本发明涉及高通量测序,具体为一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法。
背景技术:
1、随着社会的发展,生活水平的提高,人们也越来越重视自己的身体健康。但是众多疾病却也一直威胁着人类的健康,影响人们的生活质量,像癌症,虽然医护人员可以从历史诊断的信息中判断出癌症,但是这是需要处理大量的信息和数据集合,那么如何有效并正确检测出癌症并进行相关治疗,成为了一项很重要的技术之一。又因为现实存在大量的医学数据信息,那么如何从中选出出重要的数据信息,来进行癌症检测是非常重要的。因此有必要从大量的医学数据中剔除掉噪音信息和冗余信息,筛选出重要的样本学习模型,来进行有效检测。
2、专利公告号为cn109360656b的发明专利公开了一种基于多目标演化算法的癌症检测方法,包括:通过多目标进化算法筛选初始癌症数据集,得到癌症检测数据模型;通过多目标集成算法提高癌症检测数据模型的准确度,得到癌症检测集成数据模型;通过癌症检测集成数据模型对目标癌症数据集进行癌症检测。如此,大大提升第一前沿面上的解的压缩率,同时提升分类准确度,采用了多目标集成来提升算法性能,大大降低了所选出来的集成模型数目,通过多目标集成,进一步提升算法对癌症样本的分类准确度。
3、虽然上述专利能够降低所选出来的集成模型数目,通过多目标集成,进一步提升算法对癌症样本的分类准确度,但是在具体检测过程中,一般引用高通量测序提高测量效率,但是现有的测量进针对样本出具常规测量报告,检测过程中若出现检测失误或样本污染,则需要重新进行取样操作,同时并不能直接在检测过程中出具建议性治疗手段,从而导致检测效果不佳。
技术实现思路
1、针对现有技术的不足,本发明提供了一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,解决了上述背景技术中提出的问题。
2、为实现以上目的,本发明通过以下技术方案予以实现:一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,包括以下步骤:
3、步骤一:取样,使用切割手术刀对患者肿大的淋巴结处进行切片取样,同时将取出的初始样品放入生理盐水中进行初始样本的储存;
4、步骤二:样本稀释,将步骤一中生理盐水中的初始样本放入稀释液中稀释,并且使用精细切刀在电子显微镜下对初始样本进行分切,获得数量为初始样本十倍的稀释样本;
5、步骤三:样本储存,将步骤二中取得的稀释样本放入冷藏装置内部进行储存,并且控制冷藏装置的温度为抑制细胞分裂的温度;
6、步骤四:样本检测,将步骤三中储存的十份稀释样本进行依次检测,具体检测过程如下:
7、s1:将扩增微球固定在玻璃基板上形成高通量的阵列;
8、s2:将通用引物与连在微球上的dna文库模板杂交,然后进行一系列的连接反应,每个连接反应都发生在dna延伸链和带有荧光标记的单链八核苷酸探针池中的某一探针之间;
9、s3:八核苷酸探针的碱基与特定的荧光颜色有明确的对应关系,经过一系列复杂的连接,酶切和下一引物结合的反应循环后,获取荧光图象,即可根据碱基与荧光之间的对应关系读出dna序列信息,进而获得癌细胞数量;
10、步骤五:将步骤四中每个稀释样本中检测出的癌细胞数量进行统计,并将癌细胞数量记为csfc,并且预先统计步骤二中电子显微镜下各个样本中的细胞具体数量,同时将各个样本中的细胞具体数量记为ksfc;
11、步骤六:对步骤五中获取的癌细胞和所有细胞数量参照以下公式进行计步骤七:对步骤六中获取的癌细胞占比量psfc进行评级,评级标准如下:算:psfc=csfc/ksfc,(psfc为癌细胞的占比量);算:psfc=csfc/ksfc,(psfc为癌细胞的占比量);
12、步骤七:对步骤六中获取的癌细胞占比量psfc进行评级,评级标准如下:
13、第一级:psfc大于等于0.6小于1,则代表样本中的细胞癌变严重,需针对性进行强治疗;
14、第二级:psfc大于等于0.4小于0.6,则代表样本中的细胞癌变较重,需选择性进行强治疗;
15、第三级:psfc大于等于0.2小于0.4,则代表样本中的细胞癌变强度中等,需选择性进行中等强度治疗;
16、第四级:psfc大于等于0.01小于0.2,则代表样本中的细胞癌变强度较弱,需针对性选择化疗和药疗;
17、步骤八:根据步骤七所定义的淋系血液癌症等级制定治疗方案进行针对性治疗,通过对样本进行稀释可以提高单份样本的检测次数,从而可以提高对样本的检测精度,避免因为检测失误导致的重复取样,提高检测效率,同时针对癌细胞的占比情况对各样本进行评级有利于针对不同情况的患者指定不同的治疗方案,从而提高医疗资源的利用率,防止医疗资源被浪费。
18、优选的,所述步骤一中的生理盐水为0.9%浓度的氯化钠溶液,并且该生理盐水的温度为35.5℃-37.2℃。
19、优选的,所述步骤二中的稀释液主要成分为冰醋酸、亚甲基蓝,且稀释液的总量为步骤一中生理盐水总量的十倍。
20、优选的,所述步骤二中的对初始样本进行分切过程中,使用精细切刀对初始样本中的多余组织进行剔除。
21、优选的,所述步骤三中的样本储存过程中,记录稀释样本储存的时间,后续根据癌细胞和普通细胞分裂速度进行稀释样本中各细胞含量的相应删减,通过低温环境对样本的储存,可以平衡快速取样和慢速检测之间的时间差,从而使得取出的样本能够得到很好的储存,防止取出的样本出现快速裂导致后续检测时样本的严重误差,同时利用电子显微镜可以避免精细切刀和细胞数量计算出现较大偏差,提高数据准确度。
22、优选的,所述步骤四中的玻璃基板包含多个分隔区域,且每个分隔区域内部均设有不超过两份稀释样本,避免稀释样本之间互相污染影响检测结果。
23、优选的,所述步骤七中的癌细胞占比量评级通过书面报告或电子报告的形式导出,且参照评级内容定义附上治疗指导建议。
24、优选的,对所述步骤七中评级后等级为第一级和第四级的患者进行二次取样检测,以确保数据精确性。
25、本发明提供了一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法。具备以下有益效果:
26、该基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,通过对样本进行稀释可以提高单份样本的检测次数,从而可以提高对样本的检测精度,避免因为检测失误导致的重复取样,提高检测效率,同时针对癌细胞的占比情况对各样本进行评级有利于针对不同情况的患者指定不同的治疗方案,从而提高医疗资源的利用率,防止医疗资源被浪费。
27、该基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,通过低温环境对样本的储存,可以平衡快速取样和慢速检测之间的时间差,从而使得取出的样本能够得到很好的储存,防止取出的样本出现快速分裂导致后续检测时样本的严重误差,同时利用电子显微镜可以避免精细切刀和细胞数量计算出现较大偏差,提高数据准确度。
1.一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,其特征在于:包括以下步骤:
2.根据权利要求1所述的一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,其特征在于:所述步骤一中的生理盐水为0.9%浓度的氯化钠溶液,并且该生理盐水的温度为35.5℃-37.2℃。
3.根据权利要求2所述的一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,其特征在于:所述步骤二中的稀释液主要成分为冰醋酸、亚甲基蓝,且稀释液的总量为步骤一中生理盐水总量的十倍。
4.根据权利要求3所述的一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,其特征在于:所述步骤二中的对初始样本进行分切过程中,使用精细切刀对初始样本中的多余组织进行剔除。
5.根据权利要求4所述的一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,其特征在于:所述步骤三中的样本储存过程中,记录稀释样本储存的时间,后续根据癌细胞和普通细胞分裂速度进行稀释样本中各细胞含量的相应删减。
6.根据权利要求5所述的一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,其特征在于:所述步骤四中的玻璃基板包含多个分隔区域,且每个分隔区域内部均设有不超过两份稀释样本,避免稀释样本之间互相污染影响检测结果。
7.根据权利要求6所述的一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,其特征在于:所述步骤七中的癌细胞占比量评级通过书面报告或电子报告的形式导出,且参照评级内容定义附上治疗指导建议。
8.根据权利要求7所述的一种基于高通量测序研发的淋系血液癌症的检测方法,其特征在于:对所述步骤七中评级后等级为第一级和第四级的患者进行二次取样检测,以确保数据精确性。