一种数字PCR芯片的制作方法

文档序号:19353162发布日期:2019-12-06 21:45阅读:598来源:国知局
一种数字PCR芯片的制作方法

本发明涉及数字pcr技术领域,特别是数字pcr芯片。



背景技术:

聚合酶链式反应(pcr)是一种可将dna片段体外扩增的分子生物技术,数字pcr(dpcr)是一种核酸分子绝对定量的新技术,它不依赖标准曲线和参照样本,无需设对照,可直接检测出目标分子的拷贝数。dpcr原理类似于计算机科学中的“分治算法”,将低模板的试剂分配到大量微孔中,经过统计学分析,大部分微孔中没有或者只有1个目标分子,扩增完成后,通过光学检测模块计数,即为初始模板量。相比于传统的定量pcr,dpcr具有更高的灵敏度、特异性、高耐受性和精确性,此项技术已经在极微量核酸样本检测、cnv分析和复杂样本基因表达检测等方面有着广泛应用。

数字pcr可以有两种检测方法。

其一为乳滴法检测模板量,将含有核酸分子的反应体系形成上万个微滴,微滴体积约为1nl左右,遵循统计学规律,每个微滴最多含有1个核酸分子(个别差异除外),把每个微滴作为一个pcr反应容器,经过循环扩增后,使用微滴分析仪,逐个检验每个微滴是否扩增,对扩增的微滴进行计数,最后根据泊松分布原理及阳性微滴的比例,计算出模板的拷贝数。这种方法,生成微滴时误差较大,影响检测结果,且成本高。

其二为使用微流控芯片检测,微流控原理为通过外界施加压力将试剂挤入芯片孔道内,但驱动结构复杂、占用空间较大、成本高,流体通道阻力大,很容易有气体残留,这种方式一般需要试剂留有大量余量才能注满芯片,对试剂造成极大的浪费。

材料需要综合考虑导热性、耐热性、生物相容性、透光性,可选用硅和玻璃,这两种材料导热性和透光性都非常好,可以使用传统的微加工技术,如湿法刻蚀、干法刻蚀、深度反应离子刻蚀、光学刻蚀等,也可选择塑料和聚合物,相比于硅和玻璃更容易加工制造,可选择传统的微机械加工和快速成型法,如注塑。

本发明是一种无需外接驱动装置、避免微孔间交叉污染、避免液体蒸发、减少试剂用量、成本低的数字pcr芯片。



技术实现要素:

本发明提供了一种数字pcr芯片。

在一些实施例中,数字pcr芯片结构主要包括:基座、旋转上盖、微阵列反应仓、密封层、密封圈、弹力卡扣、转轴一、转轴二、扭簧,其中基座与旋转上盖之间由转轴一连接,可使两者相互转动;转轴二通过扭簧与基座和弹力卡扣之间相连,可使弹力卡扣与基座之间相互转动。

在一些实施例中,基座上置有微阵列反应仓。

在一些实施例中,微阵列反应仓表面分布400~1亿个微孔,其制作材料包括树脂、塑料、玻璃、石英、硅片、金属和陶瓷,优选硅片,其有益效果是,导热性能好、生物相容性好、适用多种加工方法;

在一些实施例中,微孔容积为0.5pl~1μl,优选4pl~1nl,根据统计学分析,可视为每个微孔内的dna数量≤1。

在一些实施例中,微阵列反应仓分隔为1~100个分区,用于1~100个样品同时进行数字pcr反应。

在一些实施例中,微孔形状为圆形、方形、三角形、六边形、多边形,排布为横纵或密排。

在一些实施例中,微阵列反应仓四周有一凹槽,其有益效果是存放多余的反应试剂。

在一些实施例中,微阵列反应仓的加工方法包括光刻蚀、玻璃陶瓷金属刻蚀、高精度模具注塑、机加工切削、3d打印、沉积和粘合等,优选光刻蚀。

在一些实施例中,微阵列反应仓具有功能化修饰基团或进行表面亲水处理,其有益效果是,使试剂顺利进入微孔内,避免产生气泡。

在一些实施例中,旋转上盖上置有密封层,密封层为低熔点固态直链烷烃。其中低熔点固态直链烷烃常温状态下为固体,其熔点为30℃~70℃,融化后其密度小于反应试剂,不与试剂互溶,不与试剂发生反应,其材料可以是石蜡、固体油脂。

在一些实施例中,密封层或微阵列反应仓外侧有密封圈,其有益效果是,将融化后的固态直链烷烃密封在微阵列反应仓上方。

在一些实施例中,扭簧两端分别固定在旋转上盖和基座上,其有益效果是,自由状态下弹力卡扣压在基座上。

本发明的优势在于,与传统微流控芯片相比,无需外接驱动装置、节省试剂、避免交叉污染、避免液体蒸发、操作简单。

附图说明

图1表示本发明实施例的整体结构示意图。

图2表示本发明实施例的微阵列反应仓结构示意图。

图3表示本发明实施例的加样过程说明图。

图4表示本发明实施例的加样完成示意图。

具体实施方式

以下将实施例和附图相结合,具体说明本发明的技术方案。

本实施例数字pcr芯片为一次性耗材。结构包括基座(11)、旋转上盖(12)、微阵列反应仓(15)、密封层(14)、密封圈(17)、弹力卡扣(18)、转轴一(13)、转轴二(16)、扭簧(19)。其中基座(11)与旋转上盖(12)之间由转轴一(13)连接,可使两者相互转动;转轴二(16)通过扭簧(19)与基座(11)和弹力卡扣(18)之间相连,可使弹力卡扣(18)与基座(11)之间相互转动。

本实施例中,旋转轴一(13)内置滑动轴承,其有益效果是,提高旋转上盖与基座的转动精度。

本实施例中,基座(11)上置有微阵列反应仓(15),其中微阵列反应仓材料为硅片,外形尺寸为25mm×25mm,其中心20mm×20mm表面通过光刻蚀法均匀分布30625个微孔(151),微孔直径0.1mm,深度0.05mm,容积约为0.4nl。微孔四周有一圈0.2mm宽的凹槽(152),用于存放多余的反应试剂,避免试剂溢出。

本实施例中,使用bsa溶液对微阵列反应仓进行亲水处理,可使试剂顺利进入微孔,避免产生气泡。

旋转上盖(12)上置有密封层(14),密封层为低熔点固态直链烷烃。其中低熔点固态直链烷烃常温状态下为固体,其熔点为30℃~70℃,融化后其密度小于反应试剂,不与试剂互溶,不与试剂发生反应,其材料可以是石蜡、固体油脂,本实施例中低熔点固态烷烃选择石蜡(sigma,货号327204),其熔点为53℃~57℃。

本实施例中,密封层(14)外侧有密封圈(17),密封圈为硅胶材质。

本实施例中,使用3个扭簧(19),每个扭簧两端分别固定在旋转上盖(12)和基座(11)上。

本实施例的加样过程为:将数字pcr芯片(10)水平放置,将试剂(31)滴在微阵列反应仓上,用手旋转旋转上盖(12),使旋转上盖(12)与基座(11)的夹角α逐渐变小,当密封层(14)与试剂(31)接触后,夹角α变小的同时旋转上盖(12)驱使液体进入微孔(151)中;当夹角α接近0度时,密封层(14)可覆盖在微孔区域的上方,手动按起弹力卡扣(18),使弹力卡扣(18)压紧旋转上盖(12),通过扭簧(19)的弹力,挤压密封圈,使其变形后,实现密封。当使用该数字pcr芯片进行pcr扩增时,随着温度升高至53℃,石蜡融化后位于微阵列反应仓上层与密封圈之间,起到密封作用,避免了交叉污染和试剂蒸发。



技术特征:

1.一种数字pcr芯片,其特征在于,其包括基座、旋转上盖、微阵列反应仓、密封层、密封圈、弹力卡扣、转轴一、转轴二、扭簧;

所述基座与所述旋转上盖之间由所述转轴一连接;

所述转轴二通过扭簧与所述基座和所述弹力卡扣之间相连;

所述基座上置有微阵列反应仓;

所述旋转上盖上置有密封层;

所述密封层为低熔点固态直链烷烃;

所述微阵列反应仓,由微孔组成。

2.根据权利要求1所述的数字pcr芯片,其特征在于,所述微阵列反应仓制作材料包括树脂、塑料、硅片、玻璃、石英、金属和陶瓷。

3.根据权利要求1所述的数字pcr芯片,其特征在于,所述微阵列反应仓表面分布400~1亿个微孔,微孔容积为0.5pl~1μl,所述微阵列反应仓分隔为1~100个分区,用于1~100个样品同时进行数字pcr反应。

4.根据权利要求1所述的数字pcr芯片,其特征在于,所述微孔形状为圆形、方形、三角形、六边形、多边形,排布为横纵或密排。

5.根据权利要求3所述的数字pcr芯片,其特征在于,所述微孔加工方法包括光刻蚀、玻璃陶瓷金属刻蚀、高精度模具注塑、机加工切削、3d打印、沉积和粘合。

6.根据权利要求1所述的数字pcr芯片,其特征在于,所述微阵列反应仓具有功能化修饰基团或表面亲水性处理。

7.根据权利要求1所述的数字pcr芯片,其特征在于,所述固态直链烷烃常温状态下为固体,其熔点为30℃~70℃,融化后其密度小于反应试剂,不与试剂互溶,不与试剂发生反应,其材料包括石蜡、固体油脂。

8.根据权利要求1所述的数字pcr芯片,其特征在于,所述密封圈位于微阵列反应仓外侧或密封层外侧。

9.根据权利要求1所述的数字pcr芯片,其特征在于,所述扭簧两端分别固定在旋转上盖和基座上,自由状态下弹力卡扣压在基座上。

10.根据权利要求1所述的数字pcr芯片,其特征在于,用于数字pcr反应中各独立反应体系的分隔与承载。


技术总结
本发明提供了一种数字PCR芯片,其包括基座、旋转上盖、微阵列反应仓、密封层、密封圈、弹力卡扣、转轴一、转轴二、扭簧。其中微阵列反应仓表面均布400~1亿个微孔,用于独立分隔和承载反应试剂体系;旋转上盖与基座绕转轴一相互转动,实现样品填充;旋转上盖上置有密封层和密封圈,用于隔离和密封微阵列反应仓,避免交叉污染和蒸发;弹力卡扣与基座绕转轴二相互转动,通过转轴二内置的扭簧实现压紧和密封。本发明的数字PCR芯片无需外接驱动装置、节省试剂、操作简单。

技术研发人员:任鲁风;李洁昆;蔡亦梅;高静;范东雨
受保护的技术使用者:北京中科生仪科技有限公司
技术研发日:2018.05.28
技术公布日:2019.12.06
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