一种用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒及其应用的制作方法

1.本发明属于试剂技术领域，尤其涉及一种用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒及其应用。


背景技术：

2.前列腺癌是指发生在前列腺的上皮性恶性肿瘤。现有用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒及其应用采用的试剂用量容易出现偏差；同时，对前列腺癌患者顺铂敏感性预测不准确。
3.通过上述分析，现有技术存在的问题及缺陷为：
4.(1)现有用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒及其应用采用的试剂用量容易出现偏差。
5.(2)对前列腺癌患者顺铂敏感性预测不准确。


技术实现要素：

6.针对现有技术存在的问题，本发明提供了一种用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒及其应用。
7.本发明是这样实现的，一种用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒包括：
8.温度检测模块、主控模块、温控模块、灭菌模块、试剂储存模块、试剂管理模块、预测模块、显示模块；
9.温度检测模块，与主控模块连接，用于通过温度传感器检测用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒内温度数据；
10.主控模块，与温度检测模块、温控模块、灭菌模块、试剂储存模块、试剂管理模块、预测模块、显示模块连接，用于控制各个模块正常工作；
11.温控模块，与主控模块连接，用于控制试剂盒内试剂适宜的存储温度；
12.灭菌模块，与主控模块连接，用于对试剂盒进行灭菌处理；
13.试剂储存模块，与主控模块连接，用于存储预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂；
14.试剂管理模块，与主控模块连接，用于对试剂进行管理；
15.预测模块，与主控模块连接，用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性；
16.显示模块，与主控模块连接，用于显示试剂盒温度、预测结果。
17.一种用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒应用方法包括以下步骤：
18.步骤一，通过温度检测模块利用温度传感器检测用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒内温度数据；
19.步骤二，主控模块通过温控模块控制试剂盒内试剂适宜的存储温度；
20.步骤三，通过灭菌模块对试剂盒进行灭菌处理；通过试剂储存模块存储预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂；通过试剂管理模块对试剂进行管理；
21.步骤四，通过预测模块预测前列腺癌患者顺铂敏感性；
22.步骤五，通过显示模块显示试剂盒温度、预测结果。
23.进一步，所述温度调控模块通过温度调节器进行变高档低档来调节试剂盒内的温度，同时温控模块内还设置有微型风扇，协助调温；灭菌模块通过小型压力泵将压力灌入灭菌罐，将灭菌液通过喷洒头均匀的对试剂盒进行灭菌；试剂存储模块将检测完的试剂在模块所设置的存储格中单个封闭存储，保证试剂不会失效；显示模块将检测试剂时试剂盒内的适宜温度和预测结果通过显示屏显示出来，便于工作人员记录数据。
24.进一步，所述试剂管理模块管理方法如下：
25.(1)构建规则管理数据库；接收检测前列腺癌项目的标本数量信息；从规则管理数据库中提取与所述检测前列腺癌项目对应的试剂用量规则；
26.(2)根据所述试剂用量规则和所述标本数量信息，计算所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量；所述试剂用量规则包括通过基础设置界面预设的最优检测批次的标本数、检测前列腺癌项目的质控用量和定标用量、单个标本的检测用量以及试剂的损耗率；从试剂库存数据库中获取与所述检测前列腺癌项目对应的试剂库存信息；
27.(3)根据所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量和所述试剂库存信息，确定试剂的领取数量；所述试剂库存信息包括试剂的入库时间、规格和库存数量，试剂的规格用于指示单位包装试剂的份量；将所述检测前列腺癌项目与所述试剂的库存信息及领取数量进行关联显示，并生成领料单；根据预设的试剂用量规则和所述标本数量信息，计算所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量；
28.计算所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量的公式为：
[0029][0030]
其中，n表示试剂需求总量，n表示标本数量信息，nmax表示最优检测批次的标本数，n1表示检测前列腺癌项目的质控用量，n2表示检测前列腺癌项目的定标用量，no表示单个标本的检测用量，α表示试剂的损耗率。
[0031]
进一步，所述根据所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量和试剂库存信息，确定试剂的领取数量，包括如下步骤：
[0032]
按照试剂入库时间的先后顺序和规格的大小顺次，依次从所述检测前列腺癌项目的试剂库存信息中获取待分配试剂的库存信息；
[0033]
在每次获取到所述待分配试剂的库存信息时，通过如下公式计算所述检测前列腺癌项目对当前待分配试剂的需求数量m：m＝n/m，其中，n表示试剂需求总量，m表示当前待分配试剂的规格；
[0034]
在m≤mo的情况下，设定m为当前待分配试剂的领取数量；其中，mo表示当前待分配试剂的库存数量；
[0035]
在m》mo的情况下，设定mo为当前待分配试剂的领取数量，并根据所述当前待分配试剂的领取数量更新所述检测前列腺癌项目试剂需求总量，以计算所述检测前列腺癌项目对下一待分配试剂的需求数量，实现不同规格试剂领取数量的确定。
[0036]
进一步，所述将所述检测前列腺癌项目与所述试剂的库存信息及领取数量进行关联显示并生成领料单之后，还包括如下步骤：
[0037]
当接收到所述领料单的确认指令时，向供应链服务器转发所述领料单和备货指令
以指示供应端进行物料准备；所述领料单的确认指令由输入设备输入；
[0038]
当获取到试剂的出库指令时，对所述试剂库存数据库中对应的试剂库存信息进行更新。
[0039]
在接收检测前列腺癌项目的标本数量信息之前，还包括如下步骤：
[0040]
通过扫描试剂的二维码标识信息来获取试剂的名称信息、规格和数量；所述二维码标识信息印设于试剂的包装盒上；
[0041]
将扫描时间设置为入库时间，并将所述入库时间与所述试剂的名称信息、规格和数量进行关联，生成对应的试剂库存信息。
[0042]
进一步，所述预测模块预测方法如下：
[0043]
1)获取肿瘤组织样本；使用mircutemirna提取分离试剂提取肿瘤组织样本中的mirna；mirna文库构建；
[0044]
2)簇生成；采用truseqsrclusterkitv3-cbot-hs试剂完成；
[0045]
3)illuminahiseq2000测序；hiseq2000上机，测序结果将原始数据转换成fastq格式；
[0046]
4)数据分析。
[0047]
进一步，所述mirna文库构建：采用truseqmirnasampleprepkitv2试剂完成。
[0048]
进一步，所述数据分析方法：
[0049]
对原始fastq文件数据筛选质量可靠的测序片段；
[0050]
将测序结果与mirbase数据库比对过滤，鉴定出结果中的已知人的mirna 数据；
[0051]
根据鉴定的mirna进行表达量统计，mirna表达量计算采用tpm计算度量指标，tpm公式＝(每条mirna比对到的read数目)/(样本总比对read数目)
ꢀ×
106；
[0052]
将目的mirna的表达量进行相关计算，预测评分值＝-0.0061*mir-215+(-0.0011*mir-129-1-3p)+0.0120*mir-1283+(-0.0007*mir-126-3 p)+(-0.0088*mir-199b-5p)。
[0053]
进一步，所述当预测评分值《10，可认定该患者肿瘤组织对顺铂高度敏感；当预测评分值≥10并且≤27时，可认定该患者肿瘤组织对顺铂中度敏感；当预测评分值》27，可认定该患者肿瘤组织对顺铂不敏感。
[0054]
结合上述的技术方案和解决的技术问题，请从以下几方面分析本发明所要保护的技术方案所具备的优点及积极效果为：
[0055]
第一、针对上述现有技术存在的技术问题以及解决该问题的难度，紧密结合本发明的所要保护的技术方案以及研发过程中结果和数据等，详细、深刻地分析本发明技术方案如何解决的技术问题，解决问题之后带来的一些具备创造性的技术效果。具体描述如下：
[0056]
本发明通过试剂管理模块预先设置检测前列腺癌项目的试剂用量规则，在接收到检测前列腺癌项目的标本数量信息时能够根据对应的试剂用量规则自动计算检测前列腺癌项目的试剂需求总量和试剂的领取数量，可以准确确定检测前列腺癌试剂用量；同时，通过预测模块利用检测组织样本中mir-215-5p， mir-1283，mir-129-1-3p，mir-126-3p和mir-199b-5p的表达量，用于预测肿瘤顺铂敏感性，较目前其他预测顺铂敏感性的参数有着更高的准确性、稳定性和应用价值。
[0057]
第二，把技术方案看做一个整体或者从产品的角度，本发明所要保护的技术方案具备的技术效果和优点，具体描述如下：
[0058]
本发明通过试剂管理模块预先设置检测前列腺癌项目的试剂用量规则，在接收到检测前列腺癌项目的标本数量信息时能够根据对应的试剂用量规则自动计算检测前列腺癌项目的试剂需求总量和试剂的领取数量，可以准确确定检测前列腺癌试剂用量；同时，通过预测模块利用检测组织样本中mir-215-5p， mir-1283，mir-129-1-3p，mir-126-3p和mir-199b-5p的表达量，用于预测肿瘤顺铂敏感性，较目前其他预测顺铂敏感性的参数有着更高的准确性、稳定性和应用价值。
附图说明
[0059]
图1是本发明实施例提供的用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒应用方法流程图。
[0060]
图2是本发明实施例提供的本发明实施例提供的用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒结构框图。
[0061]
图3是本发明实施例提供的试剂管理模块管理方法流程图。
[0062]
图4是本发明实施例提供的预测模块预测方法流程图。
[0063]
图2中：1、温度检测模块；2、主控模块；3、温控模块；4、灭菌模块； 5、试剂储存模块；6、试剂管理模块；7、预测模块；8、显示模块。
具体实施方式
[0064]
为了使本发明的目的、技术方案及优点更加清楚明白，以下结合实施例，对本发明进行进一步详细说明。应当理解，此处所描述的具体实施例仅仅用以解释本发明，并不用于限定本发明。
[0065]
一、解释说明实施例。为了使本领域技术人员充分了解本发明如何具体实现，该部分是对权利要求技术方案进行展开说明的解释说明实施例。
[0066]
如图1所示，本发明提供的用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒应用方法包括以下步骤：
[0067]
s101，通过温度检测模块利用温度传感器检测用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒内温度数据；
[0068]
s102，主控模块通过温控模块控制试剂盒内试剂适宜的存储温度；
[0069]
s103，通过灭菌模块对试剂盒进行灭菌处理；通过试剂储存模块存储预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂；通过试剂管理模块对试剂进行管理；
[0070]
s104，通过预测模块预测前列腺癌患者顺铂敏感性；
[0071]
s105，通过显示模块显示试剂盒温度、预测结果。
[0072]
本发明通过试剂管理模块预先设置检测前列腺癌项目的试剂用量规则，在接收到检测前列腺癌项目的标本数量信息时能够根据对应的试剂用量规则自动计算检测前列腺癌项目的试剂需求总量和试剂的领取数量，可以准确确定检测前列腺癌试剂用量；同时，通过预测模块利用检测组织样本中mir-215-5p， mir-1283，mir-129-1-3p，mir-126-3p和mir-199b-5p的表达量，用于预测肿瘤顺铂敏感性，较目前其他预测顺铂敏感性的参数有着更高的准确性、稳定性和应用价值。
[0073]
如图2所示，本发明实施例提供的用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒包
括：温度检测模块1、主控模块2、温控模块3、灭菌模块4、试剂储存模块5、试剂管理模块6、预测模块7、显示模块8。
[0074]
温度检测模块1，与主控模块2连接，用于通过温度传感器检测用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂盒内温度数据；
[0075]
主控模块2，与温度检测模块1、温控模块3、灭菌模块4、试剂储存模块5、试剂管理模块6、预测模块7、显示模块8连接，用于控制各个模块正常工作；
[0076]
温控模块3，与主控模块2连接，用于控制试剂盒内试剂适宜的存储温度；
[0077]
灭菌模块4，与主控模块2连接，用于对试剂盒进行灭菌处理；
[0078]
试剂储存模块5，与主控模块2连接，用于存储预测前列腺癌患者顺铂敏感性的试剂；
[0079]
试剂管理模块6，与主控模块2连接，用于对试剂进行管理；
[0080]
预测模块7，与主控模块2连接，用于预测前列腺癌患者顺铂敏感性；
[0081]
显示模块8，与主控模块2连接，用于显示试剂盒温度、预测结果。
[0082]
本发明通过温控模块3通过温度调节器进行变高档低档来调节试剂盒内的温度，同时温度调控3模块内还设置有微型风扇，协助调温；灭菌模块4通过小型压力泵将压力灌入灭菌罐，将灭菌液通过喷洒头均匀的对试剂盒进行灭菌；试剂存储模块5将检测完的试剂在模块所设置的存储格中单个封闭存储，保证试剂不会失效；显示模块8将检测试剂时试剂盒内的适宜温度和预测结果通过显示屏显示出来，便于工作人员记录数据。
[0083]
本发明通过试剂管理模块预先设置检测前列腺癌项目的试剂用量规则，在接收到检测前列腺癌项目的标本数量信息时能够根据对应的试剂用量规则自动计算检测前列腺癌项目的试剂需求总量和试剂的领取数量，可以准确确定检测前列腺癌试剂用量；同时，通过预测模块利用检测组织样本中mir-215-5p， mir-1283，mir-129-1-3p，mir-126-3p和mir-199b-5p的表达量，用于预测肿瘤顺铂敏感性，较目前其他预测顺铂敏感性的参数有着更高的准确性、稳定性和应用价值。
[0084]
如图3所示，本发明提供的试剂管理模块6管理方法如下：
[0085]
s201，构建规则管理数据库；接收检测前列腺癌项目的标本数量信息；从规则管理数据库中提取与所述检测前列腺癌项目对应的试剂用量规则；
[0086]
s202，根据所述试剂用量规则和所述标本数量信息，计算所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量；所述试剂用量规则包括通过基础设置界面预设的最优检测批次的标本数、检测前列腺癌项目的质控用量和定标用量、单个标本的检测用量以及试剂的损耗率；从试剂库存数据库中获取与所述检测前列腺癌项目对应的试剂库存信息；
[0087]
s203，根据所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量和所述试剂库存信息，确定试剂的领取数量；所述试剂库存信息包括试剂的入库时间、规格和库存数量，试剂的规格用于指示单位包装试剂的份量；将所述检测前列腺癌项目与所述试剂的库存信息及领取数量进行关联显示，并生成领料单；根据预设的试剂用量规则和所述标本数量信息，计算所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量；
[0088]
本发明通过试剂管理模块预先设置检测前列腺癌项目的试剂用量规则，在接收到检测前列腺癌项目的标本数量信息时能够根据对应的试剂用量规则自动计算检测前列腺癌项目的试剂需求总量和试剂的领取数量，可以准确确定检测前列腺癌试剂用量。
[0089]
计算所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量的公式为：
[0090][0091]
其中，n表示试剂需求总量，n表示标本数量信息，nmax表示最优检测批次的标本数，n1表示检测前列腺癌项目的质控用量，n2表示检测前列腺癌项目的定标用量，no表示单个标本的检测用量，α表示试剂的损耗率。
[0092]
本发明提供的根据所述检测前列腺癌项目的试剂需求总量和试剂库存信息，确定试剂的领取数量，包括如下步骤：
[0093]
按照试剂入库时间的先后顺序和规格的大小顺次，依次从所述检测前列腺癌项目的试剂库存信息中获取待分配试剂的库存信息；
[0094]
在每次获取到所述待分配试剂的库存信息时，通过如下公式计算所述检测前列腺癌项目对当前待分配试剂的需求数量m：m＝n/m，其中，n表示试剂需求总量，m表示当前待分配试剂的规格；
[0095]
在m≤mo的情况下，设定m为当前待分配试剂的领取数量；其中，mo表示当前待分配试剂的库存数量；
[0096]
在m》mo的情况下，设定mo为当前待分配试剂的领取数量，并根据所述当前待分配试剂的领取数量更新所述检测前列腺癌项目试剂需求总量，以计算所述检测前列腺癌项目对下一待分配试剂的需求数量，实现不同规格试剂领取数量的确定。
[0097]
本发明提供的将所述检测前列腺癌项目与所述试剂的库存信息及领取数量进行关联显示并生成领料单之后，还包括如下步骤：
[0098]
当接收到所述领料单的确认指令时，向供应链服务器转发所述领料单和备货指令以指示供应端进行物料准备；所述领料单的确认指令由输入设备输入；
[0099]
当获取到试剂的出库指令时，对所述试剂库存数据库中对应的试剂库存信息进行更新。
[0100]
在接收检测前列腺癌项目的标本数量信息之前，还包括如下步骤：
[0101]
通过扫描试剂的二维码标识信息来获取试剂的名称信息、规格和数量；所述二维码标识信息印设于试剂的包装盒上；
[0102]
将扫描时间设置为入库时间，并将所述入库时间与所述试剂的名称信息、规格和数量进行关联，生成对应的试剂库存信息。
[0103]
如图4所示，本发明提供的预测模块7预测方法如下：
[0104]
s301，获取肿瘤组织样本；使用mircutemirna提取分离试剂提取肿瘤组织样本中的mirna；mirna文库构建；
[0105]
s302，簇生成；采用truseqsrclusterkitv3-cbot-hs试剂完成；
[0106]
s303，illuminahiseq2000测序；hiseq2000上机，测序结果将原始数据转换成fastq格式；
[0107]
s304，数据分析。
[0108]
本发明通过预测模块利用检测组织样本中mir-215-5p，mir-1283， mir-129-1-3p，mir-126-3p和mir-199b-5p的表达量，用于预测肿瘤顺铂敏感性，较目前其他预测顺铂敏感性的参数有着更高的准确性、稳定性和应用价值。
[0109]
本发明提供的mirna文库构建：采用truseqmirnasampleprepkitv2试剂完成。
[0110]
本发明提供的数据分析方法：
[0111]
对原始fastq文件数据筛选质量可靠的测序片段；
[0112]
将测序结果与mirbase数据库比对过滤，鉴定出结果中的已知人的mirna 数据；
[0113]
根据鉴定的mirna进行表达量统计，mirna表达量计算采用tpm计算度量指标，tpm公式＝(每条mirna比对到的read数目)/(样本总比对read数目)
ꢀ×
106；
[0114]
将目的mirna的表达量进行相关计算，预测评分值＝
ꢀ‑
0.0061*mir-215+(-0.0011*mir-129-1-3p)+0.0120*mir-1283+(-0.0007*mir-126-3 p)+(-0.0088*mir-199b-5p)。
[0115]
本发明提供的当预测评分值《10，可认定该患者肿瘤组织对顺铂高度敏感；当预测评分值≥10并且≤27时，可认定该患者肿瘤组织对顺铂中度敏感；
[0116]
当预测评分值》27，可认定该患者肿瘤组织对顺铂不敏感。
[0117]
二、应用实施例。为了证明本发明的技术方案的创造性和技术价值，该部分是对权利要求技术方案进行具体产品上或相关技术上的应用实施例。
[0118]
本发明的工作原理：当试剂放到试剂盒中开始检测时，主控模块通过灭菌模块内的小型压力泵将压力灌入灭菌罐，将灭菌液通过喷洒头均匀的对试剂盒进行灭菌，温度检测模块检测出试剂盒内的温度并传输到主控模块，主控模块通过温控模块内的温度调节器进行变高档低档来调节试剂盒内的温度，同时温度调控模块内还设置有微型风扇，协助调温，将温度调到检测试剂的适宜温度，主控模块通过试剂管理模块和预测模块对试剂进行管理，预测出前列腺癌患者顺铂敏感性，并在显示模块上将试剂盒温度、预测结果显示出来，然后主控模块通过试剂存储模块在模块所设置的存储格中单个封闭存储，保证试剂不会失效。
[0119]
本发明通过试剂管理模块预先设置检测前列腺癌项目的试剂用量规则，在接收到检测前列腺癌项目的标本数量信息时能够根据对应的试剂用量规则自动计算检测前列腺癌项目的试剂需求总量和试剂的领取数量，可以准确确定检测前列腺癌试剂用量；同时，通过预测模块利用检测组织样本中mir-215-5p， mir-1283，mir-129-1-3p，mir-126-3p和mir-199b-5p的表达量，用于预测肿瘤顺铂敏感性，较目前其他预测顺铂敏感性的参数有着更高的准确性、稳定性和应用价值。
[0120]
应当注意，本发明的实施方式可以通过硬件、软件或者软件和硬件的结合来实现。硬件部分可以利用专用逻辑来实现；软件部分可以存储在存储器中，由适当的指令执行系统，例如微处理器或者专用设计硬件来执行。本领域的普通技术人员可以理解上述的设备和方法可以使用计算机可执行指令和/或包含在处理器控制代码中来实现，例如在诸如磁盘、cd或dvd-rom的载体介质、诸如只读存储器(固件)的可编程的存储器或者诸如光学或电子信号载体的数据载体上提供了这样的代码。本发明的设备及其模块可以由诸如超大规模集成电路或门阵列、诸如逻辑芯片、晶体管等的半导体、或者诸如现场可编程门阵列、可编程逻辑设备等的可编程硬件设备的硬件电路实现，也可以用由各种类型的处理器执行的软件实现，也可以由上述硬件电路和软件的结合例如固件来实现。
[0121]
三、实施例相关效果的证据。本发明实施例在研发或者使用过程中取得了一些积极效果，和现有技术相比的确具备很大的优势，下面内容结合试验过程的数据、图表等进行
描述。
[0122]
本发明通过试剂管理模块预先设置检测前列腺癌项目的试剂用量规则，在接收到检测前列腺癌项目的标本数量信息时能够根据对应的试剂用量规则自动计算检测前列腺癌项目的试剂需求总量和试剂的领取数量，可以准确确定检测前列腺癌试剂用量；同时，通过预测模块利用检测组织样本中mir-215-5p， mir-1283，mir-129-1-3p，mir-126-3p和mir-199b-5p的表达量，用于预测肿瘤顺铂敏感性，较目前其他预测顺铂敏感性的参数有着更高的准确性、稳定性和应用价值。
[0123]
以上所述，仅为本发明的具体实施方式，但本发明的保护范围并不局限于此，任何熟悉本技术领域的技术人员在本发明揭露的技术范围内，凡在本发明的精神和原则之内所作的任何修改、等同替换和改进等，都应涵盖在本发明的保护范围之内。