一种可口革囊星虫微卫星引物组及其应用

【】本发明涉及分子标记，特别涉及一种可口革囊星虫微卫星引物组及其应用。

背景技术

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背景技术：

1、可口革囊星虫(phascolosoma esculenta)，其又俗称“海泥虫”、“海丁”、“海蚂蝗”、“泥丁”、“土笋”等，主要分布在中国以及东南亚(如越南)沿海滩涂。可口革囊星虫作为海洋珍品之一，富含蛋白质和多种不饱和脂肪酸等营养物质，被称为“动物人参”，是当地居民的特色经济水产生物。近年来，国内外沿海开发建设进程加快，环境污染、滩涂围垦、超负荷采捕等现象屡禁不绝，导致国内外沿海的可口革囊星虫野生种群种质资源量锐减，虽然其人工繁育研究取得一定进展，但至今仍未完全突破，导致市场价格连年攀升。因此相关的种质资源调查、种苗繁育及增养殖研究引起国内外相关行业的高度关注，相关学科学者对于可口革囊星虫的人工养殖和苗种繁育持续进行大量研究。但是，关于国内外可口革囊星虫种群遗传学的研究报道相对较少见，可口革囊星虫是北部湾地区特有物种，随着人类的不断采挖自然资源量显著下降，为了该物种资源的合理开发及可持续利用，对其不同野生群体的遗传多样性开展研究十分必要。本研究则利用微卫星分子标记揭示中国与越南沿海可口革囊星虫野生种群遗传多样性，掌握中国与越南沿海可口革囊星虫野生种群的遗传多样性及其遗传结构，为国内外可口革囊星虫的合理开发及可持续利用提供了科学依据。

技术实现思路

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技术实现要素：

1、鉴于上述内容，有必要提供一种可口革囊星虫微卫星引物组及其应用，该引物能为今后开展遗传育种、基因组作图、基因定位和物种亲缘关系鉴别等研究提供新的思路。

2、为达到上述目的，本发明所采用的技术方案是：

3、一种可口革囊星虫微卫星引物组，所述引物组的序列如seq id no.1～44所示。

4、本发明还包括所述引物组对不同地域的可口革囊星虫进行聚类分析的应用。

5、进一步的，所述不同地域为：中国福建、越南、中国广西北海、中国广西钦州。

6、本发明还包括所述引物组对不同可口革囊星虫品种进行遗传多样性遗传分析的应用。

7、本发明还包括一种应用所述引物组进行可口革囊星虫聚类分析的方法，所述方法为：用如seq id no.1～44所示的22对引物对多个可口革囊星虫样本的遗传关系进行分析后对可口革囊星虫进行聚类分析。

8、本发明具有如下有益效果：

9、本发明以可口革囊星虫体壁肌肉为材料，提取可口革囊星虫的dna经过检测、分析得到相应的微卫星引物，找到适合应用于可口革囊星虫聚类分析的微卫星引物组，本发明的引物组可利用可口革囊星虫体壁引物组进行pcr分析并绘制聚类分析图，为今后开展遗传育种、基因定位、物种亲缘关系鉴别和可口革囊星虫遗传资源保护等研究提供新的引物和思路。

技术特征：

1.一种可口革囊星虫微卫星引物组，其特征在于，所述引物组的序列如seq id no.1～44所示。

2.如权利要求1所述引物组对不同地域的可口革囊星虫进行聚类分析的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述不同地域为：中国福建、越南、中国广西北海、中国广西钦州。

4.如权利要求1所述引物组对不同可口革囊星虫品种进行遗传多样性遗传分析的应用。

5.一种应用权利要求1所述引物组进行可口革囊星虫聚类分析的方法，其特征在于，所述方法为：用如seq id no.1～44所示的22对引物对多个可口革囊星虫样本的遗传关系进行分析后对可口革囊星虫进行聚类分析。

技术总结
本发明涉及分子标记技术领域，特别涉及了一种可口革囊星虫微卫星引物组及其应用，本发明通过对可口革囊星虫全基因组进行组装、运算，预测、设计相应的微卫星引物，随后以中国与越南沿海区域共101个可口革囊星虫基因组DNA作为材料，对随机选择的192个微卫星位点中进行验证，获得114对能在可口革囊星虫中扩增的微卫星引物，选取其中22对多态微卫星引物对可口革囊星虫进行分子遗传标记，可区分中国与越南多个可口革囊星虫样本基因，对中国与越南沿海不同品种的可口革囊星虫进行聚类分析，为今后开展遗传育种、基因定位、物种亲缘关系鉴别和可口革囊星虫遗传资源保护等研究提供新的思路。

技术研发人员：朱鹏,陈博宇,王重阳,廖永岩,王鹏良,于聪彦,包磊,邢佳敏,彭慧婧
受保护的技术使用者：北部湾大学
技术研发日：
技术公布日：2024/6/2