海岛棉高光效渐渗片段的分子标记及应用

本发明公开分子标记和应用，涉及植物遗传育种及核酸鉴定，具体地说是海岛棉高光效渐渗片段的分子标记及应用。

背景技术：

1、光合作用是决定棉花产量的最关键因素，同时冠层结构的优化对提高棉花的群体光合速率具有重要意义。目前缺乏鉴定能提高棉花光合速率，又能同时优化棉花冠层结构的种质资源的方法，不利于对棉花进行优良育种，进而限制棉花产量提高。

技术实现思路

1、本发明针对现有技术的问题，提供海岛棉高光效渐渗片段的分子标记及应用，通过本发明获得的分子标记可筛选高光效渐渗片段，用于获得优秀的种质资源，同时可对种质资源的高光效基因进行鉴定。

2、本发明提出的具体方案是：

3、本发明提供海岛棉高光效渐渗片段，所述海岛棉高光效渐渗片段来自于海岛棉pima10-53，通过20个indel分子标记进行鉴定：

4、使用所述20个indel分子标记引物扩增棉花基因组dna，同时含有20个indel分子标记位点的染色体片段为海岛棉高光效渐渗片段，所述indel分子标记为ind_u13_3、ind_u13_4、ind_u13_5、ind_u13_6、ind_u13_7、ind_u12_10、ind_u12_11、ind_u10_1、ind_u7_1、ind_u6_1、ind_u5_1、ind_u4_1、ind_u3_1、ind_u2_1、ind_u1_2、ind_d1_2、ind_d2_1、ind_d2_3、ind_d2_4和ind_d2_5，所述indel分子标记引物序列如下表：

5、

6、本发明还提供海岛棉高光效渐渗片段的分子标记引物，所述分子标记引物序列分别如下表：

7、

8、本发明还提供海岛棉高光效渐渗片段的分子标记，由所述的分子标记引物扩增形成。

9、本发明还提供海岛棉高光效渐渗片段的分子标记数据库，包括所述的分子标记的数据。

10、本发明还提供所述的分子标记引物、所述的分子标记和所述的分子标记数据库在制备鉴定具有高光效渐渗片段的棉花种质资源的试剂中的用途。

11、本发明还提供一种试剂盒，包含所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记和/或所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记引物。

12、进一步，所述的一种试剂盒，还包括所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记引物的pcr扩增体系所需试剂。

13、本发明还提供所述的海岛棉高光效渐渗片段片段在增加棉花光合速率及优化棉花冠层结构育种中的应用。

14、本发明还提供一种鉴定棉花种质资源具有海岛棉高光效渐渗片段的方法：

15、s1：获取待鉴定棉花种质资源的dna；

16、s2：通过所述分子标记引物进行pcr扩增；

17、s3：对s2获得的pcr扩增产物进行测序并与所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记数据库比对，匹配成功则待鉴定棉花种质资源具有海岛棉高光效渐渗片段。

18、本发明的有益之处是：

19、可利用本发明所提供分子标记及其引物鉴定所构建的近等基因系是否存在海岛棉pima10-53高光效渐渗片段，并进一步为研究渐渗系的高光效特性提供了理想材料，进一步应用于分子标记辅助选择棉花育种，可针对性选择含有海岛棉pima10-53高光效渐渗片段的品系，缩短育种周期，加快优质新品种的培育进程，提高棉花光合效率，优化冠层结构，提高生物量和产量。

技术特征：

1.海岛棉高光效渐渗片段，其特征是所述海岛棉高光效渐渗片段来自于海岛棉品系pima10-53，通过20个indel分子标记进行鉴定：

2.海岛棉高光效渐渗片段的分子标记引物，其特征是所述分子标记引物序列分别如下表：

3.海岛棉高光效渐渗片段的分子标记，其特征是由权利要求2所述的分子标记引物扩增形成。

4.海岛棉高光效渐渗片段的分子标记数据库，其特征是包括权利要求3所述的分子标记的数据。

5.权利要求2所述的分子标记引物、权利要求3所述的分子标记和权利要求4所述的分子标记数据库在制备鉴定具有高光效渐渗片段的棉花种质资源的试剂中的用途。

6.一种试剂盒，其特征是包含权利要求3所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记和/或权利要求2所述海岛棉高光效渐渗片段的分子标记引物。

7.权利要求1所述的海岛棉高光效渐渗片段在增加棉花光合速率及优化棉花冠层结构育种中的应用。

8.一种鉴定棉花种质资源具有海岛棉高光效渐渗片段的方法：

技术总结
本发明公开海岛棉高光效渐渗片段的分子标记及应用，涉及植物遗传育种及核酸鉴定技术领域；利用本发明所提供分子标记及其引物鉴定所构建的近等基因系是否存在海岛棉高光效渐渗片段，并进一步为研究渐渗系的高光效特性提供了理想材料，进一步应用于棉花分子育种，能极大地提高棉花光合效率，优化冠层结构，提高生物量和产量，并且本发明所提供的海岛棉高光效渐渗片段的20个InDel分子标记及其引物能大大提高棉花高光效基因的选择效率，通过分子标记辅助目标片段选择，具有早期鉴定、快速鉴定及其稳定性高等特点，加快棉花新品种培育与种子产业化进程。

技术研发人员：姜辉,赵军胜,房健,高明伟,王秀丽,张超,柴启超,王永翠,王家宝,李艳丽,陈莹,刘晓艳,张晓明
受保护的技术使用者：山东省农业科学院
技术研发日：
技术公布日：2024/1/16