本发明涉及分子生物学与基因工程领域,涉及敲低mettl5基因的shrna及其应用。
背景技术:
1、肺癌是起源于肺部支气管黏膜或腺体的恶性肿瘤,目前位居全球肿瘤发病率第二和死亡率第一。肺癌根据生物学,治疗和预后分为两大类,小细胞肺癌(sclc)和非小细胞肺癌(nsclc)。非小细胞肺癌(nsclcs)占肺肿瘤的85%。超过20%的非小细胞肺癌(nsclcs)在诊断时已是晚期,只进行局部治疗(手术或放疗)的患者总生存率较差,大多数死于远处转移。nsclc患者生存率改善的原理尚未研究清楚且易产生耐药,原发性或继发性耐药最终会导致所有晚期疾病患者的治疗失败。因此研究治疗相关的新分子机制和靶点十分重要。
2、甲基转移酶样蛋白5(mettl5)是一种甲基转移酶,可以催化某些结构化rrna上的m6a。人metll5是一种24kda蛋白,需要与已知的甲基转移酶激活剂trmt112形成异二聚体复合从而在细胞中获得代谢稳定性,发挥甲基转移酶活性。mettl5在整个成人体内的所有组织中具有低但普遍存在的表达,且mettl5主要在细胞质中表达。人类rrna中只有两个m6a位点,即大亚基28sa4220位和小亚基18sa1832位,这些修饰位于核糖体内功能重要的区域,rrna的修饰会影响核糖体结构和功能,包括解码,停留时间,肽基转移,与trna,mrna和翻译因子的相互作用,因此mettl5可能对翻译至关重要。不同肿瘤中甲基转移酶样蛋白影响存在差异,特别是肺癌未见敲低mettl5后对其影响。
技术实现思路
1、本发明的首要目的在于提供两种靶向敲低mettl5基因的shrna。
2、本发明的另一目的在于提供所述一种靶向敲低mettl5基因的质粒系统的应用。
3、本发明的再一目的在于提供mettl5敲低的非小细胞肺癌细胞株。
4、本发明的再一目的在于提供一种敲低mettl5基因的方法在探究mettl5对非小细胞肺癌增殖影响中的应用,用以解决上述背景技术中提出的问题。
5、技术方案
6、一种shrna在制备治疗非小细胞肺癌药物中的应用,其特征在于:
7、所述shrna包括shmettl5-1或shmettl5-2,其中
8、shmettl5-1包括如下序列:
9、shmettl5-1 oligo1:
10、5'accgggtcattcgatacagtaattatctcgagataattactgtatcgaatgacttttttg3';
11、shmettl5-1 oligo2:
12、5'cgaacaaaaaagtcattcgatacagtaattatctcgagataattactgtatcgaatgacc3';
13、shmettl5-2包括如下序列:
14、shmettl5-2 oligo1:
15、5'accgggccagcatcatacaagtttcactcgagtgaaacttgtatgatgctggcttttttg3';
16、shmettl5-2 oligo2:
17、5'cgaacaaaaaagccagcatcatacaagtttcactcgagtgaaacttgtatgatgctggcc3'。进一步而言,所述的shrna靶向敲低mettl5基因,shmettl5-1或shmettl5-2在细胞内转录后可形成发夹结构,如图1。
18、进一步,靶向敲低mettl5基因非小细胞肺癌细胞的构建方法,包括如下步骤:
19、s1:针对mettl5基因cds区不同位置设计两对shrna oligo,退火使两条oligo成双链;
20、s2:将prsi9-u6-(sh)-ubic-tagrfp-2a-puro载体用bbsi酶切形成线性化载体。载体线状化酶切回收;
21、s3:将上述退火后的oligo和载体连接;
22、s4:转化涂板单克隆鉴定;
23、s5:包装空载体及敲低mettl5质粒的慢病毒;
24、s6:病毒感染人非小细胞肺癌细胞,在感染敲低病毒的非小细胞肺癌细胞株中加入嘌呤霉素,进行筛选,构建稳定转染细胞株,westernblot检测mettl5的敲低效率。
25、s1-s4为shrna质粒的构建过程,其通过短发夹rna干扰mettl5的表达实现。
26、一种靶向敲低mettl5基因非小细胞肺癌细胞在制备作为药物筛选靶点或工具中的应用。
27、有益效果
28、与现有技术相比,本敲低mettl5基因的方法及其在探究mettl5对非小细胞肺癌增殖影响中的应用具有以下优点:
29、本发明设计的shrna对非小细胞肺癌有抑制作用,其可以通过敲低人非小细胞肺癌细胞的mettl5基因实现。
30、本发明利用稳定敲低人mettl5基因的方法制备的质粒稳定转染人非小细胞肺癌细胞后,即可使人非小细胞肺癌细胞的mettl5基因敲低,因此本发明提供了mettl5敲低细胞或shrna运用于研究mettl5对非小细胞肺癌细胞增殖的影响,提供一个非小细胞肺癌治疗的可能靶点或工具。
1.一种shrna在制备治疗非小细胞肺癌药物中的应用,其特征在于:
2.一种靶向敲低mettl5基因非小细胞肺癌细胞的构建方法,包括如下步骤:
3.一种根据权利要求2所述的方法获得的靶向敲低mettl5基因非小细胞肺癌细胞在制备作为药物筛选靶点或工具中的应用。