本公开涉及计算机,具体地,涉及一种蛋白质特征预处理方法、装置、介质及设备。
背景技术:
1、蛋白质是所有生命的基础物质,是机体细胞的最基本、最重要的组成部分。现有技术中,通常会针对具体的蛋白质任务进行蛋白质模型的训练,如可以训练蛋白质生成模型,以预测相应的蛋白质氨基酸序列。然而通过上述方式通常需要针对每一模型进行分别训练和微调,需要较高的计算资源和成本。
技术实现思路
1、提供该
技术实现要素:
部分以便以简要的形式介绍构思,这些构思将在后面的具体实施方式部分被详细描述。该发明内容部分并不旨在标识要求保护的技术方案的关键特征或必要特征,也不旨在用于限制所要求的保护的技术方案的范围。
2、第一方面,本公开提供一种蛋白质特征预处理方法,所述方法包括:
3、接收待处理的蛋白质;
4、根据所述蛋白质和训练完成的蛋白质特征预处理模型,获得所述蛋白质对应的蛋白质特征;
5、根据所述蛋白质对应的处理类型和所述蛋白质特征,确定所述蛋白质对应的应用蛋白质特征;
6、其中,所述蛋白质特征预处理模型包括共享编码器、蛋白质理解解码器和蛋白质生成解码器,所述共享编码器用于对所述蛋白质进行特征编码获得编码特征,所述蛋白质理解解码器用于对所述编码特征进行理解解码处理,获得蛋白质理解特征,所述蛋白质生成解码器用于对所述编码特征进行生成解码处理,获得蛋白质生成特征,所述蛋白质特征包括所述编码特征、所述蛋白质理解特征和所述蛋白质生成特征。
7、第二方面,本公开提供一种蛋白质特征预处理装置,所述装置包括:
8、接收模块,用于接收待处理的蛋白质;
9、处理模块,用于根据所述蛋白质和训练完成的蛋白质特征预处理模型,获得所述蛋白质对应的蛋白质特征;
10、确定模块,用于根据所述蛋白质对应的处理类型和所述蛋白质特征,确定所述蛋白质对应的应用蛋白质特征;
11、其中,所述蛋白质特征预处理模型包括共享编码器、蛋白质理解解码器和蛋白质生成解码器,所述共享编码器用于对所述蛋白质进行特征编码获得编码特征,所述蛋白质理解解码器用于对所述编码特征进行理解解码处理,获得蛋白质理解特征,所述蛋白质生成解码器用于对所述编码特征进行生成解码处理,获得蛋白质生成特征,所述蛋白质特征包括所述编码特征、所述蛋白质理解特征和所述蛋白质生成特征。
12、第三方面,本公开提供一种计算机可读介质,其上存储有计算机程序,该程序被处理装置执行时实现第一方面所述方法的步骤。
13、第四方面,本公开提供一种电子设备,包括:
14、存储装置,其上存储有计算机程序;
15、处理装置,用于执行所述存储装置中的所述计算机程序,以实现第一方面所述方法的步骤。
16、由此,通过上述技术方案,可以基于蛋白质特征预处理模型对蛋白质进行特征预处理,以获得该蛋白质对应的多个蛋白质特征,以便于根据具体的处理类型从中选择相应的蛋白质特征进行后续任务。一方面在蛋白质特征预处理模型中能够同时结合蛋白质理解和蛋白质生成进行特征提取,从而可以提高提取出的蛋白质特征的准确性,另一方面可以有效提高蛋白质特征的提取效率,同时可以使得提取出的特征能够适用于更加丰富的后续任务处理,提高该蛋白质特征预处理方法的使用范围。
17、本公开的其他特征和优点将在随后的具体实施方式部分予以详细说明。
1.一种蛋白质特征预处理方法,其特征在于,所述方法包括:
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述蛋白质特征预处理模型通过以下方式确定:
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述根据所述预测掩码氨基酸、所述预测蛋白质和所述蛋白质样本,确定所述预设模型的理解损失和生成损失,包括:
4.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述根据所述理解损失和所述生成损失分别对所述预设模型中的共享编码器、所述蛋白质理解解码器和所述蛋白质生成解码器进行训练,包括:
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述蛋白质理解解码器基于bert模型实现,所述蛋白质生成解码器基于transformer模型的解码器实现。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述根据所述蛋白质对应的处理类型和所述蛋白质特征,确定所述蛋白质对应的应用蛋白质特征,包括:
7.一种蛋白质特征预处理装置,其特征在于,所述装置包括:
8.根据权利要求7所述的装置,其特征在于,所述蛋白质特征预处理模型通过训练模型进行训练确定,所述训练模块包括:
9.一种计算机可读介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,该程序被处理装置执行时实现权利要求1-6中任一项所述方法的步骤。
10.一种电子设备,其特征在于,包括: