多核苷酸文库的制作方法

文档序号:28812067发布日期:2022-02-09 04:23阅读:来源:国知局

技术特征:
1.双链(ds)多核苷酸文库成员的文库,其长度至少为12bp,包含多种多核苷酸核心序列和相同的突出端。2.根据权利要求1所述的文库,其中所述突出端在前导链和后随链上,并且其中每个文库成员包含:a)相同的第一突出端序列,即前导链的5’突出端,以及相同的第二突出端序列,即后随链的5’突出端;或者b)相同的第一突出端序列,即前导链的3’突出端,以及相同的第二突出端序列,即后随链的3’突出端;其中所述第一突出端序列和第二突出端序列彼此不互补。3.根据权利要求1或2所述的文库,其中所述突出端的长度是4-8个核苷酸。4.根据权利要求1至3中任一项所述的文库,其中每个所述文库成员包含选自由以下项组成的组的相同修饰:磷酸化、甲基化、生物素化或与荧光团或猝灭剂的连接。5.根据权利要求1至4中任一项所述的文库,其中所述文库成员包含在一个文库容器中,或包含在多个空间上不同的文库容器中。6.根据权利要求1至5中任一项所述的文库,其中每一个所述文库成员包含与模板至少30%相同的序列。7.权利要求1至6中任一项所述文库的产生方法,包括以下步骤:a)提供模板核苷酸序列;和b)合成多种长度至少是12bp的双链(ds)多核苷酸,该多核苷酸包含多样性的核心序列并包含相同的非互补突出端,其中每个所述ds多核苷酸与所述模板至少30%相同,从而获得ds多核苷酸文库成员的文库。8.根据权利要求7所述的方法,其中所述ds多核苷酸通过聚合酶链反应(pcr)富集。9.根据权利要求7或8所述的方法,其中多种ds多核苷酸通过以下方式合成:部分退火匹配的单链寡核苷酸(ss寡核苷酸)的文库,从而获得每个都具有相同突出端的双链寡核苷酸(ds寡核苷酸)的第一文库,并且任选进一步与具有与第一文库的突出端匹配的突出端的ds寡核苷酸退火,从而获得ds寡核苷酸的第二文库。10.根据权利要求9所述的方法,其中:a)ss寡核苷酸文库包含长度至少是6nt的ss寡核苷酸;和/或b)ds寡核苷酸第一文库包含长度至少是6bp的ds寡核苷酸;和/或c)ds寡核苷酸第二文库包含长度至少是12bp的ds寡核苷酸。11.权利要求1至6中任一项所述文库在合成多种目标ds多核苷酸的方法中的用途,其中通过将所述文库成员与具有与所述文库成员的突出端匹配的突出端的ds寡核苷酸组装,使每个目标ds多核苷酸都比所述文库成员长,从而得到目标ds多核苷酸的文库。12.合成权利要求1至6中任一项文库的方法,所述文库包括多种目标ds多核苷酸,所述方法包括以下步骤:a)在阵列装置内提供包含多样性寡核苷酸文库成员的寡核苷酸文库,其中每个文库成员具有不同的核苷酸序列,并被包含在水溶液中的单独文库容器中,所述多样性包括具有至少一个突出端的单链寡核苷酸(ss寡核苷酸)和双链寡核苷酸(ds寡核苷酸),并涵盖至少10.000对匹配的寡核苷酸,
b)在第一步中,使用液体处理器将至少第一对匹配的寡核苷酸从所述文库转移到第一反应容器中,并组装匹配的寡核苷酸,从而获得包含至少一个突出端的第一反应产物,c)在第二步和任选其它步骤中,使用液体处理器将至少第二对和任选其它对匹配的寡核苷酸从所述文库分别转移到第二反应容器和任选其它反应容器中,并组装匹配的寡核苷酸,从而获得分别包含至少一个突出端的第二反应产物和任选其它反应产物,d)在预定的工作流程中组装所述第一反应产物、第二反应产物和任选其它反应产物,从而产生具有至少12bp长度和突出端的所述目标ds多核苷酸,其中ds多核苷酸文库是通过组装多种所述第一反应产物、第二反应产物或任选其它反应产物中的一种或多种而产生的,所述多种包括核心序列的多样性和相同的非互补突出端。13.根据权利要求12所述的方法,其中a)所述ss寡核苷酸的长度至少是6nt;和/或b)所述ds寡核苷酸的长度至少是6bp;和/或c)所述ds多核苷酸文库包含长度至少是12bp的ds多核苷酸;和/或d)所述突出端的长度是4-8个核苷酸。14.根据权利要求12或13所述的方法,其中包含在所述ds多核苷酸文库中的每个所述ds多核苷酸具有与模板至少30%相同的序列。15.产生权利要求1至6中任一项文库的方法,所述文库富含预定文库成员,所述预定文库成员是由第一链和互补的第二链组成的ds多核苷酸,每条链均包含多核苷酸核心序列和突出端,方法如下:(i)通过采用聚合酶产生扩增产物的酶促反应扩增预定文库成员,并且:a)第一引物对包含至少与第一链的突出端互补的正向引物,以及与第二链的核心序列的末端序列互补、不包括其突出端的反向引物;和b)第二引物对包含至少与第一链的核心序列的末端序列互补、不包括其突出端的正向引物,以及至少与第二链的突出端互补的反向引物;和(ii)产生并任选分离所述扩增产物;和(iii)产生富含所述扩增产物的文库。16.根据权利要求15所述的方法,其中所述酶促反应是聚合酶链反应(pcr)。17.根据权利要求16所述的方法,其中预定文库成员在所述第一链和/或第二链的5
’‑
末端包含标签,优选亲和标签,其中每条带标签的链通过所述标签固定在磁珠上。18.根据权利要求16所述的方法,其中预定文库成员在所述第一链和/或第二链的3
’‑
末端包含标签,优选亲和标签,其中每条带标签的链通过所述标签固定在磁珠上。

技术总结
双链(ds)多核苷酸文库成员的文库,其长度是至少12bp,包含多种多核苷酸核心序列和相同的突出端。的突出端。的突出端。


技术研发人员:H
受保护的技术使用者:里本生物实验室有限责任公司
技术研发日:2020.04.10
技术公布日:2022/2/8
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