专利名称:双温多重pcr鉴定猪早期胚胎性别的方法及试剂盒的制作方法
技术领域:
本发明涉及一种适用于猪早期胚胎性别鉴定的PCR反应技术体系,进一步讲是公 开了一种双温多重PCR鉴定猪早期胚胎性别的方法,同时还提供了相应的试剂盒,属家畜 性别控制鉴定技术领域。
背景技术:
家畜的性别控制是指通过人为干预,使雌性繁殖动物按人们的愿望繁衍所需性别 后代的技术,在畜牧业生产中具有重大意义。 目前,家畜性别鉴定方法主要有细胞遗传学方法、H-Y抗原法、性特异性DNA探针 法、PCR法、LAMP法等,主要用于牛、羊或其它经济动物的性别鉴定,经检索未见有关于猪早 期胚胎性别鉴定方法的文献报道。
发明内容
本发明一种双温多重PCR鉴定猪早期胚胎性别的试剂盒,用于猪早期胚胎的性别 鉴定。 本发明还提供了上述试剂盒的制备方法,建立一种快速、灵敏、准确率高的适用于 猪早期胚胎性别鉴定的双温多重PCR反应体系。 本发明双温多重PCR鉴定猪早期胚胎性别的试剂盒,具体构成如下 1) 1ml细胞裂解液; 2) 1ml组织裂解液; 3)550ul的2XTaq PCR MasterMix ; 4) 120ul的Primer mix,其中含有终浓度为luM的引物 Sry-1 5'-GCTTTCATTGTGTGGTCTCGT-3' Sry-2 5' -CTTGGCGACTGTGTATGTGAAG—3' 和4uM的引物 Gapdh-1 5' -GATGGCCCCTCTGGGAAACTGTG-3, Gapdh-2 5' -GGACGCCTGCTTCACCACCTTCT-3,; 5)60ul的公猪和母猪100ng/ul的基因组DNA。 本发明试剂盒的制备方法,包括以下步骤 l)样品处理 A :检测样品为猪胚胎或细胞 从待检测的猪早期胚胎中分离细胞,放入PCR管中,加入lOul细胞裂解液,置于 PCR仪中56°C 10min,94。C 5min ;12000rpm离心2min,取上清,保存于-20。C备用; 细胞裂解液1XPCR buffer,0.45% NP_40,60ug/ml的蛋白酶K组成; B :检测样品为猪早期胎儿或未知性别猪组织 取待检测样品lmmX lmm大小组织块,放入PCR管中,加入组织裂解液50ul,置于PCR仪中56。C 50min,94。C 5min ; 12000rpm离心2min,取上清保存于-20。C备用;
组织裂解液100ug/ml的蛋白酶K,20mmole/L Tris-Cl, 5mmole/L EDTA, 400mmole/L NaCl, 1%的SDS ;
2)引物设计 根据猪SRY基因序列设计一对双温PCR扩增引物
Sry-l 5' -GCTTTCATTGTGTGGTCTCGT-3'
Sry-2 5' -CTTGGCGACTGTGTATGTGAAG—3' 根据猪GAPDH基因序列设计一对双温PCR扩增引物作为内部对照
Gapdh-l 5' -GATGGCCCCTCTGGGAAACTGTG-3,
Gapdh-2 5' -GGACGCCTGCTTCACCACCTTCT-3'
3)双温多重PCR : 在20ul PCR反应体系中分别加入10ul的2XTaq PCR MasterMix、0. 05uM的 SryPrimer 1禾口 Sry Primer 2、0. 2uM的GAPDH Primer 1禾口 GAPDH Primer 2及50ng 100ng的步骤1获得的基因组DNA,补水至总体积20ul ;
反应条件如下 预变性,94°C , 5min ;变性,98°C , 10s ;退火(延伸),68°C , 90s ;扩增30个循环;最 后72"延伸5min 12"保存;
4) PCR产物检测 取7ul PCR产物,1. 2%琼脂糖凝胶电泳,120V,电泳30min,凝胶成像系统观察照 相,获得检测电泳图;
5)结果判定 根据检测电泳图中GAPDH扩增产物和SRY扩增产物的条带,检测胚胎性别。
本发明的积极效果在于充分利用了多重PCR的高效性,即在同一PCR反应管内同 时检出多个基因以及其经济简便性,即节省样本使用又提高效率,同时结合双温PCR省时、 反应特异性高的特点,建立了一种适用于猪早期胚胎性别鉴定的多重双温PCR体系。以双 温多重PCR技术体系开发的猪早期胚胎性别鉴定试剂盒,充分发挥了双温多重PCR高效、经 济简便、省时、反应特异性高的特点,实现快速鉴定猪早期胚胎从而为实现猪性别控制,提 高猪养殖业经济效益,节约养殖成本提供便利。
图1为用提取的已知性别猪组织DNA样鉴定性别的电泳图。 其中,琼脂糖凝胶浓度为1. 2% .图中编号说明如下M,Marker 2000 ;1 5均为 公猪组织DNA扩增结果,检出404和309bp带,6 10为母猪组织DNA扩增结果,检出404bp带。
具体实施例方式
通过以下实施例进一步举例描述本发明,并不以任何方式限制本发明。
实施例1
1.样品处理
A :若待检测样品为猪胚胎或细胞 从待检测的猪早期胚胎中分离4或者4个以上细胞,放入0. 2ml PCR管中,加入 10ul细胞裂解液,置于PCR仪中56°C 10min,94。C 5min ; 12000rpm离心2min,取上清,保存 于-20。C备用; B :若待检测样品为猪早期胎儿或未知性别猪组织取待检测样品lmmX lmm大小组织块,放入0. 2mlPCR管中,加入组织裂解液50ul, 置于PCR仪中56。C 50min,94。C 5min ; 12000rpm离心2min,取上清保存于-20。C备用;
2.引物设计: 根据猪SRY基因序列(Genbank登录号U49860. 2)设计一对双温PCR扩增引物。 此外,根据猪GAPDH(甘油醛-3-磷酸脱氢酶)基因序列(Genbank登录号AF017079. 1)设 计一对双温PCR扩增引物作为内部对照,以确定PCR扩增的有效性,防止假阴性结果的出 现。 设计引物序列如下
Sry-l 5' -GCTTTCATTGTGTGGTCTCGT-3'
Sry-2 5' -CTTGGCGACTGTGTATGTGAAG-3'
Gapdh-l 5' -GATGGCCCCTCTGGGAAACTGTG-3,
Gapdh-2 5' -GGACGCCTGCTTCACCACCTTCT-3'
3.双温多重PCR : 在20ul反应体系中分另U力Q入10ul的2XTaq PCR MasterMix、0. 05uM的 SryPrimer 1禾卩Sry Primer 2、0. 2uM的GAPDH Primer 1禾卩GAPDH Primer 2、50ng 100ng 的步骤1获得的基因组DNA,补水至总体积20ul。
反应条件如下 预变性,94°C , 5min ;变性,98°C , 10s ;退火(延伸),68°C , 90s ;扩增30个循环;最 后72"延伸5min 12"保存。
4. PCR产物检测 取7ulPCR产物,1. 2 %琼脂糖凝胶电泳,120V,电泳30min,凝胶成像系统观察照 相,电泳图参见附图1。
5.结果判定 检测电泳图中是否同时出现404bp的GAPDH扩增产物(见序列表SEQ ID2)和 309bp的SRY扩增产物(见序列表SEQ ID1)两条带,如果电泳图中两条带同时出现说明 待检测胚胎为雄性胚胎或待检测组织来源为雄性个体,如果只出现404bp (GAPDH扩增产物 带),说明待检测胚胎为雌性胚胎或待检测组织来源为雌性个体。
实用例 随机选取5头公猪、5头母猪,采取肝组织,按实施例所述1处理,用本发明试剂盒 检测,获得附图1 ;从图中可见,1 5公猪样品均出现404bp的GAPDH扩增产物和309bp的 SRY扩增产物条带,6 10母猪样品只出现404bp的GAPDH扩增产物条带,能够准确反映猪 的性别。 序列表
SEQ ID1TACACAGTCGCCAAG
SEQ ID2
ATCAAGAAGGTGGTGAAGCAGGCGTCC
权利要求
一种双温多重PCR鉴定猪早期胚胎性别的试剂盒,具体构成如下1)1ml细胞裂解液;2)1ml组织裂解液;3)550ul的2×Taq PCR MasterMix;4)120ul的Primer mix,其中含有终浓度为1uM的Sry-1 5′-GCTTTCATTGTGTGGTCTCGT-3′Sry-2 5′-CTTGGCGACTGTGTATGTGAAG-3′和4uM的Gapdh-1 5′-GATGGCCCCTCTGGGAAACTGTG-3′Gapdh-2 5′-GGACGCCTGCTTCACCACCTTCT-3′;5)60ul的公猪和母猪100ng/ul的基因组DNA。
2. 权利要求1所述试剂盒的制备方法,包括以下步骤1) 样品处理A :检测样品为猪胚胎或细胞从待检测的猪早期胚胎中分离细胞,放入PCR管中,加入lOul细胞裂解液,置于PCR仪中56°C 10min,94。C 5min ;12000rpm离心2min,取上清,保存于-20。C备用;细胞裂解液1XPCR buffer,0. 45% NP_40,60ug/ml的蛋白酶K组成;B :检测样品为猪早期胎儿或未知性别猪组织取待检测样品lmmX lmm大小组织块,放入PCR管中,加入组织裂解液50ul,置于PCR仪中56°C 50min,94。C 5min ;12000rpm离心2min,取上清保存于-20。C备用;组织裂解液100ug/ml的蛋白酶K,20mmole/L Tris-Cl, 5mmole/LEDTA, 400mmole/LNaCl, 1%的SDS ;2) 引物设计根据猪SRY基因序列设计一对双温PCR扩增引物Sry-l 5' -GCTTTCATTGTGTGGTCTCGT-3'Sry-2 5' -CTTGGCGACTGTGTATGTGAAG-3'根据猪GAPDH基因序列设计一对双温PCR扩增引物作为内部对照Gapdh-l 5' -GATGGCCCCTCTGGGAAACTGTG-3'Gapdh-2 5' -GGACGCCTGCTTCACCACCTTCT-3'3) 双温多重PCR :在20ul PCR反应体系中分别加入10ul的2XTaq PCR MasterMix、0. 05uM的SryPrimer 1禾口 Sry Primer 2、0. 2uM的GAPDH Primer 1禾口 GAPDHPrimer 2及50ng lOOng的步骤1获得的基因组DNA,补水至总体积20ul ;反应条件如下预变性,94t:,5min ;变性,98"C, 10s ;退火(延伸),68。C,90s ;扩增30个循环;最后72"延伸5min 12"保存;4) PCR产物检测取7ul PCR产物,1. 2%琼脂糖凝胶电泳,120V,电泳30min,凝胶成像系统观察照相,获得检测电泳图;5)结果判定根据检测电泳图中GAPDH扩增产物和SRY扩增产物的条带,检测胚胎性别。
全文摘要
本发明一种双温多重PCR鉴定猪早期胚胎性别的方法及试剂盒,建立一种快速、灵敏、准确率高的适用于猪早期胚胎性别鉴定的双温多重PCR反应体系,用于猪早期胚胎的性别鉴定。以双温多重PCR技术体系开发的猪早期胚胎性别鉴定试剂盒,充分发挥了双温多重PCR高效、经济简便、省时、反应特异性高的特点,实现快速鉴定猪早期胚胎从而为实现猪性别控制,提高猪养殖业经济效益,节约养殖成本提供便利。
文档编号C12Q1/68GK101724696SQ20091021777
公开日2010年6月9日 申请日期2009年10月28日 优先权日2009年10月28日
发明者于浩, 李小平, 李莉, 欧阳红生, 王铁东, 赖良学, 逄大欣, 闫森, 高飞 申请人:吉林大学