用于提高汉坦病毒融合蛋白g2s0.7表达的腺病毒高表达载体的制作方法

文档序号:576802阅读:195来源:国知局
专利名称:用于提高汉坦病毒融合蛋白g2s0.7表达的腺病毒高表达载体的制作方法
技术领域
本发明属于生物技术领域,涉及分子生物学、免疫学及免疫应用等相关领域。本 发明涉及腺病毒重组转移载体的改建及其对肾综合征出血热(HFRS)致病原——汉坦病毒 (HV)的嵌合基因G2S0. 7的表达。
背景技术
肾综合征出血热及其基因工程疫苗研究现状肾综合征出血热(hemorrhagic fever with renal syndrome, HFRS)是由汉坦病 毒(Hantavirus,HV)引起,由鼠类等传播的一种急性病毒性传染病,临床上以发热、出血和 急性肾功能损害为主要特征。中国是世界上HFRS疫情最严重的国家,具有流行范围广、发 病人数多、病死率高等特点,到目前为止临床上尚缺乏特异有效的治疗药物。为易感人群接种疫苗是预防传染性疾病大规模流行的最有效措施。因此,针对 HFRS疫苗的研究一直是该领域的热点。国内外近年来虽已研制出HFRS的灭活疫苗,但从 部分人群试用的情况来看,该类疫苗还存在明显不足,主要是其诱导机体产生中和抗体的 能力较弱,也不能有效地刺激细胞免疫应答。目前在HFRS基因工程疫苗基础研究中主要 使用的是病毒囊膜糖蛋白(Glycoprotein,GP),但GP免疫原性相对较弱,刺激机体产生的 抗体出现较晚,滴度亦不高。本发明人多年对HV中免疫原性最强的核蛋白(Nucleocapsid Protein, NP)的结构及功能,NP与GP不同片段嵌合基因(G1S0. 7、G2S0. 7)的构建及其表 达,以及不同融合基因(蛋白)刺激机体免疫应答的能力及其影响因素等进行了较为深入 的研究。一系列体内、外实验结果表明,上述嵌合基因在腺病毒表达系统中能有效地刺激机 体的体液免疫(包括中和抗体)应答以及细胞免疫应答,且其效果均高于非嵌合组。然而在研究中我们也发现了一些问题,如尽管利用各种系统均能表达出完整的融 合蛋白,但总的来说蛋白表达量还是偏低。此外,用融合蛋白免疫动物后虽然各表达系统均 能刺激机体产生体液及细胞免疫应答,且腺病毒表达系统的效果要优于其他系统,但是整 体的免疫水平还不十分理想。因此,进一步选择合适的表达载体、优化表达系统对目前HFRS 基因工程疫苗的研究有着重要的意义。表达载体的优化在HFRS基因工程疫苗研究领域里,如何提高外源基因的表达水平是亟待解决的难题之一。由于转录外源DNA序列的启动于和增强子是最基本的真核表达组件,因此,选 择合适的启动子或增强子并改进其活性是提高外源基因表达首先要考虑的问题。许多 来源于病毒的增强子元件,如SV40的早期基因增强子,Rous肉瘤病毒基因组长末端重复 序列(LTR)区和人类巨细胞病毒(CMV)早期启动子,在来自各种哺乳动物的多种型别细 胞中都有很强的活性。目前广泛应用的CMV启动子虽然是比较有效的表达系统启动子, 但实际应用中有些基因通常不能得到满意的表达效果。例如Garg S, et al. Thehybrid cytomegalovirus enhancer/chicken β -actin promoter along withwoodchuckhepatitis virus posttranscriptional regulatory element enhances theprotective efficacy of DNA vaccines. 2004 ;J Immunol. 173 :550 558 比较了 使用人 CMV 启动 子和CAG启动子/增强子(人CMV启动子和鸡β-actin启动子的杂合体)的流感病毒 血凝素(haemagglutinin,HA)DNA疫苗的免疫效果,使用CMV启动子几乎不能诱发任何 抗HA抗体,而使用CAG启动子/增强子可诱发较低水平的抗HA抗体。You LM, et al. A hybrid promoter-containing vectorfor direct cloning and enhanced expression of PCR-amplified ORFs inmammalian cells. 2009 ;Sep 16. Mol Biol Rep.等的最新研究表 明他们设计的一个含CAG启动子/增强子的真核载体pCAGX能在更广泛的宿主细胞中提 高外源基因的蛋白表达水平。此外还有Yoshio Nitta, et al. A CMV-actin-globinhybrid promoter improves adeno—associated viral vector gene expression in thearterial wall in vivo.The Journal ofGene Medicine. 2005 ;7 (10) 1348 1355 和 Halbert CL, et al.High-efficiency promoter-dependent transduction by adeno—associated virus type 6vectors in mouse lung. Hum Gene Ther.2007Apr ; 18 (4) :344 354。多 项报道显示CAG启动子比CMV启动子诱生抗体的水平要高。因此本专利中腺病毒转移 载体的优化研究采用了 CAG启动子/增强子替换原有的CMV启动子。此外,国内外学者 的研究表明,选择不同的启动子并配合不同的转录调节元件有助于选择出适用于特定基 因的表达系统。如前文所述的Garg等的流感病毒血凝素DNA疫苗的免疫效果的研究, 如在HA基因后加上土拨鼠肝炎病毒稳定mRNA转录后调节元件(mRNA-stabiIizingpo st—transcriptional regulatory element from the woodchuck hepatitis virus, WPRE)后,均可提高CMV启动子和CAG启动子诱生抗HA抗体的水平,且CAG启动子比CMV 启动子诱生抗体的水平高一倍。在腺病毒表达系统中,也有Xu ZL, et al. Woodchuck hepatitis virus post-transcriptional reguIationelement enhances transgene expression from adenovirus vectors. BiochimBiophys Acta. 2003 ; 1621 (3) :266 271 和Boulos S, et al. Assessment of CMV, RSV and SYNl promoters and the woodchuck post-transcriptional regulatoryelement in adenovirus vectors for transgene expression in cortical neuronalcultures. Brain Res. 2006 ;1102 (1) :27 38 多项石if 究显示WPRE可以增强不同启动子的活性,增强基因的表达。

发明内容
本发明的目的是将本申请人前期构建的含汉滩病毒76-118株的G2和SO. 7的嵌 合基因与腺病毒转移载体的重组质粒G2S0. 7-pShuttle进行改建,以获得用于提高汉坦病 毒融合蛋白G2S0. 7表达的腺病毒高表达载体。本发明目的是以下述方式实现的一种用于提高汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7表达 的腺病毒高表达载体,对含嵌合基因G2S0. 7的腺病毒转移载体G2S0. 7-pShuttle进行改 建,将其CMV启动子替换为CAG启动子/增强子,得到含CAG启动子/增强子的高表达汉坦 病毒融合蛋白G2S0. 7的腺病毒重组转移载体,命名为G2S0. 7-pCAG,其全基因序列为SEQ ID NO 1 所示。一种用于提高汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7表达的腺病毒高表达载体,对含嵌合基 因G2S0. 7的腺病毒转移载体G2S0. 7-pShuttle进行改建,在其3,端插入WPRE转录调控元件,得到含WPRE调控元件的高表达汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7的腺病毒重组转移载体,命名 为G2S0. 7-WPRE,其全基因序列为SEQ ID NO 2所示。一种用于提高汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7表达的腺病毒高表达载体,对含嵌合基 因G2S0. 7的腺病毒转移载体G2S0. 7-pShuttle进行改建,将其CMV启动子替换为CAG启动 子/增强子并在其3,端插入WPRE转录调控元件,得到含CAG启动子/增强子和WPRE调控元 件的高表达汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7的腺病毒重组转移载体,命名为G2S0. 7-pCAG-ffPRE, 其全基因序列为SEQ ID NO 3所示。本发明利用基因重组技术,将本申请人前期构建的含汉坦病毒76-118株的G2与 SO. 7的嵌合基因与腺病毒转移载体的重组质粒G2S0. 7-pShuttle进行改建。本发明包括 替换重组质粒G2S0. 7-pShuttle的启动子(CAG)或(和)插入转录后调控元件(WPRE),以 提高融合蛋白G2S0. 7的表达水平。将本发明及未改建质粒G2S0. 7-pShuttle分别整合进 腺病毒DNA,在HEK293细胞中包装腺病毒,比较各组重组腺病毒外源蛋白G2S0. 7的表达水 平。结果显示本发明与原转移载体PShuttle相比,均能有效提高外源蛋白的表达,且以替 换启动子组效果最明显。


图 1. G2S0. 7-pCAG Nhe I+Not I 双酶切鉴定结果。其中Ll :G2S0. 7-pCAG ;M 500bp DNA Ladder Marker。图 2. G2S0. 7-WPRE Kpn I+Aft II 双酶切鉴定结果。其中L1 :G2S0. 7-ffPRE ;M :DL 2000Markero图3.改建重组转移载体G2S0. 7-pCAG-WPRE示意图。图 4. G2S0. 7-pCAG、G2S0. 7-WPRE、G2S0. 7-pCAG-ffPRE 重组转移载体 Nhe I+Not I 双酶切鉴定结果。其中L1 :G2S0. 7-pCAG ;L2 :G2S0. 7-ffPRE ;L3 :G2S0. 7-pCAG-ffPRE ;M Wide Range DNA Marker。图 5. Ad-G2S0. 7-pCAG、Ad_G2S0· 7-WPRE、Ad_G2S0· 7-pCAG-ffPRE 重组转移载体 I-Ceu I+PI-Sce I 双酶切鉴定结果。其中L1 :Ad_G2S0. 7-ffPRE ;L2 :Ad_G2S0. 7-pCAG ;L3 Ad-G2S0. 7-pCAG-ffPRE ;M =Wide Range DNA Marker。图6.融合蛋白G2S0. 7在不同重组腺病毒中表达的免疫荧光检测结果。其中A Ad-G2S0. 7 ;B :Ad_G2S0· 7-ffPRE ;C :Ad_G2S0· 7-pCAG ;D :Ad_G2S0· 7-pCAG-WPRE。E 正常 293 细胞对照。图7.融合蛋白G2S0.7在不同重组腺病毒中表达的Western Blot结果。其 中 A :293 细胞对照;B =Adenovirus-Lac-Z 对照 C :Ad_G2S0· 7 ;D :Ad_G2S0· 7-ffPRE ;E Ad-G2S0. 7-pCAG ;F :Ad-G2S0. 7-pCAG-WPRE。
具体实施例方式本发明所用的腺病毒表达系统购自CL0NTECH公司的Adeno-X 系统(货号 K1650-1),其转移载体为pShuttle,含有CMV启动子。本发明中所采用的汉坦病毒为汉滩病毒76-118株。其基因组由L、M和S三个基因 片段组成。其中L片段编码RNA依赖的RNA聚合酶;M片段编码囊膜糖蛋白(GP)Gl和G2 ;S片段编码核衣壳蛋白(NP)。本专利中所涉及的嵌合基因由其M片段的G2部分及S片段 的0. 7部分分别PCR扩增获得,利用基因融合技术将其融合,并在其5’端设计Xba 1、3’端 设计NotI酶切位点,克隆入腺病毒转移载体pShuttle的相应酶切位点获得重组质粒,命名 为 G2S0. 7-pShuttle。 本发明中所替换的CAG启动子/增强子是人类巨细胞病毒 (humancytomegalovirus, CMV)早期启动子与鸡β-actin启动子的杂合体。其序列是综 合参考其他人文献,并根据本项目要求在其5’端设计Mfe 1,3'端设计Sfi I,Nhe I酶切 位点,其中Sfi I用于后续研究克隆位点,片段大小1747bp,交由Takara公司至pMD19-T Simple载体中合成。改建后的重组转移载体命名为G2S0. 7-pCAG。G2S0. 7-pCAG的全基因 序列为SEQ ID NO 1所示。本发明中所插入WPRE转录调控元件全名为土拨鼠肝炎病毒稳定mRNA转录后 i周节 7Π 件(mRNA-stabilizing post-transcriptional regulatory elementfrom the woodchuck hepatitis virus,WPRE),其序列参考GENBANK序列编号 AX823860 的WPRE序列, 根据本发明要求在其5’端和3’端分别设计Kpn I和Afl II酶切位点,片段大小623bp, 交由Takara公司至pMD19-T Simple载体中合成。重组转移载体命名为G2S0. 7-WPRE。 G2S0. 7-WPRE的全基因序列为SEQ ID NO 2所示。本发明中所涉及的第三种重组转移载体在上述G2S0. 7-pCAG基础上改建获得。利 用WPRE序列上的Kpn I和Afl II酶切位点克隆入pCAG相应的位点。改建后的重组转移 载体命名为 G2S0. 7-pCAG-WPRE。G2S0. 7-pCAG-WPRE 的全基因序列为 SEQ ID NO :3 所示。本发明中所有重组质粒构建方法具体如下1)G2S0. 7-pCAG构建方法根据腺病毒转移载体pShuttle的酶切位点,设计各改 建片段的插入酶切位点,CAG序列5,端设计Mfe 1,3,端设计Sfi I,Nhe I,其中Sfi I用于 后续研究克隆位点。用Mfe I和Nhe I分别双酶切pShuttle和pMD19_T Simple-CAG质粒, 构建pCAG重组载体。Nhe I和Not I分别双酶切pCAG重组载体和G2S0. 7-pShuttle质粒, 胶回收目的片段(G2S0. 7)和载体(pCAG),T4连接酶14°C连接过夜,连接产物转化(JM109 感受态)后涂布含卡那抗性的2 X YT固体培养基,37°C孵箱培养12 14小时,挑选单菌落 摇菌提质粒后酶切鉴定,获得阳性克隆。附图1.为G2S0. 7-pCAG阳性克隆Nhe I+Not I双 酶切鉴定结果。2)G2S0. 7-WPRE构建方法根据腺病毒转移载体pShuttle的酶切位点,为WPRE序 列的5’端和3’端分别设计Kpn I和Afl II酶切位点。用Kpn I和Afl II分别双酶切 PMD19-T Simple-WPRE和G2S0. 7-pShuttle质粒,胶回收目的片段和载体,T4连接酶14°C 连接过夜,连接产物转化(JM109感受态)后涂布含卡那抗性的2XYT固体培养基,37°C 孵箱培养12 14小时,挑选单菌落摇菌提质粒后酶切鉴定,获得阳性克隆。附图2.为 G2S0. 7-WPRE阳性克隆Kpn I+Afl II双酶切鉴定结果。3)G2S0. 7-pCAG-ffPRE构建方法Kpn I和Afl II双酶切重组转移载体 G2S0. 7-pCAG,并同样双酶切pMD19_T Simple-ffPRE,胶回收载体和目的片段,T4连接酶 14°C连接过夜,连接产物转化(JM109感受态)后涂布含卡那抗性的2XYT固体培养基, 37°C孵箱培养12 14小时,挑选单菌落摇菌提质粒后酶切鉴定,获得阳性克隆。附图3.为 G2S0. 7-pCAG-ffPRE重组转移载体示意图。
4)含目的片段G2S0. 7转移载体的鉴定本发明所构建目的片段为汉滩病毒76-118株M片段G2部分和S片段0. 7部分的嵌合基因G2S0. 7,其大小约为2. 2kb。在完 成所有重组转移载体的改建后,用Nhe I和Not I双酶切鉴定含目的片段G2S0. 7的转移载 体。附图4.为G2S0. 7-pCAG、G2S0. 7-WPRE、G2S0. 7-pCAG-ffPRE重组转移载体酶切鉴定结
果 ο5)重组腺病毒DNA构建、鉴定及腺病毒包装将上述构建成功的转移载体和腺病 毒质粒分别用PI-Sce I和I-Ceu I双酶切,胶回收目的片段和载体,T4连接酶14°C连接过 夜,连接产物转化(JM109感受态)后涂布含氨苄抗性的2XYT固体培养基,37°C孵箱培养 12 14小时,挑选单菌落摇菌提质粒后酶切鉴定,获得阳性克隆。将重组腺病毒DNA用Pac I酶单切以线性化质粒,转染HEK293细胞,待出现明显CPE (Cytopathic Effect,细胞病变) 后收细胞,离心后将沉淀重悬于高压灭菌的PBS。反复冻融该沉淀3次后离心收集上清,即 为重组腺病毒。附图 5.为 Ad-G2S0. 7-pCAG、Ad-G2S0. 7-WPRE、Ad_G2S0. 7-pCAG-ffPRE 双酶 切鉴定结果。6)不同重组腺病毒融合蛋白表达水平的比较测定重组腺病毒滴度(具体方法参 ICLONTECH Adeno-x Rapid Titer Kit, Cat. No. 631028)。以 lOOpfu/cell 的 MOI 感染 293细胞,同时感染本申请人前期包装的Ad-G2S0. 7腺病毒作为对照,48小时后免疫荧光检 测目的蛋白的表达。可观察到细胞膜上的特异性荧光,其中改建转移载体重组腺病毒的荧 光显著,尤以 Ad-G2S0. 7-pCAG 组最为明显,Ad_G2S0. 7-pCAG-ffPRE 次之。Western blot 检 测目的蛋白的表达,以相同的MOI感染293细胞,48小时后收样并测定蛋白含量,确保每孔 上样量相同。可观察到目的蛋白的特异性表达,其中改建转移载体重组腺病毒的目的蛋白 特异条带比较显著,尤以Ad-G2S0. 7-pCAG组表达最为明显,Ad-G2S0. 7_pCAG_WPRE次之。利 用ELISA检测蛋白表达水平,包被本申请人制备针对融合蛋白的特异性单抗1A8,检测抗体 为出血热抗原免疫兔血清,得到结果与上述结果相符。附图6.为不同重组腺病毒融合蛋白 G2S0. 7表达水平的免疫荧光检测结果;附图7.为融合蛋白G2S0. 7在不同重组腺病毒中表 达的Western blot结果。序列表<110>中国人民解放军第四军医大学<120>用于提高汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7表达的腺病毒高表达载体<160>3<210>1<211>7456<212>DNA<213>Artificial<400>1taactataac ggtcctaagg tagcgaaagc tcagatctgg atctcccgat cccctatggt 60cgactctcag tacaatctgc tctgatgccg catagttaag ccagtatctg ctccctgctt 120gtgtgttgga ggtcgctgag tagtgcgcga gcaaaattta agctacaaca aggcaaggct 180tgaccgacaa ttgtcgacat tgattattga ctagttatta atagtaatca attacggggt 240cattagttca tagcccatat atggagttcc gcgttacata acttacggta aatggcccgc 300
ctggctgaccgcccaacgacccccgcccat tgacgtcaat aatgacgtat gttcccatag360taacgccaatagggactttccattgacgtc aatgggtgga ctatttacgg taaactgccc420acttggcagtacatcaagtg tatcatatgc caagtacgcc ccctattgac gtcaatgacg480gtaaatggcccgcctggcattatgcccagt acatgacctt atgggacttt cctacttggc540agtacatctacgtattagtcatcgctatta ccatgggtcg aggtgagccc cacgttctgc600ttcactctccccatctcccccccctcccca cccccaattt tgtatttatt tattttttaa660ttattttgtgcagcgatggg ggcggggggg gggggggcgc gcgccaggcg gggcggggcg720gggcgaggggcggggcgggg cgaggcggag aggtgcggcg gcagccaatc agagcggcgc780getccgaaagtttcctttta tggcgaggcg gcggcggcgg cggccctata aaaagcgaag840cgcgcggcgggcgggagtcg ctgcgttgcc ttcgccccgt gccccgctcc gcgccgcctc900gcgccgcccgccccggctctgactgaccgc gttactccca caggtgagcg ggcgggacgg960cccttctcctccgggctgta attagcgctt ggtttaatga cggctcgttt cttttctgtg1020gctgcgtgaaagccttaaag ggctccggga gggccctttg tgcggggggg agcggctcgg1080ggggtgcgtgcgtgtgtgtg tgcgtgggga gcgccgcgtg cggcccgcgc tgcccggcgg1140ctgtgagcgctgcgggcgcg gcgcggggct ttgtgcgctc cgcgtgtgcg cgaggggagc1200gcggccgggggcggtgccccgcggtgcggg ggggctgcga ggggaacaaa ggctgcgtgc1260ggggtgtgtgcgtggggggg tgagcagggg gtgtgggcgc ggcggtcggg ctgtaacccc1320cccctgcacccccctccccg agttgctgag cacggcccgg cttcgggtgc ggggctccgt1380gcggggcgtggcgcggggctcgccgtgccg ggcggggggt ggcggcaggt gggggtgccg1440ggcggggcggggccgcctcg ggccggggag ggctcggggg aggggcgcgg cggccccgga1500gcgccggcggctgtcgaggcgcggcgagcc gcagccattg ccttttatgg taatcgtgcg1560agagggcgcagggacttcctttgtcccaaa tctggcggag ccgaaatctg ggaggcgccg1620ccgcaccccctctagcgggcgcgggcgaag cggtgcggcg ccggcaggaa ggaaatgggc1680ggggagggccttcgtgcgtcgccgcgccgc cgtccccttc tccatctcca gcctcggggc1740tgccgcagggggacggctgccttcgggggg gacggggcag ggcggggttc ggcttctggc1800gtgtgaccggcggctctaga gcctctgcta accatgttca tgccttcttc tttttcctac1860agctcctgggcaacgtgctg gttgttgtgc tgtctcatca ttttggcaaa gaattggcct1920cgacggccgctagcgtttaa acgggccctc tagaatgtgg atatttcttc ttgtcttaga1980atccttactgtgggctgcaa gtgcatcaga gacaccatta actcctgtct ggaatgacaa2040tgcccatggggtaggttctg ttcctatgca tacagattta gagcttgatc tctctttaac2100atccagttccaagtatacataccgtaggaa gttaacaaac ccacttgagg aagcacgatc2160cattgacctacatattgaaa tagaagaaca gacaattggt gttgatgtgc atgctctagg2220acactggtttgatggtcgtcttaaccttaa aacatccttt cactgttatg gtgcttgtac2280aaagtatgaatacccttggcatactgcaaa gtgccactat gaaagagatt accaatatga2340gacgagctggggttgtaatccatcagattg tcctggggtg ggcacaggct gtacagcatg2400tggtttatacctagatcaactgaaaccagt tggtagtgct tataaaatta tcacaataag2460gtacagcaggagagtctgtg ttcagtttgg ggaggaaaac ctttgtaaga taatagacat2520gaatgattgttttgtatcta ggcatgttaa ggtctgcata attggtacag tatctaaatt2580
ctctcagggtgataccttattgttttttgg accgcttgaa ggtggtggtc taatatttaa2640
acactggtgtacatccacat gtcaatttgg tgacccagga gatatcatga gtccaagaga2700caaaggttttttatgccctg agtttccagg tagtttcagg aagaaatgca actttgctac2760tacccctatttgtgagtatg atggaaatat ggtctcaggt tacaagaaag tgatggcgac2820aattgattccttccaatctt ttaatacaag cactatgcac ttcactgatg aaaggataga2880gtggaaagaccctgatggaa tgctaaggga ccatataaac attttagtaa cgaaggacat2940tgactttgataaccttggtg aaaatccttg caaaattggc ctacaaacat cttctattga3000gggggcctggggttctggtg tggggttcac attaacatgt ctggtatcac taacagaatg3060tcctacctttttgacctcaa taaaggcttg tgataaggct atctgttatg gtgcagagag3120tgtaacattgacaagaggac aaaatacagt caaggtatca gggaaaggtg gccatagtgg3180ttcaacatttaggtgttgcc atggggagga ctgttcacaa attggactcc atgctgctgc3240acctcaccttgacaaggtaa atgggatttc tgagatagaa aatagtaaag tatatgatga3300tggggcaccgcaatgtggga taaaatgttg gtttgttaaa tcaggggaat ggatttcagg3360gatattcagtggtaattgga ttgtactcat tgtcctctgt gtatttctat tgttctcctt3420ggttttactaagcattctct gtcccgtaag gaagcataaa aaatcagtcg acctgaatca3480cgcgtctcgactcgacatgg caactatgga ggaattacag agggaaatca atgcccatga3540gggtcaattagtgatagcca ggcagaaggt gagggatgca gaaaaacagt atgaaaagga3600tccagatgagttgaacaaga gaacattaac tgaccgagag ggcgttgcag tatctatcca3660ggcaaaaattgatgagttaa aaaggcaact ggcagatagg attgcaactg ggaaaaacct3720tgggaaggaacaagatccaa caggggtgga gcctggagac catctgaaag agaggtcaat3780gctcagttatggtaatgtgc tggatttaaa ccatttggat attgatgaac ctacaggaca3840gacagcagactggctgagca tcatcgtcta tcttacatcc tttgtcgtcc cgatacttct3900gaaagctctgtatatgttga caacaagggg gaggcaaact accaaggata ataaagggac3960ccggattcgatttaaggatg atagctcgtt cgaggatgtt aacggtatcc ggaaaccaaa4020acatctttacgtgtccttgc caaatgcaca gtcaagcatg aaggcagaag agattacacc4080tggtagatatagaacagcag tctgtgggct ctaccctgca cagattaagg cacggcagat4140gatcggtccagttatgagtg taattggttt tctagcatta gcaaaggact ggagtgatcg4200tatcgaacaatggttaattg aaccttgcaa gcttcttcca gatacagcag cagttcatca4260tcatcatcatcatgcggccg ccactgtgct ggatgatccg agctcggtac caagcttaag4320tttaaaccgctgatcagcct cgactgtgcc ttctagttgc cagccatctg ttgtttgccc4380ctcccccgtgccttccttga ccctggaagg tgccactccc actgtccttt cctaataaaa4440tgaggaaattgcatcgcatt gtctgagtag gtgtcattct attctggggg gtggggtggg4500gcaggacagcaagggggagg attgggaaga caatagcagg catgctgggg atgcggtggg4560ctctatggcttctgaggcgg aaagaaccag cagatctgca gatctgaatt catctatgtc4620gggtgcggagaaagaggtaa tgaaatggca ttatgggtat tatgggtctg cattaatgaa4680tcggccaacgcgcggggaga ggcggtttgc gtattgggcg ctcttccgct tcctcgctca4740ctgactcgctgcgctcggtc gttcggctgc ggcgagcggt atcagctcac tcaaaggcgg4800taatacggttatccacagaa tcaggggata acgcaggaaa gaacatgtga gcaaaaggcc4860agcaaaaggccaggaaccgt aaaaaggccg cgttgctggc gtttttccat aggctccgcc4920cccctgacgagcatcacaaa aatcgacgct caagtcagag gtggcgaaac ccgacaggac4980
tataaagataccaggcgttt ccccctggaa gctccctcgt gcgctctcct gttccgaccc5040tgccgcttaccggatacctg tccgcctttc tcccttcggg aagcgtggcg ctttctcaat5100gctcacgctgtaggtatctc agttcggtgt aggtcgttcg ctccaagctg ggctgtgtgc5160acgaaccccccgttcagccc gaccgctgcg ccttatccgg ta actatcgt cttgagtcca5220acccggtaagacacgactta tcgccactgg cagcagccac tggtaacagg attagcagag5280cgaggtatgtaggcggtgct acagagttct tgaagtggtg gcctaactac ggctacacta5340gaaggacagtatttggtatc tgcgctctgc tgaagccagt taccttcgga aaaagagttg5400gtagctcttgatccggcaaa caaaccaccg ctggtagcgg tggttttttt gtttgcaagc5460agcagattacgcgcagaaaa aaaggatctc aagaagatcc tttgatcttt tctacggggt5520ctgacgctcagtggaacgaa aactcacgtt aagggatttt ggtcatgaga ttatcaaaaa5580ggatcttcacctagatcctt ttgatcctcc ggcgttcagc ctgtgccaca gccgacagga5640tggtgaccaccatttgcccc atatcaccgt cggtactgat cccgtcgtca ataaaccgaa5700ccgctacaccctgagcatca aactctttta tcagttggat catgtcggcg gtgtcgcggc5760caagacggtcgagcttcttc accagaatga catcaccttc ctccaccttc atcctcagca5820aatccagcccttcccgatct gttgaactgc cggatgcctt gtcggtaaag atgcggttag5880cttttacccctgcatctttg agcgctgagg tctgcctcgt gaagaaggtg ttgctgactc5940ataccaggcctgaatcgccc catcatccag ccagaaagtg agggagccac ggttgatgag6000agctttgttgtaggtggacc agttggtgat tttgaacttt tgctttgcca cggaacggtc6060tgcgttgtcgggaagatgcg tgatctgatc cttcaactca gcaaaagttc gatttattca6120acaaagccgccgtcccgtca agtcagcgta atgctctgcc agtgttacaa ccaattaacc6180aattctgattagaaaaactc atcgagcatc aaatgaaact gcaatttatt catatcagga6240ttatcaataccatatttttg aaaaagccgt ttctgtaatg aaggagaaaa ctcaccgagg6300cagttccataggatggcaag atcctggtat cggtctgcga ttccgactcg tccaacatca6360atacaacctattaatttccc ctcgtcaaaa ataaggttat caagtgagaa atcaccatga6420gtgacgactgaatccggtga gaatggcaaa agcttatgca tttctttcca gacttgttca6480acaggccagccattacgctc gtcatcaaaa tcactcgcat caaccaaacc gttattcatt6540cgtgattgcgcctgagcgag acgaaatacg cgatcgctgt taaaaggaca attacaaaca6600ggaatcgaatgcaaccggcg caggaacact gccagcgcat caacaatatt ttcacctgaa6660tcaggatattcttctaatac ctggaatgct gttttcccgg ggatcgcagt ggtgagtaac6720catgcatcatcaggagtacg gataaaatgc ttgatggtcg gaagaggcat aaattccgtc6780agccagtttagtctgaccat ctcatctgta acatcattgg caacgctacc tttgccatgt6840ttcagaaacaactctggcgc atcgggcttc ccatacaatc gatagattgt cgcacctgat6900tgcccgacattatcgcgagc ccatttatac ccatataaat cagcatccat gttggaattt6960aatcgcggcctcgagcaaga cgtttcccgt tgaatatggc tcataacacc ccttgtatta7020ctgtttatgtaagcagacag ttttattgtt catgatgata tatttttatc ttgtgcaatg7080taacatcagagattttgaga cacaacgtgg ctttgttgaa taaatcgaac ttttgctgag7140ttgaaggatcagatcacgca tcttcccgac aacgcagacc gttccgtggc aaagcaaaag7200ttcaaaatcaccaactggtc cacctacaac aaagctctca tcaaccgtgg ctccctcact7260ttctggctggatgatggggc gattcaggcc tggtatgagt cagcaacacc ttcttcacga7320
ggcagacctc agcgctagat tattgaagca tttatcaggg ttattgtctc atgagcggat7380acatatttga atgtatttag aaaaataaac aaataggggt tccgcgcaca tttccccgaa7440aagtgccacc tgacgt7456<210>2<211>7072<212>DNA<213>Artificial<400>2taactataac ggtcctaagg tagcgaaagc tcagatctgg atctcccgat cccctatggt60cgactctcag tacaatctgc tctgatgccg catagttaag ccagtatctg ctccctgctt120gtgtgttgga ggtcgctgag tagtgcgcga gcaaaattta agctacaaca aggcaaggct180tgaccgacaa ttgcatgaag aatctgctta gggttaggcg ttttgcgctg cttcgcgatg240tacgggccag atatacgcgt tgacattgat tattgactag ttattaatag taatcaatta300cggggtcatt agttcatagc ccatatatgg agttccgcgt tacataactt a cggtaaatg360gcccgcctgg ctgaccgccc aacgaccccc gcccattgac gtcaataatg acgtatgttc420ccatagtaac gccaataggg actttccatt gacgtcaatg ggtggactat ttacggtaaa480ctgcccactt ggcagtacat caagtgtatc atatgccaag tacgccccct attgacgtca540atgacggtaa atggcccgcc tggcattatg cccagtacat gaccttatgg gactttccta600cttggcagta catctacgta ttagtcatcg ctattaccat ggtgatgcgg ttttggcagt660acatcaatgg gcgtggatag cggtttgact cacggggatt tccaagtctc caccccattg720acgtcaatgg gagtttgttt tggcaccaaa atcaacggga ctttccaaaa tgtcgtaaca780actccgcccc attgacgcaa atgggcggta ggcgtgtacg gtgggaggtc tatataagca840gagctctctg gctaactaga gaacccactg cttactggct tatcgaaatt aatacgactc900actataggga gacccaagct ggctagcgtt taaacgggcc ctctagaatg tggatatttc960ttcttgtctt agaatcctta ctgtgggctg caagtgcatc agagacacca ttaactcctg1020tctggaatga caatgcccat ggggtaggtt ctgttcctat gcatacagat ttagagcttg1080atctctcttt aacatccagt tccaagtata cataccgtag gaagttaaca aacccacttg1140aggaagcacg atccattgac ctacatattg aaatagaaga acagacaatt ggtgttgatg1200tgcatgctct aggacactgg tttgatggtc gtcttaacct taaaacatcc tttcactgtt1260atggtgcttg tacaaagtat gaataccctt ggcatactgc aaagtgccac tatgaaagag1320attaccaata tgagacgagc tggggttgta atccatcaga ttgtcctggg gtgggcacag1380gctgtacagc atgtggttta tacctagatc aactgaaacc agttggtagt gcttataaaa1440ttatcacaat aaggtacagc aggagagtct gtgttcagtt tggggaggaa aacctttgta1500agataataga catgaatgat tgttttgtat ctaggcatgt taaggtctgc ataattggta1560cagtatctaa attctctcag ggtgatacct tattgttttt tggaccgctt gaaggtggtg1620gtctaatatt taaacactgg tgtacatcca catgtcaatt tggtgaccca ggagatatca1680tgagtccaag agacaaaggt tttttatgcc ctgagtttcc aggtagtttc aggaagaaat1740gcaactttgc tactacccct atttgtgagt atgatggaaa tatggtctca ggttacaaga1800aagtgatggc gacaattgat tccttccaat cttttaatac aagcactatg cacttcactg1860
atgaaaggatagagtggaaa gaccctgatg gaatgctaag ggaccatata aacattttag1920taacgaaggacattgacttt gataaccttg gtgaaaatcc ttgcaaaatt ggcctacaaa1980catcttctattgagggggcc tggggttctg gtgtggggtt cacattaaca tgtctggtat2040cactaacagaatgtcctacc tttttgacct caataaaggc ttgtgataag gctatctgtt2100atggtgcagagagtgtaaca ttgacaagag gacaaaatac agtcaaggta tcagggaaag2160gtggccatagtggttcaaca tttaggtgtt gccatgggga ggactgttca caaattggac2220tccatgctgctgcacctcac cttgacaagg taaatgggat ttctgagata gaaaatagta2280aagtatatgatgatggggca ccgcaatgtg ggataaaatg ttggtttgtt aaatcagggg2340aatggatttcagggatattc agtggtaatt ggattgtact cattgtcctc tgtgtatttc2400tattgttctccttggtttta ctaagcattc tctgtcccgt aaggaagcat aaaaaatcag2460tcgacctgaatcacgcgtct cgactcgaca tggcaactat ggaggaatta cagagggaaa2520tcaatgcccatgagggtcaa ttagtgatag ccaggcagaa ggtgagggat gcagaaaaac2580agtatgaaaaggatccagat gagttgaaca agagaacatt aactgaccga gagggcgttg2640cagtatctatccaggcaaaa attgatgagt taaaaaggca actggcagat aggattgcaa2700ctgggaaaaaccttgggaag gaacaagatc caacaggggt ggagcctgga gaccatctga2760aagagaggtcaatgctcagt tatggtaatg tgctggattt aaaccatttg gatattgatg2820aacctacaggacagacagca gactggctga gcatcatcgt ctatcttaca tcctttgtcg2880tcccgatacttctgaaagct ctgtatatgt tgacaacaag ggggaggcaa actaccaagg2940ataataaagggacccggatt cgatttaagg atgatagctc gttcgaggat gttaacggta3000tccggaaaccaaaacatctt tacgtgtcct tgccaaatgc acagtcaagc atgaaggcag3060aagagattacacctggtaga tatagaacag cagtctgtgg gctctaccct gcacagatta3120aggcacggcagatgatcggt ccagttatga gtgtaattgg ttttctagca ttagcaaagg3180actggagtgatcgtatcgaa caatggttaa ttgaaccttg caagcttctt ccagatacag3240cagcagttcatcatcatcat catcatgcgg ccgccactgt gctggatgat ccgagctcgg3300tacctaaaccgctgatcagc ctcgactgtg ccttctagta tcaacctctg gattacaaaa3360tttgtgaaagattgactggt attcttaact atgttgctcc ttttacgcta tgtggatacg3420ctgctttaatgcctttgtat catgctattg cttcccgtat ggctttcatt ttctcctcct3480tgtataaatcctggttgctg tctctttatg aggagttgtg gcccgttgtc aggcaacgtg3540gcgtggtgtgcactgtgttt gctgacgcaa cccccactgg ttggggcatt gccaccacct3600gtcagctcctttccgggact ttcgctttcc ccctccctat tgccacggcg gaactcatcg3660ccgcctgccttgcccgctgc tggacagggg ctcggctgtt gggcactgac aattccgtgg3720tgttgtcggggaagctgacg tcctttccat ggctgctcgc ctgtgttgcc acctggattc3780tgcgcgggacgtccttctgc tacgtccctt cggccctcaa tccagcggac cttccttccc3840gcggcctgctgccggctctg cggcctcttc cgcgtcttcg ccttcgccct cagacgagtc3900ggatctccctttgggccgcc tccccgcctg cttaagttta aaccgctgat cagcctcgac3960tgtgccttctagttgccagc catctgttgt ttgcccctcc cccgtgcctt ccttgaccct4020ggaaggtgccactcccactg tcctttccta ataaaatgag gaaattgcat cgcattgtct4080gagtaggtgtcattctattc tggggggtgg ggtggggcag gacagcaagg gggaggattg4140ggaagacaatagcaggcatg ctggggatgc ggtgggctct atggcttctg aggcggaaag4200
aaccagcagatctgcagatc tgaattcatc tatgtcgggt gcggagaaag aggtaatgaa4260atggcattatgggtattatg ggtctgcatt aatgaatcgg ccaacgcgcg gggagaggcg4320gtttgcgtattgggcgctct tccgcttcct cgctcactga ctcgctgcgc tcggtcgttc4380ggctgcggcgagcggtatca gctcactcaa aggcggtaat a cggttatcc acagaatcag4440gggataacgcaggaaagaac atgtgagcaa aaggccagca aaaggccagg aaccgtaaaa4500aggccgcgttgctggcgttt ttccataggc tccgcccccc tgacgagcat cacaaaaatc4560gacgctcaagtcagaggtgg cgaaacccga caggactata aagataccag gcgtttcccc4620ctggaagctccctcgtgcgc tctcctgttc cgaccctgcc gcttaccgga tacctgtccg4680cctttctcccttcgggaagc gtggcgcttt ctcaatgctc acgctgtagg tatctcagtt4740cggtgtaggtcgttcgctcc aagctgggct gtgtgcacga accccccgtt cagcccgacc4800gctgcgccttatccggtaac tatcgtcttg agtccaaccc ggtaagacac gacttatcgc4860cactggcagcagccactggt aacaggatta gcagagcgag gtatgtaggc ggtgctacag4920agttcttgaagtggtggcct aactacggct acactagaag gacagtattt ggtatctgcg4980ctctgctgaagccagttacc ttcggaaaaa gagttggtag ctcttgatcc ggcaaacaaa5040ccaccgctggtagcggtggt ttttttgttt gcaagcagca gattacgcgc agaaaaaaag5100gatctcaagaagatcctttg atcttttcta cggggtctga cgctcagtgg aacgaaaact5160cacgttaagggattttggtc atgagattat caaaaaggat cttcacctag atccttttga5220tcctccggcgttcagcctgt gccacagccg acaggatggt gaccaccatt tgccccatat5280caccgtcggtactgatcccg tcgtcaataa accgaaccgc tacaccctga gcatcaaact5340cttttatcagttggatcatg tcggcggtgt cgcggccaag acggtcgagc ttcttcacca5400
gaatgacatcaccttcctcc accttcatcc tcagcaaatc cagcccttcc cgatctgttg5460aactgccggatgccttgtcg gtaaagatgc ggttagcttt tacccctgca tctttgagcg5520ctgaggtctgcctcgtgaag aaggtgttgc tgactcatac caggcctgaa tcgccccatc5580atccagccagaaagtgaggg agccacggtt gatgagagct ttgttgtagg tggaccagtt5640ggtgattttgaacttttgct ttgccacgga acggtctgcg ttgtcgggaa gatgcgtgat5700ctgatccttcaactcagcaa aagttcgatt tattcaacaa agccgccgtc ccgtcaagtc5760agcgtaatgctctgccagtg ttacaaccaa ttaaccaatt ctgattagaa aaactcatcg5820agcatcaaatgaaactgcaa tttattcata tcaggattat caataccata tttttgaaaa5880agccgtttctgtaatgaagg agaaaactca ccgaggcagt tccataggat ggcaagatcc5940tggtatcggtctgcgattcc gactcgtcca acatcaatac aacctattaa tttcccctcg6000tcaaaaataaggttatcaag tgagaaatca ccatgagtga cgactgaatc cggtgagaat6060ggcaaaagcttatgcatttc tttccagact tgttcaacag gccagccatt acgctcgtca6120tcaaaatcactcgcatcaac caaaccgtta ttcattcgtg attgcgcctg agcgagacga6180aatacgcgatcgctgttaaa aggacaatta caaacaggaa tcgaatgcaa ccggcgcagg6240aacactgccagcgcatcaac aatattttca cctgaatcag gatattcttc taatacctgg6300aatgctgttttcccggggat cgcagtggtg agtaaccatg catcatcagg agtacggata6360aaatgcttgatggtcggaag aggcataaat tccgtcagcc agtttagtct gaccatctca6420tctgtaacatcattggcaac gctacctttg ccatgtttca gaaacaactc tggcgcatcg6480ggcttcccatacaatcgata gattgtcgca cctgattgcc cgacattatc gcgagcccat6540
ttatacccat ataaatcagc atccatgttg gaatttaatc gcggcctcga gcaagacgtt6600tcccgttgaa tatggctcat aacacccctt gtattactgt ttatgtaagc agacagtttt6660attgttcatg atgatatatt tttatcttgt gcaatgtaac atcagagatt ttgagacaca6720acgtggcttt gttgaataaa tcgaactttt gctgagttga aggatcagat cacgcatctt6780cccgacaacg cagaccgttc cgtggcaaag caaaagttca aaatcaccaa ctggtccacc6840tacaacaaag ctctcatcaa ccgtggctcc ctcactttct ggctggatga tggggcgatt6900caggcctggt atgagtcagc aacaccttct tcacgaggca gacctcagcg ctagattatt6960gaagcattta tcagggttat tgtctcatga gcggatacat atttgaatgt atttagaaaa7020ataaacaaat aggggttccg cgcacatttc cccgaaaagt gccacctgac gt7072<210>3<211>8079<212>DNA<213>Artificial<400>3taactataac ggtcctaagg tagcgaaagc tcagatctgg atctcccgat cccctatggt60cgactctcag tacaatctgc tctgatgccg catagttaag ccagtatctg ctccctgctt120gtgtgttgga ggtcgctgag tagtgcgcga gcaaaattta agctacaaca aggcaaggct180tgaccgacaa ttgtcgacat tgattattga ctagttatta atagtaatca attacggggt240cattagttca tagcccatat atggagttcc gcgttacata acttacggta aatggcccgc300ctggctgacc gcccaacgac ccccgcccat tgacgtcaat aatgacgtat gttcccatag360taacgccaat agggactttc cattgacgtc aatgggtgga ctatttacgg taaactgccc420acttggcagt acatcaagtg tatcatatgc caagtacgcc ccctattgac gtcaatgacg480gtaaatggcc cgcctggcat tatgcccagt acatgacctt atgggacttt cctacttggc540agtacatcta cgtattagtc atcgctatta ccatgggtcg aggtgagccc cacgttctgc600ttcactctcc ccatctcccc cccctcccca cccccaattt tgtatttatt tattttttaa660ttattttgtg cagcgatggg ggcggggggg gggggggcgc gcgccaggcg gggcggggcg720gggcgagggg cggggcgggg cgaggcggag aggtgcggcg gcagccaatc agagcggcgc780getccgaaag tttcctttta tggcgaggcg gcggcggcgg cggccctata aaaagcgaag840cgcgcggcgg gcgggagtcg ctgcgttgcc ttcgccccgt gccccgctcc gcgccgcctc900gcgccgcccg ccccggctct gactgaccgc gttactccca caggtgagcg ggcgggacgg960cccttctcct ccgggctgta attagcgctt ggtttaatga cggctcgttt cttttctgtg1020gctgcgtgaa agccttaaag ggctccggga gggccctttg tgcggggggg agcggctcgg1080ggggtgcgtg cgtgtgtgtg tgcgtgggga gcgccgcgtg cggcccgcgc tgcccggcgg1140ctgtgagcgc tgcgggcgcg gcgcggggct ttgtgcgctc cgcgtgtgcg cgaggggagc1200gcggccgggg gcggtgcccc gcggtgcggg ggggctgcga ggggaacaaa ggctgcgtgc1260ggggtgtgtg cgtggggggg tgagcagggg gtgtgggcgc ggcggtcggg ctgtaacccc1320cccctgcacc cccctccccg agttgctgag cacggcccgg cttcgggtgc ggggctccgt1380gcggggcgtg gcgcggggct cgccgtgccg ggcggggggt ggcggcaggt gggggtgccg1440ggcggggcgg ggccgcctcg ggccggggag ggctcggggg aggggcgcgg cggccccgga1500
gcgccggcgg ctgtcgaggc gcggcgagcc gcagccattg ccttttatgg taatcgtgcg1560agagggcgca gggacttcct ttgtcccaaa tctggcggag ccgaaatctg ggaggcgccg1620ccgcaccccc tctagcgggc gcgggcgaag cggtgcggcg ccggcaggaa ggaaatgggc1680ggggagggcc ttcgtgcgtc gccgcgccgc cgtccccttc tccatctcca gcctcggggc1740tgccgcaggg ggacggctgc cttcgggggg gacggggcag ggcggggttc ggcttctggc1800gtgtgaccgg cggctctaga gcctctgcta accatgttca tgccttcttc tttttcctac1860agctcctggg caacgtgctg gttgttgtgc tgtctcatca ttttggcaaa gaattggcct1920cgacggccgc tagcgtttaa acgggccctc tagaatgtgg atatttcttc ttgtcttaga1980atccttactg tgggctgcaa gtgcatcaga gacaccatta actcctgtct ggaatgacaa2040tgcccatggg gtaggttctg ttcctatgca tacagattta gagcttgatc tctctttaac2100atccagttcc aagtatacat accgtaggaa gttaacaaac ccacttgagg aagcacgatc2160cattgaccta catattgaaa tagaagaaca gacaattggt gttgatgtgc atgctctagg2220acactggttt gatggtcgtc ttaaccttaa aacatccttt cactgttatg gtgcttgtac2280aaagtatgaa tacccttggc atactgcaaa gtgccactat gaaagagatt accaatatga2340gacgagctgg ggttgtaatc catcagattg tcctggggtg ggcacaggct gtacagcatg2400tggtttatac ctagatcaac tgaaaccagt tggtagtgct tataaaatta tcacaataag2460gtacagcagg agagtctgtg ttcagtttgg ggaggaaaac ctttgtaaga taatagacat2520gaatgattgt tttgtatcta ggcatgttaa ggtctgcata attggtacag tatctaaatt2580ctctcagggt gataccttat tgttttttgg accgcttgaa ggtggtggtc taatatttaa2640acactggtgt acatccacat gtcaatttgg tgacccagga gatatcatga gtccaagaga2700caaaggtttt ttatgccctg agtttccagg tagtttcagg aagaaatgca actttgctac2760tacccctatt tgtgagtatg atggaaatat ggtctcaggt tacaagaaag tgatggcgac2820aattgattcc ttccaatctt ttaatacaag cactatgcac ttcactgatg aaaggataga2880gtggaaagac cctgatggaa tgctaaggga ccatataaac attttagtaa cgaaggacat2940tgactttgat aaccttggtg aaaatccttg caaaattggc ctacaaacat cttctattga3000gggggcctgg ggttctggtg tggggttcac attaacatgt ctggtatcac taacagaatg3060tcctaccttt ttgacctcaa taaaggcttg tgataaggct atctgttatg gtgcagagag3120tgtaacattg acaagaggac aaaatacagt caaggtatca gggaaaggtg gccatagtgg3180ttcaacattt aggtgttgcc atggggagga ctgttcacaa attggactcc atgctgctgc3240acctcacctt gacaaggtaa atgggatttc tgagatagaa aatagtaaag tatatgatga3300tggggcaccg caatgtggga taaaatgttg gtttgttaaa tcaggggaat ggatttcagg3360gatattcagt ggtaattgga ttgtactcat tgtcctctgt gtatttctat tgttctcctt3420ggttttacta agcattctct gtcccgtaag gaagcataaa aaatcagtcg acctgaatca3480cgcgtctcga ctcgacatgg caactatgga ggaattacag agggaaatca atgcccatga3540gggtcaatta gtgatagcca ggcagaaggt gagggatgca gaaaaacagt atgaaaagga3600tccagatgag ttgaacaaga gaacattaac tgaccgagag ggcgttgcag tatctatcca3660ggcaaaaatt gatgagttaa aaaggcaact ggcagatagg attgcaactg ggaaaaacct3720tgggaaggaa caagatccaa caggggtgga gcctggagac catctgaaag agaggtcaat3780gctcagttat ggtaatgtgc tggatttaaa ccatttggat attgatgaac ctacaggaca3840
gacagcagactggctgagca tcatcgtcta tcttacatcc tttgtcgtcc cgatacttct3900gaaagctctgtatatgttga caacaagggg gaggcaaact accaaggata ataaagggac3960ccggattcgatttaaggatg atagctcgtt cgaggatgtt aacggtatcc ggaaaccaaa4020acatctttacgtgtccttgc caaatgcaca gtcaagcatg aaggcagaag agattacacc4080tggtagatatagaacagcag tctgtgggct ctaccctgca cagattaagg cacggcagat4140gatcggtccagttatgagtg taattggttt tctagcatta gcaaaggact ggagtgatcg4200tatcgaacaatggttaattg aaccttgcaa gcttcttcca gatacagcag cagttcatca4260tcatcatcatcatgcggccg ccactgtgct ggatgatccg agctcggtac ctaaaccgct4320gatcagcctcgactgtgcct tctagtatca acctctggat tacaaaattt gtgaaagatt4380gactggtattcttaactatg ttgctccttt tacgctatgt ggatacgctg ctttaatgcc4440tttgtatcatgctattgctt cccgtatggc tttcattttc tcctccttgt ataaatcctg4500gttgctgtctctttatgagg agttgtggcc cgttgtcagg caacgtggcg tggtgtgcac4560tgtgtttgctgacgcaaccc ccactggttg gggcattgcc accacctgtc agctcctttc4620cgggactttcgctttccccc tccctattgc cacggcggaa ctcatcgccg cctgccttgc4680ccgctgctggacaggggctc ggctgttggg cactgacaat tccgtggtgt tgtcggggaa4740gctgacgtcctttccatggc tgctcgcctg tgttgccacc tggattctgc gcgggacgtc4800cttctgctacgtcccttcgg ccctcaatcc agcggacctt ccttcccgcg gcctgctgcc4860ggctctgcggcctcttccgc gtcttcgcct tcgccctcag acgagtcgga tctccctttg4920ggccgcctccccgcctgctt aagtttaaac cgctgatcag cctcgactgt gccttctagt4980tgccagccatctgttgtttg cccctccccc gtgccttcct tgaccctgga aggtgccact5040cccactgtcctttcctaata aaatgaggaa attgcatcgc attgtctgag taggtgtcat5100tctattctggggggtggggt ggggcaggac agcaaggggg aggattggga agacaatagc5160aggcatgctggggatgcggt gggctctatg gcttctgagg cggaaagaac cagcagatct5220gcagatctgaattcatctat gtcgggtgcg gagaaagagg taatgaaatg gcattatggg5280tattatgggtctgcattaat gaatcggcca acgcgcgggg agaggcggtt tgcgtattgg5340gcgctcttccgcttcctcgc tcactgactc gctgcgctcg gtcgttcggc tgcggcgagc5400ggtatcagctcactcaaagg cggtaatacg gttatccaca gaatcagggg ataacgcagg5460aaagaacatgtgagcaaaag gccagcaaaa ggccaggaac cgtaaaaagg ccgcgttgct5520ggcgtttttccataggctcc gcccccctga cgagcatcac aaaaatcgac gctcaagtca5580gaggtggcgaaacccgacag gactataaag ataccaggcg tttccccctg gaagctccct5640cgtgcgctctcctgttccga ccctgccgct taccggatac ctgtccgcct ttctcccttc5700gggaagcgtggcgctttctc aatgctcacg ctgtaggtat ctcagttcgg tgtaggtcgt5760tcgctccaagctgggctgtg tgcacgaacc ccccgttcag cccgaccgct gcgccttatc5820cggtaactatcgtcttgagt ccaacccggt aagacacgac ttatcgccac tggcagcagc5880cactggtaacaggattagca gagcgaggta tgtaggcggt gctacagagt tcttgaagtg5940gtggcctaactacggctaca ctagaaggac agtatttggt atctgcgctc tgctgaagcc6000agttaccttcggaaaaagag ttggtagctc ttgatccggc aaacaaacca ccgctggtag6060cggtggtttttttgtttgca agcagcagat tacgcgcaga aaaaaaggat ctcaagaaga6120tcctttgatcttttctacgg ggtctgacgc tcagtggaac gaaaactcac gttaagggat6180.
tttggtcatg agattatcaa aaaggatctt cacctagatc cttttgatcc tccggcgttc 6240agcctgtgcc acagccgaca ggatggtgac caccatttgc cccatatcac cgtcggtact 6300gatcccgtcg tcaataaacc gaaccgctac accctgagca tcaaactctt ttatcagttg 6360gatcatgtcg gcggtgtcgc ggccaagacg gtcgagcttc ttcaccagaa tgacatcacc6420ttcctccacc ttcatcctca gcaaatccag cccttcccga tctgttgaac tgccggatgc6480cttgtcggta aagatgcggt tagcttttac ccctgcatct ttgagcgctg aggtctgcct6540cgtgaagaag gtgttgctga ctcataccag gcctgaatcg ccccatcatc cagccagaaa 6600gtgagggagc cacggttgat gagagctttg ttgtaggtgg accagttggt gattttgaac6660ttttgctttg ccacggaacg gtctgcgttg tcgggaagat gcgtgatctg atccttcaac6720tcagcaaaag ttcgatttat tcaacaaagc cgccgtcccg tcaagtcagc gtaatgctct6780gccagtgtta caaccaatta accaattctg attagaaaaa ctcatcgagc atcaaatgaa 6840actgcaattt attcatatca ggattatcaa taccatattt ttgaaaaagc cgtttctgta 6900atgaaggaga aaactcaccg aggcagttcc ataggatggc aagatcctgg tatcggtctg 6960cgattccgac tcgtccaaca tcaatacaac ctattaattt cccctcgtca aaaataaggt7020tatcaagtga gaaatcacca tgagtgacga ctgaatccgg tgagaatggc aaaagcttat7080gcatttcttt ccagacttgt tcaacaggcc agccattacg ctcgtcatca aaatcactcg 7140catcaaccaa accgttattc attcgtgatt gcgcctgagc gagacgaaat acgcgatcgc7200tgttaaaagg acaattacaa acaggaatcg aatgcaaccg gcgcaggaac actgccagcg 7260catcaacaat attttcacct gaatcaggat attcttctaa tacctggaat gctgttttcc7320cggggatcgc agtggtgagt aaccatgcat catcaggagt acggataaaa tgcttgatgg 7380tcggaagagg cataaattcc gtcagccagt ttagtctgac catctcatct gtaacatcat7440tggcaacgct acctttgcca tgtttcagaa acaactctgg cgcatcgggc ttcccataca 7500atcgatagat tgtcgcacct gattgcccga cattatcgcg agcccattta tacccatata 7560aatcagcatc catgttggaa tttaatcgcg gcctcgagca agacgtttcc cgttgaatat7620ggctcataac accccttgta ttactgttta tgtaagcaga cagttttatt gttcatgatg 7680atatattttt atcttgtgca atgtaacatc agagattttg agacacaacg tggctttgtt7740gaataaatcg aacttttgct gagttgaagg atcagatcac gcatcttccc gacaacgcag 7800accgttccgt ggcaaagcaa aagttcaaaa tcaccaactg gtccacctac aacaaagctc7860tcatcaaccg tggctccctc actttctggc tggatgatgg ggcgattcag gcctggtatg 7920agtcagcaac accttcttca cgaggcagac ctcagcgcta gattattgaa gcatttatca 7980gggttattgt ctcatgagcg gatacatatt tgaatgtatt tagaaaaata aacaaatagg 8040ggttccgcgc acatttcccc gaaaagtgcc acctgacgt8079
权利要求
一种用于提高汉坦病毒融合蛋白G2S0.7表达的腺病毒高表达载体,对含嵌合基因G2S0.7的腺病毒转移载体G2S0.7-pShuttle进行改建,将其CMV启动子替换为CAG启动子/增强子,得到含CAG启动子/增强子的高表达汉坦病毒融合蛋白G2S0.7的腺病毒重组转移载体,命名为G2S0.7-pCAG,其全基因序列为SEQ ID NO1所示。
2.一种用于提高汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7表达的腺病毒高表达载体,对含嵌合基因 G2S0. 7的腺病毒转移载体G2S0. 7-pShuttle进行改建,在其3,端插入WPRE转录调控元件, 得到含WPRE调控元件的高表达汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7的腺病毒重组转移载体,命名为 G2S0. 7-WPRE,其全基因序列为SEQ ID NO 2所示。
3.一种用于提高汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7表达的腺病毒高表达载体,对含嵌合基因 G2S0. 7的腺病毒转移载体G2S0. 7-pShuttle进行改建,将其CMV启动子替换为CAG启动子 /增强子,并在其3,端插入WPRE转录调控元件,得到含CAG启动子/增强子和WPRE调控元 件的高表达汉坦病毒融合蛋白G2S0. 7的腺病毒重组转移载体,命名为G2S0. 7-pCAG-ffPRE, 其全基因序列为SEQ ID NO 3所示。
全文摘要
本发明涉及腺病毒转移载体的改建,特别是对含肾综合征出血热(HFRS)致病原——汉坦病毒(HV)的嵌合基因G2S0.7的pShuttle转移载体进行改建,用于提高融合蛋白G2S0.7的表达。利用基因重组技术,将含嵌合基因G2S0.7的腺病毒转移载体G2S0.7-pShuttle进行改建,包括将其CMV启动子替换为CAG启动子/增强子;或在其3’端插入WPRE转录调控元件;或替换启动子并插入WPRE调控元件。用本发明分别表达汉坦病毒融合蛋白G2S0.7,比较各组重组腺病毒中外源蛋白的表达水平。结果显示本发明与原转移载体pShuttle相比,均能有效提高融合蛋白G2S0.7的表达,且以替换启动子组效果最明显。
文档编号C12N15/861GK101812479SQ20091025456
公开日2010年8月25日 申请日期2009年12月29日 优先权日2009年12月29日
发明者吴兴安, 张芳琳, 徐志凯, 李凯, 李璞媛, 白文涛, 胡刚 申请人:中国人民解放军第四军医大学
网友询问留言 已有0条留言
  • 还没有人留言评论。精彩留言会获得点赞!
1