三唑交联的和硫醚交联的拟肽大环化合物的制作方法
【专利摘要】本文提供了拟肽大环化合物以及使用此类大环化合物治疗疾病的方法。
【专利说明】三唑交联的和硫醚交联的拟肽大环化合物 【背景技术】 人转录因子蛋白质P53响应于DNA损伤和细胞应激而诱导细胞周期停滞和凋亡，从而 在保护细胞免于恶性转化方面发挥关键作用。E3遍在蛋白连接酶MDM2(也称为HDM2)通 过中和P53反式激活活性的直接结合相互作用而负调节p53的功能，导致p53蛋白质从核 输出，并经由遍在蛋白化-蛋白酶体途径使P53降解。由缺失、突变或MDM2过表达而引起 的P53活性丧失是人类癌症的最常见缺陷。表达野生型p53的肿瘤易受到稳定或提高活性 P53浓度的药剂的攻击。在此背景下，已出现了对MDM2活性的抑制，作为经过验证的、用于 在体外和体内恢复P53活性并使癌细胞再次对凋亡敏感的方法。MDMX(MDM4)最近已被鉴定 为P53的相似的负调节剂，并且研究显示在MDM2和MDMX的p53结合界面之间具有显著的 结构同源性。P53-MDM2和p53-MDMX的蛋白质-蛋白质相互作用由p53的同一个15个残 基的α螺旋反式激活域介导，所述α螺旋反式激活域插入MDM2和MDMX的表面上的疏水 性裂隙内。Ρ53的这个域内的三个残基（F19、W23和L26)对与MDM2和MDMX的结合至关重 要。 对于能够与p53、MDM2和/或MDMX结合并调节其活性的化合物存在相当大的需求。本 文提供了能调节P53活性的基于p53的拟肽大环化合物。本文还提供了能抑制p53、MDM2 和/或MDMX蛋白之间相互作用的基于p53的拟肽大环化合物。此外，本文提供了能够用于 治疗包括但不限于癌症和其它高增生性疾病的疾病的基于P53的拟肽大环化合物。
【发明内容】
本文描述了与人P53的一部分相关的稳定交联的肽（"p53拟肽大环化合物"）。这些 交联的肽含有至少两个经修饰的氨基酸，这些氨基酸一起形成分子内交联，该分子内交联 可帮助稳定被认为对于P53与MDM2的结合和p53与MDMX的结合至关重要的p53 -部分 的α螺旋二级结构。因此，本文描述的交联多肽可具有相对于对应的非交联多肽改善的 生物活性。据认为，Ρ53拟肽大环化合物干扰ρ53与MDM2和/或ρ53与MDMX的结合，从而 释放功能性P53并抑制其破坏。本文描述的p53拟肽大环化合物可治疗性地使用，例如用 来治疗以不希望的低P53水平或低p53活性为特征的癌症和其它病症，以及/或者用来治 疗以不希望的高水平MDM2或MDMX活性为特征的癌症和其它病症。p53拟肽大环化合物也 可用于治疗与遭到破坏的P53转录途径的调节相关的任何病症（这种遭到破坏的调节旱 致过量细胞存活和增殖的病状，如癌症和自身免疫病），以及不适当的细胞周期停滞和凋亡 的病状，如神经变性和免疫缺陷。在一些实施方案中，P53拟肽大环化合物与MDM2(例如， GenBank?登录号：228952 ;gi :228952)和 / 或 MDMX(也被称为 MDM4 ;GenBank?登 录号：88702791 ;GI :88702791)结合。 在一个方面，本文提供一种拟肽大环化合物，其包含的氨基酸序列与选自表4、表4a、 表4b或表5中氨基酸序列的氨基酸序列至少约60 %、80 %、90 %或95 %相同。在一些实施 方案中，该拟肽大环化合物不是如表6、表6a、表7、表7a或表7b所不的肽。在一些实施方 案中，该拟肽大环化合物具有选自表4的氨基酸序列。在一些实施方案中，该拟肽大环化合 物具有选自表4a的氨基酸序列。在一些实施方案中，该拟肽大环化合物具有选自表4b的 氨基酸序列。在一些实施方案中，该拟肽大环化合物具有选自表5的氨基酸序列。 或者，所述拟肽大环化合物的氨基酸序列如上所述进行选择，并且进一步其中该大环 化合物不包括全碳交联或三唑。在一些实施方案中，拟肽大环化合物包含螺旋，如α-螺 旋。在其它实施方案中，拟肽大环化合物包含α，α-二取代的氨基酸。拟肽大环化合物可 包含连接至少两个氨基酸的ct-位的交联体（crosslinker)。所述两个氨基酸中的至少一 个可以是α，α -二取代的氨基酸。 在一些实施方案中，提供了下式的拟肽大环化合物：
【权利要求】
1. 下式的拟肽大环化合物：
其中： Xaa3、Xaa5、Xaa6、Xaa7、Xaa 8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的每一个单独地为氨基酸，其中 Xaa3、Xaa5、 Xaa6、Xaa7、Xaa8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的至少三个是与序列 Phe3-X4-His5-Tyr6-Trp 7-Ala8-Gln9-L eu1(l-X n-Ser12的相应位置处的氨基酸相同的氨基酸，其中各个X为氨基酸； 各个D和E独立地为氨基酸； 札和馬独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或E 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； 各个L和L'独立地为下式的大环形成连接体：
U和L2独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳基、 亚杂环芳基或[_R4-K-R4-]n，它们各自任选地被R5取代； 各个R3独立地为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被r5取代； 各个R4独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或 亚杂芳基； 各个 K 独立地为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； 各个R7独立地为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； 各个馬独立地为 -H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被R 5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； v 为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; w 为 3-1000 的整数，例如 3-500、3-200、3-100、3-50、3-30、3-20 或 3-10 ;且 η为1-5的整数。
2. 下式的拟肽大环化合物：
其中： Xaa3、Xaa5、Xaa6、Xaa7、Xaa 8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的每一个单独地为氨基酸，其中 Xaa3、Xaa5、 Xaa6、Xaa7、Xaa8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的至少三个是与序列 Phe3-X4-His5-Tyr6-Trp 7-Ala8-Gln9-L eu1(l-X n-Ser12的相应位置处的氨基酸相同的氨基酸，其中各个X为氨基酸； 各个D和E独立地为氨基酸； 札和馬独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或E 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； 各个L或L'独立地为式-U-Lf的大环形成连接体； U和L2独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳基、 亚杂环芳基或[_R4-K-R4-]n，它们各自任选地被R5取代； 为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被r5取代； U、L2和L3独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳 基、亚杂环芳基或[-R4-K-R4_]n，它们各自是未取代的或被R 5取代； 各个 K 为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 各个r4为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或亚杂芳 基； 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； R7为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； R8为_H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； v 为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; w 为 3-1000 的整数，例如 3-500、3-200、3-100、3-50、3-30、3-20 或 3-10 ;且 η为1-5的整数。
3. -种拟肽大环化合物，其包含与选自表4、4a或4b中的氨基酸序列的氨基酸序列至 少约60%相同的氨基酸序列，其中该拟肽大环化合物具有下式 ：
其中： 各个A、C、D和E独立地为氨基酸； B 为氛基酸
[-NH_L3-C〇-]、[-NH_L 3-S02-]或[-NH_L3-]; 札和馬独立地为-Η、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或Ε 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； 各个L和L'独立地为下式的大环形成连接体：
U、L2和L3独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳 基、亚杂环芳基或[-R4-K-R4_]n，它们各自任选地被R 5取代； 各个R3独立地为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被r5取代； 各个R4独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或 亚杂芳基； 各个 K 独立地为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； 各个R7独立地为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； 各个馬独立地为 -H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被R 5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； v 和 w 独立地为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; u为1-10的整数，例如1-5、1-3或1-2 ; x、y和z独立地为0-10的整数，例如x+y+z之和为2、3或6 ;且 η为1-5的整数。
4.下式的拟肽大环化合物：
其中： Xaa3、Xaa5、Xaa6、Xaa7、Xaa 8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的每一个单独地为氨基酸，其中 Xaa3、Xaa5、 Xaa6、Xaa7、Xaa8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的至少三个是与序列 Phe3-X4-Glu5-Tyr6-Trp 7-Ala8-Gln9-L eu1(l/Cba 1(|-Xn-Ala12的相应位置处的氨基酸相同的氨基酸，其中各个X为氨基酸； 各个D和E独立地为氨基酸； 札和馬独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或E 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； 各个L和L'独立地为下式的大环形成连接体：
U和L2独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳基、 亚杂环芳基或[_R4-K-R4-]n，它们各自任选地被R5取代； 为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被r5取代； 各个r4为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或亚杂芳 基； 各个 K 为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； R7为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； R8为_H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； v 为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; w 为 3-1000 的整数，例如 3-500、3-200、3-100、3-50、3-30、3-20 或 3-10 ;且 η为1-5的整数。
5. -种拟肽大环化合物，其包含与选自表6或6a中的氨基酸序列的氨基酸序列至少约 60 %相同的氨基酸序列，其中该拟肽大环化合物具有下式：
式⑴ 其中： 各个A、C、D和E独立地为氨基酸； B 为氨基酸、
[-NH_L4-C〇-]、[-NH_L 4-S02-]或[-nh_l4-]; 札和馬独立地为-Η、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或Ε 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； 为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被r5取代； ^、。、。和"独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环 芳基、亚杂环芳基或[-R4-K-R4-]n，它们各自是未取代的或被R 5取代； 各个 K 为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 各个r4为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或亚杂芳 基； 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； R7为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； R8为_H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； v 和 w 独立地为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; u为1-10的整数，例如1-5、1-3或1-2 ; x、y和z独立地为0-10的整数，例如x+y+z之和为2、3或6 ;且 η为1-5的整数， 其中该拟肽大环化合物不是表7、表7a或表7b的拟肽大环化合物。
6. 下式的拟肽大环化合物：
其中： Xaa3、Xaa5、Xaa6、Xaa7、Xaa 8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的每一个单独地为氨基酸，其中 Xaa3、Xaa5、 Xaa6、Xaa7、Xaa8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的至少三个是与序列 Phe3-X4-Glu5-Tyr6-Trp 7-Ala8-Gln9-L eu1(l/Cba 1(|-Xn-Ala12的相应位置处的氨基酸相同的氨基酸，其中各个X为氨基酸； 各个D和E独立地为氨基酸； 札和馬独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或E 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； U、L2和L3独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳 基、亚杂环芳基或[-R4-K-R4_]n，它们各自是未取代的或被R 5取代； 各个 K 为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被r5取代； 各个r4为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或亚杂芳 基； 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； R7为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； R8为_H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； v 为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; w 为 3-1000 的整数，例如 3-500、3-200、3-100、3-50、3-30、3-20 或 3-10 ;且 η为1-5的整数。
7. 下式的拟肽大环化合物：
其中： Xaa3、Xaa5、Xaa6、Xaa7、Xaa 8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的每一个单独地为氨基酸，其中 Xaa3、Xaa5、 Xaa6、Xaa7、Xaa8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的至少三个是与序列 Phe3-X4-His5-Tyr6-Trp 7-Ala8-Gln9-L eu1(l-X n-Ser12的相应位置处的氨基酸相同的氨基酸，其中各个X为氨基酸； 各个D和E独立地为氨基酸； 札和馬独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或E 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； 各个L和L'独立地为下式的大环形成连接体：
U和L2独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳基、 亚杂环芳基或[_R4-K-R4-]n，它们各自任选地被R5取代； 各个R3独立地为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被r5取代； 各个R4独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或 亚杂芳基； 各个 K 独立地为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； 各个R7独立地为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； 各个馬独立地为 -H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被R 5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； 各个R9独立地为烧基、稀基、块基、芳基、环烧基、环稀基、杂芳基或杂环基，它们是未取 代的或任选地被R a和/或Rb取代； v 为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; w 为 3-1000 的整数，例如 3-500、3-200、3-100、3-50、3-30、3-20 或 3-10 ;且 η为1-5的整数。
8.下式的拟肽大环化合物：
其中： Xaa3、Xaa5、Xaa6、Xaa7、Xaa 8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的每一个单独地为氨基酸，其中 Xaa3、Xaa5、 Xaa6、Xaa7、Xaa8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的至少三个是与序列 Phe3-X4-Glu5-Tyr6-Trp 7-Ala8-Gln9-L eu1(l/Cba 1(|-Xn-Ala12的相应位置处的氨基酸相同的氨基酸，其中各个X为氨基酸； 各个D和E独立地为氨基酸； 札和馬独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或E 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； 各个L和L'独立地为下式的大环形成连接体：
U和L2独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳基、 亚杂环芳基或[_R4-K-R4-]n，它们各自任选地被R5取代； 为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被r5取代； 各个r4为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或亚杂芳 基； 各个 K 为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； R7为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； R8为_H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； 各个R9独立地为烧基、稀基、块基、芳基、环烧基、环稀基、杂芳基或杂环基，它们是未取 代的或任选地被Ra和/或Rb取代； v 为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; w 为 3-1000 的整数，例如 3-500、3-200、3-100、3-50、3-30、3-20 或 3-10 ;且 η为1-5的整数。
9. 一种拟肽大环化合物，其包含与选自表4、4a或4b中的氨基酸序列的氨基酸序列至 少约60%相同的氨基酸序列，其中该拟肽大环化合物具有下式 ：
其中： 各个A、C、D和E独立地为氨基酸； B 为氛基酸、
[-NH-L3_C〇-]、[-NH_L 3-S02-]或[-NH_L3-]; 札和馬独立地为-Η、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或Ε 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； 各个L和L'独立地为下式的大环形成连接体：
U、L2和L3独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳 基、亚杂环芳基或[-R4-K-R4_]n，它们各自任选地被R 5取代； 各个R3独立地为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被r5取代； 各个R4独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或 亚杂芳基； 各个 K 独立地为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； 各个R7独立地为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； 各个馬独立地为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧 基、环芳基或杂环芳基，它们任选地被R 5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； 各个R9独立地为烧基、稀基、块基、芳基、环烧基、环稀基、杂芳基或杂环基，它们是未取 代的或任选地被R a和/或Rb取代； v 和 w 独立地为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; u为1-10的整数，例如1-5、1-3或1-2 ; x、y和z独立地为0-10的整数，例如x+y+z之和为2、3或6 ;且 η为1-5的整数。
10. 如权利要求7、8或9所述的拟肽大环化合物，其中各个L和L'独立地为下式的大 环形成连接体：
11. 下式的拟肽大环化合物：
其中： Xaa3、Xaa5、Xaa6、Xaa7、Xaa 8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的每一个单独地为氨基酸，其中 Xaa3、Xaa5、 Xaa6、Xaa7、Xaa8、Xaa9 和 Xaa1(l 中的至少三个是与序列 Phe3-X4-His5-Tyr6-Trp 7-Ala8-Gln9-L eu1(l-X n-Ser12的相应位置处的氨基酸相同的氨基酸，其中各个X为氨基酸； 各个D和E独立地为氨基酸； 札和馬独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基、环烷基烷基、杂烷基或杂环烷 基，它们是未取代的或被卤素-取代的；或者凡和R2中的至少一个形成连接至所述D或E 氨基酸之一的α位置的大环形成连接体L' ； 各个L或L'独立地为式-U-Lf的大环形成连接体； U和L2独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳基、 亚杂环芳基或[_R4-K-R4-]n，它们各自任选地被R5取代； 为氧、烧基、稀基、块基、芳基烧基、杂烧基、环烧基、杂环烧基、环烧基烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被r5取代； U、L2和L3独立地为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚环芳 基、亚杂环芳基或[-R4-K-R4_]n，它们各自是未取代的或被R 5取代； 各个 K 为 0、S、SO、S02、CO、C02 或 CONR3 ; 各个r4为亚烷基、亚烯基、亚炔基、亚杂烷基、亚环烷基、亚杂环烷基、亚芳基或亚杂芳 基； 各个r5独立地为卤素、烷基、-or6、-n(r6)2、-sr 6、-sor6、-so2r6、-co2r 6、荧光部分、放射 性同位素或治疗剂； 各个R6独立地为-H、烷基、烯基、炔基、芳基烷基、环烷基烷基、杂环烷基、荧光部分、放 射性同位素或治疗剂； R7为-H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与D残基形成的环状结构的一部分； R8为_H、烧基、稀基、块基、芳基烧基、环烧基、杂烧基、环烧基烧基、杂环烧基、环芳基或 杂环芳基，它们任选地被R5取代，或是与E残基形成的环状结构的一部分； v 为 1-1000 的整数，例如 1-500、1-200、1-100、1-50、1-30、1-20 或 1-10 ; w 为 3-1000 的整数，例如 3-500、3-200、3-100、3-50、3-30、3-20 或 3-10 ;且 η为1-5的整数。
12. 如权利要求1、2、4、6、7、8或11所述的拟肽大环化合物，其中Xaa5为Glu或其氨基 酸类似物。
13. 如权利要求12所述的拟肽大环化合物，其中Xaa5为Glu或其氨基酸类似物，并且 其中该拟肽大环化合物相对于其中Xaa 5为Ala的对应拟肽大环化合物具有改善的性质，如 改善的结合亲和力、改善的溶解度、改善的细胞效力、改善的螺旋度、改善的细胞透性、改善 的体内或体外抗肿瘤效力，或改善的凋亡诱导。
14. 如权利要求1-13中任一项所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物相对于 其中w为0、1或2的对应拟肽大环化合物具有改善的对MDM2或MDMX的结合亲和力。
15. 如权利要求1-13中任一项所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物相对于 其中w为0、1或2的对应拟肽大环化合物具有降低的MDMX结合亲和力与MDM2结合亲和力 之比。
16. 如权利要求1-13中任一项所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物相对于 其中w为0、1或2的对应拟肽大环化合物具有改善的针对p53阳性肿瘤细胞系的体外抗肿 瘤效力。
17. 如权利要求1-13中任一项所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物相对于 其中w为0、1或2的对应拟肽大环化合物在p53阳性肿瘤细胞系中显示出改善的体外凋亡 诱导。
18. 如权利要求1-13中任一项所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物相对于 其中w为0、1或2的对应拟肽大环化合物具有改善的针对p53阳性肿瘤细胞系与针对p53 阴性或突变肿瘤细胞系的体外抗肿瘤效力比。
19. 如权利要求1-13中任一项所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物相对于 其中w为0、1或2的对应拟肽大环化合物具有改善的针对p53阳性肿瘤的体内抗肿瘤效力。
20. 如权利要求1-13中任一项所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物相对于 其中w为0、1或2的对应拟肽大环化合物在p53阳性肿瘤中具有改善的体内凋亡诱导。
21. 如权利要求1-13中任一项所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物相对于 其中w为0、1或2的对应拟肽大环化合物具有改善的细胞透性。
22. 如权利要求1-13中任一项所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物相对于 其中W为0、1或2的对应拟肽大环化合物具有改善的溶解度。
23. 如任一前述权利要求所述的拟肽大环化合物，其中各个E独立地为选自Ala (丙氨 酸）、D-Ala(D_丙氨酸）、Aib(a-氨基异丁酸）、Sar(N_甲基甘氨酸）和Ser (丝氨酸）的 氨基酸。
24. 如任一前述权利要求所述的拟肽大环化合物，其中[D]vS-LeUl-Thr2。
25. 如权利要求12-24中任一项所述的拟肽大环化合物，其中w为3-10。
26. 如权利要求25所述的拟肽大环化合物，其中w为3-6。
27. 如权利要求25所述的拟肽大环化合物，其中w为6-10。
28. 如权利要求27所述的拟肽大环化合物，其中w为6。
29. 如权利要求12-24中任一项所述的拟肽大环化合物，其中v为1-10。
30. 如权利要求24所述的拟肽大环化合物，其中v为2-10。
31. 如权利要求25所述的拟肽大环化合物，其中v为2-5。
32. 如权利要求26所述的拟肽大环化合物，其中v为2。
33. 如权利要求1-24中任一项所述的拟肽大环化合物，其中w为3-1000,例如3-500、 3-200、3-100、3-50、3-30、3-20 或 3-10。
34. 如任一前述权利要求所述的拟肽大环化合物，其中该拟肽大环化合物不是表5、表 7、表7a或表7b的大环化合物。
35. 如任一前述权利要求所述的拟肽大环化合物，其中各个E是Ser或Ala或其类似 物。
36. 如任一前述权利要求所述的拟肽大环化合物，其包含至少一种为氨基酸类似物的 氨基酸。
37. -种治疗受试者的癌症的方法，其包括向该受试者施用如任一前述权利要求所述 的拟肽大环化合物。
38. -种调节受试者中的p53和/或MDM2和/或MDMX活性的方法，其包括向该受试者 施用如任一前述权利要求所述的拟肽大环化合物。
39. -种拮抗受试者中的p53与MDM2之间和/或p53与MDMX蛋白之间的相互作用的 方法，其包括向该受试者施用如任一前述权利要求所述的拟肽大环化合物。
【文档编号】A61K38/12GK104144695SQ201380009773
【公开日】2014年11月12日 申请日期:2013年2月14日 优先权日:2012年2月15日
【发明者】V·格拉维斯, C·R·康利, S·P·伦蒂尼 申请人:爱勒让治疗公司