本公开涉及临床检测,具体地,涉及一种通过分子标志物辨识类风湿关节炎的中医证型的试剂盒和系统。
背景技术:
1、类风湿关节炎(rheumatoid arthritis,ra)是一种病因未明的慢性、以炎性滑膜炎为主的系统性疾病。其特征是手、足小关节的多关节、对称性、侵袭性关节炎症,经常伴有关节外器官受累及血清类风湿因子阳性,可以导致关节畸形及功能丧失。ra的早期诊断对治疗和预后影响重大,受到了越来越广泛的关注。
2、西医学对ra的诊察侧重于客观量化,临床上主要参照1987年acr发布的ra分类标准与2010年acr/eular发布的ra分类标准进行诊断。1987年acr发布的ra分类标准以研究ra同质患者群体为目的,其数据源于平均病程为7年的患者,故对早期ra患者不够敏感。2010年acr/eular发布的ra分类标准对早期ra的诊断敏感性更高(72.3% vs 39.1%),但特异性更低(83.2% vs 92.4%)(尤其针对老年患者)。ra在中医学归属于“痹病”的范畴,中医药治疗ra的特色在于辨证论治。ra患者的基因表达以及临床表现(基因型与表型)均具有明显的多样性和复杂性,因此,临床上西医以“疾病”为主体的诊疗模式和中医以“证候”为主体的诊疗模式并存,然而,目前关于ra中西医结合的诊断治疗指南仍有欠缺,制约了ra的精准诊断和及早治疗。所以,针对ra高风险人群,提供准确易行的中医早期证候分型诊断辅助方法,显得尤为重要。
技术实现思路
1、本公开的目的是提供一种通过分子标志物辨识类风湿关节炎的中医证型的试剂盒和系统。本公开的系统和试剂盒能够通过分子标志物的相对表达量对类风湿关节炎的不同中医证型进行区分,协助做出较早期的诊断,为指导临床提供有效的依据。
2、为了实现上述目的,本公开第一方面提供一种辨识类风湿关节炎的中医证型的系统,该系统包括计算装置、用于输入类风湿关节炎患者个体的分子生物标志的表达量的输入装置和用于输出类风湿关节炎诊断结果的输出装置;其中,所述分子标志物包括marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33;所述类风湿关节炎的中医证型包括湿热痹阻证、痰瘀痹阻证和风湿痹阻证;
3、所述计算机装置包括存储器和处理器,所述存储器中存储有计算机程序;所述处理器被配置为执行所述存储器中存储的计算机程序,以构建二分类模型和/或实现如下判别:
4、若marcks、rnf19b和dcaf12中至少一个分子标志物的相对表达量大于相对应分子标志物二分类模型的roc曲线的最佳截断值,则表示湿热痹阻证成立;若gata3、gtpbp4和dnajb11中至少一个分子标志物的相对表达量大于相对应分子标志物二分类模型的roc曲线的最佳截断值,则表示痰瘀痹阻证成立;若klf9、ugcg和snora33中至少一个分子标志物的相对表达量大于相对应分子标志物二分类模型的roc曲线的最佳截断值,则表示风湿痹阻证成立;所述相对表达量是指相对于内参的表达量值。
5、可选地,所述marcks二分类模型的roc曲线的最佳截断值为0.947,所述rnf19b二分类模型的roc曲线的最佳截断值为5.568,所述dcaf12二分类模型的roc曲线的最佳截断值为4.941,所述gata3二分类模型的roc曲线的最佳截断值的截断值为0.927,所述gtpbp4二分类模型的roc曲线的最佳截断值为3.155,所述dnajb11二分类模型的roc曲线的最佳截断值为2.732,所述klf9二分类模型的roc曲线的最佳截断值为2.152,所述ugcg二分类模型的roc曲线的最佳截断值为5.677,所述snora33二分类模型的roc曲线的最佳截断值为19.734。
6、可选地,该系统还包括分子标志物的表达量的检测装置;所述检测装置包括分子标志物表达量检测芯片和芯片信号读取器,分子标志物表达量检测芯片包括分别检测marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33的表达量的探针。
7、可选地,所述分子标志物表达量检测芯片还包括内参探针,所述内参探针为检测gapdh或β-actin的表达量的探针。
8、可选地,所述检测装置包括实时定量pcr仪和分子标志物的实时定量pcr引物,所述分子标志物的实时定量pcr引物包括分别检测marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33的表达量的实时定量pcr引物。
9、可选地,所述分子标志物的实时定量pcr引物还包括内参引物,所述内参引物为检测gapdh或β-actin的实时定量pcr引物。
10、本公开第二方面提供一种检测分子标志物表达水平的试剂在制备用于辨识类风湿关节炎的中医证型的产品中的用途,所述分子标志物包括marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33。
11、可选地,定量检测分子标志物是通过以下步骤进行的:(1)获得类风湿关节炎患者的血清样本;(2)确定所述血清样本中分子标志物的表达水平。
12、本公开第三方面提供一种用于辨识类风湿关节炎的中医证型的试剂盒,所述试剂盒包括定量检测分子标志物表达水平的试剂,所述分子标志物包括marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33。
13、本公开第四方面提供一种用于辨识类风湿关节炎的中医证型的分子标志物组合,该分子标志物组合包括marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33。
14、通过上述技术方案,本公开提供了一种通过分子标志物辨识类风湿关节炎的中医证型的试剂盒和系统,该系统和用途可以应用于通过检测分子标志物的表达量对类风湿关节炎的不同中医证型进行区分,协助做出较早期的诊断,诊断结果准确率高、稳定性好。当类风湿关节炎患者的中医证型区分后,可以建议医生针对类风湿关节炎患者的中医证型进行积极的治疗,为指导临床提供了有效的依据,也为类风湿关节炎辩证分型的科学内涵提供了客观依据。
15、本公开的其他特征和优点将在随后的具体实施方式部分予以详细说明。
1.一种辨识类风湿关节炎的中医证型的系统,其特征在于,该系统包括计算装置、用于输入类风湿关节炎患者个体的分子生物标志的表达量的输入装置和用于输出类风湿关节炎诊断结果的输出装置;其中,所述分子标志物包括marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33;所述类风湿关节炎的中医证型包括湿热痹阻证、痰瘀痹阻证和风湿痹阻证;
2.根据权利要求1所述的系统,其中,所述marcks二分类模型的roc曲线的最佳截断值为0.947,所述rnf19b二分类模型的roc曲线的最佳截断值为5.568,所述dcaf12二分类模型的roc曲线的最佳截断值为4.941,所述gata3二分类模型的roc曲线的最佳截断值的截断值为0.927,所述gtpbp4二分类模型的roc曲线的最佳截断值为3.155,所述dnajb11二分类模型的roc曲线的最佳截断值为2.732,所述klf9二分类模型的roc曲线的最佳截断值为2.152,所述ugcg二分类模型的roc曲线的最佳截断值为5.677,所述snora33二分类模型的roc曲线的最佳截断值为19.734。
3.根据权利要求1所述的系统,其中,该系统还包括分子标志物的表达量的检测装置;所述检测装置包括分子标志物表达量检测芯片和芯片信号读取器,分子标志物表达量检测芯片包括分别检测marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33的表达量的探针。
4.根据权利要求3所述的系统,其中,所述分子标志物表达量检测芯片还包括内参探针,所述内参探针为检测gapdh或β-actin的表达量的探针。
5.根据权利要求4所述的系统,其中,所述检测装置包括实时定量pcr仪和分子标志物的实时定量pcr引物,所述分子标志物的实时定量pcr引物包括分别检测marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33的表达量的实时定量pcr引物。
6.根据权利要求5所述的系统,其中,所述分子标志物的实时定量pcr引物还包括内参引物,所述内参引物为检测gapdh或β-actin的实时定量pcr引物。
7.一种检测分子标志物表达水平的试剂在制备用于辨识类风湿关节炎的中医证型的产品中的用途,其中,所述分子标志物包括marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33。
8.根据权利要求7所述的用途,其中,定量检测分子标志物是通过以下步骤进行的:
9.一种用于辨识类风湿关节炎的中医证型的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括定量检测分子标志物表达水平的试剂,所述分子标志物包括marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33。
10.一种用于辨识类风湿关节炎的中医证型的分子标志物组合,其特征在于,该分子标志物组合包括marcks、rnf19b、dcaf12、gata3、gtpbp4、dnajb11、klf9、ugcg和snora33。