构建芥菜ssr遗传图谱的引物组及遗传图谱的构建方法
【技术领域】
[0001] 本发明涉及植物分子标记技术，具体涉及构建芥菜SSR遗传图谱的引物组及遗传 图谱的构建方法。
【背景技术】
[0002] 芥菜（B. juncea)是十字花科芸薹属的一种重要栽培作物，作为蔬菜、油料和调味 品，该物种在世界范围内广泛栽培。目前常见的芥菜类作物包括芥菜型油菜、调味品籽芥 菜、菜用芥菜及其变种等，并且不同芥菜类作物之间的生物学差异很大。农艺性状都受多基 因控制，其遗传改良较为复杂。通过分子标记对芥菜进行早期选择、预测，利用遗传图谱，把 优良的基因分离出来，对多基因控制的复杂的性状进行遗传改良，可以提高目标基因的选 择效率，加速育种进程。
[0003] 目前，随着分子标记的发展与应用，越来越多的芥菜遗传图谱完成构建，其中应 用较多的分子标记有RFLP、RAPD、AFLP等，但这些标记大多是采用无全基因组序列信息 的技术开发得到，表现出随机性强、稳定性差等缺点。而简单重复序列（simple sequence repeat，SSR)标记具有重复性好、稳定性强、多态性高、共显性遗传和基因组中普遍存在等 优点，广泛应用于遗传图谱构建、遗传多样性分析及分子标记辅助育种等研宄。而目前SSR 分子标记在芥菜中的应用报道很少，并且其中大多以籽用芥菜即芥菜型油菜为材料，少数 以调味用芥菜为材料。还未见以我国特有蔬菜类芥菜为材料的SSR遗传图谱构建的报道。
【发明内容】
[0004] 本发明的目的是针对现有技术的不足，提供构建芥菜SSR遗传图谱的引物组及遗 传图谱的构建方法，所述引物组能特异地扩增出芥菜中含有的SSR分子标记，利用这些SSR 分子标记能构建芥菜的SSR遗传图谱。
[0005] 本发明的目的是通过以下技术方案实现的：构建芥菜SSR遗传图谱的引物组，包 括以下112对引物：
[0006] BjSSROOOl 正向引物 SEQ ID NO. I :AAATCCCCAAAAACCTAGAG
[0007] 反向引物 SEQ ID NO. 113 :CTCATCCATCTCCTCGTCT
[0008] BjSSR0002 正向引物 SEQ ID NO. 2 :CTTCGTTTGCGCGTTTT
[0009] 反向引物 SEQ ID NO. 114 :ATGATGGTCTCCTTTTGTTG
[0010] BjSSR0004 正向引物 SEQ ID NO. 3 :AAGAAGTCGAGTAGTCGCAG
[0011] 反向引物 SEQ ID NO. 115 :AAACGAACAATACTTCCCG
[0012] BjSSR0008 正向引物 SEQ ID NO. 4 :ATGGAGCACATCTCAAAGAC
[0013] 反向引物 SEQ ID NO. 116 :CTTTTGTTGTGATGACCCTT
[0014] BjSSR0019 正向引物 SEQ ID NO. 5 :GAAACACAAACGCAGCA
[0015] 反向引物 SEQ ID NO. 117 :ACAGGCATTGTAGGAGACAC
[0016] BjSSR0023 正向引物 SEQ ID NO. 6 :TAAGCAGAGAAAGAAATGGG
[0017] 反向引物 SEQ ID NO. 118 :AGATCTCTGGAGTTGGGAGT
[0018] BjSSR0166 正向引物 SEQ ID NO. 7 :GAACAACAACTCATCCACCT
[0019] 反向引物 SEQ ID NO. 119 :AGACTCGTTATTGATGCTGG
[0020] BjSSR0234 正向引物 SEQ ID NO. 8 :ATTCTAATCACAACAACCGC
[0021] 反向引物 SEQ ID NO. 120 :ATGTAGTAGCCAAGGTGGTG
[0022] BjSSR0312 正向引物 SEQ ID NO. 9 :AGAAGCTTGGTAAGACGACA
[0023] 反向引物 SEQ ID NO. 121 :ATGCTCGAAGCTTTCTTATG
[0024] BjSSR0364 正向引物 SEQ ID NO. 10 :ATCCCCTCGTTAAAACTCTC
[0025] 反向引物 SEQ ID NO. 122 :GATGTTGAGGAGGTACTGGA
[0026] BjSSR0486 正向引物 SEQ ID NO. 11 :TTCCAAATCATCTTCTCACC
[0027] 反向引物 SEQ ID NO. 123 :CGTCCAACACAACAAACATA
[0028] BjSSR0513 正向引物 SEQ ID NO. 12 :ATCAAGAAAATGGAGCAAGA
[0029] 反向引物 SEQ ID NO. 124 :CTTCACTCTTGAACCTCTGG
[0030] BjSSR0612 正向引物 SEQ ID NO. 13 :TCGATTCTGGTCTTGAGTTT
[0031] 反向引物 SEQ ID NO. 125 :GAGTTGTAGACCGGATCAAA
[0032] BjSSR0613 正向引物 SEQ ID NO. 14 :TGAATTTGATCTCCGGTAAC
[0033] 反向引物 SEQ ID NO. 126 :ATTGCTGATCATACGGAAAC
[0034] BjSSR0678 正向引物 SEQ ID NO. 15 :TCAGCTACGGATAGAAGAGC
[0035] 反向引物 SEQ ID NO. 127 :GGACTCACATTGATCGTCTT
[0036] BjSSR0723 正向引物 SEQ ID NO. 16 :TAATGGCTTTGAAACTCTGC
[0037] 反向引物 SEQ ID NO. 128 :GGAAAGGAAGAGGTTCTTGT
[0038] BjSSR0731 正向引物 SEQ ID NO. 17 :CTCAAGAGGCTCAACACTTC
[0039] 反向引物 SEQ ID NO. 129 :TCCATTGCAACAATTAGACA
[0040] BjSSR0806 正向引物 SEQ ID NO. 18 :GATGAAGAGAGAAGCGAAGA
[0041] 反向引物 SEQ ID NO. 130 :TCCGTGAAGAAGCTAATGAT
[0042] BjSSR0891 正向引物 SEQ ID NO. 19 :GTTCTGAACGTTCTGGCTAC
[0043] 反向引物 SEQ ID NO. 131 :CATACACACGGTCTGATGAA
[0044] BjSSR0913 正向引物 SEQ ID NO. 20 :AATCCTCAGACCTCAAAACA
[0045] 反向引物 SEQ ID NO. 132 :GTATTCCTCGTAATCGTTGG
[0046] BjSSR0942 正向引物 SEQ ID NO. 21 :AATCTGGCAGAACTCAGAGA
[0047] 反向引物 SEQ ID NO. 133 :TCGGTGTAAGCCATATCTTT
[0048] BjSSR0967 正向引物 SEQ ID NO. 22 :GACCTCCTCCTGAAGTTTCT
[0049] 反向引物 SEQ ID NO. 134 :GCTGCAACTCACTTCTCTTT
[0050] BjSSRlOl8 正向引物 SEQ ID NO. 23 :CAGTTGTGTCCATGTACGAG
[0051] 反向引物 SEQ ID NO. 135 :TTCCGATGTCTGATAACTCC
[0052] BjSSRKMO 正向引物 SEQ ID NO. 24 :ACAAACAAATGGAAGACGAG
[0053] 反向引物 SEQ ID NO. 136 :AGATCGGATTTGATCTTGG
[0054] BjSSR1215 正向引物 SEQ ID NO. 25 :AGGGTGAGATACGACGAGTA
[0055] 反向引物 SEQ ID NO. 137 :CTTTCGTTTGGTCATTCATC
[0056] BjSSR1289 正向引物 SEQ ID NO. 26 :CGAGAGCCTAGATCTGAGAA
[0057] 反向引物 SEQ ID NO. 138 :TAAACAAACGCCTTACCTTC
[0058] BjSSR1365 正向引物 SEQ ID NO. 27 :TGAAAGTAGGCAACCGTATT
[0059] 反向引物 SEQ ID NO. 139 :CTCGCTTTACTCTCTGCAAT
[0060] BjSSR1448 正向引物 SEQ ID NO. 28 :GAGGTTGTTTCTTTTCCCTT
[0061] 反向引物 SEQ ID NO. 140 :GAATCAGCTATTCATCGGAG
[0062] BjSSR1474 正向引物 SEQ ID NO. 29 :ACTTTCCCTTACAATCCTCC
[0063] 反向引物 SEQ ID NO. 141 :GACTAGCAGCCTTCATCATC
[0064] BjSSR1528 正向引物 SEQ ID NO. 30 :CGTTCTCTTCACTATGCTCC
[0065] 反向引物 SEQ ID NO. 142 :TCACATAGCCCATAAACACA
[0066] BjSSR1594 正向引物 SEQ ID NO. 31 :AACAAACCTCACAAACCAAC
[0067] 反向引物 SEQ ID NO. 143 :ATTCTTCCACTCCCTTCTTC
[0068] BjSSR1612 正向引物 SEQ ID NO. 32 :AGGAGGAGGAAGAAGACAAC
[0069] 反向引物 SEQ ID NO. 144 :TCGTTTGATCGAACTTACCT
[0070] BjSSR1764 正向引物 SEQ ID NO. 33 :AAAGTCATGAAGAATGTGGG
[0071] 反向引物 SEQ ID NO. 145 :AGAAGCTTGTCTCAACATGG
[0072] BjSSR1799 正向引物 SEQ ID NO. 34 :GAAGTTTCCAACAAAACAGG
[0073] 反向引物 SEQ ID NO. 146 :GATTATGAACCACCGAGAGA
[0074] BjSSR1811 正向引物 SEQ ID NO. 35 :TCACAACGCAAAATAAACAA
[0075] 反向引物 SEQ ID NO. 147 :CTTTCCATCCCATGTGTAGT
[0076] BjSSR1812 正向引物 SEQ ID NO. 36 :TCAATATACAATCTTCGTGACTCT
[0077] 反向引物 SEQ ID NO. 148 :CAATAGGGATCATAACCGTC
[0078] BjSSR1813 正向引物 SEQ ID NO. 37 :GCTGCTATAGCTGGTCACTC
[0079] 反向引物 SEQ ID NO. 149 :TCATCGTTTGGTTCTTCTTT
[0080] BjSSR1831 正向引物 SEQ ID NO. 38 :ACTTGTTTCACTTCCAGCAT
[0081] 反向引物 SEQ ID NO. 150 :TTGTTTTGATTGTTATCCCC
[0082] BjSSR1885 正向引物 SEQ ID NO. 39 :ACCACAAAAACACACCAAAC
[0083] 反向引物 SEQ ID NO. 151 :TCTCACTCCTCTATAACGGG
[0084] BjSSR1926 正向引物 SEQ ID NO. 40 :TCCAGCAGCTTATTACCAGT
[0085] 反向引物 SEQ ID NO. 152 :GCACTTTAGCTGTTCTTGGT
[0086] BjSSR1934 正向引物 SEQ ID NO. 41 :TTTTCTCTTACCGAACCAAA
[0087] 反向引物 SEQ ID NO. 153 :GTTTGAAGGAAGAAGTGTCG
[0088] BjSSR1950 正向引物 SEQ ID NO. 42 :CCCTCGTCTTCTTAGGTCTT
[0089] 反向引物 SEQ ID NO. 154 :ATCAACCATTCCAGACATTC
[0090] BjSSR1970 正向引物 SEQ ID NO. 43 :ATATCACCACCACCATTGTT
[0091] 反向引物 SEQ ID NO. 155 :TCCTCCACAATCTCCATTAC
[0092] BjSSR1984 正向引物 SEQ ID NO. 44 :GCAATTGCTTTAATCTGTCC
[0093] 反向引物 SEQ ID NO. 156 :GAGGCAGGTATACAGATGCT
[0094] BjSSR1985 正向引物 SEQ ID NO. 45 :GTTCTCCGACGTCTGTTCT
[0095] 反向引物 SEQ ID NO. 157 :TTTCTGGTTTTCGATTTCAT
[0096] BjSSR2017 正向引物 SEQ ID NO. 46 :CGTTGATTCCAACAAACC
[0097] 反向引物 SEQ ID NO. 158 :GAGTTGATGAGAGATTTGGC
[0098] BjSSR2113 正向引物 SEQ ID NO. 47 :CCTCAGTTTCAGAATCAAGC
[0099] 反向引物 SEQ ID NO. 159 :TCCGGAAGAGAGAATAACAA
[0100] BjSSR2164 正向引物 SEQ ID NO. 48 :TCTCTTATCCTTTGGTCACG
[0101] 反向引物 SEQ ID NO. 160 :GGAAACGAAGACATAAGCTG
[0102] BjSSR2184 正向引物 SEQ ID NO. 49 :GGATTCGTGTTTGAGTTGTT
[0103] 反向引物