疾病标志物及其用途的制作方法

专利名称：疾病标志物及其用途的制作方法
技术领域：
本发明涉及miRNA标志物和干扰素(IFN) α /I型IFN-诱导性药效学(PD)标志物 以及采用其的方法。
背景技术：
本发明涵盖miRNA标志物和IFN α /I型IFN-诱导性PD标志物。本发明还涵盖在 例如治疗患者和预测或监测疾病的方法中采用这些标志物的方法。发明_既述本发明的一个实施方式涵盖治疗患有I型IFN或IFNa介导的疾病或疾患的患者 的方法。将结合并调控I型IFN或IFN α活性的药剂施用给患者。该患者包含差异调节的 miRNA标志物谱。所述药剂中和差异调节的miRNA标志物谱。本发明的另一实施方式是在需要其的患者中中和差异调节的miRNA标志物谱的 方法。将结合并调控I型IFN或IFN α活性的药剂施用给患者。该药剂中和所述患者的差 异调节的miRNA标志物谱。本发明的另一个实施方式是监测或预测患者的自身免疫疾病或炎性疾病进展的 方法。在来自患者的第一样品中获得第一差异调节的miRNA标志物谱。本发明的又一实施方式是监测接受治疗剂治疗的患者的自身免疫疾病或炎性疾 病进展的方法。获得来自患者的第一样品中的第一 miRNA谱。施用治疗剂。获得来自患者 的第二样品中的第二 miRNA谱。比较所述第一 miRNA谱和所述第二 miRNA谱。所述第一 miRNA谱与所述第二 miRNA谱之间的变化表明治疗剂的效力水平。本发明的另一个实施方式是治疗肌炎患者的方法。将结合并调控I型IFN或IFN a 活性的药剂施用给患者。所述药剂中和患者的I型IFN或IFNa -诱导性PD标志物表达谱。本发明的另一个实施方式涵盖监测或预测患者的肌炎疾病进展的方法。获得来自 患者的第一样品中的第一 IFNa-诱导性PD标志物表达谱。本发明的又一实施方式是监测接受治疗剂治疗的患者的肌炎疾病进展的方法。获 得来自患者的第一样品中的第一 IFN a -诱导性PD标志物表达谱。将治疗剂施用给患者。从 来自患者的第二样品中获得第二 IFN a -诱导性PD标志物表达谱。比较所述第一 IFN a -诱 导性PD标志物表达谱和所述第二 IFN a -诱导性PD标志物表达谱。附图简述图Ia和Ib 在DM和PM患者的肌肉样本中上调最明显的基因的大多数是IFN-a / β诱导性的。(a)显示在DM患者肌肉样本中上调的基因的表；(b)在DM和PM患者肌肉中 的IFN-α/β诱导性基因标记(signature)评分。图2a和2b 在DM和PM患者中的IFN- α/β诱导性基因标记评分随着患者疾病 状态的改善而降低。(a)提供DM活性患者(DMA)、DM改善患者(DMI)、PM活性患者(PMA) 和PM改善患者(PMI)的IFN-α/β诱导性基因标记评分。(b)显示在DM患者中随着他们 的活性疾病变得改善，IFN-α/β诱导性基因标记评分降低。图3a_3c 如对于(a)-(c)三名患者所显示的，DM患者全血样品中的IFN-α / β诱
14导性基因标记评分与临床改善相关，但是其他细胞因子(TNFa、ILl β、IL4、ILlO和IL13) 的基因标记评分与临床改菩不相关。图4:DM患者的IFN-α/β诱导性基因标记评分预示了临床改善以及复发。图5a_5d =PM患者中的IFN-α / β诱导性基因标记评分的改变与血清CK水平相 关。(a)显示 PM 患者的 IFN- α / β -、TNF α -、ILl β -、IL4_、IL10-、IL13-诱导性基因标记 评分；(b)提供患者的血清CK活性，其符合IFN- α / β诱导性基因标记的曲线；(c)提供各 种细胞因子基因标记评分与血清CK水平之间的相关性；(d)是PM患者的IFN- α / β _诱导 性基因标记评分与健康供体(黑色圆)相比较的PCA图。图6 =DM患者中的IFN- α/β诱导性基因标记评分改变与血清CK水平相关。(a)显 示医师的四次随访内的患者的血清CK活性；(b)显示在相同的四次随访中患者的IFN-a/ β -、TNF α -、ILl β -、IL4-、IL10-、IL13-诱导性基因标记评分；(c)提供各种细胞因子基 因标记评分和血清CK水平之间的相关性。如通过患者的全血中的前25种诱导性基因的 中和所监测的，I型IFN基因标记(显示在(b)中)示踪了临床活性。随访1，治疗前；随 访2，利妥昔单抗和类固醇治疗之后(小的改善)；随访3，患者保持稳定；随访4，患者崩溃 (crashed)(血清CK水平骤增)。图7a和7b 图6中所讨论的DM患者的IFN- α/β诱导性基因标记示踪了疾病进 展/消退。(a)热图，它显示在患者进展/消退时在IFN-α/β诱导性标记中的基因的中和 及去中和；(b)示踪DM患者的IFN-α/β诱导性基因标记评分与健康供体(黑色圆)相比 较的PCA图。图8 显示IBM患者的肌肉样本展示了 IFN-α / β诱导性基因标记过表达的散点 图。散点图是使用下列两种方法由14名患IBM的患者得到的肌肉样本的IFN-α /β基因 标记评分的散点图25种基因的动态列表和21种基因的静态列表。每个点表示一名患者。图9a和9b :IBM患者血清样品显示出不同的IFN-α / β基因标记过表达。(a)使 用下列两种方法由9名IBM患者得到的全血的IFN-α / β基因标记评分25种基因的动态 列表和21种基因的静态列表；(b)使用25种基因的动态列表由9名IBM患者的全血获得 的IFN-α/β基因标记评分的散点图。每个点表示一名患者。图IOa和IOb Jol阴性DM患者比Jol阳性DM患者具有更高的IFN- α/β基因标 记评分。(a)DM Jol阳性和DM Jol阴性患者中19种IFN- α / β诱导性基因的过表达；(b) 使用19种基因得到的来自3名Jol阳性和7名Jol阴性的DM患者的肌肉的IFN- α / β基 因标记评分散点图。每个点表示一名患者。

图11-104 注释IL4标记中的基因的探针列表。图105-158 注释ILlO标记中的基因的探针列表。图159-234 注释IL13标记中的基因的探针列表。图235-381 注释807种IFNa诱导性基因的探针列表。图382-383 独特的检测物id、miRNA id、和序列的列表。图384a和384b 在DM和PM患者中过表达最明显的那些基因之中的1型IFN诱 导性基因的普遍性可用于鉴定1型IFN诱导性基因标记评分阳性患者。(a)热图，它表示 24名正常健康供体、20名PM患者和22名DM患者以及136种探针组，该探针组被鉴定为是 1型IFN诱导性的并且将42名DM和PM患者与24名正常健康供体相比较时显著过表达(q值< 0. 05并且改变倍数> 2)。第一个黑色的水平线表示正常健康供体；第二个标记为低 的水平线表示具有弱的1型IFN诱导性基因标记评分(改变倍数< 4)的患者；第三个标记 为中等的水平线表示具有中等1型IFN诱导性基因标记评分(4彡改变倍数< 10)的患者 并且第四个标记为高的水平线表示具有高1型IFN诱导性基因标记评分(即，标记评分阳 性)的患者。(b)在(a)中被分级为正常健康供体、弱标记评分、中等标记评分和高标记评 分的相同受治疗者的1型IFN诱导性基因标记评分的散点图。IFN =干扰素；DM =皮肌炎； PM=多肌炎。图385a-385c 患者特异性的纵向1型IFN诱导性转录物测量具有作为生物标志 物来测量DM和PM疾病活性的效用。(a)使用在随访1时的21名患者和36名正常健康供 体的13种基因复合评分和IFI27、IFI44、IFI44L和RSAD2的单个转录物测量所得的单个基 因复合评分和改变倍数值。通过相对较低或中等的临床测量疾病活性(MITAXS6)和高疾 病活性(MITAX > 6)将患者分组。在多重检验调整后，4种基因的任一种或13种基因复合 评分在正常健康供体和MITAX ( 6的患者之间没有显著的差异。对于所有的基因和基因复 合评分，在正常健康供体与MITAX > 6的患者相比，以及MITAX彡6的患者与MITAX > 6的 患者相比时具有显著差异(参见表8)。(b)MITAX测量的疾病活性具有一些变化的18名患 者的患者特异性分析以及(c)研究中MITAX没有改变的3名患者。提供了 18名患者的每 一个在他们的具有研究过程中的最低至最高MITAX值的随访时的基因复合评分、改变倍数 值以及原始P值。具有MITAX变化的患者显示在调整后除EFI44外的所有基因/基因复合 评分具有高度显著的一致的基因表达改变；没有MITAX变化的患者显示基本没有基因表达 改变，尽管样品大小太小而无法得到统计显著性。所有的基因复合评分和改变倍数值均相 对于36名正常健康供体的中值计算。图386a和386b :DM和PM患者表现出外周血的MITAX评分与1型IFN 13种基因复 合评分之间的相关性。(a)具有至少4次总随访的6名患者(BGE15、BGE99、BGE10、BGE106、 BGE119和BGE147)的MITAX评分与13种基因复合评分之间的比较。黑色实线和最右侧的y 轴表示MITAX评分，而黑色虚线和最左侧的y轴表示13种基因复合评分。BGE15和BGE147 的图示中的‘H’标号表示预告(herald)随访。(b)对于患者BEG92看到了在13种基因复 合评分与CK水平之间的另一种相关性。最左侧的图中黑色虚线和最右侧的y轴表示此患 者的CK水平。DM =皮肌炎；PM =多肌炎；CK =肌酸激酶。图387a和387b :WB中1型IFN诱导性基因表达的强升高预告在几个患DM或PM 的患者中的疾病复发。出现了其中相信疾病是临床上稳定的或在改善，但是在6-35天后 患者发展了临床复发的三次随访。在“预告”复发会马上出现的这3次随访的每一次中，显 著的IFN诱导性基因表达增加。(a) 13种基因复合评分的表达改变的列表。列显示了患 者样品；预告(V-预告)随访与复发(V-复发)随访之间的天数；V-预告与V-复发之间的 MITAX评分改变；从前一次随访到V-预告的基因表达增加倍数。(b) 13种基因复合评分的 代表图。每个中间随访(#3)是预告随访；MITAX评分是与之前一次随访(#2)相比稳定的 或改善的，但是13种基因复合评分则显著增加，可能预告了复发，这由下一次随访(M)的 MITAX评分增加证实。IFN =干扰素；DM =皮肌炎；PM =多肌炎。图388a-388c 其他细胞因子诱导性标记评分在中等的和严重的患DM和PM患者 之间没有不同并且与疾病活性不相关。(a)随访1时的21名患者和36名正常健康供体的TNF-α、IL-I β、IL-10、IL-13和GM-CSF的细胞因子诱导性基因标记。通过相对较低或中 等的临床测量疾病活性(MITAX ( 6)和高疾病活性(MITAX > 6)将患者分组。在多重检验 调整之后，对于所有的5种细胞因子诱导性基因标记，正常健康供体与MITAX ( 6的患者 之间存在显著的差异。对于所有的5种细胞因子诱导性基因标记，正常健康供体与MITAX >6的患者之间也存在显著的差异。然而对于5种细胞因子诱导性基因标记的任一种，在 MITAX ^ 6的患者与MITAX > 6的患者之间不存在显著的差异(参见表8)。(b) MITAX测量 的疾病活性具有一些变化的18名患者的患者特异性分析以及(c)研究中MITAX活性没有 改变的3名患者。提供了 18名患者的每一个在他们的具有研究过程中的最低至最高MITAX 值的随访时的细胞因子诱导性基因标记和原始P值。对于任何细胞因子诱导性基因标记， MITAX变化的患者均未显示出显著的一致的基因表达改变；没有MITAX变化的患者基本也 不显示基因表达改变，尽管样品大小太小而无法计算出统计显著性。所有的细胞因子诱导 性基因标记均相对于36名正常健康供体的中值计算。DM =皮肌炎；PM =多肌炎。图389 24名DM或PM患者在具有最高(上排(panel))和最低(下排)MITAX评 分的随访时的不同细胞因子诱导性基因标记的比较。各行表示不同的细胞因子诱导性基因 标记的过表达。框中显示的3名患者是1型IFN诱导性基因标记评分阴性的。每位患者的 升高的细胞因子诱导基因标记水平由近红色的颜色表示，而近蓝色的颜色表示低的细胞因 子诱导基因标记值。IFN =干扰素；DM =皮肌炎；PM =多肌炎。详细说明本发明涵盖鉴定、诊断、治疗和监测患者的疾病进展的方法。患者包括具有I型 IFN或IFN α诱导性疾病、疾患或病症的任何动物；或具有炎性或自身免疫疾病、疾患或病 症的任何动物。患者可以由于实验研究而患疾病、疾患或病症，例如，其可以是开发的用于 疾病、疾患或病症的实验模型。可选择地，患者可以在不存在实验操作的情况下患有疾病、 疾患或病症。患者包括人、小鼠、大鼠、马、猪、猫、狗和用于研究的任何动物。I型IFN或IFN α诱导性疾病、疾患或病症是表现出I型IFN或IFN α PD标志物表 达谱或基因标记的任何疾病、疾患或病症。PD标志物表达谱和基因标记应被理解为是等同 的。这些疾病、疾患或病症包括具有自身免疫组分的那些，如系统性红斑狼疮、胰岛素依赖 性糖尿病、炎性肠病(包括克罗恩病、溃疡性结肠炎、和乳糜泻(Celiac's disease))、多发 性硬化、银屑病、自身免疫性甲状腺炎、类风湿性关节炎、肾小球肾炎、如包涵体肌炎或皮肌 炎或多肌炎或非特异性肌炎的特发性炎性肌炎、或坏死性肌病、舍格伦综合征(Sjogren’ s syndrome)、血管炎和结节病。其他疾病、疾患或病症包括移植物抗宿主疾病和移植排斥。如果患者是肌炎患者，则患者可以患有包涵体肌炎或皮肌炎或多肌炎。肌炎 患者可以具有高的或低的肌炎意向治疗级别(MITAX)评分。本领域的技术人员将能 够容易地确定肌炎患者的MITAX评分。参见，例如Walsh RJ, Pinkus几，等人Type I interferon-inducible gene expression in blood is present and reflects disease activity in dermatomyositis and polymyositis.(在血液中存在 I 型干扰素诱导性 基因表达并且其反应了皮肌炎与多肌炎的疾病活性)Arthritis Rheum. 2007 ；56 (11) 3784-92，其通过引用并入。高MITAX评分可以为约大于6。低MITAX评分可以为约小于或 等于6。肌炎患者可以可选地或另外具有中等或强的I型IFN-或IFNa诱导性基因标记 评分。如果被分配的评分约小于4，则1型IFN-或IFNα诱导性基因标记评分可能是弱的，如果被分配的评分为4左右或约大于4但小于10则是中等的，并且如果被分配的评分 为约10或大于10则是高的。本领域的那些技术人员将容易理解并能够确定I型IFN或 IFNa诱导性基因标记评分。参见，例如Yao，Y，Jallal J，等人Development of Potential Pharmacodynamic and Diagnostic Markers for Anti-IFN- α Monoclonal Antibody Trials in Systemic Lupus Erythematosus.(用于系统性红斑狼疮的抗IFNα单克隆抗 体试验的潜在的药效学和诊断标志物的开发)Human Genomics and Proteomics. 2008 ；第 2009 卷，文献 ID 374312，doi 10. 4061/2009/374312，通过引用并入。自身免疫疾病、疾患或病症可以是其中在没有外来物质要抵抗时免疫系统触发免 疫应答并且机体的正常保护性免疫系统通过错误地袭击自身而损害其自身组织的任何疾 病、疾患或病症。这些疾病、疾患或病症包括多发性硬化、克罗恩病、类风湿性关节炎、斑秃 (alopecia greata)、强直性脊柱炎、抗磷脂综合征、自身免疫性阿狄森氏病、肾上腺的自身 免疫疾病、变应性脑脊髓炎、自身免疫性溶血性贫血、自身免疫性肝炎、自身免疫性炎性眼 病、自身免疫性新生儿血小板减少症、自身免疫性嗜中性白细胞减少症、自身免疫性卵巢炎 和睾丸炎、自身免疫性血小板减少症、自身免疫性甲状腺炎、贝切特氏病、大疱性类天疱疮、 心肌病、心切开术综合征(cardiotomy syndrome)、口炎性腹泻-皮炎、慢性活动性肝炎、慢 性疲劳性免疫功能障碍综合征(CFIDS)、慢性炎性脱髓鞘性多神经病、丘-施二氏综合征、 疤痕性类天疱疮、CREST综合征、冷凝集素疾病、克罗恩病、致密物沉积病(dense deposit disease)、盘状狼疮、特发性混合性冷球蛋白血症、纤维肌痛-纤维肌炎、肾小球肾炎(例 如，IgA肾病(η印hrophathy))、谷蛋白敏感性肠病、古德帕斯彻综合症(Goodpasture' s syndrome)、格雷夫斯氏病、格林_巴利病、甲状腺功能亢进症(即，桥本氏甲状腺炎)、特 发性肺纤维化、特发性阿狄森氏病、特发性血小板减少性紫癜(ITP)、IgA神经病、幼年型 关节炎、扁平苔藓(lichen planus)、红斑狼疮(lupus erthematosus)、梅尼埃病、混合性 结缔组织病、多发性硬化、重症肌无力、心肌炎、1型或免疫介导的糖尿病、重症肌无力、心 肌炎、神经炎、其他内分泌腺衰竭、寻常型天疱疮、恶性贫血、结节性多动脉炎、多软骨炎 (polychrondritis)、多种内分泌腺病、多腺性综合征、风湿性多肌痛、多肌炎和皮肌炎、心 肌梗死后(post-MI)、原发性无丙种球蛋白血症、原发性胆汁性肝硬化、银屑病、银屑病关 节炎、雷诺氏现象(Raynauld' s phenomenon)、复发性多软骨炎、莱特尔氏综合征、风湿性 心脏病、类风湿性关节炎、结节病、硬皮病、舍格伦综合征、僵人综合征、系统性红斑狼疮、 红斑狼疮、大动脉炎、颞动脉炎/巨细胞动脉炎、溃疡性结肠炎、荨麻疹、葡萄膜炎、葡萄膜 眼炎(Uveitis Opthalmia)、血管炎如疱疹样皮炎性血管炎(dermatitis herpetiformis vasculitis)、白癜风和韦格纳氏肉芽肿病。炎性疾患、疾病或病况可以包括哮喘、变应性疾患、特征为2型介导的炎症的炎 性疾患、肺纤维化、慢性阻塞性肺病(COPD)、脑炎(encephalitis)、炎性肠病、感染性休克、 未分化脊椎关节病、未分化关节病、关节炎、炎性骨质溶解以及由慢性病毒或细菌感染所导 致的慢性炎症。患者可以包含差异调节的miRNA谱。差异调节的miRNA谱可以是其中患者的组 织样品相对于患者的对照组织样品或相对于健康对照个体表现出一种或多种miRNA的表 达增加的miRNA谱。差异调节的miRNA谱可以是其中患者的组织样品相对于患者的对照 样品或相对于健康对照个体表现出一种或多种miRNA的表达降低的miRNA谱。差异调节的miRNA谱可以是其中患者的组织样品相对于对照样品表现出一种或多种miRNA的表达增 加和相对于对照样品表现出一种或多种miRNA表达降低二者的miRNA谱。表现出表达增 加的miRNA的数目可以是1 ；至少1、2 ；至少2、3 ；至少3、4 ；至少4 ；4 ；至少5 ；至少6 ；至少 7 ；至少8 ；至少9 ；至少10 ；至少15 ；至少20 ；至少25 ；至少30或至少50。表现出表达降 低的miRNA的数目可以是1 ；至少1、2 ；至少2、3 ；至少3、4 ；至少4 ；4 ；至少5 ；至少6 ；至少 7 ；至少8 ；至少9 ；至少10 ；至少15 ；至少20 ；至少25 ；至少30或至少50。表达的差异增加 或降低可以是对照样品的大约10% -500%、对照样品的大约10% -400%、对照样品的大约 10% -300%、对照样品的大约10% -250%、对照样品的大约10% -200%、对照样品的大约 10% -150%、对照样品的大约10% -100%、对照样品的大约10% -50%、对照样品的大约 100 % -500 %、对照样品的大约200 % -500 %、对照样品的大约300 % -500 %、对照样品的大 约400 % -500 %、对照样品的大约50 % -100 %、对照样品的大约100 % -200 %、对照样品的 大约100% -400%、对照样品的大约200% -400%、对照样品的大约10% -50%、对照样品 的大约20% -100%、对照样品的大约25% -75%或对照样品的大约50% -100%。它可以 是对照样品的 10%,20%,25%,30%,40%,50%,75% ,100% ,125% ,150% ,175%,200%, 250%,300%,400%^； 500% ο差异表达的任何1种；至少1、2种；至少2、3种；至少3、4种；至少4种；4种；至 少5种；至少6种；至少7种；至少8种；至少9种；至少10种；至少15种；至少20种；至 少25种；至少30或至少50种miRNA可以包括表2_5或图382-383中所讨论的任何miRNA。 miRNA 可以通过检测物 hsa-miR-34b-4373037 或 hsa-miR-1-4373161 检测。结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂的施用可以是小分子或生物药剂的施 用。如果治疗剂是小分子，则它可以是合成的或由天然来源鉴定和分离的。如果治疗剂是生物药剂，则它可以是对I型IFN或IFN α的任何亚型特异性的抗 体。例如，抗体可以是对下列的任一种特异性的JFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 6、 IFNa 7、IFNa 8、IFNa 10、IFNa 14、IFNa 17、IFNa 21、IFN^ 或 IFNco。可选择地，抗体 可以是对任两种、任三种、任四种、任五种、任六种、任七种、任八种、任九种、任十种、任i^一 种、任十二种I型IFN或IFNa亚型特异性的。如果抗体是对大于一种的I型IFN亚型特 异性的，贝U抗体可以是对 IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8、IFNa 10 禾Π IFNa 21 特 异性的；或它可以是对IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8和IFNa 10特异性的；或 它可以是对IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8禾口 IFNa 21特异性的；或它可以是对 IFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 10 禾口 IFNa 21 特异性的。对 I 型 IFN 或 IFNa 特异 性的抗体包括MEDI-545、除MEDI-545之外的任何生物剂或抗体、2004年12月10日提交的 美国专利申请11/009，410和2005年6月20日提交的11/157,494中所描述的抗体、在美 国专利第7，087，726号中描述的9F3和其他抗体(实施例1和实施例2，在表3和表4中公 开的那些和/或在名为“材料保藏”(D印osit of Material)的表的第56列，第25_54行中 所公开的那些)、NK-2 和 Y0K5/19 (W0 84/03105)、L0-22 (美国专利 4，902, 618)、144BS (美 国专利4，885，166)以及ΕΒΙ-1、ΕΒΙ-2和EBI-3(EP 119476)。调控IFNa活性的治疗剂可 以中和IFNa活性。本领域的技术人员清楚地知道这种生物药剂的制备和配制以及它们施 用的方法。抗体可以是合成抗体、单克隆抗体、多克隆抗体、重组制备的抗体、细胞内抗体、多特异性抗体(包括双特异性抗体)、人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、单链FV(SCFV)(包括双 特异性scFv)、BiTE分子、单链抗体、Fab片段、F(ab，)片段、二硫键连接的Fv(SdFv)或上 述任何一种的表位结合片段。抗体可以是免疫球蛋白分子或免疫球蛋白分子的免疫活性部 分中的任何一种。此外，抗体可以为任何同种型。例如，它可以是同种型IgGl、IgG2、IgG3 或IgG4的任何一种。抗体可以是包含可变区与恒定区的全长抗体、或其抗原结合片段，如 单链抗体、或Fab或Fab’2片段。抗体还可以轭合或连接至治疗剂上，如细胞毒素或放射性 同位素。可以将除结合以调控IFNa活性的药剂之外的第二药剂施用给患者。第二药剂 包括但不限于非类固醇类抗炎药物，如布洛芬、萘普生、舒林酸、双氯芬酸、吡罗昔康、酮洛 芬、二氟尼柳、萘丁美酮、依托度酸和奥沙普秦、吲哚美辛；抗疟疾药物，如羟氯喹；皮质类 固醇激素，如泼尼松、氢化可的松、甲泼尼龙和地塞米松；甲氨蝶呤；免疫抑制剂，如硫唑嘌 呤和环磷酰胺；以及生物药剂，例如，靶向T细胞的生物药剂，如阿法赛特(Alefac印t)和依 法利珠单抗(Efalizumab)，或靶向TNFa的生物药剂，如恩利(Enbrel)、类克(Remicade) 和修美乐(Humira)。药剂的治疗可以导致差异调节的miRNA谱的中和。药剂的治疗可以导致I型IFN 或IFNa介导的疾病或疾患的一种或多种症状的减轻。药剂的治疗可以导致I型IFN或 IFNa介导的疾病或疾患突发较少。药剂的治疗可以导致患有I型IFN或IFNa介导的疾 病或疾患的患者的预测改善。药剂的治疗可以导致患者较高的生活品质。药剂的治疗可以 减轻共施用第二药剂的需要或可以减少施用给患者的第二药剂的剂量。药剂的治疗可以降 低关于I型IFN或IFNa介导的疾病或疾患的患者住院次数。结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂可以中和差异调节的miRNA谱。差异 调节的miRNA谱的中和可以是至少一种、至少两种、至少三种、至少五种、至少七种、至少 八种、至少十种、至少十二种、至少十五种、至少二十种、至少二十五种、至少三十种、至少 三十五种、至少四十种、至少四十五种或至少五十种上调的miRNA的降低。上调的miRNA可 以包括表2或表4中所检测的或所包括的那些或如图表382-383中所显示的那些中的任何 一种。差异调节的miRNA谱的中和可以是在任何差异调节的miRNA谱中上调的至少一种、 至少两种、至少三种、至少五种、至少七种、至少八种、至少十种、至少十二种、至少十五种、 至少二十种、至少二十五种、至少三十种、至少三十五种、至少四十种、至少四十五种或至少 五十种基因中的任何基因的至少2%、至少3%、至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至 少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至 少60 %、至少70 %、至少75 %、至少80 %或至少90 %的降低。可选择地，差异调节的miRNA 谱的中和是指上调的miRNA表达的如下降低在对照样品中的那些miRNA的表达水平的最 多50%、最多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多 10%、最多5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多之内。如果结合并调控I型IFN或 IFNa活性的药剂是生物药剂如抗体则该药剂可以在下列剂量中和I型IFN或IFNa谱 0. 3 至 30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、l 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、 5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。差异调节的miRNA谱的中和可以是至少一种、至少两种、至少三种、至少五种、至 少七种、至少八种、至少十种、至少十二种、至少十五种、至少二十种、至少二十五种、至少三十种、至少三十五种、至少四十种、至少四十五种或至少五十种的miRNA的下调的表达的 增加。下调的miRNA可以包括表3或5中所检测的或所包括的那些或如图表382-383中 所显示的那些的任何一种。差异调节的miRNA谱中下调的基因的中和是在任何miRNA谱 中表达下调的至少一种、至少两种、至少三种、至少五种、至少七种、至少八种、至少十种、至 少十二种、至少十五种、至少二十种、至少二十五种miRNA中的任何miRNA的至少2%、至少 3%、至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至 少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、或 至少90%、或至少100%、或至少125%、或至少130%、或至少140%、或至少150%、或至 少175%、或至少200%、或至少250%、或至少300%、或至少500%的增加。可选择地，差 异调节的miRNA谱的中和是指miRNA的表达增加至在对照样品中那些miRNA表达水平的最 多50%、最多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多 10%、最多5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多之内。如果结合并调控I型IFN或 IFNa活性的药剂是生物药剂如抗体，则该药剂可以在下列剂量中和差异调节的miRNA谱 0. 3 至 30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、l 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、 5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。患者还可以包含I型IFN或IFN α诱导性PD标志物表达谱。I型IFN或IFN α诱 导性PD标志物表达谱可以是强的谱、中等的谱或弱的谱。可以如下而容易地将I型IFN或 IFNa诱导性PD标志物表达谱指定为强的、中等的或弱的测定患者的I型IFN或IFNa 诱导性PD标志物表达谱相对于对照样品或对照患者的失调倍数(例如，患者中上调的I型 IFN或IFNa诱导性PD标志物表达的增加倍数)，并比较患者的失调倍数与具有I型IFN 或IFN α诱导性PD标志物表达谱的其他患者的失调倍数。I型IFN或IFN α诱导性PD标 志物表达谱可以是2007年12月6日提交的PCT/US2007/024947中所公开的任一种，通过 引用将其并入本文。患者的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱中可以包括的基因的组可以是 MX1、LY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RASD2 和 IFI44。通过探针 所检测的基因可以包括IFI44、IFI27、IFI44L、DNAPTP6、LAMP3、LY6E、RSAD2、HERC5、IFI6、 ISG15、0AS3、SIGLEC1、0AS2、USP18、RTP4、IFITl、MXl、OASl、EPSTI1、PLSCRl 和 IFRG28。在 这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或 多种基因。基因可以包括LAMP3、DNAPTP6、FLJ31033、HERC6、SERPING1、EPSTl 1、RTP4、OASL, FBX06、IFIT2、IFI44、0AS3、BATF2、ISG15、IRF7、RSAD2、IFI35、OASU LAP3、IFITUIFIT5、 PLSCRl、IFI44L、MS4A4A、GALM、UBE2L6、T0R1B、SAMD9L、HERC5、TDRD7、TREXl、PARP12 和 AXUDl中的任何至少2种、任何至少3种、任何至少4种、任何至少5种、任何至少6种、任 何至少7种、任何至少8种、任何至少9种、任何至少10种、或任何至少11种、或任何至少 12种、或任何至少13种、或任何至少14种、或任何至少15种、或任何至少16种、或任何至 少17种、或任何至少18种、或任何至少19、或任何至少20种、或任何至少21种、或任何至 少22种、或任何至少23种、或任何至少24、或任何至少25种、或任何至少26种、或任何至 少27种、或任何至少28种、或任何至少29种、或任何至少30种。在这种表达谱中的IFN a 诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。
表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI27、SIGLEC1、 RSAD2、IFI6、IFI44L、IFI44、USP18、IFIT2、SAMD9L、BIRC4BP、DNAPTP6、0AS3、LY6E、IFITl、 LIPA、L0C129607、ISG15、PARP14, MX1、0AS2、OASL, CCL2、HERC5、OASl。在这种表达谱中的 IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFIT1、IFIT3、IRF7、 IFI6、IL6ST、IRF2、LY6E、MARCKS, MXl、MX2、OASl、EIF2AK2、ISG15、STAT2、0AS3、IFI44、 IFI44L、HERC5、RAB8B、LILRA5、RSAD2 和 FCH02。在这种表达谱中的 IFNa 诱导性 PD 标志 物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因SERPING1、IFIT2、 IFIT3、IFI6、LY6E、MXl、OASl、ISG15、IFI27、0AS3、IFI44、LAMP3、DNAPTP6、ETV7、HERC5、 0AS2、USP18、XAFl、RTP4、SIGLEC1和EPSTI1。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物 还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因SERPING1、IFIT2、 IFIT3、IFI6、LY6E、MXl、OASl、ISG15、IFI27、0AS3、IFI44、LAMP3、DNAPTP6、ETV7、HERC5、 0AS2、USP18、XAFU RTP4、SIGLEC1、EPSTIl 和 RSAD2。在这种表达谱中的 IFNa 诱导性 PD 标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因BCL2、BAK1、BAD、BAX 和BCL2L1。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列 的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因RTP4、RSAD2、HERC5、 SIGLEC1、USP18、LY6E、ETV7、SERPING1、IFIT3、0AS1、HSXIAPAF1、G1P3、MXU 0AS3、IFI27、 DNAPTP6、LAMP3、EPSTI1、IFI44、0AS2、IFIT2 和 ISG15。在这禾中表达谱中的 IFNa 诱导性 PD 标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因LAMP3、SIGLEC1、 DNAPTP6、IFIT2、ETV7、RTP4、SERPING1、HERC5、XAF1、MX1、EPSTI1、0AS2、0AS1、0AS3、IFIT3、 IFI6、USP18、RSAD2、IFI44、LY6E、ISG15 和 IFI27。在这种表达谱中的 IFNa 诱导性 PD 标 志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因DNAPTP6、EPSTIU HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFITU IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MXU OASU 0AS2、 0AS3、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SIGLEC1和USP18。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物 还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因SAMD9L、IFI6、IFI44、 IFIT2、ZC3HAV1、ETV6、DAPPl、IL1RN、CEACAMU OASU IFI27、0AS3、IFI44L、HERC5、IFITl、 EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL, GBPl和MXl。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物 还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MXl、IFITl、ISG15、LAMP3、0AS3、OASl、EPSTI1、IFIT3、0AS2、SIGLEC1 和 USP18。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至 少一种或多种基因。
表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MX1、IFITl、HERC5、ISG15、LAMP3、0AS3、OASl、EPSTIl、IFIT3、0AS2、LY6E、 SIGLEC1和USP18。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381 中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MX1和IFIT1。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图 表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因SAMD9L、IFI6、IFI44、 IFIT2、0AS1、IFI27、0AS3、IFI44L、HERC5、IFITl、EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL、GBPl 和 MXl0在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少 一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI27、RSAD2、 IFI44L、IFI44、0AS1、IFITl、ISG15、0AS3、HERC5、MXl、ESPTI1、IFIT3 和 IFI6。在这种表达 谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI44L、RSAD2、IFI27 和IFI44。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的 至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少基因IFI44L和RSAD2。在这种 表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少基因IFI44L。在这种表达谱中 的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少基因RSAD2。在这种表达谱中的 IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。包含差异调节的miRNA谱的患者还可以包含下调的I型IFN或IFNa PD标志物。 下调的PD标志物可以包括基因CYPlBl、TGSTl、RRAGD、IRS2、MGST1、TGFBR3和RGS2的任何 一种、任何两种、任何三种、任何四种、任何五种、任何六种或任何七种。包含差异调节的miRNA谱的患者还可以包含任何数目的IFN α或I型IFN亚型的 表达上调。IFNa或I型IFN亚型可以包括任何大于一种、大于两种、大于三种、大于四种、 大于五种、大于六种、大于七种、大于八种、大于九种或大于十种的IFNa或I型IFN亚型。 这些亚型可以包括IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 6、IFNa 7、IFNa 8、IFNa 10、 IFNa 14、IFNa 17、IFNa 21、IFN3 或 IFNco。患者可以包含 IFN亚型 IFNa l、IFNa 2、IFNa 8 和IFNa 14的表达上调。包含差异调节的miRNA谱的患者还可以包含为IFNARl或IFNAR2或二者的IFN a 受体、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNY 受体(IFNGR1、IFNGR2 或 IFNGRl 和 IFNGR2 二者)的表 达上调。患者可以被简单地鉴定为包含为IFNARl或IFNAR2或二者的IFNa受体、或TNFa 或IFN γ、或IFNy受体(IFNGR1、IFNGR2或IFNGRl和IFNGR2 二者)的表达上调的患者。患者的表达谱中的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的上调或下调可以是与来 自对照的样品(可以是来自患者的非疾病组织(例如银屑病患者的未损害的皮肤)或来自未受疾病或疾患折磨的健康人的样品)相比的任何程度。上调或下调程度可以是对照或对 照样品的至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至 少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、 或至少200 %、或至少300 %、或至少400 %、或至少500 %。此外，患者可以过表达下列程度的I型IFN亚型或具有过表达下列程度的I型IFN 亚型的组织对照的至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少 50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少 150%,或至少200%、或至少300%、或至少400%、或至少500%。I型IFN亚型可以是下列 的任何一种 JFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 6、IFN a 7、IFN a 8、IFN a 10、IFN a 14、 IFNa 17、IFNa 21、IFN^ 或 IFNco。I 型 IFN 亚型可以包括 IFNa 1、IFNa 2、IFNa 8 禾口 IFNa 14的全部。患者还可以包含或可选择地包含血清中蛋白水平的改变。患者可以具有血清水 平增加的蛋白，如脂连蛋白、甲胎蛋白、载脂蛋白CIII、β-2微球蛋白、癌抗原125、癌抗 原19-9、嗜酸细胞活化趋化因子、FABP、因子VII、铁蛋白、IL-10、IL_12p70、IL-16、IL-18、 IL-lra、IL-3、MCP-1、MMP-3、肌红蛋白、SG0T、组织因子、TIMP-1、TNF RII、TNF_a、VCAM-1 或vWF。患者在血清中可以具有血清水平增加的任何1种、2种、3种、4种、5种、6种、7种、8 种、9 种、10 种、11 种、12 种、1314 种、15 种、16 种、17 种、18 种、19 种、20 种、21 种、o22 种、23 种、24种、25种或26种的这些蛋白。增加的水平可以是对照如健康受治疗者的至少10%、 至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至 少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、或至少200%、或至少 300%、或至少400%、或至少500%。变化可以是诸如以下的蛋白的血清水平降低BDNK、 补体3、CD40配体、EGF、ENA-78、EN-RAGE, IGF-I、MDC、髓过氧化物酶、RANTES或血小板生 成素。患者可以具有血清水平降低的任何1种、2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、 10或11种的这些蛋白。降低的水平可以为对照如健康受治疗者的至少10 %、至少15 %、至 少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少 80%、至少90%或至少100%。PD标志物谱可以包含这些血清水平增加或降低的蛋白的一 种或多种。患者还可以包含结合下列自身抗原的任何一种的自身抗体(a)抗黏液病毒 (流感病毒)1，干扰素诱导蛋白p78;(b)SUrfeit 5，转录物变体c;(c)蛋白酶体(前体 (posome)，巨蛋白因子(macropain))激活物亚基3 (PA28 γ ；Ki) transc ； (d)视黄酸受 体α ； (e) IOkDa热休克蛋白1(伴侣蛋白10) ；f)原肌球蛋白3;(g)普列克底物蛋白同 源性样结构域(pleckstrin homology-like domain)，家族A，成员1 ； (h)细胞骨架相关 蛋白1 ;(i)舍格伦综合征抗原A2(60kDa，核糖核蛋白自身抗原SS-A/Ro) ； (j)NADH脱氢 酶(泛醌)1，α/β亚复合体(subcomplexU，8kDa;(k)NudE核分布基因E同系物1(构 巢曲霉(A.nidulans))；⑴MutL同系物1，2型非息肉性结肠癌(大肠杆菌(E. coli))； (m)富亮氨酸重复(FLII中)相互作用蛋白2 ； (η)原肌球蛋白1 (α ) ； (0)痉挛性截瘫20， spartin (Troyer 综合征)；(ρ)植入前蛋白(preimplantation protein),转录物变体 1 ； (r)线粒体核糖体蛋白L45 ;(s)Lin-28同系物(秀丽隐杆线虫(C. elegans)) ； (t)90kDa热 休克蛋白1，α ； (u)dom-3同系物Z (秀丽隐杆线虫)；(ν)动力蛋白，胞质的，轻中间体多肽2 (light intermediate polypeptide 2) ； (w) Ras W C31 (rhoMM,
小GTP结合蛋白)；(χ)滑膜肉瘤，X断点2，转录物变体2 ； (y)膜突蛋白；(z)homer同系物 (果蝇(Drosophila))转录物变体1 ； (aa)GCN5广泛控制的氨基酸合成5样(GCN5general control of amino-acid synthesis 5_like)2(酵母)；(bb)真核翻译延伸因子 1 Y ； (cc) 真核翻译延伸因子IS ； (dd)DNA损伤诱导转录物3 ;(ee)CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP) Y ；以及在下列临时申请中所描述的任何其他自身抗原2007年5月3日提交的名称为 "Auto-antibody markers of autoimmune disease (自白勺自”白勺 临时申请或在2007年11月6日提交的名称为‘‘Auto-antibody markers of autoimmune disease (自身免疫疾病的自身抗体标志物)”(例如但不限于在表2、4、5和9中所描述的 那些)。患者可以包含结合任何数目的这些自身抗原的自身抗体，例如任何至少2种、至少 3种、至少4种、至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9至少10种、至少11种、至 少12种、至少13种、至少14种、至少15种、至少20种、至少25种。结合并调控I型IFN或IFN α活性的药剂的施用还可以在下列范围内中和I型IFN 或IFN α诱导谱对照样品的至少2 %、至少3 %、至少4 %、至少5 %、至少7 %、至少8 %、至 少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少 60%、至少70%、至少75%、至少80%、或至少90%。在监测或预测患者的疾病进展的方法中，可以在药剂施用之前和之后从患者获得样品。样品包括任何生物流体或组织，如全血、血清、肌肉、唾液、尿、滑液、骨髓、脑脊液、 鼻分泌物、痰、羊水、支气管肺泡灌洗液、外周血单核细胞、总白细胞、淋巴结细胞、脾细胞、 扁桃体细胞或皮肤。样品可以通过本领域内的任何已知方法获得。获得样品中的miRNA谱(药剂施用之前和之后)。比较样品中的miRNA谱。比较 可以是样品中存在的miRNA数目的比较或者可以是样品中存在的miRNA数量的比较，或它 们的任何组合。如果在治疗剂施用之后所获得的样品中上调的miRNA的数目或水平(或它 们的任何组合)相对于治疗剂施用之前所获得的样品降低，则可以指示表明治疗剂效力的 变化。上调的miRNA的数目可以降低至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、 至少8、至少9、或至少10。任何给定的上调的miRNA水平可以降低至少10%、至少20%、 至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至 少90%或至少95%。水平降低的上调的miRNA的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少 4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少 35。上调的miRNA的数目降低和水平降低的任何组合可以表明效力。如果在治疗剂施用之 后所获得的样品中下调的miRNA的数目或水平(或它们的任何组合)相对于治疗剂施用之 前所获得的样品降低，则可以指示表明治疗剂效力的变化。下调的miRNA的数目可以降低 至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、或至少10。任何给定 的下调的miRNA水平可以增加至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少 40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %。水平增加的下调 的miRNA的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、 至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。下调的miRNA的数目降低和水平增 加的任何组合可以表明效力。
可以在第一次施用药剂之前(即患者对药剂是幼稚的)从患者获得样品。可选择 地，从患者获得样品可以在治疗过程中施用药剂之后进行。例如，可在监测步骤开始之前已 经施用药剂。在施用药剂之后可以从患者获得另外的样品并比较样品中的I型IFN或IFNa 诱导性PD标志物。样品可以为相同类型或不同类型的，例如，获得的各样品可以为血样，或 获得的各样品可以为血清样品。各样品中所检测的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物可 以是相同的、可以基本上重叠或可以相似。样品可以在施用治疗剂之前和之后的任何时间获得。在施用治疗剂之后获得的样 品可以在施用治疗剂之后至少2天、至少3天、至少4天、至少5天、至少6天、至少7天、至 少8天、至少9天、至少10天、至少12天或至少14天获得。在施用治疗剂之后获得的样品 可以在施用治疗剂之后至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、至少7周或至 少8周获得。在施用治疗剂之后获得的样品可以在施用治疗剂之后至少2个月、至少3个 月、至少4个月、至少5个月或至少6个月获得。可以在施用治疗剂之后从患者获得另外的样品。可以从患者获得至少2份、至少3 份、至少4份、至少5份、至少6份、至少7份、至少8份、至少9份、至少10份、至少12份、至 少15份、至少20份、至少25份样品以监测疾病或疾患随时间的进展或消退。可以在以下 的时间段内监测疾病进展至少1周、至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、 至少7周、至少2个月、至少3个月、至少4个月、至少5个月、至少6个月、至少1年、至少 2年、至少3年、至少4年、至少5年、至少10年或患者的终生。另外的样品可以定期从患 者获得，如每月一次、每两月一次、每季度一次、每年两次或每年一次的间隔。可以在施用药 剂之后定期从患者获得样品。例如，可以在下列时间从患者获得样品每次施用药剂之后一 周、每次施用药剂之后两周、或每次施用药剂之后三周或每次施用药剂之后一个月、或每次 施用药剂之后两个月。可选择地，可以在每次施用药剂之后从患者获得多份样品。可以类似地在不存在药剂施用时监测患者的疾病进展。可以定期从患有疾病或 疾患的患者获得样品。如果较晚获得的样品中的miRNA数目相对于较早获得的样品中的 miRNA数目增加，则可以确定疾病进展。miRNA的数目可以增加至少1、至少2、至少3、至少 4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、或至少10。如果任何给定的上调的miRNA的水平 增加了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少50%、至少 60%、至少70%、至少80%、至少90%或至少95%，则可以确定疾病进展。如果任何给定 的下调的miRNA的水平降低了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少 40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，则可以确定疾病 进展。水平增加的上调的miRNA的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、 至少7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。水平降低的 下调的miRNA的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至 少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。上调的miRNA的数目增加和水 平增加的任何组合可以表明疾病进展。可选择地，或与之组合，下调类型的miRNA的数目降 低和水平降低的组合可以表明疾病进展。还可以在患有疾病或病患而未用药剂治疗的患者 中鉴定疾病消退。在这种情况下，如果较晚获得的样品中的miRNA数目相对于较早获得的 样品的miRNA数目降低，则可以鉴定疾病消退。miRNA的数目可以降低至少1、至少2、至少 3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、或至少10。如果任何给定的上调的miRNA的水平降低了至少10 %、至少20 %、至少25 %、至少30 %、至少35 %、至少40 %、至少50 %、 至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，则可以鉴定疾病消退。如果任何给 定的下调的miRNA的水平增加了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至 少40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，则可以确定疾 病消退。水平降低的上调的miRNA的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至 少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。水平增 加的下调的miRNA的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少 8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。可以通过在任何时间段以 任何间隔获得样品来监测疾病进展或疾病消退。可以通过在以下的时程内获得样品来监测 疾病进展或疾病消退至少1周、至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、至少 7周、至少2月、至少3月、至少4月、至少5月、至少6月、至少1年、至少2年、至少3年、至 少4年、至少5年、至少10年或患者的终生。可以通过至少每月一次、每两月一次、每季度 一次、每年两次或每年一次获得样品来监测疾病进展或疾病消退。不需要以严格的间隔获 得样品。样品中的变化可以指导疾病或疾患的治疗策略。治疗策略可以是具体治疗剂的给 药或可以是移除或添加施用给患者的特定治疗剂。本发明还涵盖采用IFN α诱导性PD标志物来治疗、诊断、预测和监测肌炎的方法。 这些IFNa诱导性PD标志物还可以用于指导肌炎患者或肌炎疾病模型的给药和治疗。I型IFN或IFN α诱导性PD标志物表达谱可以包含相对于对照(如健康人、患者 或患者的非疾病组织的样品)的任何I型IFN或IFN α诱导性PD标志物表达谱基因或基 因的组的上调或下调。所述基因或基因的组可以包括任何至少2种、任何至少3种、任何至 少4种、任何至少5种、任何至少6种、任何至少7种、任何至少8种、任何至少9种、任何至 少10种、任何至少11种、任何至少12种、任何至少13种、任何至少14种、任何至少15种、 任何至少16种、任何至少17种、任何至少18种、任何至少19种、任何至少20种、任何至少 21种、任何至少22种、任何至少23种、任何至少24种、任何至少25种、任何至少26种、任 何至少27种、任何至少28种、任何至少29种、任何至少30种、任何至少40种、任何至少50 种基因、任何至少75种基因、任何至少100种基因或任何至少150种基因。表达谱中的IFN α诱导性PD标志物可以包括至少下列基因EPSTI 1、HERC5、 IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFITU IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MXU OASU 0AS2、0AS3、 RSAD2、RTP4、SIGLEC1、USP18。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图 表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI27、SIGLEC1、 RSAD2、IFI6、IFI44L、IFI44、USP18、IFIT2、SAMD9L、BIRC4BP、DNAPTP6、0AS3、LY6E、IFITl、 LIPA、L0C129607、ISG15、PARP14, MX1、0AS2、OASL, CCL2、HERC5、OASl。在这种表达谱中的 IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFIT1、IFIT3、IRF7、 IFI6、IL6ST、IRF2、LY6E、MARCKS, MXl、MX2、OASl、EIF2AK2、ISG15、STAT2、0AS3、IFI44、 IFI44L、HERC5、RAB8B、LILRA5、RSAD2 和 FCH02。在这种表达谱中的 IFNa 诱导性 PD 标志 物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。
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表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因SERPING1、IFIT2、 IFIT3、IFI6、LY6E、MXl、OASl、ISG15、IFI27、0AS3、IFI44、LAMP3、DNAPTP6、ETV7、HERC5、 0AS2、USP18、XAFl、RTP4、SIGLEC1和EPSTI1。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物 还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因SERPING1、IFIT2、 IFIT3、IFI6、LY6E、MXl、OASl、ISG15、IFI27、0AS3、IFI44、LAMP3、DNAPTP6、ETV7、HERC5、 0AS2、USP18、XAFU RTP4、SIGLEC1、EPSTIl 和 RSAD2。在这种表达谱中的 IFNa 诱导性 PD 标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因RTP4、RSAD2、HERC5、 SIGLEC1、USP18、LY6E、ETV7、SERPING1、IFIT3、0AS1、HSXIAPAF1、G1P3、MXU 0AS3、IFI27、 DNAPTP6、LAMP3、EPSTI1、IFI44、0AS2、IFIT2 禾Π ISG15。在这种表达谱中的 IFNa 诱导性 PD 标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因LAMP3、SIGLEC1、 DNAPTP6、IFIT2、ETV7、RTP4、SERPING1、HERC5、XAF1、MX1、EPSTI1、0AS2、0AS1、0AS3、IFIT3、 IFI6、USP18、RSAD2、IFI44、LY6E、ISG15 和 IFI27。在这种表达谱中的 IFNa 诱导性 PD 标 志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因DNAPTP6、EPSTIU HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFITU IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MXU OASU 0AS2、 0AS3、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SIGLEC1和USP18。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物 还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因SAMD9L、IFI6、IFI44、 IFIT2、ZC3HAV1、ETV6、DAPPl、IL1RN、CEACAMU OASU IFI27、0AS3、IFI44L、HERC5、IFITl、 EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL, GBPl和MXl。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物 还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MXl、IFITl、ISG15、LAMP3、0AS3、OASl、EPSTI1、IFIT3、0AS2、SIGLEC1 和 USP18。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至 少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MX1、IFITl、HERC5、ISG15、LAMP3、0AS3、OASl、EPSTIl、IFIT3、0AS2、LY6E、 SIGLEC1和USP18。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381 中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L、IFI27、MX1和IFIT1。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图 表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI6、RSAD2、IFI44、 IFI44L和IFI27。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381 中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因SAMD9L、IFI6、IFI44、IFIT2、0AS1、IFI27、0AS3、IFI44L、HERC5、IFITl、EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL、GBPl 和 MXl0在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少 一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI27、RSAD2、 IFI44L、IFI44、0AS1、IFITl、ISG15、0AS3、HERC5、MXl、ESPTI1、IFIT3 和 IFI6。在这种表达 谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI44L、RSAD2、IFI27 和IFI44。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的 至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少基因IFI44L和RSAD2。在这种 表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少基因IFI44L。在这种表达谱中 的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少基因RSAD2。在这种表达谱中的 IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包括至少下列基因IFI27、IL-121Rβ 2、 IL-15Ra、IL-15、细胞因子信号传导阻抑物 1 (SOCSl)、janus 激酶 2、CXCLll (T-TAC), TNFSF13B (BAFF)、TRAF 型结构域 1 (TRAFDl)、SERPING1、CD274 (PDl-L)、吲哚胺 2，3 双加氧 酶(INDO)、淋巴细胞激活基因3 (LAG3)和胱天蛋白酶5。在这种表达谱中的IFNa诱导性 PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。IFNα诱导性PD标志物或PD标志物谱可以包含如下的任何至少5种基因，例如 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFI6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASl、IFI44L ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、ISG15 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、LAMP3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OAS 1、OASL ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、RSAD2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 0ASUIFI44 ;或MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、0AS3 ；或 MXl、 LLY6E、IFI27、OASU USP18 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 0ASUHERC5 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、DNAPTP6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、L0C129607 ； 或 MX1、LLY6E、IFI27、OASl、EPSTIl ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、BIRC4BP ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、OASU SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、通过探针 229450_at 检测的基因；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、通过探针 235276_at 检测的基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI44L ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU ISG15 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、LAMP3 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、OASL ；或 LLY6E、IFI27、 OASU IFITU RSAD2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI44 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFIT2 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、USP18 ；或 LLY6E、 IFI27、0AS1、IFITl、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、HERC5 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITU DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、 EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、BIRC4BP ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、0ASl、IFITl、通过探针229450_at 检测的基因；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15 ；或 IFI27、 OASl、IFITl、IFI6、LAMP3 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、0ASL ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 RSAD2 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFIT2 ；或 IFI27、 0AS1、IFIT1、IFI6、0AS3 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、USP18 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 SIGLEC1 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、HERC5 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、DNAPTP6 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、L0C129607 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、EPSTI1 ；或 IFI27、0AS1、 IFIT1、IFI6、BIRC4BP ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、SIGLEC1 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 通过探针229450_at检测的基因；或IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、通过探针235276_at检测的 基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、LAMP3 ；或 0AS1、 IFITU IFI6、IFI44L、OASL ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、RSAD2 ；或 0AS1、IFITU IFI6、 IFI44L、IFI44 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、IFIT2 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、0AS3 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、USP18 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、SIGLEC1 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、HERC5 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、DNAPTP6 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 L0C129607 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L, EPSTIl ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、BIRC4BP ； 或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、SIGLEC1 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、通过探针 229450_ at检测的基因；或0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、通过探针235276_at检测的基因；或IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、0ASL ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、RSAD2 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、IFI44 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、IFIT2 或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、0AS3 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、USP18 ；或 IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、SIGLEC1 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、HERC5 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、DNAPTP6 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、L0C129607 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 EPSTIl ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、BIRC4BP ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通过探 针229450_at检测的基因；或IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通过探针235276_at检测的基 因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、DNAPTP6 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、EPSTIl ；或 IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、BIRC4BP ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通过探针 229450_at 检测 的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、SIGLEC1；或IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、USP18；或 IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、0AS3 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFIT2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFI44 ； 或IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、RSAD2；或IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL；或IFI44L、 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、IFI44 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, IFIT2 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, 0AS3 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, USP18 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、SIGLEC1 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、HERC5 ；或 IFI44L、 ISG15、LAMP3、0ASL、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、L0C129607 ；或 IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, EPSTIl ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, BIRC4BP ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通过探针 235276_at 检测的基因；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFIT2 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、0AS3 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、USP18 ；或 ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、SIGLEC1 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、HERC5 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、DNAPTP6 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、EPSTI1 ； 或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、BIRC4BP ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通过探针 229450_ at检测的基因；或ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、通过探针235276_at检测的基因；或LAMP3、 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、0AS3 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、 IFI44、USP18 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、SIGLEC1 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、HERC5 ； 或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、DNAPTP6 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、L0C129607 ；或 LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、EPSTI1 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、BIRC4BP ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、通过探针 229450_at 检测的基因；或1^1^3、(^51^、1 402、正144、通过探针235276_3{ 检测的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、USP18 ；或 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、SIGLEC1 ；或 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、HERC5 ；或 0ASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、EPSTIl ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、通 过探针229450_at检测的基因；或OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、通过探针235276_at检测 的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、SIGLEC1 ； 或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、L0C129607 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、EPSTIl ；或 RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、BIRC4BP ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通过探针 229450_at 检测的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLEC1 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、HERC5 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、DNAPTP6 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、L0C129607 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、EPSTIl ；或 IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通过探针 229450_at 检测的基 因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLECUHERC5 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 L0C129607 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、EPSTIl ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 BIRC4BP ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、通过探针 235276_at 检测的基因；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 DNAPTP6 ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 EPSTIl ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、BIRC4BP ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通过探 针229450_at检测的基因；或0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通过探针235276_at检测的基 因；或 USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 EPST11 ；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 通过探针 229450_at 检测的基因；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通过探针 235276_at 检测的基因；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1 ；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 L0C129607、BIRC4BP ；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通过探针 229450_at 检测的 基因；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通过探针 235276_at 检测的基因；或 HERC5、 DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP ；或 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl、通过探针 229450_at 检测的基因；或 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通过探针 235276_at 检 测的基因；或DNAPTP6、L0C129607、EPSTIU BIRC4BP、通过探针229450_at检测的基因；或 DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl、BIRC4BP、通过探针 235276_at 检测的基因；或 L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通过探针229450_at检测的基因、通过探针235276_at检测的基因。在这 种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少一种或多 种基因。 表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包含如下的任何至少6种基因，例如 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI44L ；或 MX1、 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、ISG15 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、LAMP3 ；或 MXl、 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、OASL ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、RSAD2 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、OASl、IFITl、IFI44 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFIT2 ；或 MXl、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFIT1、0AS3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、USP18 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASU IFITU SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU HERC5 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASl、IFITl、DNAPTP6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、L0C129607 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFITl、EPSTIl ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、BIRC4BP ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFIT1、通过探针 229450_at 检测的基因；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU 通过探针 235276_at 检测的基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、ISG15 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、LAMP3 ；或 LLY6E、 IFI27、OASl、IFITl、IFI6、0ASL;或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、RSAD2 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFIT2 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、USP18 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、HERC5 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、BIRC4BP ； 或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、通过探针 229450_at 检测的基因；或 LLY6E、IFI27、 0AS1、IFIT1、IFI6、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L, LAMP3 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 OASL ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、RSAD2 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 IFI44 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、IFIT2 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 0AS3 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、USP18 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 SIGLEC1 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、HERC5 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 DNAPTP6 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、L0C129607 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、EPSTIl ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、BIRC4BP ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、通过 探针 235276_at 检测的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3 ；或 0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、OASL ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、RSAD2 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFI44 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFIT2 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、0AS3 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、USP18 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、SIGLEC1 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、HERC5 ；或 0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、DNAPTP6 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、L0C129607 ；或 0AS1、 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、EPSTIl ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、BIRC4BP ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、通过探针 229450_at 检测的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、RSAD2 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 IFI44；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFIT2；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、0AS3 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、USP18 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、SIGLEC1 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、HERC5 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、DNAPTP6 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、L0C129607 ；或 IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、EPSTIl ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、BIRC4BP ；或 IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFI44 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFIT2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, 0AS3 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, USP18 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, SIGLEC1 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, DNAPTP6 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, EPSTIl ；或 IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, BIRC4BP ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通过探针 229450_at 检测的基因；或IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通过探针235276_at检测的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFIT2 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、0AS3 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、USP18 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、SIGLEC1 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、 HERC5 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、L0C129607 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、EPSTI1 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, RSAD2、BIRC4BP ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通过探针 229450_at 检测的 基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通过探针 235276_at 检测的基因；或 ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、0AS3 ；或 ISG15、 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、USP18 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、SIGLEC1 ；或 ISG15、 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、HERC5 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、DNAPTP6 ；或 ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、EPSTIl ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、BIRC4BP ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、通过探 针 229450_at 检测的基因；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通过探针 235276_at 检测 的基因；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、 USP18 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、SIGLEC1 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、HERC5 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、 IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、EPSTIl ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通过探针 229450_ at检测的基因；或LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通过探针235276_at检测的基因；或 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、SIGLEC1 ；或 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、L0C129607 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、EPSTIl ； 或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、BIRC4BP ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通过
33探针 229450_at 检测的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通过探针 235276_at 检 测的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、HERC5 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、DNAPTP6 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、L0C129607 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、EPSTIl ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通过探针 229450_at 检测的 基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、L0C129607 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 EPSTIl ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、BIRC4BP ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLEC1、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通过 探针 235276_at 检测的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6 ；或 IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、EPSTIl ； 或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、BIRC4BP ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通过探针 235276_ at 检测的基因；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 0AS3、USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、EPSTIl ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ；或 0AS3、USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、通过探针 229450_at 检测的基因；或 0AS3、USP18、 SIGLECU HERC5、DNAPTP6、通过探针 235276_at 检测的基因；或 USP18、SIGLECU HERC5、 DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl ；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、BIRC4BP ；或 USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通过探针 229450_at 检测的基因；或 USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通过探针 235276_at 检测的基因；或 SIGLEC1、HERC5、 DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP ；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通 过探针 229450_at 检测的基因；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通过探针 235276_at 检测的基因；或HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通过探针229450_ at 检测的基因；或 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通过探针 235276_at 检测 的基因；或DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通过探针229450_at检测的基因、通过探 针235276_at检测的基因。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表 235-381中所列的至少一种或多种基因。 表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包含如下的任何至少7种基因，例如 MXU LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、 ISG15 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、LAMP3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、 IFI6、0ASL ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、RSAD2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、 IFIT1、IFI6、IFI44 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFIT2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASU IFITU IFI6、0AS3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、USP18 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、HERC5 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、DNAPTP6 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、 L0C129607 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、EPSTIl ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITU IFI6、BIRC4BP ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、通过探针 229450_at 检 测的基因；或MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、通过探针235276_at检测的基因；或LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L, LAMP3 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、IFI44L、0ASL ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、 IFIT1、IFI6、IFI44L、RSAD2 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、IFI44 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、IFIT2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、0AS 1、IFITU IFI6、IFI44L、USP18 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、HERC5 ；或 LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、BIRC4BP ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、通过探针 229450_at 检测的基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、0ASL ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、RSAD2 ；或 IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFI44 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 IFIT2 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、0AS3 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、USP18 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、SIGLEC1 ；或 IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、HERC5 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 DNAPTP6 ；或 IFI27、0AS 1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、L0C129607 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、EPSTIl ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、BIRC4BP ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFI27、 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、通过探针 235276_at 检测的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、RSAD2 ；或 OASl、 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFI44 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 IFIT2 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0AS3 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、USP18 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、SIGLEC1 ；或 0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、HERC5 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、DNAPTP6 ； 或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、L0C129607 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、EPSTIl ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、BIRC4BP ；或 OASl、 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通过探针 229450_at 检测的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFI44 ；或 IFITl、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFIT2；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL,0AS3 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, USP18 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、SIGLEC1 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、HERC5 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, DNAPTP6 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, L0C129607 ；或 IFITUIFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, EPSTIl ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, BIRC4BP ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通过探针 229450_at 检测的 基因；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFIT2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、0AS3 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、USP18 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、SIGLEC1 ；或 IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、 DNAPTP6 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL、RSAD2、EPSTIl ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、BIRC4BP ；或 IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、0AS3 ；或 IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、USP18 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 SIGLEC1 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、HERC5 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、L0C129607 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、EPSTIl ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、BIRC4BP ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通过探针 229450_at 检测 的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通过探针 235276_at 检测的基因； 或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3 ；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、USP18 ；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、SIGLEC1 ；或 ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、HERC5 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、EPSTIl ；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、通过探针 229450_at 检测的基因；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、通过探针 235276_at 检测的基因；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、SIGLEC1 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 LAMP3、OASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、L0C129607 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、EPSTI1 ； 或1^1^3、(^51^、1 六02、正144、正叮2、(^53、811^48卩；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、通过探针 229450_at 检测的基因；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通过探 针 235276_at 检测的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1 ；或 0ASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、HERC5 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 DNAPTP6 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、L0C129607 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、EPSTI1 ；或 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 OASL、 1 八02、正144、正叮2、(^53川5 18、通过探针229450_3{检测的基因；或 0ASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、通过探针 235276_at 检测的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLECU HERC5 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、L0C129607 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 EPSTIl ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、BIRC4BP ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、通过探针 229450_at 检测的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLEC1、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ；或 IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、EPSTIl ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、BIRC4BP ；或正144、正叮2、(^53川5 18、5161^(1、!^1^5、通过探针229450_3{检测的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、EPSTIl ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、通过探针 235276_at 检测的基因；或 0AS3、USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 L0C129607、BIRC4BP ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通过探针 229450_at 检测的基因；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通过探针 235276_at 检测的基因；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP ； 或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通过探针 229450_at 检测的基因； 或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通过探针 235276_at 检测的基因； 或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIU BIRC4BP、通过探针 229450_at 检测的基 因；或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通过探针 235276_at 检测的 基因；或 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIU BIRC4BP、通过探针 229450_at 检测的基因、 通过探针235276_at检测的基因。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括 在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。 表达谱中的IFNci诱导性PD标志物可以包含如下的任何至少8种基因，例如； MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、LAMP3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OAS 1、IFITU IFI6、IFI44L、OASL ；或 MX1、 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、RSAD2 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、IFI44 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、IFIT2 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、0AS3 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 USP18 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、HERC5 ；或 MXU LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 DNAPTP6 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、L0C129607 ；或 MXl、LLY6E、 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、EPSTIl ；或 MXU LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、BIRC4BP ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、通过探针 229450_at 检 测的基因；或 MX1、LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、通过探针 235276_at 检测的 基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、OASL ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 RSAD2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFI44 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、IFIT2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、USP18 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 HERC5 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、BIRC4BP ；或 LLY6E、 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通过探针 229450_at 检测的基因；或 LLY6E、 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、通过探针 235276_at 检测的基因；orIFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、RSAD2 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFI44 ；或 IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、IFIT2 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、0AS3 ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、USP18 ；或 IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、SIGLEC1 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、HERC5 ；或 IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、DNAPTP6 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、L0C129607 ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、EPSTIl ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通过探 针 229450_at 检测的基因；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、BIRC4BP ； 或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、通过探针 235276_at 检测的基因；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, IFI44 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, IFIT2 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、0AS3 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、0ASL、USP18 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、SIGLEC1 ；或 OASl、 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, HERC5 ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, DNAPTP6 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, L0C129607 ；或 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, EPSTIl ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, BIRC4BP ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通过探 针 229450_at 检测的基因；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFIT2 ；或 IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2、0AS3 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、USP18 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、SIGLEC1 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2、HERC5 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、DNAPTP6 ； 或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、L0C129607 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、EPSTIl ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、 BIRC4BP ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、通过探针 229450_at 检测的基 因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、通过探针 235276_at 检测的基因； 或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL、RSAD2、IFI44、0AS3 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、USP18 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、SIGLEC1 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL、RSAD2、IFI44、HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、DNAPTP6 ； 或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、EPSTIl ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、 BIRC4BP ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通过探针 229450_at 检测 的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、通过探针 235276_at 检测 的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3 ；或 IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、USP18 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、SIGLEC1 ；或IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、HERC5；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、EPSTIl ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通过探针 235276_at 检测的基因；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 SIGLEC1 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、EPSTIl ；或 ISG15、LAMP3、 OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、BIRC4BP ；或 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、通过探针 229450_at 检测的基因；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 通过探针 235276_at 检测的基因；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLEC1 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、HERC5 ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、DNAPTP6 ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 L0C129607 ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、EPSTIl ；或 LAMP3、0ASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、通过探针 229450_at 检测的基因；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 通过探针 235276_at 检测的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 OASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、L0C129607 ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLECU EPSTIl ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、BIRC4BP ； 或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通过探针 229450_at 检测的基因； 或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通过探针 235276_at 检测的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 EPSTIl ；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通过探针 229450_at 检测 的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、BIRC4BP ；或 RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、EPSTIl ；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ； 或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通过探针 229450_at 检测的基因； 或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通过探针 235276_at 检测的基 因；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl ；或 IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、BIRC4BP ；或 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通过探针 235276_at 检测的基因；或 0AS3、USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP ；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、 DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通过探针 229450_at 检测的基因；或 0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通过探针 235276_at 检测的基因；或 USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl、BIRC4BP、通过探针 229450_at 检测的基因；或 USP18、 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通过探针 235276_at 检测的基因； 或 SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIU BIRC4BP、通过探针 229450_at 检测的基 因、通过探针235276_at检测的基因。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包 括在图表235-381中所列的至少一种或多种基因。 表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包含如下的任何至少12种基因，例如 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44 ；或 MXl、 LLY6E、IFI27、OAS 1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFIT2 ；或 MX1、 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、0AS3 ；或 MX1、LLY6E、 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、USP18 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、SIGLEC1 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、HERC5 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、DNAPTP6 ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、L0C129607 ；或 MX1、LLY6E、IFI27、0AS1、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、EPSTIl ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、BIRC4BP ；或 MXl、LLY6E、IFI27、OASl、 IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、通过探针 229450_at 检测的基因；或 MX1、 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、通过探针 235276_ at 检测的基因；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、0AS3 ；或 LLY6E、IFI27、OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、USP18 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、SIGLEC1 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、HERC5 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、DNAPTP6 ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、L0C129607 ；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、EPSTIl ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、BIRC4BP ；或 LLY6E、IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、通过探针 229450_at 检测的基因；或 LLY6E、IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、 15615、1^1^3、(^51^、1 402、正144、通过探针 235276_3{检测的基因；或 IFI27、0AS1、IFIT1、 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、OAS ；或 IFI27、0AS1、IFIT1、IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、USP18 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、SIGLEC1 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、HERC5 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、DNAPTP6 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、L0C129607 ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、EPSTIl ；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、BIRC4BP ；或 IFI27、0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFI27、OASU IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、通过探针 235276_at 检测的基因；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、SIGLEC1 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、HERC5 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、DNAPTP6 ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、L0C129607 ；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、EPSTIl ；或 0AS1、IFITU IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、BIRC4BP ；或 OASl、IFITl、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、通过探针 229450_at 检测的基因；或 0AS1、IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、HERC5 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、DNAPTP6 ；或 IFITl、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、L0C129607 ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、EPSTIl ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、BIRC4BP ；或 IFIT1、IFI6、IFI44L、 ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通过探针 229450_at 检测的基因； 或 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLEC1、HERC5 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLEC1、DNAPTP6 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLECU L0C129607 ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、EPSTIl ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、BIRC4BP ；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、通过探针 229450_at 检测的基因；或 IFI6、IFI44L、ISG15、LAMP3、 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、通过探针 235276_at 检测的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6 ；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、L0C129607 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、EPSTI1 ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、BIRC4BP ； 或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、通过 探针 229450_at 检测的基因；或 IFI44L、ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、 USP18、SIGLECU HERC5、通过探针 235276_at 检测的基因；或 ISG15、LAMP3、OASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607 ；或 ISG15、LAMP3、0ASL、 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、EPSTIl ；或 ISG15、LAMP3、 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、BIRC4BP ；或 ISG15、 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通过探针 229450_at 检测的基因；或 ISG15、LAMP3、0ASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、通过探针 235276_at 检测的基因；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl ；或 LAMP3、OASL、RSAD2、IFI44、 IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、BIRC4BP ；或 LAMP3、0ASL、RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、通过探针 229450_at 检 测的基因；或 LAMP3、OASL, RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 L0C129607、通过探针 235276_at 检测的基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、 SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTIl、BIRC4BP ；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、 0AS3、USP18、SIGLECU HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、通过探针 229450_at 检测的 基因；或 OASL、RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、 EPSTI1、通过探针 235276_at 检测的基因；或 RSAD2、IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、 HERC5、DNAPTP6、LOCl29607、EPSTI1、BIRC4BP、通过探针 229450_at 检测的基因；或 RSAD2、 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通过 探针 229450_at 检测的基因；或 IFI44、IFIT2、0AS3、USP18、SIGLEC1、HERC5、DNAPTP6、 L0C129607、EPSTI1、BIRC4BP、通过探针229450at检测的基因通过探针235276_at检测的基 因。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至少 一种或多种基因。表达谱中的IFN α诱导性PD标志物可以包含下列蛋白的任何一种或多种的血清 蛋白水平的改变脂连蛋白、甲胎蛋白、载脂蛋白CIII、β-2微球蛋白、癌抗原125、癌抗 原19-9、嗜酸细胞活化趋化因子、FABP、因子VII、铁蛋白、IL-10、IL_12p70、IL-16、IL-18、 IL-1 ra、IL-3、MCP-1、MMP-3、肌红蛋白、SGOT、组织因子、TIMP-1、TNF RII、TNF- α、VCAM-1、 vffF, BDNK、补体 3、CD40 配体、EGF, ENA-78、EN-RAGE、IGF-I、MDC、髓过氧化物酶、RANTES 或 血小板生成素。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中 所列的至少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包含下列蛋白的任何一种或多种的血 清蛋白水平的改变脂连蛋白、甲胎蛋白、载脂蛋白CHI、β _2微球蛋白、癌抗原125、癌抗 原19-9、嗜酸细胞活化趋化因子、FABP、因子VII、铁蛋白、IL-10、IL_12p70、IL-16、IL-18、 IL-lra、IL-3、MCP-1、MMP-3、肌红蛋白、SGOT、组织因子、TIMP-1、TNF RII、TNF_a、VCAM-1 或vWF。在这种表达谱中的IFNa诱导性PD标志物还可以包括在图表235-381中所列的至 少一种或多种基因。表达谱中的IFNa诱导性PD标志物可以包含下列蛋白的任何一种或多种的血清 蛋白水平的改变BDNK、补体3、CD40配体、EGF、ENA-78、EN-RAGE, IGF-I、MDC、髓过氧化物 酶、RANTES或血小板生成素。在这种表达谱中的FNa诱导性PD标志物还可以包括在图表 235-381中所列的至少一种或多种基因。IFNa-诱导性PD标志物表达谱还可以包含在暴露于非基线IFNa水平的细胞 中表达或活性下调的基因。所述基因可以包括下列的任何一种或多种SLC4A1、PRSS33、 FCER1A、BACH2、KLRB1、D4S234E、T 细胞受体 α 基因座/T 细胞受体 δ 基因座、FEZ1、AFF3、 CD160、ABCBl、PTCHl、0R2W3、IGHD, NOG、NR3C2、TNSl、PDZKlIPl、SH2D1B、STRBP、ZMYNDl 1、 TMODl、FCRLA、DKFZp761P0423、EPB42、NR6Al、L0C341333、MS4Al、IGHM、SIGLECP3、KIR2DS2、 PKIA、BLRl、C5orf4、MYLK、L0C283663、MADlLl、CXCL5、D4S234E、FCRLA、KRTl、cl6orf74、
42ABCB4 或 GPRASP1。PD标志物可以为相对于那些健康的受治疗者或未受折磨的患者组织上调的或下 调的。患者的表达谱中的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的上调或下调可以是与来自 对照的样品(可以是来自患者的非疾病组织(例如银屑病患者的未损害的皮肤)或来自未 受疾病或疾患折磨的健康人的样品)相比的任何程度。上调或下调程度可以是对照或对照 样品的至少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少 60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、或至 少200 %、或至少300 %、或至少400 %、或至少500 %。包含I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱的患者还可以包含任何数目的 IFNa或I型IFN亚型的表达上调。IFNa或I型IFN亚型可以包括任何大于一种、大于 两种、大于三种、大于四种、大于五种、大于六种、大于七种、大于八种、大于九种或大于十种 的 IFNa 或 I 型 IFN 亚型。这些亚型可以包括IFN a 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 6、 IFNa 7、IFN a 8、IFN a 10、IFN a 14、IFN a 17、IFN a 21、IFN β 或 IFNco。患者可以包含 IFN 亚型IFNa 1、IFNa 2、IFNa 8和IFNa 14的表达上调。表达上调可以是对照的至少10%、 至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至 少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、或至少200%、或至少 300 %、或至少400 %、或至少500 %。包含I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱的患者还可以包含为IFNARl或 IFNAR2 或二者的 IFNa 受体、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNy 受体(IFNGR1、IFNGR2 或 IFNGRl 和IFNGR2 二者)的表达上调。患者可以被简单地鉴定为包含为IFNARl或IFNAR2或二者 的 IFNa 受体、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNY 受体(IFNGR1、IFNGR2 或 IFNGRl 和 IFNGR2 二 者)的表达上调的患者。患者还可以包括或可选择地包括血清中蛋白水平的改变。患者可以具有诸如以下 的蛋白的血清水平增加脂连蛋白、甲胎蛋白、载脂蛋白CIII、β-2微球蛋白、癌抗原125、 癌抗原19-9、嗜酸细胞活化趋化因子、FABP、因子VII、铁蛋白、IL-10、IL_12p70、IL-16、 IL-18、IL-lra、IL-3、MCP-1、MMP-3、肌红蛋白、SG0T、组织因子、TIMP-1、TNF RII、TNF-a、 VCAM-I或vWF。患者在血清中可以具有血清水平增加的任何1种、2种、3种、4种、5种、6 种、7种、8种、9种、10种、11种、12种、1314种、15种、16种、17种、18种、19种、20种、21种、 o22种、23种、24种、25种或26种的这些蛋白。增加的水平可以是对照如健康受治疗者的至 少10%、至少15%、至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少 70%、至少75%、至少80%、至少90%、至少100%、至少125%、至少150%、或至少200%、 或至少300%、或至少400%、或至少500%。变化可以是诸如以下的蛋白的血清水平降低 BDNK、补体 3、CD40 配体、EGF、ENA-78、EN-RAGE, IGF-I、MDC、髓过氧化物酶、RANTES 或血小 板生成素。患者可以具有血清水平降低的任何1种、2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9 种、10或11种的这些蛋白。降低的水平可以为对照如健康受治疗者的至少10%、至少15%、 至少20%、至少25%、至少30%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至 少80%、至少90%或至少100%。PD标志物谱可以包含这些血清水平增加或降低的蛋白的 一种或多种。患者还可以包含结合下列自身抗原的任一种的自身抗体(a)抗黏液病毒(流感病毒)1，干扰素诱导蛋白p78;(b)SUrfeit 5，转录物变体c;(c)蛋白酶体(前体，巨蛋白 因子)激活物亚基3 (PA28 γ ；Ki) transc ； (d)视黄酸受体α ； (e) IOkDa热休克蛋白1 (伴 侣蛋白10) ；f)原肌球蛋白3 ;(g)普列克底物蛋白同源性样结构域，家族A，成员1 ;(h)细 胞骨架相关蛋白1 ;(i)舍格伦综合征抗原A2(60kDa，核糖核蛋白自身抗原SS-A/Ro) ； (j) NADH脱氢酶(泛醌)1，α/β亚复合体l，8kDa ； (k)NudE核分布基因E同系物1 (构巢曲 霉)；⑴MutL同系物1，2型非息肉性结肠癌(大肠杆菌)；(m)富亮氨酸重复(FLII中)相 互作用蛋白2; (η)原肌球蛋白1(a) ； (ο)痉挛性截瘫20，spartin (Troyer综合征)；(ρ)植 入前蛋白，转录物变体1 ;(r)线粒体核糖体蛋白L45 ;(s)Lin-28同系物(秀丽隐杆线虫)； (t)90kDa热休克蛋白1，α ； (u) dom-3同系物Z (秀丽隐杆线虫)；(ν)动力蛋白，胞质的，轻 中间体多肽2 ； (w) Ras相关的C3肉毒杆菌毒素底物1 (rho家族，小GTP结合蛋白)；(χ)滑膜 肉瘤，X断点2，转录物变体2 ;(y)膜突蛋白；(Z)homer同系物(果蝇)转录物变体1 ； (aa) GCN5广泛控制的氨基酸合成5样2 (酵母)；(bb)真核翻译延伸因子1 Y ； (cc)真核翻译延 伸因子IS ； (dd)DNA损伤诱导转录物3; (ee) CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP) γ ；以及在下 列临时申请中所描述的任何其他自身抗原2007年5月3日提交的名称为“Auto-antibody markers of autoimmune disease (自身免疫疾病的自身抗体标志物)”的临时申请或在 2007 ip 11^6 Hil^W^^^J "Auto-antibody markers of autoimmune disease (自胃 免疫疾病的自身抗体标志物)”(例如但不限于在表2、4、5和9中所描述的那些)。患者可 以包含结合任何数目的这些自身抗原的自身抗体，例如任何至少2种、至少3种、至少4种、 至少5种、至少6种、至少7种、至少8种、至少9至少10种、至少11种、至少12种、至少13 种、至少14种、至少15种、至少20种、至少25种。可以将治疗剂施用给肌炎患者。治疗剂可以为结合并调控I型IFN或IFNa活性 的任何分子。治疗剂可以为小分子或生物药剂。如果治疗剂是小分子，则它可以是合成的 或由天然来源鉴定和分离的。
如果治疗剂是生物药剂，则它可以是对I型IFN或IFN α的任何亚型特异性的抗 体。例如，抗体可以是对下列的任一种特异性的JFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 6、 IFNa 7、IFNa 8、IFNa 10、IFNa 14、IFNa 17、IFNa 21、IFN^ 或 IFNco。可选择地，抗体 可以是对任两种、任三种、任四种、任五种、任六种、任七种、任八种、任九种、任十种、任i^一 种、任十二种I型IFN或IFNa亚型特异性的。如果抗体是对大于一种的I型IFN亚型特 异性的，贝U抗体可以是对 IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8、IFNa 10 禾Π IFNa 21 特 异性的；或它可以是对IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8和IFNa 10特异性的；或 它可以是对IFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 8禾口 IFNa 21特异性的；或它可以是对 IFNa 1、IFN a 2、IFN a 4、IFN a 5、IFN a 10 禾口 IFNa 21 特异性的。对 I 型 IFN 或 IFNa 特异 性的抗体包括MEDI-545、除MEDI-545之外的任何生物剂或抗体、2004年12月10日提交的 美国专利申请11/009，410和2005年6月20日提交的11/157,494中所描述的抗体、在美 国专利第7，087，726号中描述的9F3和其他抗体(实施例1和实施例2，在表3和表4中公 开的那些和/或在名为“材料保藏”(D印osit of Material)的表中第56列，第25_54行所 公开的那些)、NK-2 和 Y0K5/19 (W0 84/03105)、L0_22 (美国专利 4，902，618)、144 BS (美国 专利4，885，166)以及rai-UBI-2和mi-3(EP 119476)。调控IFNa活性的治疗剂可以 中和IFNa活性。本领域的技术人员清楚地知道这种生物药剂的制备和配制以及它们施用的方法。抗体可以是合成抗体、单克隆抗体、多克隆抗体、重组制备的抗体、细胞内抗体、多 特异性抗体(包括双特异性抗体)、人抗体、人源化抗体、嵌合抗体、单链FV(SCFV)(包括双 特异性scFv)、BiTE分子、单链抗体、Fab片段、F(ab，)片段、二硫键连接的Fv(SdFv)或上 述任何一种的表位结合片段。抗体可以是免疫球蛋白分子或免疫球蛋白分子的免疫活性部 分的任何一种。此外，抗体可以为任何同种型。例如，它可以是同种型IgGl、IgG2、IgG3或 IgG4的任何一种。抗体可以是包含可变区与恒定区的全长抗体或其抗原结合片段，如单链 抗体、或Fab或Fab’2片段。抗体还可以轭合或连接至治疗剂上，如细胞毒素或放射性同位素 可以将除结合以调控IFNa活性的药剂之外的第二药剂施用给肌炎患者。第二药 剂包括但不限于非类固醇类抗炎药物，如布洛芬、萘普生、舒林酸、双氯芬酸、吡罗昔康、酮 洛芬、二氟尼柳、萘丁美酮、依托度酸和奥沙普秦、吲哚美辛；抗疟疾药物，如羟氯喹；皮质 类固醇激素，如泼尼松、氢化可的松、甲泼尼龙和地塞米松；甲氨蝶呤；免疫抑制剂，如硫唑 嘌呤和环磷酰胺；以及生物药剂，例如，靶向T细胞的生物药剂，如阿法赛特和依法利珠单 抗，或靶向TNFa的生物药剂，如恩利、类克和修美乐。药剂的治疗可以导致I型IFN或IFNa诱导谱的中和。药剂的治疗可以导致肌炎 的一种或多种症状或疾病的突发减少。症状可以包括肌无力、吞咽困难、呼吸困难、发热、体 重减少、疼痛、肌肉压痛、关节炎和疹。药剂的治疗可能导致改善的预测。药剂的治疗可以 导致患者较高的生活品质。药剂的治疗可以减轻共施用第二药剂的需要或可以减少施用给 患者的第二药剂的剂量。药剂的治疗可以减少患者的住院次数。结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂可以中和I型IFN或IFNa活性谱。I 型IFN或IFNa诱导谱的中和可以是至少一种、至少两种、至少三种、至少五种、至少七种、 至少八种、至少十种、至少十二种、至少十五种、至少二十种、至少二十五种、至少三十种、至 少三十五种、至少四十种、至少四十五种或至少五十种被I型IFN或IFNa上调的基因的降 低。I型IFN或IFNa上调的基因可以是图235-381中或如上所讨论的任何基因的组。I型 IFN或IFNa诱导谱的中和是在任何I型IFN或IFNα诱导谱中至少一种、至少两种、至少 三种、至少五种、至少七种、至少八种、至少十种、至少十二种、至少十五种、至少二十种、至 少二十五种、至少三十种、至少三十五种、至少四十种、至少四十五种或至少五十种上调的 基因的至少2%、至少3%、至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至 少25 %、至少30 %、至少35 %、至少40 %、至少45 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少 75%、至少80%或至少90%的降低。可选择地，I型IFN或IFN α谱的中和可以指上调的I 型IFN或IFNa诱导基因表达的如下降低在对照样品中的那些I型IFN或IFNa诱导基 因表达水平的最多50%、最多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、 最多15%、最多10%、最多5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多之内。如果结合并 调控I型IFN或IFNa活性的药剂是生物药剂如抗体，则该药剂可以在下列剂量中和I型 IFN 或 IFN α 谱0. 3 至 30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、1 至 30mg/ kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。I型IFN或IFNa诱导谱的中和可以是至少一种、至少两种、至少三种、至少五种、 至少七种、至少八种、至少十种、至少十二种、至少十五种、至少二十种、至少二十五种、至少三十种、至少三十五种、至少四十种、至少四十五种或至少五十种表达被I型IFN或IFNa 降低的基因的表达增加。表达被I型IFN或IFNa降低的基因可以是图235-381中或如上 所讨论的任何基因的组。I型IFN或IFNa诱导谱中下调的基因的中和可以是在任何I型 IFN或IFNa诱导谱谱中表达下调的至少一种、至少两种、至少三种、至少五种、至少七种、 至少八种、至少十种、至少十二种、至少十五种、至少二十种、至少二十五种基因中的任何基 因的至少2%、至少3%、至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至 少25 %、至少30 %、至少35 %、至少40 %、至少45 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少 75%、至少80%、或至少90%、或至少100%、或至少125%、或至少130%、或至少140%、 或至少150 %、或至少175 %、或至少200 %、或至少250 %、或至少300 %、或至少500 %的增 加。可选择地，I型IFN或IFNα诱导谱的中和是指I型IFN或IFNα诱导基因表达的如下 增加在对照样品中的那些I型IFN或IFNa诱导(下调的)基因表达水平的最多50%、最 多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多10%、最多 5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多之内。如果结合并调控I型IFN或IFN α活性 的药剂是生物药剂如抗体，则该药剂可以在下列剂量中和I型IFN或IFN α谱0. 3至30mg/ kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、1 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、 10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂还可以或可选择地中和一种或多种I 型IFN或IFNa亚型的表达。IFNa或I型IFN亚型可以包括任何大于一种、大于两种、大 于三种、大于四种、大于五种、大于六种、大于七种、大于八种、大于九种或大于十种的IFNa 或 I 型 IFN 亚型。这些亚型可以包括 JFNa 1、IFNa 2、IFNa 4、IFNa 5、IFNa 6、IFNa 7、 IFNa 8、IFNa 10、IFNa 14、IFNa 17、IFNa 21、IFN3 或 IFNco。这些亚型可以包括 IFNa 1、 IFNa 2、IFNa 8禾口 IFNa 14的全部。可选择地，这些亚型可以包括JFNa l、IFNa 2、IFNa 4、 IFNa 5、IFNa 8、IFNa 10、IFNa 21。IFNa或I型IFN亚型的中和可以是所述亚型的至少 一种、至少两种、至少三种、至少五种、至少七种、至少八种、至少十种的至少2%、至少3%、 至少4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少 35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%或至少 90%的降低。IFNa或I型IFN亚型的中和可以是下列范围内的IFNa或I型IFN亚型基 因表达的降低对照样品中的那些IFNa或I型IFN亚型表达水平的最多50%、最多45%、 最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多10%、最多5%、最 多4%、最多3%、最多2%或最多之内。如果结合并调控IFNa或I型IFN活性的药剂 是生物药剂如抗体，则该药剂可以在下列剂量中和IFNa或I型IFN亚型0. 3至30mg/kg、 0.3 M 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kg、1 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂还可以或可选择地中和为IFNARl或 IFNAR2 或二者的 IFNa 受体、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNy 受体(IFNGR1、IFNGR2 或 IFNGRl 和IFNGR2 二者)的表达。为IFNARl或IFNAR2或二者的IFN α受体、或TNF α或IFN γ、或 IFNy受体(IFNGR1、IFNGR2或IFNGRl和IFNGR2 二者)的表达的中和可以是这些基因的 任何至少一种、至少两种、至少三种、至少五种或至少六种的至少2%、至少3%、至少4%、 至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至少
4640%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%或至少90%的降 低。为 IFNARl 或 IFNAR2 的 IFNa 受体、或 TNFa 或 IFN γ、或 IFNy 受体(IFNGR1、IFNGR2 或IFNGRl和IFNGR2 二者)的表达的中和是对照样品中这些基因表达水平的最多50%、最 多45%、最多40%、最多35%、最多30%、最多25%、最多20%、最多15%、最多10%、最 多5%、最多4%、最多3%、最多2%或最多的表达降低。如果结合并调控I型IFN或 IFNa活性的药剂是生物药剂如抗体，则该药剂可以在下列剂量中和IFNa受体IFNARl或 IFNAR2、或 TNF α 或 IFN γ、或 IFN Y 受体 IFNGRl 或 IFNGR2 的表达0. 3 至 30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kgU 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂还可以或可选择地中和血清中蛋白水平 的改变，例如将血清水平下调的那些蛋白的水平增加至或将血清水平上调的那些蛋白的水 平降低至更接近对照受治疗者的那些水平的水平。血清中诸如脂连蛋白、甲胎蛋白、载脂蛋 白CIII、i3-2微球蛋白、癌抗原125、癌抗原19-9、嗜酸细胞活化趋化因子、FABP、因子VII、 铁蛋白、IL-10、IL-12p70、IL-16、IL-18、IL-lra、IL_3、MCP-1、MMP_3、肌红蛋白、SG0T、组织 因子、TIMP-1、TNF RII、TNF- α、VCAM-1、vWF、BDNK、补体3、CD40 配体、EGF、ENA-78、EN-RAGE、 IGF-I、MDC、髓过氧化物酶、RANTES或血小板生成素的蛋白表达的中和可以通过使这些蛋白 的至少一种、至少两种、至少三种、至少五种、至少六种、至少七种、至少八种、至少九种、至 少十种、至少十二种、至少十五种、至少二十种、至少25种的水平达到健康受治疗者的血清 中所述蛋白水平的至少2 %、至少3 %、至少4%、至少5 %、至少7 %、至少8 %、至少10 %、至 少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少 70%、至少75%、至少80%或至少90%之内进行。如果结合并调控I型IFN或IFNa活性 的药剂是生物药剂如抗体，则该药剂可以在下列剂量中和如脂连蛋白、甲胎蛋白、载脂蛋白 CIII、β _2微球蛋白、癌抗原125、癌抗原19-9、嗜酸细胞活化趋化因子、FABP、因子VII、铁 蛋白、IL-10、IL-12p70、IL-16, IL-18, IL-lra, IL_3、MCP-1、MMP_3、肌红蛋白、SGOT、组织因 子、TIMP-1、TNF RII、TNF-a、VCAM-1、vWF、BDNK、补体 3、CD40 配体、EGF、ENA_78、EN-RAGE、 IGF-I、MDC、髓过氧化物酶、RANTES或血小板生成素的血清蛋白的水平0. 3至30mg/kg、0. 3 至 10mg/kg、0. 3 至 3mg/kg、0. 3 至 lmg/kgU 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 10mg/kg 或 1 至 5mg/kg。结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂还可以或可选择地降低结合下列自身 抗原的任何一种、任何至少2种、任何至少3种、任何至少4种、任何至少5种、任何至少6 种、任何至少7种、任何至少8种、任何至少9种、任何至少10种、任何至少15或任何至少 20种的自身抗体的数目和水平(a)抗黏液病毒(流感病毒)1，干扰素诱导蛋白p78;(b) surfeit 5，转录物变体c; (c)蛋白酶体(前体，巨蛋白因子)激活物亚基3(ΡΑ28γ ；Ki) transc ； (d)视黄酸受体α ； (e) IOkDa热休克蛋白1(伴侣蛋白10) ；f)原肌球蛋白3 ； (g) 普列克底物蛋白同源性样结构域，家族A，成员1 ;(h)细胞骨架相关蛋白1 ;(i)舍格伦综 合征抗原A2(60kDa，核糖核蛋白自身抗原SS-A/Ro) ； (j) NADH脱氢酶(泛醌)1，α/β亚 复合体l，8kDa ； (k)NudE核分布基因E同系物1 (构巢曲霉)；(I)MutL同系物1，2型非息 肉性结肠癌(大肠杆菌)；(m)富亮氨酸重复(FLII中)相互作用蛋白2 ;(n)原肌球蛋白 1 ( α ) ； (ο)痉挛性截瘫20，spartin (Troyer综合征)；(ρ)植入前蛋白，转录物变体1 ； (r)线粒体核糖体蛋白L45 ;(s)Lin-28同系物(秀丽隐杆线虫)；(t)90kDa热休克蛋白1，α ； (u)dom-3同系物Z(秀丽隐杆线虫)；(ν)动力蛋白，胞质的，轻中间体多肽2; (w)Ras相关 的C3肉毒杆菌毒素底物1 (rho家族，小GTP结合蛋白)；(χ)滑膜肉瘤，X断点2，转录物变 体2 ； (y)膜突蛋白；(z)homer同系物(果蝇)转录物变体1 ； (aa)GCN5广泛控制的氨基酸 合成5样2(酵母)；(bb)真核翻译延伸因子IY ； (cc)真核翻译延伸因子1 δ ； (dd)DNA损 伤诱导转录物3; (ee) CCAAT/增强子结合蛋白(C/EBP) γ ；以及在2007年5月3日提交的 名称为“Auto-antibody markers of autoimmune disease (自身免疫疾病的自身抗体标志 物)”的临时申请申请中所描述的任何其他自身抗原；以及在2007年11月6日提交的名称 ^j"Auto-antibody markers of autoimmune disease (自白勺自” 的临时申请申请中所描述的任何其他自身抗原(例如但不限于在表2、4、5和9中所描述的 那些)。自身抗体水平的降低可以是存在的任何所述自身抗体的至少2%、至少3%、至少 4%、至少5%、至少7%、至少8%、至少10%、至少15%、至少25%、至少30%、至少35%、至 少40 %、至少45 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少75 %、至少80 %或至少90 %的降 低。如果结合并调控I型IFN或IFNα活性的药剂是生物药剂如抗体，则该药剂可以在下 列剂量降低自身抗体的数目或水平0. 3至30mg/kg、0. 3至10mg/kg、0. 3至3mg/kg、0. 3至 lmg/kgU 至 30mg/kg、3 至 30mg/kg、5 至 30mg/kg、10 至 30mg/kg、l 至 10mg/kg、3 至 IOmg/ kg 或 1 至 5mg/kg。结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂可以不中和不包括在干扰素诱导性标记 或PD标志物谱中的基因的表达。监测疾病进展可以通过在施用如下的药剂之前和之后获得患者样品来进行例 如，结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂、结合但不调控I型IFN或IFNa活性的药剂 或可以包括或可以不包括结合并调控I型IFN或IFN α活性的药剂的组合。样品包括任何 生物流体或组织，如全血、唾液、尿、滑液、骨髓、脑脊液、鼻分泌物、痰、羊水、支气管肺泡灌 洗液、外周血单核细胞、总白细胞、淋巴结细胞、脾细胞、扁桃体细胞或皮肤。样品可以通过 本领域内已知的任何方法获得。获得(在药剂施用之前和之后)样品中的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达 谱。比较样品中的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱。比较可以是样品中存在的 I型IFN或IFN α诱导性PD标志物的数目的比较或可以是样品中存在的I型IFN或IFN α 诱导性PD标志物的数量的比较、或它们的任何组合。如果在治疗剂施用之后所获得的样品 中上调的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目或水平(或它们的任何组合)相对于治 疗剂施用之前所获得的样品降低，则可以指示表明治疗剂效力的变化。上调的I型IFN或 IFNa诱导性PD标志物的数目可以降低至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少 7、至少8、至少9或至少10。任何给定的上调的I型IFN或IFN α诱导性PD标志物的水平 可以降低至少10 %、至少20 %、至少25 %、至少30 %、至少35 %、至少40 %、至少50 %、至少 60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %。水平降低的上调的I型IFN或IFN α诱 导性PD标志物的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、 至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。上调的I型IFN或IFNa诱 导性PD标志物的数目降低和水平降低的任何组合可以表明效力。如果在治疗剂施用之后 所获得的样品中下调的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目或水平(或它们的任何组合)相对于治疗剂施用之前所获得的样品降低，则可以指示表明治疗剂效力的变化。下 调的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目可以降低至少1、至少2、至少3、至少4、至 少5、至少6、至少7、至少8、至少9或至少10。任何给定的下调的I型IFN或IFNa诱导 性PD标志物的水平可以增加至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少 40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %。水平增加的下调 的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、 至少6、至少7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。下调 的I型IFN或IFN α诱导性PD标志物的数目降低和水平增加的任何组合可以表明效力。可以在第一次施用药剂之前(即患者对药剂是幼稚的)从患者获得样品。可选择 地，从患者获得样品可以在治疗过程中施用药剂之后进行。例如，可在监测步骤开始之前已 经施用药剂。在施用药剂之后可以从患者获得另外的样品并比较样品中的I型IFN或IFNa 诱导性PD标志物。样品可以为相同类型或不同类型的，例如，获得的各样品可以为血样，或 获得的各样品可以为血清样品。各样品中所检测的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物可 以是相同的、可以基本上重叠或可以相似。样品可以在施用治疗剂之前和之后的任何时间获得。在施用治疗剂之后获得的样 品可以在施用治疗剂之后至少2天、至少3天、至少4天、至少5天、至少6天、至少7天、至 少8天、至少9天、至少10天、至少12天或至少14天获得。在施用治疗剂之后获得的样品 可以在施用治疗剂之后至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、至少7周、至少 8周获得。在施用治疗剂之后获得的样品可以在施用治疗剂之后至少2个月、至少3个月、 至少4个月、至少5个月或至少6个月获得。可以在施用治疗剂之后从患者获得另外的样品。可以从患者获得至少2份、至少3 份、至少4份、至少5份、至少6份、至少7份、至少8份、至少9份、至少10份、至少12份、至 少15份、至少20份、至少25份样品以监测疾病或疾患随时间的进展或消退。可以在以下 的时间段内监测疾病进展至少1周、至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、 至少7周、至少2个月、至少3个月、至少4个月、至少5个月、至少6个月、至少1年、至少 2年、至少3年、至少4年、至少5年、至少10年或患者的终生。另外的样品可以定期从患 者获得，如每月一次、每两月一次、每季度一次、每年两次或每年一次的间隔。可以在施用药 剂之后定期从患者获得样品。例如，可以在下列时间从患者获得样品每次施用药剂之后一 周、每次施用药剂之后两周、或每次施用药剂之后三周或每次施用药剂之后一个月、或每次 施用药剂之后两个月。可选择地，可以在施用治疗剂之后或每次施用药剂之后从患者获得 多份样品。可以类似地在不存在药剂施用下监测患者的疾病进展。可以定期从患有疾病或疾 患的患者获得样品。如果较晚获得的样品中的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物数目相 对于较早获得的样品中的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物数目增加，则可以确定疾病进 展。I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目可以增加至少1、至少2、至少3、至少4、至 少5、至少6、至少7、至少8、至少9或至少10。如果任何给定的上调的I型IFN或IFNa诱 导性PD标志物的水平增加了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少 40 %、至少50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，则可以确定疾病 进展。如果任何给定的下调的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的水平降低了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至 少80 %、至少90 %或至少95 %，则可以确定疾病进展。水平增加的上调的I型IFN或IFN α 诱导性PD标志物的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、 至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。水平降低的下调的I型IFN 或IFNa诱导性PD标志物的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少
7、至少8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。上调的I型IFN 或IFNa诱导性PD标志物的数目增加和水平增加的任何组合可以表明疾病进展。可选择 地，或与之组合，下调的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目降低和水平降低的组合 可以表明疾病进展。还可以在患有疾病或病患而未用药剂治疗的患者中鉴定疾病消退。在 这种情况下，如果较晚获得的样品中的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物数目相对于较早 获得的样品中的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物数目降低，则可以鉴定疾病消退。I型 IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目可以降低至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少 6、至少7、至少8、至少9或至少10。如果任何给定的上调的I型IFN或IFNa诱导性PD标 志物的水平降低了至少10%、至少20%、至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少 50 %、至少60 %、至少70 %、至少80 %、至少90 %或至少95 %，则可以鉴定疾病消退。如果 任何给定的下调的I型IFN或IFN α诱导性PD标志物的水平增加了至少10%、至少20%、 至少25%、至少30%、至少35%、至少40%、至少50%、至少60%、至少70%、至少80%、至 少90%或至少95%，则可以鉴定疾病消退。水平降低的上调的I型IFN或IFNa诱导性PD 标志物的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少8、至少9、至 少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。水平增加的下调的I型IFN或IFNa 诱导性PD标志物的数目可以是至少1、至少2、至少3、至少4、至少5、至少6、至少7、至少
8、至少9、至少10、至少15、至少20、至少25、至少30或至少35。可以通过在任何时间段以 任何间隔获得样品来监测疾病进展或疾病消退。可以通过在以下的时程内获得样品来监测 疾病进展或疾病消退至少1周、至少2周、至少3周、至少4周、至少5周、至少6周、至少 7周、至少2月、至少3月、至少4月、至少5月、至少6月、至少1年、至少2年、至少3年、至 少4年、至少5年、至少10年或患者的终生。疾病进展或疾病消退可以通过至少每月一次、 每两月一次、每季度一次、每年两次或每年一次获得样品来监测。不需要以严格的间隔获得 样品。本发明还涵盖试剂盒和探针。探针可以是检测可被包括在IFNa -诱导性PD标志 物表达谱中的任何基因的任何表达或活性的任何分子。申请人:提供了 一组非限制性实施方式来描述本发明的一些方面。实施方式1. 一种治疗患有I型IFN或IFN α介导的疾病或疾患的患者的方法，所述方法包 括施用结合并调控I型IFN或IFN α活性的药剂；其中所述患者包含差异调节的miRNA标志物谱；并且其中所述药剂中和所述患者的所述差异调节的miRNA标志物谱。2.如实施方式1所述的方法，所述方法还包括检测所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱的中和。
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3.如实施方式1所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2 或4中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性上调。4.如实施方式3所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2 或4中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性上调。5.如实施方式4所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2 或4中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性上调。6.如实施方式5所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2 或4中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性上调。7.如实施方式6所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2 或4中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性上调。8.如实施方式3所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-34b-4373037 检测。9.如实施方式1所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3 或5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。10.如实施方式9所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3 或5中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。11.如实施方式10所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。12.如实施方式11所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。13.如实施方式12所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。14.如实施方式9所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-1-4373161 检测。15.如实施方式3所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱还包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。16.如实施方式15所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。17.如实施方式16所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。18.如实施方式17所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。19.如实施方式18所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。20.如实施方式15所述的方法，其中通过表3或5中所标示的检测物检测的所述 至少一种 miRNA 为 hsa-miR-1-4373161。21.如实施方式1所述的方法，其中所述药剂为生物药剂。22.如实施方式21所述的方法，其中所述药剂为抗体。23.如实施方式22所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。
24.如实施方式22所述的方法，其中所述抗体是对一种或多种I型IFN或IFNa 亚型特异性的但不是MEDI-545。25.如实施方式1所述的方法，其中所述药剂的施用减轻所述疾病或疾患的一种 或多种症状。26.如实施方式22所述的方法其中所述抗体以大约0. 03和30mg/kg之间的剂量 施用。27.如实施方式26所述的方法，其中所述抗体以0. 3和3mg/kg之间的剂量施用。28.如实施方式27所述的方法，其中所述抗体以0.03和lmg/kg之间的剂量施用。29.如实施方式21中任一项所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调 节的miRNA标志物谱中和至少10%。30.如实施方式29所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少20%。31.如实施方式30所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少30%。32.如实施方式31所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少40%。33.如实施方式32所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少50%。34.如实施方式1所述的方法，其中所述疾病或疾患是狼疮、银屑病、血管炎、结节 病、舍格伦综合征或肌炎之一。35.如实施方式34所述的方法，其中所述疾病或疾患是肌炎。36.如实施方式1所述的方法，其中所述患者还包含至少IFNa亚型1、2、8和14 的表达或活性上调。37.如实施方式2所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱在所述患者的 全血中检测。38.如实施方式2所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱在所述患者的 肌肉组织中检测。39.如实施方式1所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱是强的或中等 的。40. 一种在需要其的患者中中和差异调节的miRNA标志物谱的方法，所述方法包 括给所述患者施用结合并调控I型IFN或IFN α活性的药剂；其中所述药剂中和所述患者的所述差异调节的miRNA标志物谱。41.如实施方式40所述的方法，所述方法还包括检测所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱的中和。42.如实施方式40所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性上调。43.如实施方式42所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性上调。
44.如实施方式43所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性上调。45.如实施方式44所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性上调。46.如实施方式45所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性上调。47.如实施方式42所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-34b-4373037 检测。48.如实施方式40所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。49.如实施方式48所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。50.如实施方式49所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。51.如实施方式50所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。52.如实施方式51所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。53.如实施方式48所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-1-4373161 检测。54.如实施方式42所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱还包含通过 表3或5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。55.如实施方式54所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。56.如实施方式55所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。57.如实施方式56所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。58.如实施方式57所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。59.如实施方式54所述的方法，其中通过表3或5中所标示的检测物检测的所述 至少一种 miRNA 为 hsa-miR-1-4373161。60.如实施方式40所述的方法，其中所述药剂为生物药剂。61.如实施方式60所述的方法，其中所述药剂为抗体。62.如实施方式61所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。63.如实施方式61所述的方法，其中所述抗体是对一种或多种I型IFN或IFN α 亚型特异性的但不是MEDI-545。64.如实施方式40所述的方法，其中所述药剂的施用减轻疾病或疾患的一种或多 种症状。
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65.如实施方式61所述的方法其中所述抗体以大约0. 03和30mg/kg之间的剂量 施用。66.如实施方式65所述的方法，其中所述抗体以0. 3和3mg/kg之间的剂量施用。67.如实施方式66所述的方法，其中所述抗体以0.03和lmg/kg之间的剂量施用。68.如实施方式40所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少10%。69.如实施方式68所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少20%。70.如实施方式69所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少30%。71.如实施方式70所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少40%。72.如实施方式71所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少50%。73.如实施方式40所述的方法，其中所述患者已被诊断为患有狼疮、银屑病、血管 炎、结节病、舍格伦综合征或肌炎之一。74.如实施方式73所述的方法，其中所述患者已被诊断为患有肌炎。75.如实施方式40所述的方法，其中所述患者还包含至少IFNa亚型1、2、8和14 的表达或活性上调。76.如实施方式41所示的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱在所述患者 的全血中检测。77.如实施方式41所示的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱在所述患者 的肌肉组织中检测。78.如实施方式40所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱是强的或中等的。79. 一种监测或预测患者的炎性疾病进展的方法，所述方法包括获得来自患者的第一样品中的第一差异调节的miRNA标志物谱。80.如实施方式79所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通 过表2或4中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性上调。81.如实施方式80所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通 过表2或4中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性上调。82.如实施方式81所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通 过表2或4中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性上调。83.如实施方式82所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通 过表2或4中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性上调。84.如实施方式83所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通 过表2或4中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性上调。85.如实施方式80所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-34b-4373037 检测。
86.如实施方式79所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。87.如实施方式86所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通 过表3或5中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。88.如实施方式87所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通 过表3或5中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。89.如实施方式88所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通 过表3或5中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。90.如实施方式89所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通 过表3或5中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。91.如实施方式86所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-1-4373161 检测。92.如实施方式80所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱还包含 通过表3或5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。93.如实施方式92所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。94.如实施方式93所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。95.如实施方式94所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。96.如实施方式95所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。97.如实施方式92所述的方法，其中通过表3或5中所标示的检测物检测的所述 至少一种 miRNA 为 hsa-miR-1-4373161。98.如实施方式79所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱是强谱 并且所述患者预测为疾病进展。99.如实施方式98所述的方法，其中所述强谱包含健康个体的至少10倍的miRNA
差异表达。100.如实施方式98所述的方法，其中所述自身免疫疾病是肌炎。101.如实施方式79所述的方法，其中第一 IFNa诱导性PD标志物表达谱是弱谱 并且所述患者预测为疾病消退。102.如实施方式101所述的方法，其中所述弱谱包含不超过健康个体的2倍的 miRNA差异表达。103.如实施方式98所述的方法，其中所述强谱指示医师改变疾病治疗。104.如实施方式79所述的方法，所述方法还包括获得来自患者的第二样品中的第二差异调节的miRNA标志物谱。其中第二谱相对于第一谱的miRNA标志物的数目或水平增加预测疾病进展；或其中第二谱相对于第一谱的miRNA标志物的数目或水平降低预测疾病消退。105. 一种监测接受治疗剂治疗的患者的自身免疫疾病或炎性疾病进展的方法，所述方法包括获得来自所述患者的第一样品中的第一 miRNA谱。施用治疗剂；获得来自所述患者的第二样品中的第二 miRNA谱；以及比较所述第一 miRNA谱和所述第二 miRNA谱，其中所述第一 miRNA谱与所述第二 miRNA谱之间的变化表明治疗剂的效力水平。106.如实施方式105所述的方法，其中所述第一 miRNA谱包含通过表2或4中所 标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性上调。107.如实施方式106所述的方法，其中所述第一 miRNA谱包含通过表2或4中所 标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性上调。108.如实施方式107所述的方法，其中所述第一 miRNA谱包含通过表2或4中所 标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性上调。109.如实施方式108所述的方法，其中所述第一 miRNA标志物谱包含通过表2或 4中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性上调。110.如实施方式109所述的方法，其中所述第一 miRNA谱包含通过表2或4中所 标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性上调。111.如实施方式106所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-34b-4373037 检测。112.如实施方式105所述的方法，其中所述第一 miRNA谱包含通过表3或5中所 标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。113.如实施方式112所述的方法，其中所述第一 miRNA谱包含通过表3或5中所 标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。114.如实施方式113所述的方法，其中所述第一 miRNA谱包含通过表3或5中所 标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。115.如实施方式114所述的方法，其中所述第一 miRNA谱包含通过表3或5中所 标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。116.如实施方式115所述的方法，其中所述第一 miRNA谱包含通过表3或5中所 标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。117.如实施方式112所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-1-4373161 检测。118.如实施方式106所述的方法，其中所述第一 miRNA谱还包含通过表3或5中 所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。119.如实施方式118所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所 标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。120.如实施方式119所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所 标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。121.如实施方式120所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所 标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。122.如实施方式121所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所
56标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。123.如实施方式118所述的方法，其中通过表3或5中所标示的检测物检测的所 述至少一种 miRNA 为 hsa-miR-1-4373161。124.如实施方式105所述的方法，其中所述自身免疫疾病或炎性疾病是狼疮、特 发性炎性肌炎、舍格伦综合征、血管炎、结节病或银屑病。125.如实施方式124所述的方法，其中所述自身免疫疾病是特发性炎性肌炎。126.如实施方式105所述的方法，其中所述治疗剂为小分子或生物药剂。127.如实施方式126所述的方法，其中所述生物药剂为抗体。128.如实施方式127所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。129.如实施方式105所述的方法，其中所述第一 miRNA谱在施用所述治疗剂之前 获得。130.如实施方式105所述的方法，其中所述第一 miRNA谱在施用所述治疗剂之时获得。131.如实施方式105所述的方法，其中所述第一样品和所述第二样品是全血、肌 肉或血清。132.如实施方式105所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第三样品 中的第三miRNA谱。133.如实施方式132所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第四样品 中的第四miRNA谱。134.如实施方式133所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第五样品 中的第五miRNA谱。135.如实施方式134所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第六样品 中的第六miRNA谱。136.如实施方式105所述的方法，其中所述第二样品在施用所述治疗剂之后至少 一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。137.如实施方式132所述的方法，其中所述第三样品在获得所述第二样品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。138.如实施方式133所述的方法，其中所述第四样品在获得所述第三样品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。139.如实施方式134所述的方法，其中所述第五样品在获得所述第四样品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。140.如实施方式105所述的方法，其中变化是所述患者的差异miRNA水平相对于 健康水平的降低。141.如实施方式105所述的方法，其中变化是所述患者的差异miRNA水平相对于 健康水平的增加。142.如实施方式141所述的方法，其中所述差异miRNA水平的增加指示疾病预后 不良(poor disease prognosis)或疾病将复发。143.如实施方式141所述的方法，其中所述患者的差异miRNA水平的增加指示所 述患者的治疗的改变。
144. 一种治疗肌炎患者的方法，所述方法包括施用结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂；其中所述患者包含I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表达谱；并且其中所述药剂中和所述患者的所述I型IFN或IFNa -诱导性PD标志物表达谱。145.如实施方式144所述的方法，所述方法还包括检测所述患者的所述I型IFN 或IFNa诱导性PD标志物表达谱的中和。146.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表 达谱包含下列基因的表达或活性上调MX1、LY6E、IFI27、0AS1 IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2 和 IFI44。147.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物 表达谱包含下列基因的表达或活性上调LAMP3、SIGLEC1、DNAPTP6、IFIT2、ETV7、RTP4、 SERPING1、HERC5、XAF1、MX1、EPSTI1、0AS2、0AS1、0AS3、IFIT3、IFI6、USP18、RSAD2、IFI44、 LY6E、ISG15 和 IFI27。148.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表 达谱包含下列基因的表达或活性上调EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、 IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。149.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物 表达谱包含下列基因的表达或活性上调DNAPTP6、EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、 IFI6、IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、PLSCR1、RSAD2、RTP4、 SIGLEC1和 USP18。150.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物 表达谱包含下列基因的表达或活性上调SAMD9L、IFI6、IFI44、IFIT2、0AS1、IFI27、0AS3、 IFI44L、HERC5、IFIT1、EPSTI1、ISG15、SERPING1、OASL、GBP1 和 MX1。151.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物 表达谱包含下列基因的表达或活性上调IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、 ISG15、LAMP3、0AS3、0AS1、EPSTI1、IFIT3、0AS2、SIGLEC1和 USP18。152.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表 达谱包含下列基因的表达或活性上调IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L和IFI27。153.如实施方式144所述的方法，其中所述药剂为生物药剂。154.如实施方式153所述的方法，其中所述药剂为抗体。155.如实施方式154所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。156.如实施方式154所述的方法，其中所述抗体是对一种或多种I型IFN或IFNa 亚型特异性的但不是MEDI-545。157.如实施方式144所述的方法，其中所述药剂的施用减轻一种或多种肌炎症 状。158.如实施方式154所述的方法，其中所述抗体以大约0.03和30mg/kg之间的剂
量施用。159.如实施方式158所述的方法，其中所述抗体以0.3和3mg/kg之间的剂量施用。160.如实施方式159所述的方法，其中所述抗体以0. 03和lmg/kg之间的剂量施用。161.如实施方式153-155中任一项所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述 I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表达谱中和至少10%。162.如实施方式144所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述I型IFN或 IFN a诱导性PD标志物表达谱中和至少20%。163.如实施方式162所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述I型IFN或 IFN a诱导性PD标志物表达谱中和至少30%。164.如实施方式163所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述I型IFN或 IFN a诱导性PD标志物表达谱中和至少40 %。165.如实施方式164所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述I型IFN或 IFN a诱导性PD标志物表达谱中和至少50%。166.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表 达谱包含至少IFNa亚型1、2、8和14的表达或活性上调。167.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表 达谱包含PD标志物基因的转录物。168.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表 达谱包含由PD标志物基因所表达的多肽。169. 一种监测或预测患者的肌炎疾病进展的方法，所述方法包括获得来自患者的第一样品中的第一 IFN a -诱导性PD标志物表达谱。170.如实施方式169所述的方法，其中所述第一 IFN a诱导性PD标志物表达谱是 强谱并且所述患者预测为肌炎疾病进展。171.如实施方式170所述的方法，其中所述第一 IFNa诱导性PD标志物表达谱 包含下列基因的过量表达或活性(overexpression or activity) :EPSTI1、HERC5、IFI27、 IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、RSAD2、RTP4、 SIGLEC1和 USP18。172.如实施方式169所述的方法，其中所述第一 IFN a诱导性PD标志物表达谱是 弱谱并且所述患者预测为肌炎疾病消退。173.如实施方式169所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第二样品中的第二 IFNa-诱导性PD标志物表达谱。其中第二表达谱相对于第一表达谱的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目 或水平增加预测肌炎疾病进展；或其中第二表达谱相对于第一表达谱的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目 或水平降低预测肌炎疾病消退。174. 一种监测接受治疗剂治疗的患者的肌炎疾病进展的方法，所述方法包括获得来自所述患者的第一样品中的第一 IFNa-诱导性PD标志物表达谱；施用治疗剂；获得来自所述患者的第二样品中的第二 IFNa-诱导性PD标志物表达谱；以及
比较所述第一 IFN a -诱导性PD标志物表达谱和所述第二 IFN a -诱导性PD标志 物表达谱。其中所述第一 IFN a -诱导性PD标志物表达谱与所述第二 IFN a -诱导性PD标志 物表达谱之间的变化表明治疗剂的效力水平。175.如实施方式174所述的方法，其中包含表达或活性上调的基因谱的所述第一 I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱包含下列基因的过量表达或活性EPSTI1、HERC5、 IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、 RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。176.如实施方式174所述的方法，其中所述变化是基因的表达或活性上调水平的 降低。177.如实施方式174所述的方法，其中所述治疗剂为小分子或生物药剂。178.如实施方式177所述的方法，其中所述治疗剂为结合并调控IFNa活性的生 物药剂。179.如实施方式178所述的方法，其中所述生物药剂为抗体。180.如实施方式179所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。181.如实施方式179所述的方法，其中所述抗体结合至少一种IFNa亚型但不是 MEDI-545。182.如实施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa诱导性PD标志物表达谱在 施用所述治疗剂之前获得。183.如实施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa诱导性PD标志物表达谱在 施用所述治疗剂之时获得。184.如实施方式174所述的方法，其中所述第一样品和所述第二样品是全血、肌 肉或血清。185.如实施方式174所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第三样品 中的第三IFNa -诱导性PD标志物表达谱。186.如实施方式185所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第四样品 中的第四IFNa -诱导性PD标志物表达谱。187.如实施方式186所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第五样品 中的第五IFNa -诱导性PD标志物表达谱。188.如实施方式187所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第六样品 中的第六IFNa -诱导性PD标志物表达谱。189.如实施方式174所述的方法，其中所述第二样品在施用所述治疗剂之后至少 一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。190.如实施方式185所述的方法，其中所述第三样品在获得所述第二样品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。191.如186所述的方法，其中所述第四样品在获得所述第三样品之后至少2天、至 少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。192.如实施方式187所述的方法，其中所述第五样品在获得所述第四样品之后至 少2天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。
193.如实施方式174所述的方法，其中变化是基因的表达或活性上调的降低。194.如实施方式193所述的方法，其中所述降低为至少10%、至少20%、至少 25%、至少30%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少 80%、至少85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%。195.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表 达谱包含下列基因的表达或活性上调IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、0AS1、IFIT1、ISG15、 0AS3、HERC5、MX1、ESPTI1、IFIT3和 IFI6。196.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表 达谱包含下列基因的表达或活性上调IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。197.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表 达谱包含基因IFI44L和RSAD2的表达或活性上调。198.如实施方式169所述的方法，其中所述第一 IFNa诱导性PD标志物表达谱 包含下列基因的表达或活性上调IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、0AS1、IFIT1、ISG15、0AS3、 HERC5、MX1、ESPTI1、IFIT3和 IFI6。199.如实施方式169所述的方法，其中所述第一 IFN a诱导性PD标志物表达谱包 含下列基因的表达或活性上调IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。200.如实施方式169所述的方法，其中所述第一 IFN a诱导性PD标志物表达谱包 含基因IFI44L和RSAD2的表达或活性上调。201.如实施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa诱导性PD标志物表达谱 包含下列基因的表达或活性上调IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、0AS1、IFIT1、ISG15、0AS3、 HERC5、MX1、ESPTI1、IFIT3和 IFI6。202.如实施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa诱导性PD标志物表达谱包 含下列基因的表达或活性上调IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。203.如实施方式174所述的方法，其中所述第一 IFNa诱导性PD标志物表达谱包 含基因IFI44L和RSAD2的表达或活性上调。204.如实施方式1所述的方法，其中所述患者具有强的I型IFN或IFNa诱导性 基因标记评分。205.如实施方式1所述的方法，其中所述患者具有中等的I型IFN或IFN a诱导 性基因标记评分。206.如实施方式204所述的方法，其中强的评分大于或等于10。207.如实施方式205所述的方法，其中中等的评分大于或等于4但小于10。208.如实施方式35或74所述的方法，其中所述肌炎为DM或PM。209.如实施方式144所述的方法，其中所述肌炎患者为DM或PM患者。210.如实施方式144所述的方法，其中所述肌炎患者包含大于6的MITAX评分。211.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性基因标记评 分是强的。212.如实施方式144所述的方法，其中所述I型IFN或IFN a诱导性基因标记评 分是中等的。213.如实施方式211所述的方法，其中所述评分大于或等于10。
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214.如实施方式212所述的方法，其中所述评分大于或等于4但小于10。215.如实施方式174所述的方法，其中所述第一 IFN a -诱导性PD标志物表达谱 包含强的I型IFN或IFNa诱导性基因标记评分。216.如实施方式215所述的方法，其中强的评分为大于或等于10的评分。217.如实施方式174所述的方法，其中所述第一 IFN a -诱导性PD标志物表达谱 包含中等的I型IFN或IFNa诱导性基因标记评分。218.如实施方式217所述的方法，其中中等的评分为大于或等于4但小于10的评 分。本说明书中所提到的所有的出版物、专利和专利申请均通过引用并入本说明书， 并入程度如同特定且单独地指出各单独的出版物、专利或专利申请通过引用并入本文。此申请为了所有的目的通过引用并入了 2006年12月6日提交的美国临时申请 系列第60/873，008号、2007年4月16日提交的美国临时申请系列第60/907，762号、2007 年5月3日提交的美国临时申请系列第60/924，219号、2007年5月21日提交的美国临时 申请系列第60/924，584号、2007年9月19日提交的美国临时申请系列第60/960, 187号、 2007年11月5日提交的美国临时申请系列第60/996，176号和2007年12月6日提交的 PCT申请第PCT/US2007/024947号。此申请还为了所有的目的通过引用并入了 2008年6月 20日提交的美国临时申请系列第61/129，366号和2008年5月5日提交的PCT申请第PCT/ US2008/062646号。此申请还为了所有的目的通过引用并入了 2007年5月3日提交的美国 临时申请系列第60/924，220号、2007年11月6日提交的名称为“Auto-Antibody Markers of Autoimmune Disease (自身免疫疾病的自身抗体标志物)”的美国临时申请(系列号 60/996，219)、2007 年 12 月 6 日提交的名称为 “Auto-Antibody Markers of Autoimmune Disease (自身免疫疾病的自身抗体标志物)”的美国临时申请(系列号60/996，820)以及 2008年5月5日提交的PCT申请第PCT/US2008/062639号。此外，此申请要求2008年2月8日提交的美国临时申请系列第61/006，963号的 优先权，为了所有的目的通过引用将其并入本文。提供的下列实施例组仅为了示例的目的，并且本发明绝不能被理解为只限于这些 实施例。
实施例实施例la 在DM患者肌肉样品中上调最明显的基因大部分是IFNa /g诱导性的检测了 DM肌肉样品以测定在DM患者中上调最明显的基因。总RNA 提取和微阵列处理使用 Qiagen RNeasy Fibrous Tissue Mini(Hilden, Germany)从PAXgene肌肉活组织检查提取总RNA。以分光光度法测定RNA纯度和浓度 (260/280 > 1. 9) o 使用 RNA 6000 Nano LabChip 在 Agilent 2100 生物分析仪上估计 RNA 的质量。使用Affymetrix GeneChip -轮式(One-Cycle) cDNA 合成试剂盒(One-Cycle cDNA Synthesis kit)和 Affymetrix GeneChip IVT 标记试剂盒完成由 2 ii g 总 RNA 产生 生物素标记的扩增的cRNA。以分光光度法测定cRNA产物的浓度和纯度。将20微克的每种 生物素标记的cRNA片段化以便在Affymetrix人基因组U1332. 0+GeneChip 阵列上杂交。按照Affymetrix GeneChip 手册中的概述制备用于杂交的片段化cRNA。在设置为45 口 的320型旋转杂交炉中进行杂交过夜。所有的GeneChip 洗涤和染色步骤均在Affymetrix 450 型射流工作站(Fluidics station)上进行。在 Affymetrix GeneChip 扫描仪 3000 上 扫描阵列。用GeneChip操作软件(GeneChip Operating Software (GCOS))工具进行数据 捕获和初始阵列的质量估计。结果在DM患者的肌肉样本中上调最明显的基因大部分是IFNa/0诱导性的。 参见图la，它提供了在DM患者肌肉样品中上调最明显的基因的列表，以及在DM患者肌肉样 品中的那些基因相对于健康对照肌肉样品的上调倍数。还参见图lb，它提供了在DM和PM 患者的肌肉中IFNa/3诱导性基因标记评分的散点图。实施例lb 在大多数DM或PM患者血样中I型IFN诱导件基因的过表汰评定了 DM和PM患者的血液中I型IFM诱导性基因过表达的流行率(Prevalence) 和量值。患者和患者样品在此研究中使用两组患者。第一组包括来自单个医院中心的24 名肌炎患者(15名患DM，9名患PM)，他们预期将被募集到外周WB样品中的全基因组基因表 达与包括疾病活性的临床特征之间的关联的纵向调查研究中。在多达6年的期间内(此研 究的平均参与时间为1. 9年)收集共150次患者随访的临床数据和80次患者随访的基因 表达数据。那些患者的临床特征总结在下表6中。表6. 24名DM和PM患者的临床特征
权利要求
1.一种治疗患有I型IFN或IFNα介导的疾病或疾患的患者的方法，所述方法包括施用结合并调控I型IFN或IFN α活性的药剂；其中所述患者包含差异调节的miRNA标志物谱；并且其中所述药剂中和所述患者的所述差异调节的miRNA标志物谱。
2.如权利要求1所述的方法，所述方法还包括检测所述患者的所述差异调节的miRNA 标志物谱的中和。
3.如权利要求1所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或4 中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性上调。
4.如权利要求3所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或4 中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性上调。
5.如权利要求4所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或4 中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性上调。
6.如权利要求5所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或4 中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性上调。
7.如权利要求6所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或4 中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性上调。
8.如权利要求3所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-34b-4373037 检测。
9.如权利要求1所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或5 中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。
10.如权利要求9所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或5 中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。
11.如权利要求10所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或 5中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。
12.如权利要求11所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或 5中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。
13.如权利要求12所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或 5中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。
14.如权利要求9所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-1-4373161 检测。
15.如权利要求3所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱还包含通过表3或 5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。
16.如权利要求15所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。
17.如权利要求16所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。
18.如权利要求17所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。
19.如权利要求18所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。
20.如权利要求15所述的方法，其中通过表3或5中所标示的检测物检测的所述至少 一种 miRNA 为 hsa-miR-1-4373161。
21.如权利要求1所述的方法，其中所述药剂为生物药剂。
22.如权利要求21所述的方法，其中所述药剂为抗体。
23.如权利要求22所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。
24.如权利要求22所述的方法，其中所述抗体是对一种或多种I型IFN或IFNa亚型 特异性的但不是MEDI-545。
25.如权利要求1所述的方法，其中所述药剂的施用减轻所述疾病或疾患的一种或多 种症状。
26.如权利要求22所述的方法其中所述抗体以大约0.03和30mg/kg之间的剂量施用。
27.如权利要求26所述的方法，其中所述抗体以0.3和3mg/kg之间的剂量施用。
28.如权利要求27所述的方法，其中所述抗体以0.03和lmg/kg之间的剂量施用。
29.如权利要求21中任一项所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱中和至少10%。
30.如权利要求29所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的miRNA标 志物谱中和至少20%。
31.如权利要求30所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的miRNA标 志物谱中和至少30%。
32.如权利要求31所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的miRNA标 志物谱中和至少40%。
33.如权利要求32所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的miRNA标 志物谱中和至少50%。
34.如权利要求1所述的方法，其中所述疾病或疾患是狼疮、银屑病、血管炎、结节病、 舍格伦综合征或肌炎之一。
35.如权利要求34所述的方法，其中所述疾病或疾患是肌炎。
36.如权利要求1所述的方法，其中所述患者还包含至少IFNα亚型1、2、8和14的表 达或活性上调。
37.如权利要求2所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱在所述患者的全血 中检测。
38.如权利要求2所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱在所述患者的肌肉 组织中检测。
39.如权利要求1所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱是强的或中等的。
40.一种在需要其的患者中中和差异调节的miRNA标志物谱的方法，所述方法包括给所述患者施用结合并调控I型IFN或IFN α活性的药剂；其中所述药剂中和所述患者的所述差异调节的miRNA标志物谱。
41.如权利要求40所述的方法，所述方法还包括检测所述患者的所述差异调节的 miRNA标志物谱的中和。
42.如权利要求40所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或4中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性上调。
43.如权利要求42所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或 4中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性上调。
44.如权利要求43所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或 4中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性上调。
45.如权利要求44所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或 4中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性上调。
46.如权利要求45所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表2或 4中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性上调。
47.如权利要求42所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-34b-4373037 检测。
48.如权利要求40所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或 5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。
49.如权利要求48所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或 5中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。
50.如权利要求49所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或 5中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。
51.如权利要求50所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或 5中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。
52.如权利要求51所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱包含通过表3或 5中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。
53.如权利要求48所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-1-4373161 检测。
54.如权利要求42所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱还包含通过表3 或5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。
55.如权利要求54所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。
56.如权利要求55所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。
57.如权利要求56所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。
58.如权利要求57所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。
59.如权利要求54所述的方法，其中通过表3或5中所标示的检测物检测的所述至少 一种 miRNA 为 hsa-miR-1-4373161。
60.如权利要求40所述的方法，其中所述药剂为生物药剂。
61.如权利要求60所述的方法，其中所述药剂为抗体。
62.如权利要求61所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。
63.如权利要求61所述的方法，其中所述抗体是对一种或多种I型IFN或IFNa亚型特异性的但不是MEDI-545。
64.如权利要求40所述的方法，其中所述药剂的施用减轻疾病或疾患的一种或多种症状。
65.如权利要求61所述的方法其中所述抗体以大约0.03和30mg/kg之间的剂量施用。
66.如权利要求65所述的方法，其中所述抗体以0.3和3mg/kg之间的剂量施用。
67.如权利要求66所述的方法，其中所述抗体以0.03和lmg/kg之间的剂量施用。
68.如权利要求40所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的miRNA标 志物谱中和至少10%。
69.如权利要求68所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的miRNA标 志物谱中和至少20%。
70.如权利要求69所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的miRNA标 志物谱中和至少30%。
71.如权利要求70所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的miRNA标 志物谱中和至少40%。
72.如权利要求71所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述差异调节的miRNA标 志物谱中和至少50%。
73.如权利要求40所述的方法，其中所述患者已被诊断为患有狼疮、银屑病、血管炎、 结节病、舍格伦综合征或肌炎之一。
74.如权利要求73所述的方法，其中所述患者已被诊断为患有肌炎。
75.如权利要求40所述的方法，其中所述患者还包含至少IFNα亚型1、2、8和14的表 达或活性上调。
76.如权利要求41所示的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱在所述患者的全 血中检测。
77.如权利要求41所示的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱在所述患者的肌 肉组织中检测。
78.如权利要求40所述的方法，其中所述差异调节的miRNA标志物谱是强的或中等的。
79.—种监测或预测患者的炎性疾病进展的方法，所述方法包括获得来自患者的第一样品中的第一差异调节的miRNA标志物谱。
80.如权利要求79所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性上调。
81.如权利要求80所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性上调。
82.如权利要求81所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性上调。
83.如权利要求82所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性上调。
84.如权利要求83所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 2或4中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性上调。
85.如权利要求80所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物hsa-miR-34b-4373037 检测。
86.如权利要求79所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。
87.如权利要求86所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。
88.如权利要求87所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。
89.如权利要求88所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。
90.如权利要求89所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱包含通过表 3或5中所标示的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。
91.如权利要求86所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-1-4373161 检测。
92.如权利要求80所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱还包含通过 表3或5中所标示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。
93.如权利要求92所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。
94.如权利要求93所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。
95.如权利要求94所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。
96.如权利要求95所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示的 检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。
97.如权利要求92所述的方法，其中通过表3或5中所标示的检测物检测的所述至少 一种 miRNA 为 hsa-miR-1-4373161。
98.如权利要求79所述的方法，其中所述第一差异调节的miRNA标志物谱是强谱并且 所述患者预测为疾病进展。
99.如权利要求98所述的方法，其中所述强谱包含健康个体的至少10倍的miRNA差异 表达。
100.如权利要求98所述的方法，其中所述自身免疫疾病是肌炎。
101.如权利要求79所述的方法，其中第一IFN a诱导性PD标志物表达谱是弱谱并且 所述患者预测为疾病消退。
102.如权利要求101所述的方法，其中所述弱谱包含不超过健康个体的2倍的miRNA差异表达。
103.如权利要求98所述的方法，其中所述强谱指示医师改变疾病治疗。
104.如权利要求79所述的方法，所述方法还包括获得来自患者的第二样品中的第二差异调节的miRNA标志物谱。其中第二谱相对于第一谱的miRNA标志物的数目或水平增加预测疾病进展；或其中第二谱相对于第一谱的miRNA标志物的数目或水平降低预测疾病消退。
105.一种监测接受治疗剂治疗的患者的自身免疫疾病或炎性疾病进展的方法，所述方 法包括获得来自所述患者的第一样品中的第一 miRNA谱。施用治疗剂；获得来自所述患者的第二样品中的第二 miRNA谱；以及比较所述第一 miRNA谱和所述第二 miRNA谱，其中所述第一 miRNA谱与所述第二 miRNA谱之间的变化表明治疗剂的效力水平。
106.如权利要求105所述的方法，其中所述第一miRNA谱包含通过表2或4中所标示 的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性上调。
107.如权利要求106所述的方法，其中所述第一miRNA谱包含通过表2或4中所标示 的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性上调。
108.如权利要求107所述的方法，其中所述第一miRNA谱包含通过表2或4中所标示 的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性上调。
109.如权利要求108所述的方法，其中所述第一miRNA标志物谱包含通过表2或4中 所标示的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性上调。
110.如权利要求109所述的方法，其中所述第一miRNA谱包含通过表2或4中所标示 的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性上调。
111.如权利要求106所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-34b-4373037 检测。
112.如权利要求105所述的方法，其中所述第一miRNA谱包含通过表3或5中所标示 的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。
113.如权利要求112所述的方法，其中所述第一miRNA谱包含通过表3或5中所标示 的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。
114.如权利要求113所述的方法，其中所述第一miRNA谱包含通过表3或5中所标示 的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。
115.如权利要求114所述的方法，其中所述第一miRNA谱包含通过表3或5中所标示 的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。
116.如权利要求115所述的方法，其中所述第一miRNA谱包含通过表3或5中所标示 的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。
117.如权利要求112所述的方法，其中所述至少一种miRNA通过检测物 hsa-miR-1-4373161 检测。
118.如权利要求106所述的方法，其中所述第一miRNA谱还包含通过表3或5中所标 示的检测物检测的至少一种miRNA的表达或活性下调。
119.如权利要求118所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示 的检测物检测的至少两种miRNA的表达或活性下调。
120.如权利要求119所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示 的检测物检测的至少五种miRNA的表达或活性下调。
121.如权利要求120所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示 的检测物检测的至少十种miRNA的表达或活性下调。
122.如权利要求121所述的方法，其中所述表达或活性下调是通过表3或5中所标示 的检测物检测的至少十五种miRNA的表达或活性下调。
123.如权利要求118所述的方法，其中通过表3或5中所标示的检测物检测的所述至 少一种 miRNA 为 hsa-miR-1-4373161。
124.如权利要求105所述的方法，其中所述自身免疫疾病或炎性疾病是狼疮、特发性 炎性肌炎、舍格伦综合征、血管炎、结节病或银屑病。
125.如权利要求124所述的方法，其中所述自身免疫疾病是特发性炎性肌炎。
126.如权利要求105所述的方法，其中所述治疗剂为小分子或生物药剂。
127.如权利要求126所述的方法，其中所述生物药剂为抗体。
128.如权利要求127所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。
129.如权利要求105所述的方法，其中所述第一miRNA谱在施用所述治疗剂之前获得。
130.如权利要求105所述的方法，其中所述第一miRNA谱在施用所述治疗剂之时获得。
131.如权利要求105所述的方法，其中所述第一样品和所述第二样品是全血、肌肉或 血清。
132.如权利要求105所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第三样品中的 第三miRNA谱。
133.如权利要求132所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第四样品中的 第四miRNA谱。
134.如权利要求133所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第五样品中的 第五miRNA谱。
135.如权利要求134所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第六样品中的 第六miRNA谱。
136.如权利要求105所述的方法，其中所述第二样品在施用所述治疗剂之后至少一 周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。
137.如权利要求132所述的方法，其中所述第三样品在获得所述第二样品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。
138.如权利要求133所述的方法，其中所述第四样品在获得所述第三样品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。
139.如权利要求134所述的方法，其中所述第五样品在获得所述第四样品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。
140.如权利要求105所述的方法，其中变化是所述患者的差异miRNA水平相对于健康 水平的降低。
141.如权利要求105所述的方法，其中变化是所述患者的差异miRNA水平相对于健康 水平的增加。
142.如权利要求141所述的方法，其中所述差异miRNA水平的增加指示疾病预后不良 或疾病将复发。
143.如权利要求141所述的方法，其中所述患者的差异miRNA水平的增加指示所述患 者的治疗的改变。
144.一种治疗肌炎患者的方法，所述方法包括施用结合并调控I型IFN或IFNa活性的药剂；其中所述患者包含I型IFN或IFN a诱导性PD标志物表达谱；并且其中所述药剂中和所述患者的所述I型IFN或IFN a -诱导性PD标志物表达谱。
145.如权利要求144所述的方法，所述方法还包括检测所述患者的所述I型IFN或 IFNa诱导性PD标志物表达谱的中和。
146.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达 谱包含下列基因的表达或活性上调MX1、LY6E、IFI27、0AS1IFIT1、IFI6、IFI44L、ISG15、 LAMP3、OASL, RSAD2 和 IFI44。
147.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱 包含下列基因的表达或活性上调LAMP3、SIGLEC1、DNAPTP6、IFIT2、ETV7、RTP4、SERPING1、 HERC5、XAF1、MX1、EPSTI1、0AS2、0AS1、0AS3、IFIT3、IFI6、USP18、RSAD2、IFI44、LY6E、ISG15 和 IFI27。
148.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达 谱包含下列基因的表达或活性上调EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、 IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。
149.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达 谱包含下列基因的表达或活性上调DNAPTP6、EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、 IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、PLSCR1、RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。
150.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱 包含下列基因的表达或活性上调SAMD9L、IFI6、IFI44、IFIT2、0AS1、IFI27、0AS3、IFI44L、 HERC5、IFIT1、EPST11、ISG15、SERPING1、0ASL、GBP 1 和 MX 1。
151.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱 包含下列基因的表达或活性上调IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L、IFI27、MX1、IFIT1、ISG15、 LAMP3、0AS3、0AS1、EPSTI1、IFIT3、0AS2、SIGLEC1 禾口 USP18。
152.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱 包含下列基因的表达或活性上调IFI6、RSAD2、IFI44、IFI44L和IFI27。
153.如权利要求144所述的方法，其中所述药剂为生物药剂。
154.如权利要求153所述的方法，其中所述药剂为抗体。
155.如权利要求154所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。
156.如权利要求154所述的方法，其中所述抗体是对一种或多种I型IFN或IFNa亚 型特异性的但不是MEDI-545。
157.如权利要求144所述的方法，其中所述药剂的施用减轻一种或多种肌炎症状。
158.如权利要求154所述的方法，其中所述抗体以大约0.03和30mg/kg之间的剂量施用。
159.如权利要求158所述的方法，其中所述抗体以0.3和3mg/kg之间的剂量施用。
160.如权利要求159所述的方法，其中所述抗体以0.03和1mg/kg之间的剂量施用。
161.如权利要求153-155中任一项所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述I型 IFN或IFN a诱导性PD标志物表达谱中和至少10%。
162.如权利要求144所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述I型IFN或IFNa 诱导性PD标志物表达谱中和至少20%。
163.如权利要求162所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述I型IFN或IFNa 诱导性PD标志物表达谱中和至少30%。
164.如权利要求163所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述I型IFN或IFNa 诱导性PD标志物表达谱中和至少40%。
165.如权利要求164所述的方法，其中所述药剂将所述患者的所述I型IFN或IFNa 诱导性PD标志物表达谱中和至少50%。
166.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα诱导性PD标志物表达谱 包含至少IFNa亚型1、2、8和14的表达或活性上调。
167.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα诱导性PD标志物表达谱 包含PD标志物基因的转录物。
168.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα诱导性PD标志物表达谱 包含由PD标志物基因所表达的多肽。
169.—种监测或预测患者的肌炎疾病进展的方法，所述方法包括获得来自患者的第一样品中的第一 IFN a -诱导性PD标志物表达谱。
170.如权利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α诱导性PD标志物表达谱是强谱 并且所述患者预测为肌炎疾病进展。
171.如权利要求170所述的方法，其中所述第一IFNa诱导性PD标志物表达谱包含 下列基因的过量表达或活性:EPSTIU HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFITl、IFIT3、 ISGl5、LAMP3、LY6E、MXU OASU 0AS2, 0AS3, RSAD2、RTP4、SIGLECl 和 USP18。
172.如权利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α诱导性PD标志物表达谱是弱谱 并且所述患者预测为肌炎疾病消退。
173.如权利要求169所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第二样品中的第二 IFN α-诱导性PD标志物表达谱。其中第二表达谱相对于第一表达谱的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目或水 平增加预测肌炎疾病进展；或其中第二表达谱相对于第一表达谱的I型IFN或IFNa诱导性PD标志物的数目或水 平降低预测肌炎疾病消退。
174.—种监测接受治疗剂治疗的患者的肌炎疾病进展的方法，所述方法包括获得来自所述患者的第一样品中的第一 IFN α-诱导性PD标志物表达谱；施用治疗剂；获得来自所述患者的第二样品中的第二 IFN a -诱导性PD标志物表达谱；以及比较所述第一 IFN a -诱导性PD标志物表达谱和所述第二 IFN a -诱导性PD标志物表达谱。其中所述第一 IFN a -诱导性PD标志物表达谱与所述第二 IFN a -诱导性PD标志物表 达谱之间的变化表明治疗剂的效力水平。
175.如权利要求174所述的方法，其中包含表达或活性上调的基因谱的所述第一1型IFN或IFN α诱导性PD标志物表达谱包含下列基因的过量表达或活性EPSTI1、HERC5、IFI27、IFI44、IFI44L、IFI6、IFIT1、IFIT3、ISG15、LAMP3、LY6E、MX1、0AS1、0AS2、0AS3、 RSAD2、RTP4、SIGLEC1 和 USP18。
176.如权利要求174所述的方法，其中所述变化是基因的表达或活性上调水平的降低。
177.如权利要求174所述的方法，其中所述治疗剂为小分子或生物药剂。
178.如权利要求177所述的方法，其中所述治疗剂为结合并调控IFNa活性的生物药剂。
179.如权利要求178所述的方法，其中所述生物药剂为抗体。
180.如权利要求179所述的方法，其中所述抗体为MEDI-545。
181.如权利要求179所述的方法，其中所述抗体结合至少一种IFNa亚型但不是 MEDI-545。
182.如权利要求174所述的方法，其中所述第一IFN a诱导性PD标志物表达谱在施用 所述治疗剂之前获得。
183.如权利要求174所述的方法，其中所述第一IFN a诱导性PD标志物表达谱在施用 所述治疗剂之时获得。
184.如权利要求174所述的方法，其中所述第一样品和所述第二样品是全血、肌肉或 血清。
185.如权利要求174所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第三样品中的 第三IFN a -诱导性PD标志物表达谱。
186.如权利要求185所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第四样品中的 第四IFN a -诱导性PD标志物表达谱。
187.如权利要求186所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第五样品中的 第五IFN a -诱导性PD标志物表达谱。
188.如权利要求187所述的方法，所述方法还包括获得来自所述患者的第六样品中的 第六IFN a -诱导性PD标志物表达谱。
189.如权利要求174所述的方法，其中所述第二样品在施用所述治疗剂之后至少一 周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。
190.如权利要求185所述的方法，其中所述第三样品在获得所述第二样品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。
191.如186所述的方法，其中所述第四样品在获得所述第三样品之后至少2天、至少5 天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。
192.如权利要求187所述的方法，其中所述第五样品在获得所述第四样品之后至少2 天、至少5天、至少一周、至少2周、至少三周、至少一个月或至少两个月获得。
193.如权利要求174所述的方法，其中变化是基因的表达或活性上调的降低。
194.如权利要求193所述的方法，其中所述降低为至少10%、至少20%、至少25%、至 少30%、至少40%、至少45%、至少50%、至少60%、至少70%、至少75%、至少80%、至少 85%、至少90%、至少95%、至少96%、至少97%、至少98%、至少99%或100%。
195.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNa诱导性PD标志物表达谱 包含下列基因的表达或活性上调IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、0AS1、IFIT1、ISG15、0AS3、HERC5、MXl、ESPTI1、IFIT3和 IFI6。
196.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα诱导性PD标志物表达谱 包含下列基因的表达或活性上调IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。
197.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα诱导性PD标志物表达谱 包含基因IFI44L和RSAD2的表达或活性上调。
198.如权利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α诱导性PD标志物表达谱包含下 列基因的表达或活性上调IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、OASl、IFITl、ISG15、0AS3、HERC5、 MXU ESPTIU IFIT3 和 IFI6。
199.如权利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α诱导性PD标志物表达谱包含下 列基因的表达或活性上调IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。
200.如权利要求169所述的方法，其中所述第一IFN α诱导性PD标志物表达谱包含基 因IFI44L和RSAD2的表达或活性上调。
201.如权利要求174所述的方法，其中所述第一IFN α诱导性PD标志物表达谱包含下 列基因的表达或活性上调IFI27、RSAD2、IFI44L、IFI44、OASl、IFITl、ISG15、0AS3、HERC5、 MXU ESPTIU IFIT3 和 IFI6。
202.如权利要求174所述的方法，其中所述第一IFN α诱导性PD标志物表达谱包含下 列基因的表达或活性上调IFI44L、RSAD2、IFI27和IFI44。
203.如权利要求174所述的方法，其中所述第一IFN α诱导性PD标志物表达谱包含基 因IFI44L和RSAD2的表达或活性上调。
204.如权利要求1所述的方法，其中所述患者具有强的I型IFN或IFNa诱导性基因 标记评分。
205.如权利要求1所述的方法，其中所述患者具有中等的I型FN或IFNα诱导性基因 标记评分。
206.如权利要求204所述的方法，其中强的评分大于或等于10。
207.如权利要求205所述的方法，其中中等的评分大于或等于4但小于10。
208.如权利要求35或74所述的方法，其中所述肌炎为DM或ΡΜ。
209.如权利要求144所述的方法，其中所述肌炎患者为DM或PM患者。
210.如权利要求144所述的方法，其中所述肌炎患者包含大于6的MITAX评分。
211.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα诱导性基因标记评分是 强的。
212.如权利要求144所述的方法，其中所述I型IFN或IFNα诱导性基因标记评分是 中等的。
213.如权利要求211所述的方法，其中所述评分大于或等于10。
214.如权利要求212所述的方法，其中所述评分大于或等于4但小于10。
215.如权利要求174所述的方法，其中所述第一IFNa-诱导性PD标志物表达谱包含 强的I型IFN或IFN α诱导性基因标记评分。
216.如权利要求215所述的方法，其中强的评分为大于或等于10的评分。
217.如权利要求174所述的方法，其中所述第一IFNa-诱导性PD标志物表达谱包含 中等的I型IFN或IFN α诱导性基因标记评分。
218.如权利要求217所述的方法，其中中等的评分为大于或等于4但小于10的评分。
全文摘要
本发明涵盖炎性疾患或自身免疫疾患如肌炎中的miRNA谱和I型IFN/IFNα诱导的PD标志物谱。所述谱还可用于例如治疗患者的方法、监测患者的疾病进展的方法以及用于诊断或提供对患有炎性疾患或自身免疫疾患的患者的预测。
文档编号A61K31/70GK101999001SQ200980112393
公开日2011年3月30日 申请日期2009年2月6日 优先权日2008年2月8日
发明者B·加莱, B·希格斯, C·莫尔豪斯, S·A·格林柏格, Y·姚 申请人:米迪缪尼有限公司;布里格姆及妇女医院股份有限公司