一种与砧木南瓜抗根结线虫相关的分子标记及其应用

本发明属于农作物遗传育种，具体涉及一种与砧木南瓜抗根结线虫相关的分子标记及其应用。

背景技术：

1、南方根结线虫传统的防治方法是采用化学杀线虫剂来防治根结线虫，但是化学杀线虫剂给生态环境和人类的健康带来负面作用，因此需要寻找一种安全有效、绿色环保的防治措施。利用抗性品种防治线虫是一种绿色经济的方法，虽然目前还没有发现在葫芦科作物中商品化的抗根结线虫品种，但是，近年来随着抗线虫育种的研究深入，陆续发现了部分南瓜品种对根结线虫具有抗性，能够有效防治根结线虫病，可以作为黄瓜的抗根结线虫砧木。

2、筛选适合的抗性砧木，不仅可以减少线虫对植物的侵染，而且健壮的根系还可以为地上部植株提供充足的水分和营养物质，提高作物产量。随着南瓜全基因组测序工作的不断完善，通过同科其他作物的抗性基因来寻找目的物种的同源抗性基因，已成为一种高效快速鉴定、分离抗病基因的策略。然而，不同南瓜种质间根结线虫抗性鉴定、抗性基因分离与特征分离以及相关抗性遗传标记开发利用等方面鲜有报道，极大制约了高抗根结线虫优异南瓜种质创制与品种遗传改良。

技术实现思路

1、本发明的目的是提供一种与砧木南瓜抗根结线虫相关的分子标记及其应用，从而为砧木南瓜的种质创新和品种改良提供有效的技术手段。

2、本发明首先提供一种与砧木南瓜抗根结线虫相关的分子标记，所述的分子标记，其核苷酸序列为：

3、gggaaatggaaagaatcgtccttgcaccaccacccatacatctatcatgtcttccctctccaaaccaataagcttttgcatgtgccctgccccctcctccctctttcctttcctttttctttttcatatcaactatttacaaacattactattctcccactatttcaaggatttg(seq id no:1)；

4、本发明还提供一种用于检测上述分子标记的引物对，其一种具体的序列信息如下：

5、上游引物f：5'-gggaaatggaaagaatcgt-3'(seq id no:2)、

6、下游引物r：5'-caaatccttgaaatagtggg-3'(seq id no:3)；

7、本发明另一个方面提供一种筛选具有抗根结线虫砧木南瓜单株的方法，是通过检测上述的基因位点来实现的；

8、所述的方法，是通过pcr扩增待检测的砧木南瓜单株的核酸样品，pcr产物进行基因测序分析后确定待检测的单株的基因型，来确定是否具有抗根结线虫抗性；

9、所述的pcr扩增方法，其中所使用的引物的序列信息如下：

10、f 5'-gggaaatggaaagaatcgt-3'(seq id no:2)、

11、r 5'-caaatccttgaaatagtggg-3'(seq id no:3)。

12、本发明所筛选的分子标记与砧木南瓜抗根结线虫的相关性，该分子标记区分抗病与感病单株的符合度达85％以上，并通过pcr与基因测序法可快速鉴定对应抗性。因此，生产中可优先选择该位点基因作为亲本进行规模养殖。

技术特征：

1.一种与砧木南瓜抗根结线虫相关的分子标记，其特征在于，所述的分子标记的核苷酸序列为seq id no:1。

2.一种引物对，其特征在于，所述的引物对用于检测权利要求1所述的分子标记。

3.如权利要求2所述的引物对，其特征在于，所述的引物对，其中上游引物的序列为seqid no:2，下游引物的序列为seq id no:3。

4.一种筛选具有抗根结线虫砧木南瓜单株的方法，其特征在于，所述的方法是通过检测权利要求1所述的分子标记来进行筛选。

5.如权利要求4所述的方法，其特征在于，所述的方法，是通过pcr扩增待检测的砧木南瓜单株的核酸样品，对pcr产物进行基因测序分析后确定待检测的单株的基因型，来确定是否具有抗根结线虫抗性。

6.如权利要求5所述的方法，其特征在于，所述的pcr扩增使用的引物对，其中上游引物的序列为seq id no:2，下游引物的序列为seq id no:3。

7.权利要求2或3所述的引物对在制备用于筛选抗根结线虫砧木南瓜的制品中的应用。

8.如权利要求7所述的应用，其特征在于，所述的制品为pcr扩增检测试剂盒。

9.一种用于筛选抗根结线虫砧木南瓜的pcr扩增检测试剂盒，其特征在于，所述的试剂盒中包含有用于检测权利要求1所述的分子标记的引物对。

10.如权利要求9所述的试剂盒，其特征在于，所述的引物对，其中上游引物的序列为seq id no:2，下游引物的序列为seq id no:3。

技术总结
本发明提供一种与砧木南瓜抗根结线虫相关的分子标记及其应用，从而为砧木南瓜的种质创新和品种改良提供有效的技术手段。所提供的分子标记，其核苷酸序列为SEQ ID NO:1；用于检测上述分子标记的引物对，其中上游引物的序列为SEQ ID NO:2，下游引物的序列为SEQ ID NO:3。本发明所筛选的分子标记与砧木南瓜抗根结线虫的相关性，该分子标记区分抗病与感病单株的符合度达85％以上，并通过PCR与基因测序法可快速鉴定对应抗性。因此，生产中可优先选择该位点基因作为亲本进行规模养殖。

技术研发人员：程斐,赵紫彤,刘萍,从恩霞,郭仁波
受保护的技术使用者：青岛农业大学
技术研发日：
技术公布日：2024/6/5