抗新型冠状病毒RBD蛋白的抗体或其抗原结合片段及其应用的制作方法

本发明属于新型冠状病毒感染疾病预防/治疗药物，具体涉及一种抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或其抗原结合片段及其应用。

背景技术：

1、

2、对于sars-cov-2感染所致疾病的预防/治疗，中和抗体(也称单抗)由于其具有作用机制明确、特异性强、灵敏度高和交叉反应少等优点，是sars-cov-2感染所致疾病预防/治疗药物研究的重点方向。中和抗体能够通过阻断病毒颗粒与其受体结合，激活巨噬细胞、nk细胞等免疫细胞和补体等多种机制来杀伤、清除病毒颗粒以及受感染细胞,实现防治新冠病毒感染的目的；与疫苗相比，中和抗体能够给人们立即提供对正在流行的病毒株的抵抗力。目前，已经有新冠中和抗体治疗药物获得紧急使用授权，比如再生元公司的包含casirivimab(regn10933)和imdevimab(regn10987)的抗体药物、礼来联合君实生物的包含bamlanivimab(ly-cov555)和etesevimab(ly-cov016/cb6)的抗体药物或葛兰素史克公司的包含sotrovimnab(vir-7831/s309)的抗体药物等。

3、但是，sars-cov-2的不断进化，产生了大量的病毒变异株，比如alpha、beta、gamma、delta或omicron(奥密克戎)等变异株及其亚变种，尤其是omicron变异株，在全球范围内，ba.1已经迅速被ba.2取代，ba.2和ba.4/5亚变种也推动了循环sars-cov-2的进一步多样化，出现了几个额外的亚变种，包括ba.4/.5、xbb.1.5、xbb.1.16和eg5.1等。随着大量的病毒变异株的出现，单抗药物的有效性受到挑战。比如，再生元公司、礼来联合君实生物以及葛兰素史克公司研发的抗体药物对omicron及其亚型的有效性显著下降甚至完全失效，被美国fda取消紧急使用授权；再比如，我国获批使用的由腾盛博药公司研发的brii196和198对omicron亚型变异株的中和活性也显著降低。

4、因而，开发一种不仅对新型冠状病毒的原始毒株中和能力强，而且对变异毒株中和能力强的抗体是有必要的。

技术实现思路

1、本发明的目的就是提供一种抗新型冠状病毒(sars-cov-2)抗体(也称499a4和2173a6抗体)，该抗体靶向新型冠状病毒(包括原始株和变异株)的rbd蛋白，其对新型冠状病毒以及变异毒株(比如奥密克戎变异株ba.4/.5、xbb.1.5、xbb.1.16和eg5.1)均具有nm级别的结合能力，并且对变异毒株还具有优异的中和能力，可以应用在制备预防/治疗新型冠状病毒的原始毒株以及变异毒株感染的疾病的药物中。

2、为了达到上述目的，本发明可以采用以下技术方案：

3、本发明一方面提供一种抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或其抗原结合片段，抗体选自以下抗体中任一种：(a)抗体a：包括轻链可变区和重链可变区，轻链可变区包括如seqid no:1所示序列的轻链cdr1、如seq id no:2所示序列的轻链cdr2和如seq id no:3所示序列的轻链cdr3；重链可变区包括如seq id no:4所示序列的轻链cdr1、如seq id no:5所示序列的轻链cdr2和如seq id no:6所示序列的轻链cdr3；(b)抗体b：包括轻链可变区和重链可变区，轻链可变区包括如seq id no:13所示序列的轻链cdr1、如seq id no:14所示序列的轻链cdr2和如seq id no:15所示序列的轻链cdr3；重链可变区包括如seq id no:16所示序列的轻链cdr1、如seq id no:17所示序列的轻链cdr2和如seq id no:18所示序列的轻链cdr3。

4、本发明另一方面提供一种核酸，其包括编码上述的抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或其抗原结合片段的核酸序列。

5、本发明再一方面提供一种生物材料，生物材料为含有上述核酸的表达盒、重组载体、重组微生物和/或重组动物细胞系。

6、本发明再一方面提供一种药物组合物，其包括上述的抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或上述的核酸或上述的生物材料；和/或其他药学活性剂。

7、本发明再一方面提供一种药物制剂，其包括上述的药物组合物和药学可接受载体。

8、本发明再一方面提供一种上述的抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或上述的核酸或上述的生物材料在制备用于预防/治疗新型冠状病毒所感染的疾病中的应用。

9、本发明有益效果至少包括：

10、(1)本发明提供的抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体(499a4抗体)通过抗原抗体结合的动力学常数计算可以得知，对新型冠状病毒(奥密克戎变异株)的ba.4/.5、xbb.1.5、xbb.1.16和eg5.1各亚型都具有nm级别的结合能力，分别为5.86nm、5.874nm、6.19nm和6.2nm；并且对ba.4/.5、xbb.1.5、xbb.1.16和eg5.1的中和能力也很好，分别为0.78nm、1.39nm、1.49nm和0.82nm；可以有效应用在制备预防/治疗新型冠状病毒的原始毒株以及变异毒株感染的疾病的药物中。

11、(2)本发明提供的抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体(2173a6抗体)通过抗原抗体结合的动力学常数计算可以得知，对新型冠状病毒(奥密克戎变异株)的ba.4/.5、xbb.1.5、xbb.1.16和eg5.1各亚型都具有具有nm级别的结合能力，分别为5.86nm、5.874nm、6.19nm和6.2nm；并且对ba.4/.5、xbb.1.5、xbb.1.16和eg5.1的中和能力也很好，分别为0.89nm、1.68nm、1.9nm和0.91nm；可以有效应用在制备预防/治疗新型冠状病毒的原始毒株以及变异毒株感染的疾病的药物中。

技术特征：

1.抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或其抗原结合片段，其特征在于，抗体选自以下抗体中任一种：(a)抗体a：包括轻链可变区和重链可变区，轻链可变区包括如seq id no:1所示序列的轻链cdr1、如seq id no:2所示序列的轻链cdr2和如seq id no:3所示序列的轻链cdr3；重链可变区包括如seq id no:4所示序列的轻链cdr1、如seq id no:5所示序列的轻链cdr2和如seq id no:6所示序列的轻链cdr3；(b)抗体b：包括轻链可变区和重链可变区，轻链可变区包括如seq id no:13所示序列的轻链cdr1、如seq id no:14所示序列的轻链cdr2和如seq id no:15所示序列的轻链cdr3；重链可变区包括如seq id no:16所示序列的轻链cdr1、如seq id no:17所示序列的轻链cdr2和如seq id no:18所示序列的轻链cdr3。

2.根据权利要求1所述的抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或其抗原结合片段，其特征在于，抗体a的轻链可变区的氨基酸序列如seq id no:7所示，抗体a的重链可变区的氨基酸序列如seq id no:8所示；抗体b的轻链可变区的氨基酸序列如seq id no:19所示，抗体b的重链可变区的氨基酸序列如seq id no:20所示。

3.一种核酸，其特征在于，包括编码权利要求1或2所述的抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或其抗原结合片段的核酸序列。

4.根据权利要求3所述的核酸，其特征在于，包括：编码抗体a的轻链可变区包含如seqid no:9所示的核酸序列，编码抗体a的重链可变区包含如seq id no:10所示的核酸序列；编码抗体b的轻链可变区包含如seq id no:21所示的核酸序列，编码抗体b的重链可变区包含如seq id no:22所示的核酸序列。

5.生物材料，其特征在于，生物材料为含有权利要求3或4所述核酸的表达盒、重组载体、重组微生物和/或重组动物细胞系。

6.一种药物组合物，其特征在于，包括权利要求1或2所述的抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或权利要求3或4所述的核酸或权利要求5所述的生物材料；和/或其他药学活性剂。

7.一种药物制剂，其特征在于，包括权利要求6所述的药物组合物和药学可接受载体。

8.权利要求1或2所述的抗新型冠状病毒rbd蛋白的抗体或权利要求3或4所述的核酸或权利要求5所述的生物材料在制备用于预防/治疗新型冠状病毒所感染的疾病中的应用。

9.根据权利要求8所述的应用，其特征在于，新型冠状病毒为sars-cov-2原毒株或sars-cov-2变异毒株。

10.根据权利要求9所述的应用，其特征在于，sars-cov-2变异毒株包括ba4/5、xbb1.5、xbb 1.16或eg5.1。

技术总结
本发明属于新型冠状病毒感染疾病预防/治疗药物技术领域，具体涉及一种抗新型冠状病毒RBD蛋白的抗体或其抗原结合片段及其应用。该抗体可以选择抗体a或抗体b，抗体a的轻链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO:7所示，抗体a的重链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO:8所示；抗体b的轻链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO:19所示，抗体b的重链可变区的氨基酸序列如SEQ ID NO:20所示。上述抗体对新型冠状病毒(奥密克戎变异株)的BA.4/.5、XBB.1.5、XBB.1.16和EG5.1各亚型均具有nM级别的结合能力，并且对上述变异毒株还具有优异的中和能力，可以应用在制备预防/治疗新型冠状病毒的原始毒株以及变异毒株感染的疾病的药物中。

技术研发人员：余鹏,熊天晨,杨蕊绮,朱行,冉景平,赵婷婷
受保护的技术使用者：重庆国际免疫创新中心有限公司
技术研发日：
技术公布日：2024/1/15