本发明属于生物检测,具体涉及一种与虹鳟热应激相关的mirna标志物及其应用。
背景技术:
1、热应激,表示生物体在高温下的非特异性生理反应,应激导致系统的生理和生物化学变化,它导致代谢失衡,破坏组织和器官。最近热应激在动物福利和健康方面的作用受到了相当大的关注。热应激会诱发复杂的反应,细胞中的热应激适应是一个复杂的多基因调控步骤。热应激改变了热休克蛋白的水平,这是参与生物体内细胞活动的关键分子伴侣。mirnas是内源性的、非编码的rna(长度为21-23个核苷酸),显示出高度保守的进化。它们通过作用于目标基因的orf区域、3'-utr和5'-utr来促进目标基因的降解或抑制其翻译,从而调节基因水平。mirnas调节与不同细胞过程有关的不同基因水平,并在转录后水平上进行控制。mirna与复杂的生理事件如细胞发育、生长、分化、凋亡和免疫反应有关。此外,高度保守的哺乳动物mirnas针对数百个mrnas调节不同的重要生物事件。
2、虹鳟是一种经济型的冷水鱼。它的适宜生长温度为12℃~18°c,因此对高温敏感。暴露在25℃水温下的虹鳟肝细胞出现了坏死和凋亡的病理改变。现有的mir-8159-x过表达组荧光素酶活性下调且差异不显著,且对虹鳟肝细胞凋亡不具有促进作用。
技术实现思路
1、本发明的目的在于提供一种mir-8159-x过表达组荧光素酶活性下调且差异显著,且对虹鳟肝细胞凋亡具有促进作用的虹鳟热应激相关的mirna标志物及其应用。
2、为了实现上述发明目的,本发明采用以下技术方案:
3、一种与虹鳟热应激相关的mirna标志物,包括细胞转染、双荧光素酶报告基因检测、细胞增殖、细胞凋亡、转染mir-8159-x热应激下hsp90a1 mrna检测、转染mirna后热应激处理、rt-qpcr检测hsp90a1 mrna表达、转染mir-8159-x后western blot检测hsp90a1蛋白表达,所述rt-qpcr检测hsp90a1 mrna表达步骤为:向虹鳟肝细胞中转染mir-8159-x模拟物、mir-8159-x抑制物以及阴性对照,待48h稳定后,热处理4、8、12、24、48h后收集细胞提取rna,检测hsp90a1 mrna相对表达量。
4、作为优选,所述细胞转染包括如下步骤:
5、1)转染前先接种细胞到96孔板,接种方法同上细胞传代方法;
6、2)待细胞接种后生长密度达到80%-90%时,进行转染;
7、3)转染前将上述各组重组质粒与转染试剂按照1:1比例混合制备复合物,用移液器吹吸10~15次混匀,室温静置10~15min;
8、4)将上述复合物加入到有完全培养基的hek 293t细胞中,置于37℃,5%co2培养箱培养;
9、5)对细胞进行24h换液及后续实验处理。
10、作为优选,所述双荧光素酶报告基因检测包括如下步骤:
11、1)将转染的96孔板从培养箱中取出,放置10min使培养板平衡至室温;
12、2)向96孔培养箱各孔加入与培养基等体积的萤火虫荧光素酶检测试剂,混合均匀;
13、3)避光静置15min,待细胞充分裂解后,在酶标仪上检测萤火虫荧光素酶发光信号;
14、4)从酶标仪取出,向各孔加入与初始培养基体积相同的海肾荧光素酶检测试剂,在水平摇床上混合均匀;
15、5)避光静置15min后,在酶标仪上检测海肾荧光素酶发光信号;
16、6)计算各孔萤火虫荧光素酶信号/海肾荧光素酶酶信号的比值,比值的大小反应了双荧光素酶活性的大小。
17、作为优选,所述细胞凋亡包括如下步骤:
18、1)将细胞收集于1.5ml离心管内,离心弃上清;
19、2)细胞沉淀用0.8ml细胞染色缓冲液重悬细胞;
20、3)加入5ul hoechst染色液;
21、4)加入5ul pi染色液;
22、5)混匀,冰浴或4℃孵育20-30min;
23、6)用流式细胞仪检测红色荧光和蓝色荧光。
24、作为优选,所述转染mir-8159-x热应激下hsp90a1 mrna检测步骤为:将mir-8159-x模拟物、mir-8159-x抑制物以及阴性对照分别转染至虹鳟原代肝细胞中,待48h转染稳定后,将其转移至24℃中热处理4、8、12、24、48h,然后通过rt-qpcr和western blot方法检测每个时间点hsp90a1 mrna表达量和蛋白表达量,以此来验证热应激下mir-8159-x对靶基因hsp90a1 mrna和蛋白的表达的影响。
25、作为优选,所述转染mirna后热应激处理包括如下步骤:
26、1)将消化好的细胞均匀地铺在12孔板中,待细胞长满至60%-70%开始转染;
27、2)将mir-8159-x模拟物、mir-8159-x抑制物、mir-8159-x阴性对照分别转染进虹鳟原代肝细胞中放入18℃、5%co2培养箱中待48h稳定后进行下一步操作;
28、3)更换新的培养基后将细胞转移至24℃、5%co2培养箱中开始热应激处理;
29、4)分别在热处理4、8、12、24、48h收集细胞;
30、5)将收集好的细胞提取rna和蛋白。
31、与现有技术相比,本发明的有益效果是:
32、1)本发明中的mir-8159-x过表达组荧光素酶活性下调且差异显著,mir-8159-x与hsp90a1存在靶向关系。
33、2)本发明中mir-8159-x过表达组靶基因hsp90a1的表达水平均显著降低48.05%(p<0.05);mir-8159-x被抑制后,靶基因hsp90a1的表达水平升高1.17倍(p>0.05),说明mir-8159-x对hsp90a1具有负调控作用。
34、3)本发明中mir-8159-x对虹鳟肝细胞凋亡具有促进作用,mir-8159-x对hsp90a1蛋白的表达也具有负调控作用,但滞后于mrna表达。
1.一种与虹鳟热应激相关的mirna标志物,包括细胞转染、双荧光素酶报告基因检测、细胞增殖、细胞凋亡、转染mir-8159-x热应激下hsp90a1mrna检测、转染mirna后热应激处理、rt-qpcr检测hsp90a1mrna表达、转染mir-8159-x后westernblot检测hsp90a1蛋白表达,其特征在于所述rt-qpcr检测hsp90a1mrna表达步骤为:向虹鳟肝细胞中转染mir-8159-x模拟物、mir-8159-x抑制物以及阴性对照,待48h稳定后,热处理4、8、12、24、48h后收集细胞提取rna,检测hsp90a1mrna相对表达量。
2.根据权利要求1所述的一种与虹鳟热应激相关的mirna标志物,其特征在于所述细胞转染包括如下步骤:
3.根据权利要求1所述的一种与虹鳟热应激相关的mirna标志物,其特征在于所述双荧光素酶报告基因检测包括如下步骤:
4.根据权利要求1所述的一种与虹鳟热应激相关的mirna标志物,其特征在于所述细胞凋亡包括如下步骤:
5.根据权利要求1所述的一种与虹鳟热应激相关的mirna标志物,其特征在于所述转染mir-8159-x热应激下hsp90a1mrna检测步骤为:将mir-8159-x模拟物、mir-8159-x抑制物以及阴性对照分别转染至虹鳟原代肝细胞中,待48h转染稳定后,将其转移至24℃中热处理4、8、12、24、48h,然后通过rt-qpcr和westernblot方法检测每个时间点hsp90a1mrna表达量和蛋白表达量,以此来验证热应激下mir-8159-x对靶基因hsp90a1mrna和蛋白的表达的影响。
6.根据权利要求1所述的一种与虹鳟热应激相关的mirna标志物,其特征在于所述转染mirna后热应激处理包括如下步骤: