一种与刺参体色相关的基因组合及其应用的制作方法

本发明属于养殖动物育种标记筛选，具体涉及一种与刺参体色相关的基因组合及其应用。

背景技术：

1、刺参是具有独特养生保健和生态环保作用的高值海水养殖品种，在21世纪初引领了国内“第五次”海水养殖浪潮。繁荣发展的刺参增养殖产业,也为高质量刺参苗种生产带来了多元化与高标准的要求。面向未来,刺参养殖良种化是产业发展的必然方向,但当前我国刺参养殖整体仍表现为良种覆盖率低的特点。截至2022年，中国经全国水产原种与良种审定委员会审定的水产新品种共有266个，而刺参仅有8个新品种，比率仅占3％，且选育性状多关注生长速度与成活率等基础性状。与虾蟹鱼贝等养殖对象相比较,刺参良种选育工作整体呈现性状单一、性状高值化低的特点。刺参种业高质量发展既是刺参产业可持续发展的基础，也是今后实现刺参产业转型升级的关键突破口。提高刺参种业科技创新水平，面向刺参产业高质量发展方向与需求，研究刺参种业高质量发展关键路径与策略具有重要意义。

2、体色差异大是刺参重要特征之一，刺参的主要体色有青色、黑色和褐色，体色差异是影响刺参市场价格的最重要性状之一。分布于我国海域的刺参主要以青色、褐色为主，紫色十分罕见，经济价值极高，是刺参选育的重要方向。海参的生长发育受到温度盐度等多种环境因素的影响。不同体色海参对环境因子的耐受性存在显著差异。紫色刺参较常规青色、褐色刺参具有更宽的温度适应范围和更强的耐盐性，而白色刺参更耐高温，盐度耐受范围较窄。刺参环境适应性和物种稳定性的研究离不开色素沉着调控机制的解析，目前对刺参体色调控基因层面的研究刚刚起步，关键基因的挖掘仍然不够，主要关注点仍然停留在组织切片黑色素分析这种不全面的现象阶段。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种与刺参体色相关的基因组合及其应用，所提供的基因可用于刺参不同体色的筛选研究，为刺参育种筛选提供分子标记。

2、本发明所提供的与刺参体色相关的基因组合，其中包含有氨基酸序列为seq idno:1的tgfβ1基因，氨基酸序列为seq id no:2的tgfβ2基因、氨基酸序列为seq id no:3的activin b基因、氨基酸序列为seq id no:4的inhibin基因、氨基酸序列为seq id no:5的nodal基因、氨基酸序列为seq id no:6的gdf8基因、氨基酸序列为seq id no:7的bmp2基因、氨基酸序列为seq id no:8的bmp4基因、氨基酸序列为seq id no:9的bmp3/3b基因；

3、进一步的，所述的基因组合中还包含有氨基酸序列为seq id no:10的tgβr2基因、氨基酸序列为seq id no:11的tgβr3基因、氨基酸序列为seq id no:12的acvr2a基因、氨基酸序列为seq id no:13的bmpr2基因、氨基酸序列为seq id no:14的bmpr1b基因、氨基酸序列为seq id no:15的acvr1基因；

4、更进一步的，所述的基因组合中还包含有氨基酸序列为seq id no:16的smad1基因。

5、本发明另一个方面还提供上述的基因组合的一种用途，是在筛选检测不同体色刺参个体中的应用。

6、本发明还提供所述的与刺参体色相关的基因组合的另一个用途，是在调节刺参体色中的应用；

7、本发明还提供一种筛选不同体色刺参的方法，所述的方法是通过检测所述的基因组合中的任一个或几个基因的表达量来筛选；

8、本发明再一个方面还提供一种评价刺参体色相关饲料/养殖效果的方法，所述的方法是通过检测所述的基因组合中的任一个或几个基因的表达量来进行评价；

9、本发明再一个方面还提供一种检测上述基因组合中的基因的制品，所述的制品为基因芯片或引物组。

技术特征：

1.一种与刺参体色相关的基因组合，其特征在于，所述的基因组合中包含有氨基酸序列为seq id no:1的tgfβ1基因，氨基酸序列为seq id no:2的tgfβ2基因、氨基酸序列为seqid no:3的activin b基因、氨基酸序列为seq id no:4的inhibin基因、氨基酸序列为seqid no:5的nodal基因、氨基酸序列为seq id no:6的gdf8基因、氨基酸序列为seq id no:7的bmp2基因、氨基酸序列为seq id no:8的bmp4基因、氨基酸序列为seq id no:9的bmp3/3b基因。

2.如权利要求1所述的基因组合，其特征在于，所述的基因组合中还包含有氨基酸序列为seq id no:10的tgβr2基因、氨基酸序列为seq id no:11的tgβr3基因、氨基酸序列为seqid no:12的acvr2a基因、氨基酸序列为seq id no:13的bmpr2基因、氨基酸序列为seq idno:14的bmpr1b基因、氨基酸序列为seq id no:15的acvr1基因。

3.如权利要求1所述的基因组合，其特征在于，所述的基因组合中还包含有氨基酸序列为seq id no:16的smad1基因。

4.权利要求1-3任一项所述的基因组合在筛选检测不同体色刺参个体中的应用。

5.权利要求1-3任一项所述的基因组合在调节刺参体色中的应用。

6.一种筛选不同体色刺参的方法，所述的方法是通过检测权利要求1-3任一项所述的基因组合中的任一个或几个基因的表达量来进行筛选。

7.一种评价刺参体色相关饲料/养殖效果的方法，其特征在于，所述的方法是通过检测权利要求1-3任一项所述的基因组合的任一个或几个基因的表达量来进行评价。

8.一种检测权利要求1-3任一项所述的基因组合中的基因的制品，其特征在于，所述的制品为基因芯片或引物组。

技术总结
本发明提供一种与刺参体色相关的基因组合及其应用，所提供的基因可用于刺参不同体色的筛选研究，为刺参育种筛选提供分子标记。本发明所提供的与刺参体色相关的基因组合，其中包含有氨基酸序列为SEQ IDNO:1的TGFβ1基因，氨基酸序列为SEQ ID NO:2的TGFβ2基因、氨基酸序列为SEQ ID NO:3的Activin B基因、氨基酸序列为SEQ ID NO:4的Inhibin基因、氨基酸序列为SEQ ID NO:5的Nodal基因、氨基酸序列为SEQ ID NO:6的GDF8基因、氨基酸序列为SEQ ID NO:7的BMP2基因、氨基酸序列为SEQ ID NO:8的BMP4基因、氨基酸序列为SEQ ID NO:9的BMP3/3B基因，本发明另一个方面还提供上述的基因组合的一种用途，是在筛选检测不同体色刺参个体中的应用。

技术研发人员：姚琳琳,赵斌,李成林,王琦,胡炜,韩莎,姜旭阳
受保护的技术使用者：山东省海洋科学研究院（青岛国家海洋科学研究中心）
技术研发日：
技术公布日：2024/1/12