影响猪生长性状的SNP分子标记及应用

本发明涉及分子遗传及动物繁殖育种领域，特别涉及一种影响猪生长性状的snp分子标记及应用。

背景技术：

1、卵泡抑制素(follistatin,fst)是一种单链糖蛋白，也被称为卵泡休止素或者性激素抑制蛋白。1987年ueno等和robertgson等分别从猪和牛的卵泡液中获取了fst。fst是性腺功能的局部调节剂，是促卵泡激素(fsh)分泌的有力抑制剂。有研究证明fst基因在断奶-发情间隔期间是卵泡生长和功能的负调控因子；在围生期小鼠卵巢中的卵泡以及正在生长的卵泡的立方颗粒细胞中fst基因持续表达，fst288处理可延迟生殖细胞巢的分解，尤其是在卵巢周围附近，并显着降低原始卵泡的百分比，同时fst被证实在促进猪早期胚胎发育中起作用，通过促进初始卵裂时间并提高胚泡形成率，还可以提高胚泡质量。

2、近年来，关于fst在猪生长性状和繁殖方面均有一定研究，但在猪上的表达及多态性的研究并不多见，特别是尚未发现有关fst基因多态性与猪生长性状关联分析的报道。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种影响猪生长性状的snp分子标记及应用，以解决上述问题。

2、根据本发明的第一个方面，提供了一种影响猪生长性状的snp分子标记，含有该snp分子标记的基因片段如seq id no:1所示，在该基因片段中包括3个与猪生长性状相关的snp位点：在如seq id no:1所示序列中位于第85位点的用r表示的g＞a突变，位于第565位点的用s表示的a＞g突变，位于第1206位点的用k表示的t＞a突变。

3、在某些实施方式中，所述的3个snp位点为完全连锁遗传。

4、在某些实施方式中，所述的生长性状包括大白母猪如下性状：100千克眼肌厚、100千克背膘厚。

5、根据本发明的第二个方面，提供了一种snp分子标记在选育具备优势生长性状的猪上的应用，含有该snp分子标记的基因片段如seq id no:1所示，在该基因片段中包括3个与猪生长性状相关的snp位点：在如seq id no:1所示序列中位于第85位点的用r表示的g＞a突变，位于第565位点的用s表示的a＞g突变，位于第1206位点的用k表示的t＞a突变。

6、在某些实施方式中，在选育具备优势生长性状的猪上的应用的方法包括：

7、1)对猪仔检测如seq id no:1所示序列中第85、565和1206位点的snp分子标记；

8、2)选留步骤1)中检测得到的第85、565和1206的3个位点等位基因型为gg/aa/tt基因型的个体，进行繁育，即可得到具备优势生长性状的猪。

9、根据本发明的第三个方面，提供了一种snp分子标记在培育具备优势生长性状种猪品系上的应用，含有该snp分子标记的基因片段如seq id no:1所示，在该基因片段中包括3个与猪生长性状相关的snp位点：在如seq id no:1所示序列中位于第85位点的用r表示的g＞a突变，位于第565位点的用s表示的a＞g突变，位于第1206位点的用k表示的t＞a突变。

10、在某些实施方式中，在培育具备优势生长性状种猪品系上应用的方法包括：

11、1)对待留种的备选种猪检测如seq id no:1所示序列中第85、565和1206位点的分子标记；

12、2)选留步骤1)中检测得到的第85、565和1206的3个位点等位基因型为gg/aa/tt基因型的个体；

13、3)将步骤2)选留的个体作为种猪配种，进行繁育，培育出具备优势生长性状种猪品系。

14、根据本发明的第四个方面，提供了一种snp分子标记猪生长性状遗传改良上的应用，含有该snp分子标记的基因片段如seq id no:1所示，在该基因片段中包括3个与猪生长性状相关的snp位点：在如seq id no:1所示序列中位于第85位点的用r表示的g＞a突变，位于第565位点的用s表示的a＞g突变，位于第1206位点的用k表示的t＞a突变。

15、在某些实施方式中，猪生长性状遗传改良上的应用的方法包括：

16、1)对待留种的备选种猪检测如seq id no:1所示序列中第85、565和1206位点的分子标记；

17、2)选留步骤1)中检测得到的第85、565和1206的3个位点等位基因型为gg/aa/tt基因型的个体；

18、3)将步骤2)选留的个体作为种猪配种，后代继续选留gg/aa/tt基因型的猪，淘汰其他基因型猪，以逐代提高gg/aa/tt优势等位基因型的频率，从而改良和提高后代猪的生长性状。

19、本发明的有益效果：

20、1、获得在fst基因上与猪生长性状相关的3个snp位点，为后续的基因芯片研究和遗传育种奠定了应用基础。

21、2、将获得的3个snp位点应用于选育具备优势生长性状母猪上，可以在仔猪时期就可通过检测相应的snp位点碱基突变情况来选育具备优势生长性状母猪，可以大大提高选育效率，节约生产成本。

22、3、将获得的3个snp位点应用于培育具备优势生长性状种猪品系上，可以大大缩短育种年限，高效地获得具备相应优势生长性状种猪品系。

23、4、将获得的3个snp位点应用于生长性状遗传改良，可以改良猪品种尤其大白猪品种的生长性状，提高该品种猪的竞争力。

24、5、第85、565和1206位点的3个snp分子标记为完全连锁遗传，在基因芯片研究和后续遗传育种研究时，可以作为一个整体来进行研究，节约时间，加快效率。

技术特征：

1.影响猪生长性状的snp分子标记，其中，含有所述snp分子标记的基因片段如seq idno:1所示，在所述的基因片段中包括3个与猪生长性状相关的snp位点：在如seq id no:1所示序列中位于第85位点的用r表示的g＞a突变，位于第565位点的用s表示的a＞g突变，位于第1206位点的用k表示的t＞a突变。

2.根据权利要求1所述的snp分子标记，其中，所述的3个snp位点为完全连锁遗传。

3.根据权利要求1所述的snp分子标记，其中，所述的生长性状包括大白母猪如下性状中的一种或者多种的组合：100千克眼肌厚、100千克背膘厚。

4.权利要求1-3任一项所述的snp分子标记在选育具备优势生长性状的猪上的应用。

5.根据权利要求4所述的应用，其中，所述应用的方法包括：

6.权利要求1-3任一项所述的snp分子标记在培育具备优势生长性状种猪品系上的应用。

7.根据权利要求6所述的应用，其中，所述应用的方法包括：

8.权利要求1-3任一项所述的snp分子标记在猪生长性状遗传改良上的应用。

9.根据权利要求8所述的应用，其中，所述应用的方法包括：

技术总结
本发明公开了猪生长性状相关的SNP分子标记，含有该SNP分子标记的基因片段如SEQ ID NO:1所示，在该基因片段中包括3个与猪生长性状相关的SNP位点，包括：在SEQ ID NO:1所示序列中位于第85位点的用R表示的G＞A突变，位于第565位点的用S表示的A＞G突变，位于第1206位点的用K表示的T＞A突变。通过将获得的SNP分子标记应用于选育具备优势生长性状的猪、培育具备优势生长性状种猪品系、猪生长性状遗传改良等领域，可以提高猪的生长性能、并大大缩短育种年限，提高育种效率，加快猪的遗传改良进程。

技术研发人员：黄涛,李清春,张庆泽,和军飞,谢苏,孙晓梅,符彬彬,公红斌
受保护的技术使用者：石河子大学
技术研发日：
技术公布日：2024/1/12