心律失常性右心室心肌病标志物及其筛选方法和应用

本发明涉及生物信息学，具体涉及心律失常性右心室心肌病标志物及其筛选方法和应用。

背景技术：

1、心律失常性右心室心肌病(arrhythmogenic right ventricularcardiomyopathy,arvc)是一种以室性心律失常、心肌细胞间质脂肪组织浸润、纤维组织增生并逐步取代心肌细胞为特征的原发性心肌病。arvc是一种原发性心肌病，以右心室功能障碍和室性心律失常为特征，临床症状常表现为心悸、晕厥，临床常表现为室性心律失常、心源性猝死和/或心力衰竭，频发室性早搏、短时室性心动过速或持续性单形室性心动过速伴左束支传导阻滞形态的室性心律失常是arvc显性心律失常的早期主要临床表现。

2、arvc的致病原因，目前已提出多种理论包括发育不良学说，炎症学说，基因突变及干扰信号通路假说。基因突变学说发现arvc以常染色体显性遗传多见，典型arvc与编码桥粒蛋白的基因发生突变有关。

3、编码桥粒蛋白的基因突变在arvc的病程发展中发挥了作用，结合桥粒蛋白的基因和arvc靶向基因，筛选获得心律失常性右心室心肌病的标志物对于丰富arvc的诊断药剂和治疗药物的种类意义重大。

技术实现思路

1、为筛选出与心律失常性右心室心肌病相关的靶向基因，以达到丰富arvc的诊断试剂或治疗药物种类，本发明提供了心律失常性右心室心肌病标志物及其筛选方法和应用，通过生物信息学方法筛选出了arvc标志物，能够作为心律失常性右心室心肌病的基因标志物，能够用于制备arvc的诊断试剂和治疗arvc的药物。

2、本发明的第一个目的是提供了心律失常性右心室心肌病标志物，所述心律失常性右心室心肌病标志物为flnc、ldb3、ttn、lmna、tmem43、dsc2、pkp2、mybpc3、tnnt2、rbm20、myh7、scn5a、ryr2、dsg2、actc1和tpm1中的一种或几种。

3、本发明的第二个目的是提供了检测上述标志物的试剂在制备心律失常性右心室心肌病诊断产品中的应用。

4、进一步地，所述诊断产品包括但不限于检测试剂、试剂盒和药剂。

5、本发明的第三个目的是提供了上述标志物的调节剂在制备治疗心律失常性右心室心肌病药物中的应用。

6、本发明的第四个目的是提供了心律失常性右心室心肌病标志物的筛选方法，包括如下步骤：

7、s1，基因库数据筛选：在genecards数据库中选择心律失常性右心室心肌病相关的基因和桥粒蛋白相关的基因，筛选出心律失常性右心室心肌病和桥粒蛋白相关的基因的共有基因，即靶向基因；

8、s2，构建s1筛选获得的靶向基因的ppi蛋白互作网络分析，划分hub基因集群，依据degree值筛选出hub基因，即为心律失常性右心室心肌病标志物。

9、进一步地，s1中，具体筛选过程为：在genecards数据库中分别搜索“arrhythmogenic right ventricular cardiom-yopathy”及“desmosomes”导出心律失常性右心室心肌病相关基因的数据1及桥粒蛋白相关基因的数据2，在venny2.1在线工具中筛选数据1与数据2的共同基因，然后导入string在线数据库，生物体选择“homo sapiens”，进行搜索，将最低交互要求分数设置为0.400，隐藏无任何交集的蛋白，获取关键靶点基因，即靶向基因。

10、进一步地，s2中，根据ppi网络评分筛选出degree值高的数据，获得hub基因。

11、进一步地，s2中，运用cytoscape中的mcode插件进行ppi网络评分。

12、与现有技术相比，本发明的有益效果在于：

13、1、本发明采用生物信息学方法筛选获得了心律失常性右心室心肌病标志物，包括flnc、ldb3、ttn、lmna、tmem43、dsc2、pkp2、mybpc3、tnnt2、rbm20、myh7、scn5a、ryr2、dsg2、actc1和tpm1中的一种或几种，检测上述基因标志物的试剂能用于制备心律失常性右心室心肌病的诊断试剂；

14、调节上述基因标志物的试剂能用于制备治疗或预防心律失常性右心室心肌病的药物。

技术特征：

1.心律失常性右心室心肌病标志物，其特征在于，所述标志物为flnc、ldb3、ttn、lmna、tmem43、dsc2、pkp2、mybpc3、tnnt2、rbm20、myh7、scn5a、ryr2、dsg2、actc1和tpm1中的一种或几种。

2.检测权利要求1所述的标志物的试剂在制备心律失常性右心室心肌病诊断产品中的应用。

3.根据权利要求2所述的标志物的试剂在制备心律失常性右心室心肌病诊断产品中的应用，其特征在于，所述诊断产品包括但不限于检测试剂、试剂盒和药剂。

4.权利要求1所述的标志物的调节剂在制备治疗心律失常性右心室心肌病药物中的应用。

5.权利要求1所述的心律失常性右心室心肌病标志物的筛选方法，其特征在于，包括如下步骤：

6.根据权利要求5所述的心律失常性右心室心肌病标志物的筛选方法，其特征在于，s1中，具体筛选过程为：在genecards数据库中分别搜索“arrhythmogenic rightventricular cardiom-yopathy”及“desmosomes”导出心律失常性右心室心肌病相关基因的数据1及桥粒蛋白相关基因的数据2，在venny2.1在线工具中筛选数据1与数据2的共同基因，然后导入string在线数据库，生物体选择“homo sapiens”，进行搜索，将最低交互要求分数设置为0.400，隐藏无任何交集的蛋白，获取关键靶点基因，即靶向基因。

7.根据权利要求5所述的心律失常性右心室心肌病标志物的筛选方法，其特征在于，s2中，根据ppi网络评分筛选出degree值高的数据，获得hub基因。

8.根据权利要求5所述的心律失常性右心室心肌病标志物的筛选方法，其特征在于，s2中，运用cytoscape中的mcode插件进行ppi网络评分。

技术总结
本发明涉及生物信息学技术领域，具体公开了心律失常性右心室心肌病标志物及其筛选方法和应用，通过在Genecards数据库中选择相关基因和筛选，最终获得的与桥粒蛋白相关的关键基因。本发明筛选获得的心律失常性右心室心肌病标志物FLNC、LDB3、TTN、LMNA、TMEM43、DSC2、PKP2、MYBPC3、TNNT2、RBM20、MYH7、SCN5A、RYR2、DSG2、ACTC1和TPM1中的一种或几种，在诊断产品和药物制备方面都有潜在应用。

技术研发人员：唐任宽,杨丽,曾玉洁,张尚俣,金鹏跃,孙秋霞
受保护的技术使用者：重庆医科大学
技术研发日：
技术公布日：2024/1/15