本发明属于辐射生物剂量,具体涉及一种检测辐射损伤dna拷贝数变异的方法及其用途。
背景技术:
1、dna是辐射作用的靶分子,dna拷贝数变异(copy number variation,cnv)是dna突变的一种重要形式,一定程度上会引起细胞甚至是机体产生一系列应激反应。电离辐射诱发的dna拷贝数变异可作为一种潜在检测受照剂量的指标。在受照早期,错误的dna拷贝没有及时修复,该错误将长期在基因组中存在。相关技术对cnv的检测包括基于芯片的比较基因组杂交(array-based comparative genomic hybridization,acgh)、单核苷酸多态性-微阵列(snp-array)、基于二代测序的cnv分析、多重连接探针扩增技术(multiplexligation-dependent probe amplification,mlpa)等。这些方法复杂,检测成本高,且对dna拷贝数变异的检测准确度不高。
技术实现思路
1、针对现有技术所存在的上述技术问题,本发明的目的在于提供一种速度快、通量高,取样量少准确度高可确定辐射损伤dna拷贝数变异的方法及其用途。
2、为实现上述发明目的,本发明采用的技术方案如下:一种检测辐射损伤dna拷贝数变异的方法,包含以下步骤:
3、(1)抽取外周静脉血,对抽取的外周静脉血进行不同剂量的辐射照射,得到辐射损伤的外周静脉血样品;
4、(2)提取上述样品dna,进行测序及生物信息分析,筛选出实验组和对照组的dna拷贝数变异;
5、(3)对筛选出实验组和对照组进行数字pcr检测得到辐射损伤dna拷贝数变异14q32.33区段464bp。
6、进一步地,所述步骤(1),抽取健康成年男性外周静脉血于真空edta抗凝管,辐射照射剂量率为0.5gy/min,源皮距80cm,照射野30×30cm。
7、进一步地,所述步骤(1),所述辐射损伤是60coγ射线照射形成。
8、进一步地,所述步骤(2),参考基因组版本为grch37(hg19)。
9、进一步地,所述步骤(3),所述pcr检测的上游引物、下游引物、探针序列分别为5'-attcactcgggagaccacct-3'、5'-tgcacagttcctacaacagacc-3'、5'-ataccccgaacgac-3'。
10、本发明还提供了一种辐射损伤dna拷贝数变异的用途,所述辐射损伤dna拷贝数变异用于辐射照射的敏感生物学指标。
11、本发明还提供了一种辐射损伤dna拷贝数变异的用途,所述辐射损伤dna拷贝数变异用作检测辐射损伤的试剂盒。
12、本发明还提供了一种辐射损伤dna拷贝数变异的用途,所述辐射损伤dna拷贝数变异用作回顾性剂量估算的生物学指标。
13、采用本发明的技术方案带来的有益效果是,一种检测辐射损伤dna拷贝数变异的方法,对抽取的人体外周血进行辐射照射,对辐射照射后的样品进行测序及生物信息分析筛选辐射损伤相关dna拷贝数变异,利用数字pcr验证得到辐射损伤的dna拷贝数变异14q32.33区段464bp;本发明的方法得到的dna拷贝数变异与染色体畸变存在相关性,且具有一定的时间依赖关系和剂量依赖关系;且dna拷贝数变异14q32.33区段464bp具有剂量依赖关系。本发明的方法简单,能够快速准确的得到辐射损伤的dna拷贝数变异,可将得到的dna拷贝数变异用于辐射照射的敏感生物学指标及、检测辐射损伤的试剂盒及回顾性剂量估算的生物学指标。
1.一种检测辐射损伤dna拷贝数变异的方法,其特征是,包含以下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种检测辐射损伤dna拷贝数变异的方法,其特征是,所述步骤(1),抽取健康成年男性外周静脉血于真空edta抗凝管,辐射照射剂量率为0.5gy/min,源皮距80cm,照射野30×30cm。
3.根据权利要求1所述的一种检测辐射损伤dna拷贝数变异的方法,其特征是,所述步骤(1),所述辐射损伤是60coγ射线照射形成。
4.根据权利要求1所述的一种检测辐射损伤dna拷贝数变异的方法,其特征是,所述步骤(2),参考基因组版本为grch37(hg19)。
5.根据权利要求1所述的一种检测辐射损伤dna拷贝数变异的方法,其特征是,所述步骤(3),所述pcr检测的上游引物、下游引物、探针序列分别为5'-attcactcgggagaccacct-3'、5'-tgcacagttcctacaacagacc-3'、5'-ataccccgaacgac-3'。
6.根据权利要求1~5任一项所述的辐射损伤dna拷贝数变异的用途,其特征是:所述辐射损伤dna拷贝数变异用于辐射照射的敏感生物学指标、生物剂量回顾、检测辐射损伤的试剂盒。
7.根据权利要求1所述的辐射损伤dna拷贝数变异的用途,其特征是:dna拷贝数变异14q32.33区段464bp用于辐射照射的敏感生物学指标。
8.根据权利要求1所述的辐射损伤dna拷贝数变异的用途,其特征是:dna拷贝数变异14q32.33区段464bp用作检测辐射损伤的试剂盒。
9.根据权利要求1所述的辐射损伤dna拷贝数变异的用途,其特征是:dna拷贝数变异14q32.33区段464bp用于回顾性剂量估算的生物学指标。