本发明属于生物,具体涉及dhx9基因作为急性髓系白血病早期诊断和预后评估标志物的应用。
背景技术:
1、急性髓性白血病(aml)是成年人最常见的一类造血系统肿瘤疾病,是由髓系造血细胞恶性克隆增殖引起的高度异质性疾病,其病情发展迅速,自然病程仅数月。传统的化疗5年生存率仅为20~35%,而目前最有效的治疗方法异基因造血干细胞移植资源有限,且移植后仍存在复发可能。现有新的靶向药物如针对idh、flt3、bcl2为靶点的药物用于临床治疗,但疗效并不太理想,可能是由于上述靶点不是aml发生的驱动基因的缘故。
2、现有aml诊断和预后评估指标应用于临床,如t(8;21)、inv(16)、t(15;17)、t(9;11)和获得性的体细胞基因突变等。但仍有50~70% aml患者细胞遗传学为正常染色体核型,没有白血病融合基因。目前为止,白血病缺乏较好通用标志物,因此,寻找与aml相关的分子标志物有助于研究aml的发病机制,探究新的治疗靶标,并对临床预后具有重要意义。
技术实现思路
1、为实现上述目的,本发明涉及的内容如下:
2、dhx9作为一种生物标志物,可应用于早期急性髓系白血病的诊断和预后评估。
3、dhx9作为生物标志物在制备用于急性髓系白血病早期诊断和/或预后评估的试剂盒中的用途。
4、dhx9特异性引物和/或探针在制备用于急性髓系白血病早期诊断和/或预后评估的试剂盒中的用途。
5、本发明首次发现dhx9在急性髓系白血病患者的骨髓和外周血中显著高表达,可作为早期急性髓系白血病的诊断标志物,用于判断患者是否患有急性髓系白血病。
6、本发明还发现,相较于低风险、较好预后的急性髓系白血病患者,dhx9在具有遗传学不良预后的患者体内显著高表达,表明dhx9可作为预后标志物判断患者是否有不良预后。
7、本发明提供dhx9基因在作为早期急性髓系白血病的诊断和预后评估标志物中的应用。
8、本发明还提供一种急性髓系白血病早期诊断和预后评估产品,该产品包括dhx9基因特异性检测引物和dhx9特异性检测探针。所述探针特异性检测dhx9的基因表达水平。
9、此外,本发明还提供内对照检测基因abl1基因的特异性检测引物和特异性检测探针。
10、本发明还提供一种探针组合,所述探针组合包括实时荧光定量pcr检测dhx9探针(dhx9-p)和实时荧光定量pcr检测abl1探针(abl1-p)。
11、本发明涉及的一种早期白血病标志物dhx9,其基因序列如seq id no.1所示。
12、本发明提供的生物标志物dhx9基因引物核苷酸序列如下所示:
13、dhx9-f:ataaagagtgaagaagttccagct(seq id no.2)
14、dhx9-r:ttcaagttggctcctcggtc(seq id no.3)
15、其内参基因abl1实时荧光定量pcr的引物核苷酸序列下所示:
16、abl1-f:catcacgccagtcaacagtct(seq id no.4)
17、abl1-r:ggtacaccctcccttcgtatct(seq id no.5)
18、本发明提供的生物标志物dhx9基因及其内参基因abl1实时荧光定量pcr的探针核苷酸序列如下所示:
19、dhx9-p:agcatctccgcccccacttactgatactcc(seq id no.6)
20、abl1-p:cctgtgtcccgcaatgccgctgagtatct(seq id no.7)
21、上述探针的5’端标记的荧光基团选自fam,vic中的一种,上述探针的3’端标记的荧光基团选自tamra,bhq1中的一种。
22、根据上述本发明提供的用途,其中所述dhx9特异性引物和/或探针包括:
23、1)seq id no.6所示探针,和/或
24、2)seq id no.2、3所示的引物。
25、根据上述本发明提供的用途,其中所述dhx9特异性引物和/或探针包括上述中任一项的探针组合。
26、本发明提供的探针具有以下优势:
27、本方法采用taqman实时荧光定量pcr对dhx9基因表达水平的检测,实现对急性髓系白血病的早期诊断和预后评估,对白血病的早期发现和预后评估提供参考价值。
28、本方法特异性强,敏感性强,结果稳定,具有广泛的临床应用前景。本发明提供的用于急性髓系白血病早期诊断的dhx9标志物,其区分白血病病人骨髓/外周血和正常对照的auc达0.706,区分中高危风险的白血病病人骨髓/外周血和正常对照的auc达0.813。本发明提供的方法可用于早期急性髓系白血病预后评估,高表达dhx9的患者与细胞遗传学高风险不良预后相关。
1.dhx9作为生物标志物在制备用于急性髓系白血病早期诊断和/或预后评估的试剂盒中的用途。
2.dhx9特异性引物和/或探针在制备用于急性髓系白血病早期诊断和/或预后评估的试剂盒中的用途。
3.一种探针组合,所述探针组合包括实时荧光定量pcr检测dhx9探针(dhx9-p)和实时荧光定量pcr检测abl1探针(abl1-p)。
4.根据权利要求3所述的探针组合,其特征在于,所述探针特异性检测dhx9的基因表达水平。
5.根据权利要求3或4所述的探针组合,其特征在于,所述探针dhx9-p序列为seq idno.6所示。
6.根据权利要求3或4所述的探针组合,其特征在于,所述探针abl1-p序列为seq idno.7所示。
7.根据权利要求3-6所述的探针组合,其特征在于,所述探针的5’端标记的荧光基团选自fam,vic中的一种。
8.根据权利要求3-6所述的探针组合,其特征在于,所述探针的3’端标记的荧光基团选自tamra,bhq1中的一种。
9.根据权利要求2所述的用途,其中所述dhx9特异性引物和/或探针包括:
10.根据权利要求2所述的用途,其中所述dhx9特异性引物和/或探针包括权利要求3-8任一项所述的探针组合。