本发明涉及基因工程,尤其涉及一种与猪肌内脂肪沉积负相关的mirna及其应用。
背景技术:
1、随着生活水平的提高,人们对肉品质也有了较高的要求。肌内脂肪(intramuscular fat,简称imf)是衡量猪肉风味和嫩度的重要经济指标。提高imf含量,改善猪肉品质在猪肉生产和消费过程中具有重要意义。imf含量与多个肉质性状相关,包括嫩度、多汁性、风味和系水力。3%-4%的imf含量是肉用型猪的理想值,imf含量低于2.5%则肌肉口感变差,但自二十世纪七十年代以来,国内外育种工作者对高瘦肉率的追求,导致瘦肉型猪的imf含量降至1.5%,猪肉品质急剧下降。提高肌内脂肪含量已成为猪生产中所面临的一个严峻问题。因此,增加肌内脂肪沉积一直是猪品系选育的重要目标之一。
2、mirnas(micrornas)是长度为18-25个核苷酸的ncrna,通过与靶基因的3’-utr区结合,抑制蛋白翻译或降解mrna来调节靶基因的表达。在猪脂肪分化的研究中,mirna已被广泛报道为脂肪发育的重要调控因子。
技术实现思路
1、为了解决现有技术存在的问题,本发明提供一种与猪肌内脂肪沉积负相关的mirna及其应用。
2、通过高通量测序获得与主选性状及其关键基因相关的mirna作为分子标记,可以实现目标性状的早期选择,加快遗传选择进展。本发明采用差速贴壁法分离猪背最长肌中的肌内前体脂肪细胞,随后采用鸡尾酒法诱导分化肌内前体脂肪细胞,收集分化不同时期的细胞进行全转录组测序,筛选在猪肌内前体脂肪分化过程中表达量高、表达量差异显著、靶基因与脂肪沉积密切相关的mirna,最终得到一种和动物肌内脂肪沉积有关的mirna。
3、第一方面,本发明提供一种mirna,包括如下核苷酸序列:
4、uggaagacuagugauuuuguuguu。
5、第二方面,本发明提供一种茎环引物,包括:
6、ggtcgtatgcaaagcagggtccgaggtatccatcgcacgcatcgcactgcatacgaccaacaacaaaa。
7、在本发明的一种实施方式中,本发明提供一种生物材料,所述生物材料包括所述mirna,所述生物材料为表达盒、载体或转基因细胞。
8、在本发明的一种实施方式中,本发明提供一种试剂盒,所述试剂盒包括所述的mirna,或所述的茎环引物,或所述的生物材料。
9、第三方面,本发明提供所述的mirna,或所述的茎环引物,或所述的生物材料,或所述的试剂盒在靶向脂肪沉积调控因子klf4中的应用。
10、在本发明的一种实施方式中,本发明提供所述的mirna,或所述的茎环引物,或所述的生物材料,或所述的试剂盒在调控动物肌内的脂肪沉积中的应用。
11、在本发明的一种实施方式中,所述调控动物肌内的脂肪沉积为负调控动物的肌内脂肪沉积。
12、在本发明的一种实施方式中,通过提高所述动物体内所述的mirna的表达水平,降低所述动物肌肉内脂肪的水平;或通过降低动物体内所述的mirna的表达水平,提高动物肌肉内脂肪的水平。
13、在本发明的一种实施方式中,本发明提供所述的mirna,或所述的茎环引物,或所述的生物材料,或所述的试剂盒在调控动物肌内前体脂肪细胞的分化中的应用。
14、在本发明的一种实施方式中,所述调控动物肌内前体脂肪细胞的分化包括:
15、通过提高所述动物体内所述的mirna的表达水平,抑制所述动物肌内前体脂肪细胞的分化;或通过降低动物体内所述的mirna的表达水平,促进所述动物肌内前体脂肪细胞的分化。
16、本发明研究发现,调整该mirna的表达水平可以影响猪肌内前体脂肪细胞的分化,进而影响肌内脂肪的含量。
17、在本发明的一种实施方式中,所述动物为哺乳动物,优选为猪。
18、本发明具备如下有益效果:
19、本发明通过高通量测序技术和mirna-mrna联合分析,筛选到调控脂肪沉积调控因子klf4的一种mirna,通过过表达该mirna,可以显著降低动物肌肉内的脂肪水平,这可能是通过抑制多种脂肪分化因子,促进脂解因子的表达实现的。而若是抑制该mirna的表达,则相应地可以提高动物肌肉内的脂肪水平。本发明提供的mirna可以应用于动物育种中,调控动物的肌肉中的脂肪含量,尤其是应用于猪的育种,其对于养猪产业具有重要价值。
1.一种mirna,其特征在于,包括如下核苷酸序列:
2.一种茎环引物,其特征在于,包括:
3.一种生物材料,其特征在于,包括如权利要求1所述的mirna,所述生物材料为表达盒、载体或转基因细胞。
4.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括如权利要求1所述的mirna,或权利要求2所述的茎环引物,或权利要求3所述的生物材料。
5.权利要求1所述的mirna,或权利要求3所述的生物材料,或权利要求4所述的试剂盒在靶向脂肪沉积调控因子klf4中的应用。
6.权利要求1所述的mirna,或权利要求3所述的生物材料,或权利要求4所述的试剂盒在调控动物肌内脂肪沉积中的应用。
7.根据权利要求6所述的应用,其特征在于,所述调控动物肌内脂肪沉积为负调控动物的肌内脂肪沉积。
8.根据权利要求6或7所述的应用,通过提高所述动物体内如权利要求1所述的mirna的表达水平,降低所述动物肌肉内脂肪的水平;或通过降低动物体内如权利要求1所述的mirna的表达水平,提高动物肌肉内脂肪的水平。
9.权利要求1所述的mirna,或权利要求3所述的生物材料,或权利要求4所述的试剂盒在调控动物肌内前体脂肪细胞的分化中的应用。
10.根据权利要求5-9任一项所述的应用,其特征在于,所述动物为哺乳动物,优选为猪。