一种砂梨基因检测芯片的制作方法
【专利摘要】一种砂梨基因检测芯片,包括砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列,其特征在于,砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列排列于带正电荷硅烷化材料膜层上,至少有4个阵列,一个阵列包含所有已知的S基因的cDNA特异检测探针,一个阵列可检测一个品种;砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列又贴在基片上,组合形成砂梨S基因cDNA检测芯片。
【专利说明】—种砂梨基因检测芯片
【技术领域】
[0001]本实用新型涉及一种基因芯片,特别是一种砂梨S基因cDNA检测芯片的结构,主要用于对砂梨品种的基因组DNA进行PCR-RFLP系统检测和DNA序列分析。
【背景技术】
[0002]砂梨是重要的经济树种,但砂梨与绝大多数梨品种一样,自花授粉结实率极低,有的甚至不结实,表现出典型的配子体自交不亲和性,当不同品种异花授粉时,自交不亲和基因型相同也会出现结实率低或不结实,这种现象在遗传学上也归属于自交不亲和现象;自交不亲和性的本质是成熟雌蕊分泌的一种RNase抑制其相同S基因型花粉在柱头;因此现在很多研究梨的都在研究梨的S基因,在生产和育种上也需鉴定品种的S基因犁以确定品种间的亲和性。在研究梨的S基因往往都是会通过基因芯片来进行;基因芯片(genechip)(又称DNA芯片、生物芯片)通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法,在一块基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时,通过确定荧光强度最强的探针位置,获得一组序列完全互补的探针序列。据此可重组出靶核酸的序列。但现有的用于检测砂梨S基因cDNA检测芯片都是单个独立的基因芯片,这样在进行检测时需要准备很多单个的基因芯片,可由于基因芯片本身比较小,因此很难以把握,一不小心就会使基因芯片出现故障,因此很有必要对此加以改进。通过国内专利文献检索发现有一些相关的文献报道,与本实用新型有关的主要有以下一些:
[0003]1、专利号为CN201220371254.0,名称为“基因芯片”的实用新型专利,该专利公开了一种基因芯片。本实用新型技术方案是芯片窗口中的基片的层级依次是上层为膜,下层为背衬层,膜采用的是尼龙膜,背衬层,为合成树脂胶粘剂。本实用新型解决了现有的检测各种疾病的生物芯片王要为蛋白芯片的缺陷。
[0004]2、专利号为CN201310166271.X,名称为“一种电化学基因芯片”的发明新型专利,该专利公开了一种一种电化学基因芯片。其包括流体腔、通道模块、与通道模块相贴合的探针电路板,通道模块上设有微流槽,通道模块与探针电路板贴合后通过微流槽和探针电路板表面相接触形成微流管道,流体腔与微流管道相通,探针电路板上沿着微流管道设有用于为电化学伏安扫描提供基准参考电压的参考电极、用于连通电化学激励电路的辅助电极和用于连接检测电路的工作电极,工作电极上固定有单分子层和DNA捕获探针。
[0005]3、专利号为CN200720071634.1,名称为“一种基因芯片”的实用新型专利,该专利公开了一种方便经济的组合型基因芯片,涉及生物芯片技术和体外临床诊断检测【技术领域】,由载体和覆盖在载体上有镂空反应区的粘性膜组合而成。
[0006]上述这些专利虽然涉及到了基因芯片,可仔细分析可以看出,这些基因芯片都不是砂梨S基因CDNA检测芯片,更没有提出如何解决多个检测芯片的排列问题。
实用新型内容
[0007]本实用新型的目的在于针对现有砂梨S基因cDNA检测芯片所存在的不足,提供一种新型的砂梨S基因cDNA检测芯片,该种砂梨S基因cDNA检测芯片可以将多个检测芯片组合起来,且具有很好的使用效果。
[0008]为了实现上述目的,本实用新型所采取的技术措施是:一种砂梨基因检测芯片,包括砂梨S基因CDNA检测探针点阵阵列,砂梨S基因CDNA检测探针点阵阵列排列于带正电荷硅烷化材料膜层上,至少有4个阵列,一个阵列包含所有已知的S基因的cDNA特异检测探针,一个阵列可检测一个品种;砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列又贴在基片上,组合形成砂梨S基因cDNA检测芯片。
[0009]进一步地,所述的砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列是粘贴在带正电荷硅烷化材料膜层上的。
[0010]进一步地,所述的砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列是对称排列在带正电荷硅烷化材料膜层上的。
[0011]进一步地,所述的带正电荷硅烷化材料膜层被覆于基片上,基片的表面为玻片片基表面,片基表面被氨基修饰,带正电荷,与CDNA上带负电荷的磷酸基以离子键结合,将砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列牢固地固定于基片上。
[0012]进一步地,所述的砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列的每个阵列均含有200个阵点,每个阵点就是具有一定浓度的固定于基片上的特异的检测探针,砂梨S基因cDNA检测芯片的每个阵列包含45个S基因特异的cDNA检测探针,每个探针在阵列中点样重复4次,2个无关基因(与S基因同源性极低的基因),2个管家基因(在梨的叶中表达稳定的基因)作为对照,其片段长度与S基因特异片段长度一致,在芯片阵列中点样各重复4次,空白点样重复4次。
[0013]本实用新型的优点在于,通过将砂梨S基因cDNA特异检测探针点阵阵列排列于带正电荷膜层上,通过砂梨基因检测芯片与未知S基因型砂梨品种的叶cDNA杂交可鉴定该品种的S基因和S基因型,一个阵列包含所有已知的S基因的cDNA特异检测探针,通过与未知S基因型砂梨品种的叶cDNA杂交可鉴定该品种的S基因和S基因型,一个阵列可检测一个品种;可以实现一个芯片检测多个品种,这样可以大大减少芯片的个数,提高检测效率。
【专利附图】
【附图说明】
[0014]图1,本实用新型的结构示意图。
【具体实施方式】
[0015]下面将结合附图和实施例对本实用新型做进一步的描述。
[0016]通过附图可以看出本实用新型为一种一种砂梨基因检测芯片,包括砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列3,砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列3排列于带正电荷硅烷化材料膜2上,至少有4个阵列,一个阵列包含所有已知的S基因的cDNA特异检测探针,一个阵列可检测一个品种;砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列3又贴在基片I上,组合形成砂梨S基因cDNA检测芯片4。
[0017]进一步地,所述的砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列3是粘贴在带正电荷硅烷化材料膜层上的。
[0018]进一步地,所述的砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列是对称排列在带正电荷硅烷化材料膜层2上的。
[0019]进一步地,所述的带正电荷硅烷化材料膜层2被覆于基片I上,基片I的表面为玻片片基表面,片基表面被氨基修饰,带正电荷,与cDNA上带负电荷的磷酸基以离子键结合,将砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列牢固地固定于基片上。
[0020]进一步地,所述的砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列3的每个阵列均含有200个阵点,每个阵点就是具有一定浓度的固定于基片上的特异的检测探针,砂梨S基因cDNA检测芯片的每个阵列包含45个S基因特异的cDNA检测探针,每个探针在阵列中点样重复4次,2个无关基因(与S基因同源性极低的基因),2个管家基因(在梨的叶中表达稳定的基因)作为对照,其片段长度与S基因特异片段长度一致,在芯片阵列中点样各重复4次,空白点样重复4次。
【权利要求】
1.一种砂梨基因检测芯片,包括砂梨S基因CDNA检测探针点阵阵列,其特征在于,砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列排列于带正电荷硅烷化材料膜层上,至少有4个阵列,一个阵列包含所有已知的S基因的cDNA特异检测探针,一个阵列可检测一个品种;所述的带正电荷硅烷化材料膜层被覆于基片上,基片的表面为玻片片基表面,片基表面被氨基修饰,带正电荷,与cDNA上带负电荷的磷酸基以离子键结合,将砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列牢固地固定于基片上,组合形成砂梨S基因cDNA检测芯片。
2.如权利要求1所述的砂梨基因检测芯片,其特征在于,所述的砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列是粘贴在带正电荷硅烷化材料膜层上的。
3.如权利要求1所述的砂梨基因检测芯片,其特征在于,所述的砂梨S基因cDNA检测探针点阵阵列是对称排列在带正电荷硅烷化材料膜层上的。
【文档编号】C12M1/34GK204097484SQ201320647212
【公开日】2015年1月14日 申请日期:2013年10月21日 优先权日:2013年10月21日
【发明者】江南, 谭晓风 申请人:湖南工业大学