一种用于鉴定浙贝母的引物对及其应用的制作方法

文档序号:11246408阅读:694来源:国知局
本发明属于分子生物学领域,涉及一种采用分子生物学手段鉴定中药的方法,具体为一种用于鉴定浙贝母的引物对及其应用。
背景技术
:浙贝母为道地药材“浙八味”之一,具有润肺止咳的功效,用药历史悠久。贝母品种较多,除了浙贝母外,贝母主要品种还包括川贝母、湖北贝母、平贝母和伊贝母,另外流通领域还存在较多贝母伪品。不同品种的贝母药效差异显著,而且价格相差较大,需要建立一种准确、高效的鉴定方法。目前,较多学者利用rapd技术对浙贝母及其它药材进行分子鉴定,但是由于rapd实验应用的是随机引物,导致实验结果重复性差,无法推广应用。中药的基源鉴定是中药研究工作的基础和关键。品种混乱现象是目前贝母类药材在实际应用中较难以克服的问题,而传统的鉴别方法又有一定的主观性,特别是对一些开花前的新鲜贝母药材、干燥或破碎药材,鉴定时更为困难,不仅如此,贝母属植物种间的化学成分差异较大,用理化方法鉴定时也比较困难。核糖体dna的内转录间隔区基因与5srdna转录间隔区基因是目前研究中应用较多的序列片段之一,是被子植物进化研究中重要的dna分子标记。针对目前贝母类药材基源混乱,部分资源短缺的状况,为了建立有效的鉴别方法,同时了解贝母属植物的种系关系,并从中寻找出可利用的药用贝母资源,对贝母的样品进行高效、准确的分子鉴定尤为重要。技术实现要素:本发明的目的是:为了克服现有技术的缺陷,获得一种适用于浙贝母,且能够特异性识别浙贝母的基因片段,准确、快速进行贝母品种区分的方法,本发明提供了一种用于鉴定浙贝母的引物对及其应用。技术方案:一种用于鉴定浙贝母的引物对,所述引物对及其序列为:p1,seqidno.1~2;p2,seqidno.3~4;p3,seqidno.5~6。优选的,所述引物对p1、p2和p3的上游引物的5’端加上特异性的gc发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为seqidno.7。表1引物对及发卡结构序列名称序列(5’-3’)seqidno.p1-fggacagtactgggggagaagtc1p1-rgccaaatggagggtatgtgtcg2p2-fcgtaacaaggtttccgtaggtgaa3p2-rttattgatatgcttaaactcagcggg4p3-fggatccgtgcttgggcgagagtagta5p3-rggatccttagtgctggtatgatcgca6发卡结构cgcccgccgcgcgcggcgggcggggcgggggcacgggggg7所述引物对在制备鉴定中药浙贝母试剂盒中的应用。优选的,所述试剂盒的组分包括:引物对、dntp、dna聚合酶、lcgreen、反应缓冲液。优选的,所述试剂盒鉴定中药浙贝母的步骤为:(1)提取浙贝母样品的基因组dna;(2)以步骤(1)提取的基因组dna为模板,以p1为特异性引物,进行第一轮pcr扩增;(3)取步骤(2)的扩增产物,稀释100~1000倍后作为第二轮pcr的模板,以p2作为特异性引物,进行第二轮pcr扩增;(4)取第二轮pcr扩增的产物,稀释10~100倍后作为第三轮pcr的模板,以p3作为特异性引物,进行第三轮pcr扩增;(5)收集第三轮pcr扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。优选的,所述浙贝母样品的基因组dna的提取方法是试剂盒法或改良ctab法。优选的,所述pcr扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。有益效果:(1)本发明所述引物对能够直接对单一样品进行鉴定,因此该方法操作简单、准确、应用范围广等优点;(2)本发明所述引物对特异性好,结果重复性好,灵敏度高,适合开发成检测试剂盒。附图说明图1是实施例1~3pcr鉴定结果电泳图;其中m为分子量为2000的maker;1为实施例1pcr产物鉴定结果;2为实施例2pcr产物鉴定结果;3为实施例3pcr产物鉴定结果;4~7为市售其他品种贝母。具体实施方式实施例1一种用于鉴定浙贝母的引物对,所述引物对及其序列为:p1,seqidno.1~2;p2,seqidno.3~4;p3,seqidno.5~6。所述引物对p1、p2和p3的上游引物的5’端加上特异性的gc发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为seqidno.7。所述引物对在制备鉴定中药浙贝母试剂盒中的应用。所述试剂盒的组分包括:引物对、dntp、dna聚合酶、lcgreen、反应缓冲液。所述试剂盒鉴定中药浙贝母的步骤为:(1)提取浙贝母样品的基因组dna;(2)以步骤(1)提取的基因组dna为模板,以p1为特异性引物,进行第一轮pcr扩增;(3)取步骤(2)的扩增产物,稀释1000倍后作为第二轮pcr的模板,以p2作为特异性引物,进行第二轮pcr扩增;(4)取第二轮pcr扩增的产物,稀释10倍后作为第三轮pcr的模板,以p3作为特异性引物,进行第三轮pcr扩增;(5)收集第三轮pcr扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。所述浙贝母样品的基因组dna的提取方法是试剂盒法或改良ctab法。所述pcr扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。实施例2一种用于鉴定浙贝母的引物对,所述引物对及其序列为:p1,seqidno.1~2;p2,seqidno.3~4;p3,seqidno.5~6。所述引物对p1、p2和p3的上游引物的5’端加上特异性的gc发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为seqidno.7。所述引物对在制备鉴定中药浙贝母试剂盒中的应用。所述试剂盒的组分包括:引物对、dntp、dna聚合酶、lcgreen、反应缓冲液。所述试剂盒鉴定中药浙贝母的步骤为:(1)提取浙贝母样品的基因组dna;(2)以步骤(1)提取的基因组dna为模板,以p1为特异性引物,进行第一轮pcr扩增;(3)取步骤(2)的扩增产物,稀释100倍后作为第二轮pcr的模板,以p2作为特异性引物,进行第二轮pcr扩增;(4)取第二轮pcr扩增的产物,稀释100倍后作为第三轮pcr的模板,以p3作为特异性引物,进行第三轮pcr扩增;(5)收集第三轮pcr扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。所述浙贝母样品的基因组dna的提取方法是试剂盒法或改良ctab法。所述pcr扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。实施例3一种用于鉴定浙贝母的引物对,所述引物对及其序列为:p1,seqidno.1~2;p2,seqidno.3~4;p3,seqidno.5~6。所述引物对p1、p2和p3的上游引物的5’端加上特异性的gc发卡结构,所述发卡结构的长度为40bp,序列为seqidno.7。所述引物对在制备鉴定中药浙贝母试剂盒中的应用。所述试剂盒的组分包括:引物对、dntp、dna聚合酶、lcgreen、反应缓冲液。所述试剂盒鉴定中药浙贝母的步骤为:(1)提取浙贝母样品的基因组dna;(2)以步骤(1)提取的基因组dna为模板,以p1为特异性引物,进行第一轮pcr扩增;(3)取步骤(2)的扩增产物,稀释500倍后作为第二轮pcr的模板,以p2作为特异性引物,进行第二轮pcr扩增;(4)取第二轮pcr扩增的产物,稀释50倍后作为第三轮pcr的模板,以p3作为特异性引物,进行第三轮pcr扩增;(5)收集第三轮pcr扩增的产物,并采用琼脂糖凝胶电泳检测。所述浙贝母样品的基因组dna的提取方法是试剂盒法或改良ctab法。所述pcr扩增的程序为:95℃,2min;95℃,30s,52℃,30s,72℃,55s,35个循环;72℃,7min。如图1所示,将实施例1~3的扩增产物进行电泳检测,条带清晰可见,产物单一。其余品种无扩增条带。sequencelisting<110>苏州市李良济健康产业有限公司<120>一种用于鉴定浙贝母的引物对及其应用<130><160>7<170>patentinversion3.3<210>1<211>22<212>dna<213>人工序列<400>1ggacagtactgggggagaagtc22<210>2<211>22<212>dna<213>人工序列<400>2gccaaatggagggtatgtgtcg22<210>3<211>24<212>dna<213>人工序列<400>3cgtaacaaggtttccgtaggtgaa24<210>4<211>26<212>dna<213>人工序列<400>4ttattgatatgcttaaactcagcggg26<210>5<211>26<212>dna<213>人工序列<400>5ggatccgtgcttgggcgagagtagta26<210>6<211>26<212>dna<213>人工序列<400>6ggatccttagtgctggtatgatcgca26<210>7<211>40<212>dna<213>人工序列<400>7cgcccgccgcgcgcggcgggcggggcgggggcacgggggg40当前第1页12
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