一株拟无枝酸菌及其应用

本发明属于微生物，公开了一株拟无枝酸菌及其应用。

背景技术：

1、拟无枝酸菌(amycolatopsis)为诺卡菌型放线菌的一个独特属，是稀有放线菌。曾经一度被认为是抗菌、抗真菌或抗病毒药物的最有效来源，如今仍然是人们寻找新药时关注的焦点。拟无枝酸菌在工业和生态治理中发挥了重要作用，包括用于重金属固定化、除草剂和聚合物生物降解等生物修复以及生物转化。同时，拟无枝酸菌在抗生素生产方面也有较大贡献，包括利用东方拟无枝酸菌生产万古霉素和利用地中海拟无枝酸菌生产利福霉素等。

2、利福霉素类药物具有广谱抗菌作用，目前在临床应用的利福霉素类药物有利福平、利福喷汀及利福布汀。利福平(rifampicin)作为60年代新发展起来的一种新型的抗结核菌的利福霉素衍生物也属于拟无枝酸菌的要次级代谢产物，不但具有广泛的抗菌谱，还可用于治疗一些细菌等传染性疾病，对结核杆菌、革兰氏阳性球菌以及麻风杆菌也具抑制作用。此类抗生素的化学结构和作用机制独特，与其他抗菌药物难以产生交叉耐药现象。

3、对抗生素的发掘和结构改造已经成为微生物药物研究热点方向，并且随着病原菌耐药能力不断增强和抗生素研发进程的减缓，寻找更多新型菌株资源十分重要。

技术实现思路

1、为进一步推动对新型菌株以及抗生素的研究，本发明提供了一株拟无枝酸菌，经鉴定，将所述拟无枝酸菌amycolatopsis sp.命名为拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12。生物活性表明，拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12具有产生多样性抗生素的潜力，可能表达了一种利福霉素类抗生素，对金黄色葡萄球菌和普通变形杆菌具有较为明显的生长抑制作用，为抗生素的研究提供微生物资源。

2、本发明所述的拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12于2021年9月26日采集于宁夏贺兰山岩石(北纬38°60ˊ，东经105°93ˊ)地衣样品中分离筛选得到，保藏信息如下。

3、分类命名：拟无枝酸菌amycolatopsis sp.

4、保藏时间：2022年7月15日

5、保藏单位：中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心

6、保藏单位地址：北京市朝阳区北辰西路1号院3号，中国科学院微生物研究所

7、保藏编号：cgmcc no.25316

8、本发明所述的拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12具有产多种抗生素的潜力。

9、本发明所述的拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12具有编码重要抗生素的潜力，可能表达了利福霉素(rifamycins)类抗生素。

10、本发明所述的拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12对金黄色葡萄球菌和普通变形杆菌具有较为明显的生长抑制作用。

11、与现有技术相比，本发明提供的技术方案至少具备下述的有益效果或优点：

12、(1)本发明对拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12基因组进行功能注释。其中，6108条蛋白序列得到swiss-prot的准确注释，9425个基因在nr数据库中得到注释，7534个功能基因在pfam数据库中得到注释，7255个基因在eggnog数据库中得到注释到，3239个基因在kegg数据库中得到注释，5694个功能基因在go数据库得到注释。这些功能基因的注释为后续该菌的功能基因组学研究，潜在次级代谢产物的生物合成与代谢调控研究，一些复杂氨基酸和碳水化合物的降解、转化方面的研究，提供极大的便利。

13、(2)本发明所述拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12具有编码生产多种抗生素的基因簇，可能表达了利福霉素类抗生素，由于还存在一定量功能不明的基因，表明其具有表达新结构抗生素的潜力。

14、(3)本发明所述拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12具有抗菌性能，拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12的抗菌活性试验表明，拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12对金黄色葡萄球菌和普通变形杆菌具有较强的生长抑制作用。

15、(4)本发明所述拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12可进一步开发用于生产利福霉素类抗生素或开发成为金黄色葡萄球菌和普通变形杆菌的抑制剂。

技术特征：

1.一种拟无枝酸菌，其特征在于，所述拟无枝酸菌的菌株命名为拟无枝酸菌amycolatopsissp.qt-12，保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏编号为cgmccno.25316。

2.根据权利要求1所述的拟无枝酸菌，其特征在于，所述拟无枝酸菌amycolatopsissp.qt-12的16s rdna序列如seq id no:1所示。

3.根据权利要求1所述的拟无枝酸菌，其特征在于，所述拟无枝酸菌amycolatopsissp.qt-12具有编码抗生素的基因簇。

4.根据权利要求3所述的拟无枝酸菌，其特征在于，所述拟无枝酸菌amycolatopsissp.qt-12具有编码利福霉素类抗生素的基因簇。

5.根据权利要求1所述的拟无枝酸菌，其特征在于，所述拟无枝酸菌amycolatopsissp.qt-12对金黄色葡萄球菌和普通变形杆菌中的至少一种有拮抗作用。

6.根据权利要求1所述的拟无枝酸菌，其特征在于，所述拟无枝酸菌amycolatopsissp.qt-12具有编码聚酮化合物的基因簇。

7.权利要求1所述的拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12在制备聚酮化合物中的应用。

8.权利要求1所述的拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12在制备抗生素中的应用。

9.权利要求1所述的拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12在制备利福霉素类抗生素中的应用。

10.权利要求1所述的拟无枝酸菌amycolatopsis sp.qt-12在制备杀菌剂中的应用，其特征在于，所述杀菌剂对金黄色葡萄球菌和普通变形杆菌中的至少一种有拮抗作用。

技术总结
本发明属于微生物技术领域，公开了一株拟无枝酸菌及其应用。本发明所述拟无枝酸菌Amycolatopsis sp.QT‑12，保藏编号为CGMCCNO.25316，能够产生利福霉素类抗生素。所述拟无枝酸菌Amycolatopsis sp.QT‑12可以抑制金黄色葡萄球菌和普通变形杆菌的生长。所述拟无枝酸菌Amycolatopsis sp.QT‑12可用于开发生产多种抗生素。

技术研发人员：江志波,周乐瑞,吴秀丽,马晓莉,南泽东,丁范范
受保护的技术使用者：北方民族大学
技术研发日：
技术公布日：2024/4/24