为患有抑郁症的受试者选择治疗方案的测定法和方法

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为患有抑郁症的受试者选择治疗方案的测定法和方法
【专利摘要】本文公开的是通过在来自人受试者的测试样品中鉴定例如但不限于MTHFR、MTR或MTRR基因座上的至少一种核酸多态性,和/或确定外周生物标志物(例如,SAM、SAH和4-HNE)的表达水平来为患有抑郁症的受试者选择治疗方案的新测定法、系统和试剂盒。这些生物标志物可以用于确定利用含叶酸化合物(单独或作为抗抑郁剂的辅助剂)治疗抑郁受试者的有效性。此外,这些生物标志物可以用于为患有治疗抵抗性的抑郁症(例如对至少一种选择性5羟色胺再吸收抑制剂具有抵抗性)的受试者选择适当的治疗方案。本文还提供用于治疗患有抑郁症的受试者和/或确定或改善受试者服用的抗抑郁药的有效性的方法和组合物。
【专利说明】为患有抑郁症的受试者选择治疗方案的测定法和方法
[0001] 相关申请的交叉参考
[0002] 该申请要求保护2011年11月14日提交的美国临时申请号61/559, 541的35U. S.C§ 119(e)下的权益,其内容以其整体通过引用并入本文。
[0003] 本公开的【技术领域】
[0004] 本发明的实施方案一般涉及为患有抑郁症(例如,严重的抑郁性障碍)的受试者 选择治疗方案的测定、方法和系统。本发明进一步涉及用于治疗患有抑郁症(例如,严重的 抑郁性障碍)的受试者的方法。
[0005] 发明背景
[0006] 近期的评估表明,每年多于1900万年龄超过18岁的美国人经历抑郁症。一般相 信,叶酸缺乏状态与抑郁症之间存在一些形式的联系[1,2和3],其继而帮助解释对巨幼 红细胞性贫血的多种神经精神表现上的较早观察结果。近来,已经逐渐认识到叶酸在其 他医学状况,特别是神经管缺陷[5]与心血管疾病[6]中的相关性,以及作为食品添加剂 或"营养制品" [7和8]交易的试剂,如S-腺苷-甲硫氨酸(SAMe)、贯叶连翅(hypericum perforatum) (St. John' s wort)和ω-3-脂肪酸的潜在抗抑郁剂功效。本领域已经逐渐转 向了研究叶酸缺乏、替换和补充对抑郁病症,特别是严重的抑郁性障碍[9]的病程和管理 的影响以及叶酸在中枢神经系统功能中的推测作用。[10,11和12]。尽管在过去十年里在 抑郁症的治疗方面已经获得了显著进步,但是多达29% -46%服用抗抑郁剂的抑郁症患者 仍然部分地或完全地对治疗具有抵抗性。患有治疗抵抗性抑郁症的那些患者几乎没有可选 选项。由于不是每一种治疗方案对每一个个体都有效,所以强烈需要鉴定可以利于为患有 抑郁症的受试者选择适当的治疗方案的标志物。
[0007] 发明概述
[0008] 大部分抑郁症(如严重的抑郁性障碍)患者对传统的抗抑郁药,例如选择性5羟 色胺再吸收抑制剂仅显示部分应答或无应答。因此,强烈需要开发有效的抗抑郁剂疗法和/ 或分层抑郁症患者,以便他们可以接受适当的抗抑郁剂疗法。本文所述的多个实施方案的 方面来自与对使用含叶酸化合物作为单一疗法或作为抗抑郁药的辅助剂治疗抑郁症(例 如,严重的抑郁性障碍)的功效应答相关的单核苷酸多态性(SNPs)、外周生物标志物和/或 临床特征的发现。在一些实施方案中,本发明人也已经显示,本文所述的这些标志物或状况 也可以用于为患有治疗抵抗性抑郁症(TRD),例如对至少一种选择性5羟色胺再吸收抑制 剂(SSRI)具有抵抗性的受试者选择更有效的治疗。
[0009] 特别地,可以表明患者(例如,患有严重的抑郁性障碍和/或TRD)适合于包含含 叶酸化合物的治疗方案的生物标志物之一或组合包括,但不限于如下通过rs号鉴定的至 少一个或更多个SNPs:在亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)中存在的rsl801133;在MTHFR 中存在的rs2274976 ;在甲硫氨酸合酶(MTR)中存在的rsl805087 ;在甲硫氨酸合酶还原酶 (MTRR)中存在的rsl801394;在钙通道、电压依赖型、L型、alC亚基(CACNA1C)中存在的 rsl006737 ;在DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)中存在的rsl883729 ;在GTP环 水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)中存在的rs7163862;在还原性叶酸载体蛋白(RCF2)中 存在的rsl2659 ;在叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)(F0LH1)中存在的rs202676 ;在还 原性叶酸载体蛋白(RCF1)中存在的rs2297291 ;在还原性叶酸载体蛋白1(RCF1)中存在 的rsl051266 ;在GTP环水解酶1 (GCH1)中存在的rs8007267 ;在磷酸胆碱胞苷酰转移酶 (cytidylytransferase)A(PCYTlA)中存在的rs7639752 ;在多巴胺受体D2(DRD2)中存在的 rs6275 ;在DRD2中存在的rsl079596 ;在DRD2中存在的rsll240594 ;在儿茶酚-0-甲基转 移酶(C0MT)中存在的rs4633 ;在C0MT中存在的rs4680 ;在多巴胺活性运输蛋白(DAT或 SLC6A3)中存在的rs250682;在亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FTCD)中存在的rs2277820; 在亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)中存在的rs2236225 ;及其任何组合; 和/或s-腺苷甲硫氨酸(SAM)、s-腺苷高半胱氨酸(SAH)、4_羟基壬烯醛(4-HNE)、高度敏 感的c-反应蛋白(hsCRP)及其任何组合中至少一个的表达。额外地或备选地,测定人受试 者是否肥胖(例如,通过测定BMI值)也可以用作生物标志物,以为患有抑郁症的患者或具 有抑郁症风险的患者选择适当的治疗方案(例如包含或不包含含叶酸化合物)。本文公开 的此类生物标志物的任何个体或组合可以用于鉴定诊断为患有抑郁症或具有抑郁症风险 的患者,用于接受包含含叶酸化合物的治疗方案。在一些实施方案中,含叶酸化合物可以在 缺少抗抑郁药的情况下使用,以在所选携带至少一种或更多种本文所述生物标志物的受试 者中治疗抑郁症(例如,严重的抑郁性障碍)。在备选实施方案中,含叶酸化合物可以单独 使用或与抗抑郁药组合(例如,作为辅助剂)使用,以在所选携带至少一种或更多种本文所 述生物标志物的受试者中治疗抑郁症(例如,严重的抑郁性障碍)。在一个实施方案中,所 述抗抑郁药可以包括选择性5羟色胺再吸收抑制剂(SSRI)。SSRI的实例包括,但不限于氟 西汀、西酞普兰、氟苯哌苯醚、依他普仑、舍曲林,及其任何组合。
[0010] 因此,本文提供的一般涉及这样的测定法、方法、系统和试剂盒,其用于为患有抑 郁症或具有抑郁症风险的受试者选择治疗方案、治疗患有抑郁症或具有抑郁症风险的受 试者,和/或改善向患有抑郁症或具有抑郁症风险的受试者推荐或施用的治疗方案的有效 性。本文提供的还涉及用于在所选携带本文所述生物标志物或状况中的至少一种(例如, 至少两种或更多种)或任何组合的受试者(例如,人受试者)中治疗抑郁症的包含叶酸的 组合物。
[0011] 在一个方面中,本文提供的是为患有抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者选择治 疗方案的测定。所述测定包括:
[0012] (a)对诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者的测试样品进行至少一种分 析,以确定来自以下生物标志物中的至少两种生物标志物的参数:
[0013] (i)SEQ ID NO. 1 的位置 677 或 SEQ ID N0.7 的位置 27(通过 rsl801133 鉴定)上 SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID N0. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原 酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分;
[0014] (ii)SEQIDNO. 1 的位置 1793 或 SEQIDN0.8 的位置 27(通过 rs2274976 鉴定)上 SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID N0. 8各自独立地是MTHFR的基因组核酸 序列的一部分;
[0015] (iii)SEQ ID N0. 2 的位置 2756 或 SEQ ID N0. 9 的位置 27(通过 rsl805087 鉴定) 上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 2与SEQ ID N0. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR) 的基因组核酸序列的一部分;
[0016] (iv)SEQ IDNO. 3 的位置 66 或 SEQ IDNO. 10 的位置 27(通过 rsl801394 鉴定)上 SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶 (MTRR)的基因组核酸序列的一部分;
[0017] (v)SEQIDNO. 11的位置27(通过rsl006737鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 11是钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部 分;
[0018] (vi)SEQ IDN0. 12的位置27(通过rsl883729鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 12是DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3 β (DNMT3B)的基因组核酸序列的一部分;
[0019] (vii)SEQIDN0·13的位置27(通过rs7163862 鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID Ν0. 13是GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分;
[0020] (viii) SEQ ID N0. 14的位置27 (通过rsl2659鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分;
[0021] (ix)SEQIDN0·15的位置27(通过rs202676 鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列的一部 分;
[0022] (X) SEQ ID N0. 16的位置27 (通过rs2297291鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 16是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分;
[0023] (xi) SEQ ID N0. 17的位置27 (通过rsl051266鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分;
[0024] (xii)SEQIDNO. 18的位置27(通过rs8007267鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 18是GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分;
[0025] (xiii) SEQ ID N0. 19的位置27 (通过rs7639752鉴定)上SNP基因座的基因型, 其中SEQ ID N0. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A (PCYT1A)的基因组核酸序列的一部分;
[0026] (xiv) SEQ ID N0. 20的位置27 (通过rs6275鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 20是多巴胺受体D2 (DRD2)的基因组核酸序列的一部分;
[0027] (xv) SEQ ID N0. 21的位置27 (通过rsl079596鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分;
[0028] (xvi)SEQ ID N0.22的位置27(通过rsll240594鉴定)上SNP基因座的基因型, 其中SEQ ID N0. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分;
[0029] (χVii)SEQIDN0·23的位置27(通过rs4633 鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分;
[0030] (xviii) SEQ ID N0. 24的位置27 (通过rs4680鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分;
[0031] (xix)SEQ ID N0. 25的位置27(通过rs250682鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的基因 组核酸序列的一部分;
[0032] (XX) SEQ ID N0. 26的位置27 (通过rs2277820鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FT⑶)的基因组核酸序列的一部分;
[0033] (xxi) SEQ ID N0. 27的位置27 (通过rs2236225鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID NO. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸序列的 一部分;
[0034] (xxi i) SAM 和 SAH 的表达水平;
[0035] (xxiii)4-HNE 的表达水平;
[0036] (xxiv)hsCRP的表达水平;及其任何组合;和
[0037] (b)任选地利用非人机器从至少两种生物标志物的确定参数检测选自以下的至少 一种状况的存在:
[0038] (A) SEQ ID NO. 1 的位置 677 或 SEQ ID N0. 7 的位置 27 (通过 rsl801133 鉴定)上 的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因;
[0039] (B) SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID N0. 8 的位置 27 (通过 rs2274976 鉴定)上 的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基因;
[0040] (C) SEQ ID N0. 2 的位置 2756 或 SEQ ID N0. 9 的位置 27 (通过 rs 1805087 鉴定)上 的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因;
[0041] (D)SEQ ID N0. 3 的位置 66 或 SEQ ID N0. 10 的位置 27(通过 rsl801394 鉴定)上 的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因;
[0042] (E)SEQ ID N0. 11的位置27(通过rsl006737鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0043] (F)SEQ ID N0. 12的位置27(通过rsl883729鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0044] (G)SEQ ID N0. 13的位置27(通过rs7163862鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸 腺嘧啶"T"等位基因;
[0045] (H) SEQ ID N0. 14的位置27 (通过rsl2659鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸腺 嘧啶"T"等位基因;
[0046] (I) SEQ ID N0. 15的位置27 (通过rs202676鉴定)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌 呤"G"等位基因;
[0047] (J)SEQ ID N0. 16的位置27(通过rs2297291鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0048] (K)SEQ ID N0. 17的位置27(通过rsl051266鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0049] (L)SEQ ID N0. 18的位置27(通过rs8007267鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸 腺嘧啶"T"等位基因;
[0050] (M)SEQ ID N0. 19的位置27(通过rs7639752鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0051] (N) SEQ ID N0. 20的位置27 (通过rs6275鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧 啶"T"等位基因;
[0052] (0)SEQ ID N0. 21的位置27(通过rsl079596鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸 腺嘧啶"T"等位基因;
[0053] (P)SEQ IDN0. 22的位置27(通过rsll240594鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0054] (Q) SEQ ID NO. 23的位置27 (通过rs4633鉴定)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶 "C"等位基因;
[0055] (R) SEQ ID N0. 24的位置27 (通过rs4680鉴定)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤 "G"等位基因;
[0056] (S) SEQ ID N0. 25的位置27 (通过rs250682鉴定)上的SNP,其包含至少一个胞嘧 啶"C"等位基因;
[0057] (T)SEQ ID N0. 26的位置27(通过rs2277820鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸 腺嘧啶"T"等位基因;
[0058] (U) SEQ ID N0. 27的位置1958 (通过rs2236225鉴定)上的SNP,其包含至少一个 丙氨酸"A"等位基因;
[0059] (V)比预定参照比例低的SAM与SAH的表达水平比例;
[0060] (W)比预定参照值高的4-HNE的表达水平;
[0061] (X)如在血浆样品中测定高于约2. 3mg/升的hsCRP的表达;及其任何组合。
[0062] 基于来自步骤(b)的分析结果,如果检测到上述状况中的至少一种,所述测定可 以进一步包括为人受试者选择并任选地向所述人受试者施用包含有效量的含叶酸化合物 的治疗方案。
[0063] 在本文所述的该方面和所有其他方面的一些实施方案中,本文所述的任何SNPs 均可以包含一个或两个叶酸应答的等位基因。仅例如,SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP可以包含一个胸腺嘧啶"T"等位基因,或 两个胸腺嘧啶"Τ"等位基因。
[0064] 可以在用于本文所述测定的测试样品中确定本文所述至少两种生物标志物 (i)-(XXiv)的任何组合。本文所述至少两种生物标志物的示例性组合可以包含至少两个 SNP基因座的基因型;或至少一个SNP基因座的基因型与至少一种所示生物标志物(例如, 4-HNE)的表达水平;或至少两种所示生物标志物(例如,SAM、SAH)的表达水平。根据本文 所述至少两种生物标志物的所选组合,可以对测试样品进行一种或更多种分析,例如包括, 但不限于基因分型测定、表达测定(例如,蛋白质和/或转录物水平),或其任何组合。
[0065] 因此,在一些实施方案中,所述测定可包括对来自诊断患有抑郁症或具有抑郁症 风险的人受试者的测试样品进行至少一种基因分型测定,其适合于确定至少两个基因座 的基因型,其中所述至少两个基因座是:(i) SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的位置 27 (通过rsl801133鉴定)和(ii) SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的位置27 (通过 rsl805087鉴定)。在该实施方案中,包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1 的位置677 (或SEQ ID NO. 7的位置27)或包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2 的位置2756 (或SEQ ID NO. 9的位置27)上的至少一个SNP的检测,或两个上述SNPs的检 测表明为人受试者选择并任选地施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。
[0066] 在一些实施方案中,基因分型测定可以包括利用本文所述SNPs中任何一个SNP侧 翼的一组引物扩增测试样品的步骤。在一些实施方案中,扩增SNPs中的至少两个(例如, 至少三个、至少四个、至少五个或更多个)的至少两组(例如,至少三组、至少四组、至少五 组或更多组)引物可以用于多路扩增测定。
[0067] 在一些实施方案中,可以对测试样品进行本文所述的至少三种、至少四种、至少五 种或更多种生物标志物(i)-(xxiv)的参数确定。例如,在一些实施方案中,测定可以包括: (a)对受试者的测试样品进行一种或多于一种的分析(例如,基因分型和/或表达分析), 以确定以下状况中至少一种的存在或缺失:
[0068] i.比预定参照比例低的s-腺苷甲硫氨酸(SAM)与s-腺苷高半胱氨酸(SAH)的表 达比例;
[0069] ii.比预定参照值高的4-羟基壬烯醛(4-HNE)的表达;
[0070] iii.包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677上的单核苷 酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO. 1是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的 一部分;
[0071] iv.包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0. 2的位置2756上的SNP,其中 SEQ ID N0. 2是甲硫氨酸合酶(MTR)的基因组核酸序列的一部分;和
[0072] v.包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0. 3的位置66上的SNP,其中SEQ ID N0. 3是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR)的基因组核酸序列的一部分;和
[0073] 如果确定存在这些状况中的至少一种,所述测定可以进一步包括为人受试者选择 并任选地向所述人受试者施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。
[0074] 在本文所述该方面和所有其他方面的一些实施方案中,如在血浆样品中测定,当 SAM与SAH的表达比例低于预定参照比例,例如低于3. 0,或低于约2. 8时,可以向受试者推 荐和/或任选地施用包含含叶酸化合物的治疗方案。在一个实施方案中,如在血浆样品中 测定,SAM与SAH的表达比例低于2. 71表明受试者被推荐和/或任选地施用包含含叶酸化 合物的治疗方案。在一些实施方案中,如在血浆样品中测定,如果SAM与SAH的表达比例是 至少或高于2. 71,则不向受试者推荐或施用包含含叶酸化合物的治疗方案。根据测试样品 的来源,例如血液样品相对于口腔样品,血浆样品的预定参照比例可以不同于例如口腔样 品的比例。
[0075] 在本文所述该方面和所有其他方面的一些实施方案中,如在血浆样品中测定,当 4-HNE的表达高于预定参照值,例如高于约3mg/升,或高于约3. 2mg/升血楽或更高时,可以 向受试者推荐和/或任选地施用包含含叶酸化合物的治疗方案。在一个实施方案中,如在 血浆样品中测定,如果4-HNE的表达是至少3. 28mg/升血浆或更高,可以向受试者推荐和/ 或任选地施用包含含叶酸化合物的治疗方案。在一些实施方案中,如在血浆样品中测定,如 果4-HNE的表达低于3. 28mg/升血浆或更低,则不向受试者推荐或施用包含含叶酸化合物 的治疗方案。根据测试样品的来源,例如血液样品相对于口腔样品,血浆样品的预定参照值 可以不同于例如口腔样品的值。
[0076] 在本文所述该方面和所有其他方面的一些实施方案中,测定可以进一步包括确定 所述人受试者是否肥胖。如果确定所述受试者肥胖,那么为人受试者选择并任选地向所述 人受试者施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。在人受试者中确定肥胖症的方法 为本领域所知并且可以包括,但不限于体重指数(BMI)测定、腹部脂肪的测定(例如,通过 腰围或腰臀比例)、体脂肪的测定、皮肤皱褶厚度、水下称重(密度测定法)、空气置换体积 描记法、计算机化断层X线摄影法(CT)和磁共振成像(MRI),和双能量X-射线吸收测定 法(DEXA),及其任何组合。例如,在一个实施方案中,所述测定可以进一步包括测定人受试 者的体重指数(BMI),以确定所述人受试者是否肥胖,并且如果在该受试者中测定到至少 30kg/m2或更高的BMI值,那么为人受试者选择并任选地向人受试者施用包含有效量的含叶 酸化合物的治疗方案。在一些实施方案中,如果人受试者具有低于30kg/m2的BMI值,那么 可以不期望向人受试者推荐或施用包含含叶酸化合物的治疗方案。
[0077] 在一些实施方案中,测定可以进一步包括确定包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因 的SEQ ID NO. 1的位置1298上的SNP的存在或缺失,其中包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因的SEQ ID NO. 1的位置1298上的SNP的存在表明受试者被推荐并任选地施用包含含叶酸 化合物的治疗方案。
[0078] 在一些实施方案中,测定可以进一步包括确定高度敏感的c-反应蛋白(hsCRP)的 表达,其中如在血浆样品中测定,高于约2. 3mg/升血浆的hsCRP表达表明受试者被推荐并 任选地施用包含含叶酸化合物的治疗方案。在一些实施方案中,如在血浆样品中测定,如果 hsCRP的表达低于2. 3mg/升血浆,那么不向受试者推荐或施用包含含叶酸化合物的治疗方 案。根据测试样品的来源,例如血液样品相对于口腔样品,血浆样品中hsCRP表达可以不同 于例如口腔样品中的hsCRP表达。
[0079] 尽管在患有抑郁症的人受试者的测试样品中检测本文所述至少一种状况(A)-(X) 的存在一般足以表明所述人受试者适应包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案,但是在一 些实施方案中,可以期望检测对应于所选生物标志物的至少两种状况、三种状况、四种状况 或更多种状况的存在,以为人受试者选择或施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。 在一些实施方案中,如果本文所述的这些状况(A)-(X)没有一种出现在人受试者中,那么 不向受试者推荐包含含叶酸化合物的治疗方案。
[0080] 因此,在本文所述该方面和所有其他方面的一些实施方案中,可以分析测试样品, 以确定本文提供的状况(A)-(X)中的至少一种或至少两种、至少三种、至少四种、至少五种 或六种。例如,在一些实施方案中,可以分析测试样品,以确定受试者是否具有分别定位于 MTHFR和MTR基因座的位置677和2756上的至少SNPs。在一些实施方案中,可以分析测试 样品,以确定受试者是否肥胖(例如,所述受试者是否具有至少30kg/m 2的BMI值),并具有 分别定位于MTR和MTRR基因座的位置2756和66上的至少一个或两个SNPs。在一些实施方 案中,可以分析测试样品,以确定受试者是否肥胖(例如,所述受试者是否具有至少30kg/m 2 的BMI值),并具有分别定位于MTHFR和MTR基因座的位置677和2756上的至少一个或两 个SNPs。在其他实施方中,可以分析测试样品,以确定所述受试者是否具有至少30kg/m 2的 BMI值和定位在MTR基因座的位置2756上的SNP。在一些实施方案中,可以分析测试样品, 以确定所述受试者是否具有低于预定参照比例的至少SAM/SAH比例和定位在MTR基因座的 位置2756上的SNP。在一些实施方案中,可以分析测试样品,以确定所述受试者是否具有 高于预定标准的至少4-HNE表达和分别定位于MTR和MTRR基因座的位置2756和66上的 SNPs。设想可以在本文所述的测定中分析所有状况(A)-(X)的任何组合。
[0081] 在一些实施方案中,如果确定本文提供的状况(A)-(X)中的至少一种或至少两 种,包括至少三种或更多种存在于测试样品中,则向人受试者推荐或选择并任选地施用包 含含叶酸化合物的治疗方案。
[0082] 在一些实施方案中,如果人受试者满足本文所述状况(A)-(X)中的至少一种,包 括至少两种、至少三种或更多种(和人受试者肥胖的指标,例如至少30kg/m 2或更高的BMI 值),那么可以用含叶酸化合物为受试者施用或开处方。
[0083] 本文所述测定的一些实施方案可以包括为治疗策略的一部分,例如以为诊断患有 抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者选择适当的治疗方案。因此,本文提供的另一方面涉 及治疗诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者的方法。在一些实施方案中,用于治 疗患有抑郁症的人受试者的方法可以包括进行本文提供的测定的一个或更多个实施方案。 在一些实施方案中,如果受试者满足在本文提供的测定中描述的状况中的至少一种,那么 治疗方法可以进一步包括利用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案为受试者施用或开 处方。
[0084] 因此,在一个实施方案中,所述方法可以包括在人受试者的测试样品中确定本 文所述至少两种或更多种(包括至少三种、至少四种、至少五种或更多种)生物标志物 (i)-(XXiv)的参数;并且如果在测试样品中检测到本文所述状况(A)-(X)中的至少一种或 更多种(包括至少两种、至少三种、至少四种、至少五种或更多种)或任何组合的存在,则向 人受试者施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。
[0085] 在特定实施方案中,所述方法可以包括在人受试者的测试样品中确定SEQ ID NO. 1 的位置677 (或SEQ ID NO. 7的位置27)和SEQ ID NO. 2的位置2756 (或SEQ ID NO. 9的位置 27)上的至少两个基因座的基因型;并且如果检测到以下状况中的至少一种或两种:(i)至 少一个胸腺嘧啶"T"等位基因存在于SEQ ID NO. 1的位置677 (或SEQ ID N0. 7的位置27) 上;和(ii)至少一个鸟嘌呤"G"等位基因存在于SEQ ID NO. 2的位置2756 (或SEQ ID NO. 9 的位置27)上,则向人受试者施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。在这些实施方 案中,所述方法可以进一步包括确定本文所述状况(A)-(X)中任何一种的存在或缺失。 [0086] 在一些实施方案中,用于治疗患有抑郁症的人受试者的方法可以包括向人受试者 施用包含有效量的含叶酸化合物的组合物,所述人受试者被诊断患有抑郁症或具有抑郁症 风险,并进一步被确定携带本文所述状况(A)-(X)中的至少一种或更多种(包括至少两种、 至少三种、至少四种或更多种)或任何组合。
[0087] 在某些实施方案中,所述方法可以包括向人受试者施用包含有效量的含叶酸化合 物的组合物的方法,所述人受试者被诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险,并进一步被确定 携带以下SNPs中的至少一个或其组合:(i)包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP ;和(ii)包含 至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0. 2的位置2756或SEQ ID N0. 9的位置27上的 SNP。在这些实施方案中,所述方法可以进一步包括确定本文所述状况(A)-(X)中任何一种 的存在或缺失。
[0088] 在一些实施方案中,用包含含叶酸化合物的治疗方案施用的受试者被进一步确定 为肥胖(例如具有至少约30kg/m2或更高的BMI值)。
[0089] 在本文所述的该方面和所有其他方面的一些实施方案中,可以以有效减少与抑郁 症,例如严重的抑郁性障碍相关的至少一种症状(例如,但不限于,情绪低落、失眠、精神激 动、焦虑和/或体重减轻)的量施用含叶酸化合物。在一些实施方案中,含叶酸化合物的有 效量可以向人受试者提供至少约〇. 1-约lmg/kg体重/天施用。在一些实施方案中,含叶 酸化合物的有效量可以向人受试者提供至少约7. 5mg/天-约50mg天施用。在一个实施方 案中,含叶酸化合物的有效量可以向人受试者提供至少约15mg/天的叶酸施用。
[0090] 含叶酸化合物的有效量可以作为单次日剂量,或者以每天多于一次的分剂量通过 任何合适的施用途径,例如口腔施用向所选人受试者施用。
[0091] 向所选人受试者施用治疗如本文所述抑郁症的叶酸的有效量明显地高于作为食 品添加剂服用的典型量(在50-600 μ g/天之间)。在一些实施方案中,向所选人受试者施 用的叶酸的有效量比作为食品添加剂服用的典型量高至少约2倍、至少约5倍、至少约10 倍、至少约25倍、至少约50倍、至少约100倍、至少约250倍、至少约500倍、至少约1000 倍或更多倍。因此,在一些实施方案中,期望在缓慢释放或持续释放组合物中配制含叶酸化 合物。例如,在一个实施方案中,可以配制包含含叶酸化合物的组合物以在施用后3-6小时 或4-5小时期间内释放有效量的含叶酸化合物。
[0092] 可以选择任何本领域公认的含叶酸化合物和/或任选地向所选携带至少一种或 更多种本文所述状况(A)-(X)的人受试者施用。在一些实施方案中,含叶酸化合物可以包 含L-甲基叶酸化合物。在一个实施方案中,含叶酸化合物可以包含6(S)-5-甲基四氢叶酸 或其衍生物。
[0093] 在本文所述的该方面和所有其他方面的一些实施方案中,治疗方案可以进一步包 括选择并任选地施用抗抑郁药。在一些实施方案中,所述抗抑郁药可以包括选择性5羟色 胺再吸收抑制剂,包括但不限于,氟西汀、西酞普兰、氟苯哌苯醚、依他普仑、舍曲林,及其任 何组合。
[0094] 在这些实施方案中,抗抑郁药可以在与含叶酸化合物相同的组合物中施用。在备 选实施方案中,抗抑郁药和含叶酸化合物可以在分开的组合物中同时(例如,同时)或连续 (例如一个接一个)施用,或在任何短暂的施用方案中,其中与没有含叶酸化合物的功效相 t匕,含叶酸化合物的辅助剂效果增加了抗抑郁药的功效。在一些实施方案中,抗抑郁药和/ 或含叶酸化合物可以以单次剂量或分次剂量施用。抗抑郁药和含叶酸化合物在一定时期 (例如,每天)内施用的剂量数目可以相同或不同。抗抑郁药和含叶酸化合物可以通过相同 的或不同的途径施用。
[0095] 在本文所述的该方面和所有其他方面的一些实施方案中,与抗抑郁药组合施用的 含叶酸化合物的辅助剂效果可以是累加的。
[0096] 在本文所述的该方面和所有其他方面的一些实施方案中,与抗抑郁药组合施用的 含叶酸化合物的辅助剂效果可以是协同的。
[0097] 本文提供的其他方面是例如使用本文所述的测定,例如通过确定人受试者是否适 应叶酸或其衍生物作为辅助剂来确定和/或改善向人受试者施用的抗抑郁药的有效性的 方法。在该方面的一些实施方案中,所述方法可以进一步包括利用含有有效量的叶酸作为 抗抑郁药的辅助剂的化合物对受试者施用或开处方,如果所述受试者满足本文提供的状况 (A)-(X)中的至少一种。叶酸的示例性有效量是约7. 5mg/天-约50mg/天,或在一个实施 方案中,有效量是至少约15mg/天。在一个实施方案中,所述抗抑郁药是选择性5羟色胺再 吸收抑制剂,例如,但不限于,氟西汀、西酞普兰、氟苯哌苯醚、依他普仑、舍曲林,及其任何 组合。
[0098] 本文提供的仍另一方面是例如通过鉴定具有在如本文所述测定中所确定的状况 中的至少一种的受试者来改善受试者服用的抗抑郁药的有效性或功效的方法。因此,在该 方面的一些实施方案中,所述方法可以进一步包括利用含有有效量的叶酸作为抗抑郁药的 辅助剂的化合物对受试者施用或开处方,如果所述受试者满足在本文提供的测定中确定的 状况中的至少一种。叶酸的示例性有效量是至少约15mg/天。在一个实施方案中,所述抗 抑郁药是选择性5羟色胺再吸收抑制剂,例如,但不限于,氟西汀、西酞普兰、氟苯哌苯醚、 依他普仑、舍曲林,及其任何组合。
[0099] 还提供了用于本文所述测定和/或方法的任何方面的计算机系统。例如,本文提 供的一个实施方案是用于从获得自至少一个受试者的至少一种测试样品中获得数据的计 算机系统。所述系统包含:(a)测定模块,其被配置用于接收至少一种测试样品并在至少一 种测试样品上进行至少一种分析,以确定本文所述至少两种生物标志物(i)-(xxi V)的参 数;(b)存储设备,其被配置用于存储来自测定模块的输出数据;(c)计算模块,例如非人机 器,其包含特定编程的指令,以从输出数据确定本文所述至少一种状况(A)-(X)的存在;和 (d)显示模块,其用于显示部分基于从计算模块输出的数据的内容,其中所述内容包含表明 本文所述至少一种状况(A)-(X)存在的信号,和任选地表明本文所述状况(A)-(X)中任何 一种缺失的信号,或表明本文所述状况(A)-(X)全部缺失的信号。
[0100] 在一些实施方案中,可以配置测定模块,以在至少一种测试样品上进行至少一种 基因分型分析,以确定包含SEQ ID NO. 1的位置677 (或SEQ ID N0. 7的位置27)和SEQ ID NO. 2的位置2756 (或SEQ ID NO. 9的位置27)的至少两个基因座的基因型。在这些实施方 案中,可以配置计算模块,以确定定位在包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1 的位置677 (或SEQ ID NO. 7的位置27)和/或包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756 (或SEQ ID NO. 9的位置27)上的至少一个SNP的存在。
[0101] 在另一实施方案中,可以配置测定模块,以在至少一种测试样品上进行至少一种 分析,以确定以下状况中至少一种的存在或缺失:
[0102] i.比预定参照比例低的s-腺苷甲硫氨酸(SAM)与s-腺苷高半胱氨酸(SAH)的表 达比例;
[0103] ii.比预定参照值高的4-羟基壬烯醛(4-HNE)的表达;
[0104] iii.包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677(或SEQ ID NO. 7的位置27)上的单核苷酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地 是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分;
[0105] iv.包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0. 2的位置2756(或SEQ ID N0. 9 的位置27)上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的 基因组核酸序列的一部分;和
[0106] v.包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0. 3的位置66 (或SEQ ID N0. 10 的位置27)上的SNP,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶 (MTRR)的基因组核酸序列的一部分。
[0107] 在这些实施方案中,可以进一步配置测定模块,以确定本文所述至少一种其他状 况(A)-(X)的存在或缺失。例如,在一些实施方案中,可以进一步配置测定模块,以确定高 度敏感的c-反应蛋白(hsCRP)的表达。在一些实施方案中,可以进一步配置测定模块,以 确定包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置1298上SNP的存在或缺失。
[0108] 在一些实施方案中,可以配置测定模块,以分析至少一种测试样品,来确定上文提 供的状况中的至少两种的存在或缺失。
[0109] 在一些实施方案中,测定模块可以进一步包含适合于比较从测定模块输出的数据 与在存储设备上存储的参照数据的比较模块。
[0110] 在一些实施方案中,可以进一步配置存储设备,以存储至少一个受试者的物理信 息,例如包含测试受试者是否肥胖的指标,例如至少一个受试者的BMI。
[0111] 在一些实施方案中,显示模块上显示的内容可以进一步包含BMI值或表明BMI值 是否至少为30kg/m 2的信号。在一些实施方案中,显示模块上显示的内容可以进一步包含 表明受试者被推荐接受包含含叶酸化合物的治疗方案的信号,或表明受试者被推荐接受没 有含叶酸化合物的备选治疗方案的信号。
[0112] 本文还提供了其上记录计算机可读指令的实体和非瞬时(例如,信号传递的非瞬 时形式)的计算机可读介质,以限定用于在计算机上执行方法的软件模块。在一个实施方 案中,计算机可读存储介质包含:(a)用于比较存储设备上存储的数据与参照数据以提供 比较结果的指令,其中所述比较鉴定了本文所述至少一种状况(A)-(X)的存在或缺失;和 (b)用于显示部分基于从测定模块输出的数据的内容的指令,其中所述内容包含表明本文 所述状况(A)-(X)中的至少一种存在,和任选地本文所述这些状况(A)-(X)任何一种缺失 的信号。在其他实施方案中,所述内容可以包含表明本文所述状况(A)-(X)全部缺失的信 号。
[0113] 在一些实施方案中,可以特定编程指令,以进行比较,来鉴定定位在包含至少一个 胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677 (或SEQ ID N0. 7的位置27)和/或包含 至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0. 2的位置2756 (或SEQ ID N0. 9的位置27)上的 至少一个SNP的存在。
[0114] 在其他实施方案中,可以特定编程指令,以进行比较来鉴定以下状况之一:
[0115] i.比预定参照比例低的s-腺苷甲硫氨酸(SAM)与s-腺苷高半胱氨酸(SAH)的表 达比例;
[0116] ii.比预定参照值高的4-羟基壬烯醛(4-HNE)的表达;
[0117] iii.包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677上的单核苷 酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO. 1是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的 一部分;
[0118] iv.包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0. 2的位置2756上的SNP,其中 SEQ ID N0. 2是甲硫氨酸合酶(MTR)的基因组核酸序列的一部分;和
[0119] v.包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0. 3的位置66上的SNP,其中SEQ ID N0. 3是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR)的基因组核酸序列的一部分;
[0120] 在这些实施方案中,计算机可读介质可以进一步包含指令,以鉴定本文所述至少 一种其他状况(A)-(X)的存在或缺失。例如,在一个实施方案中,计算机可读介质可以进一 步包含指令,以鉴定包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置1298上SNP 的存在或缺失。在一些实施方案中,计算机可读介质可以进一步包含指令,以比较高度敏感 的c-反应蛋白(hsCRP)的表达与参照数据。
[0121] 在一些实施方案中,计算机可读介质可以进一步包含指令,以基于受试者的身体 特征(例如,体重和身高)确定或计算受试者是否肥胖(例如,受试者是否具有至少30kg/ m2 的 BMI)。
[0122] 在一些实施方案中,计算机可读介质可以进一步包含指令,以显示确定受试者是 否肥胖(例如,BMI值)的测定或表明受试者是否肥胖的信号(例如,BMI值是否是至少 30kg/m2)。
[0123] 在一些实施方案中,计算机可读介质可以进一步包含指令,以显示表明受试者被 推荐接受包含含叶酸化合物的治疗方案的信号,或表明受试者被推荐接受没有含叶酸化合 物的备选治疗方案的信号。
[0124] 基于与对使用含叶酸化合物的应答相关的SNPs和/或外周标志物的鉴定,本文所 述的一个方面还提供了在受试者的测试样品中鉴定本文公开的SNPs和/或外周标志物所 需的检测试剂的设计和制备。例如,可以设计和制备所述检测试剂,以鉴定本文所述测定和 方法中涉及的MTHFR基因座和MTR基因座和任选地MTRR基因座中的SNPs,和/或在测试 样品中测定SAM、SAH和4-HNE的表达水平。可以用于在测试样品中鉴定所公开SNPs的检 测试剂的实例可以包括引物和探针,其中与在相同核苷酸位置上不含有SNP的核酸分子相 t匕,所述探针可以选择性地杂交含SNP的核酸分子。可以用于在测试样品中测定血清或血 浆蛋白质(例如,SAM、SAH和/或4-HNE)的表达水平的检测试剂的实例可以包括针对此类 蛋白质的抗体,或引物和探针,其中所述探针特异性杂交对应于此类蛋白质的核酸分子。
[0125] 在一个实施方案中,试剂盒可以包含附着检测(interrogate)例如不多于30个 SNPs的多个寡核苷酸探针的寡核苷酸阵列,其中所述SNPs包含本文所述状况(A)-(U)的至 少两种或任何组合(例如,但不限于状况(A)与(C)的组合);和任选容器,其含有待缀合 到来自人受试者的测试样品的核苷酸分子上的可检测标记(例如,包含荧光分子);和至少 一种试剂。试剂盒中可以包括的试剂的实例可以包括,但不限于,限制性内切核酸酶、待缀 合到核酸分子上的通用接头、与通用接头互补的引物、洗涤剂,及其任何组合。
[0126] 在备选实施方案中,试剂盒可以包含结合不多于30个SNPs的至少一个等位基因 的多个寡核苷酸引物,其中用不同的报告子标记结合SNP的具体等位基因的每一亚组的寡 核苷酸引物,并且其中所述SNPs包含本文所述状况(A)-(U)的至少两种或任何组合(例 如,但不限于状况(A)与(C)的组合);和至少一种试剂,例如,但不限于游离的核苷酸碱 基、聚合酶、或两者。
[0127] 在一些实施方案中,试剂盒可以进一步包含至少一种试剂,以确定本文所述至少 一种生物标志物(例如,SAM、SAH、4-HNE和hsCRP)的表达。例如,在一个实施方案中,试剂 盒可以进一步包含附着至少一种基于蛋白质的结合部分(例如抗体)的固体基质支持物, 所述基于蛋白质的结合部分特异性结合本文所述的一种或更多种生物标志物。示例性固体 基质支持物可以包括,但不限于用于ELISA的微量滴定板、浸渍片、磁珠或其任何组合。在 另一实施方案中,试剂盒可以进一步包含设计用于探测本文所述的一种或更多种生物标志 物的至少一个引物。
[0128] 可以由第三方服务商进行和/或使用本文所述的测定、方法、系统和/或试剂盒。 例如,第三方服务商可以提供并付费提供用于在人受试者的测试样品中确定至少一种状况 (A)-(X)的存在或缺失的服务,例如以利于为患有抑郁症的人受试者选择治疗方案。因此, 本文还提供了用于为人受试者选择治疗方案的方法。例如,所述方法包括(a)从诊断患有 抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者获得测试样品;(b)对所述测试样品进行至少一种分 析,以确定本文所述至少两种生物标志物(i) - (xxiv)(例如,但不限于,生物标志物(i)与 (iii)的组合)的参数;(c)从所选生物标志物的参数确定至少一种状况(A)-(X)(例如,但 不限于,状况(A)和(C)中的一种或两种)的存在;和(d)提供说明状况(A)-(X)中的至少 一种是否在测试样品中检测到的结果输出。如果存在至少一种状况,那么所述方法可以进 一步包括为人受试者选择并任选地施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。
[0129] 在一些实施方案中,所述方法的步骤(b)可以进一步包括任选地将测试样品包装 并运输到测试工厂,例如第三方CLIA-检验服务商。
[0130] 在一些实施方案中,由非人机器进行方法的步骤(d)。
[0131] 用于本文所述测定、方法、系统或试剂盒的测试样品可以来自受试者的生物样品, 例如来自受试者的血液样品或血浆或血清样品。在一些实施方案中,测试样品可以包含尿 样品。在一些实施方案中,测试样品可以包含口腔样品。在一些实施方案中,测试样品可以 包含唾液样品。
[0132] 如果测试样品是核酸样品,那么可以对所述测试样品进行至少一种分析,其选自 等位基因特异的探针杂交、等位基因特异的引物延伸、等位基因特异的扩增、测序、5'核酸 酶消化、分子信标测定、DNA芯片分析、寡核苷酸连接测定、大小分析、单链构象多态性、聚合 酶链式反应(PCR)、实时定量PCR,及其任何组合。
[0133] 如果测试样品是蛋白质样品,那么可以对所述测试样品进行至少一种分析,其选 自western印迹、酶联免疫吸附测定、质谱法、免疫测定法、流式细胞术、免疫组织化学分 析,及其任何组合。
[0134] 本文提供的其他方面涉及含叶酸组合物在携带本文所述状况(A)-(X)中至少一 种(例如,但不限于一种或两种状况(A)和(C))的人受试者中治疗抑郁症的用途。本文 提供的另一方面涉及与抗抑郁剂组合的含叶酸组合物在携带本文所述状况(A)-(X)中至 少一种(例如,但不限于一种或两种状况(A)和(C))的人受试者中治疗抑郁症的用途。在 本文所述这些方面的一些实施方案中,含叶酸组合物可以包含至少约5mg的叶酸(例如约 7. 5mg-约50mg的叶酸)。在一些实施方案中,可以配制含叶酸组合物的预定释放性质(例 如,持续释放)。在一些实施方案中,人受试者是成人。
[0135] 可以利用本文所述多个方面的实施方案用于诊断患有任何形式抑郁症或具有任 何形式抑郁症风险的人受试者。在一个实施方案中,可以利用本文所述的多个方面用于诊 断患有严重的抑郁性障碍或具有严重的抑郁性障碍风险的人受试者。在一些实施方案中, 可以进一步确定人受试者对至少一种抗抑郁剂单一疗法具有抵抗性。在一些实施方案中, 人受试者是成人。
[0136] 在一些实施方案中,可以利用本文所述的多个方面用于目前服用抗抑郁剂的人受 试者。在这些实施方案中,可以为确定满足状况(A)-(X)中的至少一种(包括,例如至少两 种、至少三种或更多种)的人受试者选择和/或施用包含含叶酸化合物的治疗方案。在一 些实施方案中,治疗方案不包括抗抑郁剂。在一些实施方案中,治疗方案可以包括与人受试 者目前服用的抗抑郁剂相同的或不同的抗抑郁剂。
[0137] 附图简述
[0138] 图1A-1B显示了分析含叶酸化合物例如作为选择性5羟色胺再吸收抑制剂(SSRI) 的辅助剂用于治疗患有抑郁症的患者或鉴定表明患有抑郁症的患者被推荐包含含叶酸化 合物和SSRI的治疗方案的生物标志物或状况的功效的示例性研究设计的示意图。图1A显 示了这样的示例性研究设计,其中7. 5mg/天L-甲基叶酸(例如,6 (S)-5-甲基四氢叶酸,缩 写为如本文所述的6(S)-5-MTHF)作为SSRI的辅助剂施用。图1B显示了这样的示例性研 究设计,其中15mg/天L-甲基叶酸(例如6(S)-5-MTHF)作为SSRI的辅助剂施用。
[0139] 图2显示了使用连续平行比较的患有严重的抑郁性障碍(MDD)的SSRI抵抗门诊 病人中6(S)-5-MTHF的示例性双盲安慰剂控制研究的示意图。例如,假设10%的退出率。 该图中提供的百分比应答和非应答率仅意在表明相对功效效果,但不意在解释为或受限于 所示百分比的绝对值。
[0140] 图3A-3E显示了在试验2中利用含叶酸化合物,例如作为SSRI的辅助剂治疗MDD 患者的效果。图3A显示了 30天的治疗后,与SSRI缀合的含叶酸化合物或安慰剂治疗的 MMD患者的应答率。应答者是治疗后HDAM-17中具有至少50%降低的MDD患者。图3B显 示了 30天的治疗后与SSRI结合的含叶酸化合物或安慰剂治疗的MDD患者的多个神经心理 测试(例如HDAM-17、QIDS-SR和CGI-S)评分的平均变化。图3C显示了如通过HDAM-17测 定,30天的治疗后与SSRI结合的含叶酸化合物或安慰剂治疗的缓和中的MDD患者的百分 t匕。图3D显示了如通过QIDS-SR测定,30天的治疗后与SSRI结合的含叶酸化合物或安慰 剂治疗的缓和中的MDD患者的百分比。图3C-3D显示了 30天后,与安慰剂和SSRI相比,辅 助剂15mg/天L-甲基叶酸和SSRI的缓和率在不充分应答SSRI单一疗法的抑郁患者中并 不显著。图3E显示了从试验2中断的MDD患者的百分比,表明由于所有不利事件导致中断 率没有显著差异。
[0141] 图4A-4B显示了 MTHFR基因中单个遗传多态性(SNP) (MTHFR C677T)对包含含叶酸 化合物(例如,6(S)-5-MTHF)和任选地SSRI的治疗在患有抑郁症的患者中的功效的效果。 图4A显示了通过HDAM-28(28项汉密尔顿抑郁量表)测定的功效结果。图4B显示了通过 CGI-S(临床总体印象-严重性)测定的功效结果。
[0142] 图5A-5B显示了肥胖症(S卩,BMI是至少30kg/m2或高于30kg/m 2)对包含含叶酸 化合物(例如,6 (S)-5-MTHF)和任选地SSRI的治疗在患有抑郁症的患者中的功效的效果。 图5A显示了通过HDAM-28 (28项汉密尔顿抑郁量表)测定的功效结果,治疗效果的卡方为 3. 94。图4B显示了通过CGI-S (临床总体印象-严重性)测定的功效结果,治疗效果的卡 方为10. 03。
[0143] 图6是显示用于例如为患有抑郁症的受试者选择治疗方案的本文所述方法的示 例性系统的方块图。
[0144] 图7是本文所述系统使用的计算机可读存储介质上的示例性指令组。
[0145] 图8A-8B显示了当利用含叶酸化合物,例如作为SSRI的辅助剂治疗时,在所示基 因上携带至少一种稀有变体的MDD患者中HAMD-28的平均变化,其与各基因上完全正常的 相反。图8A是显示所示多种SNP生物标志物相关的HAMD-28中的平均变化的条线图。图 8B是显示图8A中所示结果和染色体中对应基因座的表。如图8B中所用的术语"患病率 (prevalence) "指携带如该特定研究中所示的SNP的MDD患者的总百分比。
[0146] 图9A-9C是显示当利用包含含叶酸化合物的治疗方案治疗患者时,MDD患者中所 示状况的存在或缺失对抑郁症程度的效果的表。通过社会功能问卷(SFQ)、视觉模拟量表 (VAS)和认知和体格功能问卷(CPFQ)测定抑郁症的程度。图9A显示了在所有样品上的分 析。图9B显示了在生物标志物亚组中的分析。图9C显示了在遗传亚组中的分析。
[0147] 图10A-10C是显示当利用含叶酸化合物(治疗组)或没有含叶酸化合物(安慰剂 组)治疗患者时,MDD患者中所示状况的存在或缺失对抑郁症程度的效果的表。通过Maier 或HAMD的HAMD-7子量表测定抑郁症的程度。图10A显示了 Maier SP⑶的结果。图10B显 示了 Maier均值。图10C显示了 HAMD-7SP⑶。图10D显示了 HAMD-7均值。图10E显示了 Maier量表上生物标志物和遗传分析的概述。
[0148] 发明详述
[0149] 近期的评估表明,每年多于1900万年龄超过18岁的美国人经历抑郁症。尽管在 过去十年里在抑郁症的治疗方面已经获得了显著进步,但是多达29% -46%服用抗抑郁剂 的抑郁症患者仍然部分地或完全地对治疗具有抵抗性。患有治疗抵抗性抑郁症的那些患者 几乎没有可选选项。由于不是每一种治疗方案对每一个个体都有效,所以强烈需要鉴定可 以利于为患有抑郁症的受试者选择适当的治疗方案的标志物。
[0150] 根据本文所述多个实施方案的方面,已经发现了至少21个单核苷酸多态性 (SNPs)和4种外周生物标志物参数用于预测包含含叶酸化合物的治疗方案的有效性或功 效。即,这些SNPs和血清/血浆生物标志物参数可以用于鉴定患有抑郁症的受试者,与没 有含叶酸化合物的治疗相比,其可以受益于或应答包含含叶酸化合物的治疗方案。具体而 言,这些SNPs和血清/血浆生物标志物参数可以用于鉴定患有治疗抵抗性抑郁症的受试者 (例如,对至少一种选择性5羟色胺再吸收抑制剂(SSRI)具有抵抗性的受试者),与没有含 叶酸化合物的治疗相比,其可以受益于或应答包含含叶酸化合物的治疗方案。可以在缺少 抗抑郁药的情况下施用含叶酸化合物,或者含叶酸化合物可以提供为抗抑郁药的辅助剂。 在一些实施方案中,与抗抑郁药组合施用的含叶酸化合物的辅助剂效果可以是累加的。在 其他实施方案中,与抗抑郁药组合施用的含叶酸化合物的辅助剂效果可以是协同的。
[0151] 特别地,可以预测向人受试者施用含叶酸化合物(例如,单独或组合疗法以增加 抗抑郁剂的功效)用于治疗抑郁症的功效的SNPs包括通过如下rs号鉴定的至少一个SNP 或SNPs的组合:在亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)中存在的rsl801133 ;在MTHFR中存在的 rs2274976 ;在甲硫氨酸合酶(MTR)中存在的rsl805087 ;在甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR)中 存在的rsl801394 ;在钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)中存在的rsl006737 ; 在DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)中存在的rsl883729 ;在GTP环水解酶1反馈 调节蛋白(GCHFR)中存在的rs7163862 ;在还原性叶酸载体蛋白(RCF2)中存在的rsl2659 ; 在叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)(F0LH1)中存在的rs202676 ;在还原性叶酸载体蛋 白(RCF1)中存在的rs2297291 ;在还原性叶酸载体蛋白1(RCF1)中存在的rsl051266;在 GTP环水解酶1(GCH1)中存在的rs8007267;在磷酸胆碱胞苷酰转移酶A(PCYTIA)中存在 的rs7639752 ;在多巴胺受体D2 (DRD2)中存在的rs6275 ;在DRD2中存在的rsl079596 ;在 DRD2中存在的rsll240594 ;在儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)中存在的rs4633 ;在C0MT 中存在的rs4680 ;在多巴胺活性运输蛋白(DAT或SLC6A3)中存在的rs250682 ;在亚胺甲 基转移酶环化脱氨酶(FTCD)中存在的rs2277820;在亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖 的)1 (MTHFD1)中存在的rs2236225 ;及其任何组合。
[0152] 此外,可以预测向人受试者施用含叶酸化合物(例如,单独或组合疗法以增加抗 抑郁剂的功效)用于治疗抑郁症的功效的外周生物标志物参数包括s-腺苷甲硫氨酸(SAM) 与s-腺苷高半胱氨酸(SAH)之间的相对表达水平、4-羟基壬烯醛(4-HNE)的表达、高度敏 感的c-反应蛋白(hsCRP)的表达及其任何组合。此外,也已经发现肥胖症预测包含含叶酸 化合物(例如,作为单一疗法或与抗抑郁剂的组合疗法)的治疗方案的有效性。已经在患 有严重的抑郁性障碍并已经对抗抑郁剂单一疗法显示抵抗性,例如患有治疗抵抗性抑郁症 (TRD),具体而言,对选择性5羟色胺再吸收抑制剂(SSRI)具有抵抗性的抑郁症的人群上评 估了这些遗传多态性、外周生物标志物和临床特征。
[0153] 因此,本文所述的一些实施方案一般涉及为患有抑郁症的受试者选择治疗方案或 鉴定适应或应答包含含叶酸化合物的治疗方案的患有抑郁症的受试者的测定、方法、系统 或试剂盒。在一些实施方案中,治疗可以包含含叶酸化合物与抗抑郁药的组合。在一个实 施方案中,测定、方法、系统或试剂盒涉及确定来自人受试者,例如诊断患有抑郁症或具有 抑郁症(例如,但不限于严重的抑郁性障碍)风险的人受试者的测试样品中单核苷酸多态 性(SNPs)和/或外周生物标志物参数中的至少一个的存在或缺失,以预测受试者对包含含 叶酸化合物的治疗的应答。如果确定本文所述状况中的至少一种存在于来自人受试者的测 试样品中,那么可以为所述人受试者选择并任选地施用包含含叶酸化合物的治疗方案。在 一些实施方案中,治疗方案可以进一步包含待与含叶酸化合物分别或同时施用的抗抑郁药 (例如 SSRI)。
[0154] 用于为患有抑郁症的人受试者选择治疗方案的测定
[0155] 因此,本文提供的一般涉及这样的测定、方法、系统和试剂盒,其用于为患有抑郁 症或具有抑郁症风险的受试者选择治疗方案;治疗患有抑郁症或具有抑郁症风险的受试 者,和/或改善向患有抑郁症或具有抑郁症风险的受试者推荐和/或施用的治疗方案的有 效性。本文提供的还涉及用于在所选携带本文所述生物标志物或状况中的至少一种(例 如,至少两种或更多种)或任何组合的受试者(例如,人受试者)中治疗抑郁症的含叶酸组 合物。
[0156] 本文所述的一个方面提供了通过在来自受试者的测试样品中鉴定如本文所述的 SNPs中的至少一个的基因型和/或至少一种外周生物标志物的表达为患有抑郁症的受试 者选择治疗方案的测定,以确定人受试者对包含含叶酸化合物的治疗方案的应答性。所述 测定包括:
[0157] (i)SEQ ID NO. 1 的位置 677 或 SEQ ID N0.7 的位置 27(通过 rsl801133 鉴定)上 SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID N0. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原 酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分;
[0158] (ii)SEQIDNO. 1 的位置 1793 或 SEQIDN0.8 的位置 27(通过 rs2274976 鉴定)上 SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID N0. 8各自独立地是MTHFR的基因组核酸 序列的一部分;
[0159] (iii)SEQ IDN0.2 的位置 2756 或 SEQ IDN0.9 的位置 27(通过 rsl805087 鉴定) 上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 2与SEQ ID N0. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR) 的基因组核酸序列的一部分;
[0160] (iv)SEQ IDN0. 3 的位置 66 或 SEQ IDN0. 10 的位置 27(通过 rsl801394 鉴定)上 SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 3与SEQ ID N0. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶 (MTRR)的基因组核酸序列的一部分;
[0161] (v)SEQIDNO. 11的位置27(通过rsl006737鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 11是钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部 分;
[0162] (vi)SEQ IDNO. 12的位置27(通过rsl883729鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 12是DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3 β (DNMT3B)的基因组核酸序列的一部分;
[0163] (vii)SEQIDNO. 13的位置27(通过rs7163862鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 13是GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分;
[0164] (viii)SEQ ID N0. 14的位置27(通过rsl2659鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分;
[0165] (ix)SEQIDN0·15的位置27(通过rs202676 鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列的一部 分;
[0166] (x)SEQ IDN0. 16的位置27(通过rs2297291鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 16是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分;
[0167] (xi)SEQ ID N0. 17的位置27(通过rsl051266鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分;
[0168] (xii)SEQIDN0·18的位置27(通过rs8007267 鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 18是GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分;
[0169] (xiii)SEQ ID N0. 19的位置27(通过rs7639752鉴定)上SNP基因座的基因型, 其中SEQ ID N0. 19是磷酸胆碱cytidylytransferase胞苷酰转移酶A(PCYTIA)的基因组核 酸序列的一部分;
[0170] (xiv)SEQ ID N0.20的位置27(通过rs6275鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 20是多巴胺受体D2 (DRD2)的基因组核酸序列的一部分;
[0171] (xv)SEQ ID N0. 21的位置27(通过rsl079596鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分;
[0172] (xvi)SEQ ID N0.22的位置27(通过rsll240594鉴定)上SNP基因座的基因型, 其中SEQ ID N0. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分;
[0173] (χVii)SEQIDN0·23的位置27(通过rs4633 鉴定)上SNP基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分;
[0174] (xviii)SEQ ID N0. 24的位置27(通过rs4680鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分;
[0175] (xix)SEQ ID N0. 25的位置27(通过rs250682鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的基因 组核酸序列的一部分;
[0176] (xx)SEQ ID N0. 26的位置27(通过rs2277820鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FT⑶)的基因组核酸序列的一部分;
[0177] (xxi)SEQIDNO. 27的位置27(通过rs2236225鉴定)上SNP基因座的基因型,其 中SEQ ID N0. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸序列的 一部分;
[0178] (xxii) SAM 和 SAH 的表达水平;
[0179] (xxiii)4-HNE 的表达水平;
[0180] (xxiv)hsCRP的表达水平;及其任何组合;和
[0181] (b)任选地利用非人机器从至少两种生物标志物的确定参数检测选自以下状况 (A)-(X)的至少一种状况(包括,例如至少两种状况、至少三种状况、至少四种状况或更多 种状况)的存在:
[0182] (A)SEQ ID NO. 1 的位置 677 或 SEQ ID N0. 7 的位置 27(通过 rsl801133 鉴定)上 的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因;
[0183] (B) SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID N0. 8 的位置 27 (通过 rs2274976 鉴定)上 的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基因;
[0184] (C) SEQ ID N0. 2 的位置 2756 或 SEQ ID N0. 9 的位置 27 (通过 rs 1805087 鉴定)上 的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因;
[0185] (D)SEQ ID N0. 3 的位置 66 或 SEQ ID N0. 10 的位置 27(通过 rsl801394 鉴定)上 的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因;
[0186] (E)SEQ ID N0. 11的位置27(通过rsl006737鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0187] (F)SEQ ID N0. 12的位置27(通过rsl883729鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0188] (G)SEQ ID N0. 13的位置27(通过rs7163862鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸 腺嘧啶"T"等位基因;
[0189] (H)SEQ ID N0. 14的位置27(通过rsl2659鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸腺 嘧啶"T"等位基因;
[0190] (I)SEQ IDN0. 15的位置27(通过rs202676鉴定)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌 呤"G"等位基因;
[0191] (J)SEQIDN0·16的位置27(通过rs2297291 鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0192] (K)SEQ ID N0. 17的位置27(通过rsl051266鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0193] (L)SEQ ID N0. 18的位置27(通过rs8007267鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸 腺嘧啶"T"等位基因;
[0194] (M)SEQ ID N0. 19的位置27(通过rs7639752鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0195] (N) SEQ ID N0. 20的位置27 (通过rs6275鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧 啶"T"等位基因;
[0196] (0)SEQ ID N0. 21的位置27(通过rsl079596鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸 腺嘧啶"T"等位基因;
[0197] (P)SEQ IDN0. 22的位置27(通过rsll240594鉴定)上的SNP,其包含至少一个丙 氨酸"A"等位基因;
[0198] (Q)SEQ IDN0. 23的位置27(通过rs4633鉴定)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶 "C"等位基因;
[0199] (R)SEQIDN0·24的位置27(通过rs4680鉴定)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤 "G"等位基因;
[0200] (S) SEQ ID NO. 25的位置27 (通过rs250682鉴定)上的SNP,其包含至少一个胞嘧 啶"C"等位基因;
[0201] (T)SEQ ID N0. 26的位置27(通过rs2277820鉴定)上的SNP,其包含至少一个胸 腺嘧啶"T"等位基因;
[0202] (U) SEQ ID N0. 27的位置1958 (通过rs2236225鉴定)上的SNP,其包含至少一个 丙氨酸"A"等位基因;
[0203] (V)比预定参照比例低的SAM与SAH的表达水平比例;
[0204] (W)比预定参照值高的4-HNE的表达水平;
[0205] (X)如在血浆样品中测定高于约2. 3mg/升的hsCRP的表达;及其任何组合。
[0206] 在本文所述的该方面和所有其他方面的一些实施方案中,本文所述的任何SNPs 均可以包含一个或两个叶酸应答的等位基因。仅例如,SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位置27 (通过rsl801133鉴定)上的SNP可以包含一个胸腺嘧啶"T"等位基因,或 两个胸腺嘧啶"Τ"等位基因。不希望受理论的束缚,确定在本文所述SNP基因座中携带两 个叶酸应答等位基因的人受试者可以比在相同SNP基因座中具有一个叶酸应答等位基因 的人受试者对包含含叶酸化合物的治疗方案显示更强的应答。
[0207] 根据引物和探针的设计,SNP状况(A)-(U)也可以由与本文所述对应的叶酸应答 等位基因互补的等位基因代表。例如,除了检测包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP的存在,本 领域技术人员可以容易地为SEQ ID N0. 7的互补序列设计引物和/或探针,用于探测在相同 位置却包含至少一个"A"等位基因的SNP。因此,在本文所述的该方面和所有其他方面的一 些实施方案中,可以通过检测如在上文并也在下文表42中显示的叶酸应答等位基因的互 补等位基因的存在来表明选自状况(A)-(U)的至少一种状况(包括,例如至少两种状况、至 少三种状况、至少四种状况或更多种状况)的存在。
[0208] 基于来自步骤(b)的分析结果,如果检测到上文所述状况(A)-(X)中的至少一种, 所述测定可以进一步包括为人受试者选择并任选地向所述人受试者施用包含有效量的含 叶酸化合物的治疗方案。
[0209] 可以在用于本文所述测定的测试样品中确定本文所述至少两种生物标志物 (i)-(XXiv)的任何组合。本文所述至少两种生物标志物的示例性组合可以包含至少两个 SNP基因座或更多个SNP基因座(例如,包括至少三个SNP基因座、至少四个SNP基因座、至 少五个SNP基因座或更多个SNP基因座)的基因型;或至少一个SNP基因座或更多个SNP 基因座(例如,包括至少两个SNP基因座或更多个SNP基因座)的基因型和至少一种外周 生物标志物或更多种外周生物标志物(例如,4-HNE、SAM、SAH)的表达水平;或至少两种外 周生物标志物(例如,4-!1呢、341、34!1)的表达水平。根据本文所述至少两种生物标志物的 所选组合,可以对测试样品进行一种或更多种分析,例如包括,但不限于基因分型测定、表 达测定(例如,蛋白质和/或转录物水平),或其任何组合。
[0210] 因此,在一些实施方案中,所述测定可以包括对来自诊断患有抑郁症或具有抑郁 症风险的人受试者的测试样品进行至少一种基因分型测定,其适合于确定至少两个基因座 的基因型,其中所述至少两个基因座是:(i) SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的位置 27 (通过rsl801133鉴定)和(ii) SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的位置27 (通过 rsl805087鉴定)。在该实施方案中,包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1 的位置677 (或SEQ ID NO. 7的位置27)上的至少一个SNP或包含至少一个鸟嘌呤"G"等位 基因的SEQ ID NO. 2的位置2756 (或SEQ ID NO. 9的位置27)上的至少一个SNP的检测,或 两个上述SNPs的检测表明为人受试者选择并任选施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗 方案。
[0211] 在一些实施方案中,可以对测试样品进行至少一种基因分型测定,其适合于确定 至少三个基因座、至少四个基因座、至少五个基因座、至少六个基因座、至少七个基因座、 至少八个基因座、至少九个基因座、至少十个基因座或更多个基因座的基因型。待检测的 (interrogated)额外基因座可以选自生物标志物(i)-(xxi)的任何组合。
[0212] 在一些实施方案中,基因分型测定可以包括利用本文所述SNPs中任何一个SNP侧 翼的一组引物扩增测试样品的步骤。在一些实施方案中,扩增SNPs中的至少两个(例如, 至少三个、至少四个、至少五个或更多个)的至少两组(例如,至少三组、至少四组、至少五 组或更多组)引物可以用于多路扩增测定。
[0213] 在一些实施方案中,可以对测试样品进行本文所述的至少三种、至少四种、至少五 种或更多种生物标志物(i)-(xxiv)的参数确定。例如,在一些实施方案中,测定可以包 括:(a)对受试者的测试样品进行一种或更多于一种的分析(例如,基因分型和/或表达分 析),以确定以下状况中至少一种的存在或缺失:
[0214] i.比预定参照比例低的s-腺苷甲硫氨酸(SAM)与s-腺苷高半胱氨酸(SAH)的表 达比例;
[0215] ii.比预定参照值高的4-羟基壬烯醛(4-HNE)的表达;
[0216] iii.包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID N0:1的位置677(或SEQ ID NO. 7的位置27)上的单核苷酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO: 1与SEQ ID NO. 7各自独立地 是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分;
[0217] iv.包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0:2的位置2756 (或SEQ ID N0. 9 的位置27)上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的 基因组核酸序列的一部分;和
[0218] v.包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID N0. 3的位置66 (或SEQ ID N0. 10 的位置27)上的SNP,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶 (MTRR)的基因组核酸序列的一部分。
[0219] 在这些实施方案中,检测这些状况中至少一种的存在表明受试者被推荐包含含叶 酸化合物的治疗方案。在一些实施方案中,如果不存在任何本文所述的状况,那么不向受试 者推荐包含含叶酸化合物的治疗方案。
[0220] 在本文所述该方面和所有其他方面的一些实施方案中,如在血浆样品中测定,当 SAM与SAH的表达比例低于预定参照比例,例如低于3. 0,或低于约2. 8时,可以向受试者推 荐并任选地施用包含含叶酸化合物的治疗方案。在一个实施方案中,SAM与SAH的表达比 例低于2. 71 (如在血浆样品中测定)表明受试者被推荐并任选地施用包含含叶酸化合物的 治疗方案。在一些实施方案中,如在血浆样品中测定,如果SAM与SAH的表达比例至少是或 高于2. 71,不向受试者推荐或施用包含含叶酸化合物的治疗方案。根据测试样品的来源,例 如血液样品相对于口腔样品,血浆样品的预定参照比例可以不同于例如口腔样品的比例。
[0221] 在本文所述任何方面的一些实施方案中,当4-HNE的表达高于预定参照值,例如 高于约3mg/升,或高于约3. 2mg/升时(如在血浆样品中测定),可以向受试者推荐并任选 地施用包含含叶酸化合物的治疗方案。在一个实施方案中,至少3. 28mg/升或更高的4-HNE 的表达(如在血浆样品中测定)表明受试者被推荐并任选地施用包含含叶酸化合物的治疗 方案。在一些实施方案中,如在血浆样品中测定,如果4-HNE的表达低于3. 28mg/升血浆或 更低时,不向受试者推荐或施用包含含叶酸化合物的治疗方案。根据测试样品的来源,例如 血液样品相对于口腔样品,血浆样品的预定参照值可以不同于例如口腔样品的值。
[0222] 在本文所述该方面和所有其他方面的一些实施方案中,测定可以进一步包括确定 所述人受试者是否肥胖。如果确定所述受试者肥胖,那么为人受试者选择并任选地施用包 含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。在人受试者中确定肥胖症的方法为本领域所知并且 可以包括,但不限于体重指数(BMI)测定、腹部脂肪的测定(例如,通过腰围或腰臀比例)、 体脂肪的测定、皮肤皱褶厚度、水下称重(密度测定法)、空气置换体积描记法、计算机化断 层X线摄影法(CT)和磁共振成像(MRI),和双能量X-射线吸收测定法(DEXA),及其任何组 合。
[0223] 可以在临床上以不同的方式定义肥胖症。例如,可以通过至少约30kg/m2或更高 的体重指数(BMI)值定义肥胖症。在另一实施方案中,可以通过过多的腹部脂肪(例如通 过腰围和/或腰臀比例表示)定义肥胖症。例如,过多的腹部脂肪在临床上可以定义为在 男人中>40英寸(>102cm)和在女人中>35英寸(>88cm)的腰围。或者,腹部肥胖症可以定 义为男人高于〇. 95和女人高于0. 80的腰臀比。在一些实施方案中,肥胖症可以定义为体 脂肪百分比,例如肥胖症定义为在女人中至少约32%或更高,在男人中至少约25%或更高 的体脂肪百分比。
[0224] 在一个实施方案中,BMI的测定可以用于确定人受试者是否肥胖。在该实施方案 中,所述测定可以进一步包括测定人受试者的体重指数(BMI),以确定所述人受试者是否肥 胖,并且如果在该受试者中测定到至少30kg/m 2或更高的BMI值,那么为人受试者选择并任 选地向人受试者施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。在一些实施方案中,如果人 受试者具有低于30kg/m 2的BMI值,那么可以不期望向人受试者推荐或施用包含含叶酸化 合物的治疗方案。
[0225] 在一些实施方案中,测定可以进一步包括确定包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因 的SEQ ID NO. 1的位置1298上的SNP的存在或缺失,其中包含至少一个胞嘧啶"C"的SEQ ID NO. 1的位置1298上的SNP的存在表明受试者被推荐和/或施用包含含叶酸化合物的治 疗方案。
[0226] 在一些实施方案中,测定可以进一步包括确定高度敏感的c-反应蛋白(hsCRP)的 表达,其中高于约2. 3mg/升血浆的hsCRP表达(如在血浆样品中测定)表明受试者被推荐 包含抗抑郁药和含叶酸化合物的治疗方案。在一些实施方案中,如在血浆样品中测定,如果 hsCRP的表达低于2. 3mg/升血浆,那么不向受试者推荐或施用包含含叶酸化合物的治疗方 案。根据测试样品的来源,例如血液样品相对于口腔样品,血浆样品中hsCRP表达可以不同 于例如口腔样品中的hsCRP表达。
[0227] 在本文所述测定的一些实施方案中,可以分析测试样品,以确定本文提供的状况 中的至少一种或至少两种、至少三种、至少四种、至少五种、至少六种。例如,在一些实施方 案中,可以分析测试样品,以确定受试者是否具有分别定位于MTHFR和MTR基因座的位置 677和2756上的至少SNPs。在一些实施方案中,可以分析测试样品,以确定受试者是否肥胖 (例如,所述受试者是否具有至少30kg/m 2的至少BMI值),并具有分别定位于MTR和MTRR 基因座的位置2756和66上的SNPs。在其他实施方中,可以分析测试样品,以确定所述受试 者是否肥胖(例如,所述受试者是否具有至少30kg/m 2的至少BMI值)和定位在MTR基因座 的位置2756上的SNP。在一些实施方案中,可以分析测试样品,以确定所述受试者是否具有 低于预定参照比例的至少SAM/SAH比例和定位在MTR基因座的位置2756上的SNP。在一些 实施方案中,可以分析测试样品,以确定所述受试者是否具有高于预定参照值的至少4-HNE 表达和分别定位于MTR和MTRR基因座的位置2756和66上的SNPs。如先前讨论,可以同时 或在不同的时间测定本文所述状况(A)-(X)中一种或更多种的任何组合。
[0228] 在一些实施方案中,如果确定本文提供的状况中的至少一种或至少两种,包括至 少三种或更多种存在于人受试者的测试样品中,那么为人受试者选择并任选地施用包含含 叶酸化合物的治疗方案。
[0229] 在一些实施方案中,如果人受试者满足本文所述状况(A)-(X)中的至少一种,包 括至少两种、至少三种或更多种(和例如由至少30kg/m 2或更高的BMI值定义的肥胖症), 那么可以用包含含叶酸化合物的治疗方案为受试者施用或开处方。
[0230] 在一些实施方案中,治疗方案可以进一步包含待与含叶酸化合物(例如同时或分 别)组合施用的抗抑郁药(例如SSRI)。
[0231] 在一些实施方案中,含叶酸化合物可以包含L-甲基叶酸化合物。在一个实施方案 中,含叶酸化合物可以包含6(S)-5-甲基四氢叶酸或其衍生物。
[0232] 可以由第三方服务商进行和/或使用本文所述的测定、方法、系统和/或试剂盒。 例如,第三方服务商可以提供并付费提供用于在人受试者的测试样品中确定至少一种状况 (A)-(X)的存在或缺失的服务,例如以利于为患有抑郁症的人受试者选择治疗方案。因此, 本文还提供了用于为人受试者选择治疗方案的方法。例如,所述方法包括(a)从诊断患有 抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者获得测试样品;(b)对所述测试样品进行至少一种分 析,以确定本文所述至少两种生物标志物(i) - (xxiv)(例如,但不限于,生物标志物(i)与 (iii)的组合)的参数;(c)从所选生物标志物的参数确定至少一种状况(A)-(X)(例如,但 不限于,状况(A)和(C)中的一种或两种)的存在;和(d)提供说明状况(A)-(X)中的至少 一种是否在测试样品中检测到的结果输出。如果存在至少一种状况,那么所述方法可以进 一步包括为人受试者选择并任选地施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。
[0233] 在一些实施方案中,所述方法的步骤(b)可以进一步包括任选地将测试样品包装 并运输到测试工厂,例如第三方CLIA-检验服务商。
[0234] 在一些实施方案中,由非人机器进行方法的步骤(d)。
[0235] 表明包含含叶酸化合物的治疗方案的叶酸应答生物标志物(i)-(xxiv)和相关状 况㈧-⑴
[0236] 下文表41A-41B表明叶酸应答生物标志物(i)-(xxiV)和相关状况(A)-(X),其在 诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者的测试样品中的至少一种的存在表明为人 受试者选择并任选地施用包含含叶酸化合物的治疗方案。
[0237] 下一页显示了表41A :用于本文所述测定、方法、系统和试剂盒中的叶酸应答生物 标志物(i)-(xxi)和对应的叶酸应答状况(A)-(U)。示于表41A中的人来源的序列(包括 其互补序列)可以为设计用于本文所述SNP生物标志物的检测(interrogation)的引物和 探针提供基础。
[0238]
【权利要求】
1.用于为患有抑郁症的人受试者选择治疗方案的测定法,其包括: (a) 对来自诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者的测试样品进行至少一种基 因分型测定,其适合于确定至少两个基因座的基因型,其中所述至少两个基因座是: i. SEQ IDNO. 1 的位置 677 或 SEQ IDNO. 7 的位置 27(通过 rsl801133 鉴定),其中 SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的 一部分; ii. SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的位置27 (通过rsl805087鉴定),其中 SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基因组核酸序列的一部分; 和 (b) 从所述至少两个基因座的基因型检测选自以下的单核苷酸多态性(SNP)的存在: 1. SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位置27上的SNP677,其包含至少一个胸 腺嘧啶"T"等位基因; ii. SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的位置27上的SNP2756,其包含至少一个 鸟嘌呤"G"等位基因;和 iii. 至少一个SNP677T等位基因和至少一个SNP2756G等位基因的组合;和 如果位置SNP677上的至少一个T等位基因或位置SNP2756上的至少一个G等位基因 或位置SNP677上的至少一个T等位基因和位置SNP2756上的至少一个G等位基因被检测 至IJ,那么选择,并任选地施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗方案。
2. 权利要求1的测定法,其中如果SNP677T等位基因或SNP2756G等位基因均未被检测 至IJ,那么选择没有含叶酸化合物的治疗方案。
3. 用于为患有抑郁症的人受试者选择治疗方案的测定法,其包括: 对诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者的测试样品进行至少一种测定,以 检测以下状况中至少一种的存在或缺失: i. 比预定参照比例低的s-腺苷甲硫氨酸(SAM)与s-腺苷高半胱氨酸(SAH)的表达比 例; ii. 比预定参照值高的4-羟基壬烯醛(4HNE)的表达; iii. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7 的位置27 (通过rsl801133鉴定)上的单核苷酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; iv. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分;和 v. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置 27上的SNP,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; 并且如果检测到存在所述状况中的至少一种,那么推荐选择包含含叶酸化合物的治疗 方案;并且如果确定不存在任何这些状况,那么推荐没有含叶酸化合物的治疗方案。
4. 前述权利要求任一项的测定法,其进一步包括确定来自以下的至少一种生物标志物 的参数: i. SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27 (通过 rs2274976 鉴定)上 SNP 基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶 (MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; ii. SEQ IDN0. 3 的位置 66 或 SEQ IDN0. 10 的位置 27(通过 rsl801394 鉴定)上 SNP 基 因座的基因型,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; iii. rsl006737(SEQ ID NO. 11 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 11 是钙通道、电压依赖型、L型、α 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部分; iv. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 12是 DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的一部分; ν. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 13是 GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分; vi. rsl2659 (SEQ ID NO. 14的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 14是还 原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; vii. rs202676(SEQ ID NO. 15的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 15是 叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)1(F0LH1)的基因组核酸序列的一部分; viii. rs2297291 (SEQ ID NO. 16 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 16 是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; ix. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 17是 还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; X. rs8007267(SEQ ID NO. 18的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 18是 GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 19是 磷酸胆碱胞苷酰转移酶A (PCYT1A)的基因组核酸序列的一部分; xii. rs6275(SEQ IDN0. 20的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 20是多 巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rsl079596(SEQ IDN0.21 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ IDN0.21 是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rsll240594(SEQ ID NO. 22 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 22 是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 23是儿 茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 24是儿 茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs250682(SEQ ID N0. 25的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 25是 溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的基因组核酸序列的一部 分; xviii. rs2277820 (SEQ ID N0. 26 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 26 是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部分; xix. rs2236225 (SEQ ID NO. 27的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 27是 亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1(MTHFD1)的基因组核酸序列的一部分; XX.肥胖指标(例如,BMI值); xxi. SAM和SAH的表达; xxii. 4-HNE 的表达; xxiii. hsCRP的表达;及其任何组合。
5.权利要求4的测定法,其进一步包括从所述至少一种生物标志物的确定参数确定来 自以下的至少一种状况的存在: i. SEQ ID NO. 1的位置1793或SEQ ID NO. 8的位置27上的SNP,其包含至少一个丙氨 酸"A"等位基因; ii. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌 呤"G"等位基因; iii. rsl006737(SEQ ID NO. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; iv. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; V. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; vi. rsl2659 (SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; vii. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; viii. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; ix. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; X. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; xi. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xii. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; xiii. rsl079596(SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; xiv. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; XV. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因; xvi. rs4680 (SEQ ID NO. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; xvii. rs250682 (SEQ ID NO. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; xviii. rs2277820 (SEQ ID NO. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因;和 xix. rs2236225(SEQ ID NO. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; XX.肥胖症(例如,由30kg/m2或更高的BMI值定义); xxi. 比预定参照比例低的SAM与SAH的表达比例; xxii. 比预定参照值高的4-HNE的表达; xxiii. 如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升的hsCRP的表达;及其任何组合;并且 如果检测到状况中的至少一种,那么选择和任选地施用包含有效量的含叶酸化合物的 治疗方案。
6.用于为患有抑郁症的人受试者选择治疗方案的测定法,其包括: (a)使诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者的测试样品进行至少一种分析, 以确定来自以下的至少两种生物标志物的参数: i. SEQ IDN0. 1的位置677或SEQ IDN0. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上SNP基因 座的基因型,其中SEQ IDN0. 1与SEQ IDN0. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR) 的基因组核酸序列的一部分; ii. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上 SNP 基因座的基 因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基 因组核酸序列的一部分; iii. SEQ ID NO. 2 的位置 2756 或 SEQ ID NO. 9 的位置 27 (通过 rsl805087 鉴定)上 SNP 基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分; iv. SEQ ID NO. 3 的位置 66 或 SEQ ID NO. 10 的位置 27 (通过 rsl801394 鉴定)上 SNP 基 因座的基因型,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; v. rsl006737(SEQ IDN0. 11的位置27,其中SEQ IDN0. 11是钙通道、电压依赖型、L型、 a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; vi. rsl883729(SEQ IDN0. 12 的位置 27,其中 SEQ IDN0. 12 是 DNA(胞嘧啶-5)-甲基转 移酶3 β (DNMT3B)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; vii. rs7163862(SEQ ID NO. 13 的位置 27,其中 SEQ ID NO. 13 是 GTP 环水解酶 1 反馈调 节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; viii. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白 (RCF2)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异 的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; X. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白 (RCF1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xi. rsl051266(SEQ ID NO. 17的位置27,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白 (RCF1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xii. rs8007267 (SEQ ID NO. 18 的位置 27,其中 SEQ ID NO. 18 是 GTP 环水解酶 1 (GCH1) 的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xiii. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶 A(PCYTIA)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20 的位置 27,其中 SEQ ID NO. 20 是多巴胺受体 D2 (DRD2)的基 因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 21是 多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 22 是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs4633(SEQ ID NO. 23的位置27,其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶 (C0MT)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xviii. rs4680(SEQ ID N0. 24的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 24是 儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xix. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传 递介质转运的多巴胺)成员3(SLC6A3)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因 型; XX. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27,其中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨 酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型;和 xxi. rs2236225 (SEQ ID N0. 27的位置27,其中SEQ ID N0. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶 (NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xxii. 肥胖指标(例如,BMI值); xxiii. SAM和SAH的表达水平; xxiv. 4-HNE的表达水平; xxv. hsCRP的表达水平;及其任何组合; (b)任选地利用非人机器从所述至少两种生物标志物的参数检测选自以下的至少一种 状况的存在: i. SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的位置27上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧 啶"T"等位基因; ii. rs2274976(SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID N0. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含 至少一个丙氨酸"A"等位基因; iii. SEQ ID N0. 2的位置2756或SEQ ID N0. 9的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟 嘌呤"G"等位基因; iv. SEQ ID N0. 3的位置66或SEQ ID N0. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌 呤"G"等位基因; v. rsl006737(SEQ ID N0. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; vii. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; viii. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; X. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xi. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xii. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; xiii. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xvii. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; xviii. rs4680 (SEQ ID NO. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; xix. rs250682 (SEQ ID NO. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; XX. rs2277820 (SEQ ID NO. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; xxi. rs2236225 (SEQ ID NO. 27的位置1958)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等 位基因; xxii. 肥胖症(例如,由至少30kg/m2或更高的BMI值定义); xxiii. 比预定参照比例低的SAM与SAH的表达水平比例; xxiv. 比预定参照值高的4-HNE的表达水平; XXV.如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达;及其任何组合,并且 并且如果检测到所述状况,那么选择和任选地施用包含有效量的含叶酸化合物的治疗 方案。
7.前述权利要求任一项的测定法,其中如果在血浆样品中测定,那么预定参照比例是 约 2· 8。
8. 前述权利要求任一项的测定法,其中如果在血浆样品中测定,那么预定参照比例是 约 3. 0。
9. 前述权利要求任一项的测定法,其中如果在血浆样品中测定,那么预定参照值是约 3. Omg/升血楽。
10. 前述权利要求任一项的测定法,其中如在血浆样品中测定,那么预定参照值是约 3. 2mg/升血楽。
11. 前述权利要求任一项的测定法,其中分析所述测试样品以确定状况中的至少两种。
12. 前述权利要求任一项的测定法,其中分析所述测试样品以确定状况中的至少三种。
13. 前述权利要求任一项的测定法,其中所述测试样品包含血液样品。
14. 前述权利要求任一项的测定法,其中所述测试样品包含尿样品。
15. 前述权利要求任一项的测定法,其中所述测试样品包含口腔样品。
16. 前述权利要求任一项的测定法,其中所述测试样品包含唾液样品。
17. 前述权利要求任一项的测定法,其中所述基因分型包括利用SNPs任一个侧翼的一 组引物扩增测试样品的步骤。
18. 权利要求17的测定法,其中扩增SNPs中的至少两个的至少两组引物用于多路扩增 测定中。
19. 前述权利要求任一项的测定法,其中所述测试样品包含蛋白质样品,并且对包含蛋 白质样品的该测试样品进行至少一种分析,所述分析选自western印迹、酶联免疫吸附测 定、质谱法、免疫测定法、流式细胞术、免疫组织化学分析,及其任何组合。
20. 前述权利要求任一项的测定法,其中所述治疗方案进一步包括选择和任选地施用 抗抑郁药。
21. 权利要求20的测定法,其中所述抗抑郁药包含选择性5羟色胺再吸收抑制剂。
22. 前述权利要求任一项的测定法,其中所述抑郁症是严重的抑郁性障碍。
23. 用于治疗患有抑郁症的人受试者的方法,其包括向人受试者施用包含有效量的含 叶酸化合物的组合物的方法,所述人受试者被诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险,并进一 步被确定携带以下单核苷酸多态性(SNPs)中的至少一个或其组合: i. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的 位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是 亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分;和 ii. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分。
24. 用于治疗患有抑郁症的人受试者的方法,其包括 a.确定受试者的生物样品中至少两个基因座的基因型,所述受试者被诊断患有抑郁症 或具有抑郁症风险,其中所述至少两个基因座是: i. SNP677,其中所述SNP677是SEQ IDN0. 1的位置677或SEQ IDN0. 7的位置27(通过 rsl801133鉴定),其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶 (MTHFR)的基因组核酸序列的一部分;和 ii. SNP2756,其中所述 SNP2756 是 SEQ ID NO. 2 的位置 2756 或 SEQ ID NO. 9 的位置 27(通 过rsl805087鉴定),其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的 基因组核酸序列的一部分;和 b.如果检测到以下状况中的至少一种,那么向所述受试者施用包含组合物的治疗方 案,所述组合物包含有效量的含叶酸化合物: i. SNP677上的至少一个胸腺嘧啶"T" ; ii. SNP2756上的至少一个鸟嘌呤"G" ; iii. SNP677上的至少一个胸腺嘧啶"T"和SNP2756上的至少一个鸟嘌呤"G"。
25. 改善向人受试者施用的抗抑郁药的有效性的方法,如果所述人受试者被确定携带 以下单核苷酸多态性(SNPs)中的任何一个或其组合,那么所述方法包括向该人受试者施 用包含有效量的含叶酸化合物的组合物与抗抑郁药的组合: i. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的 位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是 亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分;和 ii. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分。
26. 前述权利要求任一项的方法,其中所述受试者被进一步确定携带以下状况中的任 何一种或其任何组合: i. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含至 少一个丙氨酸"A"等位基因; ii. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位 置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; iii. rsl006737(SEQ ID NO. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 11是钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序 列的一部分; iv. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"Α"等位基 因,其中SEQ ID NO. 12是DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的 一部分; V. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"Τ"等位基 因,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部 分; vi. rsl2659 (SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; vii. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列 的一部分; viii. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; ix. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; X. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 18是GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A (PCYT1A)的基因组核酸序列的一部分; xii. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rsl079596(SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因,其中SEQ ID NO. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rs4633(SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因, 其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因, 其中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的 基因组核酸序列的一部分; xviii. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因,其中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部 分; xix. rs2236225 (SEQ ID N0. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID N0. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸 序列的一部分; XX.肥胖症(例如,由至少30kg/m2或更高的BMI值定义); xxi. 比预定比例低的SAM与SAH的表达比例; xxii. 比预定标准高的4-HNE的表达;和 xxiii. 如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达。
27.用于治疗患有抑郁症的人受试者的方法,其包括向所述人受试者施用包含有效量 的含叶酸化合物的组合物,所述人受试者被诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险,并进一步 被确定携带以下状况中的至少一种或其任何组合: i. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的 位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是 亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; ii. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID N0. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含至 少一个丙氨酸"A"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID N0. 8各自独立地是是亚甲基四氢 叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; iii. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分; iv. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤 "G"等位基因,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; v. rsl006737(SEQ IDN0. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基因, 其中SEQ IDN0. 11是钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的 一部分; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"Α"等位基 因,其中SEQ ID NO. 12是DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的 一部分; vii. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"Τ"等位 基因,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一 部分; viii. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列 的一部分; x. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xii. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 18是GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A(PCYTIA)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xviii. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xix. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID NO. 25是溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的 基因组核酸序列的一部分; XX. rs2277820 (SEQ ID NO. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部 分;和 xxi. rs2236225 (SEQ ID NO. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸 序列的一部分; xxii. 肥胖症(例如,由至少30kg/m2或更高的BMI值定义); xxiii. 比预定比例低的SAM与SAH的表达比例; xxiv. 比预定标准高的4-HNE的表达;和 xxv. 如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达。
28.用于在人受试者中治疗抑郁症的方法,其包括检测来自所述人受试者的生物样品 中以下状况中的至少一种,并且如果存在其任何一种,那么向该人受试者施用包含有效量 含叶酸化合物的治疗方案,其中所述状况中的至少一种选自以下: i. SEQIDNO. 1 的位置 677 或 SEQIDN0. 7 的位置 27(通过 rsl801133 鉴定)上的 SNP, 其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因; ii. rs2274976(SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含 至少一个丙氨酸"A"等位基因; iii. SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟 嘌呤"G"等位基因; iv. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌 呤"G"等位基因; v. rsl006737(SEQ ID NO. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; vii. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; viii. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; X. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xi. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xii. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; xiii. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xvii. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; xviii. rs4680 (SEQ ID NO. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; xix. rs250682 (SEQ ID NO. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; XX. rs2277820 (SEQ ID NO. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; xxi. rs2236225 (SEQ ID NO. 27的位置1958)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等 位基因; xxii. 肥胖症(例如,由至少30kg/m2或更高的BMI值定义); xxiii. 比预定参照比例低的SAM与SAH的表达水平比例; xxiv. 比预定参照值高的4-HNE的表达水平; XXV.如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达;及其任何组合。
29. 前述权利要求任一项的方法,其中所述受试者被进一步确定携带所述状况中的任 何两种或更多种。
30. 前述权利要求任一项的方法,其中含叶酸化合物的有效量在约0. 1-约lmg/kg体重 /天的范围内。
31. 前述权利要求任一项的方法,其中含叶酸化合物的有效量是约7. 5mg/天-约 50mg/ 天。
32. 前述权利要求任一项的方法,其中含叶酸化合物的有效量是约15mg/天。
33. 前述权利要求任一项的方法,其中含叶酸化合物的有效量作为单次日剂量施用。
34. 前述权利要求任一项的方法,其中含叶酸化合物的有效量以每天多于一次分份剂 量施用。
35. 前述权利要求任一项的方法,其中所述施用是口腔施用。
36. 前述权利要求任一项的方法,其中配制所述组合物以在施用所述组合物后至少约 3-6小时期间内释放至少一部分含叶酸化合物,其中所述释放任选地地是稳定状态的释放。
37. 前述权利要求任一项的方法,其进一步包括选择和任选地施用与含叶酸化合物组 合的抗抑郁药。
38. 权利要求37的方法,其中所述抗抑郁药包含选择性5羟色胺再吸收抑制剂。
39. 权利要求38的方法,其中所述选择性5羟色胺再吸收抑制剂选自氟西汀、西酞普 兰、氟苯哌苯醚、依他普仑、舍曲林,及其任何组合。
40. 前述权利要求任一项的方法,其中被诊断患有抑郁症的所述受试者对至少一种抗 抑郁剂单一疗法具有抵抗力。
41. 前述权利要求任一项的方法,其中所述抑郁症是严重的抑郁性障碍。
42. 前述权利要求任一项的方法,其中所述测试样品包含口腔样品。
43. 前述权利要求任一项的方法,其中所述测试样品包含唾液样品。
44. 前述权利要求任一项的方法,其中所述测试样品包含血液样品。
45. 前述权利要求任一项的方法,其中所述测试样品包含尿样品。
46. 用于从获得自至少一个受试者的至少一种测试样品中获得数据的计算机系统,所 述系统包含: (a) 被配置用于接收所述至少一种测试样品并在所述至少一种测试样品上进行至少一 种分析以确定以下状况中的至少一种或其任何组合存在或缺失的至少一个测定模块: i. 比预定参照比例低的s-腺苷甲硫氨酸(SAM)与s-腺苷高半胱氨酸(SAH)的表达比 例; ii. 比预定参照值高的4-羟基壬烯醛(4HNE)的表达; iii. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7 的位置27 (通过rsl801133鉴定)上的单核苷酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; iv. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分;和 v. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置 27上的SNP,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; (b) 被配置用于存储从所述测定模块输出的数据的至少一个存储设备;和 (d)用于显示部分基于从所述测定模块输出的数据的内容的至少一个显示模块,其中 所述内容包含表明这些状况中至少一种存在,和任选地表明这些状况中任何一种缺失的信 号,或表明这些状况全部缺失的信号。
47. 权利要求46的计算机系统,其中配置所述测定模块以分析所述至少一种测试样品 来确定所述状况中至少两种存在或缺失。
48. 权利要求46或47的计算机系统,其中所述测定模块进一步包含适合于比较从所述 测定模块输出的所述数据与所述存储设备上存储的参照数据的比较模块。
49. 用于从获得自至少一个受试者的至少一种测试样品中获得数据的计算机系统,所 述系统包含: (a)被配置用于接收所述至少一种测试样品并在所述至少一种测试样品上进行至少一 种基因分型分析以确定至少两个基因座的基因型的测定模块,其中所述至少两个基因座包 含: (i)SEQ IDN0. 1 的位置 677 或 SEQ IDN0. 7 的位置 27(通过 rsl801133 鉴定),其中 SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的 一部分; (ii) SEQ ID NO. 2 的位置 2756 或 SEQ ID NO. 9 的位置 27 (通过 rsl805087 鉴定),其中 SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基因组核酸序列的一部分; 和 (iii) 任选地,SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27 (通过rsl801394鉴 定),其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR)的基因 组核酸序列的一部分; (b) 被配置用于存储来自所述测定模块的输出数据的存储设备; (c) 计算模块,其包含特定编程的指令以从所述输出数据确定来自以下的至少一种单 核苷酸多态性(SNP)的存在: i. SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位置27上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧 啶"T"等位基因; ii. SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌 呤"G"等位基因;和 iii. 任选地,SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少 一个鸟嘌呤"G"等位基因; (d) 用于显示部分基于从所述计算模块输出的数据的内容的显示模块,其中所述内容 包含表明这些SNPs中至少一种存在,和任选地表明这些SNPs中任何一种缺失的信号,或表 明这些SNPs全部缺失的信号。
50.前述权利要求任一项的计算机系统,其中所述测定模块被进一步确定以下生物标 志物中至少一种或其任何组合的参数: i. rs2274976(SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上 SNP 基因座的基 因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基 因组核酸序列的一部分; ii. rsl006737(SEQ IDN0. 11的位置27,其中SEQ IDN0. 11是钙通道、电压依赖型、L型、 a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; iii. rsl883729(SEQ IDN0. 12 的位置 27,其中 SEQ IDN0. 12 是 DNA(胞嘧啶-5)-甲基 转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; iv. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节 蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; V. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2) 的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; vi. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异 的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; vii. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白 (RCF1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; viii. rsl051266(SEQ ID NO. 17的位置27,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白 (RCF1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; ix. rs8007267 (SEQ ID NO. 18 的位置 27,其中 SEQ ID NO. 18 是 GTP 环水解酶 1 (GCH1)的 基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; X. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶 A(PCYTIA)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xi. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2 (DRD2)的基因 组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xii. rsl079596(SEQ IDN0. 21的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ IDN0. 21是 多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rsll240594(SEQ ID NO. 22 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 22 是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rs4633(SEQ ID NO. 23的位置27,其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶 (C0MT)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; XV. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 24是儿 茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传 递介质转运的多巴胺)成员3(SLC6A3)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因 型; xvii. rs2277820(SEQ IDN0. 26的位置27,其中SEQ IDN0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱 氨酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型;和 xviii. rs2236225(SEQ IDN0. 27的位置27,其中SEQ IDN0. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢 酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xix. 肥胖指标(例如,BMI值); XX. SAM和SAH的表达水平; xxi. 4-HNE的表达水平; xxii. hsCRP的表达水平。
51.权利要求50的计算机系统,其中所述计算模块进一步适合于确定以下状况中至少 一种或其任何组合的存在: i. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID N0. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含至 少一个丙氨酸"A"等位基因; ii. rsl006737(SEQ ID N0. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; iii. rsl883729(SEQ ID N0. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; iv. rs7163862 (SEQ ID N0. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; V. rsl2659 (SEQ ID N0. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; vi. rs202676 (SEQ ID N0. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; vii. rs2297291 (SEQ ID N0. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; viii. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; ix. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; X. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xi. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; xii. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; xiii. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等 位基因; xiv. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因; XV. rs4680 (SEQ ID NO. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因; xvi. rs250682 (SEQ ID NO. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; xvii. rs2277820 (SEQ ID NO. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; xviii. rs2236225 (SEQ ID NO. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等 位基因; xix. 肥胖症(例如,由至少30kg/m2或更高的BMI值定义); XX.比预定参照比例低的SAM与SAH的表达水平比例; xxi. 比预定参照值高的4-HNE的表达水平; xxii. 如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达。
52.从获得自至少一个受试者的至少一种测试样品中获得数据的计算机系统,所述系 统包含: (a)被配置用于接收所述至少一种测试样品并在所述至少一种测试样品上进行至少一 种分析以确定至少两种生物标志物的参数的测定模块,其中所述至少两种生物标志物的参 数选自以下: i. SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位置27 (通过rsl801133鉴定)上单核苷 酸多态性(SNP)基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是亚甲基四 氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; ii. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上 SNP 基因座的基 因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基 因组核酸序列的一部分; iii. SEQ ID NO. 2 的位置 2756 或 SEQ ID NO. 9 的位置 27 (通过 rsl805087 鉴定)上 SNP 基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分; iv. SEQ ID NO. 3 的位置 66 或 SEQ ID NO. 10 的位置 27 (通过 rsl801394 鉴定)上 SNP 基 因座的基因型,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; v. rsl006737(SEQ ID NO. 11的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 11是 钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部分; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 12是 DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的一部分; vii. rs7163862(SEQ IDN0. 13的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ IDN0. 13是 GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分; viii. rsl2659(SEQ IDN0. 14的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ IDN0. 14是 还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; ix. rs202676(SEQ ID NO. 15的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 15是 叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)(F0LH1)的基因组核酸序列的一部分; X. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 16是 还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 17是 还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xii. rs8007267(SEQ ID NO. 18的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 18是 GTP环水解酶1(GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rs7639752(SEQ ID NO. 19 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 19 是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A (PCYT1A)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 20是多 巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 21是 多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 22 是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs4633(SEQ ID NO. 23的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 23是 儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xviii. rs4680(SEQ ID N0. 24的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 24是 儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xix. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 25是 溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的基因组核酸序列的一部 分; XX. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 26是 亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部分; xxi. rs2236225(SEQ ID N0. 27的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 27是 亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1(MTHFD1)的基因组核酸序列的一部分; xxii. SAM和SAH的表达; xxiii. 4-HNE 的表达; xxiv. hsCRP的表达;及其任何组合; (b) 被配置用于存储来自所述测定模块的输出数据的存储设备; (c) 计算模块,其包含特定编程的指令以从所述输出数据确定来自以下的至少一种状 况的存在: i. SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位置27上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧 啶"T"等位基因; ii. rs2274976(SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含 至少一个丙氨酸"A"等位基因; iii. SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟 嘌呤"G"等位基因; iv. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌 呤"G"等位基因; v. rsl006737(SEQ ID NO. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; vii. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; viii. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; X. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xi. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xii. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; xiii. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xvii. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; xviii. rs4680 (SEQ ID NO. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; xix. rs250682 (SEQ ID NO. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; XX. rs2277820 (SEQ ID NO. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因;和 xxi. rs2236225(SEQ ID NO. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xxii. 比预定参照比例低的SAM与SAH的表达比例; xxiii. 比预定参照值高的4-HNE的表达; xxiv. 如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达;及其任何组合。 (d)用于显示部分基于从所述计算模块输出的数据的内容的显示模块,其中所述内容 包含表明所述状况中至少一种存在,和任选地表明所述状况中任何一种缺失的信号,或表 明所述状况全部缺失的信号。
53. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中如在血浆样品中测定,所述预定参照比例 是约3. 0。
54. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中如在血浆样品中测定,所述预定参照比例 是约2. 8。
55. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中如在血浆样品中测定,所述预定参照值 是约3. Omg/升。
56. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中如在血浆样品中测定,所述预定参照值是 约 3. 2mg/ 升。
57. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中配置所述测定模块以确定至少三种生物 标志物或更多种生物标志物的参数。
58. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中配置所述计算模块以确定至少两种状况 或更多种状况的存在。
59. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中所述计算模块进一步包含适合于比较来 自所述测定模块的所述输出数据与所述存储设备上存储的参照数据的比较模块。
60. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中进一步配置所述存储设备以存储所述至 少一个受试者的物理信息。
61. 权利要求60的计算机系统,其中所述物理信息包含所述至少一个受试者的肥胖指 标(例如,BMI)。
62. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中所述显示模块上显示的内容进一步包含 肥胖指标(例如,BMI值)或表明所述受试者是否肥胖的信号(例如,通过BMI值定义的是 否是至少30kg/m2)。
63. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中所述显示模块上显示的内容进一步包含 表明受试者被推荐接受包含含叶酸化合物的治疗方案的信号,或表明受试者被推荐接受没 有含叶酸化合物的备选治疗方案的信号。
64. 前述权利要求任一项的计算机系统,其中所述抑郁症是严重的抑郁性障碍。
65. 计算机可读介质,其上记录计算机可读指令以限定软件模块在计算机上执行方法, 所述计算机可读存储介质包含: (a) 用于比较存储设备上存储的数据与参照数据以提供比较结果的指令,其中所述比 较鉴定了以下状况中至少一种或其任何组合的存在或缺失: i. 比预定参照比例低的s-腺苷甲硫氨酸(SAM)与s-腺苷高半胱氨酸(SAH)的表达比 例; ii. 比预定参照值高的4-羟基壬烯醛(4HNE)的表达; iii. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7 的位置27 (通过rsl801133鉴定)上的单核苷酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; iv. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分;和 v. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置 27上的SNP,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; (b) 用于显示部分基于从所述测定模块输出的数据的内容的指令,其中所述内容包含 表明所述状况中至少一种存在,和任选地表明所述状况中任何一种缺失的信号,或表明所 述状况全部缺失的信号。
66. 计算机可读介质,其上记录计算机可读指令以限定软件模块在计算机上执行方法, 所述计算机可读存储介质包含: (a) 用于比较存储设备上存储的数据与参照数据以提供比较结果的指令,其中所述比 较鉴定了以下状况中至少一种的存在或缺失: i. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位 置27 (通过rsl801133鉴定)上的单核苷酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7 各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; ii. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分;和 (b) 用于显示部分基于从所述测定模块输出的数据的内容的指令,其中所述内容包含 表明所述状况中至少一种存在,和任选地表明所述状况中任何一种缺失的信号,或表明所 述状况全部缺失的信号。
67. 前述权利要求任一项的计算机可读介质,其进一步包含指令以鉴定以下状况中至 少一种或其任何组合的存在或缺失: i. rs2274976(SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含至 少一个丙氨酸"A"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是亚甲基四氢叶 酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; ii. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤 "G"等位基因,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; iii. rsl006737(SEQ ID NO. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 11是钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序 列的一部分; iv. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"Α"等位基 因,其中SEQ ID NO. 12是DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的 一部分; V. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"Τ"等位基 因,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部 分; vi. rsl2659 (SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; vii. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)(F0LH1)的基因组核酸序列的 一部分; viii. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; ix. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; X. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 18是GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A (PCYT1A)的基因组核酸序列的一部分; xii. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rsl079596(SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因,其中SEQ ID NO. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rs4633(SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因, 其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因, 其中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的 基因组核酸序列的一部分; xviii. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因,其中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部 分;和 xix. rs2236225 (SEQ ID NO. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸 序列的一部分; XX.肥胖症(例如,由至少30kg/m2或更高的BMI值定义); xxi. 比预定比例低的SAM与SAH的表达比例; xxii. 比预定标准高的4-HNE的表达;和 xxiii. 如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达。
68.计算机可读介质,其上记录计算机可读指令以限定软件模块在计算机上执行方法, 所述计算机可读存储介质包含: (a)用于比较存储设备上存储的数据与参照数据以提供比较结果的指令,其中所述比 较鉴定了以下状况中至少一种的存在或缺失: i. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的 位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是 亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; ii. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含至 少一个丙氨酸"A"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是是亚甲基四氢 叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; iii. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分; iv. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤 "G"等位基因,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; v. rsl006737(SEQ IDN0. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基因, 其中SEQ ID NO. 11是钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的 一部分; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"Α"等位基 因,其中SEQ ID NO. 12是DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的 一部分; vii. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"Τ"等位 基因,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一 部分; viii. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列 的一部分; x. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xii. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 18是GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A (PCYT1A)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xviii. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xix. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的 基因组核酸序列的一部分; XX. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FT⑶)的基因组核酸序列的一部 分;和 xxi. rs2236225 (SEQ ID N0. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID N0. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸 序列的一部分; xxii. 肥胖症(例如,由至少30kg/m2或更高的BMI值定义); xxiii. 比预定比例低的SAM与SAH的表达比例; xxiv. 比预定标准高的4-HNE的表达;和 xxv. 如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达;及其任何组合;并且 (b)用于显示部分基于从所述测定模块输出的数据的内容的指令,其中所述内容包含 表明所述状况中至少一种存在,和任选地表明所述状况中任何一种缺失的信号,或表明所 述状况全部缺失的信号。
69. 权利要求68的计算机可读介质,其进一步包含指令以显示表明受试者被推荐接受 包含含叶酸化合物的治疗方案的信号,或表明受试者被推荐接受没有含叶酸化合物的备选 治疗方案的信号。
70. 前述权利要求任一项的计算机可读介质,其中所述抑郁症是严重的抑郁性障碍。
71. 试剂盒,其包括: 附着有多个寡核苷酸探针的寡核苷酸阵列,所述寡核苷酸探针检测不多于30个单核 苷酸多态性(SNPs),其中所述SNPs包含以下SNPs中的至少两种或其任何组合: i. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的 位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是 亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; ii. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含至 少一个丙氨酸"A"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是是亚甲基四氢 叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; iii. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分; iv. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤 "G"等位基因,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; v. rsl006737(SEQ IDN0. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基因, 其中SEQ ID NO. 11是钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的 一部分; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"Α"等位基 因,其中SEQ ID NO. 12是DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的 一部分; vii. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"Τ"等位 基因,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一 部分; viii. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列 的一部分; x. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xii. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 18是GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A(PCYTIA)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xviii. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xix. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的 基因组核酸序列的一部分; XX. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FT⑶)的基因组核酸序列的一部 分;和 xxi. rs2236225 (SEQ ID N0. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID N0. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸 序列的一部分;和 含有待缀合到来自受试者的测试样品的核苷酸分子上的可检测标签的任选容器;和 至少一种试剂。
72. 试剂盒,其包括: 附着有多个寡核苷酸探针的寡核苷酸阵列,所述寡核苷酸探针检测不多于5个单核苷 酸多态性(SNPs),所述SNPs包含: ⑴SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的位置27 (通过rsl801133鉴定)上的SNP, 其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID N0. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核 酸序列的一部分; (ii) SEQ ID N0. 2的位置2756或SEQ ID N0. 9的位置27 (通过rsl805087鉴定)上的 SNP,其中SEQ ID N0. 2与SEQ ID N0. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基因组核酸序列 的一部分; 含有待缀合到来自受试者的测试样品的核苷酸分子上的可检测标签的任选容器;和 至少一种试剂。
73. 权利要求71或72的试剂盒,其中所述至少一种试剂选自限制性内切核酸酶、待缀 合到核酸分子上的通用衔接头、与通用衔接头互补的引物、洗涤剂,及其任何组合。
74. 权利要求71-73任一项的试剂盒,其中所述可检测标签包含荧光分子。
75. 试剂盒,其包括: 结合不多于30个单核苷酸多态性(SNPs)的至少一个等位基因的多个寡核苷酸引物, 其中结合SNP的具体等位基因的寡核苷酸引物的每一亚组标记有不同的报告基因,并且其 中所述SNPs包含以下SNPs中的至少两种或其任何组合: i. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的位 置27 (通过rsl801133鉴定)上的单核苷酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7 各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; ii. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID N0. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含至 少一个丙氨酸"A"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID N0. 8各自独立地是是亚甲基四氢 叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; iii. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分; iv. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤 "G"等位基因,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; v. rsl006737(SEQ IDN0. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基因, 其中SEQ IDN0. 11是钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的 一部分; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"Α"等位基 因,其中SEQ ID NO. 12是DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的 一部分; vii. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"Τ"等位 基因,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一 部分; viii. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列 的一部分; x. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xii. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 18是GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A(PCYTIA)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xviii. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xix. rs250682 (SEQ ID NO. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID NO. 25是溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的 基因组核酸序列的一部分; XX. rs2277820 (SEQ ID NO. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID NO. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FT⑶)的基因组核酸序列的一部 分;和 xxi. rs2236225 (SEQ ID NO. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸 序列的一部分;和 至少一种试剂。
76. 试剂盒,其包括: 结合不多于5个单核苷酸多态性(SNPs)的至少一个等位基因的多个寡核苷酸引物,其 中结合SNP的具体等位基因的寡核苷酸引物的每一亚组标记有不同的报告基因,并且其中 所述SNPs包含以下SNPs : (i) 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的 位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是 亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; (ii) 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分;和 至少一种试剂。
77. 权利要求75-76的试剂盒,其中所述至少一种试剂包含游离的核苷酸碱基、聚合 酶、或两者。
78. 用于为患有抑郁症的受试者选择治疗方案的试剂盒,其包含: 用于在诊断患有抑郁症或具有抑郁症风险的人受试者的测试样品中确定以下SNPs存 在或缺失的至少一种试剂: i. 包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因的SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位 置27 (通过rsl801133鉴定)上的单核苷酸多态性(SNP),其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7 各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分;和 ii. 包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因的SEQ ID NO. 2的位置2756或SEQ ID NO. 9的 位置27上的SNP,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分;和 用于权利要求1_69任一项的测定、权利要求70-129任一项的方法、或权利要求 130-171任一项的系统、或其任何组合中的指令。
79. 权利要求78的试剂盒,其中所述SNPs进一步包含以下中的一个或任何组合: i. rs2274976(SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含至 少一个丙氨酸"A"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是是亚甲基四氢 叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; ii. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤 "G"等位基因,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; iii. rsl006737(SEQ ID NO. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 11是钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序 列的一部分; iv. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"Α"等位基 因,其中SEQ ID NO. 12是DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的 一部分; V. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"Τ"等位基 因,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部 分; vi. rsl2659 (SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; vii. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列 的一部分; viii. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; ix. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; X. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 18是GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A (PCYT1A)的基因组核酸序列的一部分; xii. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rsl079596(SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因,其中SEQ ID NO. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID NO. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rs4633(SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因, 其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因, 其中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的 基因组核酸序列的一部分; xviii. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因,其中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部 分;和 xix. rs2236225 (SEQ ID NO. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸 序列的一部分。
80. 前述权利要求任一项的试剂盒,其进一步包含附着有至少一个基于蛋白质的结合 部分的固体基质支持物,所述结合部分特异性地结合选自SAM、SAH、4-HNE和hsCRP的生物 标志物。
81. 权利要求80的试剂盒,其中所述基于蛋白质的结合部分包含抗体。
82. 权利要求80或81的试剂盒,其中所述固体基质支持物是用于ELISA的微量滴定 板。
83. 权利要求80或81的试剂盒,其中所述固体基质支持物是浸渍片。
84. 权利要求80或81的试剂盒,其中所述固体基质支持物包含磁珠。
85. 前述权利要求任一项的试剂盒,其进一步包含设计用于探测选自SAM、SAH、4-HNE 和hsCRP的生物标志物的至少一个引物。
86. 前述权利要求任一项的试剂盒,其中所述抑郁症是严重的抑郁性障碍。
87. 用于为患有抑郁症的人受试者选择治疗方案的方法,其包括: a. 从诊断患有抑郁症的人受试者中获得测试样品; b. 对所述测试样品进行至少一种分析以确定至少两种生物标志物的参数,其中所述至 少两种生物标志物的参数选自以下: i. SEQ IDN0. 1的位置677或SEQ IDN0. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上SNP基因 座的基因型,其中SEQ IDN0. 1与SEQ IDN0. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR) 的基因组核酸序列的一部分; ii. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上 SNP 基因座的基 因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基 因组核酸序列的一部分; iii. SEQ ID NO. 2 的位置 2756 或 SEQ ID NO. 9 的位置 27 (通过 rsl805087 鉴定)上 SNP 基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分; iv. SEQ ID NO. 3 的位置 66 或 SEQ ID NO. 10 的位置 27 (通过 rsl801394 鉴定)上 SNP 基 因座的基因型,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; v. rsl006737(SEQ ID NO. 11的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 11是 钙通道、电压依赖型、L型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部分; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 12是 DNA(胞嘧啶-5)-甲基转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的一部分; vii. rs7163862(SEQ ID NO. 13的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 13是 GTP环水解酶1反馈调节蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分; viii. rsl2659(SEQ IDN0. 14的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ IDN0. 14是 还原性叶酸载体蛋白(RCF2)的基因组核酸序列的一部分; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 15是 叶酸水解酶(前列腺特异的膜抗原)(F0LH1)的基因组核酸序列的一部分; X. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 16是 还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; xi. rsl051266(SEQ ID NO. 17的位置27,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白 (RCF1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xii. rs8007267(SEQ IDN0. 18的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ IDN0. 18是 GTP环水解酶1 (GCH1)的基因组核酸序列的一部分; xiii. rs7639752(SEQ IDN0. 19 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ IDN0. 19 是磷酸胆碱胞苷酰转移酶A (PCYT1A)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 20是多 巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 21是 多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 22 是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs4633(SEQ ID NO. 23的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 23是 儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xviii. rs4680(SEQ ID N0. 24的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 24是 儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xix. rs250682 (SEQ ID N0. 250的位置27,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传 递介质转运的多巴胺)成员3(SLC6A3)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因 型; XX. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 26是 亚胺甲基转移酶环化脱氨酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部分; xxi. rs2236225 (SEQ ID N0. 27 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID N0. 27 是亚甲基四氢叶酸脱氢酶(NADP+依赖的)1(MTHFD1)的基因组核酸序列的一部分; xxii. SAM和SAH的表达; xxiii. 4-HNE 的表达; xxiv. hsCRP的表达;及其任何组合;和 (c)从所述至少两种生物标志物的参数确定选自以下的至少一种状况的存在: i. SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的位置27上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧 啶"T"等位基因; ii. rs2274976(SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID N0. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含 至少一个丙氨酸"A"等位基因; iii. SEQ ID N0. 2的位置2756或SEQ ID N0. 9的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟 嘌呤"G"等位基因; iv. SEQ ID N0. 3的位置66或SEQ ID N0. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌 呤"G"等位基因; v. rsl006737(SEQ ID NO. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; vi. rsl883729 (SEQ ID NO. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; vii. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; viii. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; ix. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; X. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xi. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xii. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; xiii. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xiv. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; XV. rsl079596 (SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; xvi. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xvii. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; xviii. rs4680 (SEQ ID NO. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; xix. rs250682 (SEQ ID NO. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; XX. rs2277820 (SEQ ID NO. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因;和 xxi. rs2236225(SEQ ID NO. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; xxii. 比预定参照比例低的SAM与SAH的表达比例; xxiii. 比预定参照值高的4-HNE的表达; xxiv. 如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达;及其任何组合; d.提供结果输出,其阐明是否从所述测试样品中检测到所述状况中的至少一种,并且 如果检测到所述至少一种状况,那么为人受试者选择和任选地施用包含有效量的含叶酸化 合物的治疗方案。
88. 用于为患有抑郁症的受试者选择治疗方案的方法,其包括: a. 从诊断患有抑郁症的人受试者中获得测试样品; b. 对所述测试样品进行至少一种分析以确定至少两种生物标志物的参数,其中所述至 少两种生物标志物的参数包含以下: i. SEQ IDNO. 1的位置677或SEQ IDNO. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上SNP基因 座的基因型,其中SEQ IDNO. 1与SEQ IDNO. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR) 的基因组核酸序列的一部分; ii. SEQ ID NO. 2 的位置 2756 或 SEQ ID NO. 9 的位置 27 (通过 rsl805087 鉴定)上 SNP 基因座的基因型,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基 因组核酸序列的一部分; c. 从所述至少两种生物标志物的确定参数确定以下中的至少一种状况或其组合的存 在: i. SEQ ID NO. 1的位置677上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因; ii. SEQ ID NO. 2的位置2756上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因; d. 提供结果输出,其阐明是否从所述测试样品中检测到所述状况中的至少一种,并且 如果检测到所述至少一种状况或两种,那么为人受试者选择和任选地施用包含有效量的含 叶酸化合物的治疗方案。
89. 权利要求88的方法,其中使所述测试样品进一步确定以下生物标志物中至少一种 或其任何组合的参数: i. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上 SNP 基因座的基 因型,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基 因组核酸序列的一部分; ii. SEQ IDNO. 3 的位置 66 或 SEQ IDNO. 10 的位置 27(通过 rsl801394 鉴定)上 SNP 基 因座的基因型,其中SEQ IDNO. 3与SEQ IDNO. 10各自独立地是甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR) 的基因组核酸序列的一部分; iii. rsl006737(SEQ IDNO. 11的位置27),其中SEQ IDNO. 11是钙通道、电压依赖型、L 型、a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; iv. rsl883729(SEQ IDNO. 12 的位置 27),其中 SEQ IDNO. 12 是 DNA(胞嘧啶-5)-甲基 转移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; ν. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27),其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节 蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; vi. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27),其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白 (RCF2)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; vii. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27),其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特 异的膜抗原)1 (F0LH1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; viii. rs2297291 (SEQ IDNO. 16的位置27),其中SEQ IDNO. 16是还原性叶酸载体蛋白 (RCF1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; ix. rsl051266(SEQ ID NO. 17的位置27),其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白 (RCF1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; X. rs8007267 (SEQ ID NO. 18 的位置 27),其中 SEQ ID NO. 18 是 GTP 环水解酶 1 (GCH1)的 基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xi. rs7639752(SEQ ID NO. 19的位置27),其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶 A(PCYTIA)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xii. rs6275(SEQ ID NO. 20 的位置 27),其中 SEQ ID NO. 20 是多巴胺受体D2(DRD2)的基 因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xiii. rsl079596(SEQ ID NO. 21 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 21 是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xiv. rsll240594(SEQ ID NO. 22 的位置 27)上 SNP 基因座的基因型,其中 SEQ ID NO. 22 是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; xv. rs4633(SEQ ID NO. 23的位置27),其中SEQ ID NO. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶 (C0MT)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xvi. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上SNP基因座的基因型,其中SEQ ID N0. 24是儿 茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; xvii. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27),其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经 传递介质转运的多巴胺)成员3 (SLC6A3)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基 因型; xviii. rs2277820(SEQ IDN0. 26的位置27),其中SEQ IDN0. 26是亚胺甲基转移酶环化 脱氨酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; xix. rs2236225 (SEQ ID N0. 27的位置27),其中SEQ ID N0. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶 (NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座的基因型; XX. SAM和SAH的表达; xxi. 4-HNE的表达;和 xxii. hsCRP 的表达。
90.权利要求89的方法,其进一步包括确定以下状况中至少一种或其任何组合的存 在: i. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID N0. 8 的位置 27)上的 SNP,其包含至 少一个丙氨酸"A"等位基因; ii. SEQ ID N0. 3的位置66或SEQ ID N0. 10的位置27上的SNP,其包含至少一个鸟嘌 呤"G"等位基因; iii. rsl006737(SEQ ID N0. 11的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; iv. rsl883729 (SEQ ID N0. 12的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; V. rs7163862 (SEQ ID N0. 13的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; vi. rsl2659 (SEQ ID N0. 14的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; vii. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基 因; viii. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; ix. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; X. rs8007267 (SEQ ID NO. 18的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; xi. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位基 因; xii. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因; xiii. rsl079596(SEQ ID NO. 21的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因; xiv. rsll240594(SEQ ID NO. 22的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; XV. rs4633 (SEQ ID NO. 23的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基因; xvi. rs4680 (SEQ ID NO. 24的位置27)上的SNP,其包含至少一个鸟嘌呤"G"等位基因; xvii. rs250682 (SEQ ID NO. 25的位置27)上的SNP,其包含至少一个胞嘧啶"C"等位基 因; xviii. rs2277820 (SEQ ID NO. 26的位置27)上的SNP,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等 位基因;和 xix. rs2236225(SEQ ID NO. 27的位置27)上的SNP,其包含至少一个丙氨酸"A"等位 基因; XX.比预定参照比例低的SAM与SAH的表达比例; xxi. 比预定参照值高的4-HNE的表达;和 xxii. 如在血楽样品中测定高于约2. 3mg/升血楽的hsCRP的表达。
91. 前述权利要求任一项的方法,其中如在血浆样品中测定,所述预定参照值是约 3. Omg/ 升。
92. 前述权利要求任一项的方法,其中如在血浆样品中测定,所述预定参照值是约 3. 2mg/ 升。
93. 前述权利要求任一项的方法,其中步骤(b)进一步包括任选地包装和运输所述测 试样品至测试设施。
94. 权利要求93的方法,其中所述测试设施是第三方CLIA验证的服务提供商。
95. 前述权利要求任一项的方法,其中通过非人机器进行步骤(d)。
96. 前述权利要求任一项的方法,其进一步包括确定受试者是否肥胖(例如,测定受试 者的BMI值)。
97. 前述权利要求任一项的方法,其中确定前述生物标志物参数中的至少三个。
98. 前述权利要求任一项的方法,其中所述抑郁症是严重的抑郁性障碍。
99. 用于在人受试者中治疗抑郁症的含叶酸组合物,所述人受试者携带以下单核苷酸 多态性中的至少一个或其组合: a. SNP677上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因,其中所述SNP677位于SEQ ID NO. 1的 位置677或SEQ IDN0. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上,其中SEQ IDN0. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分;和 b. SNP2756上的至少一个鸟嘌呤"G"等位基因,其中所述SNP2756位于SEQ ID NO. 2的 位置2756或SEQ ID NO. 9的位置27 (通过rsl805087鉴定)上,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是甲硫氨酸合酶(MTR)的基因组核酸序列的一部分。
100. 用于在人受试者中治疗抑郁症的含叶酸组合物,所述人受试者携带以下状况中的 至少一个或其任何组合: a. SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID NO. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP 基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 7各自独立地 是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; b. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上 SNP 基因座上的 至少一个丙氨酸"A"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是亚甲基四氢 叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; c. SEQ ID NO. 2 的位置 2756 或 SEQ ID NO. 9 的位置 27 (通过 rsl805087 鉴定)上的 SNP 基因座上的至少一个鸟嘌呤"G"等位基因,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是 甲硫氨酸合酶(MTR)的基因组核酸序列的一部分; d. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27 (通过rsl801394鉴定)上的SNP 基因座上的至少一个鸟嘌呤"G"等位基因,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是 甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR)的基因组核酸序列的一部分; e. rsl006737(SEQIDN0. 11的位置27,其中SEQIDN0. 11是钙通道、电压依赖型、L型、 alC亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部分)上的SNP基因座上的至少一个丙氨酸 "A"等位基因; f. rsl883729(SEQ IDN0. 12 的位置 27,其中 SEQ IDN0. 12 是 DNA(胞嘧啶-5)-甲基转 移酶3β (·ΜΤ3Β)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等 位基因; g. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节 蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; h. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2) 的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因; i. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的 膜抗原)1(F0LH1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个鸟嘌呤"G"等 位基因; j. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白 (RCF1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等位基因; k. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; l. rs8007267 (SEQ ID NO. 18 的位置 27,其中 SEQ ID NO. 18 是 GTP 环水解酶 1 (GCH1)的 基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因; m. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶 A(PCYTIA)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等位基因; n. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2 (DRD2)的基因 组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因; 〇. rsl079596(SEQ ID NO. 21的位置27)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID N0. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; p. rsll240594(SEQ ID N0. 22的位置27)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID N0. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; q. rs4633 (SEQ ID N0. 23的位置27,其中SEQ ID N0. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT) 的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胞嘧啶"C"等位基因; r. rs4680 (SEQ ID N0. 24的位置27)上SNP基因座上的至少一个鸟嘌呤"G"等位基因, 其中SEQ ID N0. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; s. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传递 介质转运的多巴胺)成员3(SLC6A3)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少 一个胞嘧啶"C"等位基因; t. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27,其中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨 酶(FTCD)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因;和 u. rs2236225(SEQ ID N0. 27的位置27,其中SEQ ID N0. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶 (NADP+依赖的)1(MTHFD1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个丙氨 酸"A"等位基因; V.肥胖症(例如,由至少30kg/m2或更高的BMI值定义); w.比预定参照比例低的SAM与SAH的表达水平比例; X.比预定参照值高的4-HNE的表达水平;和 y.如在血浆样品中测定高于约2. 3mg/升血浆的hsCRP的表达。
101. 用于在人受试者中治疗抑郁症的与抗抑郁剂组合的含叶酸组合物,所述人受试者 携带以下单核苷酸多态性中的至少一个或其组合: a. SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上的 SNP677,其包含至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因;和 b. SEQ ID N0. 2的位置2756或SEQ ID N0. 9的位置27上的SNP2756,其包含至少一个 鸟嘌呤"G"等位基因。
102. 用于在人受试者中治疗抑郁症的与抗抑郁剂组合的含叶酸组合物,所述人受试者 携带以下状况中的至少一个或其任何组合: a. SEQ ID NO. 1的位置677或SEQ ID N0. 7的位置27(通过rsl801133鉴定)上的SNP 基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID N0. 7各自独立地 是亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; b. rs2274976 (SEQ ID NO. 1 的位置 1793 或 SEQ ID NO. 8 的位置 27)上 SNP 基因座上的 至少一个丙氨酸"A"等位基因,其中SEQ ID NO. 1与SEQ ID NO. 8各自独立地是亚甲基四氢 叶酸还原酶(MTHFR)的基因组核酸序列的一部分; c. SEQ ID NO. 2 的位置 2756 或 SEQ ID NO. 9 的位置 27 (通过 rsl805087 鉴定)上的 SNP 基因座上的至少一个鸟嘌呤"G"等位基因,其中SEQ ID NO. 2与SEQ ID NO. 9各自独立地是 甲硫氨酸合酶(MTR)的基因组核酸序列的一部分; d. SEQ ID NO. 3的位置66或SEQ ID NO. 10的位置27 (通过rsl801394鉴定)上的SNP 基因座上的至少一个鸟嘌呤"G"等位基因,其中SEQ ID NO. 3与SEQ ID NO. 10各自独立地是 甲硫氨酸合酶还原酶(MTRR)的基因组核酸序列的一部分; e. rsl006737(SEQIDN0. 11的位置27,其中SEQIDN0. 11是钙通道、电压依赖型、L型、 a 1C亚基(CACNA1C)的基因组核酸序列的一部分)上的SNP基因座上的至少一个丙氨酸 "Α"等位基因; f. rsl883729(SEQ IDN0. 12 的位置 27,其中 SEQ IDN0. 12 是 DNA(胞嘧啶-5)-甲基转 移酶3β (DNMT3B)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等 位基因; g. rs7163862 (SEQ ID NO. 13的位置27,其中SEQ ID NO. 13是GTP环水解酶1反馈调节 蛋白(GCHFR)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因; h. rsl2659(SEQ ID NO. 14的位置27,其中SEQ ID NO. 14是还原性叶酸载体蛋白(RCF2) 的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因; i. rs202676 (SEQ ID NO. 15的位置27,其中SEQ ID NO. 15是叶酸水解酶(前列腺特异的 膜抗原)1(F0LH1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个鸟嘌呤"G"等 位基因; j. rs2297291 (SEQ ID NO. 16的位置27,其中SEQ ID NO. 16是还原性叶酸载体蛋白 (RCF1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等位基因; k. rsl051266 (SEQ ID NO. 17的位置27)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等位基 因,其中SEQ ID NO. 17是还原性叶酸载体蛋白(RCF1)的基因组核酸序列的一部分; l. rs8007267 (SEQ ID NO. 18 的位置 27,其中 SEQ ID NO. 18 是 GTP 环水解酶 1 (GCH1)的 基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因; m. rs7639752 (SEQ ID NO. 19的位置27,其中SEQ ID NO. 19是磷酸胆碱胞苷酰转移酶 A(PCYTIA)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等位基因; n. rs6275 (SEQ ID NO. 20的位置27,其中SEQ ID NO. 20是多巴胺受体D2 (DRD2)的基因 组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基因; 〇. rsl079596(SEQ ID NO. 21的位置27)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位 基因,其中SEQ ID N0. 21是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; p. rsll240594(SEQ ID N0. 22的位置27)上SNP基因座上的至少一个丙氨酸"A"等位 基因,其中SEQ ID N0. 22是多巴胺受体D2(DRD2)的基因组核酸序列的一部分; q. rs4633 (SEQ ID N0. 23的位置27,其中SEQ ID N0. 23是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT) 的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胞嘧啶"C"等位基因; r. rs4680 (SEQ ID NO. 24的位置27)上SNP基因座上的至少一个鸟嘌呤"G"等位基因, 其中SEQ ID NO. 24是儿茶酚-0-甲基转移酶(C0MT)的基因组核酸序列的一部分; s. rs250682 (SEQ ID N0. 25的位置27,其中SEQ ID N0. 25是溶质载体家族6 (神经传递 介质转运的多巴胺)成员3(SLC6A3)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少 一个胞嘧啶"C"等位基因; t. rs2277820 (SEQ ID N0. 26的位置27,其中SEQ ID N0. 26是亚胺甲基转移酶环化脱氨 酶(FT⑶)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个胸腺嘧啶"T"等位基 因;和 u. rs2236225(SEQ ID N0. 27的位置27,其中SEQ ID N0. 27是亚甲基四氢叶酸脱氢酶 (NADP+依赖的)1 (MTHFD1)的基因组核酸序列的一部分)上SNP基因座上的至少一个丙氨 酸"A"等位基因; V.肥胖症(例如,由至少30kg/m2或更高的BMI值定义); w.比预定参照比例低的SAM与SAH的表达水平比例; X.比预定参照值高的4-HNE的表达水平;和 y.如在血浆样品中测定高于约2. 3mg/升血浆的hsCRP的表达。
103. 前述权利要求任一项的组合物,其中所述含叶酸组合物包含至少约5mg的叶酸。
104. 前述权利要求任一项的组合物,其中所述含叶酸组合物包含约7. 5-50mg的叶酸。
105. 前述权利要求任一项的组合物,其中所述含叶酸组合物进一步包含预定释放谱。
106. 权利要求105的组合物,其中所述预定释放谱包含持续释放谱。
107. 权利要求106的组合物,其中所述持续释放是稳定状态的释放。
108. 权利要求105的组合物,其中所述预定释放谱包含脉冲式释放谱。
109. 权利要求105的组合物,其中所述预定释放谱包含时间-控制释放谱。
110. 权利要求105-109任一项的组合物,其中配制所述含叶酸组合物以在施用所述组 合物后至少约3-6小时期间内释放至少30%的含叶酸化合物。
111. 前述权利要求任一项的组合物,其中所述抑郁症是严重的抑郁性障碍。
112. 前述权利要求任一项的组合物,其中所述人受试者目前服用抗抑郁剂。
113. 权利要求112的组合物,其中利用含叶酸组合物施用满足所述状况中的至少一种 或任一组合的所述人受试者。
114. 权利要求113的组合物,其中所述含叶酸组合物包括抗抑郁剂。
115. 权利要求113的组合物,其中所述含叶酸组合物不包括抗抑郁剂。
【文档编号】C12Q1/68GK104053785SQ201280065415
【公开日】2014年9月17日 申请日期:2012年11月14日 优先权日:2011年11月14日
【发明者】M·法瓦, G·帕帕科斯塔斯, H·O·小科克, D·克朗拉格 申请人:综合医院公司, 雀巢产品技术援助有限公司
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