肺孢子菌lamp特异性检测试剂盒的制作方法
【专利摘要】本实用新型公开了一种肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒。检测试剂盒包括甜菜碱试剂瓶、dNTPs试剂瓶、缓冲液试剂瓶、氯化镁试剂瓶、引物试剂瓶、聚合酶试剂瓶、超纯水试剂瓶、荧光指示剂、荧光显色液、阳性对照品、阴性对照品、试剂盒壳体和试剂瓶固定块。甜菜碱试剂瓶、dNTPs试剂瓶、缓冲液试剂瓶、氯化镁试剂瓶、引物试剂瓶、聚合酶试剂瓶、超纯水试剂瓶、荧光指示剂、荧光显色液、阳性对照品、阴性对照品固定在试剂瓶固定块上,试剂瓶固定块固定于试剂盒壳体内。本实用新型是一种特异性强、敏感性高、快速、廉价并且操作简单的肺孢子菌检测试剂盒,为检测肺孢子菌肺炎提供技术保证,有望成为临床检测肺孢子菌肺炎的主要方式。
【专利说明】肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒 【技术领域】
[〇〇〇1] 本实用新型涉及生物应用领域,特别涉及一种肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒, 适用于肺孢子菌肺炎临床检测。 【背景技术】
[0002] 肺孢子菌肺炎(Pneumocystis pneumonm,PCP)是一种严重的致死性肺炎。不仅 常见于艾滋病及其他各类先天或后天免疫机能受损者,而且与慢性阻塞性肺病、肺囊性纤 维变以及间质性肺炎等危害严重的呼吸系统疾病的发生密切相关。随着艾滋病蔓延、免疫 抑制剂的广泛应用、慢性阻塞性肺病等呼吸系统疾病的日趋增多,PCP在临床上逐步成为 "常见病",已经引起医学界广泛重视。PCP -旦发生,病情进展迅速,不经治疗几乎100% 死亡。而早期及时的治疗,治愈率可达80%。因此,早期诊断和治疗对患者的预后极为重 要。由于PCP的临床表现和体征不具特异性,必须依赖实验室的病原学检查进行诊断。然 而,因孢子菌寄生部位的特殊性,使其病原学检测方法受到取材及阳性率低等方面的限制, 缺乏临床适用性。聚合酶链反应(PCR)等基因检测技术被认为是诊断肺孢子菌感染的最有 希望的方法之一。但是,经典的及一些改良的PCR方法因其对设备要求高,操作过程复杂 等缺点,难以在临床诊断中广泛推广应用。环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification, LAMP)技术,是近年来开发的一种新的核酸扩增方法,其原理是针对祀基因 的6个区域设计3对特异性引物,在一种特殊的链置换DNA聚合酶(BstDNA polymerase)的 作用下发生DNA链的置换和环化,恒温水浴(65°C左右)30-60分钟即可完成109-1010拷 贝的扩增。其最低敏感检测极限是10个拷贝,比PCR高几个数量级。而且,LAMP技术不像 PCR和实时定量PCR那样需要昂贵的仪器,只需要普通水浴箱即可。因此,与其他检测方法 相比,LAMP方法有扩增快速、结果易于观察、设备简单、敏感性和特异性高等优点,适于基层 临床应用。目前,LAMP技术正在被广泛应用于某些疾病的流行病学调查以及某些热带病的 检测、诊断中。在日本被卫生组织认可并开发利用LAMP的检测试剂盒有八种:检测SARS冠 状病毒,结核分枝杆菌,肺炎支原体,军团菌,A型流感病毒,Hl,H5流感病毒,人类乳头状瘤 病毒等。但是,目前尚缺乏LAMP技术检测肺孢子菌感染的可靠技术和可供临床应用的检测 试剂盒。
【发明内容】
[0003] 本实用新型是克服现有技术不足,提供一种特异性强、敏感性高、快速、廉价并且 操作简单的肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒,为检测肺孢子菌肺炎提供了技术保证,也有 望成为临床检测肺孢子菌肺炎的主要方式。
[0004] 一种用于肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒,其特征在于:包括甜菜碱试剂瓶、 dNTPs试剂瓶、缓冲液试剂瓶、氯化镁试剂瓶、引物试剂瓶、聚合酶试剂瓶、超纯水试剂瓶、荧 光指示剂、荧光显色液、阳性对照品、阴性对照品、试剂盒壳体和试剂瓶固定块,甜菜碱试剂 瓶、dNTPs试剂瓶、缓冲液试剂瓶、氯化镁试剂瓶、引物试剂瓶、聚合酶试剂瓶、超纯水试剂 瓶、荧光指示剂、荧光显色液、阳性对照品、阴性对照品固定在试剂瓶固定块上,试剂瓶固定 块固定于试剂盒壳体内。
[0005] 所述的试剂盒壳体形状为长方体或其他形状,所使用的材料为纸板或其他材料, 其打开方式为绕转轴打开,或其它打开形式,其闭合后固定方式为搭扣形式,或其它固定形 式。
[〇〇〇6] 所述的试剂瓶固定块所能固定试剂瓶数量等于或者大于1,形状为长方体,或是其 它形状,所使用的材料为海绵,或使用其它材料,固定试剂瓶的方式为依靠摩擦力固定,或 其它固定方式。
[0007] 肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒的使用方法包括如下使用步骤:
[0008] 1)配置反应体系。从试剂盒中取出甜菜碱试剂瓶、dNTPs试剂瓶、缓冲液试剂瓶、 氯化镁试剂瓶、引物试剂瓶、聚合酶试剂瓶、超纯水试剂瓶,将溶液加入反应容器内,在反应 容器内加入荧光指示剂、荧光显色液,将被检测模板加入反应容器;
[0009] 2) LAMP扩增反应。将反应容器置于一定温度环境内反应一段时间;
[〇〇1〇] 3)结果检测。使用仪器检测反应扩增曲线(步骤1中使用荧光指示剂),或观察容 器内颜色变化(步骤1中使用荧光显色液)判断检测结果;
[0011] 4)阳性对照品、阴性对照品使用时,替代步骤1中的被检测模板。
[0012] 本实用新型通过比较人源肺孢子菌(P. jirovecii)和大鼠源肺孢子菌 (P. carinii、P. wakefieldiae)的核酸序列,选取核糖体小亚基一段保守序列,根据此序列设 计特异性引物:
[0013] F35,-ATCAGATACCGTCGTAGTCTTA-3,
[0014] B35, -GCTCTCAATCTGTCAATCCTTA-3,
[0015] FIP5, -TTCAGCCTTGCGACCATACTCCTCGCTCGGCATCTTATG-3,
[0016] BIP5, -AAGGGCACCACCAGGAGTTATGTCTGGACCTGGTGAG-3,
[0017] LoopF 5,-GGAACCCGAAGACTTTGATTTC-3,
[0018] LoopB 5,-TGCGGCTTAATTTGACTCAAC-3
[0019] 本实用新型根据上述的引物组开发肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒。
[0020] 本实用新型的试剂盒还包括SYBR GREEN I荧光指示剂和显色液的应用。上述试剂 盒在检测肺孢子菌中的应用所使用的反应体系如下:
[0021]
【权利要求】
1. 一种肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒,包括装有特异性引物 F35' -ATCAGATACCGTCGTAGTCTTA-3' B35' -GCTCTCAATCTGTCAATCCTTA-3' FIP5'-TTCAGCCTTGCGACCATACTCCTCGCTCGGCATCTTATG-3' BIP 5' -AAGGGCACCACCAGGAGTTATGTCTGGACCTGGTGAG-3' LoopF5 '-GGAACCCGAAGACTTTGATTTC-3 ' LoopB5,-TGCGGCTTAATTTGACTCAAC-3, 的引物试剂瓶(5),其特征在于还包括甜菜碱试剂瓶(1)、dNTPs试剂瓶(2)、缓冲液试 剂瓶(3)、氯化镁试剂瓶(4)、聚合酶试剂瓶(6)、超纯水试剂瓶(7)、荧光指示剂(8)、荧光 显色液(9)、阳性对照品(10)、阴性对照品(11)、试剂盒壳体(12)和试剂瓶固定块(13),其 中:甜菜碱试剂瓶(1 )、dNTPs试剂瓶(2)、缓冲液试剂瓶(3)、氯化镁试剂瓶(4)、引物试剂 瓶(5)、聚合酶试剂瓶(6)、超纯水试剂瓶(7)、荧光指示剂(8)、荧光显色液(9)、阳性对照品 (10 )、阴性对照品(11)固定在试剂瓶固定块(13 )上,试剂瓶固定块(13 )固定于试剂盒壳体 (12)内。
2. 根据权利要求1所述的肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒,其特征在于,所述的试剂 盒壳体(12)形状为长方体,所使用的材料为纸板,其打开方式为绕转轴打开,其闭合后固定 方式为搭扣形式。
3. 根据权利要求1所述的肺孢子菌LAMP特异性检测试剂盒,其特征在于所述的试剂 瓶固定块(13)能固定试剂瓶数量等于或者大于1,形状为长方体,所使用的材料为海绵材 料,固定试剂瓶的方式为依靠摩擦力固定。
【文档编号】C12Q1/04GK203833934SQ201320561332
【公开日】2014年9月17日 申请日期:2013年9月10日 优先权日:2013年9月10日
【发明者】张楠, 安春丽, 王晓黎, 秦铮, 国九英, 马素丽, 樊华, 赵亚滨 申请人:中国医科大学