一种金针菇f3菌种的ssr标记指纹图谱与应用的制作方法
【专利摘要】本发明涉及一种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱与应用，该指纹图谱由6对基于金针菇基因组序列开发的SSR标记的特异等位片段组合而成。应用包括：对金针菇菌种进行SSR标记扩增，将得到的带型与指纹图谱对照，与该指纹图谱一致即为F3菌种。本发明与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验相比，具有检测时间短、准确性高、可重复性好的优点，在收集的我国24个主栽金针菇菌种中具有F3菌种的专一性。
【专利说明】—种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱与应用
【技术领域】
[0001]本发明属于金针菇菌种的检测领域，特别涉及一种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱与应用。
【背景技术】
[0002]金针燕[Flammulina velutipes (Fr.) Sing.]又名金燕、朴燕、构菌、青杠菌、毛柄金钱菌，在分类上属于伞菌目白蘑科小火焰菌属。金针菇分布广泛，营养丰富，是一种经济价值很高的食用菌和药用菌，也是市场上十分走俏的天然保健食品之一。金针菇是中国主要栽培食用菌和现代工厂化生产主要食用菌之一，2013年国内工厂化日生产量达到2700吨。
[0003]优质菌种在金针菇单产和质量中的贡献率举足轻重，这决定了金针菇菌种在金针菇产业中的重要地位。1999年我国签署了《国际植物新品种保护法》，这不仅要求我们尊重其它国家的品种知识产权，同时也要加强保护我们国家自己的品种知识产权，为了建立食用菌新品种登记制度来真正保护我国的品种产权，必须首先建立成熟的品种鉴定技术，为新品种登记奠定基础。尤其日本2004年4月I日开始实行《种苗法修正案》，对我国食用菌尤其是金针菇的生产构成了极大的威胁。就国内而言，金针菇栽培菌种“同种异名，异种同名”的现象，不仅给菇农带来了极大的损失，影响了他们的栽培积极性，也极大地影响了中国金针菇产业的发展；而且，随着大规模的工厂化栽培方式的出现，对金针菇栽培菌株质量的要求越来越高，需要发展更为简便、快速、准确的菌株鉴定技术，以保证每批次的用种都准确无误。
[0004]面对这种局势，就需要我们进一步加快菌种鉴定技术的研究，在金针菇的研究中建立更为有效的菌种鉴定体系。
【发明内容】
[0005]本发明所要解决的技术问题是提供一种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱及其构建方法与应用，该指纹图谱与常规形态学检测、拮抗试验、出菇试验相比，具有检测时间短，准确性高，重复性好的优点。
[0006]本发明的一种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱，该指纹图谱由6对SSR标记组成，是基于金针菇基因组简单重复序列片段开发SSR引物，扩增带型好，重复性高的SSR引物，标记详细信息如表1。
[0007]表1 SSR标记详细信息列表
[0008]
【权利要求】
1.一种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱，其特征在于:该指纹图谱由6对基于金针菇基因组序列开发的SSR标记的特异等位片段组合而成，6对SSR标记在金针菇F3菌种上扩增的等位片段信息具体为: Fv_fp0001的等位片段的数量为2，等位片段I相对于50bp DNA ladder的分子量为700bp ;等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为680bp ； Fv_fp0002的等位片段的数量1，等位片段I相对于50bp DNA ladder的分子量为1300bp, Fv_fp0003的等位片段的数量为1，等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为680bp ； Fv_fp0004的等位片段的数量2，等位片段I相对于50bp DNA ladder的分子量为1250bp ;等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为1200bp ； Fv_fp0005的等位片段的数量4，等位片段I相对于50bp DNA ladder的分子量为IlOObp,等位片段2相对于50bp DNA ladder的分子量为800bp ;等位片段3相对于50bpDNA ladder的分子量为530bp ;等位片段4相对于50bp DNA ladder的分子量为500bp ； Fv_fp0006的等位片段的数量为2，等位片段I相对于50bp DNA ladder的分子量为400bp ;等位片段3相对于50bp DNA ladder的分子量为360bp。
2.根据权利要求1所述的一种金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱，其特征在于:所述6对SSR标记等位片段的特异编号组合为:(1+2) 12 (1+2) (1+2+3+4) (1+3)。
3.—种如权利要 求1所述的金针菇F3菌种的SSR标记指纹图谱的应用，其特征在于:应用于鉴定金针菇F3菌种的特异等位变异组合以及鉴定金针菇F3菌种相对于其他国审金针菇品种的特异性。
【文档编号】C12Q1/04GK104131086SQ201410318267
【公开日】2014年11月5日 申请日期:2014年7月4日 优先权日:2014年7月4日
【发明者】尚晓冬, 陆欢, 王瑞娟, 章炉军, 徐珍, 张丹, 谭琦 申请人:上海市农业科学院