一种用于检测胃癌易感性的试剂盒及其SNP标志物的制作方法

文档序号:12249931阅读:来源:国知局

技术特征:

1.一种用于检测胃癌易感性的SNP标志物,其特征在于,所述SNP标志物包括28个SNP位点,所述28个SNP位点为rs16861205、rs10773989、rs1044471、rs3212986、rs187116、rs121964871、rs26160、rs17690554、rs1880481、rs2072454、rs1799793、rs11466306、rs889312、rs2279744、rs3732183、rs2303428、rs1801133、rs4072037、rs4648068、rs2274223、rs2076167、rs3734254、rs13361707、rs2294008、rs2976392、rs1478604、rs11536889和rs9841504。

2.根据权利要求1所述的SNP标志物的PCR扩增引物和单碱基延伸引物,其特征在于,

所述检测rs16861205的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:3;

所述检测rs10773989的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:4和SEQ ID NO:5,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:6;

所述检测rs1044471的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:7和SEQ ID NO:8,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:9;

所述检测rs3212986的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:10和SEQ ID NO:11,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:12;

所述检测rs187116的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:13和SEQ ID NO:14,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:15;

所述检测rs121964871的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:16和SEQ ID NO:17,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:18;

所述检测rs26160的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:19和SEQ ID NO:20,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:21;

所述检测rs1 7690554的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:22和SEQ ID NO:23,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:24;

所述检测rs1880481的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:25和SEQ ID NO:26,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:27;

所述检测rs2072454的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:28和SEQ ID NO:29,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:30;

所述检测rs1799793的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:31和SEQ ID NO:32,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:33;

所述检测rs11466306的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:34和SEQ ID NO:35,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:36;

所述检测rs889312的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:37和SEQ ID NO:38,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:39;

所述检测rs2279744的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:40和SEQ ID NO:41,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:42;

所述检测rs3732183的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:43和SEQ ID NO:44,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:45;

所述检测rs2303428的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:46和SEQ ID NO:47,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:48;

所述检测rs1801133的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:49和SEQ ID NO:50,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:51;

所述检测rs4072037的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:52和SEQ ID NO:53,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:54;

所述检测rs4648068的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:55和SEQ ID NO:56,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:57;

所述检测rs2274223的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:58和SEQ ID NO:59,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:60;

所述检测rs2076167的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:61和SEQ ID NO:62,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:63;

所述检测rs3734254的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:64和SEQ ID NO:65,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:66;

所述检测rs13361707的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:67和SEQ ID NO:68,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:69;

所述检测rs2294008的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:70和SEQ ID NO:71,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:72;

所述检测rs2976392的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:73和SEQ ID NO:74,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:75;

所述检测rs1478604的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:76和SEQ ID NO:77,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:78;

所述检测rs11536889的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:79和SEQ ID NO:80,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:81;

所述检测rs9841504的PCR扩增引物的序列分别为SEQ ID NO:82和SEQ ID NO:83,以及单碱基延伸引物的序列为SEQ ID NO:84。

3.一种用于检测胃癌易感性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求2所述SNP标志物的PCR扩增引物和单碱基延伸引物,用于检测外周血DNA中28个SNP位点为rs16861205、rs10773989、rs1044471、rs3212986、rs187116、rs121964871、rs26160、rs17690554、rs1880481、rs2072454、rs1799793、rs11466306、rs889312、rs2279744、rs3732183、rs2303428、rs1801133、rs4072037、rs4648068、rs2274223、rs2076167、rs3734254、rs13361707、rs2294008、rs2976392、rs1478604、rs11536889和rs9841504。

4.根据权利要求3所述的一种用于检测胃癌易感性的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括Taq酶、dNTP混合液、MgCl2溶液、PCR反应缓冲液、酶切反应缓冲液、去离子水。

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