用于肠癌预后的标志物组、产品、系统及其用途

本发明涉及生物医学领域；具体地，涉及用于评估肠癌预后的标志物组、产品、系统及其用途。

背景技术：

1、目前结直肠癌(crc)已经成为我国第三位常见的恶性肿瘤。对于已接受手术治疗结直肠癌，术后的病理评估是最重要的预后指标和术后治疗依据。进展期crc患者应在术后接受辅助治疗，但对于ii/iii期患者的辅助治疗决策仍存在较大的争议。

2、回顾性研究发现有约10-20％的ii期患者术后会发生复发和转移。此外高危ii期患者也可从辅助化疗中获益。目前针对ⅱ期结肠癌患者是否需要接受辅助化疗的评价方式目前仍主要停留在组织学层面：肿瘤的浸润深度、分化程度、有无淋巴管浸润、有无神经浸润、淋巴结总数及阳性数以及切缘的病理；分子层面研究提示，msi-h(microsatelliteinstability high，高度卫星不稳定性)或dmmr(mismatch repair deficient，错配修复缺陷)的患者接受5-fu化疗获益降低。而对于iii期crc患者，化疗的时间长短仍有争议，idea最新研究结果表明：iii期患者辅助化疗3个月和6个月之间的5年生存差异很小；iii期低危4周期xelox的5年生存率优于8周期xelox，iii期高危4周期xelox比8周期xelox的5年生存率仅下降1％，但毒副反应大大下降。此外，目前临床治疗结果反映并不是只有高危ii/iii期可以通过辅助化疗获益。这些问题的关键在于，缺乏特异的分子标志物定义或判断“高危”。因此，如何筛选特异性的分子标志物，对ii/iii期crc患者进行精准的分子特征和亚型分析，鉴定真正的“高危”患者使之通过辅助化疗获益，一直是临床亟待解决的问题。

技术实现思路

1、为解决上述技术问题，发明人经长期、深入的研究分析，发现并精练了能够用于评估对象的肠癌预后的标志物组。采用所述标志物组，能够对肠癌(例如，结直肠癌)患者进行精准的分子特征和亚型分析，大幅提高真“高危”患者鉴定和临床预后的准确性。

2、一方面，本文提供一种用于评估对象的肠癌预后的标志物组，其具有以下14种基因标志物：ifit3、cxcl13、stat1、cxcl9、ca4、aqp8、slc4a4、areg、ereg、spink4、reg4、sfrp2、zeb2和sfrp4。

3、另一方面，本文提供用于评估对象的肠癌预后的产品或产品组，其包含用于检测来自对象的生物样品的标志物组的各标志物的试剂，所述标志物组具有以下14种基因标志物：ifit3、cxcl13、stat1、cxcl9、ca4、aqp8、slc4a4、areg、ereg、spink4、reg4、sfrp2、zeb2和sfrp4。

4、另一方面，本文提供一种用于评估对象的肠癌预后的系统，其包括存储器和一个或多个处理器；

5、其中，所述存储器包含：

6、来自对象的生物样品的标志物组的各基因表达数据，

7、cms分型特征基因组表达模板数据，和

8、一个或多个处理器可执行的指令；

9、其中，所述标志物组具有以下14种基因标志物：ifit3、cxcl13、stat1、cxcl9、ca4、aqp8、slc4a4、areg、ereg、spink4、reg4、sfrp2、zeb2和sfrp4；并且

10、其中，所述一个或多个处理器可执行的指令被设置为：

11、(a)获取来自对象的生物样品的所述标志物组的基因表达数据；

12、(b)计算(a)中各基因表达数据与cms分型特征基因组表达模板的余弦距离；

13、(c)根据(b)中计算所得余弦距离确定cms分型；和

14、(d)根据(c)中所得cms分型确定对象的肠癌预后。

15、另一方面，本文提供一种计算机可读介质，其包括：

16、来自对象的生物样品的标志物组的各基因表达量数据，其中，所述标志物组具有以下14种基因标志物：ifit3、cxcl13、stat1、cxcl9、ca4、aqp8、slc4a4、areg、ereg、spink4、reg4、sfrp2、zeb2和sfrp4；

17、cms分型特征基因组表达模板数据，和

18、用于执行方法的指令，所述方法包括：

19、(a)获取来自对象的生物样品的标志物组的基因表达量数据；

20、(b)计算(a)中各基因表达量数据与cms分型特征基因组表达模板的余弦距离；

21、(c)根据(b)中计算所得余弦距离确定cms分型；和

22、(d)根据(c)中所得cms分型确定对象的肠癌预后。

23、另一方面，本文提供一种装载有所述计算机可读介质的电子设备。

24、另一方面，本文提供用于检测来自对象的生物样品的标志物组的各标志物的试剂在制备用于评估对象的肠癌预后的产品或产品组中的用途，其中，所述标志物组具有以下14种基因标志物：ifit3、cxcl13、stat1、cxcl9、ca4、aqp8、slc4a4、areg、ereg、spink4、reg4、sfrp2、zeb2和sfrp4。

25、另一方面，本文提供包含用于检测来自对象的生物样品的标志物组的各标志物的试剂的产品或产品组用于评估对象的肠癌预后的用途，其中，所述标志物组具有以下14种基因标志物：ifit3、cxcl13、stat1、cxcl9、ca4、aqp8、slc4a4、areg、ereg、spink4、reg4、sfrp2、zeb2和sfrp4。

技术特征：

1.用于评估对象的肠癌预后的产品或产品组，其包含用于检测来自对象的生物样品的标志物组的各标志物的试剂，所述标志物组具有以下14种基因标志物：ifit3、cxcl13、stat1、cxcl9、ca4、aqp8、slc4a4、areg、ereg、spink4、reg4、sfrp2、zeb2和sfrp4。

2.一种用于评估对象的肠癌预后的系统，其包括存储器和一个或多个处理器；

3.一种计算机可读介质，其包括：

4.一种装载有如权利要求3所述的计算机可读介质的电子设备。

5.用于检测来自对象的生物样品的标志物组的各标志物的试剂在制备用于评估对象的肠癌预后的产品或产品组中的用途，其中，所述标志物组具有以下14种基因标志物：ifit3、cxcl13、stat1、cxcl9、ca4、aqp8、slc4a4、areg、ereg、spink4、reg4、sfrp2、zeb2和sfrp4。

6.如权利要求1所述的产品或产品组、如权利要求2所述的系统、如权利要求3所述的计算机可读介质、如权利要求4所述的电子设备或如权利要求5所述的用途，其中，所述标志物组还具有以下6种基因标志物：ca1、clca4、ms4a12、cldn8、muc2和zeb1。

7.如权利要求6所述的产品或产品组、系统、计算机可读介质、电子设备或用途，其中，所述标志物组还具有以下20种基因标志物：cxcl10、aim2、gbp5、cxcl11、krt20、slc26a3、ca2、ascl2、vav3、celp、rnf43、mlph、tff3、aqp3、col3a1、snai2、ccdc80、aebp1、timp2和twist1。

8.如权利要求1所述的产品或产品组、如权利要求2所述的系统、如权利要求3所述的计算机可读介质、如权利要求4所述的电子设备或如权利要求5所述的用途，其中，所述肠癌是结直肠癌；具体地，所述肠癌是ii/iii期结直肠癌。

9.如权利要求2所述的系统，其包括以下模块：

10.如权利要求1所述的产品或产品组，或如权利要求5所述的用途，其中，所述试剂为用于检测所述生物样品中的所述标志物组中各基因标志物的表达的试剂。

技术总结
本文提供了用于肠癌预后的标志物组、产品、系统及其用途。具体地，本文提供了一种用于评估对象的肠癌预后的产品或产品组，其包含用于检测来自对象的生物样品的标志物组的各标志物的试剂，所述标志物组具有以下14种基因标志物：IFIT3、CXCL13、STAT1、CXCL9、CA4、AQP8、SLC4A4、AREG、EREG、SPINK4、REG4、SFRP2、ZEB2和SFRP4。本文提供了低成本、高效率、高质量的肠癌预后评估手段。

技术研发人员：盛伟琪,许蜜蝶,陈丽萌,黄凯,彭俊杰,彭海翔,黄丹,陆彬彬
受保护的技术使用者：复旦大学附属肿瘤医院
技术研发日：
技术公布日：2024/5/6