治疗和诊断表达slc34a2(tat211=seqid2)的肿瘤的抗体的制作方法

文档序号:6002798阅读:297来源:国知局
专利名称:治疗和诊断表达slc34a2(tat211=seqid2)的肿瘤的抗体的制作方法
技术领域
本发明致力于可用于诊断和治疗哺乳动物中的肿瘤的物质组合物,及使用那些物质组合物来诊断和治疗哺乳动物中的肿瘤的方法。
背景技术
恶性肿瘤(癌)是在美国位居心脏病之后的第二位致死原因(Boring et al.,CACancel J. Clin. 43:7(1993))。癌的特征为衍生自正常组织的异常或肿瘤性细胞的数量增力口,所述细胞增殖形成肿瘤块;这些赘生性肿瘤细胞侵入邻近组织;及产生恶性细胞,所述恶性细胞最终经血液或淋巴系统传播到局部淋巴结并经称为转移的过程传播到远处。在癌性状态,细胞在正常细胞不生长的条件下增殖。癌自身表现为多种形式,特征为不同程度的侵袭力和进攻性。在寻找癌症诊断和治疗的有效细胞靶物的尝试中,研究人员试图鉴定在一种或多种特定类型的癌细胞的表面上与一种或多种正常非癌性细胞相比特异性表达的跨膜多肽膜相关多肽。通常,此类膜相关多肽在癌细胞的表面上比在非癌性细胞的表面上表达的量更大。此类肿瘤相关细胞表面抗原多肽的鉴定导致了经基于抗体的疗法特异性靶向破坏癌细胞的能力。在这点上,注意到基于抗体的疗法已经证明在某些癌症的治疗中是非常有效的。例如,丨丨丨..土(.:1.:丨)「丨—丨 貧和RIrH .;XAN.1K都来自Genentech Inc. , South SanFrancisco, California)是已经分别成功用于治疗乳腺癌和非何杰金氏(Hodgkin)淋巴瘤的抗体。更具体的说,i U.:RC[.:P'n;S 是从重组DNA衍生的人源化单克隆抗体,其选择性结合人表皮生长因子受体2 (HER2)原癌基因的胞外结构域。HER2蛋白过表达在25-30%的原发性乳腺癌中观察到。Rn'〖AAN.K.是遗传工程嵌合鼠/人单克隆抗体,其针对在正常的和恶性的B淋巴细胞的表面上发现的⑶20抗原。这两种抗体都是在CHO细胞中重组生产的。尽管在哺乳动物癌症疗法中有了上述进展,对于能够分别检测哺乳动物中肿瘤的存在和有效抑制肿瘤性细胞生长的另外的诊断和治疗剂仍然存在很大的需要。因此,本发明的目标之一是鉴定在一种或多种类型的癌细胞上与正常细胞上或其它不同癌细胞上相比表达更大量的细胞膜相关多肽,及使用那些多肽及其编码核酸来生成可用于哺乳动物中的癌症的治疗性处理和诊断性检测的物质组合物。发明概述在本说明书中,申请人首次描述了如下所述的细胞多肽(及其编码核酸或其片段)的鉴定,所述细胞多肽在一种或多种类型癌细胞表面上表达的程度高于它们在一种或多种类型正常非癌细胞表面上表达的程度。这些多肽在本文中称为肿瘤相关抗原性靶多肽(Tumor-associated Antigenic Target polypeptides, “TAT” 多妝),它们有望充当哺乳动物中癌症治疗和诊断的有效靶物。因此,在本发明的一个实施方案中,本发明提供了分离的核酸分子,其具有编码肿瘤相关抗原性靶多肽或其片段(“TAT”多肽)的核苷酸序列。在某些方面,所述分离的核酸分子包含与下述各项具有至少约80%的核酸序列同一性,或者至少约 81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的核酸序列同一性的核苷酸序列(a)编码 具有本文所公开的氨基酸序列的全长TAT多肽、本文所公开的缺少信号肽的TAT多肽氨基酸序列、本文所公开的有或没有信号肽的跨膜TAT多肽的胞外域、或本文所公开的全长TAT多肽氨基酸序列的任何其它具体定义的片段的DNA分子;或者(b) (a)的 DNA 分子的互补分子(complement)。在其它方面,所述分离的核酸分子包含与下述各项具有至少约80%的核酸序列同一性,或者至少约 81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的核酸序列同一性的核苷酸序列(a)包含本文所公开的全长TAT多肽cDNA的编码序列、本文所公开的缺少信号肽的TAT多肽的编码序列、本文所公开的有或没有信号肽的跨膜TAT多肽的胞外域的编码序列、或本文所公开的全长TAT多肽氨基酸序列的任何其它具体定义的片段的编码序列的DNA分子;或者(b) (a)的DNA分子的互补分子。本文的另一个方面提供了分离的核酸分子,其包含如下核苷酸序列,所述核苷酸序列编码跨膜域删除的或跨膜域灭活的TAT多肽,或者与此类编码核苷酸序列互补,其中,本文中公开了此类多肽的跨膜域。因此,设想了本文中所描述的TAT多肽的可溶性胞外域。在其它方面,本发明致力于分离的核酸分子,其与下述核苷酸序列杂交(a)编码具有本文所公开的全长氨基酸序列的TAT多肽、本文所公开的缺少信号肽的TAT多肽氨基酸序列、本文所公开的有或没有信号肽的跨膜TAT多肽的胞外域、或本文所公开的全长TAT多肽氨基酸序列的任何其它具体定义的片段的核苷酸序列,或者(b) (a)的核苷酸序列的互补分子。在这点上,本发明的一个实施方案致力于本文所公开的全长TAT多肽编码序列的片段或其互补序列,它们可用作例如杂交探针,所述杂交探针可用作例如诊断探针、PCR引物、反义寡核苷酸探针,或者用于编码全长TAT多肽的片段,可任选编码包含抗TAT多肽抗体的结合位点的多肽。此类核酸片段的长度通常为至少约5个核苷酸,或者长度为至少约
6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、
45、50、55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、 170、175、180、185、190、195、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990 或 1000 个核苷酸,其中在此语境中,术语“约”意指所述核苷酸序列长度加上或减去所述长度的10%。此外,此类核酸片段经常包含衍生自TAT多肽全长编码序列或其互补序列的连续核苷酸。注意到TAT多肽编码核苷酸序列或其互补序列的新片段可以常规方式确定,即使用多种众所周知的序列对比程序中的任一种将TAT多肽编码核苷酸序列与其它已知核苷酸序列对比,并确定哪个(些)TAT多肽编码核苷酸序列或其互补序列是新的。本文设想了 TAT多肽编码核苷酸序列或其互补序列的所有此类新片段。还设想了由这些核苷酸分子片段编码的TAT多肽片段,优选那些 包含抗TAT多肽抗体的结合位点的TAT多肽片段。在另一个实施方案中,本发明提供了分离的TAT多肽,其由上文鉴定的任何分离的核酸序列编码。在某一个方面,本发明涉及分离的TAT多肽,其包含与具有本文所公开的全长氨基酸序列的TAT多肽、本文所公开的缺少信号肽的TAT多肽氨基酸序列、本文所公开的有或没有信号肽的跨膜TAT多肽的胞外域、由本文所公开的任何核酸序列编码的氨基酸序列、本文所公开的全长TAT多肽氨基酸序列的任何其它具体定义的片段具有至少约80% 的氨基酸序列同一性,或者至少约 81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98%、99%或100%的氨基酸序列同一性的氨基酸序列。在又一个方面,本发明涉及分离的TAT多肽,其包含与编码(a)具有本文所公开的全长氨基酸序列的TAT多肽、(b)本文所公开的缺少信号肽的TAT多肽氨基酸序列、(c)本文所公开的有或没有信号肽的跨膜TAT多肽的胞外域、(d)本文所公开的任何核酸序列编码的氨基酸序列、或(e)本文所公开的全长TAT多肽氨基酸序列的任何其它具体定义的片段的DNA分子的互补序列杂交的核苷酸序列编码的氨基酸序列。在一个具体的方面,本发明提供了分离的TAT多肽,其没有N-末端信号序列和/或没有起始甲硫氨酸,且由编码上文所述氨基酸序列的核苷酸序列所编码。本文还描述了用于产生它的方法,其中所述方法包括在适于表达TAT多肽的条件下培养包含如下载体的宿主细胞,所述载体包含适宜的编码核酸分子,并从细胞培养物回收TAT多肽。本发明的另一个方面提供了分离的TAT多肽,其是跨膜域删除的或跨膜域灭活的。本文还描述了用于产生它的方法,其中所述方法包括在适于表达TAT多肽的条件下培养包含如下载体的宿主细胞,所述载体包含适宜的编码核酸分子,并从细胞培养物回收TAT多肽。在本发明的其它实施方案中,本发明提供了包含编码任何本文所述多肽的DNA的载体。还提供了包含任何此类载体的宿主细胞。举例而言,所述宿主细胞可以是CHO细胞、大肠杆菌(E. coli)细胞或酵母细胞。还提供了用于产生任何本文所述多肽的方法,包括在适于表达期望多肽的条件下培养宿主细胞并从细胞培养物回收期望多肽。在其它实施方案中,本发明提供了分离的嵌合多肽,其包含与异源(非TAT)多肽融合的任何本文所述TAT多肽。此类嵌合分子的例子包括与异源多肽诸如例如表位标签序列或免疫球蛋白Fe区融合的任何本文所述TAT多肽。在另一个实施方案中,本发明提供了抗体,其结合,优选特异性结合任何前述或后述多肽。任选的是,所述抗体是单克隆抗体、抗体片段、嵌合抗体、人源化抗体、单链抗体、或竞争性抑制抗TAT多肽抗体与其各自抗原性表位结合的抗体。本发明的抗体可任选偶联 生长抑制剂或细胞毒剂诸如毒素包括例如美登木素生物碱(maytansinoid)或加利车霉素(calicheamicin)、抗生素、放射性同位素、溶核酶(nucleolytic enzyme)或诸如此类。本发明的抗体可任选在CHO细胞或细菌细胞中产生,且优选抑制其所结合的细胞生长或增殖或者诱导其所结合的细胞死亡。为了诊断目的,本发明的抗体可以被可检测地标记,附着于固相支持物,等等。在本发明的其它实施方案中,本发明提供了包含编码任何本文所述抗体的DNA的载体。还提供了包含任何此类载体的宿主细胞。举例而言,所述宿主细胞可以是CHO细胞、大肠杆菌细胞或酵母细胞。还提供了用于产生任何本文所述抗体的方法,包括在适于表达期望抗体的条件下培养宿主细胞并从细胞培养物回收期望的抗体。在又一个实施方案中,本发明涉及物质组合物,其包含与载体组合的如本文所述的TAT多肽、如本文所述的嵌合TAT多肽、或如本文所述的抗TAT抗体。任选的是,所述载体是药学可接受的载体。在又一个实施方案中,本发明涉及制品,其包括容器及该容器中容纳的物质组合物,其中所述物质组合物可包含如本文所述的TAT多肽、如本文所述的嵌合TAT多肽、或如本文所述的抗TAT抗体。该制品可任选还包括附于所述容器的标签或所述容器中包括的包装插页,其涉及所述物质组合物在肿瘤的治疗性处理或诊断性检测中的用途。本发明的另一个实施方案致力于如本文所述的TAT多肽、如本文所述的嵌合TAT多肽、或如本文所述的抗TAT多肽抗体用于制备药物的用途,所述药物可用于治疗对所述TAT多肽、嵌合TAT多肽、或抗TAT多肽抗体有响应的状况。本发明的其它实施方案致力于任何分离的抗体,其包含本文所公开的CDR-L1、⑶R-L2、⑶R-L3、⑶R-H1、⑶R-H2和⑶R-H3序列中的一种或多种,或是与任何此类抗体结合相同表位的任何抗体。本发明的另一个实施方案致力于用于抑制表达TAT多肽的细胞生长的方法,其中该方法包括使所述细胞接触与所述TAT多肽结合的抗体,且其中所述抗体与所述TAT多肽的结合引起所述表达TAT多肽的细胞的生长抑制。在优选的实施方案中,所述细胞是癌细胞,且所述抗体与所述TAT多肽的结合引起表达所述TAT多肽的所述细胞死亡。任选的是,所述抗体是单克隆抗体、抗体片段、嵌合抗体、人源化抗体、或单链抗体。本发明方法中所采用的抗体可任选偶联生长抑制剂或细胞毒剂诸如毒素包括例如美登木素生物碱或加利车霉素、抗生素、放射性同位素、溶核酶或诸如此类。本发明方法中所采用的抗体可任选在CHO细胞或细菌细胞中产生。本发明的又一个实施方案致力于治疗性处理具有癌性肿瘤的哺乳动物的方法,所述癌性肿瘤包含表达TAT多肽的细胞,其中该方法包括给所述哺乳动物施用治疗有效量的结合所述TAT多肽的抗体,由此所述肿瘤得到有效的治疗性处理。任选的是,所述抗体是单克隆抗体、抗体片段、嵌合抗体、人源化抗体或单链抗体。本发明方法中所采用的抗体可任选偶联生长抑制剂或细胞毒剂诸如毒素包括例如美登木素生物碱或加利车霉素、抗生素、放射性同位素、溶核酶或诸如此类。本发明方法中所采用的抗体可任选在CHO细胞或细菌细胞中产生。本发明的又一个实施方案致力于测定怀疑含有TAT多肽的样品中该TAT多肽的存在的方法,其中该方法包括使所述样品暴露于结合所述TAT多肽的抗体,并测定所述样品中所述抗体与所述TAT多肽的结合,其中此类结合的存在表明所述样品中存在所述TAT多肽。任选的是,所述样品可包括怀疑表达TAT多肽的细胞(可以是癌细胞)。本发明方法中所采用的抗体可任选被可检测地标记、附着于固相支持物,或诸如此类。 本发明的又一个实施方案致力于诊断哺乳动物中肿瘤的存在的方法,其中该方法包括检测(a)从所述哺乳动物获得的组织细胞的测试样品中和(b)相同组织来源或类型的已知正常非癌性细胞的对照样品中编码TAT多肽的基因的表达水平,其中所述TAT多肽在测试样品中的表达水平高于对照样品表明获取该测试样品的哺乳动物中存在肿瘤。 本发明的又一个实施方案致力于诊断哺乳动物中肿瘤的存在的方法,其中该方法包括(a)使包含从所述哺乳动物获得的组织细胞的测试样品接触结合TAT多肽的抗体,并
(b)检测所述测试样品中所述抗体和所述TAT多肽之间复合物的形成,其中复合物的形成表明所述哺乳动物中存在肿瘤。任选的是,所采用的抗体被可检测地标记,附着于固相支持物,或诸如此类,和/或所述组织细胞的测试样品是从怀疑具有癌性肿瘤的个体获得的。本发明的又一个实施方案致力于治疗或预防与改变的,优选提高的TAT多肽表达或TAT多肽活性有关的细胞增殖性紊乱(病症)的方法,该方法包括给需要此类治疗的受试者施用有效量的TAT多肽的拮抗剂。优选的是,所述细胞增殖性紊乱是癌症,且所述TAT多肽的拮抗剂是抗TAT多肽抗体或反义寡核苷酸。细胞增殖性紊乱TAT多肽的有效治疗或预防可以是直接杀死表达TAT多肽的细胞或抑制其生长的结果,或者通过拮抗TAT多肽的细胞生长促进活性实现。本发明的又一个实施方案致力于使抗体与表达TAT多肽的细胞结合的方法,其中该方法包括在适于所述抗体与所述TAT多肽结合的条件下使表达TAT多肽的细胞接触所述抗体,并容许它们之间的结合。在优选的实施方案中,所述抗体用可定性和/或定量测定所述抗体结合所述细胞的位置和/或量的分子或化合物标记。本发明的其它实施方案致力于TAT多肽、编码TAT多肽的核酸或包含该核酸的载体或宿主细胞、或抗TAT多肽抗体在制备可用于(i)癌症或肿瘤的治疗性处理或诊断性检测或(ii)细胞增殖性紊乱(病症)的治疗性处理或预防的药物中的用途。本发明的另一个实施方案致力于抑制癌细胞生长的方法,其中所述癌细胞的生长至少部分依赖于TAT多肽的生长促进效果(其中所述TAT多肽可以是由癌细胞自身表达的,或者是由产生对癌细胞具有生长促进效果的多肽的细胞表达的),其中该方法包括使所述TAT多肽接触结合所述TAT多肽的抗体,由此拮抗所述TAT多肽的生长促进活性,继而抑制所述癌细胞的生长。优选完全抑制癌细胞的生长。甚至更优选的是,所述抗体与所述TAT多肽的结合诱导所述癌细胞的死亡。任选的是,所述抗体是单克隆抗体、抗体片段、嵌合抗体、人源化抗体或单链抗体。本发明方法中所采用的抗体可任选偶联生长抑制剂或细胞毒剂诸如毒素包括例如美登木素生物碱或加利车霉素、抗生素、放射性同位素、溶核酶或诸如此类。本发明方法中所使用的抗体可任选在CHO细胞或细菌细胞中产生。本发明的又一个实施方案致力于治疗性处理哺乳动物中的肿瘤的方法,其中所述肿瘤的生长至少部分依赖于TAT多肽的生长促进效果,其中所述方法包括给所述哺乳动物施用治疗有效量的结合所述TAT多肽的抗体,由此拮抗所述TAT多肽的生长促进活性并使所述肿瘤得到有效的治疗性处理。任选的是,所述抗体是单克隆抗体、抗体片段、嵌合抗体、人源化抗体或单链抗体。本发明方法中所采用的抗体可任选偶联生长抑制剂或细胞毒剂诸如毒素包括例如美登木素生物碱或加利车霉素、抗生素、放射性同位素、溶核酶或诸如此、类。本发明方法中所采用的抗体可任选在CHO细胞或细菌细胞中产生。在其它实施方案中,本发明致力于如下这套本申请或未来申请可能的
权利要求
I.分离的核酸,其具有与下述各项具有至少80%核酸序列同一性的核苷酸序列(a)DNA分子,其编码SEQ ID N0:2所不氨基酸序列;(b)DNA分子,其编码SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽;(C)DNA分子,其编码SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d)DNA分子,其编码SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列;(f) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码序列;或(g) (a), (b), (c),(d), (e)或(f)的互补序列。2.分离的核酸,其具有(a)核苷酸序列,其编码SEQ ID NO:2所示氨基酸序列;(b)核苷酸序列,其编码SEQ ID NO:2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽;(c)核苷酸序列,其编码SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d)核苷酸序列,其编码SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列;(f) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区;或(g) (a), (b), (c),(d), (e)或(f)的互补序列。3.分离的核酸,其与下述任一项杂交(a)核酸,其编码SEQ ID NO:2所示氨基酸序列;(b)核酸,其编码SEQ ID N0:2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽;(c)核酸,其编码SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d)核酸,其编码SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列;(f) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区;或(g) (a), (b), (c),(d), (e)或(f)的互补序列。4.权利要求3的核酸,其中所述杂交在严格条件下发生。
5.权利要求3的核酸,其长度为至少约5个核苷酸。6.表达载体,其包含权利要求1、2或3的核酸。7.权利要求6的表达载体,其中所述核酸与控制序列可操作连接,所述控制序列受到用该载体转化的宿主细胞的识别。8.宿主细胞,其包含权利要求7的表达载体。9.权利要求8的宿主细胞,其是CHO细胞、大肠杆菌细胞或酵母细胞。10.用于生产多肽的方法,包括在适于表达所述多肽的条件下培养权利要求8的宿主细胞,并从细胞培养物回收所述多肽。11.分离的多肽,其与下述各项具有至少80%的氨基酸序列同一性
(a) SEQ ID NO: 2 所示多肽;(b)SEQ ID NO:2所示多肽,缺少其相关信号肽;(c)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d)SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽。12.分离的多肽,其具有(a) SEQ ID NO :2所示氨基酸序列;(b) SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,具有其相关信号肽序列;(d)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(e)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的氨基酸序列。13.嵌合多肽,其包含与异源多肽融合的权利要求11或12的多肽。14.权利要求13的嵌合多肽,其中所述异源多肽是表位标签序列或免疫球蛋白的Fe区。15.分离的抗体,其结合与下述各项具有至少80%氨基酸序列同一性的多肽(a) SEQ ID NO: 2 所示多肽;(b)SEQ ID NO:2所示多肽,缺少其相关信号肽;(c)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d)SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽。16.分离的抗体,其结合具有下述任一项的多肽(a) SEQ ID NO :2所示氨基酸序列;(b) SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,具有其相关信号肽序列;(d)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的氨基酸序列。
17.权利要求15或16的抗体,其是单克隆抗体。18.权利要求15或16的抗体,其是抗体片段。19.权利要求15或16的抗体,其是嵌合或人源化抗体。20.权利要求15或16的抗体,其与生长抑制剂偶联。21.权利要求15或16的抗体,其与细胞毒剂偶联。22.权利要求21的抗体,其中所述细胞毒剂选自毒素、抗生素、放射性同位素和溶核酶。23.权利要求21的抗体,其中所述细胞毒剂是毒素。24.权利要求23的抗体,其中所述毒素选自美登木素生物碱和加利车霉素。 25.权利要求23的抗体,其中所述毒素是美登木素生物碱。26.权利要求15或16的抗体,其在细菌中产生。27.权利要求15或16的抗体,其在CHO细胞中产生。28.权利要求15或16的抗体,其诱导与其结合的细胞死亡。29.权利要求15或16的抗体,其被可检测地标记。30.分离的核酸,其具有编码权利要求15或16的抗体的核苷酸序列。31.表达载体,其包含与控制序列可操作连接的权利要求30的核酸,所述控制序列由用该载体转化的宿主细胞识别。32.宿主细胞,其包含权利要求31的表达载体。33.权利要求32的宿主细胞,其是CHO细胞、大肠杆菌细胞或酵母细胞。34.用于生产抗体的方法,包括在适于表达所述抗体的条件下培养权利要求32的宿主细胞,并从细胞培养物回收所述抗体。35.物质组合物,其包含与载体组合的(a)权利要求11的多肽;(b)权利要求12的多肽;(c)权利要求13的嵌合多肽;(d)权利要求15的抗体;或(e)权利要求16的抗体。36.权利要求35的物质组合物,其中所述载体是药学可接受的载体。37.制品,其包括(a)容器;及(b)所述容器中容纳的权利要求35的物质组合物。38.权利要求37的制品,还包括附于所述容器的标签或所述容器中包括的包装插页,其涉及所述物质组合物用于癌症的治疗性处理或诊断性检测的用途。39.抑制细胞生长的方法,所述细胞表达与所述任一项具有至少80%氨基酸序列同一性的蛋白质(a) SEQ ID NO: 2 所示多肽;(b)SEQ ID NO:2所示多肽,缺少其相关信号肽;(c)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d)SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;
(e)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽,所述方法包括使所述细胞接触结合所述蛋白质的抗体,由此所述抗体与所述蛋白质的结合引起所述细胞的生长抑制。40.权利要求39的方法,其中所述抗体是单克隆抗体。41.权利要求39的方法,其中所述抗体是抗体片段。42.权利要求39的方法,其中所述抗体是嵌合或人源化抗体。43.权利要求39的方法,其中所述抗体与生长抑制剂偶联。44.权利要求39的方法,其中所述抗体与细胞毒剂偶联。 45.权利要求44的方法,其中所述细胞毒剂选自毒素、抗生素、放射性同位素和溶核酶。46.权利要求44的方法,其中所述细胞毒剂是毒素。47.权利要求46的方法,其中所述毒素选自美登木素生物碱和加利车霉素。48.权利要求46的方法,其中所述毒素是美登木素生物碱。49.权利要求39的方法,其中所述抗体在细菌中产生。50.权利要求39的方法,其中所述抗体在CHO细胞中产生。51.权利要求39的方法,其中所述细胞是癌细胞。52.权利要求51的方法,其中使所述癌细胞进一步暴露于放射处理或化疗剂。53.权利要求51的方法,其中所述癌细胞选自乳腺癌细胞、结肠直肠癌细胞、肺癌细胞、卵巢癌细胞、中枢神经系统癌细胞、肝癌细胞、膀胱癌细胞、胰腺癌细胞、宫颈癌细胞、黑素瘤细胞和白血病细胞。54.权利要求51的方法,其中所述癌细胞与相同组织来源的正常细胞相比更大量的表达所述蛋白质。55.权利要求39的方法,其引起所述细胞死亡。56.权利要求39的方法,其中所述蛋白质具有(a) SEQ ID NO :2所示氨基酸序列;(b) SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,具有其相关信号肽序列;(d)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的氨基酸序列。57.治疗性处理具有癌性肿瘤的哺乳动物的方法,所述癌性肿瘤包含表达与下述任一项具有至少80%氨基酸序列同一性的蛋白质的细胞(a) SEQ ID NO: 2 所示多肽;(b)SEQ ID NO:2所示多肽,缺少其相关信号肽;(c)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d)SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽,所述方法包括给所述哺乳动物施用治疗有效量的结合所述蛋白质的抗体,由此有效治疗所述哺乳动物。58.权利要求57的方法,其中所述抗体是单克隆抗体。59.权利要求57的方法,其中所述抗体是抗体片段。60.权利要求57的方法,其中所述抗体是嵌合或人源化抗体。61.权利要求57的方法,其中所述抗体与生长抑制剂偶联。62.权利要求57的方法,其中所述抗体与细胞毒剂偶联。63.权利要求62的方法,其中所述细胞毒剂选自毒素、抗生素、放射性同位素和溶核酶。64.权利要求62的方法,其中所述细胞毒剂是毒素。 65.权利要求64的方法,其中所述毒素选自美登木素生物碱和加利车霉素。66.权利要求64的方法,其中所述毒素是美登木素生物碱。67.权利要求57的方法,其中所述抗体在细菌中产生。68.权利要求57的方法,其中所述抗体在CHO细胞中产生。69.权利要求57的方法,其中使所述肿瘤进一步暴露于放射处理或化疗剂。70.权利要求57的方法,其中所述肿瘤是乳腺肿瘤、结肠直肠肿瘤、肺肿瘤、卵巢肿瘤、中枢神经系统肿瘤、肝肿瘤、膀胱肿瘤、胰腺肿瘤或宫颈肿瘤。71.权利要求57的方法,其中所述肿瘤的癌性细胞与相同组织来源的正常细胞相比更大量的表达所述蛋白质。72.权利要求57的方法,其中所述蛋白质具有(a) SEQ ID NO :2所示氨基酸序列;(b) SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,具有其相关信号肽序列;(d)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的氨基酸序列。73.测定怀疑含有某种蛋白质的样品中该蛋白质的存在的方法,其中所述蛋白质与下述任一项具有至少80%的氨基酸序列同一性(a) SEQ ID NO: 2 所示多肽;(b)SEQ ID NO:2所示多肽,缺少其相关信号肽;(c)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽,所述方法包括使所述样品暴露于结合所述蛋白质的抗体,并测定所述样品中所述抗体与所述蛋白质的结合,其中所述抗体与所述蛋白质的结合表明所述样品中存在所述蛋白质。74.权利要求73的方法,其中所述样品包含怀疑表达所述蛋白质的细胞。75.权利要求74的方法,其中所述细胞是癌细胞。76.权利要求73的方法,其中所述抗体被可检测地标记。77.权利要求73的方法,其中所述蛋白质具有
(a) SEQ ID NO :2所示氨基酸序列;(b) SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(c) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,具有其相关信号肽序列;(d)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的氨基酸序列。78.诊断哺乳动物中肿瘤的存在的方法,所述方法包括测定从所述哺乳动物获得的组织细胞的测试样品中及相同组织来源的已知正常细胞的对照样品中编码与下述任一项具有至少80%氨基酸序列同一性的蛋白质的基因的表达水平 (a) SEQ ID NO: 2 所示多肽;(b) SEQ ID NO: 2所示多肽,缺少其相关信号肽;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽,其中所述蛋白质在测试样品中的表达水平高于对照样品表明获取测试样品的哺乳动物中存在肿瘤。79.权利要求78的方法,其中测定编码所述蛋白质的基因的表达水平的步骤包括在原位杂交或RT-PCR分析中使用寡核苷酸。80.权利要求78的方法,其中测定编码所述蛋白质的基因的表达水平的步骤包括在免疫组化或Western印迹分析中使用抗体。81.权利要求78的方法,其中所述蛋白质具有(a) SEQ ID NO :2所示氨基酸序列;(b) SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(c) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,具有其相关信号肽序列;(d)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的氨基酸序列。82.诊断哺乳动物中肿瘤的存在的方法,所述方法包括使从所述哺乳动物获得的组织细胞的测试样品接触这样的抗体,该抗体结合与下述任一项具有至少80%的氨基酸序列同一性的蛋白质(a) SEQ ID NO:2 所示多肽;(b)SEQ ID NO:2所示多肽,缺少其相关信号肽;(c)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽,并检测测试样品中所述抗体和所述蛋白质之间复合物的形成,其中复合物的形成表明所述哺乳动物中存在肿瘤。83.权利要求82的方法,其中所述抗体被可检测地标记。
84.权利要求82的方法,其中所述组织细胞的测试样品从怀疑具有癌性肿瘤的个体获得。85.权利要求82的方法,其中所述蛋白质具有(a) SEQ ID NO :2所示氨基酸序列;(b) SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,具有其相关信号肽序列;(d)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的氨基酸序列。 86.治疗或预防与某种蛋白质的表达或活性增高有关的细胞增殖性紊乱的方法,所述蛋白质与下述任一项具有至少80%的氨基酸序列同一丨丨生(a) SEQ ID NO: 2 所示多肽;(b) SEQ ID NO: 2所示多肽,缺少其相关信号肽;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽,所述方法包括给需要此类治疗的受试者施用有效量的所述蛋白质的拮抗剂,由此有效治疗或预防所述细胞增殖性紊乱。87.权利要求86的方法,其中所述细胞增殖性紊乱是癌症。88.权利要求86的方法,其中所述拮抗剂是抗TAT多肽抗体或反义寡核苷酸。89.使抗体与细胞结合的方法,所述细胞表达与下述任一项具有至少80%氨基酸序列同一性的蛋白质(a) SEQ ID NO: 2 所示多肽;(b) SEQ ID NO: 2所示多肽,缺少其相关信号肽;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽,所述方法包括使所述细胞接触结合所述蛋白质的抗体,并允许所述抗体与所述蛋白质的结合发生,由此使所述抗体结合所述细胞。90.权利要求89的方法,其中所述抗体是单克隆抗体。91.权利要求89的方法,其中所述抗体是抗体片段。92.权利要求89的方法,其中所述抗体是嵌合或人源化抗体。93.权利要求89的方法,其中所述抗体与生长抑制剂偶联。94.权利要求89的方法,其中所述抗体与细胞毒剂偶联。95.权利要求94的方法,其中所述细胞毒剂选自毒素、抗生素、放射性同位素和溶核酶。96.权利要求94的方法,其中所述细胞毒剂是毒素。
97.权利要求96的方法,其中所述毒素选自美登木素生物碱和加利车霉素。98.权利要求96的方法,其中所述毒素是美登木素生物碱。99.权利要求89的方法,其中所述抗体在细菌中产生。100.权利要求89的方法,其中所述抗体在CHO细胞中产生。101.权利要求89的方法,其中所述细胞是癌细胞。102.权利要求101的方法,其中使所述癌细胞进一步暴露于放射处理或化疗剂。
103.权利要求101的方法,其中所述癌细胞选自乳腺癌细胞、结肠直肠癌细胞、肺癌细胞、卵巢癌细胞、中枢神经系统癌细胞、肝癌细胞、膀胱癌细胞、胰腺癌细胞、宫颈癌细胞、黑素瘤细胞和白血病细胞。104.权利要求103的方法,其中所述癌细胞与相同组织来源的正常细胞相比更大量地表达所述蛋白质。105.权利要求89的方法,其引起所述细胞死亡。106.权利要求1-5或30任一项的核酸在制备用于癌症的治疗性处理或诊断性检测的药物中的用途。107.权利要求1-5或30任一项的核酸在制备用于治疗肿瘤的药物中的用途。108.权利要求1-5或30任一项的核酸在制备用于治疗或预防细胞增殖性紊乱(病症)的药物中的用途。109.权利要求6、7或31任一项的表达载体在制备用于癌症的治疗性处理或诊断性检测的药物中的用途。110.权利要求6、7或31任一项的表达载体在制备用于治疗肿瘤的药物中的用途。111.权利要求6、7或31任一项的表达载体在制备用于治疗或预防细胞增殖性紊舌L (病症)的药物中的用途。112.权利要求8、9、32或33任一项的宿主细胞在制备用于癌症的治疗性处理或诊断性检测的药物中的用途。113.权利要求8、9、32或33任一项的宿主细胞在制备用于治疗肿瘤的药物中的用途。114.权利要求8、9、32或33任一项的宿主细胞在制备用于治疗或预防细胞增殖性紊乱(病症)的药物中的用途。115.权利要求11-14任一项的多肽在制备用于癌症的治疗性处理或诊断性检测的药物中的用途。116.权利要求11-14任一项的多肽在制备用于治疗肿瘤的药物中的用途。117.权利要求11-14任一项的宿主细胞在制备用于治疗或预防细胞增殖性紊乱的药物中的用途。118.权利要求15-29任一项的抗体在制备用于癌症的治疗性处理或诊断性检测的药物中的用途。119.权利要求15-29任一项的抗体在制备用于治疗肿瘤的药物中的用途。120.权利要求15-29任一项的抗体在制备用于治疗或预防细胞增殖性紊乱的药物中的用途。
121.权利要求35或36任一项的物质组合物在制备用于癌症的治疗性处理或诊断性检测的药物中的用途。122.权利要求35或36任一项的物质组合物在制备用于治疗肿瘤的药物中的用途。123.权利要求35或36任一项的物质组合物在制备用于治疗或预防细胞增殖性紊乱的药物中的用途。124.权利要求37或38任一项的制品在制备用于癌症的治疗性处理或诊断性检测的药物中的用途。125.权利要求37或38任一项的制品在制备用于治疗肿瘤的药物中的用途。
126.权利要求37或38任一项的制品在制备用于治疗或预防细胞增殖性紊乱的药物中的用途。127.用于抑制细胞生长的方法,其中所述细胞的生长至少部分依赖于下述任一项具有至少80%氨基酸序列同一性的蛋白质的生长促进作用(a) SEQ ID NO: 2 所示多肽;(b) SEQ ID NO: 2所示多肽,缺少其相关信号肽;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽,所述方法包括使所述蛋白质接触与所述蛋白质结合的抗体,由此抑制所述细胞的生长。128.权利要求127的方法,其中所述细胞是癌细胞。129.权利要求127的方法,其中所述蛋白质由所述细胞表达。130.权利要求127的方法,其中所述抗体与所述蛋白质的结合拮抗所述蛋白质的细胞生长强化活性。131.权利要求127的方法,其中所述抗体与所述蛋白质的结合诱导所述细胞死亡。132.权利要求127的方法,其中所述抗体是单克隆抗体。133.权利要求127的方法,其中所述抗体是抗体片段。134.权利要求127的方法,其中所述抗体是嵌合或人源化抗体。135.权利要求127的方法,其中所述抗体与生长抑制剂偶联。136.权利要求127的方法,其中所述抗体与细胞毒剂偶联。137.权利要求136的方法,其中所述细胞毒剂选自毒素、抗生素、放射性同位素和溶核酶。138.权利要求136的方法,其中所述细胞毒剂是毒素。139.权利要求138的方法,其中所述毒素选自美登木素生物碱和加利车霉素。140.权利要求138的方法,其中所述毒素是美登木素生物碱。141.权利要求127的方法,其中所述抗体在细菌中产生。142.权利要求127的方法,其中所述抗体在CHO细胞中产生。143.权利要求127的方法,其中所述蛋白质具有
(a) SEQ ID NO :2所示氨基酸序列;(b) SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(c) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,具有其相关信号肽序列;(d)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的 全长编码区所编码的氨基酸序列。144.治疗性处理哺乳动物中的肿瘤的方法,其中所述肿瘤的生长至少部分依赖于下述任一项具有至少80%氨基酸序列同一性的蛋白质的生长促进作用(a) SEQ ID NO:2 所示多肽;(b) SEQ ID NO: 2所示多肽,缺少其相关信号肽;(C)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域,具有其相关信号肽;(d)SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域,缺少其相关信号肽;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的多肽;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的多肽,所述方法包括使所述蛋白质接触与所述蛋白质结合的抗体,由此有效治疗所述肿瘤。145.权利要求144的方法,其中所述蛋白质由所述肿瘤的细胞表达。146.权利要求144的方法,其中所述抗体与所述蛋白质的结合拮抗所述蛋白质的细胞生长促进活性。147.权利要求144的方法,其中所述抗体是单克隆抗体。148.权利要求144的方法,其中所述抗体是抗体片段。149.权利要求144的方法,其中所述抗体是嵌合或人源化抗体。150.权利要求144的方法,其中所述抗体与生长抑制剂偶联。151.权利要求144的方法,其中所述抗体与细胞毒剂偶联。152.权利要求151的方法,其中所述细胞毒剂选自毒素、抗生素、放射性同位素和溶核酶。153.权利要求151的方法,其中所述细胞毒剂是毒素。154.权利要求153的方法,其中所述毒素选自美登木素生物碱和加利车霉素。155.权利要求153的方法,其中所述毒素是美登木素生物碱。156.权利要求144的方法,其中所述抗体在细菌中产生。157.权利要求144的方法,其中所述抗体在CHO细胞中产生。158.权利要求144的方法,其中所述蛋白质具有(a) SEQ ID NO :2所示氨基酸序列;(b) SEQ ID NO: 2所示氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(c) SEQ ID NO: 2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,具有其相关信号肽序列;(d)SEQ ID NO:2所示多肽的胞外域的氨基酸序列,缺少其相关信号肽序列;(e) SEQ ID NO: I所示核苷酸序列所编码的氨基酸序列;或(f)SEQ ID NO: I所示核苷酸序列的全长编码区所编码的氨基酸序列。159.分离的抗体,其与权利要求15至29任一项的抗体结合相同表位。160.权利要求159的抗体,其是单克隆抗体。
161.权利要求159的抗体,其是抗体片段。162.权利要求159的抗体,其是嵌合或人源化抗体。163.权利要求159的抗体,其与生长抑制剂偶联。164.权利要求159的抗体,其与细胞毒剂偶联。165.权利要求164的抗体,其中所述细胞毒剂选自毒素、抗生素、放射性同位素和溶核酶。166.权利要求164的抗体,其中所述细胞毒剂是毒素。167.权利要求166的抗体,其中所述毒素选自美登木素生物碱和加利车霉素。、168.权利要求166的抗体,其中所述毒素是美登木素生物碱。169.权利要求159的抗体,其在细菌中产生。170.权利要求159的抗体,其在CHO细胞中产生。171.权利要求159的抗体,其诱导其所结合的细胞死亡。172.权利要求159的抗体,其被可检测地标记。173.权利要求159的抗体,其包含权利要求15至29的任何抗体的至少一个互补
决定区。174.产生结合TAT多肽的单克隆抗体的杂交瘤细胞。175.鉴定如下所述抗体的方法,所述抗体结合权利要求15至29的任何抗体结合的表位,所述方法包括测定测试抗体阻断权利要求15至29的任何抗体结合的能力,其中所述测试抗体在相等抗体浓度阻断所述权利要求15至29的任何抗体与所述TAT多肽结合达至少40%的能力表明所述测试抗体能够结合所述权利要求15至29的任何抗体所结合的表位。阅读本说明书后,本发明的其它实施方案对于本领域技术人员而言将是显而易见的。附图简述图I显示了 TAT211cDNA的核苷酸序列(SEQ ID NO: I),其中SEQ IDNO: I是本文中称作“DNA219894”的克隆。图2显示了衍生自图I中所示SEQ ID NO: I的编码序列的氨基酸序列(SEQ IDNO:2)。图3A-C显示了以下各项的轻链可变区氨基酸序列的比对轻链人亚类I共有序列(huKI; SEQ ID 勵3)、鼠10111抗了六了211抗体(1111110111-1;5£0 IDN0:4)、和 IOHl 抗 TAT211移植的“人源化”抗体(10Hl-graft;SEQ ID NO:5)、和多种其它抗TAT211 “人源化”抗体(SEQ ID NO :6-11)。图4A-C显示了以下各项的重链可变区氨基酸序列的比对重链人亚组III共有序列(hum III;SEQ ID NO: 12)、鼠 IOHl 抗 TAT211 抗体(mulOHl-H; SEQ ID N0:13)、10H1 抗TAT211移植的“人源化”抗体(10Hl-graft;SEQ IDN0:14)、和多种其它抗TAT211 “人源化抗体(SEQ ID NO: 15-20)。图5显示了选定的亲和力成熟的IOHl衍生抗体的各种⑶R-Ll序列(SEQ IDNOS:21-34)。图6显示了选定的亲和力成熟的IOHl衍生抗体的各种⑶R-L2序列(SEQ IDNOS:35-38)。图7显示了选定的亲和力成熟的IOHl衍生抗体的各种⑶R-L3序列(SEQ IDNOS:39-41)。图8显示了选定的亲和力成熟的IOHl衍生抗体的各种⑶R-Hl序列(SEQ IDNOS:42-45)。图9显示了选定的亲和力成熟的IOHl衍生抗体的各种⑶R-H2序列(SEQ IDNOS:46-60)。

图10显示了选定的亲和力成熟的IOHl衍生抗体的各种⑶R-H3序列(SEQ IDNOS:61-65)。图11显示了用于实施本发明的例示性受体人共有框架序列,序列标识符如下人 VH亚类I共有框架除去Kabat CDR(SEQ ID NO:66)、人VH亚类I共有框架除去延伸的高变区(SEQ ID NO: 67-69)、人 VH 亚类 II 共有框架除去 Kabat CDR(SEQ ID NO: 70)、人 VH 亚类II共有框架除去延伸的高变区(SEQ ID NO: 71-73)、人VH亚类III共有框架除去KabatCDR “L变体”(SEQID NO: 74)、和人VH亚类III共有框架除去Kabat CDR “F变体”(SEQIDNO:75)。图12显示了用于实施本发明的例示性受体人共有框架序列,序列标识符如下人VLk亚类I共有框架除去Kabat CDR(SEQ ID NO: 76)、人VLk亚类II共有框架除去Kabat CDR(SEQ ID NO: 77)、人 VL K 亚类 III 共有框架除去 Kabat CDR(SEQ ID NO: 78)、和人 VLk亚类IV共有框架除去Kabat CDR(SEQ ID NO: 79) 图13显示了抗体10H1. I. 4B的重链氨基酸序列(SEQ ID NO:80)。图14显示了抗体10H1. I. 4B的轻链氨基酸序列(SEQ ID NO:81)。图15显示了下述ADC vc-MMAE缀合抗体处理对0VCAR-3细胞(其在细胞表面上内源表达 TAT211 多肽)的体外杀伤10H1. 11( )、10H1. 11. I ( )、( ■ )、10H1. 11. 2B ( A ) >IOHL 11.4B( )、10H1. 11.6B⑴、10Hl-grart(〇)、抗人 gD( | )、抗豚草(□)。图16显示了下述ADC vc-MMAE缀合抗体处理对293细胞(其不在细胞表面上内源表达TAT211多肽)的体外杀伤10H1. 11.4B( )、或抗人gD( | )。图17显示了下述ADC vc-MMAE缀合抗体处理对293/TAT211细胞(其改造成在细胞表面上表达TAT211多肽)的体外杀伤10H1. 11.4B( )、或抗人gD( | )。图18显示了使用下述ADC vc-MMAE缀合抗体进行的小鼠乳房脂肪垫实验中对0VCAR-3肿瘤的体内杀伤单独的媒介(口)、10H1. 11( )、10H1. 11. I ( ■)、IOHL 11. 2B( ▲ )、IOHL 11. 4B( )、IOHL 11. 6B(+)、和 lOHl-graft (〇)。图19显示了使用下述ADC vc-MMAE缀合抗体进行的小鼠乳房脂肪垫实验中对0VCAR-3肿瘤的体内杀伤单独的媒介⑴、3mg/g的10H1. 11. 4B ( ■ )、lmg/kg的10H1. 11. 4B( )、或不结合TAT211的非特异性抗gpl20对照抗体(▲)。优选实施方案的详述I.定义术语“TAT多肽”和“TAT”在用于本文时且后面紧跟着数值名称时指各种多肽,其中完整名称(即TAT/数值)指本文描述的特定多肽序列。术语“TAT/数值多肽”和“TAT/数值”,其中术语“数值”作为实际数值名称提供,在用于本文时涵盖天然序列多肽、多肽变体和天然序列多肽的片段和多肽变体(本文中有进一步定义)。本文中描述的TAT多肽可从多种来源分离,诸如人组织类型或其它来源,或者通过重组或合成方法制备。术语“TAT多肽”指本文中公开的每一种个别的TAT/数值多肽。本说明书中涉及“TAT多肽”的所有公开内容适用于独自的以及共同的每一种多肽。例如,关于多肽的制备、纯化、衍生、针对该多肽的抗体的形成、针对该多肽的TAT结合寡肽的形成、针对该多肽的TAT结合有机分子的形成、施用、含有该多肽的组合物、用该多肽治疗疾病、等等的描述适用于本发明的具体的每一种多肽。术语“TAT多肽”还包括本文中公开的TAT/数值多肽的变体。在一个实施方案中,TAT211多肽序列显示为SEQ ID NO:2。“天然序列TAT多肽”包括与衍生自自然界的相应TAT多肽具有相同氨基酸序列的多肽。此类天然序列TAT多肽可从自然界分离,或者可通过重组或合成手段生成。术语“天然序列TAT多肽”明确涵盖天然存在的截短或分泌形式的特定TAT多肽(例如胞外结构域序列)、该多肽的天然存在变体形式(例如可变剪接形式)和天然存在的等位变体。在本发明的某些实施方案中,本文中公开的天然序列TAT多肽是包含附图中所示全长氨基酸序列的成熟或全长天然序列多肽。起始和终止密码子(如果指示的话)在图中以粗体和下划线显示。附图中以“N”或“X”指示的核酸残基是任何核酸残基。然而,尽管附图中公开的TAT 多肽据显示以本文中指派为图中第I位氨基酸的甲硫氨酸残基开始,可以想到且有可能的是,可采用位于图中第I位氨基酸上游或下游的其它甲硫氨酸残基作为TAT多肽的起始氨基酸残基。TAT多肽“胞外结构域”或“ECD”指基本上不含跨膜结构域和胞质结构域的TAT多肽形式。通常,TAT多肽ECD具有少于1%的所述跨膜结构域和/或胞质结构域,优选具有少于0. 5%的所述结构域。可以理解,为本发明TAT多肽鉴定的任何跨膜结构域是依照本领域常规用于鉴定该种类型疏水性结构域的标准鉴定的。跨膜结构域的精确边界可以变化,但最有可能是本文中最初鉴定的结构域任一末端不超过约5个氨基酸。因此,任选的是,TAT多肽的胞外结构域可含有实施例或说明书中鉴定的跨膜结构域/胞外结构域边界任一侧的约5个或更少氨基酸,而且本发明设想了具有或没有相关信号肽的此类多肽及编码它们的核酸。本说明书和/或附图中可能显示了本文中所公开的各种TAT多肽的“信号肽”的大致位置。然而,应当注意,信号肽的C-末端边界可以变化,但最有可能的是本文中最初鉴定的信号肽C-末端边界任一侧不超过约5个氨基酸,其中信号肽的C-末端边界可依照本领域常规用于鉴定该种类型氨基酸序列元件的标准鉴定(例如Nielsen et al.,Prot.Eng. 10:1-6(1997)和 von Heinje et al.,Nucl. Acids. Res. 14:4683-4690(1986))。此外,还认识到,在有些情况中,从分泌多肽上切除信号序列不是完全统一的,导致超过一种分泌种类。本发明涵盖这些成熟多肽,其中信号肽在本文中所鉴定的信号肽C-末端边界任一侧不超过约5个氨基酸内切除,本发明还涵盖编码所述成熟多肽的多核苷酸。“TAT多肽变体”意指与本文中所公开的全长天然序列TAT多肽序列、缺乏本文中所公开的信号肽的TAT多肽序列、具有或没有本文中所公开的信号肽的TAT多肽胞外结构域、或本文中所公开的全长TAT多肽序列的任何其它片段(诸如那些由只呈现全长TAT多肽的完整编码序列一部分的核酸编码的片段)具有至少约80%的氨基酸序列同一性的本文中所定义的TAT多肽,优选活性TAT多肽。此类TAT多肽变体包括例如其中全长天然氨基酸序列的N-或C-末端添加或删除一个或多个氨基酸残基的TAT多肽。通常,TAT多肽变体与本文中所公开的全长天然序列TAT多肽序列、缺乏本文中所公开的信号肽的TAT多肽序列、具有或没有本文中所公开的信号肽的TAT多肽胞外结构域、或本文中所公开的全长TAT多肽序列的任何其它特别限定片段具有至少约80%的氨基酸序列同一性,或者至少约81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98% 或 99% 的氨基酸序列同一性。通常,TAT变体多肽的长度为至少约10个氨基酸,或者长度为至少约20、
30、40、50、60、70、80、90、100、110、120、130、140、150、160、170、180、190、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600 个氨基酸或更多。任选的是,TAT变体多肽与天然TAT多肽序列相比具有不超过一个保守氨基酸替代,或者与天然TAT多肽序列相比具有不超过2、3、4、5、6、7、8、9或10个保守氨基酸替代。 关于本文中所鉴定的TAT多肽序列的“百分比(%)氨基酸序列同一性”定义为对比序列并在必要时引入缺口以获取最大百分比序列同一性后,且不将任何保守替代视为序列同一性的一部分时,候选序列中与特定TAT多肽序列中的氨基酸残基相同的氨基酸残基的百分率。可以本领域技术范围内的多种方式进行测定百分比氨基酸序列同一性目的的序列对比,例如使用公众可得到的计算机软件,诸如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)软件。本领域技术人员可决定测量对比的适宜参数,包括对所比较序列全长获得最大对比所需的任何算法。然而,为了本发明,%氨基酸序列同一性值是使用序列比较计算机程序ALIGN-2获得的,其中美国专利No. 7,160,985中提供了 ALIGN-2程序的完整源代码,通过提及收入本文。ALIGN-2序列比较计算机程序由Genentech公司编写,其源代码已经连同用户文档一起提交给美国版权局(US Copyright Office, WashingtonD. C.,20559),并以美国版权注册号了乂邪10087注册。公众可通过Genentech公司(SouthSan Francisco, California)得到ALIGN-2程序,或者可从源代码编译。ALIGN2程序应当编译成在UNIX操作系统,优选数码UNIX V4. OD上使用。所有序列比较参数由ALIGN-2程序设定且不变。在采用ALIGN-2用于氨基酸序列比较的情况中,给定氨基酸序列A相对于(to)、与(with)、或针对(against)给定氨基酸序列B的%氨基酸序列同一性(或者可表述为具有或包含相对于、与、或针对给定氨基酸序列B的某一%氨基酸序列同一性的给定氨基酸序列A)如下计算分数X/Y 乘 100其中X是由序列对比程序ALIGN-2在该程序的A和B对比中评分为相同匹配的氨基酸残基数,且其中Y是B中的氨基酸残基总数。可以领会,若氨基酸序列A的长度与氨基酸序列B的长度不相等,则A相对于B的%氨基酸序列同一性将不等于B相对于A的%氨基酸序列同一丨I"生。“TAT变体多核苷酸”或“TAT变体核酸序列”意指编码本文中所定义的TAT多肽,优选活性TAT多肽且与编码本文中所公开的全长天然序列TAT多肽序列、本文中所公开的缺乏信号肽的全长天然序列TAT多肽序列、本文中所公开的具有或没有信号肽的TAT多肽胞外结构域、或本文中所公开的全长TAT多肽序列的任何其它片段(诸如那些由只呈现全长TAT多肽的完整编码序列一部分的核酸编码的片段)的核苷酸序列具有至少约80%核酸序列同一性的核酸分子。通常,TAT变体多核苷酸与编码本文中所公开的全长天然序列TAT多肽序列、本文中所公开的缺乏信号肽的全长天然序列TAT多肽序列、本文中所公开的具有或没有信号序列的TAT多肽胞外结构域、或本文中所公开的全长TAT多肽序列的任何其它片段的核酸序列具有至少约80%的核酸序列同一性,或者至少约81%、82%、83%、84%、85%、86%、87%、88%、89%、90%、91%、92%、93%、94%、95%、96%、97%、98% 或 99% 的核酸序列同一性。变体不涵盖天然核苷酸序列。通常,TAT变体多核苷酸的长度为至少约5个核苷酸,或者长度为至少约6、7、8、
9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、35、40、45、50、
55、60、65、70、75、80、85、90、95、100、105、110、115、120、125、130、135、140、145、150、155、160、165、170、175、180、185、190、195、200、210、220、230、240、250、260、270、280、290、300、310、320、330、340、350、360、370、380、390、400、410、420、430、440、450、460、470、480、490、500、510、520、530、540、550、560、570、580、590、600、610、620、630、640、650、660、670、680 、690、700、710、720、730、740、750、760、770、780、790、800、810、820、830、840、850、860、870、880、890、900、910、920、930、940、950、960、970、980、990 或 1000 个核苷酸,其中在此语境中,术语“约”意指所述核苷酸序列长度加上或减去所述长度的10%。关于本文中所鉴定的TAT编码核酸序列的“百分比(%)核酸序列同一性”定义为对比序列并在必要时引入缺口以获取最大百分比序列同一性后,候选序列中与TAT目的核酸序列中的核苷酸相同的核苷酸的百分率。可以本领域技术范围内的多种方式进行测定百分比核酸序列同一性目的的序列对比,例如使用公众可得到的计算机软件,诸如BLAST、BLAST-2、ALIGN或Megalign(DNASTAR)软件。然而,为了本发明,%核酸序列同一性值是使用序列比较计算机程序ALIGN-2获得的,其中美国专利No. 7,160,985中提供了 ALIGN-2程序的完整源代码,通过提及收入本文。ALIGN-2序列比较计算机程序由Genentech公司编写,其源代码已经连同用户文档一起提交给美国版权局(US Copyright Office, WashingtonD. C.,20559),并以美国版权注册号了乂邪10087注册。公众可通过Genentech公司(SouthSan Francisco, California)得到ALIGN-2程序,或者可从提供的源代码编译。ALIGN2程序应当编译成在UNIX操作系统,优选数码UNIX V4. OD上使用。所有序列比较参数由ALIGN-2程序设定且不变。在采用ALIGN-2来比较核酸序列的情况中,给定核酸序列C相对于(to)、与(with)、或针对(against)给定氨基酸序列D的%核酸序列同一'丨生(或者可表述为具有或包含相对于、与、或针对给定核酸序列D的某一 %核酸序列同一性的给定核酸序列C)如下计算分数W/Z 乘 100其中W是由序列对比程序ALIGN-2在该程序的C和D对比中评分为相同匹配的核苷酸数,且其中Z是D中的核苷酸总数。可以领会,若核酸序列C的长度与核酸序列D的长度不相等,则C相对于D的%核酸序列同一性将不等于D相对于C的%核酸序列同一性。在其它实施方案中,TAT变体多核苷酸是编码TAT多肽且能够与编码本文中所公开的全长TAT多肽的核苷酸序列杂交,优选在严格杂交和洗涤条件下杂交的核酸分子。TAT变体多肽可以是那些由TAT变体多核苷酸编码的变体多肽。
术语“全长编码区”在涉及编码TAT多肽的核酸使用时指编码本发明全长TAT多肽的核苷酸序列(常常在附图中起始和终止密码子(含)之间显示)。术语“全长编码区”在涉及ATCC保藏核酸使用时指插入保藏在ATCC的载体中的cDNA的TAT多肽编码部分(常常在附图中起始和终止密码子(含)之间显示)。“分离的”,在用于描述本文中所公开的各种TAT多肽时,意指已经鉴定且与/由其天然环境的一种成分分开和/或回收的多肽。其天然环境的污染性成分指通常会干扰该多肽的诊断或治疗用途的物质,可包括酶、激素、和其它蛋白质性质或非蛋白质性质的溶质。在优选的实施方案中,将多肽纯化至(I)足以通过使用转杯式测序仪获得至少15个残基的N-末端或内部氨基酸序列的程度,或(2)根据使用考马斯蓝或优选银染色的非还原或还原条件下的SDS-PAGE,达到同质。既然TAT多肽天然环境的至少一种成分不会存在,那么分离的多肽包括重组细胞内的原位多肽。然而,分离的多肽通常通过至少一个纯化步骤来制备。“分离的”TAT多肽编码核酸或其它多肽编码核酸指已经鉴定且与该多肽编码核酸 的天然来源中通常与之相关的至少一种污染性核酸分子分开的核酸分子。分离的多肽编码核酸分子不同于在自然界中发现它时的形式或背景。分离的多肽编码核酸分子因此与存在于天然细胞中时的特定多肽编码核酸分子有区别。然而,分离的多肽编码核酸分子包括通常表达该多肽的细胞中所包含的多肽编码核酸分子,例如当所述核酸分子在所述细胞中的染色体定位不同于它在天然细胞中的染色体定位时。术语“控制序列”指在特定宿主生物体中表达可操作连接的编码序列所必需的DNA序列。例如,适于原核生物的控制序列包括启动子、任选的操纵基因序列、和核糖体结合位点。已知真核细胞利用启动子、多腺苷酸化信号、和增强子。若一条核酸与另一条核酸序列处于功能性相互关系中,则它是“可操作连接”的。例如,若前序列(presequence)或分泌前导序列(secretory leader)的DNA表达成参与多肽分泌的前蛋白质(preprotein),则它与多肽的DNA可操作连接;若启动子或增强子影响编码序列的转录,则它与该序列可操作连接;或者,若核糖体结合位点的位置促进翻译,则它与编码序列可操作连接。通常,“可操作连接”意味着相连的DNA序列是相邻的,而且在分泌前导的情况中意味着相邻且处于阅读状态。然而,增强子不必相邻。连接可通过在方便的限制性位点处的连接反应来实现。如果没有此类位点,那么依照常规实践使用合成的寡核苷酸衔接头或接头。杂交反应的“严格性”可以容易的由本领域普通技术人员确定,而且通常根据探针长度、洗涤温度、和盐浓度凭经验计算。通常,较长的探针要求较高的温度以正确退火,而较短的探针需要较低的温度。杂交通常依赖于当互补链存在于低于其解链温度的环境中时变性DNA重新退火的能力。探针和可杂交序列之间的期望同源性程度越高,可使用的相对温度也越高。结果是,推断出较高相对温度将趋向于使反应条件更为严格,而较低温度也就较不严格。关于杂交反应严格性的另外细节和解释,参见Ausubel等人,《Current Protocolsin Molecular Biology)), Wiley Interscience Publishers, 1995。“严格条件”或“高严格性条件”,如本文中所定义的,可如下鉴别(I)采用低离子强度和高温进行洗涤,例如0. 015M氯化钠/0. 0015M柠檬酸钠/0. 1%十二烷基硫酸钠,50°C; (2)在杂交过程中采用变性剂,诸如甲酰胺,例如50%(v/v)甲酰胺及0. 1%牛血清清蛋白/0. l%Ficoll/0. 1%聚乙烯吡咯烷酮/50mM磷酸钠缓冲液pH 6. 5,含750mM氯化钠,75mM柠檬酸钠,42 °C ;或(3)在采用50%甲酰胺,5x SSC (0. 75M NaCl,0. 075M柠檬酸钠),50mM磷酸钠(pH 6. 8),0. 1%焦磷酸钠,5x Denhardt氏溶液,超声波处理的鲑鱼精DNA (50 u g/ml),0. 1%SDS,和10%硫酸右旋糖苷的溶液中于42°C杂交过夜,以及于42°C在0. 2x SSC (氯化钠/柠檬酸钠)中洗涤10分钟,接着在含EDTA的0. Ix SSC中于55°C进行10分钟高严格性洗漆。“中等严格条件”可以如 Sambrook 等人,《Molecular Cloning:ALaboratoryManual)),New York,Cold Spring Harbor Press, 1989所述鉴别,包括使用比上文所述较不严格的洗涤溶液和杂交条件(例如温度、离子强度和%SDS)。中等严格条件的一个例子是于37°C 在含20% 甲酰胺,5x SSC(150mM NaCl,15mM 柠檬酸三钠),50mM 磷酸钠(pH 7. 6),5xDenhardt氏溶液,10%硫酸右旋糖苷,和20mg/ml变性剪切的鲑鱼精DNA的溶液中温育过夜,接着在Ix SSC中于约37-50°C洗涤滤膜。技术人员将认识到如何根据需要调整温度、离子强度等以适应诸如探针长度等因素。
术语“表位标记的”在用于本文时指包含与“标签多肽”融合的TAT多肽或抗TAT抗体的嵌合多肽。标签多肽具有足够残基以提供表位而可制备针对其的抗体,但又足够短使得其不干扰与其融合的多肽的活性。标签多肽优选还是相当独特的,使得所述抗体基本上不与其它表位发生交叉反应。合适的标签多肽通常具有至少6个氨基酸残基且通常在约8个到约50个氨基酸残基之间(优选在约10个到约20个氨基酸残基之间)。“有活性的”或“活性”为了本发明指保留天然或天然存在TAT的生物学和/或免疫学活性的TAT多肽形式,其中“生物学”活性指由天然或天然存在TAT引起的,诱导针对天然或天然存在TAT所具有的抗原性表位的抗体生成的能力以外的生物学功能(或是抑制性的或是刺激性的),而“免疫学”活性指诱导针对天然或天然存在TAT所具有的抗原性表位的抗体生成的能力。术语“拮抗剂”以最广义使用,包括部分或完全阻断、抑制、或中和本文中所公开的天然TAT多肽的生物学活性的任何分子。类似的,术语“激动剂”以最广义使用,包括模拟本文中所公开的天然TAT多肽的生物学活性的任何分子。合适的激动剂或拮抗剂分子明确包括激动性或拮抗性抗体或抗体片段、天然TAT多肽的片段或氨基酸序列变体、肽、反义寡核苷酸、有机小分子等。用于鉴定TAT多肽的激动剂或拮抗剂分子的方法可包括使TAT多肽接触候选激动剂或拮抗剂分子并测量通常与TAT多肽有关的一种或多种生物学活性的可检测变化。“处理”或“治疗”或“缓和”指治疗性处理及预防性或防范性措施二者,其中目标是预防或减缓(减轻)所针对的病理学状况或紊乱。需要治疗的受试者包括早就患有紊乱的受试者以及倾向于患上紊乱的受试者或要预防紊乱的受试者。如果在依照本发明的方法接受治疗量的抗TAT抗体、TAT结合寡肽或TAT结合有机分子后,患者在如下一项或多项中显示出可观察和/或可测量的降低或消失,那么受试者或哺乳动物成功“治疗” 了表达TAT多肽的癌症癌细胞数减少或癌细胞消失;肿瘤体积缩小;癌细胞浸润到周围器官中,包括癌传播到软组织和骨中受到抑制(即一定程度的减缓,优选停止);肿瘤转移受到抑制(即一定程度的减缓,优选停止);肿瘤生长受到一定程度的抑制;和/或与特定癌症有关的一种或多种症状得到一定程度的减轻;发病率和死亡率降低;及生命质量提高。就抗TAT抗体或TAT结合寡肽可预防癌细胞生长和/或杀死现有癌细胞而言,它可能是抑制细胞的和/或毒害细胞的。这些体征或症状的减轻还可以由患者感受到。用于评估疾病的成功治疗和改善的上述参数可以容易地通过内科医师所熟悉的常规流程来测量。对于癌症治疗,可通过例如评估疾病进展时间(time to diseaseprogression, TTP)和/或测定响应速率(response rate, RR)来测量功效。转移可通过分期测试(staging test)来测定,及通过骨扫描及钙水平和其它酶的测试以测定是否传播到骨。还可进行CT扫描以查明是否传播到骨盆及该区域中的淋巴结。分别使用胸腔X射线和通过已知方法进行的肝酶水平测量来分别查明是否转移到肺和肝。用于监测疾病的其它常规方法包括经直肠超声检查(TRUS)和经直肠针吸活组织检查(TRNB)。“长期”施用指以与短期模式相反的连续模式施用药剂,从而将初始治疗效果(活性)维持较长的一段时间。“间歇”施用指并非连续不间断进行的处理,而是本质上是循环的处理。 对于癌症的治疗、减轻症状、或诊断而言,“哺乳动物”指归入哺乳类的任何动物,包括人、家畜和牲畜,及动物园、运动或宠物动物,诸如犬、猫、牛、马、绵羊、猪、山羊、兔等。优选的是,哺乳动物指人。“联合”一种或多种其它治疗剂的施用包括同时(共同)施用和任意次序的连续施用。“载体”在用于本文时包括药学可接受的载体、赋形剂或稳定剂,它们在所采用的剂量和浓度对暴露于其的细胞或哺乳动物是无毒的。通常,生理学可接受的载体是PH缓冲水溶液。生理学可接受载体的来自包括缓冲剂,诸如磷酸盐、柠檬酸盐和其它有机酸盐的缓冲剂;抗氧化剂,包括抗坏血酸;低分子量(少于约10个残基)多肽;蛋白质,诸如血清清蛋白、明胶或免疫球蛋白;亲水性聚合物,诸如聚乙烯吡咯烷酮;氨基酸,诸如甘氨酸、谷氨酰胺、天冬酰胺、精氨酸或赖氨酸;单糖、二糖和其它碳水化合物,包括葡萄糖、甘露糖或糊精;螯合剂,诸如EDTA ;糖醇,诸如甘露醇或山梨醇;成盐相反离子,诸如钠;和/或非离子表面活性剂,诸如TWEEN 、聚乙二醇(PEG)和“固相”或“固体支持物”意指本发明的抗体、TAT结合寡肽或TAT结合有机分子可粘着或附着其上的非水性基质。本文中所涵盖的固相的例子包括那些部分或完全由玻璃(例如可控孔径玻璃)、多糖(例如琼脂糖)、聚丙烯酰胺、聚苯乙烯、聚乙烯醇和聚硅氧烷(silicone)制成的固相。在某些实施方案中,根据语境,固相可包括测定板的孔;在其它实施方案中,它指纯化柱(例如亲和层析柱)。此术语还包括离散颗粒的不连续固相,诸如美国专利4,275,149中所述。“脂质体”指由各种类型脂质、磷脂和/或表面活性剂构成的,可用于对哺乳动物递送药物(诸如TAT多肽、针对其的抗体或TAT结合寡肽)的小囊泡。与生物膜的脂质排列相似,脂质体的成分通常排列成双层形式。“小”分子或有机“小”分子在本文中定义为分子量小于约500道尔顿。本文中所公开的多肽、抗体、TAT结合寡肽、TAT结合有机分子、或其激动剂或拮抗剂的“有效量”指足以实现明确规定的目的的量。“有效量”可凭经验且以常规方式,联系所述的目的来确定。术语“治疗有效量”指在受试者或哺乳动物中有效“治疗”疾病或紊乱的抗体、多肽、TAT结合寡肽、TAT结合有机分子或其它药物的量。在癌症的情况中,药物的治疗有效量可减少癌细胞数;缩小肿瘤体积;抑制(即一定程度的减缓,优选停止)癌细胞浸润到周围器官中;抑制(即一定程度的减缓,优选停止)肿瘤转移;一定程度的抑制肿瘤生长;和/或一定程度的减轻与癌症有关的一种或多种症状。参见本文中“治疗”的定义。就药物可预防现存癌细胞生长和/或杀死现有癌细胞的程度而言,它可以是抑制细胞的和/或毒害细胞的。抗TAT抗体、TAT多肽、TAT结合寡肽或TAT结合有机分子的“生长抑制量”指能够在体外或在体内抑制细胞,尤其是肿瘤,例如癌细胞生长的量。抗TAT抗体、TAT多肽、TAT结合寡肽或TAT结合有机分子为了抑制肿瘤性细胞生长的“生长抑制量”可凭经验且以常规方式来确定。抗TAT抗体、TAT多肽、TAT结合寡肽或TAT结合有机分子的“细胞毒性量”指能够在体外或在体内引起细胞,尤其是肿瘤,例如癌细胞破坏的量。抗TAT抗体、TAT多肽、TAT结合寡肽或TAT结合有机分子为了抑制肿瘤性细胞生长的“细胞毒性量”可凭经验且以常规方式来确定。 术语“抗体”以最广义使用,明确覆盖例如单一抗TAT单克隆抗体(包括激动性、拮抗性和中和性抗体)、具有多表位特异性的抗TAT抗体组合物、多克隆抗体、单链抗TAT抗体、及抗TAT抗体的片段(见下文),只要它们展现出期望生物学或免疫学活性。术语“免疫球蛋白”(Ig)在本文中与抗体可互换使用。“分离的”抗体指已经鉴定且与/由其天然环境的一种成分分开和/或回收的抗体。其天然环境的污染性成分指会干扰该抗体的诊断或治疗用途的物质,可包括酶、激素、和其它蛋白质性质或非蛋白质性质的溶质。在优选的实施方案中,将抗体纯化至(I)根据Lowry方法的测定,抗体重量超过95%,最优选重量超过99%,(2)足以通过使用转杯式测序仪获得至少15个残基的N-末端或内部氨基酸序列的程度,或(3)根据使用考马斯蓝或优选银染色的还原性或非还原性条件下的SDS-PAGE,达到同质。既然抗体天然环境的至少一种成分不会存在,那么分离的抗体包括重组细胞内的原位抗体。然而,分离的抗体通常通过至少一个纯化步骤来制备。基本的4链抗体单元是由两条相同的轻链(L)和两条相同的重链(H)构成的异四聚体糖蛋白(IgM抗体由5个基本的异四聚体单元及称作J链的另外多肽组成,因此包含10个抗原结合位点;而分泌型IgA抗体可聚合形成包含2-5个基本的4链单元及J链的多价装配物)。在IgG的情况中,4链单元通常是约150,000道尔顿。每条轻链通过一个共价二硫键与重链相连,而两条重链通过一个或多个二硫键彼此相连,二硫键的数目取决于重链的同种型。每条重链和轻链还具有间隔规律的链内二硫键。每条重链在N-末端具有一个可变区(Vh),接着是三个(对于a和Y链)或四个(对于U和e同种型)恒定区(Ch)。每条轻链在N-末端具有一个可变区(VJ,接着是其另一端的一个恒定区(Q)。'与¥11排列在一起,而Q与重链的第一恒定区(ChI)排列在一起。认为特定的氨基酸残基在轻链和重链可变区之间形成界面。成对的一个Vh和一个'一起形成一个抗原结合位点。关于不同类别抗体的结构和性质,参见例如《Basic and Clinical Immunology》,第8版,DanielP. Stites, Abba I. Terr 和 Tristram G. Parslow 编,Appleton&Lange, Norwalk, CT, 1994,第71页和第6章。
来自任何脊椎动物物种的轻链,根据其恒定区氨基酸序列,可归入两种截然不同类型中的一种,称作卡帕(O和拉姆达U)。根据其重链(Ch)恒定区氨基酸序列,免疫球蛋白可归入不同的类别或同种型。有五类免疫球蛋白1§么、1§0、1§£、1§6和1§11,分别具有称作a、6、e、Y和y的重链。根据Ch序列和功能的较小差异,Y和a类可进一步分为亚类,例如人类表达 下列亚类IgGl、IgG2、IgG3、IgG4、IgAl和IgA2。术语“可变的”指可变区中的某些区段在抗体序列中差异广泛的实情。V结构域介导抗原结合并限定特定抗体对其特定抗原的特异性。然而,变异性并非均匀分布于可变区跨越的Iio个氨基酸。事实上,V区由15-30个氨基酸,称作框架区(KR)的相对不变异的区段及将框架区分开的每个长度为9-12个氨基酸,称作“高变区”的极度变异的较短区域构成。天然重链和轻链的可变区各自包含四个FR,它们大多采取¢-折叠构象,通过形成环状连接且在有些情况中形成¢-折叠结构一部分的三个高变区连接。每条链中的高变区通过FR非常接近的保持在一起,并与另一条链的高变区一起促成抗体的抗原结合位点的形成(参见 Kabat 等人,《Sequences of Proteins of Immunological Interest》,第 5 版,Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD, 1991 )。恒定区不直接参与抗体与抗原的结合,但展现出多种效应器功能,诸如抗体依赖性细胞介导的细胞毒性(ADCC)中抗体的参与。术语“单克隆抗体”在用于本文时指从一群基本上同质的抗体获得的抗体,即构成群体的各个抗体相同,除了可能以极小量存在的可能的天然存在突变外。单克隆抗体是高度特异的,针对单一抗原性位点。另外,与通常包含针对不同决定簇(表位)的不同抗体的多克隆抗体制备物不同,每种单克隆抗体针对抗原上的单一决定簇。除了它们的特异性,单克隆抗体的优越性体现在它们在合成时可未受到其它抗体的污染。修饰语“单克隆”不能解释为要求通过任何特定方法来生成抗体。例如,可用于本发明的单克隆抗体可通过最初由Kohler et al., Nature, 256:495(1975)描述的杂交瘤方法来制备,或者可通过重组DNA方法在细菌、真核动物或植物细胞中制备(参见例如美国专利4,816,567)。“单克隆抗体”还可使用例如 Clackson et al. , Nature, 352:624-628 (1991)和 Marks et al. , J. Mol.Biol.,222:581-597(1991)中描述的技术从噬菌体抗体库分离。单克隆抗体在本文中包括“嵌合”抗体,以及此类抗体的片段,其中重链和/或轻链的一部分与衍生自特定物种或属于特定抗体类别或亚类的抗体中的相应序列相同或同源,而链的剩余部分与衍生自另一物种或属于另一抗体类别或亚类的抗体中的相应序列相同或同源,只要它们展现出期望生物学活性(参见美国专利4,816,567和Morrison etal.,Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81:6851-6855 (1984))。本文中感兴趣的嵌合抗体包括包含衍生自非人灵长类动物(如旧大陆猴类(Old World Monkey)、猿等)的可变区抗原结合序列和人恒定区序列的“灵长类化(primatized) ”抗体。“完整抗体”指包含抗原结合位点以及Q和至少重链恒定区Ch1、Ch2和Ch3的抗体。恒定区可以是天然序列恒定区(例如人天然序列恒定区)或其氨基酸序列变体。优选的是,完整抗体具有一项或多项效应器功能。“抗体片段”包含完整抗体的一部分,优选完整抗体的抗原结合区或可变区。抗体片段的例子包括Fab、Fab’、F(ab' )2和Fv片段;双抗体(diabody);线性抗体(参见美国专利 5,641,870,实施例 2; Zapata et al. , Protein Eng. 8 (10) : 1057-1062 (1995));单链抗体分子;及由抗体片段形成的多特异性抗体。用木瓜蛋白酶消化抗体产生两个相同的抗原结合片段,称作“Fab”片段,和一个残余“Fe”片段,其名称反映了它易于结晶的能力。Fab片段由一条完整轻链及一条重链的可变区(Vh)和第一恒定区(ChI)组成。每个Fab片段对于抗原结合是单价的,即它具有一个抗原结合位点。胃蛋白酶处理抗体产生一个较大F(ab' )2片段,它粗略相当于两个通过二硫键相连的Fab片段,具有二价抗原结合活性且仍能够交联抗原。Fab’片段因在C0I结构域的羧基末端增加了少数残基而与Fab片段有所不同,包括来自抗体铰链区的一个或多个半胱氨酸。Fab’ -SH是本文中对其中恒定区半胱 氨酸残基携带游离硫醇基的Fab’的称谓。F(ab’)2抗体片段最初是作为成对Fab’片段生成的,在Fab’片段之间具有铰链半胱氨酸。还知道抗体片段的其它化学偶联。Fe片段包含通过二硫键保持在一起的两条重链的羧基末端部分。抗体的效应器功能是由Fe区中的序列决定的,该区还是受到在某些类型细胞上发现的Fe受体(FcR)识别的部分。“Fv”是包含完整抗原识别和结合位点的最小抗体片段。此片段由紧密、非共价结合的一个重链可变区和一个轻链可变区的二聚体组成。从这两个结构域的折叠中散发出六个高变环(重链和轻链各3个环),贡献出抗原结合的氨基酸残基并赋予抗体以抗原结合特异性。然而,即使是单个可变区(或只包含对抗原特异的三个CDR的半个Fv)也具有识别和结合抗原的能力,尽管亲和力低于完整结合位点。“单链Fv”,也可缩写为“sFv”或“scFv”,是包含连接成一条多肽链的抗体Vh和'结构域的抗体片段。优选的是,sFv多肽在Vh和'结构域之间还包含多肽接头,使得sFv形成抗原结合期望的结构。关于sFv的综述参见Pliickthun,《The Pharmacology ofMonoclonal Antibodies》,vol. 113, Rosenburg 和 Moore 编,Springer-Verlag, New York,pp. 269-315,1994;Borrebaeck 1995,见下文。术语“双抗体”指通过在Vh和\结构域之间使用短接头(约5-10个残基)构建sFv片段(见上一段)而制备的小型抗体片段,由于接头短,使得V结构域实行链间而非链内配对,导致二价片段,即具有两个抗原结合位点的片段。双特异性双抗体是两个“交叉” sFv片段的异二聚体,其中两种抗体的Vh和\结构域存在于不同多肽链上。双抗体更完整的描述于例如 EP 404, 097;WO 93/11161 ;Hollinger et al. , Proc. Natl. Acad. Sci.USA, 90:6444-6448(1993)。非人(例如啮齿类)抗体的“人源化”形式指最低限度包含衍生自非人抗体的序列的嵌合抗体。在极大程度上,人源化抗体指人免疫球蛋白(受体抗体)中的高变区残基用具有期望抗体特异性、亲和力和能力的非人物种(供体抗体)诸如小鼠、大鼠、兔或非人灵长类的高变区残基替换的免疫球蛋白。在有些情况中,将人免疫球蛋白的框架区(FR)残基用相应的非人残基替换。此外,人源化抗体可包含在受体抗体或供体抗体中没有发现的残基。进行这些修饰是为了进一步改进抗体的性能。通常,人源化抗体包含至少一个、通常两个基本上整个如下可变区,其中整个或基本上整个高变环对应于非人免疫球蛋白的高变环,且整个或基本上整个FR是人免疫球蛋白序列的FR。人源化抗体任选还包含至少部分免疫球蛋白恒定区(Fe),通常是人免疫球蛋白的恒定区。更多细节参见Jones et al. , Nature321:522-525(1986);Riechmann et al. , Nature 332:323-329 (1988);Presta,Curr.Op. Struct. Biol. 2:593-596(1992)。“物种依赖性抗体”,例如哺乳动物抗人IgE抗体,指对来自第一哺乳动物物种的抗原的结合亲和力强于对来自第二哺乳动物物种的该抗原的同系物的结合亲和力的抗体。通常,物种依赖性抗体“特异性结合”人类抗原(即具有不超过约1x10_7M,优选不超过约1x10_8M,最优选不超过约1x10_9M的结合亲和力(Kd)),但是对来自第二非人哺乳动物物种的该抗原的同系物具有比其对人类抗原的结合亲和力弱至少约50倍,或至少约500倍,或至少约1000倍的结合亲和力。物种依赖性抗体可以是上文定义的各种类型抗体,但是优选人源化抗体或人抗体。术语“依照Kabat的可变域残基编号”或“依照Kabat的氨基酸位置编号”及其变体指Kabat et al. , Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. PublicHealth Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD. (1991)中的抗体编辑用于重链可变域或轻链可变域的编号系统。使用此编号系统,实际的线性氨基酸序列可包含 较少或另外的氨基酸,对应于可变域FR或CDR的缩短或插入。例如,重链可变域可包含H2残基52后的单一氨基酸插入(依照Kabat为残基52a)及重链FR残基82后的插入残基(例如依照Kabat为残基82a、82b和82c等)。给定抗体的Kabat残基编号可通过将抗体序列与“标准”Kabat编号序列对比同源区来确定。短语“基本上相似”或“基本上相同”在用于本文时表示两个数值(通常一个涉及本发明的抗体而另一个涉及参照/比较抗体)之间足够高的相似程度,以致本领域技术人员将认为在用所述数值(例如Kd值)所测量的生物学特性背景内两个数值之间的差异具有很小的或没有生物学和/或统计学显著性。作为参照/比较抗体的数值的函数,所述两个数值之间的差异优选小于约50%,优选小于约40%,优选小于约30%,优选小于约20%,优选小于约10%。“结合亲和力”通常指分子(例如抗体)的单一结合位点与其结合配偶体(例如抗原)之间全部非共价相互作用总和的强度。除非另有说明,在用于本文时,“结合亲和力”指反映结合对的成员(例如抗体与抗原)之间I: I相互作用的内在结合亲和力。分子X对其配偶体Y的亲和力通常可用解离常数(Kd)来表述。亲和力可通过本领域知道的常用方法来测量,包括本文中所描述的。低亲和力抗体通常缓慢的结合抗原且趋于容易解离,而高亲和力抗体通常更快速的结合抗原且趋于保持更长时间的结合。本领域知道测量结合亲和力的多种方法,其中任一种都可用于本发明的目的。下文描述了具体的示例性实施方案。在一个实施方案中,依照本发明的“Kd”或“Kd值”是通过如下测定法所述使用Fab型式的目的抗体及其抗原进行的放射性标记抗原结合测定法(RIA)来测量的通过在存在未标记抗原的滴定系列的条件下,用最小浓度的125I标记抗原平衡Fab,然后用抗Fab抗体包被的平板捕捉结合的抗原来测量Fab对抗原的溶液中的结合亲和力(Chen,et al.,J MolBiol 293:865-881 (1999)) o 为了确定测定条件,用 50mM 碳酸钠(pH 9. 6)中的 5 y g/ml捕捉用抗Fab抗体(Cappel Labs)包被微量滴定板(Dynex)过夜,随后用PBS中的2%(w/v)牛血清清蛋白在室温(约23° C)封闭2-5小时。在非吸附平板(Nunc#269620)中,将IOOpM或26pM[125I]_抗原与连续稀释的目的Fab混合(例如与Presta et al. , CancerRes. 57:4593-4599(1997)中抗VEGF抗体,Fab-12的评估一致)。然后将目的Fab保温过夜;不过,保温可持续更长时间(例如65个小时)以保证达到平衡。此后,将混合物转移至捕捉板以进行室温保温(例如I小时)。然后除去溶液,并用含0. l%Tween-20的PBS洗板8次。平板干燥后,加入150 u I/孔闪烁液(MicroScint-20; Packard),然后在Topcount伽马计数器(Packard)上对平板计数10分钟。选择各Fab的给出小于或等于最大结合之20%的浓度用于竞争性结合测定法。依照另一实施方案,Kd或Kd值是通过表面等离振子共振测定法使用 BIAcore -2000 或 BIAcore -3000 (BIAcore, Inc.,Piscataway, NJ)在 25 ° C 使用固定化抗原CM5芯片在约10个响应单位(RU)测量的。简而言之,依照供应商的说明书用盐酸N-乙基-N,-(3- 二甲基氨基丙基)-碳化二亚胺(EDC)和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)活化羧甲基化右旋糖苷生物传感器芯片(CM5,BIAcore Inc.)。用IOmM乙酸钠pH 4. 8将抗原稀释至5 u g/ml (约0. 2 ii M),然后以5 iil/分钟的流速注入以获得约10个响应单位(RU)的偶联蛋白质。注入抗原后,注入IM乙醇胺以封闭未反应基团。为了进行动力学测量,在25° C以约25iU/分钟的流速注入在含0. 05%Tween-20的PBS(PBST)中两倍连续稀释的Fab (0. 78nM至500nM)。使用简单一对一朗格缪尔(Langmuir)结合模型(BIAcoreEvaluation Software version 3. 2)通过同时拟合结合和解离传感图计算结合速率(kQn)和解离速率U。平衡解离常数(Kd)以比率IwZkm计算。参见例如Chen,Y.,et al.,JMol Biol 293:865-881(1999)。如果根据上文表面等离振子共振测定法,结合速率超过IO6M-1S'那么结合速率可使用荧光淬灭技术来测定,即根据分光计诸如配备了断流装置的 分光光度计(a stop-f low equipped spectrophometer) (Aviv Instruments)或 8000 系列SLM-Aminco分光光度计(ThermoSpectronic)中用经搅拌的比色杯的测量,在存在浓度渐增的抗原的条件下,测量PBS,pH 7. 2中的20nM抗抗原抗体(Fab形式)在25° C的荧光发射强度(激发=295nm ;发射=340nm, 16nm带通(band pass))的升高或降低。依照本发明的“结合速率”(on-rate, rate of association, association rate)或“k。/也可通过上文所述相同的表面等离振子共振技术使用BIAcOreTM-2000或BIAcoreTm-3000 (BIAcore, Inc.,Piscataway, NJ)在25° C使用固定化抗原CM5芯片在约10个响应单位(RU)来测定。简而言之,依照供应商的说明书用盐酸N-乙基-N’ -(3-二甲基氨基丙基)_碳化二亚胺(EDC)和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)活化羧甲基化右旋糖苷生物传感器芯片(CM5, BIAcore Inc.)。用IOmM乙酸钠pH 4. 8将抗原稀释至5 u g/ml (约0. 2 u M),然后以5 Ul/分钟的流速注入以获得约10个响应单位(RU)的偶联蛋白质。注入抗原后,注入IM乙醇胺以封闭未反应基团。为了进行动力学测量,在25° C以约25 Ul/分钟的流速注入在含0. 05%Tween-20的PBS(PBST)中两倍连续稀释的Fab(0. 78nM至500nM)。使用简单一对一朗格缪尔(Langmuir)结合模型(BIAcoreEvaluation Software version 3. 2)通过同时拟合结合和解离传感图计算结合速率(km)和解离速率。平衡解离常数(Kd)以比率计算。参见例如 Chen, Y.,et al.,J Mol Biol 293:865-881(1999)。然而,如果根据上文表面等离振子共振测定法,结合速率超过IO6M4S'那么结合速率优选使用荧光淬灭技术来测定,即根据分光计诸如配备了断流装置的分光光度计(Aviv Instruments)或8000系列SLM-Aminco分光光度计(ThermoSpectronic)中用经搅拌的比色杯的测量,在存在浓度渐增的抗原的条件下,测量PBS,pH 7. 2中的20nM抗抗原抗体(Fab形式)在25° C的突光发射强度(激发=295nm ;发射=340nm, 16nm带通)的升高或降低。在一个实施方案中,依照本发明的“Kd”或“Kd值”是通过如下测定法所述使用Fab型式的抗体和抗原分子进行的放射性标记抗原结合测定法(RIA)来测量的通过在存在未标记抗原的滴定系列的条件下,用最小浓度的125I标记抗原平衡Fab,然后用抗Fab抗体包被的平板捕捉结合的抗原来测量Fab对抗原的溶液中的结合亲和力(Chen, et al. , J Mol Biol 293:865-881(1999))。为了确定测定条件,用50mM碳酸钠(pH 9.6)中的5 y g/ml捕捉用抗Fab抗体(CappelLabs)包被微量滴定板(Dynex)过夜,随后用PBS中的2%(w/v)牛血清清蛋白在室温(约23。C)封闭2-5小时。在非吸附平板(Nunc#269620)中,将IOOpM或26pM[125I]-抗原与连续稀释的目的 Fab 混合(与 Presta et al. , Cancer Res. 57:4593-4599 (1997)中抗 VEGF抗体,Fab-12的评估一致)。然后将目的Fab保温过夜;不过,保温可持续更长时间(例如65个小时)以保证达到平衡。此后,将混合物转移至捕捉板以进行室温保温I小时。然后除去溶液,并用含0. l%Tween-20的PBS洗板8次。平板干燥后,加入150 U I/孔闪烁液(MicroScint-20;Packard),然后在Topcount伽马计数器(Packard)上对平板计数10分钟。选择各Fab的给出小于或等于最大结合之20%的浓度用于竞争性结合测定法。依照另一实施方案,Kd或Kd值是通过表面等离振子共振测定法使用BIACOTeTM-2000或BIAcore -3000 (BIAcore, Inc.,Piscataway, NJ)在25° C使用固定化抗原CM5芯片在约10个响应、单位(RU)测量的。简而言之,依照供应商的说明书用盐酸N-乙基-N’ -(3-二甲基氨基丙基)_碳化二亚胺(EDC)和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)活化羧甲基化右旋糖苷生物传感器芯片(CM5, BIAcore Inc.)。用IOmM乙酸钠pH 4. 8将抗原稀释至5 u g/ml (约0. 2 u M),然后以5 Ul/分钟的流速注入以获得约10个响应单位(RU)的偶联蛋白质。注入抗原后,注入IM乙醇胺以封闭未反应基团。为了进行动力学测量,在25° C以约25 Ul/分钟的流速注入在含0. 05%Tween-20的PBS(PBST)中两倍连续稀释的Fab(0. 78nM至500nM)。使用简单一对一朗格缪尔(Langmuir)结合模型(BIAcore Evaluation Software version 3. 2)通过同时拟合结合和解离传感图计算结合速率(km)和解离速率Gwf)。平衡解离常数(Kd)以比率 kf/U 计算。参见例如 Chen, Y. , et al. , J Mol Biol 293:865-881(1999)。如果根据上文表面等离振子共振测定法,结合速率超过IO6M4S'那么结合速率可使用荧光淬灭技术来测定,即根据分光计诸如配备了断流装置的分光光度计(Aviv Instruments)或8000系列SLM-Aminco分光光度计(ThermoSpectronic)中用经搅拌的比色杯的测量,在存在浓度渐增的抗原的条件下,测量PBS,pH 7. 2中的20nM抗抗原抗体(Fab形式)在25° C的荧光发射强度(激发=295nm ;发射=340nm, 16nm带通)的升高或降低。 在一个实施方案中,依照本发明的“结合速率”(on-rate, rate ofassociation, association rate)或“km”是通过上文所述相同的表面等离振子共振技术使用 BIAcore -2000 或 BIAcore -3000 (BIAcore, Inc. , Piscataway, NJ)在 25 ° C 使用固定化抗原CM5芯片在约10个响应单位(RU)测定的。简而言之,依照供应商的说明书用盐酸N-乙基-N,-(3-二甲基氨基丙基)-碳化二亚胺(EDC)和N-羟基琥珀酰亚胺(NHS)活化羧甲基化右旋糖苷生物传感器芯片(CM5,BIAcore Inc.)。用IOmM乙酸钠pH 4. 8将抗原稀释至5 ii g/ml (约0. 2iiM),然后以5iU/分钟的流速注入以获得约10个响应单位(RU)的偶联蛋白质。注入抗原后,注入IM乙醇胺以封闭未反应基团。为了进行动力学测量,在25° C以约25iU/分钟的流速注入在含0. 05%Tween-20的PBS(PBST)中两倍连续稀释的Fab (0. 78nM至500nM)。使用简单一对一朗格缪尔(Langmuir)结合模型(BIAcoreEvaluation Software version 3. 2)通过同时拟合结合和解离传感图计算结合速率(kon)和解离速率(koff)。平衡解离常数(Kd)以比率IwZkm计算。参见例如Chen,Y.,etal. , J Mol Biol 293:865-881 (1999) 0然而,如果根据上文表面等离振子共振测定法,结合速率超过IO6M-1S'那么结合速率优选使用荧光淬灭技术来测定,即根据分光计诸如配备了断流装置的分光光度计(Aviv Instruments)或8000系列SLM-Aminco分光光度计(ThermoSpectronic)中用经搅拌的比色杯的测量,在存在浓度渐增的抗原的条件下,测量PBS, pH7. 2中的20nM抗抗原抗体(Fab形式)在25。C的荧光发射强度(激发=295nm ;发射=340nm, 16nm带通)的升高或降低。短语“实质性降低”或“实质性不同”在用于本文时表示两个数值(通常一个涉及本发明的抗体而另一个涉及参照/比较抗体)之间足够高的差异程度,以致本领域技术人员将认为在用所述数值(例如Kd值、HAMA反应)所测量的生物学特性背景内两个数值之间的差异具有统计学显著性。作为参照/比较抗体的数值的函数,所述两个数值之间的差异优选大于约10%,优选大于约20%,优选大于约30%,优选大于约40%,优选大于约50%。“抗原”是抗体可选择性结合的预定抗原。靶抗原可以是多肽、碳水化合物、核酸、脂质、半抗原或其它天然发生的或合成的化合物。优选的是,靶抗原是多肽。就本文目的而 言,“受体人框架”是包含衍生自人免疫球蛋白框架或人共有框架的VL或VH框架之氨基酸 序列的框架。“衍生自”人免疫球蛋白框架或人共有框架的受体人框架包含与之相同的氨基酸序列,或者可包含预先存在的氨基酸序列变化。当存在预先存在的氨基酸变化时,优选存在不超过5个,优选4个或更少,或者3个或更少预先存在的氨基酸变化。当VH中存在预先存在的氨基酸变化时,优选那些变化只位于71H、73H和78H中的三个、两个或一个位置;例如,位于那些位置的氨基酸残基可以是71A、73T和/或78A。在一个实施方案中,VL受体人框架在序列上与VL人免疫球蛋白框架序列或人共有框架序列相同。本发明的抗体可能能够竞争对第二抗体所结合的相同表位的结合。若单克隆抗体在标准体外抗体竞争结合分析中在相同抗体浓度阻断其它单克隆抗体的结合达40%或更多,则认为各单克隆抗体共享“相同表位”。“人共有框架”是代表人免疫球蛋白VL或VH框架序列选集中最常见的氨基酸残基的框架。通常,所述人免疫球蛋白VL或VH选集来自可变区序列亚型。通常,所述序列亚型是如Kabat等人所述的亚型。在一个实施方案中,对于VL,所述亚型是如Kabat等人所述的亚型K I。在一个实施方案中,对于VH,所述亚型是如Kabat等人所述的亚型III。“VH亚型III共有框架”包含获自Kabat等人所述的可变重链亚型III中的氨基酸序列的共有序列。“VL亚型I共有框架”包含获自Kabat等人所述的可变轻链k亚型I中的氨基酸序列的共有序列。“未修饰的人框架”是具有与受体人框架相同的氨基酸序列的人框架,例如在受体人框架中没有人到非人的氨基酸替代。“改变的高变区”就本文目的而言是其中包含一个或多个(例如I个至约16个)氨基酸替代的高变区。“未修饰的高变区”就本文目的而言是具有与衍生它的非人抗体相同的氨基酸序列的高变区,即其中没有一个或多个氨基酸替代的高变区。术语“高变区”、“ HVR ”、“ HV ”或“⑶R ”在用于本文时指抗体可变域中序列上高度可变且/或形成结构上确定的环的区域。通常,抗体包含6个高变区三个在VH中(HI、H2、H3),三个在VL中(LI、L2、L3)。本文使用且包括许多高变区的叙述。Kabat互补决定区(O)R)是以序列可变性为基础的,而且是最常用的(Kabat et al. , Sequences of Proteinsof Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes ofHealth, Bethesda, MD. (1991))。Chothia 改为指结构环的位置(Chothia and LeskJ. Mol.Biol. 196:901-917(1987))。“接触”高变区是以可获得复杂晶体结构的分析为基础的。下文记录了这些高变区中每一个的残基。除非另有说明,将采用Kabat编号。高变区的位置通常如下第24-34位氨基酸(HVR-Ll)、第49-56位氨基酸(HVR-L2)、第89-97位氨基酸(HVR-L3)、第26-35A位氨基酸(HVR-Hl)、第49-65位氨基酸(HVR-H2)和第93-102位氨基酸(HVR-H3)。高变区还可包括如下“延伸的高变区”:VL中的氨基酸24_36(L1)和氨基酸46-56 (L2)。对于这些定义中的每一个,可变域残基是依照文献Kabat等人(见上文)所述编号的。“框架”或“FR”残基是可变区中除了如本文所定义的高变区残基以外的那些残基。 “人抗体”是具有与由人生成的抗体的氨基酸序列对应的氨基酸序列且/或使用本文所公开的用于制备人抗体的任何技术制备的抗体。人抗体的这种定义明确排除了包含非人抗原结合残基的人源化抗体。“亲和力成熟的”抗体指在其一个或多个CDR中具有导致抗体对抗原的亲和力与没有这些改变的亲本抗体相比有所改进的一处或多处改变的抗体。优选的亲和力成熟的抗体将具有纳摩尔或甚至皮摩尔水平的对靶抗原的亲和力。亲和力成熟的抗体可通过本领域已知流程生成。Marks et al. , Bio/Technology 10:779-783 (1992)描述了经由通过VH和VL结构域改组的亲和力成熟。下列文献描述了⑶R和/或框架残基的随机诱变Barbas et al. , Proc. Nat. Acad. Sci. USA 91:3809-3813 (1994) ; Schieret al., Gene 169:147-155 (1995);Yelton et al.,J. Immunol. 155:1994-2004(1995);Jackson et al.,J. Immunol. 154 (7) : 3310-9 (1995);及 Hawkins et al. , J. Mol.Biol.226:889-896(1992)。“阻断性”抗体或“拮抗性”抗体指抑制或降低其所结合的抗原的生物学活性的抗体。优选的阻断性抗体或拮抗性抗体基本上抑制或完全抑制抗原的生物学活性。“TAT结合寡肽”指结合,优选特异性结合本文中所描述的TAT多肽的寡肽。TAT结合寡肽可使用已知寡肽合成方法而化学合成,或者可使用重组技术来制备和纯化。TAT结合寡肽的长度通常是至少约5个氨基酸,或者长度为至少约6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19、20、21、22、23、24、25、26、27、28、29、30、31、32、33、34、35、36、37、38、39、40、41、42、43、44、45、46、47、48、49、50、51、52、53、54、55、56、57、58、59、60、61、62、63、64、65、66、67、68、69、70、71、72、73、74、75、76、77、78、79、80、81、82、83、84、85、86、87、88、89、90、91、92、93、94、95、96、97、98、99或100个氨基酸或更多,其中能够结合,优选特异性结合本文所述TAT多肽的此类TAT结合寡肽可使用众所周知的技术无需过多实验就得以鉴定。在这点上,注意到用于对寡肽库筛选能够特异性结合多肽靶物的寡肽的技术是本领域众所周知的(参见例如美国专利 5,556,762,5,750,373,4,708,871,4,833,092,5,223,409,5,403,484,5,571,689,5,663,143; PCT
发明者B.鲁宾菲尔德, M.丹尼斯, P.波拉基斯 申请人:霍夫曼-拉罗奇有限公司
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