一种调控玉米光周期的Indel分子标记及其应用的制作方法

本发明属于生物，具体涉及一种调控玉米光周期indel分子标记及其应用。

背景技术：

1、玉米是一种重要的粮食作物、经济作物以及工业原料，其产量对保障国民经济生产与人们生活具有重要意义，高产仍然是现阶段玉米生产的首要目标。热带玉米种质与其他玉米种质资源遗传交流较少，具有丰富的遗传多样性，从而形成特殊的种质类群，表现出根系发达，抗病抗虫，耐高温耐阴雨，持绿性好的优良性状，但是，热带玉米种质在温带地区种植往往光周期敏感性强，表现出极大的不适应性。光周期是昼夜间的光暗交替，直接影响植物的开花转换，还影响作物种子的发育或者器官的形成等，间接影响作物产量。光周期敏感的玉米种质材料，表现出生育期变长，花期不育，结实受阻等，不利于丰富种质资源和品种改良。光周期作为复杂的数量性状，受多数微效等位基因和环境共同影响。因此，借助分子生物技术改良与光周期相关的重要性状，从而间接提高产量是极其有效的方式，对实现玉米高产的育种目标具有重要意义。

技术实现思路

1、基于以上背景，本发明不仅提供一种调控玉米光周期indel分子标记及其应用，可为玉米光周期敏感性性的遗传改良及其分子育种中提供有效、可靠的分子辅助选择手段。

2、本发明的技术方案为：

3、本发明的目的之一是提供：

4、一种调控玉米光周期的indel分子标记，其特征在于，所述indel分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示：ggattttttccc。

5、进一步地，所述indel分子标记存在于性状表现出光敏感的玉米zmgi基因的非编码区，但不在于性状表现出光不敏感性的玉米zmgi基因的非编码区。

6、进一步地，所述性状包括株高和穗位高。

7、本发明的目的之二是提供：上述的indel分子标记的应用，所述应用至少包括以下一种：

8、1)在对玉米光周期敏感性进行鉴定或筛选中的应用；

9、2)在对玉米光周期敏感性的遗传改良和/或育种中的应用。

10、本发明的目的之三是提供：

11、一种用于扩增上述的indel分子标记的引物对，所述引物对的核苷酸序列分别如seq id no.2和seq id no.3所示：

12、前引物f：5’-tttttccctgtgcggatctc-3’(seq id no.2)；

13、后引物r：5’-cgaggctagccaaaacagtc-3’(seq id no.3)。

14、本发明的目的之四是提供：

15、上述的引物对的应用，所述应用至少包括以下一种：

16、1)在对玉米光周期敏感性进行鉴定或筛选中的应用；

17、2)在对玉米光周期敏感性的遗传改良和/或育种中的应用。

18、本发明的目的之四是提供：

19、一种用于对玉米光周期敏感性进行检测或筛选中的应用中的试剂盒，其包括上述的引物对。

20、本发明的目的之五是提供一种玉米光周期敏感性的鉴定或筛选方法，其包括如下步骤：

21、提取待测玉米基因组dna，利用上述的引物对进行pcr扩增；

22、对pcr扩增产物测序，当测序结果显示所测待测玉米植株含有所述的indel分子标记时，待测玉米为光周期敏感性；当所测待测玉米植株中缺失所述的indel分子标记时，待测玉米为光周期不敏感性。

23、本发明的目的之六是提供：

24、一种玉米育种方法，其以玉米单株叶片dna为模板，以所述的引物对进行pcr扩增，得扩增产物；对扩增产物进行测序并进行鉴定，如鉴定结果缺失所述的indel分子标记时，则将玉米单株进行自交授粉获得目标基因稳定遗传自交系。

25、本发明的目的之七是提供：一种玉米光周期相关的分子标记，所述分子标记的核苷酸序列如seq id no.4所示。

26、本发明的目的之八是提供：上述分子标记的应用，其应用至少包括以下一种：

27、1)在对玉米光周期敏感性进行鉴定或筛选中的应用；

28、2)在对玉米光周期敏感性的遗传改良和/或育种中的应用。

29、相比现有技术，本发明的有益效果为：

30、本发明为玉米的光周期敏感性的鉴定或筛选提供了一种有效的分子辅助选择手段，可应用于对玉米的光周期敏感改良遗传及其育种，可有效缩短育种年限，加快育种进程，提高了育种效率，加快筛选优异种质资源的进程，为降低育种成本提供新的方向，通过对缺失indel分子标记的玉米单株进行授粉保种，可用于玉米制种，具有广阔的前景。

技术特征：

1.一种调控玉米光周期的indel分子标记，其特征在于，所述indel分子标记的核苷酸序列如seq id no.1所示：ggattttttccc。

2.根据权利要求1所述的一种调控玉米光周期的indel分子标记，其特征在于，所述indel分子标记存在于性状表现出光敏感的玉米zmgi基因的非编码区上，但不在于性状表现出光不敏感性的玉米zmgi基因的编码区。

3.根据权利要求2所述的一种调控玉米光周期的indel分子标记，其特征在于，所述性状包括株高和穗位高。

4.权利要求1至3任一项所述的一种调控玉米光周期的indel分子标记的应用，其特征在于，所述应用至少包括以下一种：

5.一种用于扩增权利要求1至5所述的indel分子标记的引物对，其特征在于，所述引物对的核苷酸序列分别如seq id no.2和seq id no.3所示：

6.权利要求5所述的引物对的应用，其特征在于，所述应用至少包括以下一种：

7.一种玉米光周期敏感性的鉴定或筛选方法，其特征在于，其包括如下步骤：

8.一种玉米育种方法，其特征在于，其以玉米单株叶片dna为模板，以权利要求6所述的引物对进行pcr扩增，得扩增产物；对扩增产物进行测序并进行鉴定，如鉴定结果缺失权利要求1所述的indel分子标记时，则将玉米单株进行自交授粉获得目标基因稳定遗传自交系。

9.一种玉米光周期相关的分子标记，其特征在于，所述分子标记的核苷酸序列如seqid no.4所示。

10.权利要求9所述的分子标记的应用，其特征在于，所述应用至少包括以下一种：

技术总结
本发明公开一种调控玉米光周期Indel分子标记及其应用，其存在于性状表现出光敏感的玉米ZmGI基因的编码区，本发明为玉米的光周期敏感性的鉴定或筛选提供了一种有效的分子辅助选择手段，可应用于对玉米的光周期敏感改良遗传及其育种，可有效缩短育种年限，加快育种进程，提高了育种效率，加快筛选优异种质资源的进程，为降低育种成本提供新的方向，通过对缺失InDel分子标记的玉米单株进行授粉保种，可用于玉米制种，具有广阔的前景。

技术研发人员：陆雪峰,吴迅,涂亮,蒋喻林,刘鹏飞,郭向阳,王安贵,祝云芳,陈泽辉
受保护的技术使用者：贵州省旱粮研究所（贵州省高粱研究所）（贵州省玉米工程技术研究中心）
技术研发日：
技术公布日：2024/7/11