本发明实施例涉及生物,具体涉及一种减少气溶胶污染的重组bst-ung酶及其编码基因。
背景技术:
1、环介导等温扩增(loop-mediated isothermal amplification,lamp)是notomi等人于2000年提出来的一种新的核酸扩增技术,已被广泛地应用于病原微生物检测和传染性疾病诊断等领域。反应原理为,当fip的f2区与靶dna的f2c区结合并启动互补链合成时,扩增开始,然后f3引物结合到靶dna的f3c区并延伸,置换fip连接的互补链。这条互补的链在5'端形成一个环作为bip的模板。b2结合到到模板dna的b2c区域。dna合成开始形成互补链并打开5'端环。随后,b3结合到靶dna的b3c区域并延伸,取代bip连接的互补链。这样会形成一个哑铃状dna。核苷酸通过bstdna聚合酶添加到f1的3'端,其延伸并打开5'端的环。哑铃形状的dna现在被转化为茎环结构,该结构用作lamp循环的引发剂,开始lamp反应的第二阶段,用于lamp的指数扩增。获得的最终产物是具有不同茎长度的茎环dna和具有多个环的各种花头菜样结构的混合物。
2、由于lamp反应自身灵敏度较高,容易受到气溶胶的污染,出现检测假阳性。鉴于此,特提出本发明。
技术实现思路
1、为此,本发明实施例提供一种减少气溶胶污染的重组bst-ung酶。cod ung酶能够选择性水解双链或单链dna中尿嘧啶与脱氧核糖之间的n-糖苷键,形成缺失一个碱基位点(无嘧啶)的dna链,在碱性溶液及高温条件下会进一步水解断裂,从而被完全水解;且codung酶对rna中的尿嘧啶无活性。本发明将bst dna聚合酶和ung酶进行融合,一次性加入表达的酶可以减少加入试剂的次数,从而减少气溶胶污染。
2、为了实现上述目的,本发明实施例提供如下技术方案:
3、根据本发明实施例的第一方面,提供一种编码减少气溶胶污染的重组bst-ung酶的基因,所述基因的核苷酸序列包括:
4、用于编码bst dnapolⅰ蛋白的如seq id no:1所示的核苷酸序列;和,
5、用于编码cod ung蛋白的如seq id no:2所示的核苷酸序列。
6、bst dna聚合酶大片段(bst dna polⅰ)是bacillus stearothermophilus dna聚合酶的一部分,来源于e.coli菌株,利用基因重组技术,在大肠杆菌中进行表达后经多次纯化分离而得,该酶具有5'→3'dna聚合酶活性,但不具有5'→3'外切核酸酶活性。发明人发现,将bst dnapolⅰ核苷酸序列中51a>c(seq id no:1),能够增加bst dnapolⅰ5'→3'dna聚合酶活性,提高扩增效率,缩短反应时间,最大程度减少气溶胶污染。
7、进一步地,所述seq id no:1所示的核苷酸序列和seq id no:2所示的核苷酸序列通过柔性linker融合连接,所述柔性linker的核苷酸序列为:ggcggcggcggcagcggcggcggcggctcg。
8、根据本发明实施例的第二方面,提供一种减少气溶胶污染的重组bst-ung酶,所述重组bst-ung酶由如上所述的基因编码得到。
9、根据本发明实施例的第三方面,提供一种表达载体,所述表达载体含有如上所述的基因。
10、根据本发明实施例的第四方面,提供一种宿主细胞,所述宿主细胞含有如上所述的基因,或如上所述的表达载体。
11、根据本发明实施例的第五方面,提供如上所述的基因、如上所述的重组bst-ung酶、如上所述的表达载体,或如上所述的宿主细胞在环介导等温扩增中的应用。
12、本发明实施例具有如下优点:
13、本发明提供的重组bst-ung酶可以很好的扩增lamp反应,能有效增加聚合酶的扩增效率,与此同时,一次性加入表达的酶可以减少添加试剂的次数,减少长时间开盖引起的气溶胶污染可能性,最大程度防止气溶胶污染。
1.一种编码减少气溶胶污染的重组bst-ung酶的基因,其特征在于,所述基因的核苷酸序列包括:
2.根据权利要求1所述的编码减少气溶胶污染的重组bst-ung酶的基因,其特征在于,所述seq id no:1所示的核苷酸序列和seq id no:2所示的核苷酸序列通过柔性linker融合连接,所述柔性linker的核苷酸序列为:ggcggcggcggcagcggcggcggcggctcg。
3.一种减少气溶胶污染的重组bst-ung酶,其特征在于,所述重组bst-ung酶由权利要求1或2所述的基因编码得到。
4.一种表达载体,其特征在于,所述表达载体含有如权利要求1或2所述的基因。
5.一种宿主细胞,其特征在于,所述宿主细胞含有如权利要求1或2所述的基因,或如权利要求4所述的表达载体。
6.权利要求1或2所述的基因、权利要求3所述的重组bst-ung酶、权利要求4所述的表达载体,或权利要求5所述的宿主细胞在环介导等温扩增中的应用。