本发明涉及生物,特别是涉及一种与鸡产蛋量相关的分子标记及其应用。
背景技术:
1、产蛋性状是鸡繁殖性能育种的重要指标,复杂且由多种高度相关的因素控制,但遗传因素在产蛋性状中起着决定性的作用。因此研究影响产蛋性状的遗传因素,将大大提高鸡的繁殖性能,促进家禽的保护、开发和利用。筛选鸡产蛋量相关的分子标记,能够为鸡生产性能的选育提供直接依据。
2、江西省优质地方品种康乐黄鸡至今已有1700余年饲养历史,以喙黄、脚黄、皮毛黄为主要特征,体型中等,胴体丰满,耐粗饲。但其生长缓慢,性成熟晚,饲养成本高,导致其在现代商业化的家禽生产竞争中处于非常不利的位置。
3、如果能够从康乐黄鸡的产蛋规律及其相关基因入手,筛选产蛋量相关的遗传标记,通过分子选育的方法,获得生产性能好的个体,将有效缩短育种进程,可为鸡的分子辅助选育积累理论基础,为鸡的饲养管理提供数据,对江西地方鸡种的保护和利用是非常必要的。
技术实现思路
1、本发明的目的是提供一种与鸡产蛋量相关的分子标记及其应用,以解决上述现有技术存在的问题,该分子标记与鸡产蛋量性状相关,可用于鸡产蛋性状早期选择,从而有利于减少鸡产蛋性状的育种时间,降低育种成本,具有很高的应用价值。
2、为实现上述目的,本发明提供了如下方案:
3、本发明提供一种与鸡产蛋量相关的分子标记,所述分子标记的核苷酸序列如seqid no.1所示;所述分子标记的437bp处碱基存在一个snp位点,为a/g突变。
4、进一步地,所述snp位点的基因型为aa或ga。
5、本发明还提供一种扩增上述的分子标记的引物对,所述引物对包括如seq idno.2所示的上游引物和如seq id no.3所示的下游引物。
6、本发明还提供上述的引物对在制备鉴定鸡产蛋量性状的试剂盒中的应用。
7、本发明还提供一种鉴定鸡产蛋量性状的试剂盒,包括上述的引物对。
8、本发明还提供上述的分子标记、引物对或试剂盒在鉴定鸡产蛋量性状中的应用。
9、本发明还提供一种鉴定鸡产蛋量性状的方法,包括以下步骤:
10、(1)获取待测鸡个体的dna,并将其作为模板,pcr扩增得到包含chr3:81190436位点的dna片段;
11、(2)鉴定所述dna片段在chr3:81190436位点的基因型,当所述待测鸡个体的基因型为aa时,产蛋量性状优于ga。
12、进一步地,在步骤(1)中,所述pcr扩增采用上述的引物对。
13、进一步地,在步骤(1)中,所述pcr扩增的反应体系为:dna 1-2μl,2×pcr mix 7.5μl,混合引物2μl,h2o补至15μl。
14、进一步地,在步骤(1)中,所述pcr扩增的反应程序为:95℃3min;94℃15s,55℃15s,72℃30s,72℃3min,20个循环。
15、本发明公开了以下技术效果:
16、本发明以chr3:81190436位点为分子标记检测该位点在地方鸡种中的多态性,并分析其与产蛋性状的关系,筛选出了优势基因型,为地方鸡种选育及标记辅助选择提供依据。这种选育方法相较于现在的表型数据选育,不仅成本低、操作简便,并且结果准确。将snp位点检测用于开展鸡产蛋性状早期选择,可以缩短培育周期、加快培育进程,从而减少鸡产蛋性状的育种时间,降低育种成本,具有很高的应用价值。
1.一种与鸡产蛋量相关的分子标记,其特征在于,所述分子标记的核苷酸序列如seqid no.1所示;所述分子标记的437bp处碱基存在一个snp位点,为a/g突变。
2.根据权利要求1所述的分子标记,其特征在于,所述snp位点的基因型为aa或ga。
3.一种扩增如权利要求1所述的分子标记的引物对,其特征在于,所述引物对包括如seq id no.2所示的上游引物和如seq id no.3所示的下游引物。
4.一种如权利要求3所述的引物对在制备鉴定鸡产蛋量性状的试剂盒中的应用。
5.一种鉴定鸡产蛋量性状的试剂盒,其特征在于,包括权利要求3所述的引物对。
6.一种如权利要求1或2所述的分子标记、如权利要求3所述的引物对或如权利要求5所述的试剂盒在鉴定鸡产蛋量性状中的应用。
7.一种鉴定鸡产蛋量性状的方法,其特征在于,包括以下步骤:
8.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,在步骤(1)中,所述pcr扩增采用如权利要求3所述的引物对。
9.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,在步骤(1)中,所述pcr扩增的反应体系为:dna1-2μl,2×pcrmix7.5μl,混合引物2μl,h2o补至15μl。
10.根据权利要求7所述的方法,其特征在于,在步骤(1)中,所述pcr扩增的反应程序为:95℃3min;94℃15s,55℃15s,72℃30s,72℃3min,20个循环。