抗精神病药物相关代谢综合征的易感基因及其应用

文档序号:9300651阅读:743来源:国知局
抗精神病药物相关代谢综合征的易感基因及其应用
【技术领域】
[0001] 本发明属于生物技术及检测领域,具体地,本发明涉及一种检测抗精神病药物相 关代谢综合征易感性的标志性SNP的方法及其应用。
【背景技术】
[0002] 代谢综合征(metabolic syndrome,MetS)是一组心血管疾病的危险因素,包括糖 耐量减低、糖尿病、中心性肥胖(腹型肥胖)、脂代谢异常(甘油三酯升高、低密度脂蛋白胆 固醇升高、高密度脂蛋白胆固醇降低)、高血压。MetS作为多种危险因素的聚集者,预后不 佳的危险大于仅有一种危险因素者,而且其效应不是简单相加,而是协同加剧,有MetS者 发生心血管事件及中风的患病率及死亡风险是无 MetS者的2~3倍。合并多种心血管危 险因素对心、脑、肾等生命器官的损害远远大于单纯性高血压或糖尿病,代谢综合征引起的 心脑血管病、心肌梗塞和肺部疾病将成为未来导致人类死亡的三大主要疾病。
[0003] 研究发现精神分裂症患者中MetS的患病率明显高于普通人群,近年来,精神分裂 症合并MetS的现象也引起了人们的广泛关注。研究抗精神病药引起的代谢综合征的发生 机制及治疗干预方法意义重大。精神分裂症患者MetS的高患病率与他们的遗传因素、药物 治疗、饮食习惯及生活方式等都有一定关系。在过去,精神分裂症患者MetS的发生可能与 不良生活习惯(如久坐不动等)的关系更为密切,但随着非典型抗精神病药的使用,药物对 代谢综合征的影响越来越引起人们的广泛注意。多种抗精神病药均可导致代谢综合征,特 别是氯氮平等药物。这些不良反应与患者潜在的长期健康风险、降低药物治疗依从性和最 终可能导致复发有关。
[0004] 因此,本领域迫切需要对服用抗精神病药物合并出现MetS的患者群体进行发病 机制、基因组学以及治疗靶向的研究。

【发明内容】

[0005] 本发明提供了一个来源于SREBF-I基因的抗精神病药物相关代谢综合征易感性 SNP及其应用。
[0006] 本发明第一方面,提供了一种分离的含单核苷酸多态性即SNP位点的多核苷酸、 或其检测试剂的用途,用于制备检测抗精神病药物相关代谢综合征易感性的试剂盒,其中, 所述的多核苷酸中的SNP位点对应于:
[0007] 人染色体 17ρ11· 2 区域(chrl7:17708129(GRCh37/hgl9)),rsll654081,C - T。
[0008] 在另一优选例中,所述的SNP是:
[0009]
[0010] 在另一优选例中,所述多核苷酸长度为8-5000bp,较佳地10-3000bp,更佳地 15-1000bp,最佳地 18-500bp。
[0011] 在另一优选例中,所述的多核苷酸如SEQ ID NO. : I所示。
[0012] 在另一优选例中,所述的易感性包括:
[0013] ⑴如果检测对象的染色体 17ρ11· 2 区域(chrl7:17708129 (GRCh37/hgl9)), rsll654081携带T等位基因或基因型为TT,则说明所述检测对象患有抗精神病药物相关代 谢综合征的易感性较高;和/或
[0014] (ii)如果检测对象的染色体 17ρ11· 2 区域(chrl7:17708129(GRCh37/hgl9)), rs 11654081携带C等位基因或基因型为CT,则说明所述检测对象患有抗精神病药物相关代 谢综合征的易感性较低。
[0015] 本发明第二方面,提供了一种多核苷酸,所述的多核苷酸中的SNP位点对应于:
[0016] 人染色体 17ρ11· 2 区域(chrl7:17708129(GRCh37/hgl9)),rsll654081,C - T。
[0017] 本发明第三方面,提供了一种载体,所述载体包含本发明第二方面所述的多核苷 酸。
[0018] 本发明的第四方面,提供了一种宿主细胞,所述宿主细胞包含本发明第三方面中 所述的载体。
[0019] 本发明的第五方面,提供了一种核酸引物对,所述的引物长度为15_50bp,且特 异性地杂交并扩增出单核苷酸多态性(SNP)的扩增产物,其中所述的SNP为:人染色体 17ρ11· 2 区域,rsll654081,C - T。
[0020] 本发明的第六方面,提供了一种寡核苷酸探针,所述探针的长度为15-500bp,且特 异性地杂交并检测出含单核苷酸多态性(SNP)的扩增产物,其中所述的SNP为:人染色体 17ρ11· 2 区域,rsll654081,C - T。
[0021] 在另一优选例中,所述的检测试剂包括引物对、和/或探针。
[0022] 在另一优选例中,所述的多核苷酸包括扩增产物、或质粒。
[0023] 在另一优选例中,所述的检测试剂为引物对,所述引物对中引物的长度为 15_50bp,且特异性地杂交并扩增出含有所述SNP的扩增产物。
[0024] 在另一优选例中,所述的引物对序列如SEQ ID NO. :2、3所示。
[0025] SEQ ID NO. :2Forward ACGTTGGATGAAAATAAAAACACTACTAGG
[0026] SEQ ID NO. :3Reverse ACGTTGGATGGCTCAATCATCCTCCCACCT
[0027] 在另一优选例中,所述的检测试剂还包括探针,且所述探针长度为15_500bp,且特 异性地杂交并检测出含有所述SNP的扩增产物。
[0028] 在另一优选例中,所述的探针序列如SEQ ID NO. : 4所示。
[0029] TTGCACACTACTAGGAGCCAGC
[0030] 在另一优选例中,所述的多核苷酸用于作为阳性对照。
[0031] 在另一优选例中,所述的抗精神病药物包括:氯氮平、或奥氮平。
[0032] 在另一优选例中,所述的精神病包括精神分裂症。
[0033] 在另一优选例中,所述的代谢综合征包括一种或多种选自糖类、脂类的代谢异常。
[0034] 本发明第七方面,提供了一种用于检测抗精神病药物相关代谢综合征易感性的试 剂盒,所述的试剂盒含有检测SNP的检测试剂,且所述试剂盒的扩增产物含有所述的SNP, 其中所述的SNP如下:
[0035] 人染色体 17ρ11· 2 区域(chrl7:17708129(GRCh37/hgl9)),rsll654081,C - T。
[0036] 在另一优选例中,所述的试剂盒还含有对应于以下SNP的多核苷酸作为阳性对 昭.
[0037] 人染色体 17ρ11· 2 区域(chrl7:17708129(GRCh37/hgl9)),rsll654081,C - Τ。
[0038] 在另一优选例中,所述的检测试剂包括引物对、和/或探针。
[0039] 本发明第八方面,提供了一种体外非诊断性的判断SREBP-I基因是否为抗精神病 药物相关代谢综合征相关基因的方法,包括步骤:
[0040] (i)提供一样本,并检测所述样本中SREBP-I基因的SNP位点,其中,所述的位点为 人染色体 17ρ11· 2 区域(chrl7:17708129(GRCh37/hgl9)),rsll654081,C - T ;
[0041] (ii)当⑴中的SNP位点的等位基因检测为T,或基因型检测为TT时,则说明所 述样本中含有的SREBP-I基因为抗精神病药物相关代谢综合征的相关基因;
[0042] 当⑴中的SNP位点的等位基因检测为C,或基因型检测为CT时,,则说明所述样 本中含有的SREBP-I基因不是抗精神病药物相关代谢综合征的相关基因。
[0043] 本发明第九方面,提供了一种判断个体对抗精神病药物相关代谢综合征易感性的 方法,包括步骤:
[0044] (I)提供一来自所述个体的样本,并检测所述样本中SREBP-I基因的SNP位点,其 中,所述的位点为人染色体 17plL 2 区域(chrl7:17708129 (GRCh37/hgl9)),rsl 1654081, C - T ;
[0045] (II)当⑴中的SNP位点的等位基因检测为T,或基因型检测为TT时,则说明所 述个体对抗精神病药物相关代谢综合征的易感性高;
[0046] 当⑴中的SNP位点的等位基因检测为C,或基因型检测为CT时,则说明所述个体 对抗精神病药物相关代谢综合征的易感性低。
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