一种影响猪个体精液中原生质滴含量的SNP标记

本发明涉及分子标记领域，特别涉及影响猪个体精液中原生质滴含量的snp标记。

背景技术：

1、猪在我们的生活的各个方面扮演着重要的角色。作为重要的肉类来源之一，猪肉为人们提供高质量的蛋白质和营养。不仅如此，猪的皮、毛、骨髓等也被广泛利用，用于生产食品、药品、皮革制品等，为人们的生活提供了丰富的资源。此外，猪是农业系统中的重要组成部分，其养殖可以促进农业与畜牧业的发展，为农民提供稳定的经济来源。而良种是保障生猪产业发展的重要基础，是提升生猪产业核心竞争的关键。随着后非瘟时代人工授精技术使用率大大提高，种公猪的遗传改良特别是种公猪精液品质的遗传改良显得尤为重要。

2、而异常精子率作为评估猪精液品质的重要指标之一，反映了精子的形态结构和功能状态，对猪的生育能力和繁殖效率产生重要影响。精子异常涵盖了头部畸形、尾部畸形以及其他形态异常，过高的异常率可能表明着猪精子的质量下降，影响其受精能力和胚胎发育，从而降低了繁殖效率。精子原生质滴不脱落是异常精子的一种常见类型，主要包括近端原生质滴和远端原生质滴精子。

技术实现思路

1、本发明之一提供了一种猪的snp标记，所述snp标记的核酸的序列如seq id no.1所示，所述snp标记的位点位于如seq id no.1所示的核酸上的从5’端起的第301位，对应于11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第76872377位，为a或g。

2、本发明之二提供了本发明之一所述的snp标记在辅助鉴定猪精液中原生质滴含量中的应用。

3、在一个具体实施方式中，所述原生质滴含量包括总原生质滴含量、近端原生质滴含量和远端原生质滴含量中的一种。

4、在一个具体实施方式中，基于所述总原生质滴含量，所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、a/g基因型和a/a基因型。

5、在一个具体实施方式中，基于所述近端原生质滴含量，所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、a/g基因型和a/a基因型。

6、在一个具体实施方式中，基于所述远端原生质滴含量，所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、a/g基因型和a/a基因型。

7、本发明之三提供了一种辅助猪遗传改良的方法，所述方法包括：确定种猪核心群中的种猪的如本发明之一所述的snp标记，并根据所述snp标记做出相应的选择：

8、在所述种猪核心群中选择在所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点为a/g和g/g基因型的种猪个体，淘汰在该位点为a/a基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因g的频率。

9、在一个具体实施方式中，在所述种猪核心群中选择在所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点为g/g基因型的种猪个体，淘汰在该位点为a/g和a/a基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因g的频率。

10、在一个具体实施方式中，利用分析所述种猪的核酸的序列来确定所述种猪的如本发明之一所述的snp标记，其中所述核酸的序列如seq id no.1所示。

11、本发明的有益效果：

12、本发明的snp标记6_76872377与猪精液中原生质滴含量显著相关，因此可以通过本发明的snp标记对猪群该位点进行判型，并通过该snp标记对猪群进行与猪精液中总原生质滴含量、近端原生质滴含量或远端原生质滴含量相关的遗传改良。

13、通过改良6_76872377snp位点，提高该位点等位基因g的频率，降低等位基因a的频率，可以降低精液中原生质滴含量(总原生质滴含量、近端原生质滴含量或远端原生质滴含量)，使企业生产出更多的成品猪精，为养殖业带来良好收益。

技术特征：

1.一种猪的snp标记，所述snp标记的核酸的序列如seq id no.1所示，所述snp标记的位点位于如seq id no.1所示的核酸上的从5’端起的第301位，对应于11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第76872377位，为a或g。

2.如权利要求1所述的snp标记在辅助鉴定猪精液中原生质滴含量中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述原生质滴含量包括原生质滴总含量、近端原生质滴含量和远端原生质滴含量中的一种。

4.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，基于所述总原生质滴含量，所述seq idno.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、a/g基因型和a/a基因型。

5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，基于所述近端原生质滴含量，所述seqidno.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、a/g基因型和a/a基因型。

6.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，基于所述远端原生质滴含量，所述seqidno.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、a/g基因型和a/a基因型。

7.一种辅助猪遗传改良的方法，所述方法包括：确定种猪核心群中的种猪的如权利要求1所述的snp标记，并根据所述snp标记做出相应的选择：

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，在所述种猪核心群中选择在所述seq idno.1上的从5’端起的第301位点为g/g基因型的种猪个体，淘汰在该位点为a/g和a/a基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因g的频率。

9.根据权利要求7或8所述的方法，其特征在于，利用分析所述种猪的核酸的序列来确定所述种猪的如权利要求1所述的snp标记，其中所述核酸的序列如seq id no.1所示。

技术总结
本发明提供了一种影响猪个体精液中原生质滴含量的SNP标记。所述SNP标记的核酸的序列如SEQ ID No.1所示，所述SNP标记的位点位于如SEQ ID No.1所示的核酸上的从5’端起的第301位，对应于11.1版本国际猪基因组的6号染色体上的从5’端起的第76872377位，为A或G。

技术研发人员：黄路生,陈佐权,孙迎春,张志燕,周梦,肖石军
受保护的技术使用者：江西农业大学
技术研发日：
技术公布日：2024/6/5