护肝肽快速筛选方法及其应用与流程

文档序号:37349851发布日期:2024-03-18 18:28阅读:32来源:国知局
护肝肽快速筛选方法及其应用与流程

本发明涉及分子筛选领域,尤其涉及护肝肽快速筛选方法及其应用。


背景技术:

1、酒精性肝损伤(alcohol-induced liver damage,ald)是导致全球非病毒性肝病发病率和死亡率的主要原因之一。长期或过量饮酒几乎会损伤机体的每个器官。ald是慢性肝病最常见的病因之一,每年因ald死亡人数约250万人,占全球死亡率的4%。

2、生物活性肽是指从天然动、植物的蛋白质中获取的一类小分子多肽片段。由于其具有营养价值高、无抗原性、无毒副作用、生物活性强、易于改造和可以长期服用等优点,受到越来越多营养学家的关注。目前,研究人员已通过酶解技术制备了多种具有加速酒精代谢功能的生物活性肽,这些生物活性肽均能通过刺激乙醇脱氢酶的活性,加速体内乙醇向乙醛的转化,预防和改善酒精性肝损伤。

3、目前护肝肽筛选大多局限于粗肽,并没有一个很好的筛选方法能将护肝肽的具体序列从肽组学数据库中定位出来。


技术实现思路

1、有鉴于此,本发明提供了护肝肽快速筛选方法及其应用。本发明通过ds和机器学习两种手段提取与拟合阳性肽的共同特征元素并造模,分别使用两种模型对未知肽库进行筛选,得到的候选护肝肽作进一步的分子对接进行验证,最后定位出具体的护肝肽序列,该方法快速高效且具有较高的准确性。

2、为了实现上述发明目的,本发明提供以下技术方案:

3、本发明提供了生物活性肽,具有:

4、(1)、如seq id no:1~seq id no:7任意所示的氨基酸序列;或

5、(2)、如(1)所示的氨基酸序列经取代、缺失或添加一个或多个氨基获得的氨基酸序列,且与(1)所示的氨基酸序列功能相同或相似的氨基酸序列;或

6、(3)、与(1)或(2)所示的氨基酸序列至少有80%同一性的氨基酸序列。

7、在本发明的一些实施方案中,seq id no:1的序列为:gln-ser-leu-asp-lys-phe-leu(qsldkfl)。

8、在本发明的一些实施方案中,seq id no:2的序列为:leu-asn-lys-phe-leu-ala(lnkfla)。

9、在本发明的一些实施方案中,seq id no:3的序列为:trp-asp-ser-his-tyr-leu-lys(wdshylk)。

10、在本发明的一些实施方案中,seq id no:4的序列为:phe-asp-arg-pro-leu-leu(fdrpll)。

11、在本发明的一些实施方案中,seq id no:5的序列为:asn-tyr-leu-leu-leu-lys(nylllk)。

12、在本发明的一些实施方案中,seq id no:6的序列为:leu-pro-leu-glu-leu-arg(lplelr)。

13、在本发明的一些实施方案中,seq id no:7的序列为:glu-val-tyr-his-leu-leu-lys(evyhllk)。

14、本发明还提供了上述生物活性肽在制备治疗和/或预防酒精性肝损伤的产品中的应用。

15、本发明还提供了上述生物活性肽的筛选方法,包括如下步骤:

16、s1:获得阳性肽的数据库,分析所述数据库的共同特征元素,构建共同特征药效团模型;

17、s2:采用机器学习方法对训练集的肽段属性特性拟合建模,获得模型;

18、s3:取所述共同特征药效团模型和所述模型的肽的交集作为候选肽;

19、s4:取所述候选肽与受体蛋白分子对接,获得所述生物活性肽。

20、在本发明的一些实施方案中,上述筛选方法,s1中所述分析采用分子模拟软件。

21、在本发明的一些实施方案中,上述筛选方法,s2中所述机器学习方法包括:随机森林、knn和xgboost中的一种或多种。

22、在本发明的一些实施方案中,上述筛选方法,s4中所述受体蛋白包括:pdb:3koh(cyp2e1)。

23、本发明还提供了产品,包括:上述生物活性肽和/或上述筛选方法获得的生物活性肽。

24、在本发明的一些实施方案中,上述产品包括:药物或制剂。

25、本发明提供了生物活性肽,具有:

26、(1)、如seq id no:1~seq id no:7任意所示的氨基酸序列;或

27、(2)、如(1)所示的氨基酸序列经取代、缺失或添加一个或多个氨基获得的氨基酸序列,且与(1)所示的氨基酸序列功能相同或相似的氨基酸序列;或

28、(3)、与(1)或(2)所示的氨基酸序列至少有80%同一性的氨基酸序列。

29、本发明提供了一种护肝肽的筛选方法,通过共同特征药效团模型和统计学特征提取与拟合以及分子对接等手段,能够准确的从未知肽中筛选出护肝肽,筛选方法快速高效。



技术特征:

1.生物活性肽,其特征在于,具有:

2.如权利要求1所述的生物活性肽在制备治疗和/或预防酒精性肝损伤的产品中的应用。

3.如权利要求1所述的生物活性肽的筛选方法,其特征在于,包括如下步骤:

4.如权利要求3所述的筛选方法,其特征在于,s1中所述分析采用分子模拟软件。

5.如权利要求3或4所述的筛选方法,其特征在于,s2中所述机器学习方法包括:随机森林、knn和xgboost中的一种或多种。

6.如权利要求3至5任一项所述的筛选方法,其特征在于,s4中所述受体蛋白包括:pdb:3koh(cyp2e1)。

7.产品,其特征在于,包括:如权利要求1所述的生物活性肽和/或如权利要求3至6任一项所述筛选方法获得的生物活性肽。

8.如权利要求7所述的产品,其特征在于,包括:药物或制剂。


技术总结
本发明涉及分子筛选领域,尤其涉及护肝肽快速筛选方法及其应用。本发明提供了生物活性肽,具有:如SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:7任意所示的氨基酸序列;或如所示的氨基酸序列经取代、缺失或添加一个或多个氨基获得的氨基酸序列,且与所示的氨基酸序列功能相同或相似的氨基酸序列;或与所示的氨基酸序列至少有80%同一性的氨基酸序列。本发明通过DS和机器学习两种手段提取与拟合阳性肽的共同特征元素并造模,分别使用两种模型对未知肽库进行筛选,得到的候选护肝肽作进一步的分子对接进行验证,最后定位出具体的护肝肽序列,该方法快速高效且具有较高的准确性。

技术研发人员:党亚丽,高浚铭,周天琼,何滨霞
受保护的技术使用者:杭州华津药业股份有限公司
技术研发日:
技术公布日:2024/3/17
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