本发明涉及生物医学，具体为idh野生型胶质母细胞瘤患者的预后方法。
背景技术：
1、idh野生型胶质母细胞瘤是一种恶性程度极高的肿瘤，累及中枢神经系统，患者的中位生存期通常为15～18个月，由于目前临床治疗方法的局限，准确预测患者的生存期有助于临床医生决定采取相对保守或激进的治疗策略，从而在更大程度上使患者获益。目前，准确预测idh野生型胶质母细胞瘤患者预后是极具挑战的。
2、现有的技术方案包括通过影像组学或二代测序等技术构建预后模型。二代测序技术直接检测肿瘤组织的基因表达水平，具有易于操作的特征，更加受到临床医生的青睐。我们前期的meta分析发现目前存在三个基于转录组数据构建的idh野生型胶质母细胞瘤预后模型，包括模型1(基于mrna表达，pmid：31632497)、模型2(基于mrna表达，pmid：31921684)，以及模型3(基于lncrna表达，pmid：32851059)，这些预后预测模型均通过cox-ph模型或结合lasso算法筛选具有预后价值的基因主要效应，并将筛选结果组合构建模型，现均已发表sci论文。
3、目前已经发表的3个idh野生型胶质母细胞瘤存在的技术缺点包括：1.缺乏模型的外部验证(如模型3)，导致模型过度拟合，对随机人群的预测效率可能被高估；2.模型的预测效率不高，并且只有单一的评估方式(如计算曲线下面积auc)，影响模型的稳健性(如模型1和模型2)；3.只关注基因的主要效应。
4、而经研究发现将经过标准化后的两个基因的表达量的乘积作为基因-基因相互作用的度量，可以用于构建稳健的预测模型(pmid：35436725)，且这种方式显著提高了候选基因的数量而大幅增加适用于各个数据集的候选基因，故而用以解决idh野生型胶质母细胞瘤患者的预后预测难题。
技术实现思路
1、(一)解决的技术问题
2、针对现有技术的不足，本发明提供了idh野生型胶质母细胞瘤患者的预后方法，具备预测效率高且成本低等优点，解决了预测效率不佳且影响模型稳健性的问题。
3、(二)技术方案
4、为实现上述预测效率高且成本低目的，本发明提供如下技术方案：idh野生型胶质母细胞瘤患者的预后方法，包括以下步骤：
5、s1，对原发idh野生型胶质母细胞瘤肿瘤组织进行基因panel的rna-seq或基因芯片测序，检测的基因包括：rit2，oas1，hoxa5，mllt11，slc1a2，fam189a2，loxl1，ncapg，c21orf62，golga8a，ube2s，nrxn1。对于rna-seq测序的样本，是将得到基因表达的count值标准化为tpm值，然后进行对数转化，即log(tpm+1)，然后依次计算gg score和covprigrna-seq评分，后者即为患者的最终得分，计算公式为：
6、gg score＝0.518×rit2+0.170×oas1-0.135×rit2×oas1-0.935×hoxa5
7、-0.322×mllt11+0.178×hoxa5×mllt11-0.318×slc1a2-0.623
8、×fam189a2+0.163×slc1a2×fam189a2+0.846×loxl1+0.593
9、×ncapg-0.253×loxl1×ncapg-0.479×c21orf62-0.570
10、×golga8a+0.166×c21orf62×golga8a-0.399×ube2s-1.032
11、×nrxn1+0.254×ube2s×nrxn1
12、covprigrna-seq＝1.101×ggscore+0.042×age；
13、s2，对于芯片测序的患者，只需要将基因的表达量做对数转换后计算gg score和covprigmicroarray评分，计算公式如下：
14、gg score＝0.435×rit2+0.394×oas1-0.056×rit2×oas1-0.734×hoxa5
15、-0.472×mllt11+0.074×hoxa5×mllt11-0.483×slc1a2-0.558
16、×fam189a2+0.076×slc1a2×fam189a2+0.480×loxl1+0.313
17、×ncapg-0.066×loxl1×ncapg-0.479×c21orf62-0.541
18、×golga8a+0.064×c21orf62×golga8a-0.682×ube2s-0.717
19、×nrxn1+0.104×ube2s×nrxn1
20、covprigmicroarray＝0.535×ggscore+0.025×age
21、优选的，所述步骤s1中rna-seq或者芯片测序，可以依据步骤s1中公式：covprigrna-seq＝1.101×ggscore+0.042×age或covprigmicroarray＝0.535×gg score+0.025×age，对患者进行评分，当rna-seq测序患者评分高于-1.175认为具有高死亡风险，当芯片测序患者评分高于-0.942认为具有高死亡风险，而对于高风险患者，依据患者的年龄、经济状况、自身及家属医院等可予以更激进或保守的治疗，使患者的临床获益最大化。
22、(三)有益效果
23、与现有技术相比，本发明提供了idh野生型胶质母细胞瘤患者的预后方法，具备以下有益效果：
24、1、该idh野生型胶质母细胞瘤患者的预后方法，通过对原发idh野生型胶质母细胞瘤肿瘤组织进行基因panel的rna-seq或基因芯片测序，计算covprig评分，可以有效的评估基因表达量，在为患者提供稳健的预测结果的同时显著降低检测成本。
25、2、该ldh野生型胶质母细胞瘤患者的预后方法，由于数据规模较大，为模型的稳健性提供保障；经过多种现有统计参数的检验，较现有预后模型更全面；统计分析发现我们的模型的有效性超过了模型1/2/3，预测能力优秀；且通过检测少数基因的表达来准确判断患者的预后，相对于常规的全部(20000)种基因测序更经济。
1.idh野生型胶质母细胞瘤患者的预后方法，其特征在于，包括以下步骤：
2.根据权利要求1所述的idh野生型胶质母细胞瘤患者的预后方法，其特征在于：所述步骤s1中rna-seq或者芯片测序，可以依据步骤s1中公式：covprigrna-seq＝1.101×ggscore+0.042×age，对患者进行评分，当rna-seq测序患者评分高于-1.175认为具有高死亡风险，当芯片测序患者评分高于-0.942认为具有高死亡风险。对于高风险患者，依据患者的年龄、经济状况、自身及家属医院等可予以更激进或保守的治疗，使患者的临床获益最大化。