专利名称：百合属est-ssr标记及应用的制作方法
技术领域：
本发明涉及分子生物学DNA标记技术与应用领域，特别涉及4个百合属EST-SSR标记及应用。
背景技术：
分子标记广泛应用于种质资源遗传多样性分析以及 辅助育种工作中。百合属的分子标记研究始于1993年，然而限于科学技术发展的水平，之后的十多年在百合属植物上开发的标记主要是以随机扩增多态性DNA(RAPD)为主的第一代分子标记，这类标记重复性较差。表达序列标签(Express sequence tag, EST)中含有许多简单重复序列(Simplesequence repeat, SSR),已经成为普遍认可的第二代分子标记,具有重复性好,共显性，易于检测的特点。2008年和2011年，杨素_和Sung-Il Lee分别利用GeneBank公布的百合属EST序列(分别为1688条和2235条)开发了 12条和19条EST-SSR标记。分子标记的数量影响着种质资源遗传多样性分析的准确性和遗传图谱构建的精确性，现有的百合属分子标记数量远远不能满足百合属分子生物学研究的需求。为开发更多的标记，本发明利用GeneBank公布的百合属的3332条EST序列(截止2012年6月20日)以及MISA软件寻找SSR，合成了 48对引物，经5类百合品种和2个野生型百合共26个不同基因型百合筛选，得到4个不同于前人的具有多态性的通用型标记。
发明内容
本发明要解决的技术问题是，克服现有技术中的不足，提供4个新的百合属EST-SSR标记及应用。为了解决技术问题，增加百合属分子标记的数量以应用于今后的育种工作中，本发明提供了 4个新的分子标记。所述百合属EST-SSR标记分别是一组引物对，其序列如SEQID NO: I 至 SEQ ID NO: 8 所示。本发明还提供了所述的百合属EST-SSR标记在百合属植物种质资源遗传多样性分析以及辅助育种中的应用。本发明提供4个百合属分子标记，4个分子标记的特征如表I所示表I百合属EST-SSR标记的特征(SEQ ID NO :1-8)
权利要求
1.一种百合属EST-SSR标记，其特征在于，该标记是一组引物对，其序列如SEQ ID NO:I 和 SEQ ID NO: 2 所示。
2.一种百合属EST-SSR标记，其特征在于，该标记是一组引物对，其序列如SEQ ID NO:3 和 SEQ ID NO: 4 所示。
3.一种百合属EST-SSR标记，其特征在于，该标记是一组引物对，其序列如SEQ ID NO:5 和 SEQ ID NO: 6 所示。
4.一种百合属EST-SSR标记，其特征在于，该标记是一组引物对，其序列如SEQ ID NO:7 和 SEQ ID NO: 8 所示。
5.权利要求I至4任意一项中所述的百合属EST-SSR标记在百合属植物种质资源遗传多样性分析以及辅助育种中的应用。
全文摘要
本发明分子生物学DNA标记技术与应用领域，旨在提供4个百合属EST-SSR标记及应用。该4个标记分别是一组引物对，其序列如SEQ ID NO: 1-8所示。本发明的4个分子标记在26个百合种或品种中有多态性，在26个百合种或品种中进行的遗传多样性分析与百合属植物分类常识相吻合(
图1)，是稳定存在的新标记，可以直接将本发明所提供的4个引物对应用于更多百合属植物上，进行种质资源和遗传多样性分析。本发明的4 个分子标记均来自于百合花发育相关基因EST序列，为克隆百合属植物花发育相关基因、基因序列分析奠定了良好的基础。
文档编号C12N15/11GK102787115SQ201210270328
公开日2012年11月21日 申请日期2012年7月30日 优先权日2012年7月30日
发明者夏宜平, 杜方, 高中山 申请人:浙江大学