与小麦籽粒葡萄糖产量性状相连锁的分子标记、及其特异性引物和应用

本申请涉及分子标记领域，具体涉及与小麦籽粒葡萄糖产量性状相连锁的分子标记、及其特异性引物和应用。

背景技术：

1、小麦是中国白酒和酿造大曲的主要原粮之一，谷物中葡萄糖的产量是酒精产量的关键。因此，具有籽粒高葡萄产量性状的材料对酿酒和制曲小麦的筛选工作具有重要意义。

2、目前对小麦葡萄糖的了解多以品质方面，主要用于小麦淀粉工业以小麦淀粉为原料，生产淀粉深加工产品。有关基因型对葡萄糖产量影响的研究相对较少，有关于基因调控对葡萄糖最终产量影响方面的研究尚不清楚，目前了解到不同品种小麦基因型与环境互作对葡萄糖产量有显著或极显著影响，只表明以小麦原粮生产葡萄糖时需要优良品种类型与适宜栽培区域相结合。因此选育具有籽粒较高葡萄糖产量性状的品种，能够对小麦酿造提供相应保障，所以鉴定和验证有关小麦籽粒葡萄糖产量性状基因是至关重要的。

3、利用全基因组关联分析对籽粒葡萄糖产量性状基因进行精确定位，将有具有高籽粒葡萄糖产量性状基因材料进行筛选并有效利用。snp标记技术与dna微阵列和芯片技术的结合，使snp标记技术成为继rflp和ssr标记之后最有前途的第三代分子标记。并在遗传图谱构建、种质资源分析和生物多样性检测、连锁不平衡的关联分析等农作物育种领域发挥着重要作用。

技术实现思路

1、为了解决上述问题，本申请的发明人提出并完成了本发明。

2、本发明的目的是提供及与小麦籽粒葡萄糖产量性状相连锁的分子标记的分子标记。

3、本发明的再一目的是提供上述与小麦籽粒葡萄糖产量性状基因相连锁的分子标记的应用。

4、本发明的再一目的是提供一种鉴定小麦籽粒葡萄糖产量性状品种的方法。

5、根据发明的多个与小麦籽粒葡萄糖产量性状基因相连锁的分子标记，通过使用kasp引物kasp-ax-111191751、kasp-ax-108772957和kasp-ax-108764386分型而得，其定位分别在2a和2b染色体上，物理距离均为1.927mb。

6、所述的kasp引物分别由以下引物组成：

7、kasp-ax-111191751：

8、正向引物a：5’-gaaggtgaccaagttcatgctaggccctgcaccccatcactc-3’,

9、正向引物b:5’-gaaggtcggagtcaacggattaggccctgcaccccatcactt-3’,

10、反向引物:5’-acacgccgagaaccacgcta-3’。

11、kasp-ax-108772957：

12、正向引物a：5’-gaaggtgaccaagttcatgctcacgaaactaagcatttacggtcc-3’,

13、正向引物b:5’-gaaggtcggagtcaacggattcacgaaactaagcatttacggtct-3’,

14、反向引物:5’-gcacatctatcttaaggtttctagtttc-3’。

15、kasp-ax-108764386：

16、正向引物a：5’-gaaggtgaccaagttcatgctacgtatgcatgttaaacc-3’,

17、正向引物b:5’-gaaggtcggagtcaacggattacgtatgcatgttaaact-3’,

18、反向引物:5’-taaaccgccagtattacct-3’。

19、根据本发明的具体实施方式，使用由77份四川地方小麦品种和156份四川育成小麦品种构成的233份四川小麦种质群体，通过snp标记鉴定结果和表型数据进行全基因组关联分析定位，获得了3个与小麦高籽粒葡萄糖产量性状基因连锁的标记：kasp-ax-111191751、kasp-ax-108772957和kasp-ax-108764386，通过检测3个分子标记的分型结果，结合籽粒葡萄糖产量性状的表型数据，该3个标记均可应用于小麦高籽粒葡萄产量性状品种的辅助选择育种。

20、根据本发明的鉴定小麦高籽粒葡萄产量性状基因的方法，所述方法包括使用kasp引物扩增待检测材料的步骤，其中，所述kasp引物包括：

21、kasp-ax-111191751：

22、正向引物a：5’-gaaggtgaccaagttcatgctaggccctgcaccccatcactc-3’,

23、正向引物b:5’-gaaggtcggagtcaacggattaggccctgcaccccatcactt-3’,

24、反向引物:5’-acacgccgagaaccacgcta-3’。

25、kasp-ax-108772957：

26、正向引物a：5’-gaaggtgaccaagttcatgctcacgaaactaagcatttacggtcc-3’,

27、正向引物b:5’-gaaggtcggagtcaacggattcacgaaactaagcatttacggtct-3’,

28、反向引物:5’-gcacatctatcttaaggtttctagtttc-3’。

29、kasp-ax-108764386：

30、正向引物a：5’-gaaggtgaccaagttcatgctacgtatgcatgttaaacc-3’,

31、正向引物b:5’-gaaggtcggagtcaacggattacgtatgcatgttaaact-3’,

32、反向引物:5’-taaaccgccagtattacct-3’。

33、fam信号标记与正向引物a相连，hex信号与正向引物b相连。kasp-ax-111191751中蓝色荧光类型1，携带籽粒葡萄糖产量性状基因，能够明显提高小麦籽粒葡萄糖的产量；橙黄色荧光为类型2，不携带籽粒葡萄糖产量性状基因。kasp-ax-108772957中橙黄色荧光类型1，携带籽粒葡萄糖产量性状基因，能够明显提高小麦籽粒葡萄糖的产量；蓝色荧光为类型2，不携带籽粒葡萄糖产量性状基因。kasp-ax-108764386中橙黄色荧光类型1，携带籽粒葡萄糖产量性状基因，能够明显提高小麦籽粒葡萄糖的产量；蓝色荧光为类型2，不携带籽粒葡萄糖产量性状基因。

34、本发明的积极性效果及应用如下：

35、本发明获得的与高籽粒葡萄糖产量性状基因紧密连锁的分子标记，是在对我国四川地区的地方品种和育成品种组成的四川种质群体的籽粒葡萄糖产量性状进行全基因组关联分析获得的多个新标记，这些标记靠近籽粒葡萄糖产量性状的有关基因或直接定位于相关基因上，重复性好，稳定性强，可以用于小麦籽粒葡萄糖产量性状的鉴定和筛选制曲酿酒小麦专用型的品种，进而为原粮或育种亲本的选择提供分子技术支撑。

技术特征：

1.与小麦籽粒葡萄糖产量性状基因相连锁的分子标记的特异性引物组，其特征在于，所述引物组包括以下引物对，

2.权利要求1所述与小麦籽粒葡萄糖产量性状基因相连锁的分子标记的特异性引物组用于鉴定小麦籽粒葡萄糖产量性状的应用。

3.一种鉴定小麦籽粒葡萄糖产量性状基因的方法，其特征在于，所述方法包括使用kasp引物组扩增待检测材料的步骤，其中，所述kasp引物组包括以下引物对组成：

4.根据权利要求3所述的鉴定小麦籽粒葡萄糖产量性状基因的方法，其特征在于，各所述正向引物a和所述正向引物b连接有发光不同的荧光信号。

5.根据权利要求3所述的鉴定小麦籽粒葡萄糖产量性状基因的方法，其特征在于，所述方法包括判断扩增产物的基因型的步骤，其中，

技术总结
本发明涉及遗传育种领域，具体涉及与小麦籽粒葡萄糖产量性状相连锁的分子标记、及其特异性引物和应用。本发明获得的与籽粒葡萄糖产量性状基因紧密连锁的分子标记，是在对我国四川地区的地方品种和育成品种组成的四川种质群体的籽粒葡萄糖产量性状进行全基因组关联分析(GWAS)获得的多个新标记，这些标记靠近籽粒葡萄糖产量性状的有关基因或直接定位于相关基因上，重复性好，稳定性强，可以用于小麦籽粒葡萄糖产量性状的鉴定和筛选制曲酿酒小麦专用型的品种，进而为原粮或育种亲本的选择提供分子技术支撑。

技术研发人员：李伟,李佳敏,刘志勇,宁佳鑫,周会娴,李柯逸,蒲至恩,马建,陈国跃,江千涛,王际睿,魏育明,郑有良
受保护的技术使用者：四川农业大学
技术研发日：
技术公布日：2024/1/13