区A。这种结合导致第二核酸链21的解离,使 得固相表面上的介电常凄t显著改变。由前述内容容易地理解,才艮据 本发明第一方面的第一实施例的检测核酸链Nl可用于结合抑制物 质5的功能抑制剂的筛选。述的功能分析等。在下文中,将参照图7A~图7C对这样的应用的 一个实例进行描述。图7A~图7C示出了才艮据本发明第二方面的第七实施例、如用 于适体功能的分析、预定物质结合于适体后的功能的分析或物质的筛选的用于4企测物质间结合或相互作用的方法。在该第七实施例中,还将4吏用图1A和图1B中所示的检测核酸链N1,作为4企测核 酸链进4于描述。然而,第七实施例并不限于4吏用一企测核酸链Nl。 例如,也可根据需要,使用上述根据第一至第四实施例的检测核酸 链中的任意一种。如上所述,在反应或相互作用的位置中准备才企测核酸链Nl用 于反应或相互作用(参见图7A)。当预定物质4c充满那里时,预 定物质4c和碱基序列区A彼此结合从而导致第二核酸链21的解离 (如图7B中所示)。此时,预定物质4c结合至石咸基序列区A (其 起适体作用)可首先通过测量介电常lt等的变化而i正实。适体设置有与各种物质结合以影响它们的作用的功能。当预定 物质4c (其通常不与,例如物质61进行任何相互作用)与适体(石咸 基序列区A)结合后能够与物质61相互作用时,该适体(碱基序 列区A)则^皮i人为具有将预定物质4c改变为可以与物质61相互作 用的物质4d的功能。虽然还不知道预定物质4c在与其适体结合后将提供什么功能, 但根据第七实施例的方法使得可以进行由预定物质4c与适体(碱 基序列区A)结合而获得的物质4d的功能分析。如果可以确定预 定物质4c在其与适体U咸基序列区A)结合后能够与物质61相互 作用(如图7C中所示),则由预定物质4c结合至适体(碱基序列 区A)而产生的物质4d^皮i人为具有如允i午其与物质61相互作用的 这样的性能。此外,上述方法原理的4吏用还使;得可以进4亍由预定物质4c与 适体(碱基序列区A)的相互作用而可获得的物质61的筛选。在上述应用中,物质61与物质4c之间相互作用的存在与否可 通过传统已知的方法而确定。由于通过物质61与物质4d之间相互 作用重量发生改变,因此该相互作用可通过石英晶体微量天平法 (QCM法)等来才企测。该相互作用也可通过将标记物质(例如荧 光物质、》文射性物质或插入剂)结合或吸附在物质61或物质4d上 的方法,或者通过如PRET原理中,物质间的相互作用可导致来自 物质61或物质4d本身的荧光的颜色等发生变化的方法而得到4企 测。本领域的技术人员应当理解,可以根据设计要求和其它因素进 行各种变更、组合、子组合以及改变,只要它们在所附权利要求或 其等同物的范围内。
权利要求
1.一种检测核酸链,包括第一核酸链,所述第一核酸链具有能够起适体作用的第一碱基序列区,以及第二核酸链,所述第二核酸链具有第二碱基序列区,所述第二碱基序列区与所述第一碱基序列区互补并与所述第一碱基序列区形成互补链,其中,所述检测核酸链这样设计,使得当预定物质与所述第一碱基序列区相互作用时,所述第一碱基序列区和第二碱基序列区形成的所述互补链解离为单链。
2. 根据权利要求1所述的检测核酸链,进一步包括可用于检测所 述第一和第二互补石威基序列区形成的所述互补链离解为所述 单链的探针。
3. 根据权利要求2所述的检测核酸链,其中,所述探针是保持在 所述第二核酸链上并可以产生4企测信号的物质。
4. 根据权利要求3所述的检测核酸链,其中,所述物质是电介质。
5. 根据权利要求3所述的检测核酸链,其中,所述物质是荧光物 质。
6. 根据权利要求2所述的检测核酸链,其中,所述探针包括荧光物质,所述荧光物质标记在所述第二核酸链上,以及猝灭剂,所述猝灭剂标记在所述第一核酸链上并能够在 所述第 一碱基序列区和第二碱基序列区形成的所述互4卜链存 在时猝灭所述荧光物质。
7. —种通过至少使用根据权利要求1所述的检测核酸链,检测能 够起适体作用的第 一碱基序列区与预定物质之间的相互作用 的方法。
8. 根据权利要求7所述的方法,其中,所述第一核酸链的一端固 定在固相表面上。
9. 根据权利要求7所述的方法,其中,通过测量可由保持在所述 第二核酸链上的电介质获得的介电常H的变化来4全测所述互 补链解离为所述单链。
10. 根据权利要求7所述的方法,其中,通过测量所述检测核酸链 的重量的变化来检测所述互补链解离为所述单链。
11. 根据权利要求7所述的方法,其中,通过测量来自结合或吸附 在所述检测核酸链中的所述第 一碱基序列区和第二碱基序列 区的所述互补链上并能够发射焚光的插入剂的焚光强度的降 低来检测所述互补链解离为所述单链。
全文摘要
本文公开了一种检测核酸链,该检测核酸链包括第一核酸链,其具有能够起适体作用的第一碱基序列区,以及第二核酸链,其具有第二碱基序列区,该第二碱基序列区与第一碱基序列区互补且与第一碱基序列区形成互补链,其中,所述检测核酸链这样设计,使得当预定物质与第一碱基序列区相互作用时,第一和第二碱基序列区形成的互补链解离为单链。本发明还公开了一种检测物质间结合或相互作用的方法。
文档编号C12Q1/68GK101307360SQ200810098110
公开日2008年11月19日 申请日期2008年5月13日 优先权日2007年5月14日
发明者上野雅嗣, 渡部祐己 申请人:索尼株式会社
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