一种筛选具有快速生长性能的红鳍东方鲀个体的育种方法

本发明属于鱼类遗传选育，具体涉及一种筛选具有快速生长性能的红鳍东方鲀个体的育种方法。

背景技术：

1、红鳍东方鲀(takifugu rubripes)属鲀形目(telraodontiformes)，东方鲀属(fugu)，以日本沿海为主要分布中心，在我国沿海野生群体较少且存在种质不纯；且其野生群体因受海洋污染等因素在缩减，故此其每年的捕捞量在逐渐减少。红鳍东方鲀肉质鲜嫩，营养丰富，素有“鱼类之王”的美称。虽然野生红鳍东方鲀其肝脏及卵巢等组织富含河鲀鱼毒素是很强烈的神经毒，但是其毒素制剂可以用于镇痛剂、麻醉剂等且价格昂贵。因此，此种鱼类具有较高的经济价值。目前红鳍东方鲀自然资源量下降严重，养殖规模虽然逐渐增大，而且在人工养殖过程中存在过种质退化现象。因此，选育出有优良生长性状的红鳍东方鲀品种是非常有必要。

2、现阶段普遍使用形态性状选择育种方法进行繁育工作，但实际上生长性状的遗传力在0.2左右，性状选择在子代中的效果并不理想，而分子标记辅助选择育种将大概率使优良性状完全遗传到子代并表达。但目前分子标记辅助选择育种最大的问题是缺乏有效的分子标记。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种筛选具有快速生长性能的红鳍东方鲀个体的育种方法，即通过与红鳍东方鲀体重、体长、体全长生长性状相关的snp位点来选育具有快速生长性状的红鳍东方鲀稚鱼和选配亲本，从而加快红鳍东方鲀的遗传选育速度。

2、本发明首先提供一种筛选具有快速生长性能的红鳍东方鲀个体的育种方法，是通过检测与红鳍东方鲀生长性状相关的snp位点的基因型进行筛选；

3、所述的snp位点，是位于序列为seq id no：1的核苷酸片段的第264位，其碱基为c或t。

4、gacattgaggaaaccaccagtagattgaaagatctggaccccgactgcctcatgcaaccctcactcttgtccgattgcacaccacccatttttagcttcagagatgatgactcaggtcgagctagctgctgtgaccctgatctttccagtgaaccagaggcctcaactgtccatccagcaattctaaatcaagtcatcaatcaaacattttgctcgacaggatgtgcgggctcaggtttgctgaatcagacccctaatgtgagcgagactgaaaccttggacagagaggcactgtatacccaagtgagtgaagtgaggtcaactggcaaggtgctactatctcccgagttggagaaaatcagcagcagcaaagggatgccattagagaacgagggtaaggacctccacatcttagtggtgaatgcgcatcatggcagtaatatggcaggaaatgtaagtcaaacatttcccagaccagacacgagtgaactttttgacagttctcatgcatccacctcacattcccatgaatcagatgccacctccaaccgccccgctcctgcctacactgtggtagatggtgtaagtgggc(seq idno:1)；

5、更进一步的，所述的基因型，是所述的snp位点的基因型为cc纯合型。

6、更进一步的，所述的方法是通过pcr产物测序分析待筛选的红鳍东方鲀个体，pcr产物进行测序分析后确定待检测个体的snp位点的基因型；

7、所述的pcr扩增方法，其中所使用的引物的序列信息如下：

8、f:5′-gacattgaggaaaccaccag-3′(seq id no:2)，

9、r:5′-gcccacttacaccatctacc-3′(seq id no:3)。

10、本发明通过分析位点基因型与红鳍东方鲀体重性状的相关性，发现红鳍东方鲀核苷酸序列seq id no：1的第264bp处碱基存在与体重性状相关的snp位点，基因型为cc纯合型个体的体重显著高于ct基因型个体体重性状的表型值(p<0.05)。并通过pcr产物测序法可快速鉴定对应性状。因此，生产中可优先选择该位点基因型为cc型个体作为亲本或进行规模养殖。

技术特征：

1.一种筛选具有快速生长性能的红鳍东方鲀个体的育种方法，其特征在于，所述的方法是通过检测与红鳍东方鲀生长性状相关的snp位点的基因型进行筛选；所述的snp位点，是位于序列为seq id no：1的核苷酸片段的第264位，其碱基为c或t。

2.如权利要求1所述的方法，其特征在于，所述的基因型，是所述的snp位点的基因型为cc纯合型。

3.如权利要求1或2所述的方法，其特征在于，所述的方法是通过pcr产物测序分析待筛选的红鳍东方鲀个体，pcr产物进行测序分析后确定待检测个体的snp位点的基因型。

4.如权利要求3所述的方法，其特征在于，所述的方法中pcr扩增方法所使用的引物的序列为seq id no:2和seq id no:3。

5.一种snp位点，其特征在于，所述的snp位点是位于序列为seq id no：1的核苷酸片段的第264位，其碱基为c或t。

6.权利要求5所述的snp位点在进行红鳍东方鲀遗传育种中的应用。

7.一种用于红鳍东方鲀育种的分子制品，其特征在于，所述制品中包含有用于检测权利要求5所述的snp位点的pcr扩增引物。

8.如权利要求7所述的分子制品，其特征在于，所述的pcr扩增引物，其序列为seq idno:2和seq id no:3。

技术总结
本发明提供一种红鳍东方鲀早期生长体重相关的SNP位点，所提供的SNP位点与红鳍东方鲀体重生长性状相关，可用于选育具有快速育肥性状的红鳍东方鲀稚鱼和选配亲本。本发明首先提供与红鳍东方鲀体重生长性状相关的SNP位点，所述的SNP位点位于序列为SEQ ID NO：1的核苷酸片段的第264位，其碱基为C或T。本发明通过分析位点基因型频率与红鳍东方鲀生长性状的相关性，发现红鳍东方鲀的GHR2基因的264碱基处存在与体重性状相关的SNP位点，基因型为CC纯合型个体的体重显著高于CT基因型个体体重性状的表型值(p<0.05)。因此，生产中可优先选择该位点基因型为CC型个体作为亲本或者进行规模养殖。

技术研发人员：王秀利,马文超,包玉龙,仇雪梅,刘圣聪
受保护的技术使用者：大连海洋大学
技术研发日：
技术公布日：2024/1/13