纳米孔原始电流信号的匹配方法、装置、设备及介质与流程

本申请涉及生物特征检测，尤其涉及一种纳米孔原始电流信号的匹配方法、装置、设备及介质。

背景技术：

1、电流信号识别是基因组学和生物信息学领域的一项重要技术，旨在将原始测序信号与基因组序列进行准确地匹配和对应。这项技术的发展为更准确、更深入地理解基因组序列提供了重要手段。在原始测序信号中存在多种噪音和误差，例如仪器误差、化学噪声等，这给信号识别带来了挑战。而现有技术未能考虑到原始测序信号中的噪声和误差，导致纳米孔原始电流信号的匹配准确性较低，降低了后续信号识别的准确性。

技术实现思路

1、本申请实施例的目的在于提出一种纳米孔原始电流信号的匹配方法、装置、设备及介质，以提高纳米孔原始电流信号的匹配准确性。

2、为了解决上述技术问题，本申请实施例提供一种纳米孔原始电流信号的匹配方法，包括：

3、获取原始信号和基因组序列；

4、对所述原始信号与所述基因组序列进行匹配，得到匹配后的信息；

5、基于所述匹配后的信息、所述原始信号和所述基因组序列计算重排参数；

6、基于所述重排参数对所述原始信号与所述基因组序列进行迭代重排，以获取成功重排的原始信号，将所述成功重排的原始信号对应的基因组序列作为目标基因组序列；

7、获取dna参考碱基序列，将所述目标基因组序列与所述dna参考碱基序列进行对比，得到对比结果，并提取所述对比结果中的对比信息；

8、构建重排参数对象，基于所述重排参数对象与所述对比信息进行重排操作，得到目标重排结果。

9、为了解决上述技术问题，本申请实施例提供一种纳米孔原始电流信号的匹配装置，包括：

10、信号获取单元，用于获取原始信号和基因组序列；

11、序列匹配单元，用于对所述原始信号与所述基因组序列进行匹配，得到匹配后的信息；

12、参数计算单元，用于基于所述匹配后的信息、所述原始信号和所述基因组序列计算重排参数；

13、迭代重排单元，用于基于所述重排参数对所述原始信号与所述基因组序列进行迭代重排，以获取成功重排的原始信号，将所述成功重排的原始信号对应的基因组序列作为目标基因组序列；

14、信息提取单元，用于获取dna参考碱基序列，将所述目标基因组序列与所述dna参考碱基序列进行对比，得到对比结果，并提取所述对比结果中的对比信息；

15、结果生成单元，用于构建重排参数对象，基于所述重排参数对象与所述对比信息进行重排操作，得到目标重排结果。

16、为解决上述技术问题，本发明采用的一个技术方案是：提供一种电子设备，包括，一个或多个处理器；存储器，用于存储一个或多个程序，使得一个或多个处理器实现上述任意一项所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法。

17、为解决上述技术问题，本发明采用的一个技术方案是：一种计算机可读存储介质，所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现上述任意一项所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法。

18、本发明实施例提供了一种纳米孔原始电流信号的匹配方法、装置、设备及介质。其中，方法包括：获取原始信号和基因组序列；对所述原始信号与所述基因组序列进行匹配，得到匹配后的信息；基于所述匹配后的信息、所述原始信号和所述基因组序列计算重排参数；基于所述重排参数对所述原始信号与所述基因组序列进行迭代重排，以获取成功重排的原始信号，将所述成功重排的原始信号对应的基因组序列作为目标基因组序列；获取dna参考碱基序列，将所述目标基因组序列与所述dna参考碱基序列进行对比，得到对比结果，并提取所述对比结果中的对比信息；构建重排参数对象，基于所述重排参数对象与所述对比信息进行重排操作，得到目标重排结果。本发明实施例先将原始信号与基因组序列迭代重排后，再将dna参考碱基序列与目标基因组序列进行迭代重排，有效解决了原始测序信号中的噪声和误差，提高了纳米孔原始电流信号的匹配准确性，有利于后续信号识别的准确性和可靠性。

技术特征：

1.一种纳米孔原始电流信号的匹配方法，其特征在于，包括：

2.根据权利要求1所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法，其特征在于，所述对所述原始信号与所述基因组序列进行匹配，得到匹配后的信息包括：

3.根据权利要求2所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法，其特征在于，所述将所述信号分段与所述基因组序列进行匹配，以确定每个所述信号分段对应的基因组序列片段，得到所述匹配后的信息之后，所述方法还包括：

4.根据权利要求1所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法，其特征在于，所述基于所述重排参数对所述原始信号与所述基因组序列进行迭代重排，以获取成功重排的原始信号，将所述成功重排的原始信号对应的基因组序列作为目标基因组序列，包括：

5.根据权利要求1所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法，其特征在于，所述获取dna参考碱基序列，将所述目标基因组序列与所述dna参考碱基序列进行对比，得到对比结果，并提取所述对比结果中的对比信息，包括：

6.根据权利要求1至5任一项所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法，其特征在于，所述构建重排参数对象，基于所述重排参数对象与所述对比信息进行重排操作，得到目标重排结果，包括：

7.根据权利要求6所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法，其特征在于，所述若所述目标基因组序列与所述dna参考碱基序列的重排操作失败时，将所述目标基因组序列的反向序列与所述dna参考碱基序列进行迭代重排，得到所述目标重排结果，包括：

8.一种纳米孔原始电流信号的匹配装置，其特征在于，包括：

9.一种电子设备，其特征在于，包括存储器和处理器，所述存储器中存储有计算机程序，所述处理器执行所述计算机程序时实现如权利要求1至7中任一项所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法。

10.一种计算机可读存储介质，其特征在于，所述计算机可读存储介质上存储有计算机程序，所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1至7中任一项所述的纳米孔原始电流信号的匹配方法。

技术总结
本申请涉及一种纳米孔原始电流信号的匹配方法、装置、设备及介质，其中方法包括：获取原始信号和基因组序列；对原始信号与基因组序列进行匹配，得到匹配后的信息；基于匹配后的信息、原始信号和基因组序列计算重排参数；基于重排参数对原始信号与基因组序列进行迭代重排，以获取成功重排的原始信号，将成功重排的原始信号对应的基因组序列作为目标基因组序列；获取DNA参考碱基序列，将目标基因组序列与DNA参考碱基序列进行对比，得到对比结果，并提取对比结果中的对比信息；构建重排参数对象，基于重排参数对象与对比信息进行重排操作，得到目标重排结果。本申请提高了纳米孔原始电流信号的匹配准确性，有利于后续信号识别的准确性和可靠性。

技术研发人员：李军,臧宇鹏
受保护的技术使用者：深圳市梅丽纳米孔科技有限公司
技术研发日：
技术公布日：2024/9/29