Hla-a*24组的判定方法
【专利摘要】本发明提供一种歧义少且简便地判定HLA-A*24组的分型的方法。本发明的HLA-A*24组的判定方法，其特征在于，以受试者的基因组DNA中的HLA基因的起始密码子的A(腺嘌呤)作为第1位，基于(a)第211位碱基和(b)第395位碱基的分型结果进行判定。另外，在前述HLA-A*24组的判定方法中，其特征在于，还基于选自由(c)第437位碱基、第441位碱基、第443位碱基、第444位碱基、第447位碱基和第449位碱基所组成的组中的一个以上碱基的分型结果进行判定。
【专利说明】HLA-A*24组的判定方法
【技术领域】
[0001]本发明涉及一种判定HLA型是否是HLA_A*24组的方法。
[0002]本申请基于2011年12月28日在日本提出的“特愿2011-289336号”申请主张优先权，特将其内容援引于此。
【背景技术】
[0003]HLA (Human Leukocyte Antigen,人类白细胞抗原)是在位于第六染色体短臂部的MHC(Major Histocompatibility Complex:主要组织相容性复合体)区域所编码的基因簇的基因产物。HLA具有非常丰富的多样性，特别是在造血干细胞的移植、输血等临床实践操作中，提高HLA的拟合优度很重要。因此，在临床实践中要求以尽量少的劳力进行准确的HLA分型。
[0004]HLA分型的方法，大致可分为血清学分型方法和DNA分型方法。与血清学分型方法相比，DNA分型方法能够更详细地确定HLA型。但是，即使在DNA分型方法中，也存在两种以上根据DNA分型的结果无法辨别的等位基因，有时会发生无法准确地确定HLA型的所谓歧义(Ambiguity)的问题。
[0005]例如，在专利文献I中公开了在基因水平上对HLA-A抗原的亚类(亚型)进行分型的方法。具体而言，将HLA-A等位基因(allele)分类成特定的组，使用可特异性地扩增各组的HLA-A等位基因的引物进行PCR反应，对所得到的PCR产物实施RFLP法、PCR-RFLP法、SSOP法、PCR-SSOP法、PCR-SSP法或者PCR-SSCP法的操作，由此将HLA-A型进行分型。通过像该方法那样进行多阶段的测定(assay)，虽然能够期待消除歧义、对HLA-A型详细进行分型，但是存在耗费大量劳力的问题。
[0006]另外，HLA型的分布是根据人种而存在差异。根据日本特定非营利活动法人HLA研究所的报告，在对日本人的5538个家族的21705人进行分型的结果(当时是2011年12月19日)中，如表1所示，日本人的HLA-A型的基因频率是HLA-A*24:02型为最高的35.936%(例如，参照非专利文献I)。
[0007]表1
[0008]
【权利要求】
1.一种HLA-A*24组的判定方法，其特征在于， 以受试者的基因组DNA中的HLA基因的起始密码子的A腺嘌呤作为第I位，基于(a)第211位碱基和(b)第395位碱基的分型结果进行判定。
2.如权利要求1所述的HLA-A*24组的判定方法，其特征在于， 还基于选自由(c)第437位碱基、第441位碱基、第443位碱基、第444位碱基、第447位碱基和第449位碱基所组成的组中的一个以上碱基的分型结果进行判定。
3.如权利要求2所述的HLA-A*24组的判定方法，其特征在于， 对所述受试者的HLA型是否是HLA-A*24:02进行判定。
4.如权利要求3所述的HLA-A*24组的判定方法，其特征在于， 在至少一个等位基因中，当第211位碱基是C胞嘧啶、第395位碱基是G鸟嘌呤、第437位碱基是C、第441位碱基是T胸腺嘧啶、第443位碱基是G、第444位碱基是C、第447位碱基是T、第449位碱基是C时，判定所述受试者的HLA型是HLA_A*24:02。
5.如权利要求 1~4中任一项所述的HLA-A*24组的判定方法，其特征在于， 采用序列分析方法或者单碱基检测方法进行所述(a)和(b)的碱基的分型。
6.如权利要求2~5中任一项所述的HLA-A*24组的判定方法，其特征在于， 采用序列分析方法或者单碱基检测方法进行所述(C)的碱基的分型。
7.如权利要求2~5中任一项所述的HLA-A*24组的判定方法，其特征在于， 当通过使用由序列号7表示的碱基序列构成的引物的聚合酶进行的延伸反应获得了延伸产物时，将所述(c)的碱基分型为第437位碱基是C、第441位碱基是T、第443位碱基是G、第444位喊基是C、第447位喊基是T、第449位喊基是C。
8.—种HLA-A*24:02判定用试剂盒，其特征在于，包含由序列号7表示的碱基序列构成的HLA-A*24:02的判定用引物。
【文档编号】C12Q1/68GK104024410SQ201280064968
【公开日】2014年9月3日 申请日期:2012年12月28日 优先权日:2011年12月28日
【发明者】牧野洋一, 山根明男, 东友彦, 中山雅人 申请人:凸版印刷株式会社