本发明属于分子生物学领域,涉及一种采用分子生物学手段鉴定中药的方法,具体为一种用于鉴定南板蓝根的引物对及其应用。
背景技术:
南板蓝根来源于爵床科植物马蓝的干燥根茎及根,功能清热解毒,凉血消斑、丹毒等。长期以来,其作为抗病毒、消炎、防治流感等方面的高效中药材,在我国南方地区应用十分广泛,是著名的南药之一。当前,随着抗病毒有效成分腺苷、喹唑酮等化合物的相继发现,使得该药更是成为抗病毒的焦点南药,其在sars、h1n1等病毒性疾病的临床治疗方面发挥着重要作用。
然而,从目前南板蓝根市场的流通来看,南板蓝根药材来源主要为栽培品。由于先进的种植技术推广力度不足,人们对南板蓝根的种植不够重视,导致南板蓝根的种植成本增加,种植面积不断缩小致使南板蓝根药材资源短缺,产品供不应求,出现同科植物球花马蓝、疏花马蓝、少花马蓝以及广西马蓝等伪劣品不断充斥市场,南板蓝根临床用药的安全性和有效性常得不到保证。
技术实现要素:
本发明的目的是:为了克服现有技术的缺陷,获得一种准确度高、客观性强的南板蓝根鉴定方法,本发明提供了一种用于鉴定南板蓝根的引物对及其应用。
技术方案:一种用于鉴定南板蓝根的引物对,所述引物对及其序列为:p1,seqidno.1~2;p2,seqidno.3~4;p3,seqidno.5~6。
优选的,所述引物对p1、p2和p3的上游引物的5,端加上特异性的gc发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为seqidno.7。
表1引物对及发卡结构序列
所述引物对在制备鉴定南板蓝根试剂盒中的应用。
优选的,所述试剂盒的组分包括:引物对、dntp、dna聚合酶、lcgreen、反应缓冲液。
优选的,所述试剂盒鉴定南板蓝根的步骤包括:
(1)提取南板蓝根样品的基因组dna;
(2)以步骤(1)提取的基因组dna为模板,以p1为特异性引物,进行第一轮pcr扩增;
(3)取步骤(2)的扩增产物,稀释200~500倍后作为第二轮pcr的模板,以p2作为特异性引物,进行第二轮pcr扩增;
(4)取第二轮pcr扩增的产物,稀释10~100倍后作为第三轮pcr的模板,以p3作为特异性引物,进行第三轮pcr扩增;
(5)收集第三轮pcr扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。
优选的,所述南板蓝根样品的基因组dna的提取方法是试剂盒法或改良ctab法。
优选的,所述pcr扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。
有益效果:(1)本发明所述引物对具有特异性好,灵敏度高,稳定性强的优点;(2)本发明所述方法准确度高、客观性强。
附图说明
图1是实施例1~3pcr鉴定结果电泳图;
其中m为分子量为2000的maker;1为实施例1pcr产物鉴定结果;2为实施例2pcr产物鉴定结果;3为实施例3pcr产物鉴定结果。
具体实施方式
实施例1
一种用于鉴定南板蓝根的引物对,所述引物对及其序列为:p1,seqidno.1~2;p2,seqidno.3~4;p3,seqidno.5~6。
所述引物对p1、p2和p3的上游引物的5,端加上特异性的gc发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为seqidno.7。
所述引物对在制备鉴定南板蓝根试剂盒中的应用。
所述试剂盒的组分包括:引物对、dntp、dna聚合酶、lcgreen、反应缓冲液。
所述试剂盒鉴定南板蓝根的步骤包括:
(1)提取南板蓝根样品的基因组dna;
(2)以步骤(1)提取的基因组dna为模板,以p1为特异性引物,进行第一轮pcr扩增;
(3)取步骤(2)的扩增产物,稀释200倍后作为第二轮pcr的模板,以p2作为特异性引物,进行第二轮pcr扩增;
(4)取第二轮pcr扩增的产物,稀释100倍后作为第三轮pcr的模板,以p3作为特异性引物,进行第三轮pcr扩增;
(5)收集第三轮pcr扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。
所述南板蓝根样品的基因组dna的提取方法是试剂盒法或改良ctab法。
所述pcr扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。
实施例2
一种用于鉴定南板蓝根的引物对,所述引物对及其序列为:p1,seqidno.1~2;p2,seqidno.3~4;p3,seqidno.5~6。
所述引物对p1、p2和p3的上游引物的5,端加上特异性的gc发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为seqidno.7。
所述引物对在制备鉴定南板蓝根试剂盒中的应用。
所述试剂盒的组分包括:引物对、dntp、dna聚合酶、lcgreen、反应缓冲液。
所述试剂盒鉴定南板蓝根的步骤包括:
(1)提取南板蓝根样品的基因组dna;
(2)以步骤(1)提取的基因组dna为模板,以p1为特异性引物,进行第一轮pcr扩增;
(3)取步骤(2)的扩增产物,稀释500倍后作为第二轮pcr的模板,以p2作为特异性引物,进行第二轮pcr扩增;
(4)取第二轮pcr扩增的产物,稀释10倍后作为第三轮pcr的模板,以p3作为特异性引物,进行第三轮pcr扩增;
(5)收集第三轮pcr扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。
所述南板蓝根样品的基因组dna的提取方法是试剂盒法或改良ctab法。
所述pcr扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。
实施例3
一种用于鉴定南板蓝根的引物对,所述引物对及其序列为:p1,seqidno.1~2;p2,seqidno.3~4;p3,seqidno.5~6。
所述引物对p1、p2和p3的上游引物的5,端加上特异性的gc发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为seqidno.7。
所述引物对在制备鉴定南板蓝根试剂盒中的应用。
所述试剂盒的组分包括:引物对、dntp、dna聚合酶、lcgreen、反应缓冲液。
所述试剂盒鉴定南板蓝根的步骤包括:
(1)提取南板蓝根样品的基因组dna;
(2)以步骤(1)提取的基因组dna为模板,以p1为特异性引物,进行第一轮pcr扩增;
(3)取步骤(2)的扩增产物,稀释300倍后作为第二轮pcr的模板,以p2作为特异性引物,进行第二轮pcr扩增;
(4)取第二轮pcr扩增的产物,稀释25倍后作为第三轮pcr的模板,以p3作为特异性引物,进行第三轮pcr扩增;
(5)收集第三轮pcr扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。
所述南板蓝根样品的基因组dna的提取方法是试剂盒法或改良ctab法。
所述pcr扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。
如图1所示,将实施例1~3的扩增产物进行电泳检测,条带清晰可见,产物单一。
sequencelisting
<110>苏州市李良济健康产业有限公司
<120>一种用于鉴定南板蓝根的引物对及其应用
<130>
<160>7
<170>patentinversion3.3
<210>1
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>1
atgcgatacttgactgtgaat21
<210>2
<211>21
<212>dna
<213>人工序列
<400>2
gacgcttacgcagactacaat21
<210>3
<211>22
<212>dna
<213>人工序列
<400>3
gttatgcatctacgtaatgctc22
<210>4
<211>20
<212>dna
<213>人工序列
<400>4
cgcgcatccattcacaatcc20
<210>5
<211>25
<212>dna
<213>人工序列
<400>5
cgtacagtacaattgtgttaacgag25
<210>6
<211>27
<212>dna
<213>人工序列
<400>6
acccagtccatgacataatcttggttc27
<210>7
<211>40
<212>dna
<213>人工序列
<400>7
cgcccgccgcgcgcggcgggcggggcgggggcacgggggg40