本发明属于分子生物学,具体涉及一种bsai限制性内切酶的制备方法。
背景技术:
1、bsai是一种iis型限制性内切酶,识别dna双链中的ggtctc序列,并切割位于识别序列后间隔1个碱基的4个任意碱基。与常见的tpyeii型限制性内切酶不同,bsai的识别位点和切割位置不位于同一处,因此常用于构建具有特定dna切割形状的片段,在分子克隆领域具有广泛应用。
2、目前,bsai限制性内切酶主要通过在大肠杆菌中表达获得,然而由于bsai对宿主dna会造成切割损伤,因此其表达难度较大。现有技术中,通过使用m.bsai(cn111019922 a)甲基化保护宿主来构建突变型限制性内切酶bsai,但该方法需要多个步骤进行筛选和试验,操作繁琐,且成本较高,限制了其在合成生物学等领域的大规模应用。此外,单一种类的甲基化只能保护单链,双链dna依旧会造成切割损伤,因此大肠杆菌表达bsai的难点在于宿主的位点特异性甲基化程度,位点特异性甲基化程度取决于m1.bsai与m2.bsai的表达水平与酶活力,然而调控m1.bsai与m2.bsai的难度较大。
3、因此,降低bsai限制性内切酶的生产难度,简化制备流程,对于bsai限制性内切酶的大规模应用具有重要意义。
技术实现思路
1、本发明针对现有技术中bsai限制性内切酶生产难度大、成本高的问题,提供了一种简便、高效的bsai限制性内切酶的制备方法,降低了生产成本,提高了产量,有利于推动bsai限制性内切酶的广泛应用。
2、为达上述目的,本发明采用以下技术方案:
3、本发明提供一种bsai限制性内切酶的制备方法,包括以下步骤:
4、(1)构建r.bsai基因克隆质粒pet-bsair,将m.bsmai基因克隆至pet-bsair获得pet-bsmaim-bsair质粒;
5、(2)将阿拉伯糖操纵子基因克隆至pet-bsmaim-bsair,获得重组表达质粒pet-bsmaim-arabsair;
6、(3)将重组表达质粒pet-bsmaim-arabsair转入大肠杆菌top10菌株的感受态细胞中,筛选获得具备表达bsai限制性内切酶的重组表达菌株,诱导培养,纯化回收产物即为限制性内切酶bsai。
7、bsmai识别位点是gtctc,bsai酶识别位点是ggtctc,bsmbi酶识别位点是cgtctc,因此本发明构建含有甲基转移酶m.bsmai的重组表达质粒可以同时保护bsai,bsmbi,bsmai酶识别位点,继而获得表达bsai,bsmbi,bsmai酶的能力。
8、进一步地,步骤(1)中的r.bsai基因克隆质粒pet-bsair的构建方法包括以下步骤:从pet质粒载体中去除t7启动子序列,将sphi-ndei处进行置换,置换序列如seq id no:6所示,将置换序列与r.bsai基因序列融合,选择酶切位点为5’sphi-3’xhoi,通过基因重组方式构建入所述pet质粒载体中。
9、进一步地,所述大肠杆菌top10菌株的基因型为δ(mrr-hsdrms-mcrbc)或enda1。
10、mrr基因型具有切割甲基化dna(cmag/gmac)的能力,因此gag m6acc中的g m6ac会被切割。
11、因为最终产物是核酸酶,最下游应用时以dna作为底物进行特异性切割,因此enda1基因型可以避免最终产物中含有非特异性核酸酶,其好处是减少纯化bsai难度,同时保障bsai在分子克隆中的特异性。
12、进一步地,所述大肠杆菌top10菌株为top10(arabadc–)。
13、top10(arabadc–)为原核表达专用菌株,此菌株的阿拉伯糖操纵子被破坏,可用于阿拉伯糖诱导的原核表达。
14、进一步地,所述r.bsai基因的核苷酸序列如seq id no:1所示,所述m.bsmai基因的核苷酸序列如seq id no:2所示。
15、进一步地,所述m.bsmai基因包含有3处bsai限制性内切酶识别以及切割位点,分别是agatcgagacc/tgaaagagacc/cgatcgagacc,用于bsai酶切电泳检测其甲基化保护的程度。
16、进一步地,所述m.bsmai基因的启动子为大肠杆菌deda的启动子,启动子下游接lac operator。m.bsmai的表达是受大肠杆菌阿拉伯糖操纵子控制,阿拉伯糖操纵子的核苷酸序列如seq id no:5所示。
17、本发明还提供采用上述bsai限制性内切酶的制备方法所制备的bsai限制性内切酶。
18、与现有技术相比,本发明构建的含有甲基转移酶m.bsmai的重组表达质粒可以同时保护bsai,bsmbi,bsmai酶识别位点,从而获得同时表达bsai,bsmbi,bsmai三种限制性内切酶的能力;此外,本发明提供的bsai限制性内切酶的制备方法流程简单,制备周期短,成本低,易于大规模生产制备,具有较好的产业化应用价值。
1.一种bsai限制性内切酶的制备方法,其特征在于,包括以下步骤:
2.如权利要求1所述的制备方法,其特征在于,所述r.bsai基因克隆质粒pet-bsair的构建方法包括以下步骤:从pet质粒载体中去除t7启动子序列,将sphi-ndei处进行置换,置换序列如seq id no:6所示,将置换序列与r.bsai基因序列融合,选择酶切位点为5’sphi-3’xhoi,通过基因重组方式构建入所述pet质粒载体中。
3.如权利要求1所述的制备方法,其特征在于,所述大肠杆菌top10菌株的基因型为δ(mrr-hsdrms-mcrbc)或enda1。
4.如权利要求1所述的制备方法,其特征在于,所述大肠杆菌top10菌株为top10(arabadc–)。
5.如权利要求1所述的制备方法,其特征在于,所述r.bsai基因的核苷酸序列如seq idno:1所示,所述m.bsmai基因的核苷酸序列如seq id no:2所示。
6.如权利要求5所述的制备方法,其特征在于,所述m.bsmai基因包含有3处bsai限制性内切酶识别以及切割位点。
7.如权利要求6所述的制备方法,其特征在于,所述m.bsmai基因的启动子为大肠杆菌deda的启动子,启动子下游接lac operator。
8.一种bsai限制性内切酶,其特征在于,所述bsai限制性内切酶由权利要求1~7任一项所述的制备方法制得。