影响猪中C14:0含量或C18:1n9含量的猪12号染色体上的SNP标记

本发明涉及分子标记领域，特别涉及影响猪中c14:0含量或c18:1n9含量的猪12号染色体上的snp标记。

背景技术：

1、猪是六畜之首，是中国人最重要的肉食来源，我国每年生产消费5亿头猪，占全球总耗费量的一半，每个中国人平均一年要消费掉近40公斤的猪肉，远远高于其他肉类的总和。而猪肉中富含大量的营养物质，为人体提供包括：蛋白质、多种必需氨基酸、脂肪酸、丰富的微量元素等营养物质。其中脂肪酸作为一类营养物质，与人类日常生活以及身体健康息息相关。大多数不饱和脂肪酸(如油酸、亚油酸、亚麻酸等必需脂肪酸)人类自身不能合成，需要靠外界摄入。

2、c14:0，也被称为肉豆蔻酸，是一种饱和脂肪酸。研究表明，c14:0不仅会升高低密度脂蛋白、胆固醇和中性脂肪的含量，而且c14:0摄入量过高还会导致血胆固醇、三酰甘油、ldl-c升高，继而引发动脉管腔狭窄，形成动脉粥样硬化，增加患冠心病的风险。c18:1n9，可用于预防心脏病和降低胆固醇，以及预防癌症和其他疾病。另外，c18:1n9在猪肉中的含量与猪肉的风味呈正相关，对猪的肉质有正面的影响。因此，适当提高猪肉脂肪酸中c18:1n9的含量，可以提供猪肉的风味，且对人类健康有益；降低脂肪酸c14:0的含量，可以有效地缓解各种诱发人类疾病的风险。

3、由于脂肪酸性状的测定成本高，费时费力，且需要屠宰后取样测定，利用传统基于家系信息的遗传育种技术来改良脂肪酸效率不高。猪肉作为一种富含饱和脂肪酸与不饱和脂肪酸的肉类食品，挖掘出影响脂肪酸性状的分子标记，对于肉质改良、育种群体改良、生猪养殖的经济效应、以及人类健康都有重大的意义。

技术实现思路

1、本发明之一提供了一种猪的snp标记，所述snp标记的核酸的序列如seq id no.1所示，所述snp标记的位点位于如seq id no.1所示的核酸上的从5’端起的第301位，对应于11.1版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第516894位，为g或a。

2、本发明之二提供了本发明之一中所述的snp标记在辅助鉴定猪脂肪酸含量中的应用。即可以先通过snp标记高通量筛选出c14:0的含量较低和/或c18:1n9的含量较高的g/g基因型和/或g/a基因型，再根据需要基于常规方法(例如《食品安全国家标准食品中脂肪酸的测定gb5009.168—2016》中所述及到的方法)对g/g基因型和/或g/a基因型进行定量测定，或省略定量测定步骤，仅基于snp标记的基因型作出选择。

3、在一个具体实施方式中，所述脂肪酸含量包括c14:0的含量和/或c18:1n9的含量。

4、在一个具体实施方式中，基于所述猪脂肪酸含量，所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型。

5、在一个具体实施方式中，基于所述c14:0的含量，所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型。

6、在一个具体实施方式中，基于所述c18:1n9的含量，所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型。

7、在一个具体实施方式中，所述猪为杜洛克、大白、长白、皮特兰、二花脸、莱芜、巴马香和藏猪的杂交嵌合猪。

8、在一个具体实施方式中，所述猪为杜洛克、大白、长白、皮特兰、二花脸、莱芜、巴马香和藏猪的杂交嵌合猪的f6代、f7代或f7代的后代。

9、本发明之三提供了一种辅助猪遗传改良的方法，所述方法包括：确定种猪核心群中的种猪的如本发明之一所述的snp标记，并根据所述snp标记做出相应的选择：在所述种猪核心群中选择在所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点为g/a或g/g基因型的种猪个体，淘汰在该位点为a/a基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因g的频率。

10、在一个具体实施方式中，在所述种猪核心群中选择在所述seq id no.1上的从5’端起的第301位点为g/g基因型的种猪个体，淘汰在该位点为g/a和a/a基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因g的频率。

11、在一个具体实施方式中，利用分析所述种猪的核酸的序列来确定所述种猪的如本发明之一所述的snp标记，其中所述核酸的序列如seq id no.1所示。

12、在一个具体实施方式中，所述猪的来源为杜洛克、大白、长白、皮特兰、二花脸、莱芜、巴马香和藏猪的杂交嵌合猪。

13、在一个具体实施方式中，所述猪的来源为杜洛克、大白、长白、皮特兰、二花脸、莱芜、巴马香和藏猪的杂交嵌合猪的f6代、f7代或f7代的后代。

14、本发明的有益效果：

15、本发明的snp标记12_516894与猪脂肪酸含量显著相关，特别是与c14:0的含量和c18:1n9的含量显著相关，因此可以通过本发明的snp标记对猪群该位点进行判型，并通过该snp标记可以对猪中的脂肪酸含量进行辅助鉴定或对猪群进行与脂肪酸含量相关的遗传改良。

16、通过改良12_516894snp位点，提高该位点等位基因g的频率，降低等位基因a的频率，可以降低c14:0的含量，提高c18:1n9的含量。其中，降低c14:0的含量有利于降低人患2型糖尿病，心脑管等疾病的风险；而提高c18:1n9的含量有利于提高肉质的风味，可预防心脏病和降低胆固醇，以及预防癌症和其他疾病，为人类健康带来益处。

技术特征：

1.一种猪的snp标记，所述snp标记的核酸的序列如seq id no.1所示，所述snp标记的位点位于如seq id no.1所示的核酸上的从5’端起的第301位，对应于11.1版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第516894位，为g或a。

2.如权利要求1所述的snp标记在辅助鉴定猪脂肪酸含量中的应用。

3.根据权利要求2所述的应用，其特征在于，所述脂肪酸含量包括c14:0的含量和/或c18:1n9的含量。

4.根据权利要求2或3所述的应用，其特征在于，基于所述猪脂肪酸含量，所述seq idno.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型。

5.根据权利要求3所述的应用，其特征在于，基于所述c14:0的含量，所述seq idno.1上的从5’端起的第301位点基因型的优选顺序依次为：g/g基因型、g/a基因型和a/a基因型；和/或

6.根据权利要求2至5中任意一项所述的应用，其特征在于，所述猪为杜洛克、大白、长白、皮特兰、二花脸、莱芜、巴马香和藏猪的杂交嵌合猪。

7.一种辅助猪遗传改良的方法，所述方法包括：确定种猪核心群中的种猪的如权利要求1所述的snp标记，并根据所述snp标记做出相应的选择：

8.根据权利要求7所述的方法，其特征在于，在所述种猪核心群中选择在所述seq idno.1上的从5’端起的第301位点为g/g基因型的种猪个体，淘汰在该位点为g/a和a/a基因型的种猪个体，以逐代提高该位点的等位基因g的频率。

9.根据权利要求7或8所述的方法，其特征在于，利用分析所述种猪的核酸的序列来确定所述种猪的如权利要求1所述的snp标记，其中所述核酸的序列如seq id no.1所示。

10.根据权利要求7或8所述的方法，其特征在于，所述猪的来源为杜洛克、大白、长白、皮特兰、二花脸、莱芜、巴马香和藏猪的杂交嵌合猪。

技术总结
本发明提供了影响猪中C14:0含量或C18:1n9含量的猪12号染色体上的SNP标记。所述SNP标记的核酸的序列如SEQ ID No.1所示，所述SNP标记的位点位于如SEQ ID No.1所示的核酸上的从5’端起的第301位，对应于11.1版本国际猪基因组的12号染色体上的从5’端起的第516894位，为G或A。

技术研发人员：黄路生,杨斌,艾华水,张志燕,陈佐权,晏敏
受保护的技术使用者：江西农业大学
技术研发日：
技术公布日：2024/10/10